View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2994_low_4 (Length: 565)

Name: NF2994_low_4
Description: NF2994
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2994_low_4
NF2994_low_4
[»] chr1 (189 HSPs)
chr1 (347-562)||(35012870-35013085)
chr1 (347-565)||(23580370-23580589)
chr1 (347-565)||(4167203-4167422)
chr1 (347-565)||(4177859-4178078)
chr1 (347-565)||(4250609-4250826)
chr1 (347-562)||(19187785-19188001)
chr1 (347-565)||(12730491-12730710)
chr1 (347-565)||(12741084-12741303)
chr1 (347-565)||(12898027-12898246)
chr1 (347-565)||(21877711-21877930)
chr1 (347-565)||(21895146-21895365)
chr1 (347-562)||(19178906-19179122)
chr1 (347-565)||(5639754-5639973)
chr1 (347-565)||(5650311-5650530)
chr1 (347-565)||(12614360-12614579)
chr1 (347-565)||(12623825-12624044)
chr1 (347-565)||(33084506-33084725)
chr1 (347-565)||(20441361-20441578)
chr1 (347-560)||(7689503-7689715)
chr1 (347-562)||(7507249-7507465)
chr1 (347-562)||(7517846-7518062)
chr1 (347-562)||(51629231-51629447)
chr1 (347-562)||(51656492-51656708)
chr1 (347-565)||(10997828-10998047)
chr1 (347-565)||(21863605-21863824)
chr1 (347-562)||(39194138-39194352)
chr1 (347-565)||(154333-154550)
chr1 (347-565)||(35648734-35648954)
chr1 (347-565)||(38095020-38095240)
chr1 (347-565)||(38105645-38105865)
chr1 (347-565)||(148258-148475)
chr1 (161-528)||(22464664-22465030)
chr1 (347-565)||(5973703-5973926)
chr1 (347-565)||(5833162-5833382)
chr1 (347-565)||(5843764-5843984)
chr1 (347-565)||(35401208-35401428)
chr1 (347-565)||(35404435-35404655)
chr1 (347-565)||(35638082-35638302)
chr1 (347-565)||(47607974-47608194)
chr1 (347-565)||(47618582-47618802)
chr1 (347-565)||(2538480-2538698)
chr1 (347-562)||(18381948-18382161)
chr1 (181-490)||(25448442-25448751)
chr1 (347-565)||(3171566-3171786)
chr1 (347-565)||(3182168-3182388)
chr1 (347-565)||(36236474-36236692)
chr1 (347-565)||(36247021-36247239)
chr1 (161-418)||(22427213-22427471)
chr1 (347-562)||(9050532-9050745)
chr1 (184-401)||(29215781-29215998)
chr1 (347-562)||(11195111-11195325)
chr1 (347-565)||(39586915-39587132)
chr1 (182-401)||(22600057-22600278)
chr1 (161-401)||(2834673-2834914)
chr1 (177-401)||(2267073-2267297)
chr1 (347-565)||(47195207-47195424)
chr1 (182-401)||(1900329-1900550)
chr1 (182-401)||(22153841-22154062)
chr1 (182-401)||(32785813-32786033)
chr1 (184-401)||(35040150-35040367)
chr1 (181-383)||(39200868-39201070)
chr1 (347-562)||(17957189-17957402)
chr1 (347-562)||(20195737-20195949)
chr1 (347-557)||(14388170-14388378)
chr1 (347-555)||(675403-675609)
chr1 (185-401)||(35401792-35402011)
chr1 (177-401)||(33256221-33256447)
chr1 (177-401)||(33276393-33276619)
chr1 (164-401)||(2327298-2327536)
chr1 (182-401)||(38282551-38282771)
chr1 (204-401)||(36134174-36134370)
chr1 (347-514)||(41132659-41132825)
chr1 (182-401)||(44821422-44821641)
chr1 (182-401)||(28492279-28492500)
chr1 (167-400)||(1577852-1578087)
chr1 (181-401)||(21702798-21703017)
chr1 (231-401)||(16235222-16235392)
chr1 (347-557)||(18311016-18311224)
chr1 (177-401)||(2268515-2268738)
chr1 (184-401)||(48570111-48570327)
chr1 (231-400)||(22201662-22201831)
chr1 (181-401)||(14263325-14263548)
chr1 (347-557)||(46180923-46181131)
chr1 (182-400)||(20954348-20954568)
chr1 (181-401)||(30572181-30572400)
chr1 (177-401)||(19717508-19717734)
chr1 (182-401)||(10757405-10757627)
chr1 (182-401)||(12284407-12284628)
chr1 (177-399)||(48704190-48704414)
chr1 (181-401)||(10250970-10251180)
chr1 (181-400)||(46088974-46089184)
chr1 (181-421)||(7744966-7745207)
chr1 (185-401)||(23036405-23036625)
chr1 (347-537)||(20798914-20799102)
chr1 (245-385)||(21191805-21191945)
chr1 (16-165)||(25448183-25448338)
chr1 (350-537)||(45070700-45070885)
chr1 (347-557)||(22610018-22610226)
chr1 (4-165)||(2834965-2835132)
chr1 (245-380)||(17024904-17025039)
chr1 (295-510)||(17370917-17371124)
chr1 (342-557)||(44200841-44201054)
chr1 (347-537)||(20883926-20884114)
chr1 (347-557)||(23926888-23927096)
chr1 (4-132)||(39200663-39200791)
chr1 (19-165)||(2267331-2267482)
chr1 (204-399)||(12613715-12613908)
chr1 (185-378)||(7309826-7310020)
chr1 (4-165)||(22426996-22427163)
chr1 (350-537)||(28474077-28474262)
chr1 (4-165)||(29216058-29216225)
chr1 (347-489)||(5929600-5929741)
chr1 (298-400)||(21121057-21121159)
chr1 (342-510)||(19170371-19170539)
chr1 (4-92)||(21134803-21134891)
chr1 (4-165)||(21204568-21204736)
chr1 (298-401)||(23024772-23024875)
chr1 (177-400)||(30893077-30893303)
chr1 (298-401)||(37642232-37642335)
chr1 (298-400)||(21135153-21135255)
chr1 (4-165)||(44821180-44821349)
chr1 (347-407)||(12946818-12946878)
chr1 (298-401)||(19215596-19215699)
chr1 (298-400)||(21984580-21984683)
chr1 (16-165)||(32785602-32785757)
chr1 (4-130)||(36134489-36134616)
chr1 (231-401)||(21028777-21028947)
chr1 (298-400)||(42284613-42284715)
chr1 (4-149)||(21703121-21703274)
chr1 (342-510)||(22655352-22655520)
chr1 (4-165)||(2327045-2327213)
chr1 (342-489)||(22019232-22019379)
chr1 (11-165)||(22464437-22464596)
chr1 (4-104)||(25448008-25448108)
chr1 (4-104)||(35040477-35040577)
chr1 (347-489)||(19037903-19038045)
chr1 (350-489)||(52350731-52350869)
chr1 (351-489)||(20251671-20251808)
chr1 (298-400)||(21204916-21205017)
chr1 (347-489)||(28379892-28380033)
chr1 (4-92)||(46089335-46089423)
chr1 (298-510)||(21543904-21544108)
chr1 (4-165)||(1900608-1900775)
chr1 (16-165)||(22154149-22154304)
chr1 (342-510)||(22642770-22642938)
chr1 (232-401)||(26702056-26702225)
chr1 (4-92)||(48569849-48569937)
chr1 (4-92)||(21984927-21985015)
chr1 (25-92)||(21120728-21120795)
chr1 (4-130)||(22599819-22599946)
chr1 (4-89)||(30572524-30572610)
chr1 (1-130)||(48704515-48704645)
chr1 (4-132)||(19717818-19717947)
chr1 (4-103)||(2268870-2268970)
chr1 (347-399)||(23064935-23064987)
chr1 (4-130)||(1578148-1578275)
chr1 (4-165)||(38282858-38283025)
chr1 (298-400)||(34255509-34255611)
chr1 (267-380)||(18896559-18896672)
chr1 (4-65)||(30893443-30893504)
chr1 (11-130)||(16234956-16235076)
chr1 (16-92)||(37642597-37642673)
chr1 (1-60)||(1090176-1090235)
chr1 (4-165)||(10251267-10251427)
chr1 (1-60)||(28492070-28492129)
chr1 (1-112)||(22019682-22019793)
chr1 (4-60)||(23036155-23036211)
chr1 (342-398)||(26548294-26548350)
chr1 (4-60)||(33255990-33256046)
chr1 (4-60)||(33276162-33276218)
chr1 (25-149)||(23025053-23025184)
chr1 (4-132)||(10757718-10757846)
chr1 (1-42)||(16870358-16870399)
chr1 (4-92)||(17371416-17371505)
chr1 (4-112)||(22655824-22655933)
chr1 (4-112)||(23065280-23065388)
chr1 (16-112)||(35402152-35402249)
chr1 (4-92)||(42284975-42285064)
chr1 (4-60)||(22201472-22201528)
chr1 (25-92)||(7310154-7310221)
chr1 (25-92)||(7744727-7744794)
chr1 (9-60)||(9659061-9659112)
chr1 (4-130)||(20954092-20954219)
chr1 (370-401)||(24028751-24028782)
chr1 (11-60)||(16478411-16478460)
chr1 (4-112)||(28380340-28380448)
chr1 (4-59)||(22643295-22643351)
chr1 (133-165)||(35040425-35040457)
chr1 (4-59)||(44201375-44201431)
[»] chr6 (182 HSPs)
chr6 (347-565)||(27505908-27506128)
chr6 (347-565)||(27372798-27373018)
chr6 (347-565)||(27463148-27463368)
chr6 (347-565)||(9123143-9123362)
chr6 (347-565)||(9112506-9112725)
chr6 (347-565)||(25986048-25986266)
chr6 (347-562)||(7751247-7751462)
chr6 (347-565)||(31542909-31543128)
chr6 (347-565)||(11147261-11147479)
chr6 (347-565)||(12827659-12827877)
chr6 (347-565)||(25787668-25787885)
chr6 (347-565)||(12854987-12855206)
chr6 (347-565)||(12865513-12865732)
chr6 (347-565)||(33199294-33199513)
chr6 (347-565)||(17984721-17984940)
chr6 (347-562)||(26044183-26044397)
chr6 (347-565)||(31982637-31982856)
chr6 (347-565)||(32961940-32962159)
chr6 (347-565)||(32972559-32972778)
chr6 (347-565)||(34807171-34807390)
chr6 (347-565)||(34817803-34818022)
chr6 (347-562)||(26025428-26025644)
chr6 (347-562)||(26036002-26036218)
chr6 (347-562)||(7375770-7375984)
chr6 (347-565)||(17982512-17982731)
chr6 (347-562)||(20029916-20030130)
chr6 (347-565)||(26864754-26864973)
chr6 (347-565)||(26875378-26875597)
chr6 (347-565)||(27341660-27341879)
chr6 (347-565)||(27402400-27402619)
chr6 (347-565)||(27413059-27413278)
chr6 (347-565)||(28251577-28251793)
chr6 (347-565)||(28356724-28356940)
chr6 (347-562)||(4630842-4631058)
chr6 (347-562)||(32301054-32301270)
chr6 (347-562)||(32311743-32311959)
chr6 (347-565)||(3661349-3661567)
chr6 (347-565)||(3672013-3672231)
chr6 (347-562)||(27474815-27475030)
chr6 (347-562)||(27504314-27504529)
chr6 (347-562)||(20062667-20062881)
chr6 (347-562)||(27384402-27384617)
chr6 (347-565)||(29384718-29384936)
chr6 (347-562)||(12716845-12717062)
chr6 (347-562)||(12727494-12727711)
chr6 (347-562)||(16930420-16930635)
chr6 (161-401)||(20730628-20730868)
chr6 (347-562)||(16959591-16959806)
chr6 (347-565)||(5845052-5845268)
chr6 (347-562)||(17042591-17042806)
chr6 (347-565)||(18925774-18925991)
chr6 (182-401)||(15954688-15954907)
chr6 (347-562)||(17064164-17064379)
chr6 (347-562)||(18826250-18826463)
chr6 (182-401)||(29918002-29918222)
chr6 (347-562)||(18834646-18834859)
chr6 (347-562)||(31572385-31572598)
chr6 (347-565)||(13913017-13913233)
chr6 (182-401)||(32544250-32544471)
chr6 (347-562)||(4292697-4292910)
chr6 (347-562)||(16123549-16123762)
chr6 (182-401)||(16877198-16877417)
chr6 (347-562)||(29765507-29765719)
chr6 (182-401)||(9717828-9718049)
chr6 (182-401)||(18435541-18435762)
chr6 (4-384)||(12348995-12349407)
chr6 (185-401)||(16336112-16336328)
chr6 (347-562)||(8653631-8653844)
chr6 (347-562)||(17745794-17746007)
chr6 (182-401)||(22802126-22802345)
chr6 (182-380)||(19832977-19833176)
chr6 (182-399)||(21618230-21618448)
chr6 (182-401)||(23284549-23284770)
chr6 (181-401)||(20487861-20488082)
chr6 (161-401)||(16265074-16265314)
chr6 (182-406)||(14100383-14100608)
chr6 (182-401)||(22076352-22076571)
chr6 (347-562)||(25518661-25518874)
chr6 (184-401)||(26972173-26972390)
chr6 (347-562)||(22308761-22308974)
chr6 (182-401)||(13435517-13435738)
chr6 (182-401)||(15531567-15531788)
chr6 (347-562)||(27166455-27166667)
chr6 (347-557)||(17741714-17741922)
chr6 (185-401)||(21625086-21625303)
chr6 (185-400)||(15302186-15302403)
chr6 (167-418)||(13602139-13602393)
chr6 (347-537)||(9933683-9933871)
chr6 (182-363)||(19688789-19688970)
chr6 (182-401)||(20112642-20112864)
chr6 (350-537)||(25735573-25735757)
chr6 (347-557)||(11205922-11206130)
chr6 (211-401)||(12423246-12423435)
chr6 (182-400)||(12715362-12715583)
chr6 (232-400)||(18378300-18378468)
chr6 (420-562)||(26022878-26023020)
chr6 (206-385)||(15987234-15987414)
chr6 (347-557)||(19289392-19289600)
chr6 (4-165)||(20730427-20730593)
chr6 (347-537)||(25686761-25686948)
chr6 (347-557)||(12953142-12953351)
chr6 (350-497)||(25675196-25675342)
chr6 (350-537)||(25679234-25679418)
chr6 (4-165)||(21235373-21235539)
chr6 (182-400)||(24116814-24117035)
chr6 (347-557)||(31931399-31931607)
chr6 (182-401)||(19623964-19624185)
chr6 (347-557)||(11235475-11235683)
chr6 (161-401)||(21235109-21235338)
chr6 (4-165)||(22802401-22802567)
chr6 (4-165)||(15954963-15955130)
chr6 (4-165)||(16264873-16265039)
chr6 (347-557)||(18498596-18498804)
chr6 (347-557)||(18555246-18555454)
chr6 (204-380)||(10640386-10640562)
chr6 (184-401)||(33351876-33352090)
chr6 (298-510)||(20635595-20635799)
chr6 (4-166)||(29918276-29918446)
chr6 (182-356)||(34451611-34451787)
chr6 (181-400)||(19065971-19066181)
chr6 (226-401)||(19086143-19086308)
chr6 (4-165)||(17381706-17381873)
chr6 (4-165)||(19832707-19832874)
chr6 (4-165)||(20487608-20487774)
chr6 (243-385)||(26943577-26943719)
chr6 (347-488)||(7586268-7586408)
chr6 (4-165)||(18435850-18436017)
chr6 (281-510)||(14051426-14051654)
chr6 (4-165)||(33351649-33351818)
chr6 (309-401)||(17381506-17381598)
chr6 (347-510)||(17608417-17608579)
chr6 (182-307)||(25597558-25597685)
chr6 (347-422)||(6158316-6158391)
chr6 (243-378)||(19470678-19470813)
chr6 (347-510)||(21128103-21128265)
chr6 (295-510)||(22386678-22386885)
chr6 (281-421)||(14070107-14070247)
chr6 (4-160)||(21618516-21618680)
chr6 (4-149)||(16877506-16877657)
chr6 (350-421)||(25722973-25723044)
chr6 (4-165)||(16336430-16336598)
chr6 (27-165)||(139096-139240)
chr6 (27-165)||(147117-147261)
chr6 (490-562)||(12353525-12353597)
chr6 (18-149)||(12423514-12423653)
chr6 (298-401)||(17316586-17316689)
chr6 (298-385)||(19482753-19482840)
chr6 (4-165)||(26971916-26972083)
chr6 (299-401)||(25594053-25594155)
chr6 (350-513)||(17047573-17047736)
chr6 (316-401)||(26589584-26589670)
chr6 (57-165)||(32544544-32544657)
chr6 (4-165)||(9718119-9718286)
chr6 (11-130)||(13435848-13435968)
chr6 (4-165)||(19086426-19086593)
chr6 (4-165)||(24117104-24117271)
chr6 (4-130)||(34451390-34451517)
chr6 (4-92)||(26589981-26590070)
chr6 (1-128)||(13602473-13602601)
chr6 (4-60)||(17928190-17928246)
chr6 (25-132)||(19689030-19689138)
chr6 (4-130)||(12715141-12715268)
chr6 (4-130)||(14100179-14100306)
chr6 (1-74)||(15531326-15531400)
chr6 (4-77)||(22387176-22387250)
chr6 (4-60)||(3680862-3680918)
chr6 (4-162)||(19624241-19624405)
chr6 (16-60)||(22056434-22056478)
chr6 (4-130)||(21625414-21625541)
chr6 (347-380)||(19625814-19625847)
chr6 (4-60)||(15302558-15302614)
chr6 (4-60)||(18384025-18384081)
chr6 (16-60)||(25597849-25597893)
chr6 (1-60)||(17445398-17445457)
chr6 (25-112)||(17608048-17608134)
chr6 (4-58)||(19876184-19876238)
chr6 (290-380)||(25930479-25930568)
chr6 (4-59)||(11525313-11525369)
chr6 (4-60)||(15987581-15987637)
chr6 (4-60)||(20112420-20112476)
chr6 (16-60)||(24399038-24399082)
chr6 (4-60)||(32336165-32336221)
[»] chr5 (207 HSPs)
chr5 (347-562)||(22559557-22559773)
chr5 (347-565)||(30069828-30070046)
chr5 (347-565)||(31448673-31448892)
chr5 (347-565)||(20797816-20798034)
chr5 (347-565)||(34782977-34783194)
chr5 (347-565)||(43043593-43043811)
chr5 (347-562)||(27622691-27622907)
chr5 (347-565)||(31418782-31419001)
chr5 (347-565)||(34772032-34772249)
chr5 (347-562)||(5290500-5290716)
chr5 (347-562)||(27603342-27603558)
chr5 (347-565)||(27203913-27204132)
chr5 (347-565)||(39352608-39352827)
chr5 (347-565)||(40390477-40390696)
chr5 (347-565)||(6130909-6131128)
chr5 (347-565)||(7032047-7032268)
chr5 (347-562)||(10754614-10754828)
chr5 (347-565)||(16003812-16004031)
chr5 (347-565)||(22146641-22146860)
chr5 (347-565)||(22157224-22157443)
chr5 (347-565)||(31844079-31844298)
chr5 (347-565)||(36582479-36582698)
chr5 (347-565)||(36593034-36593253)
chr5 (347-565)||(40401139-40401358)
chr5 (347-565)||(8521962-8522179)
chr5 (347-562)||(23406567-23406781)
chr5 (347-565)||(39490871-39491090)
chr5 (347-565)||(39502061-39502280)
chr5 (347-565)||(1109068-1109285)
chr5 (347-565)||(1121826-1122043)
chr5 (347-565)||(21703051-21703268)
chr5 (347-565)||(21705898-21706115)
chr5 (347-563)||(15993252-15993469)
chr5 (347-562)||(6975928-6976144)
chr5 (347-562)||(6986418-6986634)
chr5 (347-562)||(9377386-9377602)
chr5 (347-562)||(14030164-14030380)
chr5 (347-562)||(14040717-14040933)
chr5 (347-562)||(14557941-14558157)
chr5 (347-562)||(14568578-14568794)
chr5 (347-562)||(22676236-22676452)
chr5 (347-562)||(22686127-22686343)
chr5 (347-562)||(23306965-23307181)
chr5 (347-565)||(23362230-23362450)
chr5 (347-562)||(24816810-24817026)
chr5 (347-562)||(24827398-24827614)
chr5 (347-562)||(27460281-27460497)
chr5 (347-562)||(27470680-27470896)
chr5 (347-565)||(27042133-27042352)
chr5 (347-562)||(36084582-36084796)
chr5 (347-562)||(36228860-36229074)
chr5 (347-562)||(5301071-5301292)
chr5 (347-562)||(17607181-17607397)
chr5 (347-562)||(17617795-17618011)
chr5 (347-562)||(23296397-23296613)
chr5 (347-562)||(31348655-31348871)
chr5 (347-562)||(31359269-31359485)
chr5 (347-562)||(36687816-36688032)
chr5 (347-562)||(36698382-36698598)
chr5 (347-565)||(40513910-40514130)
chr5 (347-565)||(9336076-9336294)
chr5 (347-565)||(9346663-9346881)
chr5 (347-565)||(24808033-24808251)
chr5 (347-562)||(24926065-24926279)
chr5 (347-562)||(24983346-24983560)
chr5 (352-565)||(27052757-27052971)
chr5 (347-565)||(33951721-33951941)
chr5 (347-565)||(35215625-35215845)
chr5 (347-565)||(35226209-35226429)
chr5 (347-565)||(15693953-15694171)
chr5 (347-562)||(19464092-19464306)
chr5 (347-562)||(19478122-19478336)
chr5 (347-565)||(23707563-23707781)
chr5 (347-565)||(24567210-24567428)
chr5 (347-565)||(30227419-30227637)
chr5 (347-565)||(30237946-30238164)
chr5 (347-565)||(42042905-42043123)
chr5 (347-565)||(42053480-42053698)
chr5 (347-565)||(17446619-17446835)
chr5 (347-565)||(34062741-34062957)
chr5 (347-562)||(17719038-17719255)
chr5 (347-562)||(17729690-17729907)
chr5 (347-565)||(14446920-14447140)
chr5 (347-565)||(14457532-14457752)
chr5 (347-565)||(15740087-15740307)
chr5 (347-565)||(15769247-15769467)
chr5 (181-401)||(33022645-33022865)
chr5 (347-559)||(42395101-42395311)
chr5 (347-562)||(20551936-20552150)
chr5 (347-565)||(17457235-17457451)
chr5 (181-401)||(31117858-31118079)
chr5 (347-565)||(34052080-34052296)
chr5 (384-565)||(31833639-31833820)
chr5 (347-562)||(37729176-37729392)
chr5 (347-562)||(37740492-37740708)
chr5 (347-565)||(37406769-37406985)
chr5 (182-401)||(11993869-11994088)
chr5 (181-401)||(4887003-4887223)
chr5 (347-562)||(106239-106453)
chr5 (347-562)||(20624885-20625099)
chr5 (181-401)||(30742962-30743181)
chr5 (177-399)||(21910539-21910763)
chr5 (182-401)||(42243662-42243881)
chr5 (182-401)||(20550876-20551097)
chr5 (181-418)||(33933230-33933472)
chr5 (181-401)||(14086473-14086695)
chr5 (430-565)||(39364685-39364820)
chr5 (347-494)||(43621853-43621999)
chr5 (186-401)||(7745632-7745849)
chr5 (347-557)||(20417022-20417230)
chr5 (347-560)||(23372631-23372848)
chr5 (182-400)||(41566369-41566589)
chr5 (347-559)||(32753875-32754085)
chr5 (182-401)||(13545455-13545668)
chr5 (347-562)||(20562461-20562660)
chr5 (347-495)||(21414191-21414338)
chr5 (182-401)||(15516951-15517169)
chr5 (184-400)||(17814950-17815168)
chr5 (182-401)||(89357-89578)
chr5 (181-401)||(3245378-3245597)
chr5 (182-400)||(6512366-6512583)
chr5 (182-401)||(26759131-26759349)
chr5 (11-401)||(9088950-9089345)
chr5 (182-399)||(23412909-23413128)
chr5 (182-401)||(29138345-29138562)
chr5 (347-537)||(13533763-13533951)
chr5 (350-557)||(20168188-20168393)
chr5 (347-557)||(13523016-13523224)
chr5 (1-165)||(14086249-14086418)
chr5 (184-401)||(25930104-25930312)
chr5 (16-165)||(31118132-31118286)
chr5 (277-510)||(32160638-32160871)
chr5 (347-557)||(35543247-35543455)
chr5 (270-489)||(11208011-11208229)
chr5 (205-401)||(26765480-26765674)
chr5 (182-401)||(19536235-19536457)
chr5 (182-401)||(26784335-26784556)
chr5 (347-557)||(36095771-36095978)
chr5 (347-557)||(36097228-36097435)
chr5 (243-399)||(21072238-21072394)
chr5 (253-401)||(28139588-28139736)
chr5 (4-165)||(42243969-42244136)
chr5 (25-165)||(5430140-5430285)
chr5 (181-401)||(10848754-10848965)
chr5 (181-385)||(28464285-28464479)
chr5 (4-159)||(33022926-33023086)
chr5 (431-565)||(23696988-23697123)
chr5 (204-401)||(25096783-25096981)
chr5 (204-401)||(25154753-25154951)
chr5 (271-401)||(30115863-30115993)
chr5 (4-162)||(33933577-33933741)
chr5 (4-163)||(29138106-29138272)
chr5 (342-489)||(1915311-1915457)
chr5 (4-165)||(4887278-4887445)
chr5 (204-401)||(23881048-23881245)
chr5 (298-400)||(35932059-35932161)
chr5 (342-510)||(23478241-23478409)
chr5 (9-167)||(30743281-30743446)
chr5 (181-400)||(35986177-35986387)
chr5 (342-489)||(20215213-20215360)
chr5 (347-426)||(39362434-39362514)
chr5 (347-489)||(40228553-40228694)
chr5 (348-489)||(40032869-40033009)
chr5 (4-92)||(35931709-35931797)
chr5 (4-165)||(15517242-15517411)
chr5 (4-165)||(28139843-28140012)
chr5 (292-375)||(642754-642837)
chr5 (350-489)||(13405010-13405148)
chr5 (270-562)||(25111911-25112195)
chr5 (270-562)||(25171002-25171286)
chr5 (298-400)||(21660194-21660296)
chr5 (4-149)||(3245136-3245289)
chr5 (292-401)||(6499220-6499329)
chr5 (264-401)||(9398753-9398890)
chr5 (204-385)||(21198964-21199143)
chr5 (4-92)||(28464043-28464132)
chr5 (298-401)||(23391656-23391760)
chr5 (4-165)||(11994186-11994352)
chr5 (4-74)||(25929875-25929946)
chr5 (319-401)||(12352869-12352951)
chr5 (4-89)||(21660577-21660662)
chr5 (347-408)||(23392837-23392897)
chr5 (264-400)||(21099723-21099859)
chr5 (4-92)||(35985934-35986022)
chr5 (25-165)||(10849037-10849187)
chr5 (4-132)||(7745361-7745490)
chr5 (4-92)||(23389161-23389249)
chr5 (4-92)||(32161148-32161236)
chr5 (4-65)||(6512163-6512224)
chr5 (4-112)||(20551192-20551301)
chr5 (4-132)||(26784651-26784779)
chr5 (164-274)||(5429991-5430102)
chr5 (4-130)||(23412705-23412832)
chr5 (16-132)||(21071967-21072084)
chr5 (68-165)||(26759452-26759555)
chr5 (4-125)||(89151-89273)
chr5 (4-58)||(23590114-23590168)
chr5 (347-388)||(31815283-31815325)
chr5 (4-128)||(17815281-17815406)
chr5 (181-222)||(30115812-30115853)
chr5 (4-60)||(21910910-21910966)
chr5 (4-112)||(40229001-40229109)
chr5 (4-60)||(19535999-19536055)
chr5 (4-59)||(20214803-20214859)
chr5 (73-109)||(20416696-20416732)
chr5 (4-40)||(21198751-21198787)
chr5 (4-60)||(26251455-26251511)
[»] chr4 (184 HSPs)
chr4 (347-562)||(27814951-27815167)
chr4 (347-565)||(48371166-48371385)
chr4 (347-565)||(10909443-10909661)
chr4 (347-565)||(18077912-18078130)
chr4 (347-565)||(25657171-25657388)
chr4 (347-565)||(40470594-40470811)
chr4 (347-565)||(52703823-52704042)
chr4 (347-565)||(40454355-40454572)
chr4 (347-565)||(450611-450830)
chr4 (347-565)||(461192-461411)
chr4 (347-562)||(5022774-5022988)
chr4 (347-565)||(14843659-14843878)
chr4 (347-565)||(16266497-16266716)
chr4 (347-565)||(17918087-17918306)
chr4 (347-565)||(17928735-17928954)
chr4 (347-562)||(18752497-18752711)
chr4 (347-565)||(22007046-22007265)
chr4 (347-565)||(30937078-30937297)
chr4 (347-562)||(10751174-10751390)
chr4 (347-562)||(10964943-10965159)
chr4 (347-565)||(15561085-15561304)
chr4 (347-562)||(18763107-18763321)
chr4 (347-565)||(19944333-19944552)
chr4 (347-565)||(21996448-21996667)
chr4 (347-565)||(24028091-24028310)
chr4 (347-565)||(30926500-30926719)
chr4 (347-565)||(49518170-49518389)
chr4 (347-565)||(55745258-55745477)
chr4 (347-565)||(55755869-55756088)
chr4 (347-565)||(4987309-4987526)
chr4 (347-562)||(10740600-10740816)
chr4 (347-562)||(10954369-10954585)
chr4 (347-562)||(18130245-18130461)
chr4 (347-562)||(36018374-36018590)
chr4 (347-562)||(36028927-36029143)
chr4 (347-565)||(16255904-16256123)
chr4 (347-565)||(19954968-19955187)
chr4 (347-565)||(4948370-4948589)
chr4 (347-565)||(47152086-47152302)
chr4 (347-562)||(24640285-24640502)
chr4 (347-565)||(10695676-10695892)
chr4 (347-562)||(27656638-27656855)
chr4 (347-562)||(27667211-27667428)
chr4 (347-565)||(14836110-14836326)
chr4 (182-401)||(10692830-10693049)
chr4 (182-401)||(10906596-10906815)
chr4 (347-562)||(11535885-11536098)
chr4 (347-565)||(3370751-3370968)
chr4 (347-565)||(15207420-15207635)
chr4 (347-565)||(19581277-19581493)
chr4 (182-401)||(19884681-19884901)
chr4 (161-401)||(412980-413221)
chr4 (181-401)||(22675432-22675653)
chr4 (346-562)||(11515075-11515289)
chr4 (347-562)||(10300574-10300787)
chr4 (347-565)||(16317366-16317583)
chr4 (347-562)||(24713471-24713683)
chr4 (347-565)||(3390491-3390708)
chr4 (347-562)||(5873409-5873622)
chr4 (347-565)||(16305142-16305359)
chr4 (182-401)||(37435446-37435667)
chr4 (161-401)||(13576006-13576246)
chr4 (161-381)||(54679929-54680147)
chr4 (193-406)||(29121344-29121557)
chr4 (347-562)||(31266804-31267018)
chr4 (161-381)||(17247243-17247462)
chr4 (347-557)||(49001985-49002193)
chr4 (347-557)||(55651369-55651577)
chr4 (182-401)||(6517464-6517683)
chr4 (177-401)||(16632419-16632645)
chr4 (177-400)||(3395570-3395795)
chr4 (182-401)||(10072914-10073134)
chr4 (232-401)||(14604869-14605039)
chr4 (182-401)||(45833373-45833594)
chr4 (184-400)||(37985525-37985743)
chr4 (194-401)||(8105617-8105825)
chr4 (182-363)||(3483738-3483921)
chr4 (187-400)||(19666352-19666567)
chr4 (182-400)||(12811089-12811306)
chr4 (189-400)||(29680462-29680675)
chr4 (182-400)||(19620972-19621192)
chr4 (232-400)||(9140892-9141060)
chr4 (182-418)||(14904267-14904506)
chr4 (181-400)||(3105332-3105550)
chr4 (204-379)||(12601102-12601277)
chr4 (183-400)||(17398598-17398805)
chr4 (182-401)||(19911791-19912013)
chr4 (182-374)||(56034580-56034774)
chr4 (4-165)||(13575820-13575986)
chr4 (347-557)||(23509162-23509370)
chr4 (211-401)||(25651046-25651235)
chr4 (235-399)||(56533027-56533191)
chr4 (4-165)||(55732064-55732230)
chr4 (277-401)||(16853482-16853606)
chr4 (347-557)||(18007087-18007296)
chr4 (350-557)||(18774686-18774891)
chr4 (182-399)||(55380271-55380490)
chr4 (347-557)||(8997284-8997492)
chr4 (295-512)||(33378279-33378488)
chr4 (184-327)||(14833449-14833594)
chr4 (235-401)||(16939995-16940160)
chr4 (4-165)||(54680167-54680333)
chr4 (347-539)||(16819380-16819570)
chr4 (4-165)||(29121643-29121810)
chr4 (4-149)||(3793376-3793526)
chr4 (264-385)||(6641679-6641800)
chr4 (1-165)||(22675223-22675392)
chr4 (4-132)||(3497941-3498069)
chr4 (4-166)||(19884957-19885127)
chr4 (181-324)||(55731836-55731978)
chr4 (177-400)||(40860647-40860861)
chr4 (270-401)||(1672368-1672499)
chr4 (270-401)||(1674843-1674974)
chr4 (243-401)||(40846078-40846236)
chr4 (4-165)||(3105125-3105294)
chr4 (298-399)||(22190827-22190928)
chr4 (4-92)||(22191190-22191278)
chr4 (245-380)||(11915700-11915835)
chr4 (177-400)||(15475060-15475274)
chr4 (298-401)||(20977436-20977539)
chr4 (4-165)||(14571295-14571465)
chr4 (4-165)||(25650814-25650983)
chr4 (4-132)||(16853787-16853915)
chr4 (342-489)||(36210131-36210278)
chr4 (4-92)||(40861025-40861113)
chr4 (298-401)||(9751569-9751672)
chr4 (350-489)||(14778473-14778611)
chr4 (298-397)||(38513861-38513960)
chr4 (4-130)||(45833705-45833832)
chr4 (4-132)||(10693160-10693290)
chr4 (4-132)||(10906926-10907056)
chr4 (9-165)||(17247529-17247691)
chr4 (4-92)||(17398353-17398442)
chr4 (4-165)||(8105940-8106102)
chr4 (350-489)||(17993824-17993962)
chr4 (4-130)||(37435196-37435323)
chr4 (9-165)||(3395895-3396057)
chr4 (57-165)||(10073192-10073305)
chr4 (4-112)||(413337-413444)
chr4 (298-401)||(27188667-27188771)
chr4 (4-165)||(6517756-6517926)
chr4 (350-489)||(14710809-14710947)
chr4 (4-130)||(19620767-19620894)
chr4 (322-401)||(39419787-39419866)
chr4 (4-125)||(12810869-12810991)
chr4 (9-165)||(14604587-14604749)
chr4 (4-90)||(38514225-38514311)
chr4 (4-92)||(16940315-16940404)
chr4 (16-132)||(56034866-56034983)
chr4 (16-92)||(3499331-3499407)
chr4 (4-80)||(17700467-17700543)
chr4 (16-92)||(39419426-39419502)
chr4 (4-165)||(9141131-9141298)
chr4 (299-401)||(3499682-3499784)
chr4 (4-112)||(14833720-14833829)
chr4 (4-65)||(19911615-19911676)
chr4 (204-311)||(15139296-15139403)
chr4 (245-380)||(17540395-17540530)
chr4 (330-401)||(23750501-23750572)
chr4 (391-537)||(19242091-19242235)
chr4 (11-125)||(29680241-29680355)
chr4 (4-57)||(1672797-1672850)
chr4 (4-57)||(1675272-1675325)
chr4 (4-77)||(9751219-9751292)
chr4 (4-132)||(14903994-14904123)
chr4 (4-60)||(6642067-6642123)
chr4 (181-229)||(14571175-14571223)
chr4 (353-401)||(16848526-16848574)
chr4 (161-216)||(3793287-3793342)
chr4 (291-385)||(14154015-14154110)
chr4 (245-383)||(11901184-11901322)
chr4 (1-63)||(19888806-19888868)
chr4 (4-60)||(40846465-40846522)
chr4 (182-279)||(23123532-23123631)
chr4 (1-60)||(12417277-12417336)
chr4 (1-60)||(16324188-16324247)
chr4 (4-130)||(16632748-16632875)
chr4 (245-376)||(41114746-41114877)
chr4 (10-60)||(2652121-2652171)
chr4 (135-165)||(3486372-3486402)
chr4 (350-396)||(19243982-19244028)
chr4 (339-376)||(8685513-8685550)
chr4 (11-60)||(14902168-14902217)
chr4 (133-165)||(413273-413305)
[»] chr8 (190 HSPs)
chr8 (347-565)||(3220659-3220878)
chr8 (347-562)||(19139310-19139526)
chr8 (347-562)||(19128778-19128994)
chr8 (347-562)||(19428958-19429174)
chr8 (347-565)||(23469495-23469713)
chr8 (347-565)||(30314731-30314948)
chr8 (347-565)||(6151097-6151316)
chr8 (347-562)||(19418383-19418597)
chr8 (347-565)||(6318551-6318769)
chr8 (347-565)||(9341171-9341390)
chr8 (347-565)||(9368315-9368534)
chr8 (347-565)||(9856506-9856725)
chr8 (347-565)||(15780744-15780963)
chr8 (347-565)||(15791333-15791552)
chr8 (347-565)||(36292946-36293165)
chr8 (347-565)||(36303549-36303768)
chr8 (347-565)||(20161264-20161481)
chr8 (347-565)||(20195986-20196203)
chr8 (347-562)||(3348661-3348877)
chr8 (347-562)||(3359258-3359474)
chr8 (347-565)||(18449397-18449616)
chr8 (347-562)||(19224965-19225179)
chr8 (347-565)||(18769172-18769389)
chr8 (161-401)||(23185160-23185400)
chr8 (347-565)||(26120936-26121156)
chr8 (347-565)||(210188-210406)
chr8 (347-565)||(241851-242069)
chr8 (347-565)||(252436-252654)
chr8 (347-565)||(723811-724029)
chr8 (347-565)||(849002-849220)
chr8 (347-565)||(6161052-6161271)
chr8 (347-565)||(32088304-32088522)
chr8 (347-565)||(13688601-13688821)
chr8 (347-565)||(26111258-26111478)
chr8 (347-565)||(36077962-36078182)
chr8 (347-565)||(36088548-36088768)
chr8 (366-565)||(43248353-43248553)
chr8 (347-562)||(44481121-44481337)
chr8 (347-562)||(44491737-44491953)
chr8 (347-565)||(29076758-29076976)
chr8 (347-565)||(29087009-29087227)
chr8 (347-562)||(31215046-31215261)
chr8 (347-565)||(32077731-32077949)
chr8 (347-565)||(18158284-18158500)
chr8 (347-537)||(23457339-23457528)
chr8 (182-528)||(15425108-15425453)
chr8 (347-534)||(30325287-30325473)
chr8 (182-528)||(15336043-15336388)
chr8 (182-528)||(15516412-15516757)
chr8 (347-565)||(16747030-16747246)
chr8 (347-565)||(18153765-18153980)
chr8 (182-401)||(16207283-16207504)
chr8 (161-401)||(17797399-17797639)
chr8 (347-562)||(40213205-40213418)
chr8 (164-401)||(30421365-30421603)
chr8 (164-401)||(45538376-45538613)
chr8 (370-565)||(795206-795401)
chr8 (347-557)||(3843560-3843768)
chr8 (164-401)||(24551251-24551488)
chr8 (161-401)||(36105172-36105412)
chr8 (177-401)||(40845338-40845561)
chr8 (347-493)||(1750193-1750339)
chr8 (184-528)||(21932735-21933079)
chr8 (185-418)||(39693494-39693730)
chr8 (182-401)||(19943212-19943435)
chr8 (347-504)||(6576554-6576712)
chr8 (347-557)||(7018416-7018624)
chr8 (184-401)||(1237614-1237831)
chr8 (182-400)||(12757716-12757936)
chr8 (182-400)||(16188962-16189182)
chr8 (182-400)||(19156174-19156394)
chr8 (167-401)||(602658-602894)
chr8 (177-398)||(16681251-16681474)
chr8 (182-401)||(18121062-18121280)
chr8 (347-559)||(20259652-20259862)
chr8 (347-559)||(21046282-21046492)
chr8 (182-363)||(33082872-33083055)
chr8 (164-401)||(9320546-9320784)
chr8 (182-400)||(17525681-17525902)
chr8 (204-374)||(17914463-17914633)
chr8 (347-557)||(22167058-22167266)
chr8 (347-557)||(22211423-22211632)
chr8 (182-401)||(22673755-22673974)
chr8 (347-537)||(22135893-22136081)
chr8 (182-400)||(17441761-17441980)
chr8 (182-383)||(23263564-23263768)
chr8 (182-400)||(29693293-29693513)
chr8 (181-401)||(6407703-6407913)
chr8 (182-385)||(22663109-22663312)
chr8 (164-401)||(24832993-24833230)
chr8 (182-401)||(18321112-18321333)
chr8 (204-401)||(17701722-17701919)
chr8 (182-400)||(24646316-24646536)
chr8 (269-510)||(45567943-45568184)
chr8 (184-401)||(14989417-14989625)
chr8 (232-418)||(18679774-18679961)
chr8 (4-165)||(45538171-45538338)
chr8 (347-557)||(23370591-23370794)
chr8 (182-400)||(17267452-17267671)
chr8 (232-401)||(18718978-18719147)
chr8 (4-162)||(30421159-30421322)
chr8 (182-385)||(20382347-20382552)
chr8 (204-314)||(20255542-20255652)
chr8 (4-165)||(1237936-1238104)
chr8 (4-150)||(24832771-24832923)
chr8 (202-398)||(43644876-43645071)
chr8 (4-165)||(17441539-17441706)
chr8 (280-562)||(21540768-21541042)
chr8 (181-400)||(43639760-43639971)
chr8 (4-165)||(15335758-15335925)
chr8 (4-165)||(15424823-15424990)
chr8 (4-165)||(15516127-15516294)
chr8 (294-401)||(18151713-18151820)
chr8 (218-380)||(18685388-18685550)
chr8 (218-380)||(18722637-18722799)
chr8 (218-380)||(18730982-18731144)
chr8 (347-537)||(23271239-23271428)
chr8 (4-166)||(17797688-17797857)
chr8 (298-400)||(21301000-21301102)
chr8 (4-165)||(6407985-6408154)
chr8 (4-165)||(40845086-40845255)
chr8 (4-165)||(9320854-9321022)
chr8 (342-489)||(28903349-28903495)
chr8 (298-400)||(13430699-13430801)
chr8 (264-401)||(19956378-19956514)
chr8 (11-165)||(18120847-18121007)
chr8 (4-129)||(22745779-22745905)
chr8 (4-165)||(23184959-23185125)
chr8 (11-165)||(36105494-36105656)
chr8 (342-489)||(17519173-17519320)
chr8 (245-385)||(19707499-19707639)
chr8 (4-92)||(21301364-21301452)
chr8 (1-92)||(22674145-22674237)
chr8 (4-92)||(33559961-33560049)
chr8 (4-150)||(3598045-3598198)
chr8 (342-510)||(40003097-40003265)
chr8 (350-489)||(8031923-8032062)
chr8 (4-149)||(13430350-13430501)
chr8 (300-400)||(21288381-21288481)
chr8 (4-92)||(21288745-21288833)
chr8 (4-165)||(21933169-21933334)
chr8 (4-165)||(14989173-14989342)
chr8 (4-92)||(1745501-1745590)
chr8 (4-132)||(16189305-16189434)
chr8 (9-132)||(19927351-19927476)
chr8 (4-92)||(45292958-45293045)
chr8 (245-372)||(22461656-22461783)
chr8 (1-165)||(19156450-19156620)
chr8 (4-60)||(17525446-17525502)
chr8 (351-491)||(19461051-19461190)
chr8 (351-491)||(19558729-19558868)
chr8 (1-92)||(22663498-22663590)
chr8 (4-92)||(43774234-43774322)
chr8 (25-92)||(1082230-1082297)
chr8 (4-165)||(20382112-20382279)
chr8 (27-94)||(24551643-24551710)
chr8 (4-130)||(24646645-24646772)
chr8 (346-401)||(29379555-29379610)
chr8 (9-92)||(45567575-45567658)
chr8 (25-130)||(2811130-2811234)
chr8 (4-65)||(18680172-18680233)
chr8 (4-92)||(43640139-43640228)
chr8 (182-271)||(22745594-22745685)
chr8 (319-401)||(25164047-25164129)
chr8 (4-149)||(18151378-18151530)
chr8 (4-65)||(18719340-18719401)
chr8 (298-363)||(33560295-33560360)
chr8 (298-401)||(1745136-1745240)
chr8 (4-60)||(16681022-16681078)
chr8 (4-60)||(17702105-17702161)
chr8 (4-60)||(17914838-17914894)
chr8 (25-112)||(21541315-21541402)
chr8 (4-60)||(29693696-29693752)
chr8 (182-224)||(3598301-3598343)
chr8 (4-132)||(602451-602580)
chr8 (4-92)||(19943583-19943672)
chr8 (347-380)||(26833034-26833067)
chr8 (4-112)||(28903808-28903917)
chr8 (4-112)||(40003534-40003643)
chr8 (317-401)||(2810800-2810882)
chr8 (4-60)||(18320907-18320963)
chr8 (4-60)||(22461340-22461396)
chr8 (4-60)||(23352803-23352859)
chr8 (4-60)||(26833435-26833491)
chr8 (4-60)||(33083243-33083299)
chr8 (290-380)||(18772618-18772707)
chr8 (25-59)||(23783918-23783952)
chr8 (4-45)||(39696579-39696620)
chr8 (4-60)||(19707887-19707943)
chr8 (16-64)||(19956076-19956124)
[»] chr3 (266 HSPs)
chr3 (347-562)||(6490350-6490565)
chr3 (347-562)||(6501004-6501219)
chr3 (347-565)||(10655264-10655482)
chr3 (347-565)||(10626942-10627160)
chr3 (347-565)||(23635726-23635944)
chr3 (347-565)||(12237615-12237832)
chr3 (347-565)||(12249441-12249658)
chr3 (347-565)||(24706555-24706773)
chr3 (25-401)||(40799858-40800246)
chr3 (347-565)||(6220702-6220921)
chr3 (347-562)||(9993894-9994108)
chr3 (347-565)||(19789038-19789257)
chr3 (347-565)||(4174757-4174976)
chr3 (350-565)||(9380660-9380874)
chr3 (350-565)||(9391206-9391420)
chr3 (347-565)||(13372670-13372889)
chr3 (347-565)||(13383264-13383483)
chr3 (347-565)||(13393858-13394077)
chr3 (347-565)||(19778401-19778620)
chr3 (347-565)||(23757314-23757533)
chr3 (347-565)||(23767910-23768129)
chr3 (347-565)||(37759686-37759905)
chr3 (347-565)||(39672883-39673102)
chr3 (347-565)||(11216722-11216939)
chr3 (347-562)||(24659919-24660135)
chr3 (347-562)||(37885597-37885813)
chr3 (347-565)||(6180528-6180747)
chr3 (347-562)||(9535628-9535842)
chr3 (347-562)||(9981886-9982100)
chr3 (347-565)||(13121678-13121897)
chr3 (347-565)||(13131921-13132140)
chr3 (347-565)||(14465607-14465826)
chr3 (347-562)||(19887355-19887569)
chr3 (347-565)||(20673196-20673415)
chr3 (347-565)||(20683781-20684000)
chr3 (347-565)||(23647764-23647983)
chr3 (347-565)||(28314232-28314451)
chr3 (347-562)||(504168-504384)
chr3 (347-562)||(526534-526750)
chr3 (347-562)||(5579634-5579850)
chr3 (347-562)||(5628018-5628234)
chr3 (347-562)||(5865694-5865910)
chr3 (347-562)||(5876293-5876509)
chr3 (347-562)||(12286979-12287195)
chr3 (347-562)||(20721132-20721348)
chr3 (347-562)||(24383519-24383735)
chr3 (347-562)||(24670499-24670715)
chr3 (347-562)||(35187396-35187612)
chr3 (347-562)||(37866464-37866680)
chr3 (347-562)||(41683697-41683913)
chr3 (347-562)||(41694266-41694482)
chr3 (347-565)||(13557590-13557809)
chr3 (347-565)||(28324848-28325067)
chr3 (347-565)||(29461214-29461431)
chr3 (347-565)||(29472066-29472283)
chr3 (347-562)||(12296801-12297017)
chr3 (347-565)||(18484060-18484280)
chr3 (347-565)||(38194740-38194960)
chr3 (347-565)||(38205276-38205496)
chr3 (347-565)||(39372069-39372289)
chr3 (347-565)||(39382706-39382926)
chr3 (347-565)||(4743754-4743972)
chr3 (347-565)||(5510712-5510930)
chr3 (347-565)||(5520890-5521108)
chr3 (347-565)||(5537022-5537240)
chr3 (347-562)||(7794608-7794822)
chr3 (347-565)||(933644-933861)
chr3 (4-401)||(20627197-20627606)
chr3 (347-565)||(8774673-8774893)
chr3 (347-565)||(8785258-8785478)
chr3 (347-565)||(5547606-5547824)
chr3 (347-562)||(7804519-7804733)
chr3 (347-565)||(10099084-10099302)
chr3 (347-562)||(48337261-48337475)
chr3 (347-565)||(14476237-14476458)
chr3 (347-562)||(11272383-11272600)
chr3 (347-562)||(28169102-28169315)
chr3 (347-565)||(11163846-11164063)
chr3 (347-565)||(13261674-13261890)
chr3 (161-401)||(47207690-47207931)
chr3 (347-565)||(4404290-4404506)
chr3 (347-565)||(4456933-4457149)
chr3 (347-565)||(18851693-18851909)
chr3 (347-565)||(4754341-4754557)
chr3 (347-562)||(8995957-8996170)
chr3 (347-562)||(9006509-9006722)
chr3 (347-562)||(17910003-17910217)
chr3 (347-562)||(27883404-27883617)
chr3 (161-528)||(47405356-47405721)
chr3 (347-562)||(38314719-38314933)
chr3 (347-562)||(1064159-1064372)
chr3 (347-562)||(16076950-16077163)
chr3 (181-400)||(24775489-24775708)
chr3 (164-401)||(53056665-53056902)
chr3 (347-565)||(1794483-1794701)
chr3 (347-562)||(1053730-1053943)
chr3 (181-399)||(46349799-46350018)
chr3 (182-401)||(2561172-2561393)
chr3 (347-565)||(1784071-1784289)
chr3 (182-401)||(2785049-2785268)
chr3 (182-401)||(49642716-49642937)
chr3 (181-401)||(11223548-11223767)
chr3 (181-401)||(14955412-14955631)
chr3 (347-562)||(14581158-14581372)
chr3 (184-385)||(28582106-28582309)
chr3 (347-562)||(8740128-8740340)
chr3 (347-557)||(2246393-2246601)
chr3 (182-401)||(6090716-6090937)
chr3 (347-515)||(16666128-16666295)
chr3 (177-401)||(22140748-22140972)
chr3 (182-401)||(18121576-18121797)
chr3 (190-401)||(38177605-38177818)
chr3 (347-557)||(13199243-13199453)
chr3 (182-400)||(37467318-37467538)
chr3 (347-562)||(17281434-17281648)
chr3 (205-401)||(41494983-41495179)
chr3 (347-562)||(16671163-16671376)
chr3 (182-398)||(49553443-49553661)
chr3 (182-401)||(12726184-12726405)
chr3 (182-401)||(18142706-18142927)
chr3 (347-512)||(16391615-16391780)
chr3 (181-401)||(29855393-29855614)
chr3 (231-418)||(13780589-13780777)
chr3 (182-401)||(5213562-5213779)
chr3 (185-400)||(13948321-13948538)
chr3 (182-401)||(33583214-33583434)
chr3 (403-559)||(16386096-16386251)
chr3 (182-401)||(14392958-14393179)
chr3 (347-537)||(29933559-29933748)
chr3 (347-537)||(29982713-29982902)
chr3 (182-401)||(52920390-52920610)
chr3 (182-401)||(20646138-20646360)
chr3 (166-401)||(46796317-46796542)
chr3 (182-371)||(14969341-14969532)
chr3 (204-363)||(13824091-13824250)
chr3 (347-516)||(16476343-16476513)
chr3 (347-537)||(29906181-29906369)
chr3 (347-537)||(29947346-29947534)
chr3 (347-537)||(29996500-29996688)
chr3 (266-399)||(25398295-25398428)
chr3 (231-400)||(31303371-31303540)
chr3 (271-399)||(16032511-16032639)
chr3 (181-385)||(21640867-21641070)
chr3 (4-165)||(11869361-11869527)
chr3 (182-401)||(12963039-12963260)
chr3 (187-385)||(15903198-15903399)
chr3 (182-401)||(16658572-16658793)
chr3 (190-373)||(17238884-17239069)
chr3 (4-165)||(47207985-47208151)
chr3 (19-165)||(53056460-53056612)
chr3 (204-379)||(29951416-29951591)
chr3 (204-379)||(30000570-30000745)
chr3 (161-323)||(11869130-11869292)
chr3 (347-453)||(12567271-12567376)
chr3 (347-453)||(15216341-15216446)
chr3 (347-537)||(15651071-15651259)
chr3 (347-557)||(15662706-15662914)
chr3 (347-557)||(21736136-21736344)
chr3 (280-510)||(51340886-51341108)
chr3 (9-165)||(11223822-11223983)
chr3 (204-380)||(20725092-20725267)
chr3 (181-400)||(21636634-21636844)
chr3 (4-165)||(50300493-50300659)
chr3 (181-401)||(21605618-21605829)
chr3 (181-401)||(49666370-49666580)
chr3 (4-165)||(28582382-28582549)
chr3 (4-165)||(29855701-29855868)
chr3 (280-421)||(11909078-11909220)
chr3 (204-385)||(12388851-12389031)
chr3 (177-369)||(19888893-19889088)
chr3 (236-363)||(50300245-50300372)
chr3 (181-399)||(30054181-30054390)
chr3 (4-165)||(47405169-47405336)
chr3 (316-401)||(11868253-11868338)
chr3 (295-510)||(15850884-15851092)
chr3 (342-489)||(10529243-10529389)
chr3 (347-537)||(31113987-31114175)
chr3 (264-401)||(22804061-22804198)
chr3 (295-510)||(15833281-15833486)
chr3 (4-165)||(14955733-14955900)
chr3 (4-165)||(31303664-31303831)
chr3 (4-92)||(2028640-2028729)
chr3 (350-513)||(27172900-27173063)
chr3 (4-92)||(40851316-40851404)
chr3 (298-401)||(9700108-9700211)
chr3 (347-406)||(14321683-14321742)
chr3 (387-514)||(17961419-17961545)
chr3 (387-514)||(18006364-18006490)
chr3 (4-165)||(22141018-22141185)
chr3 (10-165)||(33583537-33583698)
chr3 (10-165)||(33598157-33598318)
chr3 (280-401)||(12752682-12752795)
chr3 (298-401)||(1728087-1728190)
chr3 (177-363)||(40850990-40851167)
chr3 (350-489)||(41045640-41045778)
chr3 (347-485)||(51989144-51989282)
chr3 (4-165)||(2561449-2561622)
chr3 (4-165)||(5216262-5216431)
chr3 (4-160)||(24775216-24775380)
chr3 (4-92)||(49666113-49666202)
chr3 (204-372)||(19249391-19249558)
chr3 (343-510)||(45861689-45861856)
chr3 (366-562)||(49990084-49990280)
chr3 (4-130)||(46349545-46349672)
chr3 (4-165)||(2785371-2785536)
chr3 (4-132)||(49553205-49553335)
chr3 (342-510)||(13148141-13148309)
chr3 (4-92)||(30053974-30054063)
chr3 (342-421)||(17021990-17022070)
chr3 (9-92)||(21606389-21606473)
chr3 (342-489)||(22151142-22151289)
chr3 (280-352)||(45858803-45858875)
chr3 (4-130)||(6091047-6091174)
chr3 (245-380)||(12968311-12968446)
chr3 (2-92)||(21605357-21605448)
chr3 (4-130)||(52920720-52920847)
chr3 (4-74)||(1727741-1727811)
chr3 (4-92)||(15833747-15833835)
chr3 (4-92)||(15851293-15851381)
chr3 (4-132)||(20646468-20646596)
chr3 (245-372)||(23538185-23538312)
chr3 (253-380)||(26417706-26417833)
chr3 (4-74)||(38177406-38177477)
chr3 (1-130)||(41495289-41495419)
chr3 (37-164)||(18121371-18121504)
chr3 (4-91)||(21636375-21636463)
chr3 (20-92)||(12725995-12726069)
chr3 (4-130)||(14392723-14392850)
chr3 (4-130)||(14969629-14969756)
chr3 (1-92)||(45858423-45858514)
chr3 (22-112)||(49990605-49990695)
chr3 (1-59)||(19197573-19197631)
chr3 (298-400)||(37412590-37412692)
chr3 (4-61)||(12968731-12968788)
chr3 (4-72)||(46796102-46796171)
chr3 (4-130)||(29951155-29951283)
chr3 (4-130)||(30000309-30000437)
chr3 (4-60)||(49642496-49642552)
chr3 (25-112)||(12752340-12752427)
chr3 (4-65)||(3522644-3522706)
chr3 (19-92)||(46828346-46828422)
chr3 (1-125)||(13824354-13824478)
chr3 (4-65)||(16658359-16658420)
chr3 (4-60)||(25397979-25398036)
chr3 (11-130)||(13948651-13948771)
chr3 (4-60)||(16032866-16032922)
chr3 (1-60)||(4242910-4242969)
chr3 (1-60)||(22803814-22803873)
chr3 (11-92)||(46828423-46828505)
chr3 (25-74)||(512690-512740)
chr3 (11-64)||(19705753-19705807)
chr3 (25-103)||(51341392-51341470)
chr3 (11-48)||(1470109-1470146)
chr3 (4-41)||(6713473-6713510)
chr3 (11-60)||(14073079-14073128)
chr3 (355-408)||(16812204-16812257)
chr3 (4-60)||(8728734-8728790)
chr3 (4-60)||(9080621-9080677)
chr3 (4-60)||(12397502-12397558)
chr3 (4-60)||(12962818-12962874)
chr3 (4-60)||(16199523-16199579)
chr3 (347-406)||(16487067-16487127)
chr3 (133-165)||(18142635-18142667)
chr3 (4-60)||(19249124-19249180)
chr3 (4-59)||(22151645-22151701)
chr3 (4-60)||(26417402-26417458)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (347-562)||(14584-14800)
scaffold0028 (347-565)||(54164-54381)
scaffold0028 (169-401)||(5496-5728)
scaffold0028 (51-165)||(5301-5421)
[»] chr7 (221 HSPs)
chr7 (347-562)||(20989656-20989872)
chr7 (347-565)||(14745750-14745968)
chr7 (347-565)||(15888410-15888627)
chr7 (347-562)||(5685522-5685738)
chr7 (347-562)||(9433267-9433483)
chr7 (347-565)||(6867306-6867525)
chr7 (347-565)||(1367631-1367848)
chr7 (347-562)||(9443863-9444079)
chr7 (347-562)||(21003089-21003305)
chr7 (347-565)||(541085-541304)
chr7 (347-565)||(6877938-6878157)
chr7 (347-565)||(37344200-37344419)
chr7 (347-565)||(467662-467881)
chr7 (347-565)||(4222610-4222829)
chr7 (347-565)||(8617386-8617605)
chr7 (347-565)||(8627949-8628168)
chr7 (347-565)||(11096055-11096274)
chr7 (347-565)||(24930684-24930903)
chr7 (347-565)||(26653406-26653625)
chr7 (347-565)||(26699735-26699954)
chr7 (347-565)||(31116592-31116809)
chr7 (347-565)||(454880-455099)
chr7 (347-565)||(2705693-2705912)
chr7 (347-565)||(2716297-2716516)
chr7 (347-565)||(4212011-4212230)
chr7 (347-565)||(11005185-11005404)
chr7 (347-565)||(17950199-17950418)
chr7 (347-565)||(17960805-17961024)
chr7 (347-565)||(48710572-48710791)
chr7 (347-565)||(20491008-20491225)
chr7 (347-565)||(44280498-44280715)
chr7 (347-565)||(166882-167101)
chr7 (347-565)||(177474-177693)
chr7 (347-562)||(9170990-9171204)
chr7 (347-565)||(22089123-22089342)
chr7 (347-565)||(22099738-22099957)
chr7 (347-565)||(26294110-26294329)
chr7 (347-565)||(589214-589431)
chr7 (347-565)||(3165736-3165953)
chr7 (350-562)||(24734756-24734969)
chr7 (350-562)||(24744703-24744916)
chr7 (347-565)||(8002145-8002365)
chr7 (347-565)||(8012790-8013010)
chr7 (347-562)||(26390177-26390393)
chr7 (347-562)||(26400819-26401035)
chr7 (347-565)||(9085284-9085502)
chr7 (347-565)||(9094998-9095216)
chr7 (347-562)||(21770024-21770238)
chr7 (347-565)||(1987540-1987760)
chr7 (347-565)||(1998161-1998381)
chr7 (347-562)||(9159734-9159948)
chr7 (347-562)||(9170189-9170403)
chr7 (347-562)||(18441201-18441415)
chr7 (347-565)||(40042190-40042408)
chr7 (347-565)||(40052739-40052957)
chr7 (181-401)||(30945313-30945533)
chr7 (347-565)||(42865827-42866047)
chr7 (347-565)||(42876453-42876673)
chr7 (181-401)||(30944280-30944500)
chr7 (347-562)||(18419120-18419334)
chr7 (347-562)||(40054835-40055048)
chr7 (181-385)||(14426544-14426748)
chr7 (161-401)||(48236839-48237079)
chr7 (161-399)||(33605668-33605907)
chr7 (182-401)||(44467045-44467267)
chr7 (347-564)||(30049522-30049738)
chr7 (164-401)||(28622296-28622533)
chr7 (347-511)||(19985894-19986058)
chr7 (161-401)||(9709739-9709979)
chr7 (182-401)||(21283329-21283550)
chr7 (182-401)||(33691668-33691889)
chr7 (181-401)||(35952644-35952865)
chr7 (347-559)||(3476421-3476631)
chr7 (184-401)||(9069543-9069762)
chr7 (347-557)||(26209629-26209837)
chr7 (182-528)||(23279915-23280261)
chr7 (347-557)||(29590004-29590212)
chr7 (161-401)||(4821455-4821694)
chr7 (177-401)||(28409020-28409246)
chr7 (182-401)||(15467897-15468118)
chr7 (182-385)||(22577977-22578182)
chr7 (182-418)||(13302773-13303012)
chr7 (182-401)||(10883129-10883350)
chr7 (182-401)||(24788122-24788343)
chr7 (184-385)||(15088517-15088720)
chr7 (164-400)||(16111824-16112060)
chr7 (164-401)||(12174280-12174517)
chr7 (346-557)||(15216328-15216537)
chr7 (347-557)||(13682332-13682540)
chr7 (182-401)||(21695382-21695603)
chr7 (182-400)||(2913564-2913784)
chr7 (204-385)||(19237024-19237204)
chr7 (188-400)||(2500020-2500234)
chr7 (182-400)||(13137851-13138071)
chr7 (182-400)||(21692269-21692489)
chr7 (389-562)||(38403331-38403502)
chr7 (347-555)||(12734247-12734453)
chr7 (185-400)||(13648711-13648928)
chr7 (181-401)||(8182911-8183130)
chr7 (204-400)||(13880086-13880282)
chr7 (182-401)||(2265477-2265695)
chr7 (189-400)||(13730638-13730851)
chr7 (4-165)||(14426786-14426952)
chr7 (252-385)||(14193111-14193244)
chr7 (182-418)||(11792870-11793109)
chr7 (181-356)||(16542977-16543152)
chr7 (181-356)||(16622510-16622685)
chr7 (4-165)||(9709553-9709719)
chr7 (182-401)||(16316513-16316734)
chr7 (347-557)||(24882501-24882709)
chr7 (182-401)||(15704457-15704666)
chr7 (182-401)||(12366704-12366925)
chr7 (245-401)||(29935379-29935535)
chr7 (205-400)||(11319387-11319582)
chr7 (270-401)||(19711059-19711190)
chr7 (182-400)||(30025887-30026107)
chr7 (186-400)||(331627-331842)
chr7 (347-453)||(8933634-8933739)
chr7 (4-165)||(30944077-30944242)
chr7 (177-400)||(14425429-14425642)
chr7 (206-401)||(5000803-5000999)
chr7 (4-165)||(33691445-33691612)
chr7 (202-385)||(39284543-39284725)
chr7 (4-165)||(28622086-28622252)
chr7 (204-401)||(13893979-13894174)
chr7 (181-400)||(19339216-19339426)
chr7 (4-128)||(33606001-33606125)
chr7 (9-132)||(48236659-48236782)
chr7 (347-453)||(38593816-38593921)
chr7 (281-401)||(16309964-16310084)
chr7 (246-401)||(1293011-1293157)
chr7 (9-165)||(16542762-16542922)
chr7 (9-165)||(16622740-16622900)
chr7 (4-92)||(5826318-5826406)
chr7 (182-400)||(24794681-24794891)
chr7 (298-401)||(27871699-27871803)
chr7 (4-92)||(48062547-48062635)
chr7 (181-401)||(48062786-48062997)
chr7 (4-165)||(13880376-13880543)
chr7 (204-366)||(13880604-13880766)
chr7 (181-401)||(32264683-32264895)
chr7 (4-92)||(32264442-32264530)
chr7 (233-401)||(41842282-41842450)
chr7 (4-111)||(4821807-4821914)
chr7 (246-401)||(13018527-13018682)
chr7 (298-401)||(48805953-48806056)
chr7 (347-489)||(8999014-8999155)
chr7 (4-165)||(30945110-30945275)
chr7 (347-408)||(6044292-6044353)
chr7 (4-132)||(35952389-35952519)
chr7 (4-92)||(8183298-8183387)
chr7 (253-338)||(16556667-16556752)
chr7 (253-338)||(16608910-16608995)
chr7 (9-92)||(27872047-27872131)
chr7 (11-130)||(30026203-30026323)
chr7 (4-130)||(2500337-2500464)
chr7 (10-128)||(12174049-12174168)
chr7 (4-132)||(16111601-16111731)
chr7 (204-361)||(13692372-13692520)
chr7 (4-165)||(2913340-2913508)
chr7 (4-165)||(14425693-14425862)
chr7 (4-135)||(15469774-15469906)
chr7 (4-130)||(4494785-4494912)
chr7 (4-125)||(22577739-22577862)
chr7 (16-165)||(7339615-7339769)
chr7 (347-489)||(11087124-11087265)
chr7 (9-165)||(11319677-11319839)
chr7 (4-165)||(2265250-2265419)
chr7 (4-165)||(9069852-9070012)
chr7 (181-400)||(21381394-21381605)
chr7 (347-407)||(48382304-48382365)
chr7 (342-489)||(13174680-13174827)
chr7 (293-401)||(13260684-13260792)
chr7 (1-132)||(13303131-13303263)
chr7 (4-123)||(23279759-23279879)
chr7 (4-162)||(48800360-48800524)
chr7 (264-363)||(9098286-9098385)
chr7 (298-400)||(4412036-4412138)
chr7 (331-401)||(4494558-4494628)
chr7 (1-165)||(10882889-10883059)
chr7 (19-92)||(24794473-24794546)
chr7 (460-557)||(48382201-48382297)
chr7 (11-165)||(13692612-13692772)
chr7 (11-130)||(15088801-15088921)
chr7 (4-60)||(16556525-16556581)
chr7 (4-60)||(16609081-16609137)
chr7 (4-92)||(19338979-19339066)
chr7 (489-565)||(38593935-38594010)
chr7 (4-122)||(44467370-44467489)
chr7 (25-130)||(331963-332068)
chr7 (319-510)||(602636-602828)
chr7 (16-92)||(21381182-21381259)
chr7 (4-132)||(28409344-28409473)
chr7 (9-132)||(16316300-16316424)
chr7 (16-165)||(13137655-13137810)
chr7 (181-243)||(7339831-7339893)
chr7 (4-128)||(29935096-29935222)
chr7 (4-132)||(13031806-13031934)
chr7 (193-309)||(13472548-13472665)
chr7 (19-165)||(13648970-13649123)
chr7 (4-132)||(13730429-13730558)
chr7 (182-251)||(4494637-4494708)
chr7 (25-112)||(19710740-19710827)
chr7 (9-130)||(12366474-12366596)
chr7 (4-92)||(14193429-14193518)
chr7 (4-60)||(5000573-5000629)
chr7 (4-60)||(13018243-13018299)
chr7 (25-109)||(15216826-15216910)
chr7 (181-229)||(27871863-27871911)
chr7 (4-63)||(7487597-7487656)
chr7 (319-362)||(13032167-13032210)
chr7 (1-60)||(14304099-14304158)
chr7 (16-74)||(9396651-9396709)
chr7 (25-71)||(48805605-48805651)
chr7 (4-112)||(8998598-8998706)
chr7 (11-60)||(9065824-9065873)
chr7 (4-45)||(15701009-15701050)
chr7 (133-165)||(4821761-4821793)
chr7 (16-48)||(7185310-7185342)
chr7 (4-60)||(9097958-9098014)
chr7 (4-60)||(13880979-13881035)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (347-565)||(6926-7144)
[»] chr2 (187 HSPs)
chr2 (347-562)||(29244215-29244431)
chr2 (347-562)||(29254794-29255010)
chr2 (347-562)||(43082640-43082856)
chr2 (347-565)||(17857456-17857675)
chr2 (347-562)||(7005826-7006042)
chr2 (347-562)||(43093249-43093465)
chr2 (347-565)||(9897593-9897812)
chr2 (347-565)||(9908181-9908400)
chr2 (347-565)||(36251863-36252082)
chr2 (347-565)||(40222323-40222542)
chr2 (347-565)||(40251184-40251403)
chr2 (347-565)||(1099214-1099433)
chr2 (347-565)||(4220473-4220692)
chr2 (347-565)||(11388828-11389047)
chr2 (347-565)||(22914883-22915102)
chr2 (347-565)||(24327753-24327972)
chr2 (347-565)||(32217864-32218083)
chr2 (347-565)||(34790236-34790455)
chr2 (347-565)||(34804379-34804598)
chr2 (347-565)||(21172486-21172703)
chr2 (347-562)||(10266987-10267203)
chr2 (347-562)||(10277564-10277780)
chr2 (347-562)||(11395191-11395407)
chr2 (347-562)||(11405507-11405723)
chr2 (347-562)||(24338423-24338639)
chr2 (347-562)||(39170114-39170330)
chr2 (347-565)||(4209881-4210100)
chr2 (347-565)||(9762789-9763008)
chr2 (347-565)||(9773325-9773544)
chr2 (347-565)||(16768933-16769152)
chr2 (347-565)||(18392656-18392875)
chr2 (347-565)||(22960351-22960570)
chr2 (347-562)||(28721336-28721550)
chr2 (347-565)||(2561481-2561698)
chr2 (347-565)||(18768926-18769142)
chr2 (347-565)||(27221371-27221591)
chr2 (347-565)||(35252972-35253192)
chr2 (347-565)||(35263581-35263801)
chr2 (347-565)||(35274206-35274426)
chr2 (347-565)||(21650551-21650769)
chr2 (347-565)||(34477919-34478137)
chr2 (347-565)||(43355013-43355231)
chr2 (347-565)||(30488842-30489062)
chr2 (347-565)||(43345398-43345616)
chr2 (347-565)||(27978402-27978618)
chr2 (347-565)||(28064931-28065147)
chr2 (355-562)||(28731930-28732136)
chr2 (347-562)||(38586107-38586320)
chr2 (347-565)||(24415042-24415258)
chr2 (347-565)||(26867064-26867280)
chr2 (347-562)||(26879656-26879869)
chr2 (181-528)||(6574023-6574371)
chr2 (347-562)||(36784824-36785031)
chr2 (161-363)||(20151915-20152118)
chr2 (347-557)||(967522-967730)
chr2 (347-520)||(4099819-4099993)
chr2 (177-400)||(25829114-25829339)
chr2 (182-400)||(30666969-30667189)
chr2 (181-401)||(6392613-6392834)
chr2 (347-557)||(24275027-24275235)
chr2 (164-401)||(28711582-28711819)
chr2 (181-401)||(31800788-31801008)
chr2 (161-400)||(23234987-23235228)
chr2 (182-400)||(13963878-13964098)
chr2 (347-559)||(17969228-17969438)
chr2 (182-401)||(33074205-33074424)
chr2 (347-557)||(19498010-19498218)
chr2 (181-401)||(22802440-22802659)
chr2 (182-401)||(20568650-20568871)
chr2 (347-537)||(22774380-22774568)
chr2 (411-565)||(24427670-24427823)
chr2 (204-401)||(38781377-38781575)
chr2 (164-401)||(28701113-28701350)
chr2 (184-401)||(34321840-34322057)
chr2 (177-401)||(24576014-24576241)
chr2 (186-418)||(30621177-30621412)
chr2 (186-418)||(30623798-30624033)
chr2 (182-401)||(21537148-21537369)
chr2 (184-528)||(22317447-22317792)
chr2 (181-401)||(30557220-30557441)
chr2 (204-401)||(18376830-18377027)
chr2 (182-400)||(22188002-22188222)
chr2 (182-400)||(25037159-25037379)
chr2 (182-400)||(25041266-25041486)
chr2 (182-401)||(19540395-19540616)
chr2 (177-365)||(45087079-45087269)
chr2 (181-401)||(31327866-31328086)
chr2 (181-401)||(31334587-31334807)
chr2 (16-166)||(20151726-20151881)
chr2 (182-400)||(9015270-9015488)
chr2 (347-557)||(19300029-19300238)
chr2 (347-557)||(19313036-19313245)
chr2 (347-537)||(22763676-22763864)
chr2 (173-418)||(24850556-24850805)
chr2 (182-401)||(10009649-10009871)
chr2 (347-557)||(20646626-20646835)
chr2 (182-401)||(24377080-24377301)
chr2 (232-400)||(40782457-40782625)
chr2 (4-165)||(28711376-28711543)
chr2 (347-557)||(19356321-19356529)
chr2 (182-400)||(22776200-22776408)
chr2 (182-400)||(22781578-22781786)
chr2 (181-401)||(28550829-28551039)
chr2 (4-165)||(28700875-28701042)
chr2 (161-385)||(35743883-35744105)
chr2 (181-400)||(44840414-44840622)
chr2 (280-510)||(1083884-1084106)
chr2 (204-401)||(41121644-41121840)
chr2 (185-354)||(22260432-22260603)
chr2 (181-401)||(31967954-31968164)
chr2 (205-400)||(24779323-24779518)
chr2 (233-400)||(39037595-39037762)
chr2 (182-400)||(28140519-28140739)
chr2 (347-483)||(22779811-22779946)
chr2 (182-401)||(1586944-1587153)
chr2 (4-162)||(6573802-6573965)
chr2 (4-165)||(22317882-22318049)
chr2 (177-400)||(22785562-22785775)
chr2 (295-398)||(40332069-40332172)
chr2 (295-401)||(14581494-14581600)
chr2 (4-132)||(22802782-22802911)
chr2 (204-401)||(23595494-23595688)
chr2 (4-132)||(45086798-45086927)
chr2 (182-378)||(3277032-3277219)
chr2 (4-149)||(28550588-28550740)
chr2 (4-132)||(31967712-31967843)
chr2 (4-165)||(34321565-34321735)
chr2 (347-408)||(28374534-28374595)
chr2 (4-92)||(40332430-40332519)
chr2 (298-510)||(24814609-24814813)
chr2 (4-165)||(23235277-23235444)
chr2 (245-380)||(26619066-26619201)
chr2 (4-164)||(31327619-31327785)
chr2 (4-164)||(31334340-31334506)
chr2 (4-165)||(1586702-1586871)
chr2 (4-112)||(13963673-13963782)
chr2 (292-401)||(22455002-22455111)
chr2 (4-165)||(31800545-31800716)
chr2 (243-374)||(25189404-25189535)
chr2 (298-510)||(23392686-23392898)
chr2 (4-130)||(9015031-9015161)
chr2 (347-406)||(24425571-24425629)
chr2 (4-130)||(38781690-38781817)
chr2 (4-125)||(24576364-24576486)
chr2 (4-165)||(44840692-44840862)
chr2 (4-92)||(14581803-14581892)
chr2 (4-128)||(21536912-21537037)
chr2 (4-149)||(22775974-22776127)
chr2 (4-149)||(22781352-22781505)
chr2 (4-92)||(3277338-3277429)
chr2 (4-165)||(25829373-25829541)
chr2 (4-165)||(33074512-33074680)
chr2 (4-165)||(38631223-38631391)
chr2 (322-401)||(23184346-23184425)
chr2 (245-373)||(22272139-22272268)
chr2 (4-112)||(24793648-24793757)
chr2 (342-537)||(22755312-22755504)
chr2 (11-130)||(30621497-30621617)
chr2 (11-130)||(30624118-30624238)
chr2 (4-60)||(40782852-40782908)
chr2 (205-376)||(19115087-19115257)
chr2 (4-130)||(30667299-30667426)
chr2 (245-376)||(44881171-44881302)
chr2 (4-132)||(19540706-19540835)
chr2 (4-60)||(20568411-20568467)
chr2 (16-60)||(44366819-44366863)
chr2 (4-130)||(25036931-25037058)
chr2 (4-130)||(25041038-25041165)
chr2 (25-110)||(1084392-1084477)
chr2 (4-112)||(24814223-24814332)
chr2 (4-60)||(10009430-10009486)
chr2 (4-60)||(17966812-17966868)
chr2 (4-60)||(18430594-18430650)
chr2 (4-60)||(22187782-22187838)
chr2 (11-63)||(22260783-22260835)
chr2 (4-60)||(24377450-24377506)
chr2 (11-63)||(44881533-44881585)
chr2 (25-104)||(19297270-19297348)
chr2 (350-381)||(20568134-20568165)
chr2 (1-60)||(21846482-21846541)
chr2 (4-63)||(28140297-28140356)
chr2 (22-104)||(19312628-19312709)
chr2 (350-400)||(22258181-22258231)
chr2 (11-60)||(14867569-14867618)
chr2 (4-61)||(24302609-24302666)
chr2 (4-60)||(26618763-26618820)
chr2 (4-59)||(21025130-21025186)
[»] scaffold0047 (5 HSPs)
scaffold0047 (347-565)||(40493-40712)
scaffold0047 (347-565)||(32944-33160)
scaffold0047 (184-327)||(30283-30428)
scaffold0047 (199-401)||(9888-10089)
scaffold0047 (4-112)||(30554-30663)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (347-562)||(6882-7098)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (347-565)||(7795-8012)
scaffold0068 (347-565)||(10642-10859)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (347-562)||(31132-31348)
scaffold0133 (347-562)||(42561-42775)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (347-565)||(12353-12572)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (347-565)||(7958-8178)
scaffold0105 (347-565)||(36997-37217)
scaffold0105 (347-499)||(47631-47785)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (347-565)||(2259-2476)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (347-537)||(2825-3014)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (347-562)||(12156-12370)
scaffold0407 (347-458)||(15987-16097)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (347-565)||(13648-13864)
[»] scaffold1359 (4 HSPs)
scaffold1359 (181-385)||(561-765)
scaffold1359 (4-165)||(357-523)
scaffold1359 (177-400)||(1667-1880)
scaffold1359 (4-92)||(1447-1536)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (347-565)||(36775-36992)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (347-562)||(5298-5511)
[»] scaffold0227 (2 HSPs)
scaffold0227 (182-401)||(22661-22882)
scaffold0227 (4-132)||(22974-23103)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (347-562)||(52143-52361)
[»] scaffold0084 (7 HSPs)
scaffold0084 (347-557)||(56822-57030)
scaffold0084 (182-418)||(32452-32691)
scaffold0084 (182-400)||(49318-49538)
scaffold0084 (269-394)||(339-464)
scaffold0084 (25-92)||(3-70)
scaffold0084 (4-165)||(49593-49760)
scaffold0084 (368-421)||(464-518)
[»] scaffold0012 (5 HSPs)
scaffold0012 (163-401)||(215385-215623)
scaffold0012 (347-557)||(140812-141021)
scaffold0012 (347-557)||(127654-127862)
scaffold0012 (16-165)||(215161-215316)
scaffold0012 (350-562)||(7693-7905)
[»] scaffold1331 (2 HSPs)
scaffold1331 (181-401)||(1605-1825)
scaffold1331 (4-165)||(279-445)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (182-401)||(6647-6866)
scaffold0439 (4-149)||(6376-6528)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (161-418)||(89941-90199)
scaffold0003 (4-165)||(89740-89906)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (350-562)||(10331-10541)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (347-511)||(6259-6423)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (347-562)||(175327-175540)
scaffold0017 (350-537)||(40388-40574)
scaffold0017 (350-537)||(58934-59120)
scaffold0017 (347-375)||(180424-180452)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (347-501)||(1-155)
scaffold0216 (4-77)||(29929-30002)
[»] scaffold0043 (3 HSPs)
scaffold0043 (182-401)||(78273-78492)
scaffold0043 (18-165)||(78047-78200)
scaffold0043 (20-60)||(25388-25428)
[»] scaffold0002 (6 HSPs)
scaffold0002 (347-514)||(117148-117314)
scaffold0002 (342-489)||(475317-475464)
scaffold0002 (342-489)||(481837-481984)
scaffold0002 (342-510)||(156693-156861)
scaffold0002 (4-114)||(481441-481551)
scaffold0002 (10-63)||(112564-112617)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (182-401)||(36680-36901)
scaffold0120 (182-401)||(42104-42325)
scaffold0120 (4-130)||(36444-36571)
scaffold0120 (4-130)||(42434-42561)
[»] scaffold0471 (2 HSPs)
scaffold0471 (161-401)||(3289-3529)
scaffold0471 (11-165)||(3611-3773)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (347-559)||(35543-35753)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (182-398)||(60791-61007)
scaffold0015 (4-162)||(61083-61249)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (173-401)||(27325-27555)
scaffold0171 (4-130)||(27113-27240)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (347-514)||(40552-40718)
[»] scaffold0161 (3 HSPs)
scaffold0161 (161-401)||(9991-10234)
scaffold0161 (319-401)||(14816-14898)
scaffold0161 (16-125)||(9818-9927)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (347-562)||(19242-19466)
scaffold0099 (357-562)||(16985-17203)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (182-401)||(9140-9358)
scaffold0176 (4-92)||(9537-9626)
[»] scaffold0337 (2 HSPs)
scaffold0337 (204-401)||(14633-14830)
scaffold0337 (4-129)||(14978-15104)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (184-401)||(7690-7907)
scaffold0251 (4-161)||(7969-8132)
[»] scaffold0004 (7 HSPs)
scaffold0004 (182-400)||(377464-377684)
scaffold0004 (185-401)||(211383-211599)
scaffold0004 (247-379)||(244256-244388)
scaffold0004 (231-400)||(220224-220392)
scaffold0004 (4-129)||(377244-377370)
scaffold0004 (4-88)||(211761-211846)
scaffold0004 (11-127)||(30547-30663)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (182-418)||(20876-21115)
scaffold0116 (4-132)||(20640-20768)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (347-537)||(12865-13053)
[»] scaffold0479 (2 HSPs)
scaffold0479 (182-401)||(9954-10175)
scaffold0479 (11-92)||(10290-10373)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (177-400)||(60002-60227)
scaffold0026 (177-399)||(7913-8137)
scaffold0026 (4-165)||(8171-8339)
scaffold0026 (11-132)||(60329-60451)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (204-401)||(1675-1872)
[»] scaffold0290 (2 HSPs)
scaffold0290 (204-400)||(18550-18746)
scaffold0290 (4-130)||(18289-18416)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (185-385)||(25883-26085)
scaffold0083 (226-353)||(44655-44782)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (347-557)||(15737-15945)
scaffold0410 (25-109)||(7063-7147)
[»] scaffold0005 (7 HSPs)
scaffold0005 (232-401)||(212339-212509)
scaffold0005 (184-327)||(6105-6250)
scaffold0005 (4-165)||(245911-246081)
scaffold0005 (350-489)||(61119-61257)
scaffold0005 (9-165)||(212629-212791)
scaffold0005 (4-112)||(5870-5979)
scaffold0005 (181-229)||(246153-246201)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (347-559)||(2000-2210)
[»] scaffold0217 (6 HSPs)
scaffold0217 (181-401)||(9545-9764)
scaffold0217 (204-401)||(19016-19213)
scaffold0217 (182-401)||(22038-22257)
scaffold0217 (4-160)||(19315-19477)
scaffold0217 (4-165)||(21783-21952)
scaffold0217 (11-165)||(9836-10000)
[»] scaffold0861 (2 HSPs)
scaffold0861 (182-401)||(4852-5073)
scaffold0861 (16-60)||(4627-4671)
[»] scaffold0771 (2 HSPs)
scaffold0771 (185-400)||(461-678)
scaffold0771 (11-130)||(791-911)
[»] scaffold0426 (2 HSPs)
scaffold0426 (226-400)||(13557-13731)
scaffold0426 (4-165)||(13886-14054)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (182-401)||(1645-1866)
scaffold0210 (4-130)||(1946-2073)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (182-401)||(103556-103778)
scaffold0023 (16-130)||(103872-103987)
[»] scaffold0411 (2 HSPs)
scaffold0411 (182-400)||(12195-12415)
scaffold0411 (1-130)||(12526-12656)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (269-421)||(164940-165093)
scaffold0011 (181-332)||(65335-65485)
scaffold0011 (181-332)||(144380-144530)
scaffold0011 (4-132)||(65093-65224)
scaffold0011 (4-92)||(135060-135149)
scaffold0011 (25-92)||(164589-164656)
scaffold0011 (1-60)||(59920-59979)
[»] scaffold0414 (2 HSPs)
scaffold0414 (182-399)||(7063-7282)
scaffold0414 (4-92)||(6804-6893)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (182-400)||(5595-5815)
scaffold0359 (4-165)||(5359-5527)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (270-510)||(38080-38319)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (184-396)||(143087-143292)
scaffold0007 (347-557)||(59332-59539)
scaffold0007 (18-165)||(143366-143519)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (347-514)||(29524-29691)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (182-401)||(99115-99331)
scaffold0035 (182-385)||(19377-19582)
scaffold0035 (4-92)||(98843-98932)
scaffold0035 (11-60)||(19149-19198)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (350-557)||(1213-1418)
scaffold0752 (350-557)||(1828-2033)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (190-373)||(15130-15315)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (347-537)||(58329-58517)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (204-401)||(5992-6188)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (347-537)||(28836-29025)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (184-401)||(17684-17891)
scaffold0249 (4-92)||(17439-17528)
[»] scaffold0211 (3 HSPs)
scaffold0211 (270-421)||(15617-15769)
scaffold0211 (16-92)||(15267-15343)
scaffold0211 (4-45)||(27741-27782)
[»] scaffold0056 (6 HSPs)
scaffold0056 (181-401)||(34719-34930)
scaffold0056 (181-401)||(25580-25791)
scaffold0056 (4-92)||(25324-25412)
scaffold0056 (4-92)||(34478-34566)
scaffold0056 (245-372)||(36154-36281)
scaffold0056 (16-63)||(35857-35904)
[»] scaffold0527 (4 HSPs)
scaffold0527 (181-355)||(7963-8136)
scaffold0527 (4-149)||(162-314)
scaffold0527 (4-149)||(8225-8377)
scaffold0527 (181-244)||(10-73)
[»] scaffold0090 (4 HSPs)
scaffold0090 (347-557)||(654-862)
scaffold0090 (347-557)||(5034-5242)
scaffold0090 (25-104)||(1156-1234)
scaffold0090 (25-104)||(5536-5614)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (243-400)||(9942-10099)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (347-539)||(744-934)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (177-400)||(15779-16006)
scaffold0193 (4-60)||(16168-16224)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (4-165)||(1536-1703)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (246-401)||(2702-2856)
scaffold0280 (342-513)||(17873-18044)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (280-421)||(1802-1944)
[»] scaffold0247 (4 HSPs)
scaffold0247 (260-401)||(25384-25525)
scaffold0247 (181-264)||(23469-23551)
scaffold0247 (347-401)||(15811-15865)
scaffold0247 (133-165)||(23382-23414)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (299-510)||(20409-20611)
scaffold0177 (16-92)||(20067-20144)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (430-557)||(38120-38246)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (177-314)||(686-825)
[»] scaffold0022 (8 HSPs)
scaffold0022 (182-323)||(39488-39631)
scaffold0022 (182-323)||(137548-137691)
scaffold0022 (206-398)||(159043-159234)
scaffold0022 (325-401)||(37387-37463)
scaffold0022 (325-401)||(135447-135523)
scaffold0022 (4-130)||(39727-39854)
scaffold0022 (4-130)||(137787-137914)
scaffold0022 (4-58)||(159461-159515)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (9-112)||(11277-11380)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (342-489)||(5014-5161)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (347-423)||(8103-8179)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (4-92)||(87268-87356)
scaffold0045 (298-399)||(87623-87724)
[»] scaffold0607 (2 HSPs)
scaffold0607 (1-160)||(7195-7362)
scaffold0607 (349-401)||(5991-6043)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (423-557)||(9907-10040)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (218-356)||(9825-9963)
scaffold0334 (4-130)||(10109-10236)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (317-489)||(7181-7354)
scaffold0269 (25-112)||(7643-7730)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (270-489)||(1674-1886)
[»] scaffold0473 (3 HSPs)
scaffold0473 (4-92)||(2394-2482)
scaffold0473 (322-399)||(2738-2815)
scaffold0473 (181-287)||(2618-2723)
[»] scaffold0352 (3 HSPs)
scaffold0352 (4-92)||(495-583)
scaffold0352 (300-400)||(846-945)
scaffold0352 (181-266)||(736-821)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (298-401)||(7366-7469)
scaffold0387 (4-92)||(7745-7833)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (347-418)||(7375-7446)
[»] scaffold0908 (2 HSPs)
scaffold0908 (317-489)||(3937-4110)
scaffold0908 (25-112)||(3560-3647)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (264-401)||(43908-44044)
[»] scaffold0018 (4 HSPs)
scaffold0018 (298-510)||(6553-6757)
scaffold0018 (4-60)||(52892-52948)
scaffold0018 (4-60)||(56844-56900)
scaffold0018 (4-112)||(6167-6276)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (342-489)||(61629-61776)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (347-401)||(1701-1755)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (280-510)||(16831-17053)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (243-385)||(40638-40780)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (342-510)||(11637-11804)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (298-401)||(708-812)
scaffold0016 (4-92)||(3219-3307)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (298-510)||(966-1170)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (298-510)||(1159-1363)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (4-92)||(5013-5100)
scaffold0069 (298-396)||(5347-5446)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (342-401)||(9281-9340)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (4-132)||(9045-9173)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (264-373)||(1510-1619)
scaffold0040 (4-60)||(1167-1223)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (4-92)||(11750-11838)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (271-379)||(74588-74696)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (293-380)||(1323-1410)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (293-380)||(1-88)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (253-380)||(5633-5759)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (473-557)||(16518-16601)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (319-370)||(2039-2090)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (384-489)||(1114-1218)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (4-72)||(8649-8718)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (184-270)||(4900-4988)
scaffold0243 (84-132)||(4759-4807)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (18-60)||(13216-13258)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (4-62)||(45965-46023)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (347-381)||(31856-31890)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (347-381)||(35199-35233)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (11-132)||(60560-60682)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (347-400)||(9892-9945)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (347-380)||(384-417)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (352-401)||(84380-84429)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (4-60)||(145256-145312)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (352-399)||(2969-3016)
[»] scaffold1898 (1 HSPs)
scaffold1898 (25-91)||(1191-1257)
[»] scaffold1782 (1 HSPs)
scaffold1782 (4-42)||(693-731)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (350-396)||(22030-22076)
[»] scaffold1709 (1 HSPs)
scaffold1709 (4-45)||(1-42)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (4-76)||(4788-4861)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (347-375)||(4540-4568)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (347-375)||(6250-6278)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (4-59)||(10925-10981)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 189)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 35013085 - 35012870
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35013085 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaa 35012986  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35012985 tttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 35012886  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  35012885 tcaacgtctctttcac 35012870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 23580370 - 23580589
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23580370 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatga 23580469  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23580470 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 23580569  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23580570 ctcaacgtctctttcacgcc 23580589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4167422 - 4167203
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4167422 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 4167323  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4167322 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 4167223  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4167222 ctcaacgtctctttcacgcc 4167203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4178078 - 4177859
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  4178078 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcaaaatttgtacgttcaagatgggaatga 4177979  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4177978 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 4177879  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4177878 ctcaacgtctctttcacgcc 4177859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 4250609 - 4250826
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4250609 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 4250707  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4250708 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 4250807  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  4250808 tcaacatctctttcacgcc 4250826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19188001 - 19187785
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  19188001 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 19187902  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19187901 atttgaagcttactcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 19187802  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  19187801 ctcaacgtctctttcac 19187785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 12730710 - 12730491
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12730710 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 12730611  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12730610 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 12730511  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12730510 ctcaacgtctctttcacgcc 12730491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 12741303 - 12741084
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12741303 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 12741204  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12741203 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 12741104  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12741103 ctcaacgtctctttcacgcc 12741084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 12898027 - 12898246
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12898027 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 12898126  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12898127 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 12898226  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12898227 ctcaacgtctctttcacgcc 12898246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 21877930 - 21877711
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  21877930 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 21877831  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21877830 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 21877731  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21877730 ctcaacgtctctttcacgcc 21877711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 21895365 - 21895146
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  21895365 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 21895266  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21895265 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 21895166  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21895165 ctcaacgtctctttcacgcc 21895146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19179122 - 19178906
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  19179122 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 19179023  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19179022 atttgaagcttactcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 19178923  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  19178922 ctcaacgtctctttcac 19178906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 5639754 - 5639973
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5639754 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 5639853  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5639854 atttgaagcgtattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5639953  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5639954 ctcaacgtctctttcacgcc 5639973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 5650311 - 5650530
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5650311 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 5650410  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5650411 atttgaagcgtattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5650510  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5650511 ctcaacgtctctttcacgcc 5650530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 12614360 - 12614579
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12614360 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 12614459  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12614460 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 12614559  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12614560 ctcaacgtctctttcacgcc 12614579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 12623825 - 12624044
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12623825 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 12623924  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12623925 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 12624024  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12624025 ctcaacgtctctttcacgcc 12624044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 33084725 - 33084506
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33084725 aagtgtacaaccactacctccactactctattttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 33084626  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33084625 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 33084526  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33084525 ctcaacgtctctttcacgcc 33084506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 20441361 - 20441578
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20441361 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctacagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 20441460  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | || |||    
T  20441461 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaattc-aacgactctttagacgtgcttatcatc 20441559  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20441560 tcaacgtctctttcacgcc 20441578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 560
Target Start/End: Original strand, 7689503 - 7689715
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7689503 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgtgaatgaa 7689601  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  7689602 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacggctctttagacgtgctaattatc 7689701  T
Q  547 tcaacgtctctttc 560  Q
    ||||||||||||||    
T  7689702 tcaacgtctctttc 7689715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 7507465 - 7507249
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  7507465 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 7507366  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7507365 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 7507266  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  7507265 ctcaacgtctctttcac 7507249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 7518062 - 7517846
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  7518062 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 7517963  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7517962 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 7517863  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  7517862 ctcaacgtctctttcac 7517846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 51629231 - 51629447
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  51629231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 51629330  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51629331 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 51629430  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  51629431 ctcaacgtctctttcac 51629447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 51656492 - 51656708
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  51656492 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 51656591  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51656592 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 51656691  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  51656692 ctcaacgtctctttcac 51656708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 10997828 - 10998047
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  10997828 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 10997927  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10997928 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagaagtgctgattat 10998027  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10998028 ctcaacgtctctttcacgcc 10998047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 21863824 - 21863605
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  21863824 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtttacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 21863725  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21863724 atttgaagcttatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 21863625  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21863624 ctcaacgtctctttcacgcc 21863605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 39194138 - 39194352
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194138 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 39194236  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||    
T  39194237 tttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctaatcatc 39194336  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  39194337 tcaacgtctctttcac 39194352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 154333 - 154550
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  154333 aagtgtataaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaa 154431  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  154432 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 154531  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  154532 tcaacgtctctttcacgcc 154550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 35648734 - 35648954
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  35648734 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35648833  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35648834 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 35648933  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35648934 tctcaacgtctctttcacgcc 35648954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 38095240 - 38095020
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  38095240 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 38095141  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38095140 aatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 38095041  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38095040 tctcaacgtctctttcacgcc 38095020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 38105865 - 38105645
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  38105865 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 38105766  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38105765 aatttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 38105666  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38105665 tctcaacgtctctttcacgcc 38105645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 148258 - 148475
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  148258 aagtgtacaatcactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaa 148356  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  148357 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 148456  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  148457 tcaacgtctctttcacgcc 148475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 161 - 528
Target Start/End: Original strand, 22464664 - 22465030
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactg 259  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22464664 ctgaaaatcaccagatgctacagttcatcaggagatgtaacataaagcttcaaaaggttgttcaacggatttaatctcatctaagcattgcagaagactg 22464763  T
Q  260 gaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaacca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||    
T  22464764 gaaaagtgaagcaacgactaatttgaaatgatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaagtgtacgaagtgtacatcca 22464863  T
Q  360 ctacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgat 458  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||  ||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||||    
T  22464864 ctacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgat 22464962  T
Q  459 tcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 528  Q
     ||||| || || | | ||| |||||||||| ||| | |||||  |||||||||   |||||||||||||    
T  22464963 ccttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaag--cttcaaacgactct 22465030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 5973926 - 5973703
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973926 aagtgtacaaccactgcctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 5973828  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg------ttg 540  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |     
T  5973827 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattata 5973728  T
Q  541 attatctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5973727 attatctcaacgtctctttcacgcc 5973703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 5833382 - 5833162
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  5833382 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 5833283  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5833282 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 5833183  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5833182 tctcaacgtctctttcacgcc 5833162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 5843984 - 5843764
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  5843984 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 5843885  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5843884 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 5843785  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5843784 tctcaacgtctctttcacgcc 5843764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 35401208 - 35401428
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  35401208 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35401307  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  35401308 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtactgatta 35401407  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35401408 tctcaacgtctctttcacgcc 35401428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 35404435 - 35404655
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  35404435 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35404534  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  35404535 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtactgatta 35404634  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35404635 tctcaacgtctctttcacgcc 35404655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 35638082 - 35638302
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  35638082 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35638181  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35638182 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacctgctgatta 35638281  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35638282 tctcaacgtctctttcacgcc 35638302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 47607974 - 47608194
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  47607974 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 47608073  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47608074 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 47608173  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  47608174 tctcaacgtctctttcacgcc 47608194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 47618582 - 47618802
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  47618582 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 47618681  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47618682 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 47618781  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  47618782 tctcaacgtctctttcacgcc 47618802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 2538698 - 2538480
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| |  |||||||||||||||    
T  2538698 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagt-tttgtacactcaagatgggaatga 2538600  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2538599 atttgaagcttatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 2538500  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2538499 ctcaacgtctctttcacgcc 2538480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 18381948 - 18382161
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  18381948 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaa 18382046  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||    
T  18382047 tttgaagctaattcttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgttaatcatc 18382145  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  18382146 tcaacgtctctttcac 18382161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 181 - 490
Target Start/End: Original strand, 25448442 - 25448751
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  25448442 cagttcatcagaagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcagcgactat 25448541  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25448542 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 25448641  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaa 479  Q
    |||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |   ||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||     
T  25448642 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaacaaccat 25448740  T
Q  480 atcaggcaaag 490  Q
    |||||||||||    
T  25448741 atcaggcaaag 25448751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 3171786 - 3171566
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||||||||||    
T  3171786 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatg 3171687  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3171686 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 3171587  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3171586 tctcaacgtctctttcacgcc 3171566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 3182388 - 3182168
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||||||||||    
T  3182388 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatg 3182289  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3182288 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 3182189  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3182188 tctcaacgtctctttcacgcc 3182168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 36236474 - 36236692
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  36236474 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 36236572  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36236573 atttgaaatttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 36236672  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36236673 ctcaacgtctctttcacgcc 36236692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 36247021 - 36247239
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  36247021 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 36247119  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36247120 atttgaaatttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 36247219  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36247220 ctcaacgtctctttcacgcc 36247239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 161 - 418
Target Start/End: Original strand, 22427213 - 22427471
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22427213 ctgaaaatcaccagaagctccagttcatcaggagatgcaacataaagcttcaaagactgttcaatagatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgg 22427312  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22427313 aaaagtgaagcaacgactagtttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttaaaaaagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccac 22427412  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgca 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  22427413 tacctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 22427471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 9050532 - 9050745
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  9050532 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatggtaatgaa 9050630  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | || |||    
T  9050631 tttgaagctattttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaattc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 9050729  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  9050730 tcaacgtctctttcac 9050745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29215998 - 29215781
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  29215998 ttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaggttgtttaatggatttaatctcgtctaagcattgcaaaagactagaaaagtgaagcaacggctagttt 29215899  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29215898 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgataacaaagtacaattgtacgaagtgtacaatcactagctccactactctgtttttgt 29215799  T
Q  384 ctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||  |||||||| |||||    
T  29215798 ctctgctacaaggcaaga 29215781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 11195111 - 11195325
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  11195111 aagtgtacaaccattacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 11195209  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  11195210 tttgaagttgatccttcaaaggactacactcaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatc 11195309  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  11195310 tcaacgtctctttcac 11195325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 39587132 - 39586915
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  39587132 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatga 39587034  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || ||    
T  39587033 atttgaagctaattcttcaaaggactacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcat 39586935  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39586934 ctcaacgtctctttcacgcc 39586915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 22600057 - 22600278
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||    
T  22600057 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatcttgtctaagcattgcagaagactggaagagtaaaacaacgacta 22600156  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22600157 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 22600256  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  22600257 ttgtctctgctacaagacaaga 22600278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2834914 - 2834673
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||   |||||||     
T  2834914 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcgggagatgcaacttaaagcttccaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgttgaagactga 2834815  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2834814 aaaagtgaagcaacggctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagaacgttgacaaagtacgattgtacgaattgtacaaccac 2834715  T
Q  361 tacctccactactctgtt-tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2834714 tgcctccactactctgttctttgtctctgctacaagacaaga 2834673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 177 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2267297 - 2267073
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2267297 gctacagttcatcaggagatgcaacataaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaa 2267198  T
Q  277 ctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2267197 ctagtttgaaagaatttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgtcaaagtgcaattgtatgaagtgtacaaccactacctccactactatg 2267098  T
Q  377 tttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||    
T  2267097 tttttgtctctactacaagacaaga 2267073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 47195424 - 47195207
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  47195424 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatga 47195326  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || ||    
T  47195325 atttgaagttaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcgaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcat 47195227  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47195226 ctcaacgtctctttcacgcc 47195207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1900550 - 1900329
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | | || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1900550 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttattcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgacta 1900451  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900450 ttttgaaaggatttaaaggcattgaatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacagttgtaagaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 1900351  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  1900350 ttgtctctgctacaagacaaga 1900329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22154062 - 22153841
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22154062 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaatagtgaagcaacaacta 22153963  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22153962 atttgaaaggatttgaaagcattggatgattgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 22153863  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  22153862 ttgtctctgctacaagacaaga 22153841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 32785813 - 32786033
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32785813 agttcatcatgagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcat-ggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgacta 32785911  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32785912 gtttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttaaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactatgttt 32786011  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||| ||||| |||||||||    
T  32786012 ttgtctccgctaaaagacaaga 32786033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 35040367 - 35040150
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  35040367 ttcatcatgggatgcaacttaaggcttcaaaagttgtttaatggatccaacctcgtctaaagattgcagaagactagaaaagtaaagcaacgactatttt 35040268  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35040267 gaaaggatttgaaagcattggatgcttgatcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 35040168  T
Q  384 ctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  35040167 ctctgctacaagacaaga 35040150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 181 - 383
Target Start/End: Original strand, 39200868 - 39201070
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||     
T  39200868 cagttcattaggagatgcaacataaagcttcaaaagctgttcaatggatttaatctcatgtaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacggctag 39200967  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39200968 tttgaaaggatttgaagacattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 39201067  T
Q  381 tgt 383  Q
    |||    
T  39201068 tgt 39201070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17957402 - 17957189
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  17957402 aagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctacactacaagacaagaaaacaaccatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 17957304  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| | || ||     
T  17957303 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccatatcaggcaaagaattactggtggaagatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatt 17957205  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  17957204 tcaacgtctctttcac 17957189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 20195737 - 20195949
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  20195737 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatt-gttccatcaagatgggaatgaa 20195835  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  20195836 tttgaagttgatccttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct-aaaatc 20195933  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  20195934 tcaacgtctctttcac 20195949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 14388170 - 14388378
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  14388170 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 14388268  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  14388269 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 14388367  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  14388368 tcaacgtctct 14388378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 347 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 675609 - 675403
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||| |||||||||||    
T  675609 aagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaaaatgggaatgaa 675511  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  675510 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 675412  T
Q  547 tcaacgtct 555  Q
    |||||||||    
T  675411 tcaacgtct 675403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 185 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 35402011 - 35401792
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    ||||||| ||||||||  || |||||||||||   |||| || |||| ||||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35402011 tcatcagaagatgcaagacttaaagcttcaaagactgttcaatggatttaatctcgtttaaacaatacagaagactggaaaagtgaagcaacgactattt 35401912  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35401911 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactatgtttttt 35401812  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  35401811 gtctctgctacaagacaaga 35401792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 177 - 401
Target Start/End: Original strand, 33256221 - 33256447
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33256221 gctaaagttcaacaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaac 33256320  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33256321 gactattttaaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagggcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 33256420  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||| |||||  ||||||||||||||    
T  33256421 agtttgtgtctctgctacaagacaaga 33256447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 177 - 401
Target Start/End: Original strand, 33276393 - 33276619
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33276393 gctaaagttcaccaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaac 33276492  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33276493 gactattttaaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagggcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 33276592  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||| |||||  ||||||||||||||    
T  33276593 agtttgtgtctctgctacaagacaaga 33276619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 164 - 401
Target Start/End: Original strand, 2327298 - 2327536
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaa 263  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||  |||||| | ||||| |||    
T  2327298 aaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaatagattcaaactcgtctaaagattgcagatgactgaaaa 2327397  T
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctc-aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccacta 362  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2327398 agtgaagcaaaaactattttgaaaggattcgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcattgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccacta 2327497  T
Q  363 cctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  2327498 cctccactactctggttttgtctctgctacaagacaaga 2327536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38282771 - 38282551
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  ||    
T  38282771 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcatcgcagaagactggaagagtgaagcaacgggta 38282672  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38282671 ttttgaaaggatttaaaggcattgaatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagt-tacaaccactatctccactactctgttt 38282573  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||| ||||    
T  38282572 ttgtctctgctacaagataaga 38282551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 36134370 - 36134174
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    |||| |||||| | |||| || |||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36134370 aaagtttcaaaggttgttcaatggatttaatctcatctaaacaatgcagaagactggaaaagtggagcaacaactattttgaaaggatttgaag-cattg 36134272  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36134271 gatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 36134174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 347 - 514
Target Start/End: Original strand, 41132659 - 41132825
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  41132659 aagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-ctgttccttcaaaatgggaatgaa 41132757  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 514  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41132758 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 41132825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 44821422 - 44821641
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||  ||| | ||||||| ||||||  ||||||||||| |    
T  44821422 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaaaggattcaaactcgtctaaggtttgtagaagactgaaaaagtatagcaacgactatt 44821521  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44821522 ttggaaggatttgaaggctttgtatgcttattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaactactatctccactactctgttttt 44821621  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  44821622 gtctctgctacaagacaaga 44821641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 28492279 - 28492500
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  28492279 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatatcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacaacta 28492378  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28492379 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaatagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 28492478  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||| ||||||||    
T  28492479 gtgtctctgctactagacaaga 28492500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 167 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1578087 - 1577852
Alignment:
Q  167 atcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaa 264  Q
    |||| |||| |||| |||| ||||||||||||||  || | ||||||||| | |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1578087 atcacaagaagctaaagtttatcaggagatgcaagacttagagcttcaaaggttgttcaatagatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaga 1577988  T
Q  265 gtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacc 364  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  1577987 gtgaagcaacgactattttgaaagaatttgaaagcattggatgcttgttcttttaagagcgttgacaaagtataattgtactaagtgtacaaccactatc 1577888  T
Q  365 tccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  1577887 tccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 1577852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21703017 - 21702798
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  || |||||||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||| |||     
T  21703017 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaatttgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagacttgaaaagtatagcaacggctat 21702919  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21702918 tttgaaaggattgaagggcattgaatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 21702819  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  21702818 tgtctctgctacaagacaaga 21702798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 231 - 401
Target Start/End: Original strand, 16235222 - 16235392
Alignment:
Q  231 taatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgac 330  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  16235222 taatctcgtctaaacaatgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattgaatgcttgttctccaaagagtgttgac 16235321  T
Q  331 aaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  16235322 aaagtacaattgtacgaagtgtacaacaactacctccactactccttttttgtctctgctacaagacaaga 16235392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 18311016 - 18311224
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  18311016 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 18311114  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  18311115 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaagcaaaagattactggtgaatgatcaaagaaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 18311213  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  18311214 tcaacgtctct 18311224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 177 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2268738 - 2268515
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||| | |||| || |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||    
T  2268738 gctaaagttcattaggagatgcaagacttaaggcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaatcattgtagaagactggaagagttaagcaac 2268639  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
       || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2268638 ---tattttgaaatgatttgaaggcattgaatgcttgttcgtcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctcgactactc 2268542  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||    
T  2268541 tgtttttgtctctgctacaagacaaga 2268515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Original strand, 48570111 - 48570327
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||  || |||||||||| |||||| |||||| |||||||  | ||||||||| |||    
T  48570111 ttcatcaggagatgcaacttaaagtttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactagaaaagtataacaacgactatttt 48570209  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48570210 ggaaggattaaaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgt 48570309  T
Q  384 ctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||  |||||| |||||||    
T  48570310 ctctgctacaggacaaga 48570327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 231 - 400
Target Start/End: Original strand, 22201662 - 22201831
Alignment:
Q  231 taatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgac 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  22201662 taatctcgtctaagcattgcagaagactgaaaaagtaaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctatgaagagcgttgac 22201761  T
Q  331 aaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  22201762 aaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 22201831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 14263325 - 14263548
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaaga-tgtttaaa-ggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||| | ||||||||| || ||||||||| | |||| ||  ||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||| |||  || ||||||||    
T  14263325 cagttcatcatgtgatgcaacttaaggcttcaaaaaactgttcaattggattaaatcccgtctaaggattgcagaagactggagaagcaaaacaacgact 14263424  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg-t 377  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14263425 attttgaaaggatttgaaggcattggatacttgttcctcaaagagcgttggcaaagcacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 14263524  T
Q  378 ttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||  ||||||||||||||    
T  14263525 ttttgtctctgctacaagacaaga 14263548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 46180923 - 46181131
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  46180923 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcttcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 46181021  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  46181022 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagatc 46181120  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  46181121 tcaacgtctct 46181131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 20954348 - 20954568
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | | |    
T  20954348 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagacaggaagagtgaagcaatggcca 20954447  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20954448 ttttgaaaggatttgaaagcattggaggcttattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtaccaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 20954547  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     | |||  |||||||||||||    
T  20954548 gtttctctgctacaagacaag 20954568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 30572400 - 30572181
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||  || ||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||     
T  30572400 cagttcatcaggagatacaacttaaagcttcaatagctgtttcaaggattcaaactcgtctgag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacggctat 30572302  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| || ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30572301 tttgaaaggattgaaaagcattggatgtttattcttagaagagcgttgacatagtacgattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 30572202  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||| |  ||||||||||||||    
T  30572201 tgtttctgctacaagacaaga 30572181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 177 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19717734 - 19717508
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||||  ||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  19717734 gctaaagttcatatggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtcgaagcattgcagaggactggaagagtgaagcaac 19717635  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||    
T  19717634 gactattttgaaaggatttgaaggcatcggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacaactaactccacaaatc 19717535  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||| |||||  |||| |||||||||    
T  19717534 agtttgtgtctctgctaaaagacaaga 19717508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10757627 - 10757405
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||| || |   ||| ||||||||||| |||    
T  10757627 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaaaatcagaagagtgaagcaacaact 10757528  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  10757527 attttgaaaggatttgaaagcattggatgattgttctttgaagagcattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatcttcactactcagtt 10757428  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | |||||  ||||||||||||||    
T  10757427 tgtgtctctgctacaagacaaga 10757405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12284628 - 12284407
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||| ||||||||  || | ||||||||| | |||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  12284628 agttcatcagaagatgcaagacttagagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagaggagtgaagcaacgacta 12284529  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  12284528 ttttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaacactatctccactaatcagttt 12284429  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  12284428 gtgtctctgctacaagacaaga 12284407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 177 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 48704414 - 48704190
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  48704414 gctaaagttcatcagaagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtttaagcaatgcagaagactggaagagtgaaacaac 48704315  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  48704314 aactattttgaaaggatttgaaggcactggatgcttgttctttgaagaacgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccaatgtctccactactc 48704215  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
      ||| |||||  ||||||||||||    
T  48704214 aatttatgtctctgctacaagacaa 48704190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10251180 - 10250970
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  10251180 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtataacaacggctaa 10251082  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||         ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10251081 tttg---------gaaggcattggatgcttattcttcaaagagttttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccattatctccactactctgtttt 10250991  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||   |||||||||||||    
T  10250990 tgtctctactacaagacaaga 10250970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 46089184 - 46088974
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||| ||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||||||     
T  46089184 cagttcatcatgagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgcctaaaaattgcagaagactggaaaagtatggcaacgactat 46089085  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46089084 tttgaaagg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 46088994  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||  ||||| |||||||    
T  46088993 tgtctctgctactagacaag 46088974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 421
Target Start/End: Original strand, 7744966 - 7745207
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    ||||||||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||| ||||  || ||| |||||  | |||| ||||||| | ||| | ||||||   |||    
T  7744966 cagttcatcagaagatgcaacctacagtttcaaaagttgtttaatggattcaaactcatctaaagagtgcataagactgaagaagagtagcaacagttaa 7745065  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  7745066 tttgaaaggatttgaatgcatttgatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtttatacaaagtgtacaaccactacctccactactctgctat 7745165  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaa 421  Q
    || || ||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||    
T  7745166 tgccttcgctacatgacaagaaaaacagctttgcctgcagaa 7745207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 185 - 401
Target Start/End: Original strand, 23036405 - 23036625
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    ||||||| ||||||||  || ||||||||||| | | || || |||| |||||||||||||  | |||| ||||||  ||||||||| |||| |||| ||    
T  23036405 tcatcagaagatgcaagacttaaagcttcaaaggctattcaatggatttaatctcgtctaaataatgcagaagactaaaaaagtgaaacaacaactattt 23036504  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg--tttt 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  23036505 tgaaaggatttgaagacattggatgcttgttcttcaaagagcgtcaacaaagaacaattgtacgaagtgtacaaccactacctcctctactttgtttttt 23036604  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  23036605 tgtctctgctacaagacaaga 23036625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20799102 - 20798914
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  20799102 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaaaataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 20799004  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||| |||| ||  | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  20799003 tttgaagttgatcctctataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 20798914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 385
Target Start/End: Original strand, 21191805 - 21191945
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  21191805 cattgcagaagaccagaagagtgaagcaacagctaattcaaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttggcaaagtacaattgta 21191904  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21191905 cgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtct 21191945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 25448183 - 25448338
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaa 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  25448183 tggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagcaaaggaatcaacaaa 25448282  T
Q  116 ga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
     | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25448283 aagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 25448338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 350 - 537
Target Start/End: Original strand, 45070700 - 45070885
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  45070700 tgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaattt 45070798  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    |||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||    
T  45070799 gaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattagtggtgaatgatcaaaggaactc-aacgattctttagacgtg 45070885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 22610018 - 22610226
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  22610018 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 22610116  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||  |||| ||| | || ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  22610117 tttgaatttgatcctttataggactacactcaaatcaggcaaaagattactgatggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 22610215  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  22610216 tcaacgtctct 22610226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2835132 - 2834965
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  2835132 aaaattgtcaattggatatgctaatgtttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggttttggaagaacaataaagagcaaa 2835033  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2835032 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtttgaagaaaattgctcctgaagacaaagcgctcctgaa 2834965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 380
Target Start/End: Original strand, 17024904 - 17025039
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  || ||||||    
T  17024904 cattgcaaaagaccataagagtgaagcaacgactaattcaaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttaaagagcgttgaaaaatgacaattgta 17025003  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17025004 cgaagtgtacaaccactacctccacttctttgtttt 17025039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17371124 - 17370917
Alignment:
Q  295 aaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaa 394  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17371124 aaggcattggatgcttgtccttcaaagagagttgacaaagtacga--------agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaa 17371033  T
Q  395 gacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggat 493  Q
    |||||| | || |||  |||||||||||  ||| |||||| ||| |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| |||    
T  17371032 gacaagaaaaatagctctgcctgcagaa-atgttccttcatgataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagat 17370934  T
Q  494 tactggtggatgatcaa 510  Q
     | |||||  |||||||    
T  17370933 cattggtgattgatcaa 17370917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 342 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 44201054 - 44200841
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggga 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  44201054 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacaactttgcctgcagaa-atgttccttcaagatagga 44200956  T
Q  442 atgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttga 541  Q
    ||| |||||||  ||||  |||| || || ||| |||||||||| ||| ||| | ||||   |||||||||| ||   |||||||||||||||||| | |    
T  44200955 atggatttgaacttgatctttcataggacaacatccaaatcaggaaaaagatcattggt-attgatcaaaggtttctcaacgactctttagacgtgctta 44200857  T
Q  542 ttatctcaacgtctct 557  Q
      ||||||||||||||    
T  44200856 agatctcaacgtctct 44200841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 20883926 - 20884114
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||| || |||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  20883926 aagtgtacaaccattagctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgccagcagaattctt-ccttcaagataggaatgaa 20884024  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  20884025 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaacagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtg 20884114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23927096 - 23926888
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| | || |||||||||| |||||| |    
T  23927096 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtatgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctacagaaat-gttccttcaagataggaatgga 23926998  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| | |  |||    
T  23926997 tttgaacgtgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtgctaaaaatc 23926899  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  23926898 tcaacgtctct 23926888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 39200663 - 39200791
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  39200663 aaaattgtcaatcggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 39200762  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  39200763 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgt 39200791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2267482 - 2267331
Alignment:
Q  19 atatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagag 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||    
T  2267482 atatgctaatatttgttcaagtgtataggaccatagacaaaatttgacattttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagtaaagaaatcaacaaaaag 2267383  T
Q  119 gaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||||||||||| |     |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2267382 gaagcttaaagcatatgaagaaaactgcttctgaagacatagtgctcctgaa 2267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 399
Target Start/End: Original strand, 12613715 - 12613908
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  12613715 aaagcttcaaaggttgttcaaaagatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacggctaattcaaaag-atttgaaagcattg 12613812  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    | ||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  12613813 gttgcttgttctttgaagagcgttggcaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttgtgtctctgctacaggacaa 12613908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 185 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7310020 - 7309826
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| || ||||  | | ||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||   | ||    
T  7310020 tcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaagctgttcaatggattcagtgtcgtctaaggattgcagaagactataagagtgaagcaacggtcattt 7309921  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    || | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7309920 tgtagggatttgaaggcattggatgctcgttcttcaaa-agcgttaacgtagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccaatactctgtt 7309826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 22426996 - 22427163
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22426996 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccattgacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttgaaagaacaatagagagcaa 22427095  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || || |||||||||| ||     |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22427096 aggaatcaacaaaaagaaagcttaaagtgtctgaagaaaactgctcccgaagaccaagtgctcctgaa 22427163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 350 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28474262 - 28474077
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| |||||| ||||    
T  28474262 tgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctgcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcctttaagataggaatggattt 28474164  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    |||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  28474163 gaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtg 28474077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29216225 - 29216058
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| || |||    
T  29216225 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaaatgtacaggactatagacaaaaatttgacatcctaaaaaggtcttggaagaacaatagagatcaa 29216126  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |  ||||||| || ||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  29216125 aagaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgttcctgaagacaaaatgcccctgaa 29216058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 347 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5929741 - 5929600
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  5929741 aagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagacaccagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 5929643  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  5929642 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 5929600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Original strand, 21121057 - 21121159
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21121057 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgacgtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagac 21121156  T
Q  398 aag 400  Q
    |||    
T  21121157 aag 21121159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 510
Target Start/End: Original strand, 19170371 - 19170539
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| | |||||||| ||    
T  19170371 gtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcgttcaagatagg 19170469  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||| ||||| ||| | |||||  |||||||    
T  19170470 aatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaagcaaaagatcattggtgattgatcaa 19170539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 21134803 - 21134891
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21134803 aaaattgtcaattggatacgttaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaa 21134891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 21204568 - 21204736
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||    
T  21204568 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagacaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaaataaagagcaa 21204667  T
Q  103 agaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
      | |||||| || ||| |||||||||||||     ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21204668 gtacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctaaagaaaagtgctcctgaagacaacgtgcttctgaa 21204736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23024875 - 23024772
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23024875 gcattggatgcttattcctcaaggagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagac 23024776  T
Q  398 aaga 401  Q
    ||||    
T  23024775 aaga 23024772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30893303 - 30893077
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaa 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||||| | ||| |  ||||  ||||||||| |||||||||||||||   ||  ||||||||||    
T  30893303 gctaaagttcatcaggagatgcaagacttaaagtttcaaaaggttgttcattggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagatcagaggagtgaagcaa 30893204  T
Q  274 cgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactact 373  Q
     | ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |  || |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30893203 aggctattttgaaaggatttgaaagcactagatgcttgttctttgaatagcgctgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 30893104  T
Q  374 ctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
      |||| |||||   ||||||||||||    
T  30893103 aagtttgtgtctctactacaagacaag 30893077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37642335 - 37642232
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37642335 gcattggatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttatacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagac 37642236  T
Q  398 aaga 401  Q
    ||||    
T  37642235 aaga 37642232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Original strand, 21135153 - 21135255
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21135153 gcattggatgcttattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactaaatccactactctgtttttgtctctgctacaagac 21135252  T
Q  398 aag 400  Q
    |||    
T  21135253 aag 21135255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 44821180 - 44821349
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||    
T  44821180 aaaattgtcaattggatatgctaaaatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagca 44821279  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44821280 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 44821349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 347 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12946878 - 12946818
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12946878 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacag 12946818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19215699 - 19215596
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19215699 gcatttgatgcttattcctcaaggagcgttgacatagtgtgattgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagac 19215600  T
Q  398 aaga 401  Q
    ||||    
T  19215599 aaga 19215596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21984683 - 21984580
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc-tgtttttgtctacgctacaaga 396  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  21984683 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactcttttttttgtctctgctacaaga 21984584  T
Q  397 caag 400  Q
    ||||    
T  21984583 caag 21984580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 32785602 - 32785757
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacga 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||  |||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||| |    
T  32785602 tggatatgctaatatttgttcaagtatacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaatagaaagcaaatgaatcaacaa 32785701  T
Q  115 agaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32785702 aaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaaggcaaagtgcccctgaa 32785757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 36134616 - 36134489
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  |||  ||||||||||| || ||||||    
T  36134616 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaaaagagagcaa 36134517  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || ||||||||| ||||    
T  36134516 aggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 36134489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21028947 - 21028777
Alignment:
Q  231 taatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgac 330  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||||| |  |  ||||||| ||||    
T  21028947 taatctcatccaagcattgcagaagaccataagagtgaagcaacgactaattcaaatgaagttgaaggcattggatgcttgctttttgaagagcgctgac 21028848  T
Q  331 aaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  21028847 aaagtacaattgtatgaagtgtacagccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaggacaaga 21028777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42284715 - 42284613
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||  ||||||||||    
T  42284715 gcattggatgctttttcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactattatgagtttgtctctgctacaagac 42284616  T
Q  398 aag 400  Q
    |||    
T  42284615 aag 42284613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21703274 - 21703121
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||    
T  21703274 aaaattgtcaattggatatgcttatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatcttaaaatggtcttggaagaacaaataaagagca 21703175  T
Q  102 aagaaatcaacgaagag-gaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    || | |||||| || || ||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  21703174 aatacatcaaccaaaagagaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 21703121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22655520 - 22655352
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  22655520 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttccttcaagatagg 22655422  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||| |||||||  |||| ||||  || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  22655421 aatggatttgaatgtgatccttcttaggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgactgatcaa 22655352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 2327045 - 2327213
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||    
T  2327045 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtctaggactatagacaaaaaattgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaa 2327144  T
Q  103 agaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  2327145 aggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaggcgctcctgaa 2327213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22019379 - 22019232
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  22019379 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctcttcctgcagaa-atgttccttcaagatagg 22019281  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||  ||||||||||||||    
T  22019280 aatggatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaa 22019232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 22464437 - 22464596
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattg-gtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  22464437 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtata-gaccatagacaaagtttgacatcttaaaaaaagtcttggaagaacaatatagagcaaaggaatc 22464535  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||| || |||||||||||||  |     ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22464536 aacaaaaaggaagcttaaagtatatgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgttcctgaa 22464596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Original strand, 25448008 - 25448108
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  25448008 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggacaatagacaaaaattgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagaaagcaaa 25448107  T
Q  104 g 104  Q
    |    
T  25448108 g 25448108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35040577 - 35040477
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||  |||||||    
T  35040577 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtaaaagactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttagaagaacaataaagagcaaa 35040478  T
Q  104 g 104  Q
    |    
T  35040477 g 35040477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19038045 - 19037903
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||     
T  19038045 aagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctgcgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgg 19037947  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||||||  |||||||| | || || ||| ||||||||||||||    
T  19037946 atttgaacgtgattctttataggacaacatccaaatcaggcaaa 19037903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 489
Target Start/End: Original strand, 52350731 - 52350869
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||  ||| |||||||| | |||||| ||||    
T  52350731 tgtacaaccactacctccacaactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataatagctctgcctgcagaa-atgtcccttcaagttaggaatggattt 52350829  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  52350830 gaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 52350869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 351 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20251808 - 20251671
Alignment:
Q  351 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttg 450  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  20251808 gtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctatgctacaaaacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttg 20251710  T
Q  451 aagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    ||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  20251709 aacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 20251671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Original strand, 21204916 - 21205017
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    |||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  21204916 gcattggatgttaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctg-ttttgtctgtgctacaagac 21205014  T
Q  398 aag 400  Q
    |||    
T  21205015 aag 21205017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 28380033 - 28379892
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||  |    
T  28380033 aagtgtacaaccagtacctccacgactctaattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaattga 28379935  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  28379934 tttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 28379892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 46089423 - 46089335
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  46089423 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaattttgacatctt-aattggtcttggaagcacaa 46089335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 21544108 - 21543904
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||        | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21544108 gcattggatgcttgtacttcaaagagagttgacaaagtaaga--------aatgtacgaccactacctccactactttgcttttgtctacgctacaagac 21544017  T
Q  398 aag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattac 496  Q
    ||| | ||||||  |||||| ||||  ||| |||||||| | |||||| |||||||  |||||||| | || || ||| |||||||||||||| ||| |     
T  21544016 aagaaaaacagctctgcctgtagaa-atgttccttcaagttaggaatggatttgaacatgattctttataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcat 21543918  T
Q  497 tggtggatgatcaa 510  Q
    |||||  |||||||    
T  21543917 tggtgattgatcaa 21543904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1900775 - 1900608
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||  || | | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  1900775 aaaattgtcaattggatatgctaataattgttcaaatgtacaggaccatagacaaaaatttgagatcatcattaggttctggaagaacaaaagagagcaa 1900676  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || |||||||||||| |||     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900675 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaaacgtctgaagagaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 1900608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22154304 - 22154149
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacga 114  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || |||||||  ||||||| |    
T  22154304 tggatatgctaatatttattcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaaatgaatcaacaa 22154205  T
Q  115 agaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | | ||||||| ||||||     || || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  22154204 aaatgaagcttgaagcgtctgaagagaagtgctcctgaagtcacagtgctcctgaa 22154149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22642938 - 22642770
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||  |||||   |||||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  22642938 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacggtacaagacaagataaacagttctgcctgcagaa-atgttccttcaagatagg 22642840  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||| |||||||  |||| ||||  || || ||| |||||| ||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  22642839 aatggatttgaacatgatccttcttaggacaacatccaaataaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 22642770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 232 - 401
Target Start/End: Original strand, 26702056 - 26702225
Alignment:
Q  232 aatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgaca 331  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||  | | ||||||||||| | |||||  || | | ||||||||||||||| |||| |  |  ||||| | |||||    
T  26702056 aatctcgtttgagcattgcagaagaccaggagagtgaagcaacaattaattcaaatgaagttgaaggcattggattcttgctttttgaagagtgatgaca 26702155  T
Q  332 aagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||  ||||||||||||||    
T  26702156 aagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactacttagtatgtgtctctgctacaagacaaga 26702225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 48569849 - 48569937
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  48569849 aaaattgtcaattggatatgctaatatt-gttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaa 48569937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21985015 - 21984927
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| ||||||   |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21985015 aaaattgtcaattggatacaataatatttcttcaagtgtatatgactataaacaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaa 21984927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Original strand, 21120728 - 21120795
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21120728 taatatttgttctagtgtacaggattatagacaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaa 21120795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 22599819 - 22599946
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||||| || ||||||    
T  22599819 aaaattgtcaattggatatgctaatacttattcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttttggaagaacaaaagagagcaa 22599918  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    |  ||||||| || ||||||||| ||||    
T  22599919 atgaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 22599946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 30572610 - 30572524
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaa 89  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30572610 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtccaagactatagacaaaaatttgacatcttaaaatggtcttggaagaa 30572524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 48704645 - 48704515
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggag 99  Q
    ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  ||||||||||| || |||    
T  48704645 attaaaattttcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagaacaaaagagag 48704546  T
Q  100 caaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||| ||||||||| || | ||||||| ||||    
T  48704545 caatgaaatcaacaaaaatgaagcttgaagc 48704515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19717947 - 19717818
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  || | | | |||  ||||||||||| || | ||||    
T  19717947 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgaaatcatcattaggttctggaagaacaaaagagggcaa 19717848  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  19717847 aggaatcaataaaaaggaagcttaaagcgt 19717818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 2268970 - 2268870
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  |||  ||||||||||| || ||||||    
T  2268970 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagacaatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaaaagagagcaa 2268871  T
Q  103 a 103  Q
    |    
T  2268870 a 2268870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23064987 - 23064935
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23064987 aagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaa 23064935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1578275 - 1578148
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  || |||||||| || ||||||    
T  1578275 aaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtataggaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctgaaagaacaaaagagagcaa 1578176  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||    
T  1578175 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagc 1578148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38283025 - 38282858
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || | | | |||  | ||||||||| |  ||||||    
T  38283025 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgagatcatcattaggttctagaagaacaaaatagagcaa 38282926  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |  ||||||  || ||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38282925 atgaatcaataaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaactgctcctgaagacaaaatgttcctgaa 38282858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Original strand, 34255509 - 34255611
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||  |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  34255509 gcattggatgctttatcctcaaagagcgttgacattgtgagtatgtacgaactgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagac 34255608  T
Q  398 aag 400  Q
    |||    
T  34255609 aag 34255611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 380
Target Start/End: Original strand, 18896559 - 18896672
Alignment:
Q  267 gaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctc 366  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||  || |   ||| |||||  |||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18896559 gaagcaacggctaattcaaaagaatttgaaggcattggatgcttagtctttggagaacgttggaaaaggacagttgtacgaagtgtacaaccactacctc 18896658  T
Q  367 cactactctgtttt 380  Q
    ||||||| ||||||    
T  18896659 cactactttgtttt 18896672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 30893504 - 30893443
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttga 65  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30893504 aaaattgtcaattggatttgttaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaattga 30893443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 16234956 - 16235076
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | | |||||  |||  ||||||||||| || |||||| | ||||    
T  16234956 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgtcatattaaaaaggttctggaagaacaaaagagagcaatggaatc 16235055  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||| || ||||||||| ||||    
T  16235056 aacaaaaaggaagcttgaagc 16235076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 37642673 - 37642597
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||    
T  37642673 tggatacgctaatatttgttcaattgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaagtgatcctgaaagaacaa 37642597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 1090176 - 1090235
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1090176 attaaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcatgaccatagacaaaa 1090235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10251427 - 10251267
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  10251427 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtaca--------gacaaaatatgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagcaa 10251336  T
Q  103 agaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  10251335 atacatcaacaaaaatggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagttgaagtgctcctgaa 10251267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 28492070 - 28492129
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  28492070 attaaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacacgatcatagacaaaa 28492129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22019793 - 22019682
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggag 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||    || ||| |||||||||||||||| || |||    
T  22019793 attaaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagac-aaagttgatcaatttaataggtcttggaagaacaaaagagag 22019695  T
Q  100 caaagaaatcaac 112  Q
    ||||| |||||||    
T  22019694 caaaggaatcaac 22019682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 23036155 - 23036211
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23036155 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaa 23036211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 398
Target Start/End: Original strand, 26548294 - 26548350
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||||    
T  26548294 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgacactgcctctgtctacgctacaagaca 26548350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 33255990 - 33256046
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33255990 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcatgaccatagacaaaa 33256046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 33276162 - 33276218
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33276162 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcatgaccatagacaaaa 33276218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23025184 - 23025053
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagcaaagaa-atcaacgaagagg-a 120  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| || ||| |    
T  23025184 taatatttgtttaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatct--atttggtcttggaagaacaaataaagagcaaagtacatcaacaaaaaggga 23025087  T
Q  121 agcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    ||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  23025086 agcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 23025053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10757846 - 10757718
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  || |||||||| || |||| |    
T  10757846 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttaaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctgaaagaacaaaagagagcta 10757747  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    || ||||||| || ||||||||| ||||||    
T  10757746 aggaatcaac-aaaaggaagcttgaagcgt 10757718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 16870399 - 16870358
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgt 42  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16870399 attaaaaatgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgt 16870358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17371505 - 17371416
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaa-gtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||    
T  17371505 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaaagtatacaggactgtagacaaaatttgatatcataaattggtcctgaaagaacaa 17371416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22655933 - 22655824
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||   |   || ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  22655933 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaagttgatcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaa 22655834  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    || |||||||    
T  22655833 aggaatcaac 22655824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23065388 - 23065280
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |  | | ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  23065388 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaagttgatcaacat-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaa 23065290  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    || |||||||    
T  23065289 aggaatcaac 23065280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 35402249 - 35402152
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaac 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| | |||||||  |||  ||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  35402249 tggatatgctaatatttgttcaagtgtacaaaaccatagacaaaaatttgtcatcttaaaaaggttatggaagaacaaaagagagcaatggaatcaac 35402152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 42285064 - 42284975
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatag-acaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| | | |||||||||||||  ||||||||    
T  42285064 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagaaaaaaaattgtcatattaaattggtcttcaaagaacaa 42284975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 22201472 - 22201528
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22201472 aaaattgtcaattggatatgctaatattttttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 22201528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7310221 - 7310154
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  7310221 taatatttgttcaagggtacaagaccatatacaaagtttgacatcttaaataggttctggaagaacaa 7310154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Original strand, 7744727 - 7744794
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||    
T  7744727 taatatttgttcaagtgtacaggaccctaaacaaaatttgatatctttaagaggtcttggaagaacaa 7744794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9659112 - 9659061
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  9659112 tgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcatgaccttagacaaaa 9659061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 20954092 - 20954219
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactataga-caaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||   || | | | ||| || ||||||||| || ||||||    
T  20954092 aaaattgtcaattggatatgctaatattcgttcaagtgtacaggaccatagataaaaatttggaatcattattaggttttagaagaacaaaagagagcaa 20954191  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || ||||||||| ||||    
T  20954192 aggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 20954219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 401
Target Start/End: Original strand, 24028751 - 24028782
Alignment:
Q  370 tactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028751 tactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 24028782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 16478411 - 16478460
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  16478411 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaagaccatagacaaaa 16478460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28380448 - 28380340
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||    || ||| |||||| ||||||||| || ||||||    
T  28380448 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagac-aaacttgatcaatttaataggtcttagaagaacaaaagagagcaa 28380350  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    || |||||||    
T  28380349 aggaatcaac 28380340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22643351 - 22643295
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa 59  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22643351 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaa 22643295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 35040457 - 35040425
Alignment:
Q  133 gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35040457 gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcatgaa 35040425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 44201431 - 44201375
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa 59  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44201431 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaa 44201375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 182)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27506128 - 27505908
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt--gtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27506128 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatg 27506029  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27506028 aatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 27505929  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27505928 tctcaacgtctctttcacgcc 27505908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27373018 - 27372798
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt--gtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373018 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatg 27372919  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27372918 aatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 27372819  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27372818 tctcaacgtctctttcacgcc 27372798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27463368 - 27463148
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt--gtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27463368 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatg 27463269  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27463268 aatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 27463169  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27463168 tctcaacgtctctttcacgcc 27463148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 9123143 - 9123362
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9123143 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatga 9123242  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9123243 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaaagactctttagacgtgctgattat 9123342  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9123343 ctcaacgtctctttcacgcc 9123362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 9112506 - 9112725
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9112506 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcaaaatttgtaccttcaagatgggaatga 9112605  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9112606 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaaagactctttagacgtgctgattat 9112705  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9112706 ctcaacgtctctttcacgcc 9112725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 25986266 - 25986048
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25986266 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaataaa 25986167  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25986166 tttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 25986067  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25986066 tcaacgtctctttcacgcc 25986048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 7751247 - 7751462
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7751247 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgaa 7751346  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7751347 tttgaagctaactcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggaattcaaacgactctttagacgtgctgattatc 7751446  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  7751447 tcaacgtctctttcac 7751462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 31542909 - 31543128
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31542909 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 31543008  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31543009 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 31543108  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31543109 ctcaacgtctctttcacgcc 31543128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 11147261 - 11147479
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147261 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 11147360  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  11147361 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaatgactctttagacgtgctaattatc 11147460  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11147461 tcaacgtctctttcacgcc 11147479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 12827877 - 12827659
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12827877 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgcgccttcaagatgggaatgaa 12827778  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  12827777 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 12827678  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12827677 tcaacgtctctttcacgcc 12827659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 25787885 - 25787668
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787885 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 25787787  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25787786 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 25787687  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25787686 tcaacgtctctttcacgcc 25787668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 12855206 - 12854987
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12855206 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 12855107  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12855106 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 12855007  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12855006 ctcaacgtctctttcacgcc 12854987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 12865732 - 12865513
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12865732 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 12865633  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12865632 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 12865533  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12865532 ctcaacgtctctttcacgcc 12865513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 33199513 - 33199294
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  33199513 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacattcaagataggaatga 33199414  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33199413 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 33199314  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33199313 ctcaacgtctctttcacgcc 33199294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 17984721 - 17984940
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  17984721 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 17984820  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17984821 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 17984920  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17984921 ctcaacgtctctttcacgcc 17984940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 26044397 - 26044183
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044397 aagtgtacaaccactacctccactactctgcttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 26044299  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26044298 tttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 26044199  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  26044198 tcaacgtctctttcac 26044183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 31982637 - 31982856
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  31982637 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 31982736  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31982737 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 31982836  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31982837 ctcaacgtctctttcacgcc 31982856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 32961940 - 32962159
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  32961940 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 32962039  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32962040 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 32962139  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32962140 ctcaacgtctctttcacgcc 32962159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 32972559 - 32972778
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  32972559 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 32972658  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32972659 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 32972758  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32972759 ctcaacgtctctttcacgcc 32972778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 34807171 - 34807390
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  34807171 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 34807270  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34807271 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 34807370  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34807371 ctcaacgtctctttcacgcc 34807390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 34817803 - 34818022
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  34817803 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 34817902  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34817903 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 34818002  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34818003 ctcaacgtctctttcacgcc 34818022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 26025644 - 26025428
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26025644 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 26025545  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26025544 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 26025445  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  26025444 ctcaacgtctctttcac 26025428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 26036218 - 26036002
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26036218 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 26036119  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26036118 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 26036019  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  26036018 ctcaacgtctctttcac 26036002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 7375770 - 7375984
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7375770 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgccagcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 7375868  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||    
T  7375869 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctaatcatc 7375968  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  7375969 tcaacgtctctttcac 7375984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 17982512 - 17982731
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  17982512 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 17982611  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17982612 atttgaagtttattcttcagaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 17982711  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17982712 ctcaacgtctctttcacgcc 17982731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 20029916 - 20030130
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20029916 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 20030014  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||    
T  20030015 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgcaaatcatc 20030114  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  20030115 tcaacgtctctttcac 20030130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 26864973 - 26864754
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  26864973 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagattttgtacactcaagatgggaatga 26864874  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26864873 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 26864774  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26864773 ctcaacgtctctttcacgcc 26864754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 26875597 - 26875378
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  26875597 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagattttgtacactcaagatgggaatga 26875498  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26875497 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 26875398  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26875397 ctcaacgtctctttcacgcc 26875378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27341879 - 27341660
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  27341879 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 27341780  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27341779 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 27341680  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27341679 ctcaacgtctctttcacgcc 27341660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27402619 - 27402400
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  27402619 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 27402520  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27402519 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 27402420  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27402419 ctcaacgtctctttcacgcc 27402400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27413278 - 27413059
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  27413278 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 27413179  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27413178 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 27413079  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27413078 ctcaacgtctctttcacgcc 27413059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 28251577 - 28251793
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28251577 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaa 28251675  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28251676 tttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt-gatgatttaaggaattcaaacgactctttagacatgctgattatc 28251774  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28251775 tcaacgtctctttcacgcc 28251793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 28356724 - 28356940
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28356724 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaa 28356822  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28356823 tttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggt-gatgatttaaggaattcaaacgactctttagacatgctgattatc 28356921  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28356922 tcaacgtctctttcacgcc 28356940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 4631058 - 4630842
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  4631058 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 4630959  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4630958 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 4630859  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  4630858 ctcaacgtctctttcac 4630842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 32301054 - 32301270
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  32301054 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 32301153  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32301154 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 32301253  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  32301254 ctcaacgtctctttcac 32301270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 32311743 - 32311959
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  32311743 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 32311842  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32311843 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 32311942  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  32311943 ctcaacgtctctttcac 32311959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 3661567 - 3661349
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  3661567 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 3661469  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3661468 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 3661369  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3661368 ctcaacgtctctttcacgcc 3661349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 3672231 - 3672013
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  3672231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 3672133  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672132 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 3672033  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3672032 ctcaacgtctctttcacgcc 3672013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27475030 - 27474815
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  27475030 aagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgat 27474931  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  27474930 tttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgataatc 27474831  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  27474830 tcaacgtctctttcac 27474815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27504529 - 27504314
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  27504529 aagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgat 27504430  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  27504429 tttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgataatc 27504330  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  27504329 tcaacgtctctttcac 27504314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 20062667 - 20062881
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062667 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 20062765  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||    
T  20062766 tttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgcaaatcatc 20062865  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    |||| |||||||||||    
T  20062866 tcaatgtctctttcac 20062881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27384617 - 27384402
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  27384617 aagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgat 27384518  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  27384517 tttgaagctaactcttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgataatc 27384418  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||| ||||||||||    
T  27384417 tcaacatctctttcac 27384402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 29384936 - 29384718
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  29384936 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 29384838  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29384837 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 29384738  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29384737 ctcaacgtctctttcacgcc 29384718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 12716845 - 12717062
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  12716845 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 12716944  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12716945 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 12717044  T
Q  545 tctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12717045 tctcaacgtctctttcac 12717062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 12727494 - 12727711
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  12727494 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 12727593  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12727594 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 12727693  T
Q  545 tctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12727694 tctcaacgtctctttcac 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16930635 - 16930420
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  16930635 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 16930537  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16930536 atttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 16930437  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  16930436 ctcaacgtctctttcac 16930420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Original strand, 20730628 - 20730868
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| | |||| || |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  20730628 ctgaaaatcactagaagctgcagttcatcaggagatgtaacaaaaagcttcaaaggctgttcaagggatttaatctcatctaagtattgcagaagactgg 20730727  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20730728 aaaagtgaagcaacgactagtttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccac 20730827  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20730828 tacctccactgctctgtttttgtctcagctacaagacaaga 20730868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16959806 - 16959591
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  16959806 aagtgtgcaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 16959708  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16959707 atttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 16959608  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  16959607 ctcaacgtctctttcac 16959591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 5845268 - 5845052
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | || | |||||||||||||||||    
T  5845268 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcaggaat-gttcattcaagatgggaatgaa 5845170  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  5845169 tttgaagccgattcttcaaaggactgcacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 5845071  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5845070 tcaacgtctctttcacgcc 5845052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17042806 - 17042591
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17042806 aagtgtacaaccactacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaa 17042707  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  17042706 tttgaagttaatacttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatc 17042607  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  17042606 tcaacgtctctttcac 17042591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 18925774 - 18925991
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  18925774 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatga 18925872  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || ||    
T  18925873 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcat 18925971  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18925972 ctcaacgtctctttcacgcc 18925991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15954907 - 15954688
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15954907 agttcatcaagagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcttctaaagattgcagaagactggaaaaatgaagcaacgactaat 15954808  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15954807 ttgaaaggatttgaaggcattgaatgcttgttattcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 15954708  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  15954707 gtctcttctacaagacaaga 15954688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 17064379 - 17064164
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17064379 aagtgtacaacaactacctccactactatgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaa 17064280  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  17064279 tttgaagttaatacttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatc 17064180  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  17064179 tcaacgtctctttcac 17064164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 18826250 - 18826463
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18826250 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagatgggaatgaa 18826348  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  18826349 tttgaagttgatccttcaaaggactttacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 18826447  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  18826448 tcaacgtctctttcac 18826463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29918222 - 29918002
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29918222 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcat-ggatttaatctcgtctaagcattgcagaagattggaaaagtgaagcaacgacta 29918124  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29918123 gtttgaaaagatttgaaggcatcagatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 29918024  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  29918023 ttgtctatgctacaagacaaga 29918002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 18834646 - 18834859
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18834646 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagatgggaatgaa 18834744  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  18834745 tttgaagttgatccttcaaaggacttttcccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 18834843  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  18834844 tcaacgtctctttcac 18834859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 31572598 - 31572385
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||    
T  31572598 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacgaccatgcctgcagaaat-gttctatcaagatgggaatgaa 31572500  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  31572499 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 31572401  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  31572400 tcaacgtctctttcac 31572385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 13913233 - 13913017
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  13913233 aagtgtacaaccactacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacaactctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 13913135  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||| | || |||    
T  13913134 tttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacaactctttagacgtgctaatcatc 13913036  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13913035 tcaacgtctctttcacgcc 13913017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32544471 - 32544250
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  32544471 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgtcta 32544372  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32544371 ttttgaaaggatttaaaggcattggatgtttattcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 32544272  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  32544271 ctgtctctgctacaagacaaga 32544250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 4292910 - 4292697
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  4292910 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaggacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 4292812  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| | |  |||    
T  4292811 tttgaagctgatccttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaaggaact-taacgactctttagacgtgctaaaaatc 4292713  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  4292712 tcaacgtctctttcac 4292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 16123549 - 16123762
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || | || |||||||||| | ||||||    
T  16123549 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacatccatgccttcataaat-gttccttcaagattgtaatgaa 16123647  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  16123648 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagtcaaagtattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 16123746  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  16123747 tcaacgtctctttcac 16123762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16877417 - 16877198
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||      
T  16877417 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactgagaaagtgaagcaacgactatc 16877318  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877317 ttaaaaggatttgaaggaattggatgctaattcctcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 16877218  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | ||  ||||||||||||||    
T  16877217 gcctctgctacaagacaaga 16877198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 29765719 - 29765507
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29765719 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctatcagacaagacaacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 29765621  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||  | |  |||    
T  29765620 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc-ttagacgtactaaaaatc 29765523  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  29765522 tcaacgtctctttcac 29765507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9718049 - 9717828
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9718049 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaaacattgtagaagactggaagagtgaagcaacaacta 9717950  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717949 ttttgaaaggatttaaaggcatttgatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 9717850  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  | ||||||||||||    
T  9717849 ttgtctctgatacaagacaaga 9717828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18435762 - 18435541
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||  || | | || || |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18435762 agttcatcaggagatgcaagacttaaagctttgaaggttattcaatggatttaatctcgtctaagaatttcaaaagactagaaaagtgaagcaacgacta 18435663  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18435662 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaagtgtacaaagtgtacaaccactacctccagtacactgttt 18435563  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  18435562 ttgtctctgctacaagacaaga 18435541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12349407 - 12348995
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||  |||||    
T  12349407 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactacagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagca 12349308  T
Q  102 aagaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag------------------acaaagtgctcctgaaa-------atca 170  Q
    || | |||||| || ||| |||||||||||||     |||||||||||||||||                  ||||||||||||||||        ||||    
T  12349307 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtttgaagtgctcctgaagacaaagtgctcctgaagtgatgacatca 12349208  T
Q  171 gaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaag 270  Q
      ||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||    
T  12349207 tcagaagctgcagttcatcaggagatgcaacttagagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatag 12349109  T
Q  271 caacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccact 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12349108 caacgactattttgaaaggattgaaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacaaagtgtacaaccactatctccact 12349009  T
Q  371 actctgtttttgtc 384  Q
    ||||||||||||||    
T  12349008 actctgtttttgtc 12348995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 185 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16336328 - 16336112
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttg 284  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16336328 tcatcaggagatgcaacttgaagcttcaaaagttgtttaaaggattcaaactcgtctaaacattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttg 16336229  T
Q  285 aaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 384  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16336228 gaaggattagaaggcattgaatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgattgtacgaagtgtacaaccactatctacactactctgtttttgtc 16336129  T
Q  385 tacgctacaagacaaga 401  Q
    |  ||||||||||||||    
T  16336128 tctgctacaagacaaga 16336112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 8653844 - 8653631
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| | || ||||||| | |||||||||    
T  8653844 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaaagctatgcctgtagaaat-gttccttcaaaacgggaatgaa 8653746  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || | |    
T  8653745 tttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcaac 8653647  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  8653646 tcaacgtctctttcac 8653631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 17745794 - 17746007
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17745794 aagtgtacaaccattacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaa 17745892  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| || |||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  17745893 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaatcattactggtgaataatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaacatc 17745991  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  17745992 tcaacgtctctttcac 17746007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22802345 - 22802126
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| || |||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |    
T  22802345 agttcatcaggagatgcaacataaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatattgtctaagcattgcagacgactggaaaagtgaaacaacgacaagt 22802246  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22802245 ttgaaagaatttaaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttaacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctattttt 22802146  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  22802145 gtctctgctacaagacaaga 22802126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 182 - 380
Target Start/End: Original strand, 19832977 - 19833176
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||  || ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19832977 agttcatcaggagatgcaacttaaagctttaaaagctgtttaacggattcaaactcatctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactatt 19833076  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctc-aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19833077 ttgaaaggatttgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaagcactacctccactactctgtttt 19833176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 182 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21618448 - 21618230
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||| |||||  |||| | |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21618448 agttcatcagaagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcttctaaagattgtagaagactggaaaagtaaagcaacgactatt 21618349  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgt-ttt 380  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21618348 ttggaaggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 21618249  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaa 399  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  21618248 tgtctctgctacaagacaa 21618230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23284770 - 23284549
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||    
T  23284770 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaatgttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaaaagtgaagcaacgccta 23284671  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  23284670 ttttgaaaggatttgaaggcattgaatgcttgttccttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtataaccattatctccactactcagttt 23284571  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  23284570 gtgtctccgctacaagacaaga 23284549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 20487861 - 20488082
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatct-aatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||   | || |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20487861 cagttcatcagaggatgcaacttaaggcttcaaaagttgtttaatggggttcaacctcgtctaaagattgcagaagactgtaaaagtgaagcaacggcta 20487960  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20487961 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtttacaaccactacctccactactctgttt 20488060  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||| |  ||||||||||||||    
T  20488061 ttgtatctgctacaagacaaga 20488082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Original strand, 16265074 - 16265314
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||| | |||| || |||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  16265074 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcgtcaagagatgcaacataaagcttgaaaggttgttcaatggatttaatctcatctaagcattgcacaggactgg 16265173  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  16265174 aaaagtgaagcaacgagtagattgaaaggttttgaatgcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgagaaagtacaattgtacgaagtgtgcaaccac 16265273  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16265274 tacctccactactctgtttgtgtctctgctacaagacaaga 16265314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 182 - 406
Target Start/End: Original strand, 14100383 - 14100608
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  14100383 agttcatcaggagatgcaagacttaaagtttcaaaggatgttcaatggatttaatctcatctaagcattgtagaagactggaagagtgaagaaacaacta 14100482  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14100483 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttcttctttaaagagcgttgacaaagtacaattatacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-tt 14100581  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaagacaaca 406  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  14100582 ttgtctctgctacaagacaagaaaaca 14100608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 22076352 - 22076571
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||| |||||||  ||||||||||| |    
T  22076352 agttcatcaggagatgcaacttaaagctttaaaagctgtttaaaggatttaaactcgtctaaagattgcagaagactcgaaaagtatagcaacgactatt 22076451  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22076452 ttggaaggattggaaagcatttgatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacatttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttttt 22076551  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  22076552 gtctctgctacaagacaaga 22076571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 25518874 - 25518661
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||| |||||||||  ||||||||    
T  25518874 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgttacaagacaagacaacagctctgcctccagaa-atgttccttcaagacaggaatgaa 25518776  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  25518775 tttgaagttgatccttcatagcacaacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 25518677  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  25518676 tcaacgtctctttcac 25518661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Original strand, 26972173 - 26972390
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  26972173 ttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaatgttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagacttgaagagtgaagcaacaactatt 26972272  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26972273 ttgaaaggatttaaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattg--cgaagtgtacaaccactacctccactactcagtattt 26972370  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  26972371 gtctctgctacaagacaaga 26972390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22308974 - 22308761
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |  | |||||||||||||||||||    
T  22308974 aagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctacactacaagacaagacaacagctctacctgtagaaatatt-ccttcaagatgggaatgaa 22308876  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  22308875 tttgaaattgattcctcaaaggactacacccaaatcatgcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 22308777  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  22308776 tcaacgtctctttcac 22308761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13435738 - 13435517
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13435738 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggattttcaatggatttaatctcgtttaagcattgcagaagattggaagagtgaagcaacgacta 13435639  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |  || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13435638 ttttgaaaggatttgaaagcattgaatgattgttctttgaaaagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctatat 13435539  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  13435538 ttgtctctgctacaagacaaga 13435517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 15531567 - 15531788
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||||||| ||| | |||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || |||||  ||    
T  15531567 agttcatcagaagatgcaagacttaaagcttgaaaggttgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtaaaacaacggtta 15531666  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15531667 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagcgtacaaccactacctccactactctgtct 15531766  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  15531767 ttgtctctgctacaagacaaga 15531788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 27166455 - 27166667
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  27166455 aagtgtacaaccactacctccactacactgttcttgtccacgctacaagacaagacaacggctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 27166553  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| | |  |||    
T  27166554 tttgaagttgatccttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagaaactc-aacgactc-ttagacgtgctaaacatc 27166651  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  27166652 tcaacgtctctttcac 27166667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 17741714 - 17741922
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  17741714 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaatacaacatctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 17741812  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  17741813 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaagcataagattactggtgtatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 17741911  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  17741912 tcaacgtctct 17741922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 185 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21625303 - 21625086
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  21625303 tcatcaggagatgcaagacttacagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagattggaagagtaaagcaacggcta-tt 21625205  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 382  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21625204 tgaaagcatttgaaggcattgcatgcttgttcttcaaagagcgttaacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactttgtttttg 21625105  T
Q  383 tctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||   ||||||||||||||    
T  21625104 tccgtgctacaagacaaga 21625086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15302403 - 15302186
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    |||| |||||||||||  || ||||| ||||| | |||| || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15302403 tcattaggagatgcaagacttaaagcgtcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaaacattgcagaagactggaaaagtgaagcaacggctattt 15302304  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 382  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||    
T  15302303 tgaaaggatttaaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacattgtacaattgtacaaagtgtacaaccactatctccactactcagttagtg 15302204  T
Q  383 tctacgctacaagacaag 400  Q
    |||  |||||||||||||    
T  15302203 tctctgctacaagacaag 15302186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 167 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 13602393 - 13602139
Alignment:
Q  167 atcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaa 264  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  13602393 atcacaagaagctatagttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatcttgtctaagcattgcagaagactggaaga 13602294  T
Q  265 gtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacc 364  Q
    |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||| |    
T  13602293 gtgaagcaaccactattttgaaatgaattgaaggcattggatgcttattctttgaagaacgttgacaaaatacaattgtaagaagtgtataaccactatc 13602194  T
Q  365 tccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa-gacaacagccttgcctgca 418  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  13602193 tccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgca 13602139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 9933683 - 9933871
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || |||||||||| |||| |||    
T  9933683 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttctgtctatgctacaagacaagacaacaactctgcctgcagaaat-gttccttcaagataggaaggaa 9933781  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  9933782 tttgaagttgatccttcataggactacaccaaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 9933871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19688970 - 19688789
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| || |||| || ||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||| ||||| |    
T  19688970 agttcatcaggagatgcgacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttattctcgtccaagcattgtagaaaactggaagagtgaagcaaggactatt 19688871  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  19688870 ttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtataaccactac 19688789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 20112642 - 20112864
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||| | ||| || |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  20112642 agttcatcaagagatgcaagacttaaagcttaaaaaggttgttcaatggatttaatctcttctaagcattgcagaagaccggaagaatgaagcaacgact 20112741  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20112742 attttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaaatgtacaaccactatctccactactcagtt 20112841  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | |||||  || |||||||||||    
T  20112842 tgtgtctctgcgacaagacaaga 20112864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 350 - 537
Target Start/End: Original strand, 25735573 - 25735757
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25735573 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggattt 25735671  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    |||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||    
T  25735672 gaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggattactggtagatgatc-aaggaactc-aacgactctttagacgtg 25735757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 11206130 - 11205922
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  11206130 aagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctatgctacaacacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 11206032  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||  ||||| |||| ||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  11206031 tttgaacttgatttttcatagtacaatatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtgcttaagatc 11205933  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  11205932 tcaacgtctct 11205922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 211 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12423435 - 12423246
Alignment:
Q  211 caaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgctt 310  Q
    |||||| ||||||| ||||  || |||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12423435 caaaagctgtttaatggattcaaactcgtctaagaat-gcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttgaaaggattggaaggcattgtatgctt 12423337  T
Q  311 gttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12423336 attcttcaaagagcgttgacatagtacctttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctccgctataagacaaga 12423246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 12715362 - 12715583
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaaga-tgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||    
T  12715362 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagattgaaagagtgaagcaacgact 12715461  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | ||||||| |||||||| |||||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  12715462 attttgaaatgatttgaaagcattgtatgcctattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtagaaccactatctccactactcagtt 12715561  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    | |||||  |||||||||||||    
T  12715562 tgtgtctctgctacaagacaag 12715583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 232 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18378468 - 18378300
Alignment:
Q  232 aatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgaca 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |    
T  18378468 aatctcgtctaagtattgcaaaagactggaagagtcaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattggatgcatgttctttgaagagcgttgata 18378369  T
Q  332 aagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  18378368 aagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaaaacaag 18378300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 420 - 562
Target Start/End: Original strand, 26022878 - 26023020
Alignment:
Q  420 aatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttca 519  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  26022878 aatttgtgccttcaaaatgggaatgaatttaaacctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgaataatcaaaggatttca 26022977  T
Q  520 aacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  26022978 aacgactctttaaacttgctgattatctcaacgtctctttcac 26023020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 206 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15987414 - 15987234
Alignment:
Q  206 agcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaagg-atttgaaggcattgg 304  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  15987414 agcttcaaaggatgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcaatgactattttaaaagggatttgaaggcattgg 15987315  T
Q  305 atgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  15987314 atgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccattactcagtttgtgtct 15987234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 19289392 - 19289600
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  19289392 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 19289490  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    |||||||  ||| ||||| || |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  19289491 tttgaagtcgatccttcataggactacatccaaatcagacaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaagatc 19289589  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  19289590 tcaacgtctct 19289600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 20730427 - 20730593
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20730427 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggatcatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagcaaa 20730526  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||     ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20730527 gaaatcaacaaaaaggaagctttaagcgtctgaagaaaactgctcatgaagacaaagtgctcctgaa 20730593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 25686761 - 25686948
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  25686761 aagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 25686859  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||    
T  25686860 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagaaaaagattactggtggatgatc-aaggaactc-aacgactctttagacgtg 25686948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 12953142 - 12953351
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  |||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  12953142 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaatacaagataacagctctgcctgtagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 12953240  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgttgattat 545  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | |  ||    
T  12953241 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttaagacgtgctaaaaat 12953339  T
Q  546 ctcaacgtctct 557  Q
    ||||||||||||    
T  12953340 ctcaacgtctct 12953351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 350 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25675342 - 25675196
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25675342 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggattt 25675244  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattact 497  Q
    |||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25675243 gaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggattact 25675196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 350 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25679418 - 25679234
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25679418 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacatcagctcttcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggattt 25679320  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    |||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||    
T  25679319 gaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggattactagtagatgatc-aaggaactc-aacgactctttagacgtg 25679234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21235539 - 21235373
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21235539 aaaattgtcaattggatatgctaatatttattcaagtatacaggaccatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagcaaa 21235440  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | |||| || || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21235439 ggaatctacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 21235373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24117035 - 24116814
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaaga-tgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||  |||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||| | ||  |    
T  24117035 agttcatcagaagatgcaagacttaaagcttcaaaaggctgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagaggagtgaagtagcggtt 24116936  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24116935 attttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtt 24116836  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    | |||||  |||||||||||||    
T  24116835 tgtgtctctgctacaagacaag 24116814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 31931607 - 31931399
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  31931607 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacaactctgcctgcagaatt-gttccttcaagttaggaatgaa 31931509  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  31931508 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaatattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagatc 31931410  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  31931409 tcaacgtctct 31931399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19624185 - 19623964
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactc--aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  19624185 agttcatcaggagatgcaagtcttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagaggagtgaagcaacgacta 19624086  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgaca-aagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
     | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |   |||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  19624085 ttctgaaaggatttgaaagcattggatgattgttctttggagagcgtt-acactagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtt 19623987  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | |||||  ||||||||||||||    
T  19623986 tgtgtctttgctacaagacaaga 19623964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 11235683 - 11235475
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  11235683 aagtgtacaaccactacctccactattctacttttgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 11235585  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||  ||||| |||| || || | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | || |||||||||||||| ||| | |  |||    
T  11235584 tttgaacttgatttttcataggacaatatccaaatcaggcaaaagattacaggtggatgatcaatggttctc-aacgactctttagatgtgcttaagatc 11235486  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  11235485 tcaacgtctct 11235475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21235338 - 21235109
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21235338 ctgaaaatcactagaagctgcagttcatcaggagatgcaacataaagctttaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcaaaaggctgt 21235239  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
      || ||       ||||    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  21235238 tcaa-tg-------gact----tgaaagcatttgaaggcattcgatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtatgaagtgtacaaccac 21235151  T
Q  361 tacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  21235150 tacctccactactctgatatttgtctctgctacaagacaaga 21235109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22802567 - 22802401
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22802567 aaaattgtcaattggatatgctaatattttttcaagtgtacaggaccatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagaggaaa 22802468  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcg--tga---aaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || |||||||||||| ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802467 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaaacgtctgaaataaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 22802401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15955130 - 15954963
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  15955130 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagaaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 15955031  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||||||      |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15955030 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaaaaaaactgctccttaagacaaagtgctcctgaa 15954963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 16264873 - 16265039
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16264873 aaaattgtcaattggatatgctaatttttgttaaagtgtacatgaccatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttgaaagaacaatagagagcaaa 16264972  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || ||||| | |||||| |     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264973 ggaatcaacaaaaaggaatcctaaagcatctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 16265039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 18498804 - 18498596
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  18498804 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaaataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataagaatgaa 18498706  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||| | || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||| | |  |||    
T  18498705 tttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcagacaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aatgactctttggacgtgctaaaaatc 18498607  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  18498606 tcaacgtctct 18498596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 18555454 - 18555246
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || || ||||||| ||||||||    
T  18555454 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccctcaagataggaatgaa 18555356  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||| | |  |||    
T  18555355 tttgaagttgatccttcgtaggactacacccaaatcaggcaaaagtttactcgtggatgatctaaggaactc-aacgactctttagatgtgctaaaaatc 18555257  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  18555256 tcaacgtctct 18555246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 204 - 380
Target Start/End: Original strand, 10640386 - 10640562
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  10640386 aaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactaattcaaaaggatttgaaggcatta 10640484  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttg-acaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| | |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10640485 gatgcttgttctttgaagagcgttgaaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgtttt 10640562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Original strand, 33351876 - 33352090
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||  |  |||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||| | ||| |||    
T  33351876 ttcatcgggagatgcaacttaaagcctcaaaagctgtttcaaggattcacactcgtctaag-agtgcagaagactggaaaagtatagcaagg-ctatttt 33351973  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    |||||||||  ||  ||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33351974 gaaaggattgaaaaacattggatgtttattcttcaa-gagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaatcactatctccactactctgtttttgt 33352072  T
Q  384 ctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  33352073 ctctgctacaagacaaga 33352090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 298 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 20635799 - 20635595
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20635799 gcattggatgcttgtccttcaaagagagttgacaaagtac--------aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 20635708  T
Q  398 aag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattac 496  Q
    ||| | ||||||  ||||||||| |  ||| |||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| |     
T  20635707 aagaaaaacagctctgcctgcagca-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcat 20635609  T
Q  497 tggtggatgatcaa 510  Q
    |||||  |||||||    
T  20635608 tggtgattgatcaa 20635595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 29918446 - 29918276
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29918446 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggattatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaataatagagagcaa 29918347  T
Q  103 agaaatcaacgaa--gaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaaa 166  Q
    || ||||||| ||   ||||||||||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29918346 aggaatcaacaaatcaaggaagcttaaagcgtatgaagaaaactgcttctgaagacaaagtgctcctgaaa 29918276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 356
Target Start/End: Original strand, 34451611 - 34451787
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||||| | |||| || ||||  | | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  34451611 agttcatcaggagatgcaagacttaaagattcaaaggctgttcaatggattcagtatcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacgacta 34451710  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaa 356  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| | ||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34451711 atttgagaggatttgaaagcattgtatgcctattctttgaaaagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaa 34451787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 400
Target Start/End: Original strand, 19065971 - 19066181
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagga-tctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||   |||||| ||||||||||||||   |||||| |||    
T  19065971 cagttcatcaggagatggatcttaaagcttcaaaagctgtttcaaggactctaa-ctcgcctagaaattgcagaagactggaaaagtatggcaacggcta 19066069  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||| |         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19066070 ttttgaaatg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtatgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgttt 19066160  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  19066161 ttgtctctgctacaagacaag 19066181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19086308 - 19086143
Alignment:
Q  226 ggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcg 325  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||          |||||||||||||||| |  |||||||    
T  19086308 ggatttaatctcgtctaagtattgcagaagactgggagagtgaagcaacgactattttgaaag----------cattggatgcttgttctttgaagagcg 19086219  T
Q  326 ttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  19086218 ttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 19086143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17381873 - 17381706
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |    
T  17381873 aaaattgtcaattggatatgctaatacttgttcaagtgtacatgactatagaaaaaattttacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcata 17381774  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17381773 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 17381706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 19832707 - 19832874
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  19832707 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgtttaagtatacaggactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagcaa 19832806  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | | |||||| || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19832807 atacatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 19832874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 20487608 - 20487774
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||   ||||||    
T  20487608 aaaattgtcaattggatatggtaatatttgttcaagtctacaggactatagacaaaaattgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaaaagcaaa 20487707  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | ||||||||||||||     |||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  20487708 ggaatcaacaaaaaagaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaggtgctcttgaa 20487774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26943719 - 26943577
Alignment:
Q  243 agcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattg 342  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||| ||||    
T  26943719 agcattgcagaagactagaagagtgaagcaaccgctatttcaataggattagaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttggcgaagtacaattg 26943620  T
Q  343 tacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26943619 tacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtct 26943577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 347 - 488
Target Start/End: Original strand, 7586268 - 7586408
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  7586268 aagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 7586366  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaa 488  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||    
T  7586367 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaa 7586408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18436017 - 18435850
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||||| ||| ||    
T  18436017 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgtcatcttaaaaatgtattggaagaacaatagagagaaa 18435918  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || |||||||||||||| |     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18435917 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcatctgaagagaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 18435850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 510
Target Start/End: Original strand, 14051426 - 14051654
Alignment:
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||| | | |||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14051426 tttgaaggaatttgaagtcattggatgcttatccttcaaagagagtcgacaaagtac-attgtacgaagcgtacagccacttcctccactactctgtttt 14051524  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaa 479  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  |||  ||||||  |  ||||| |||||||  | |||||||| || || ||| ||||    
T  14051525 tgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgtttcttcaaattcagaatggatttgaaattaattcttcataggacaacatccaa 14051623  T
Q  480 atcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  14051624 atcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 14051654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 33351649 - 33351818
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactataga-caaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33351649 aaaattgtcaattggataggctaatatttgttcaagtgtacaggactatagataaaaatttgacatcttaaagtggtcttggaagaacaaatagagagca 33351748  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |  | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33351749 agtacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcttgaa 33351818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 309 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17381598 - 17381506
Alignment:
Q  309 ttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17381598 ttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaatcactacctccactattctgtttttgtctctgctacaagacaaga 17381506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 347 - 510
Target Start/End: Original strand, 17608417 - 17608579
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| | || |||||||||| |||||||    
T  17608417 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttt-gtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagataggaatga 17608514  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  17608515 atttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 17608579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25597685 - 25597558
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||    
T  25597685 agttcatcaggacatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagactggaagagtgaagcgacggcta 25597586  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatg 307  Q
     || ||||||||||||||||||||||||    
T  25597585 tttcgaaaggatttgaaggcattggatg 25597558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 347 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6158391 - 6158316
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaat 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6158391 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 6158316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19470813 - 19470678
Alignment:
Q  243 agcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattg 342  Q
    ||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| || |||| || ||||    
T  19470813 agcattgcacaagaccagaagaatgaagcaacgactaattcaaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgcagagcgtggaaaaaggacaattg 19470714  T
Q  343 tacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19470713 tacgaagtttacaaccactacctccactactatgtt 19470678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 347 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 21128265 - 21128103
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  21128265 aagtgtacaaccactacttccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacatctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 21128167  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    ||||||   ||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  21128166 tttgaatgcgattcttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagataattggtgattgatcaa 21128103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22386885 - 22386678
Alignment:
Q  295 aaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaa 394  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22386885 aaggcattggatgcttgtccttcaaagagagttgacaaagtacca--------agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaa 22386794  T
Q  395 gacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggat 493  Q
    |||||| | ||||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||   |||| |||| ||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| |||    
T  22386793 gacaagaaaaacagctctgcctgcagta-atgttccttcaagatattaatggattttaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagat 22386695  T
Q  494 tactggtggatgatcaa 510  Q
     | |||||  |||||||    
T  22386694 cattggtgattgatcaa 22386678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 421
Target Start/End: Original strand, 14070107 - 14070247
Alignment:
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||| | | |||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14070107 tttgaaggaatttgaagtcattggatgcttatccttcaaagagagtcgacaaagtac-attgtacgaagcgtacagccacttcctccactactctgtttt 14070205  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaa 421  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  14070206 tttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 14070247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21618680 - 21618516
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||    
T  21618680 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaagtttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagca 21618581  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctc 160  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21618580 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctc 21618516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16877657 - 16877506
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||  |||||||    
T  16877657 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgattatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtcctggaagaacaataaagagcaaa 16877558  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    | ||| ||| || | ||| |||||||||||     |||||||||||||||||    
T  16877557 ggaattaacaaaaagggaggcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 16877506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 421
Target Start/End: Original strand, 25722973 - 25723044
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaa 421  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25722973 tgtacaactactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa 25723044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16336598 - 16336430
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||    
T  16336598 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtagatgactatagacaaaaatttgacatcttaaa-aggtcttggaagaacaaataaagagca 16336500  T
Q  102 aagaaatcaacgaagag-gaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || || ||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  16336499 aatacatcaacaaaaagtgaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgttcctgaa 16336430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 165
Target Start/End: Original strand, 139096 - 139240
Alignment:
Q  27 atatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaat-ttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagctt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| || || ||||||    
T  139096 atatttgttcaagtgtacatgattatagacaaaatattgtcatcttaaaaaggtcttagaagaacaataaagagcaaaggaatcaacaaaaagaaagctt 139195  T
Q  126 aaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||||||     |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  139196 aaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaggcgctcctgaa 139240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 165
Target Start/End: Original strand, 147117 - 147261
Alignment:
Q  27 atatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaat-ttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagctt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||  |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| || || ||||||    
T  147117 atatttgttcaagtgtacatgattatagacaaaatattgtcatcttaaaaaggtcttagaagaacaataaagagcaaaggaatcaacaaaaagaaagctt 147216  T
Q  126 aaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||||||     |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  147217 aaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaggcgctcctgaa 147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12353597 - 12353525
Alignment:
Q  490 ggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  12353597 ggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctccttcac 12353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12423653 - 12423514
Alignment:
Q  18 gatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagcaaagaaatcaacgaa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||| ||    
T  12423653 gatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagcaaatacatcaacaaa 12423554  T
Q  116 gag-gaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
     || ||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  12423553 aagtgaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 12423514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Original strand, 17316586 - 17316689
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  17316586 gcatcggatgcttattcctcaaggagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactatgtttttgtctctgctacaagac 17316685  T
Q  398 aaga 401  Q
    ||||    
T  17316686 aaga 17316689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19482840 - 19482753
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19482840 gcattggatgcttattcctcaaggagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtct 19482753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 26971916 - 26972083
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||| | ||||||    
T  26971916 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccataaacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaatggagagcaa 26972015  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || ||||| ||||||||||     || ||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  26972016 aggaatcaacaaaaaggaatcttaaagcgtctgaagagaactgcttctgaagtcaaagtgctactgaa 26972083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25594155 - 25594053
Alignment:
Q  299 cattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 398  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |    
T  25594155 cattggatgcttgttctttgaagcgcgttgacaaagtacaattgtacgaaatgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagaaa 25594056  T
Q  399 aga 401  Q
    |||    
T  25594055 aga 25594053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 350 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 17047736 - 17047573
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccacta-ctctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatt 448  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17047736 tgtacaaccacgacctccacgaactctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcaga-tttgttccttcaagataggaatgaatt 17047638  T
Q  449 tgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagg 513  Q
    | ||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||    
T  17047637 ttaagttaattctttaaaggactacatccaaatcaggcaaaagtttaatggtgaaagatcaaagg 17047573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26589670 - 26589584
Alignment:
Q  316 tcaaagagcgttgacaaagtacgattgtac-aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  26589670 tcaaagagcgttgacatagtacgtctgtacgaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttctgtctctgctacaagacaaga 26589584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32544657 - 32544544
Alignment:
Q  57 aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac 151  Q
    |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||     || ||||||||||||||||    
T  32544657 aaaatttgacatcttaaaaaggttatggaagaacaatagagagcaaaggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaactgctcctgaagac 32544558  T
Q  152 aaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||| ||||    
T  32544557 aaagtgctcttgaa 32544544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9718286 - 9718119
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  || |   | |||  | ||||||||| || ||||||    
T  9718286 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgagatcatcgttaggttctagaagaacaaaagagagcaa 9718187  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||     || |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9718186 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaactactcctgaagacaaagtgctcttgaa 9718119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13435968 - 13435848
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  || |||||||| || |||||| | ||||    
T  13435968 tcaattggatatgctaatatttgttcaaatgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctgaaagaacaaaagagagcaatggaatc 13435869  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||| || ||||||||| ||||    
T  13435868 aacaaaaaggaagcttgaagc 13435848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19086593 - 19086426
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||  || | | | |||  ||||||||||| || |||| |    
T  19086593 aaaattgtcaattggatatgctaatattttttcaagtgtacaagaccatagacaaaaatttgatatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcta 19086494  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || ||||||||| ||||||     || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19086493 aggaatcaacaaaaaggaagcttgaagcgtctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgctcctgaa 19086426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24117271 - 24117104
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |  | | | |||  ||||||||||| || |||| |    
T  24117271 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatattattattaggttatggaagaacaaaagagagcta 24117172  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || |||||||||||||| |     || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24117171 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcatctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgctcctgaa 24117104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 34451390 - 34451517
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||  |||  ||||||||||| || ||||||    
T  34451390 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagcgtacaggaccaaagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaaaagagagcaa 34451489  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||| | || ||||||||| ||||    
T  34451490 aggaatcagcaaaaaggaagcttgaagc 34451517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 26590070 - 26589981
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  26590070 aaaattgtcaattggattcgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaattttgacatcttaaattgatcctgaaagaacaa 26589981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13602601 - 13602473
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggag 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||   || | | | |||  ||||||||||| || |||    
T  13602601 attaaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttggaatcattattaggttctggaagaacaaaagagag 13602502  T
Q  100 caaagaaatcaacgaagaggaagcttaaa 128  Q
     |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  13602501 aaaaggaatcaacaaaaaggaagcttaaa 13602473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17928246 - 17928190
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17928246 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaa 17928190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19689138 - 19689030
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagc 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||| || |||||||  ||||||| || ||||||     
T  19689138 taatatttgtttaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaaatgaatcaacaaaaaggaagt 19689039  T
Q  124 ttaaagcgt 132  Q
    || ||||||    
T  19689038 ttgaagcgt 19689030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 12715141 - 12715268
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||   || | | | || | ||||||||||| || ||||||    
T  12715141 aaaattgtcaattggatatattaatatttgttcaagtgtacaggaccataaacaaaaatttggaatcattattaggacctggaagaacaaaagagagcaa 12715240  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||    
T  12715241 agaaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 12715268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 14100179 - 14100306
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | ||| |||||| |||||||||  | |||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  14100179 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaaatgtataggaccatagacaaaaatttgatatattaaataggttctggaagaacaaaagagagcaa 14100278  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
     | ||||||| || ||||||||| ||||    
T  14100279 tggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 14100306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 15531326 - 15531400
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactataga-caaaatttgacgtcttaaa 74  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  15531326 attaaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagataaaaatttgacatcttaaa 15531400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 22387250 - 22387176
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaa-gtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattg 77  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22387250 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaaagtatacaggactatagacaaaatttgatatcttaaattg 22387176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3680918 - 3680862
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3680918 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaa 3680862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19624405 - 19624241
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  || | | | |||  ||||||||||| || |||| |    
T  19624405 aaaattgtcaattagatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcta 19624306  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcct 162  Q
    || ||||||| || ||||||||| |||| |     || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  19624305 aggaatcaacaaaaaggaagcttgaagcatctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgctcct 19624241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Original strand, 22056434 - 22056478
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22056434 tggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaa 22056478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21625541 - 21625414
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |  |||  | ||||||||| || ||| ||    
T  21625541 aaaattgtcaattggatattctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttagaaaggttctcgaagaacaaaagagagaaa 21625442  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    |  ||||||| || ||||||||| ||||    
T  21625441 atgaatcaacaaataggaagcttgaagc 21625414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 19625847 - 19625814
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19625847 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 19625814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15302614 - 15302558
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15302614 aaaattgtcaatcggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 15302558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 18384081 - 18384025
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  18384081 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttaaagtgtacaggaccatagacaaaa 18384025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 25597893 - 25597849
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25597893 tggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 25597849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 17445398 - 17445457
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  17445398 attaaaaatgttaactggatatgctaatatttgttcaagtgtgaaggaccatagacaaaa 17445457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Original strand, 17608048 - 17608134
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   | | |||||  |||||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  17608048 taatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaagttgatcattttaaa-aggtcttggaagaacaaaagagagcaaatgaatcaac 17608134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 19876238 - 19876184
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaa 58  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  19876238 aaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgttcaagaccatagacaa 19876184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25930568 - 25930479
Alignment:
Q  290 atttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||  |||| |  || ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25930568 atttgaagtcattggatgcttattccttgaagagcgttggaaaaggataatagtacaat-tgtacaaccactatctccactactctctttt 25930479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Original strand, 11525313 - 11525369
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa 59  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11525313 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaa 11525369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15987637 - 15987581
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  15987637 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatatacaaaa 15987581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 20112420 - 20112476
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20112420 aaaattgtcaattggaattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 20112476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24399082 - 24399038
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  24399082 tggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 24399038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 32336221 - 32336165
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  32336221 aaaaatgtcaattagatatgctaatatttgttcaagtgtgcaagaccatagacaaaa 32336165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 207)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 22559557 - 22559773
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22559557 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatga 22559656  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22559657 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 22559756  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  22559757 ctcaacgtctctttcac 22559773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 30070046 - 30069828
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30070046 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 30069947  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30069946 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcataggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 30069847  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30069846 tcaacgtctctttcacgcc 30069828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 31448673 - 31448892
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31448673 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 31448772  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  31448773 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattat 31448872  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31448873 ctcaacgtctctttcacgcc 31448892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 20797816 - 20798034
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20797816 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctgcaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 20797915  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20797916 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 20798015  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20798016 tcaacgtctctttcacgcc 20798034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 34782977 - 34783194
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34782977 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 34783075  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34783076 tttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 34783175  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34783176 tcaacgtctctttcacgcc 34783194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 43043811 - 43043593
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043811 aagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 43043712  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43043711 tttgaagctaattcttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 43043612  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43043611 tcaacgtctctttcacgcc 43043593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27622907 - 27622691
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  27622907 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 27622808  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27622807 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 27622708  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  27622707 ctcaacgtctctttcac 27622691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 31418782 - 31419001
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31418782 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttatgccttcaagatgggaatga 31418881  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  31418882 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattat 31418981  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31418982 ctcaacgtctctttcacgcc 31419001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 34772032 - 34772249
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772032 aagtgtacaaccactacctccaccactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 34772130  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34772131 tttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgatgattatc 34772230  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34772231 tcaacgtctctttcacgcc 34772249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5290716 - 5290500
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  5290716 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatggtaatga 5290617  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5290616 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5290517  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  5290516 ctcaacgtctctttcac 5290500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27603558 - 27603342
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  27603558 aagtatacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 27603459  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27603458 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 27603359  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  27603358 ctcaacgtctctttcac 27603342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 27203913 - 27204132
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  27203913 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 27204012  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27204013 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 27204112  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27204113 ctcaacgtctctttcacgcc 27204132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 39352608 - 39352827
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39352608 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 39352707  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39352708 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaagaatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 39352807  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39352808 ctcaacgtctctttcacgcc 39352827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 40390477 - 40390696
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40390477 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 40390576  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40390577 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 40390676  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40390677 ctcaacgtctctttcacgcc 40390696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 6130909 - 6131128
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  6130909 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 6131008  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6131009 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 6131108  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6131109 ctcaacgtctctttcacgcc 6131128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 7032268 - 7032047
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt---gtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaat 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7032268 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaat 7032169  T
Q  444 gaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatt 543  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7032168 gaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt 7032069  T
Q  544 atctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7032068 atctcaacgtctctttcacgcc 7032047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 10754614 - 10754828
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10754614 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaa 10754712  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10754713 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaatgatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 10754812  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  10754813 tcaacgtctctttcac 10754828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 16004031 - 16003812
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  16004031 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 16003932  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16003931 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 16003832  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16003831 ctcaacgtctctttcacgcc 16003812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 22146641 - 22146860
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22146641 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 22146740  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22146741 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 22146840  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22146841 ctcaacgtctctttcacgcc 22146860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 22157224 - 22157443
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22157224 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 22157323  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22157324 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 22157423  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22157424 ctcaacgtctctttcacgcc 22157443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 31844079 - 31844298
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  31844079 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 31844178  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31844179 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 31844278  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31844279 ctcaacgtctctttcacgcc 31844298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 36582698 - 36582479
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  36582698 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatga 36582599  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36582598 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 36582499  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36582498 ctcaacgtctctttcacgcc 36582479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 36593253 - 36593034
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  36593253 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatga 36593154  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36593153 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 36593054  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36593053 ctcaacgtctctttcacgcc 36593034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 40401139 - 40401358
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40401139 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 40401238  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40401239 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 40401338  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40401339 ctcaacgtctctttcacgcc 40401358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 8521962 - 8522179
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8521962 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 8522060  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8522061 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtgaatgatcaaatgatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 8522160  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8522161 tcaacgtctctttcacgcc 8522179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 23406567 - 23406781
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406567 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaatacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 23406665  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  23406666 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 23406765  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  23406766 tcaacgtctctttcac 23406781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 39491090 - 39490871
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  39491090 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 39490991  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39490990 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 39490891  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39490890 ctcaacgtctctttcacgcc 39490871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 39502280 - 39502061
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  39502280 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 39502181  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39502180 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 39502081  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39502080 ctcaacgtctctttcacgcc 39502061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 1109285 - 1109068
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1109285 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaa 1109187  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1109186 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 1109087  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1109086 tcaacgtctctttcacgcc 1109068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 1122043 - 1121826
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1122043 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaa 1121945  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1121944 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 1121845  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1121844 tcaacgtctctttcacgcc 1121826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 21703268 - 21703051
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703268 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 21703169  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||  ||    
T  21703168 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctc 21703070  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21703069 tcaacgtctctttcacgcc 21703051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 21706115 - 21705898
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21706115 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 21706016  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||  ||    
T  21706015 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctc 21705917  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21705916 tcaacgtctctttcacgcc 21705898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 15993469 - 15993252
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  15993469 aagtgtacaaccactacctccactaatctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 15993370  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15993369 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 15993270  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacg 563  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15993269 ctcaacgtctctttcacg 15993252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 6975928 - 6976144
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  6975928 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 6976027  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6976028 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 6976127  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  6976128 ctcaacgtctctttcac 6976144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 6986418 - 6986634
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  6986418 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 6986517  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6986518 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 6986617  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  6986618 ctcaacgtctctttcac 6986634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9377602 - 9377386
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9377602 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 9377503  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9377502 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9377403  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  9377402 ctcaacgtctctttcac 9377386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 14030164 - 14030380
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  14030164 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 14030263  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14030264 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 14030363  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  14030364 ctcaacgtctctttcac 14030380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 14040717 - 14040933
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  14040717 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 14040816  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14040817 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 14040916  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  14040917 ctcaacgtctctttcac 14040933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14558157 - 14557941
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  14558157 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 14558058  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14558057 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 14557958  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  14557957 ctcaacgtctctttcac 14557941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14568794 - 14568578
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  14568794 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 14568695  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14568694 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 14568595  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  14568594 ctcaacgtctctttcac 14568578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 22676236 - 22676452
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22676236 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 22676335  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22676336 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 22676435  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  22676436 ctcaacgtctctttcac 22676452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 22686127 - 22686343
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22686127 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 22686226  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22686227 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 22686326  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  22686327 ctcaacgtctctttcac 22686343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 23306965 - 23307181
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  23306965 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 23307064  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23307065 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 23307164  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  23307165 ctcaacgtctctttcac 23307181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 23362230 - 23362450
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  23362230 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatga 23362329  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaa-gtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23362330 atttgaagcttattcttcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 23362429  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23362430 tctcaacgtctctttcacgcc 23362450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24817026 - 24816810
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  24817026 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 24816927  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24816926 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 24816827  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  24816826 ctcaacgtctctttcac 24816810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24827614 - 24827398
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  24827614 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 24827515  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24827514 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 24827415  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  24827414 ctcaacgtctctttcac 24827398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 27460281 - 27460497
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  27460281 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 27460380  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27460381 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 27460480  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  27460481 ctcaacgtctctttcac 27460497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 27470680 - 27470896
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  27470680 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 27470779  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27470780 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 27470879  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  27470880 ctcaacgtctctttcac 27470896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27042352 - 27042133
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  27042352 aagtgtacaaccactaccaccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 27042253  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27042252 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 27042153  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27042152 ctcaacgtctctttcacgcc 27042133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 36084582 - 36084796
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084582 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacatgacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 36084680  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  36084681 tttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 36084780  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  36084781 tcaacgtctctttcac 36084796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 36228860 - 36229074
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36228860 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgccacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 36228958  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  36228959 tttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 36229058  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  36229059 tcaacgtctctttcac 36229074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5301292 - 5301071
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaa-----cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  5301292 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaagacaacagccatgccagcagaagttgtacgttcaagatggg 5301193  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttg 540  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5301192 aatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctg 5301093  T
Q  541 attatctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5301092 attatctcaacgtctctttcac 5301071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 17607181 - 17607397
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  17607181 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 17607280  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17607281 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 17607380  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  17607381 ctcaacgtctctttcac 17607397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 17617795 - 17618011
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  17617795 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 17617894  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17617895 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 17617994  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  17617995 ctcaacgtctctttcac 17618011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 23296397 - 23296613
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  23296397 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 23296496  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23296497 atttgaagtttattcttcaaatgactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 23296596  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  23296597 ctcaacgtctctttcac 23296613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 31348655 - 31348871
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  31348655 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 31348754  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31348755 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 31348854  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  31348855 ctcaacgtctctttcac 31348871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 31359269 - 31359485
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  31359269 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 31359368  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31359369 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 31359468  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  31359469 ctcaacgtctctttcac 31359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 36687816 - 36688032
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  36687816 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 36687915  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36687916 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 36688015  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  36688016 ctcaacgtctctttcac 36688032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 36698382 - 36698598
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  36698382 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 36698481  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36698482 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 36698581  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  36698582 ctcaacgtctctttcac 36698598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 40514130 - 40513910
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  40514130 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 40514031  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40514030 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 40513931  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40513930 tctcaacgtctctttcacgcc 40513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 9336076 - 9336294
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  9336076 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 9336174  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9336175 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9336274  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9336275 ctcaacgtctctttcacgcc 9336294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 9346663 - 9346881
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  9346663 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 9346761  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9346762 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9346861  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9346862 ctcaacgtctctttcacgcc 9346881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 24808033 - 24808251
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  24808033 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 24808131  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24808132 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 24808231  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24808232 ctcaacgtctctttcacgcc 24808251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24926279 - 24926065
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24926279 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacacctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 24926181  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  24926180 tttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 24926081  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  24926080 tcaacgtctctttcac 24926065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24983560 - 24983346
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24983560 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 24983462  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  24983461 tttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 24983362  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  24983361 tcaacgtctctttcac 24983346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 352 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27052971 - 27052757
Alignment:
Q  352 tacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttg 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  27052971 tacaaccactaccaccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttg 27052872  T
Q  451 aagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaa 550  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27052871 aagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaa 27052772  T
Q  551 cgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||    
T  27052771 cgtctctttcacgcc 27052757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 33951941 - 33951721
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  33951941 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcccgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 33951842  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33951841 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 33951742  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33951741 tctcaacgtctctttcacgcc 33951721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 35215625 - 35215845
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  35215625 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35215724  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35215725 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 35215824  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35215825 tctcaacgtctctttcacgcc 35215845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 35226209 - 35226429
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  35226209 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35226308  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35226309 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 35226408  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35226409 tctcaacgtctctttcacgcc 35226429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 15694171 - 15693953
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  15694171 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 15694073  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15694072 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 15693973  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15693972 ctcaacgtctctttcacgcc 15693953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 19464092 - 19464306
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19464092 aagtgtacaaccactacgtccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 19464191  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||   || |||    
T  19464192 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcaaatcatc 19464290  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  19464291 tcaacgtctctttcac 19464306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 19478122 - 19478336
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19478122 aagtgtacaaccactacgtccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 19478221  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||   || |||    
T  19478222 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcaaatcatc 19478320  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  19478321 tcaacgtctctttcac 19478336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 23707563 - 23707781
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  23707563 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 23707661  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23707662 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 23707761  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23707762 ctcaacgtctctttcacgcc 23707781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 24567210 - 24567428
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  24567210 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 24567308  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24567309 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 24567408  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24567409 ctcaacgtctctttcacgcc 24567428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 30227637 - 30227419
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  30227637 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 30227539  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30227538 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 30227439  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30227438 ctcaacgtctctttcacgcc 30227419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 30238164 - 30237946
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  30238164 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 30238066  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30238065 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 30237966  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30237965 ctcaacgtctctttcacgcc 30237946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 42042905 - 42043123
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  42042905 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 42043003  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42043004 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 42043103  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42043104 ctcaacgtctctttcacgcc 42043123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 42053480 - 42053698
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  42053480 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 42053578  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42053579 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 42053678  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42053679 ctcaacgtctctttcacgcc 42053698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 17446835 - 17446619
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  17446835 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagttgggaatgaa 17446737  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |  | |||    
T  17446736 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctattcatc 17446638  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17446637 tcaacgtctctttcacgcc 17446619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 34062741 - 34062957
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  34062741 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagttgggaatgaa 34062839  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |  | |||    
T  34062840 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctattcatc 34062938  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34062939 tcaacgtctctttcacgcc 34062957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 17719038 - 17719255
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  17719038 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 17719137  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17719138 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 17719237  T
Q  545 tctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17719238 tctcaacgtctctttcac 17719255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 17729690 - 17729907
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  17729690 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 17729789  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17729790 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 17729889  T
Q  545 tctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17729890 tctcaacgtctctttcac 17729907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 14447140 - 14446920
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  14447140 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 14447041  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14447040 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 14446941  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14446940 tctcaacgtctctttcacgcc 14446920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 14457752 - 14457532
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  14457752 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 14457653  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14457652 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 14457553  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14457552 tctcaacgtctctttcacgcc 14457532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 15740087 - 15740307
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  15740087 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 15740186  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15740187 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 15740286  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15740287 tctcaacgtctctttcacgcc 15740307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 15769247 - 15769467
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  15769247 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 15769346  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15769347 aatttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 15769446  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15769447 tctcaacgtctctttcacgcc 15769467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33022865 - 33022645
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  33022865 cagttcatcaggagatgcaacataaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcatctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactag 33022766  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33022765 tttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgtttt 33022666  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  33022665 tgtctctgctacaagacaaga 33022645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 559
Target Start/End: Original strand, 42395101 - 42395311
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42395101 aagtgtacaaccactacctccacta-tctgtttt-gtccacactacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatggaaatgaa 42395198  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42395199 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 42395298  T
Q  547 tcaacgtctcttt 559  Q
    |||||||||||||    
T  42395299 tcaacgtctcttt 42395311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 20551936 - 20552150
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20551936 aagtgtacaaccactacctccactactctatttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaa 20552034  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | || |||    
T  20552035 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaatgatttcaaacaactctttagacttgctaatcatc 20552134  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  20552135 tcaacgtctctttcac 20552150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 17457451 - 17457235
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  17457451 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtatacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagttgggaatgaa 17457353  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |  | |||    
T  17457352 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctattcatc 17457254  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17457253 tcaacgtctctttcacgcc 17457235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31118079 - 31117858
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31118079 cagttcatcaggagatgcaacataaagcttcaaaaggttgtttaacggatttaaactcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgacta 31117980  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31117979 atttgaaagaatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagtgttgacaaagtacaaatgtacgaagtgtacatccactacttccactactctgttt 31117880  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  31117879 ttgtctctgctacaagacaaga 31117858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 34052080 - 34052296
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||    
T  34052080 aagtgtacaaccactacctccactagtctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagttggaaatgaa 34052178  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |  | |||    
T  34052179 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctattcatc 34052277  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34052278 tcaacgtctctttcacgcc 34052296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 384 - 565
Target Start/End: Original strand, 31833639 - 31833820
Alignment:
Q  384 ctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatca 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31833639 ctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatca 31833738  T
Q  484 ggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31833739 ggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcacgcc 31833820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 37729392 - 37729176
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  37729392 aagtgtacaaccactacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 37729293  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  37729292 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctga-tc 37729194  T
Q  545 tctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37729193 tctcaacgtctctttcac 37729176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 37740708 - 37740492
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  37740708 aagtgtacaaccactacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 37740609  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  37740608 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctga-tc 37740510  T
Q  545 tctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37740509 tctcaacgtctctttcac 37740492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 37406769 - 37406985
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  37406769 aagtgtacaaccactatctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaatt-gttccttcaagatgagaattaa 37406867  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  | |||    
T  37406868 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgttattcatc 37406966  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37406967 tcaacgtctctttcacgcc 37406985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11994088 - 11993869
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||  || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11994088 agttcatcaggagatgcaacttaaagtttcaaaagatgttcaacggattcaaactcgtctaaggattgcagaagactggaatagtgaagcaacggctaat 11993989  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11993988 ttgaagggatttgaaagcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtatgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgttttt 11993889  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||| ||||||    
T  11993888 gtctctgctacaaaacaaga 11993869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4887223 - 4887003
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||| || |||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  4887223 cagttcatcaagatatgcaacttaaagcttcaaaagttgttcaatggatttaaacttgtcttaagattgcaaaagactggaaaagtatagcaacgactat 4887124  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4887123 tttgaaaagatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtgtgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 4887024  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  4887023 tgtctctgctacaagacaaga 4887003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 106239 - 106453
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | || |||||||||||||||||||    
T  106239 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgtagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 106337  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg-ttgattat 545  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |  |  ||    
T  106338 tttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaaat 106436  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  106437 ctcaacgtctctttcac 106453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 20624885 - 20625099
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  20624885 aagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaacagctatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgagaatgaa 20624983  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg-ttgattat 545  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |  |  ||    
T  20624984 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaaat 20625082  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  20625083 ctcaacgtctctttcac 20625099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 30743181 - 30742962
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||     
T  30743181 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaggcaaagcaacgattat 30743082  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30743081 tttgaaaggatttgaaggcattggatgtttattcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttt 30742983  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  30742982 tgtctctgctacaagacaaga 30742962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 177 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21910763 - 21910539
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| | |||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21910763 gctaaagttcatcaggagatgcaagacttaaagcgtcaaaggctgttgaattgatttaatctcgtctaagcattacaaaagactggaaaagtgaagcaac 21910664  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21910663 gattattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 21910564  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
     |||| |||||  ||||||||||||    
T  21910563 agtttgtgtctctgctacaagacaa 21910539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 42243881 - 42243662
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  42243881 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaaaattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactatt 42243782  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcc-tcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42243781 ttgaaaggatttgaagacatttgatgtttgttccttaaaagagcgttgacaaaatacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttt 42243683  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  42243682 tgtctctgctacaagacaaga 42243662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20551097 - 20550876
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||| || || | ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||    
T  20551097 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggttttaatctcgtctaagcattgcagaaaactagaagagtgaagcaacgact 20550998  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20550997 attttgaaaagatttgaaggcattggatgcttgttctttaaagagcgttgacaaa-tacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 20550899  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  20550898 tttgtctctgctacaagacaaga 20550876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 181 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33933472 - 33933230
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaaga--tgtttaaagg-atctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgac 277  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |  ||||||| || ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33933472 cagttcatcagaggatgcaacttaaagcttcaaaaaagttgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacaac 33933373  T
Q  278 taatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctc-aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33933372 tattttgaaaggatttaaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgatatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctg 33933273  T
Q  377 tttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgca 418  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  33933272 tttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 33933230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 14086473 - 14086695
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagg-atctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14086473 cagttcatcagaggatgcaacttaaggcttcaaaagctgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgcagaagactggaaaagtgaagcaacggcta 14086572  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaa-gagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
     ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14086573 ttttgaagtgatttgaatgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccgctacctccactactctgtt 14086672  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  14086673 tttgtctctgctacaagacaaga 14086695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 430 - 565
Target Start/End: Original strand, 39364685 - 39364820
Alignment:
Q  430 ttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39364685 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 39364784  T
Q  530 tagacgtgttgattatctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39364785 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcacgcc 39364820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 347 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 43621999 - 43621853
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621999 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 43621901  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggatt 494  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43621900 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatt 43621853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 186 - 401
Target Start/End: Original strand, 7745632 - 7745849
Alignment:
Q  186 catcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    |||||||||||| ||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||| | || |||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||| |||    
T  7745632 catcaggagatgtaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatcgcatccaagcattggagaagactagaagagtgaagcaacaactatttt 7745731  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7745732 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcggtttttgt 7745831  T
Q  384 ctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  7745832 ctctgctacaagacaaga 7745849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 20417022 - 20417230
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||    
T  20417022 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagagaggaatgaa 20417120  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  20417121 tttgaagttgatccttcataggactacatctaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 20417219  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  20417220 tcaacgtctct 20417230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 347 - 560
Target Start/End: Original strand, 23372631 - 23372848
Alignment:
Q  347 aagtgtacaacc-actacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaattt-gtgccttcaagatgggaat 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||  | ||||| || |  |||||||||||||    
T  23372631 aagtgtacaacccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagaaaaaacaacagccatgcctcaaaaattttgttcactcaagatgggaat 23372730  T
Q  444 gaatttgaagctgattcttcaaa-gtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgat 542  Q
    |||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23372731 gaatttgaagtttattcttcaaaaggactacccccaaatcaggcaaaggaacactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgggctgat 23372830  T
Q  543 tatctcaacgtctctttc 560  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23372831 tatctcaacgtctctttc 23372848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 41566369 - 41566589
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  41566369 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaagctattcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaaaagtgaagcaacgtcta 41566468  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41566469 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgtttattctttgaagagcgttgatatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 41566568  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  41566569 gtgtctctgctacaagacaag 41566589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 347 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 32754085 - 32753875
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  32754085 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 32753987  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  32753986 tttgaagttaatccttcataggactacacccaaatcaggaaaaagattaatggtagatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 32753888  T
Q  547 tcaacgtctcttt 559  Q
    |||||||||||||    
T  32753887 tcaacgtctcttt 32753875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 13545455 - 13545668
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||| ||||    
T  13545455 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggacttaatctcgtctaagcattgcagaaga--------gtgaagcaacaacta 13545546  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13545547 ctttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaagtgtacgaagtgtacaaccaccacctccactactctattt 13545646  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  13545647 ttgtctctgctacaagacaaga 13545668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 20562461 - 20562660
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||               | |||||||||||||||||||||    
T  20562461 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccatgctacaagacaagacaacagc---------------tatgccttcaagatgggaatgaa 20562544  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | || |||    
T  20562545 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaatgatttcaaacaactctttagacttgctaatcatc 20562644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 21414338 - 21414191
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  21414338 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaa 21414240  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggatta 495  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21414239 tttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatta 21414191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15517169 - 15516951
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |    
T  15517169 agttcatcagaagatgcaacttaaagcttcaaaagttgttcaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacggctatt 15517070  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15517069 ttggaaggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagtgttggcatagtacttttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttt 15516971  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  15516970 gtctctgctacaagacaaga 15516951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17815168 - 17814950
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17815168 ttcatcaagagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactatt 17815069  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  17815068 ctgaaaggatttgaaagcattagatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacggagtgtacaaccactatctccactactcagtttgt 17814969  T
Q  382 gtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||  |||||||| ||||    
T  17814968 gtctctgctacaaggcaag 17814950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 89357 - 89578
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  89357 agttcatcaggagatgcaaaacttaaagcttcaaaagttgttcaatggatttaatctcgtctaagaattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgacta 89456  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  89457 ttttgaaagaatttgaaagcattgcatgcttgttctttgaagagcattgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 89556  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  89557 gtgtctctgctacaagacaaga 89578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 3245378 - 3245597
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||     
T  3245378 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttccaaaactgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacggctat 3245476  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3245477 tttgaaagaattgaaaggcatttgatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccagtactctgtttt 3245576  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||   |||||||||||||    
T  3245577 tgtctctactacaagacaaga 3245597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 6512366 - 6512583
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| |  |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6512366 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcagtggatttaatctcgtctaagcattgctgaagactggaagagtgaagcaacgacta 6512465  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||   |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  6512466 ttttgaaaggatttgaaggcattg---gcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatcttcactactcagttt 6512562  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||| ||||||    
T  6512563 gtgtctctgctacacgacaag 6512583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26759349 - 26759131
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||  ||| ||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |    
T  26759349 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaattcgcctaaagattgcagaagactggaaaagtataacaacgactatt 26759250  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26759249 ttggaaggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgctgaaatagtaagtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactct-atttt 26759151  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  26759150 gtctctgctacaagacaaga 26759131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9089345 - 9088950
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagcaaagaaat 108  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||| | ||    
T  9089345 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagcaaatacat 9089246  T
Q  109 caacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagaca--aagtgctc-----ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggaga 195  Q
    |||| || ||| |||||||||||||     |||||||||||||||||  |  | ||  ||     |||  |||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  9089245 caacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtgatgacgtcatcagaagctgtgaatcaccagaagctgcagttcatcaggaga 9089146  T
Q  196 tgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttga 295  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||   || |||||||| | |||| | ||||||||||||||    ||||||||| ||||         ||    
T  9089145 tgcaacttaaagtttcaaaagctgtttaaaggaatcaaactcgtctatg-attgaagaagactggaaaagtattacaacgactattttg---------ga 9089056  T
Q  296 aggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaag 395  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9089055 aggcattggatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaag 9088956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 399
Target Start/End: Original strand, 23412909 - 23413128
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||| || |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||    
T  23412909 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcatccaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgatta 23413008  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23413009 ttttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttttttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 23413108  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaa 399  Q
     |||||  ||||||||||||    
T  23413109 gtgtctctgctacaagacaa 23413128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 29138345 - 29138562
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |||  ||  ||||||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||| |||| |    
T  29138345 agttcatcaggagatgcaacttaaagtttcaaaagctgtttaacagattcaaaatcgtctaag-attgcagaagactggaaa-gtatagcaacaactatt 29138442  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  29138443 ttggaaggattagaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgtcatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttgt 29138542  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  29138543 gtctctgctacaagacaaga 29138562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 13533951 - 13533763
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  13533951 aagtgtacaaccactatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 13533853  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  13533852 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 13533763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 350 - 557
Target Start/End: Original strand, 20168188 - 20168393
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||    
T  20168188 tgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccctcaagataggaatgaattt 20168286  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctca 549  Q
    |||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  ||||||    
T  20168287 gaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaagatctca 20168385  T
Q  550 acgtctct 557  Q
    ||||||||    
T  20168386 acgtctct 20168393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 13523224 - 13523016
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  13523224 aagtgtacaaccactatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 13523126  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  13523125 tttgaagttgatctttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaagatc 13523027  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  13523026 tcaacgtctct 13523016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 14086249 - 14086418
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagc 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  || ||| |||||||||||  ||||    
T  14086249 attaaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagacaaaatttgatatcttaaaaaggccttcgaagaacaataaagagc 14086348  T
Q  101 aaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14086349 aaaggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtatgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 14086418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Original strand, 25930104 - 25930312
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  25930104 ttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaaaggattcaaactcgtctaaagattgcataagactggaaaagtataacaacggctaattt 25930203  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
              ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25930204 a---------gaaggcattggatgcttatttttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaattgtacaaccactatctctactactctgtttttgt 25930294  T
Q  384 ctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  25930295 ctctgctacaagacaaga 25930312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31118286 - 31118132
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaa 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||    
T  31118286 tggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaaggaatcaacaaa 31118187  T
Q  116 gaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
     ||||||||||||||||     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31118186 aaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactactcatgaagacaaagtgctcctgaa 31118132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 32160871 - 32160638
Alignment:
Q  277 ctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32160871 ctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagaacgtatgtacgaagtgtacgaccactacctccactactctg 32160772  T
Q  377 tttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacac 475  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||  ||| || | |  || |||||| |||||||  |||| ||||| || || |||     
T  32160771 tttatgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcccttagaataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacaa 32160673  T
Q  476 ccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  32160672 ccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 32160638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 35543247 - 35543455
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  35543247 aagtgtacaaccactacctcgacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagatatgaatgaa 35543345  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  35543346 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattacttgtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagatc 35543444  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  35543445 tcaacgtctct 35543455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 270 - 489
Target Start/End: Original strand, 11208011 - 11208229
Alignment:
Q  270 gcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccac 369  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||    | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11208011 gcaacgactattttgaagagatttgaatgcattggatgctcagccttcaaagagcgttgacaaagtactat-gtacgaagtgtataaccactacctccac 11208109  T
Q  370 tactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagt 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||  ||||| |||||||  | |||||||| ||     
T  11208110 tactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaaaataagaatggatttgaacttaattcttcatagg 11208208  T
Q  469 actacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  11208209 acaacatccaaatcaggcaaa 11208229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 205 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26765674 - 26765480
Alignment:
Q  205 aagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattgg 304  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || ||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26765674 aagcttcaaaagctgtttaacgattcaaat-tcgcctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacaactattttggaaggatttgaaggcattgg 26765576  T
Q  305 atgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  26765575 atgcttattcttcaaagagcgctgaaatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactgcctccactactctg-ttttgtctcagctacaagacaaga 26765480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 19536235 - 19536457
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaa-agtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||  | |||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||    
T  19536235 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaagggctgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccaaaaggagtgaagcaacgact 19536334  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
      |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  19536335 tttttgaatggatttgaaagcattggatgtttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacttagtt 19536434  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | |||||  ||||||||||||||    
T  19536435 tgtgtctctgctacaagacaaga 19536457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26784556 - 26784335
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||| ||||||||||||   | ||||||| ||| | |||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  26784556 agttcagcaggagatgcaagatttaaagctttaaaggctgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagagcagtgaagcaacgacta 26784457  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||| | | | ||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26784456 ttttgaaaggatttggaagaactggatgcttattctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagttt 26784357  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     ||| |  ||||||||||||||    
T  26784356 gtgtgtctgctacaagacaaga 26784335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 36095771 - 36095978
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| || |||||||||| ||||||||    
T  36095771 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaatt-gttccttcaagataggaatgaa 36095869  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| | |  |||    
T  36095870 tttgaagttaatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg-tctc-aacgaatctttagacgtgcttaagatc 36095967  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  36095968 tcaacgtctct 36095978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 36097228 - 36097435
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| || |||||||||| ||||||||    
T  36097228 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaatt-gttccttcaagataggaatgaa 36097326  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| | |  |||    
T  36097327 tttgaagttaatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg-tctc-aacgaatctttagacgtgcttaagatc 36097424  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  36097425 tcaacgtctct 36097435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 243 - 399
Target Start/End: Original strand, 21072238 - 21072394
Alignment:
Q  243 agcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattg 342  Q
    ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  21072238 agcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattg 21072337  T
Q  343 tacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  21072338 tacgaagtgtacaaccactatctctactactcagtttgtgtctctgctacaagacaa 21072394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 253 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28139736 - 28139588
Alignment:
Q  253 aagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgt 352  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  28139736 aagactgaaaaagtatagcaacgactattttgaaaggattgaaagacattggatgcttattcttcatagagcgttgacatagtatgtttgtacgaagtgt 28139637  T
Q  353 acaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28139636 acaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 28139588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42244136 - 42243969
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  42244136 aaaactgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtattggaagaacaataaagagcaaa 42244037  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||     |||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  42244036 gaaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtatgaagaaaacagctcctgaagataaagcgctcctgaa 42243969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5430285 - 5430140
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagct 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  5430285 taatatttgttcaagtgtacaggactatatacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaaggaatcaacaaaaaggaagct 5430186  T
Q  125 taaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5430185 taaagcgtccgaagaaaagtgctcctgaagacaaagtgcttctgaa 5430140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10848965 - 10848754
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||| ||||  |||||| || |||||||||||   ||| |  |||     
T  10848965 cagttcatcatgagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgcctaaaaattgcagaaaactggaaaagtatggcatcagctat 10848866  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||         |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10848865 tttgaaagg---------cattagatgcttattcttcaaagagcgttgacataatacgtttgtacaaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 10848775  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  10848774 tgtctctgctacaagacaaga 10848754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 385
Target Start/End: Original strand, 28464285 - 28464479
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||  ||||||  | ||||| |||     
T  28464285 cagttcatcaggagatacaacttaaagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactaaaaaagtataacaacggctat 28464383  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28464384 tttgaaagg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctctactactctgtttt 28464474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33023086 - 33022926
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  33023086 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaacttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatcgagagcaaa 33022987  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgct 159  Q
    | ||||||| || |||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  33022986 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaaacgtctgaaaaaaactgctcctgaagacaaagtgct 33022926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 431 - 565
Target Start/End: Original strand, 23696988 - 23697123
Alignment:
Q  431 tcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaa-gtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 529  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  23696988 tcaagatgggaaggaatttgaaggtttttctttaaaaggactccacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattcaaaacgactctt 23697087  T
Q  530 tagacgtgttgattatctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23697088 tagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcc 23697123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Original strand, 25096783 - 25096981
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||  || ||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  25096783 aaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaattacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgattaattcaaaaggatttgaagacattg 25096881  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttg---acaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||||||| | |||||||||||   | |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  25096882 gatgcttgttctttaaagagcgttgaaaaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgcaacaagacaag 25096980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Original strand, 25154753 - 25154951
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||  || ||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  25154753 aaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaattacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgattaattcaaaaggatttgaagacattg 25154851  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttg---acaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||||||| | |||||||||||   | |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  25154852 gatgcttgttctttaaagagcgttgaaaaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgcaacaagacaag 25154950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 401
Target Start/End: Original strand, 30115863 - 30115993
Alignment:
Q  271 caacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccact 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  30115863 caacgactattttgaaaggattgaagggcatttgatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaaatgtacaaccactatctccact 30115962  T
Q  371 actctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30115963 actctgtttttgtctctgctacaagacaaga 30115993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33933741 - 33933577
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  33933741 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatatgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagcaaa 33933642  T
Q  104 gaaatcaacgaagag-gaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcct 162  Q
    | ||||||| || || |||||||||| |||     |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33933641 ggaatcaacaaaaagagaagcttaaatcgtctgaagaaaactgctcctgaagaaaaagtgttcct 33933577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Original strand, 29138106 - 29138272
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||    
T  29138106 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactataaacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaagtaaagagcaa 29138205  T
Q  103 agaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctg 163  Q
    | | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29138206 atacatcaacaaaaatggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgttcctgaagacaaagtgctcctg 29138272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 1915457 - 1915311
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggga 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  1915457 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacaactctgcctgcagaa-atgttccttcaagatagga 1915359  T
Q  442 atgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    ||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  1915358 atggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 1915311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4887445 - 4887278
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  4887445 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttggtatcataaaaagatcttggaagaacaatagagagcaaa 4887346  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||||||     |||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  4887345 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgttcctaaagataaagtgctcctgaa 4887278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23881245 - 23881048
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcatt 302  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||  || | | |||||||||||    
T  23881245 aaagcttcaaaaggttgtttaatggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccaggagagtgaagcaacgactaattcaaatgaagttgaaggcatt 23881147  T
Q  303 ggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||| |  |  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||    
T  23881146 ggatgcttgctttttgaagagcgttgacaaagtgcaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaaga 23881048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Original strand, 35932059 - 35932161
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35932059 gcattggatgcttattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagac 35932158  T
Q  398 aag 400  Q
    |||    
T  35932159 aag 35932161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 23478409 - 23478241
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||  ||| |||||||||| ||    
T  23478409 gtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgtagaa-atgttccttcaagatagg 23478311  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||| |||||||  |||| ||||  || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  23478310 aatggatttgaatgtgatccttcttaggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 23478241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30743446 - 30743281
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaa 107  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  30743446 tgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaaattgtcatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaagaac 30743347  T
Q  108 tcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaaaa 167  Q
    ||| | || ||| |||||||||||||     ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  30743346 tcagcaaaaaggaaagcttaaagcgtctgaagaaaactactcctgaagataaagcgctcctgaaaa 30743281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 400
Target Start/End: Original strand, 35986177 - 35986387
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagga-tctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  35986177 cagttcatcaggagattgaacttaaagtttcaaaagatgtttcaaggactctaa-ctcgcctaaa-attgcagaagactggaaaagtgtggcaacgacta 35986274  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
     ||||||| |         |||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  35986275 ttttgaaatg---------cattggatgcctattcttcaaagagcgttgacatagtacgtctgtacaaaagtgtacaaccactacttccactactctgag 35986365  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  35986366 tttgtctctgctacaagacaag 35986387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Original strand, 20215213 - 20215360
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  20215213 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatagg 20215311  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  20215312 aatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 20215360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 347 - 426
Target Start/End: Original strand, 39362434 - 39362514
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39362434 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgt 39362514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 347 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 40228694 - 40228553
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  40228694 aagtgtacaaccactacctccatgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 40228596  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  40228595 tttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 40228553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 348 - 489
Target Start/End: Original strand, 40032869 - 40033009
Alignment:
Q  348 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||  ||| |||||||||| |||||| ||    
T  40032869 agtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcttgcagaa-atgttccttcaagataggaatggat 40032967  T
Q  448 ttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  40032968 ttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 40033009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 35931709 - 35931797
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  35931709 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtataggactatagacaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaa 35931797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15517411 - 15517242
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||  |||||    
T  15517411 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtatacatgactttagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttgaaagaacaaataaagagca 15517312  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15517311 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 15517242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28140012 - 28139843
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||  |||||    
T  28140012 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtattggaagaacaaataaagagca 28139913  T
Q  102 aagaaatcaacga-agaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| | |  ||||||||||||| |     |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28139912 aatacatcaacaacaagggaagcttaaagcatctgaagaaaactgctcctgaagataaactgctcctgaa 28139843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 375
Target Start/End: Original strand, 642754 - 642837
Alignment:
Q  292 ttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactct 375  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  642754 ttgaaggcattggatgcttgttttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactct 642837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 13405148 - 13405010
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||  |||||| ||||    
T  13405148 tgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagaaaggaatggattt 13405050  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||  |||| |||||  | || ||| ||||||||||||||    
T  13405049 gaacttgatccttcattggacaacatccaaatcaggcaaa 13405010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 562
Target Start/End: Original strand, 25111911 - 25112195
Alignment:
Q  270 gcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccac 369  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  |||| |||||||| || | | |||||| |||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||    
T  25111911 gcaacgattcatttgaaaggaatataaggtattggatgtttatccttcaaagggcgttgacaaagtacga--------agtgtacgaccactacctccac 25112002  T
Q  370 tactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagt 468  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||  |||| ||||| |      
T  25112003 tactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataag 25112101  T
Q  469 actacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttca-aacgactctttagacgtg-ttgattatctcaacgtctctttcac 562  Q
    || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||  | ||||| ||||||||||| |||||| || |  ||||||||| |||||||||    
T  25112102 acaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgactctttcac 25112195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 562
Target Start/End: Original strand, 25171002 - 25171286
Alignment:
Q  270 gcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccac 369  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  |||| |||||||| || | | |||||| |||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||    
T  25171002 gcaacgattcatttgaaaggaatataaggtattggatgtttatccttcaaagggcgttgacaaagtacga--------agtgtacgaccactacctccac 25171093  T
Q  370 tactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagt 468  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||  |||| ||||| |      
T  25171094 tactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataag 25171192  T
Q  469 actacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttca-aacgactctttagacgtg-ttgattatctcaacgtctctttcac 562  Q
    || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||  | ||||| ||||||||||| |||||| || |  ||||||||| |||||||||    
T  25171193 acaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgactctttcac 25171286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21660296 - 21660194
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  21660296 gcattggatgcttagtcctcaaagatcgttgacatagtatgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagac 21660197  T
Q  398 aag 400  Q
    |||    
T  21660196 aag 21660194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 3245136 - 3245289
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||    
T  3245136 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagcgtacaagactataggcaaaaatttgacatcttaaaatggtcttggaagaacaaataaagagca 3245235  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  3245236 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 3245289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6499329 - 6499220
Alignment:
Q  292 ttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgcta 391  Q
    |||||||||| ||||||||| |  |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||    
T  6499329 ttgaaggcatcggatgcttgctttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgcta 6499230  T
Q  392 caagacaaga 401  Q
    || |||||||    
T  6499229 caggacaaga 6499220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 264 - 401
Target Start/End: Original strand, 9398753 - 9398890
Alignment:
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||| ||||||||||||||  || | | |||||||||||| ||||||  |  |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||     
T  9398753 agtggagcaacgactaattcaaatgaagttgaaggcattgaatgcttactttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtataaccactat 9398852  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  9398853 ctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 9398890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 385
Target Start/End: Original strand, 21198964 - 21199143
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||| || ||| | | |||| |||||  ||||| ||| |||||| ||||||  || | ||||||||||||||    
T  21198964 aaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcacgccta-gtactgcagaagaccagaaaaatga-gcaacggctaattcaaatgaatttgaaggcattg 21199061  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    |||||| |||| |   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21199062 gatgctcgttctttggaaagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaatcactacctccactactcagtttgtgtct 21199143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 28464043 - 28464132
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  28464043 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagacaaaaatttgacatcctaaaatggtcttggaagaacaa 28464132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Original strand, 23391656 - 23391760
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaaga 396  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  23391656 gcattggatgcttattcctcaaggagcgttgacatagttcgtttgtacgaagtgtacaatcactatctgcactactctgttttttgtctctgctacaaga 23391755  T
Q  397 caaga 401  Q
    |||||    
T  23391756 caaga 23391760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11994352 - 11994186
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||||   |||||||    
T  11994352 aaaattgtcaattggatatgctaatagttgttcaagcgtacaggactatagac-aaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaattaagagcaaa 11994254  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | ||||||||||||| |     |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  11994253 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcatctgaagaaaactgctcctgaagttaaagcgctcctgaa 11994186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 25929875 - 25929946
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaa 74  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25929875 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaa 25929946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 319 - 401
Target Start/End: Original strand, 12352869 - 12352951
Alignment:
Q  319 aagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  12352869 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaggacaaga 12352951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21660662 - 21660577
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaa 89  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  21660662 aaaattgtcaattggatacgctaatattttttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaattagtcttgaaagaa 21660577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 347 - 408
Target Start/End: Original strand, 23392837 - 23392897
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagc 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23392837 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagc 23392897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 400
Target Start/End: Original strand, 21099723 - 21099859
Alignment:
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    ||||||||||| |||||||  || | |  |||||||||||||||||||    |  |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21099723 agtgaagcaacaactaattcaaatgaagctgaaggcattggatgcttgccttttgaagaacgtttacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactac 21099822  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||    
T  21099823 ctccactactcagtttgtgtctctgctacaggacaag 21099859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 35985934 - 35986022
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  35985934 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacagggctatagacaaagtttgacatcttaaattggtcctgaaagaacaa 35986022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10849187 - 10849037
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa--tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagcaaagaaatcaacgaagagg-a 120  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  | |||||| || ||| |    
T  10849187 taatatttgttcaagtgtgcaggactatagacaaaaaatttgacatcttaaattggtcttggaagaacaaataaagagcaagtacatcaacaaaaaggga 10849088  T
Q  121 agcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||||||     ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  10849087 agcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtctgaagtgctcctgaa 10849037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 7745361 - 7745490
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| |||||||| |||  || |||||||| || ||||||    
T  7745361 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacagaaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctgaaagaacaaaagagagcaa 7745460  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    |   |||||| || ||||||||| ||||||    
T  7745461 atggatcaacaaaaaggaagcttgaagcgt 7745490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 23389161 - 23389249
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  23389161 aaaattgtcaattggatacgctaatatttcttcaagtgtacaggattatagacaatatttgacatcttaaattggtcctgaaagaacaa 23389249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 32161236 - 32161148
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| || || ||||||||    
T  32161236 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaatatttgacatcttaacttgatcctgaaagaacaa 32161148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Original strand, 6512163 - 6512224
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttga 65  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6512163 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaatttga 6512224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20551301 - 20551192
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  20551301 aaaattgtcaattgcatatgctaatatttgttcaagtgtagaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaa 20551202  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
     | |||||||    
T  20551201 tggaatcaac 20551192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26784779 - 26784651
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattgg-tcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||  || | | | || |||| ||||||||| || ||||||    
T  26784779 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtataggaccatagacaaaacttgatatcattattaggctctt-gaagaacaaaagagagcaa 26784681  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||    
T  26784680 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgt 26784651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5430102 - 5429991
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatg-tttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaa 262  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||  ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| ||    
T  5430102 aaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgcaacttaaggcttcaaaagctgttttatgggattcaacctcgtttaaggattgcagaagactgaaa 5430003  T
Q  263 aagtgaagcaac 274  Q
    ||||||||||||    
T  5430002 aagtgaagcaac 5429991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 23412705 - 23412832
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  ||||||| ||| || ||||||    
T  23412705 aaaattgtcaattggatttgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagagcaaaagagagcaa 23412804  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
     | ||||||| || ||||||||| ||||    
T  23412805 tggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 23412832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Original strand, 21071967 - 21072084
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  || |||||||| |  |||| ||| ||||||| |    
T  21071967 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctgaaagaacaaaaaagagctaaggaatcaacaa 21072066  T
Q  115 agaggaagcttaaagcgt 132  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  21072067 aaaggaagcttgaagcgt 21072084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26759555 - 26759452
Alignment:
Q  68 tcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcc 161  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26759555 tcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagcaaatacatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcc 26759456  T
Q  162 tgaa 165  Q
    ||||    
T  26759455 tgaa 26759452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 89151 - 89273
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||  |||| | | |||  ||||||||||| || |||| |    
T  89151 aaaattgtcaattggatatgctaatatttattcaagtgcacaggaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagaacaaaagagagcta 89250  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagctt 125  Q
    || ||||||| || |||||||||    
T  89251 aggaatcaacaaaaaggaagctt 89273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23590168 - 23590114
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaa 58  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  23590168 aaaagtgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaa 23590114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 388
Target Start/End: Original strand, 31815283 - 31815325
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacg 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31815283 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacg 31815325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17815406 - 17815281
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||   || | | | |||  ||||||||||| || ||| ||    
T  17815406 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaaatttggaatcattattaggttctggaagaacaaaagagagtaa 17815307  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaa 128  Q
    || ||||||| || ||||||||||||    
T  17815306 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaa 17815281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 30115812 - 30115853
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgttt 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30115812 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgttt 30115853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21910966 - 21910910
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  21910966 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggatcatagacaaaa 21910910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 40229109 - 40229001
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || |    || ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  40229109 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagac-aaagttaatcaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaa 40229011  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    || |||||||    
T  40229010 aggaatcaac 40229001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 19535999 - 19536055
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  19535999 aaaattgtcaattggataggctaatatttgttcaagtatacaggaccatagacaaaa 19536055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Original strand, 20214803 - 20214859
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa 59  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20214803 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaa 20214859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 109
Target Start/End: Original strand, 20416696 - 20416732
Alignment:
Q  73 aattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20416696 aattggttttggaagaacaatagagagcaaagaaatc 20416732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 40
Target Start/End: Original strand, 21198751 - 21198787
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagt 40  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21198751 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagt 21198787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26251511 - 26251455
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  26251511 aaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgcgcaggaccatagacaaaa 26251455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 184)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 27814951 - 27815167
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27814951 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttatgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatga 27815050  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27815051 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 27815150  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  27815151 ctcaacgtctctttcac 27815167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 48371385 - 48371166
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  48371385 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcataatttgtaccttcaagatgggaatga 48371286  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48371285 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 48371186  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48371185 ctcaacgtctctttcacgcc 48371166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 10909661 - 10909443
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909661 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 10909562  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10909561 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 10909462  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10909461 tcaacgtctctttcacgcc 10909443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 18077912 - 18078130
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18077912 aagtgtacaaccactacctccactcctctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 18078011  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18078012 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 18078111  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18078112 tcaacgtctctttcacgcc 18078130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 25657388 - 25657171
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657388 aagtgtacaaccactacctccactactctgcttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 25657290  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25657289 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 25657190  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25657189 tcaacgtctctttcacgcc 25657171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 40470594 - 40470811
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40470594 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaa 40470692  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40470693 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 40470792  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40470793 tcaacgtctctttcacgcc 40470811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 52704042 - 52703823
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52704042 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 52703943  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52703942 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 52703843  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52703842 ctcaacgtctctttcacgcc 52703823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 40454355 - 40454572
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40454355 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaa 40454453  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40454454 tttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 40454553  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40454554 tcaacgtctctttcacgcc 40454572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 450830 - 450611
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  450830 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 450731  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  450730 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 450631  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  450630 ctcaacgtctctttcacgcc 450611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 461411 - 461192
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  461411 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 461312  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  461311 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 461212  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  461211 ctcaacgtctctttcacgcc 461192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5022988 - 5022774
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5022988 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcctttaagatgggaatgaa 5022890  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5022889 tttggagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 5022790  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  5022789 tcaacgtctctttcac 5022774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 14843659 - 14843878
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  14843659 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 14843758  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14843759 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 14843858  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14843859 ctcaacgtctctttcacgcc 14843878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 16266716 - 16266497
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  16266716 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 16266617  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16266616 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 16266517  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16266516 ctcaacgtctctttcacgcc 16266497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 17918306 - 17918087
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  17918306 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 17918207  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17918206 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 17918107  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17918106 ctcaacgtctctttcacgcc 17918087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 17928954 - 17928735
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  17928954 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 17928855  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17928854 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 17928755  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17928754 ctcaacgtctctttcacgcc 17928735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 18752497 - 18752711
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752497 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaaggcaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 18752595  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18752596 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaatggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 18752695  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  18752696 tcaacgtctctttcac 18752711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 22007265 - 22007046
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22007265 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 22007166  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22007165 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 22007066  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22007065 ctcaacgtctctttcacgcc 22007046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 30937078 - 30937297
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  30937078 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 30937177  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30937178 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 30937277  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30937278 ctcaacgtctctttcacgcc 30937297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 10751174 - 10751390
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  10751174 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 10751273  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10751274 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 10751373  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  10751374 ctcaacgtctctttcac 10751390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 10964943 - 10965159
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  10964943 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 10965042  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10965043 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 10965142  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  10965143 ctcaacgtctctttcac 10965159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 15561085 - 15561304
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  15561085 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 15561184  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15561185 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 15561284  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15561285 ctcaacgtctctttcacgcc 15561304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 18763107 - 18763321
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763107 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaaggcaacagttatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 18763205  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18763206 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaatggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 18763305  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  18763306 tcaacgtctctttcac 18763321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 19944333 - 19944552
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19944333 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctataagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 19944432  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19944433 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaatgactctttagacgtgctgattat 19944532  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19944533 ctcaacgtctctttcacgcc 19944552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 21996667 - 21996448
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  21996667 aagtgtacaaccactacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 21996568  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21996567 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 21996468  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21996467 ctcaacgtctctttcacgcc 21996448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 24028091 - 24028310
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  24028091 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 24028190  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24028191 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggattatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 24028290  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24028291 ctcaacgtctctttcacgcc 24028310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 30926500 - 30926719
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  30926500 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 30926599  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30926600 atttaaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 30926699  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30926700 ctcaacgtctctttcacgcc 30926719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 49518389 - 49518170
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  49518389 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 49518290  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49518289 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 49518190  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  49518189 ctcaacgtctctttcacgcc 49518170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 55745258 - 55745477
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  55745258 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 55745357  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  55745358 atttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgattat 55745457  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55745458 ctcaacgtctctttcacgcc 55745477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 55755869 - 55756088
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  55755869 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 55755968  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  55755969 atttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgattat 55756068  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55756069 ctcaacgtctctttcacgcc 55756088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4987526 - 4987309
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4987526 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 4987427  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||  ||    
T  4987426 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctc 4987328  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4987327 tcaacgtctctttcacgcc 4987309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 10740600 - 10740816
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  10740600 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 10740699  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10740700 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 10740799  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  10740800 ctcaacgtctctttcac 10740816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 10954369 - 10954585
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  10954369 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 10954468  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10954469 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 10954568  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  10954569 ctcaacgtctctttcac 10954585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 18130245 - 18130461
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  18130245 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 18130344  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18130345 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 18130444  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  18130445 ctcaacgtctctttcac 18130461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 36018590 - 36018374
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  36018590 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 36018491  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36018490 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 36018391  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  36018390 ctcaacgtctctttcac 36018374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 36029143 - 36028927
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  36029143 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 36029044  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36029043 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 36028944  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  36028943 ctcaacgtctctttcac 36028927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 16256123 - 16255904
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  16256123 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaacttgtacactcaagatgggaatga 16256024  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16256023 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttaaacgtgctgattat 16255924  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16255923 ctcaacgtctctttcacgcc 16255904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 19954968 - 19955187
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  19954968 aagtgtacaaccactacctccactactcttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgagaatga 19955067  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19955068 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaaccaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 19955167  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19955168 ctcaacgtctctttcacgcc 19955187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4948589 - 4948370
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  4948589 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatatgtacactcaagatgggaatga 4948490  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4948489 atttgaagcttattcttcaaatgaccacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 4948390  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4948389 ctcaacgtctctttcacgcc 4948370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 47152086 - 47152302
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47152086 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctacgctacaagacaagacaacaaccatgcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 47152184  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  47152185 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 47152283  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47152284 tcaacgtctctttcacgcc 47152302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24640502 - 24640285
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  24640502 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 24640403  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24640402 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 24640303  T
Q  545 tctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24640302 tctcaacgtctctttcac 24640285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 10695892 - 10695676
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  10695892 aagtgtacaaccactacctccactaccctgtttttttctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatt-gttccttcgagatgggaatgaa 10695794  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  10695793 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 10695695  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10695694 tcaacgtctctttcacgcc 10695676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27656855 - 27656638
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  27656855 aagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 27656756  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27656755 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 27656656  T
Q  545 tctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27656655 tctcaacgtctctttcac 27656638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27667428 - 27667211
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  27667428 aagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 27667329  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27667328 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 27667229  T
Q  545 tctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27667228 tctcaacgtctctttcac 27667211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 14836110 - 14836326
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14836110 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 14836208  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  14836209 tttaaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 14836307  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14836308 tcaacgtctctttcacgcc 14836326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10693049 - 10692830
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10693049 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactatt 10692950  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10692949 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgtttacaaagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 10692850  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  10692849 gtctctgctacaagacaaga 10692830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10906815 - 10906596
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10906815 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactatt 10906716  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906715 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgtttacaaagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 10906616  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  10906615 gtctctgctacaagacaaga 10906596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 11536098 - 11535885
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  11536098 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 11536000  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  11535999 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 11535901  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  11535900 tcaacgtctctttcac 11535885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 3370968 - 3370751
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3370968 aagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 3370869  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||| | ||  ||    
T  3370868 tttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgggtgatcaaagaaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctc 3370770  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3370769 tcaacgtctctttcacgcc 3370751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 15207420 - 15207635
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15207420 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 15207517  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  15207518 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 15207616  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15207617 tcaacgtctctttcacgcc 15207635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 19581493 - 19581277
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  19581493 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 19581395  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |  | |||    
T  19581394 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctattcatc 19581296  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19581295 tcaacgtctctttcacgcc 19581277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19884901 - 19884681
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19884901 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttcat-ggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgacta 19884803  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19884802 gtttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactaatctgttt 19884703  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  19884702 ttgtctctgctacaagacaaga 19884681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 413221 - 412980
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  413221 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagattcaacttaaagcttcaaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgcagaagactcg 413122  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  413121 aaaagtgaagcaacggctaatttgaaaggatttgaaggcattgaatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacgaagtgtacaaccac 413022  T
Q  361 tacctccactactctgtt-tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  413021 tgcctccactactctgttctttgtctttgctacaaaacaaga 412980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 22675432 - 22675653
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  22675432 cagttcattaggagatgcaacataaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaaaagtgaagcaacgactag 22675531  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttt 379  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22675532 tttgaaaggatttgaaggcatttgatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactcagtttt 22675631  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  22675632 ttgtctctgctacaagacaaga 22675653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 346 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 11515289 - 11515075
Alignment:
Q  346 aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  11515289 aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgagaatga 11515191  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  ||    
T  11515190 atttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaat 11515092  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  11515091 ctcaacgtctctttcac 11515075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10300787 - 10300574
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  10300787 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 10300689  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  10300688 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 10300590  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  10300589 tcaacgtctctttcac 10300574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 16317583 - 16317366
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  16317583 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatga 16317485  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || ||    
T  16317484 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaaatc-aacgactctttagacgtgctaatcat 16317386  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16317385 ctcaacgtctctttcacgcc 16317366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24713683 - 24713471
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  24713683 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc-acgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 24713586  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  24713585 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 24713487  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  24713486 tcaacgtctctttcac 24713471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 3390708 - 3390491
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3390708 aagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcatgcagaatttatgccttcaagatgggaatgaa 3390609  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||| | ||  ||    
T  3390608 tttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgggtgatcaaagaaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctc 3390510  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3390509 tcaacgtctctttcacgcc 3390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5873622 - 5873409
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  5873622 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 5873524  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  5873523 attgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatccaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 5873425  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||| ||||||    
T  5873424 tcaacgtctttttcac 5873409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 16305359 - 16305142
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  16305359 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacaaccatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgagaatga 16305261  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || ||    
T  16305260 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaaatc-aacgactctttagacgtgctaatcat 16305162  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16305161 ctcaacgtctctttcacgcc 16305142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 37435446 - 37435667
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37435446 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtccaagcattgcagaagattggaagagtgaagcaacgacta 37435545  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37435546 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacatagtactattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactttgttt 37435645  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  |||| |||||||||    
T  37435646 ttgtctctgctataagacaaga 37435667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Original strand, 13576006 - 13576246
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13576006 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgcaacataaagcttcaaagcctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgg 13576105  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  13576106 aagagtgaagcaacgcctagtttgaaaggatttgaaggcattagatgcttgttcttcaaagagcgttgacatagtacaactgtacgaagtgtaaaaccac 13576205  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13576206 tacatccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaaga 13576246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 54680147 - 54679929
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || || || |||||||||  |||||| ||||||||    
T  54680147 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaatgg-tcaaa-ctcgtctaatgattgcagaagactgg 54680050  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  54680049 aaaagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcattgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccac 54679950  T
Q  361 tacctccactactctgttttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  54679949 tacctccactactctgttttt 54679929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 193 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29121557 - 29121344
Alignment:
Q  193 agatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatt 292  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29121557 agatgcaacttaaggcttcaaaagctgtttaatggattcaacctcgtctaaagattgcagaagactgaaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatt 29121458  T
Q  293 tgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctac 392  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  29121457 tgaaggcactggatgcttgttctttaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgttac 29121358  T
Q  393 aagacaagacaaca 406  Q
    ||||||||| ||||    
T  29121357 aagacaagaaaaca 29121344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 31266804 - 31267018
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  31266804 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 31266902  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg-ttgattat 545  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| |  |  ||    
T  31266903 tttgaagttgatttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagaaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaaat 31267001  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  31267002 ctcaacgtctctttcac 31267018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 161 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17247462 - 17247243
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  17247462 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgaatcttaaagcttcaaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgcagaagattgg 17247363  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17247362 aaa-gtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattgaatgtttgttcttcaaagaacattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccac 17247264  T
Q  361 tacctccactactctgttttt 381  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  17247263 tgcctccactactctgttttt 17247243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 49001985 - 49002193
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  49001985 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 49002083  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  49002084 tttgaagttaatccttcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 49002182  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  49002183 tcaacgtctct 49002193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 55651577 - 55651369
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  55651577 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 55651479  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  55651478 tttgaatttgatccttcataggactacacccaaatcagtcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 55651380  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  55651379 tcaacgtctct 55651369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6517683 - 6517464
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  6517683 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttatttaaaggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactatt 6517584  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| ||||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6517583 ttggaaggattggaaagcatgagatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttttt 6517484  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  6517483 gtctctgctacaagacaaga 6517464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16632645 - 16632419
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16632645 gctaaagttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtataagcattgcagaagactggaagagtgaatcaac 16632546  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16632545 gactattttgaaaagatttgaaggcattggattcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccaccaatc 16632446  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||| |||||  ||||||||||||||    
T  16632445 agtttgtgtctctgctacaagacaaga 16632419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 177 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3395795 - 3395570
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||| || ||||  ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  3395795 gctatagttcatcaggagatgcaagacttaaatcttcaaaagttgttcaatggattaaatatcgtctaagcattgcagaaaactgaaaaagtgaagcaac 3395696  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3395695 gactattttgaaaggatttgaaagcattggatgctagttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 3395596  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||| |||||  |||||||||||||    
T  3395595 agtttgtgtctctgctacaagacaag 3395570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10073134 - 10072914
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| |  |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  10073134 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcat-ggatttaatctcgtttaagcatagcagaagactggaaaagtgaagcaactgcta 10073036  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10073035 gtttgaaaggatttgaaggcattggaggcttgttattcaaagagcgttgacaaagtacaaatgtacgaagtgtacaaccactatctccactactatgttt 10072936  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  |||| |||||||||    
T  10072935 ttgtctctgctataagacaaga 10072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 232 - 401
Target Start/End: Original strand, 14604869 - 14605039
Alignment:
Q  232 aatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaa-ggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgac 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  14604869 aatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacaactatttttaaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgac 14604968  T
Q  331 aaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14604969 aaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaaga 14605039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 45833594 - 45833373
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  |||    
T  45833594 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagttaagcaacttcta 45833495  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45833494 ttttgaaagtatttgaatgcattggatgctttttcttttaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 45833395  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | ||||  ||||||| ||||||    
T  45833394 tggtctctgctacaaaacaaga 45833373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 400
Target Start/End: Original strand, 37985525 - 37985743
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  37985525 ttcatcatgagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcatctaagcatcgcagaagactgaaaaagtgaagcaacaactatt 37985624  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  37985625 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgt 37985724  T
Q  382 gtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||  |||||| ||||||    
T  37985725 gtctctgctacaggacaag 37985743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 194 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8105825 - 8105617
Alignment:
Q  194 gatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagg-atctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatt 292  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||  ||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8105825 gatgcaacttaaggcttcaaaagttgtttaatgggattcaacttcgtctaaggattgcagaagactggaaaattgaagcaacggctattttgaaaggatt 8105726  T
Q  293 tgaaggcattggatgcttgttcctc-aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgcta 391  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  8105725 tgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaaatgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgcta 8105627  T
Q  392 caagacaaga 401  Q
    ||||| ||||    
T  8105626 caagataaga 8105617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 182 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3483921 - 3483738
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||| | |||||||||  || ||||||||||||  | || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3483921 agttcattaagagatgcaagacttaaagcttcaaaaactattcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgacta 3483822  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||    
T  3483821 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagcgcacaaccactac 3483738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 187 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19666567 - 19666352
Alignment:
Q  187 atcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttg 284  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||| | | || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19666567 atcaggagatgcaagacttaaagcttgaaaggttattcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttg 19666468  T
Q  285 aaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 384  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  19666467 aaaggatttgaaagcattgaatacttgttctttgaagagagttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtc 19666368  T
Q  385 tacgctacaagacaag 400  Q
    |  |||||||||||||    
T  19666367 tctgctacaagacaag 19666352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 12811089 - 12811306
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||| |||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| || | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  12811089 agttcattaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttagtttcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacgacta 12811188  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12811189 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgt---tctaatagcgttgacaaagtaaaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 12811285  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  12811286 gtgtctctgctacaagacaag 12811306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 400
Target Start/End: Original strand, 29680462 - 29680675
Alignment:
Q  189 caggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaa 286  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||| | |||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29680462 caggagatgcaagacttaaagctccaaaggttgttcaatggatttaatcttgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaa 29680561  T
Q  287 aggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 386  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||||| || | |||||     
T  29680562 aggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaatcattatctccactactcagtatgtgtctc 29680661  T
Q  387 cgctacaagacaag 400  Q
     |||||||||||||    
T  29680662 tgctacaagacaag 29680675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 19620972 - 19621192
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||| | |||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  19620972 agttcatcaggagatgcaagagttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagagaagtgaagcaacgacta 19621071  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  19621072 ttttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctatgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactattcagttt 19621171  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  19621172 gtgtctctgctacaagacaag 19621192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 232 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9141060 - 9140892
Alignment:
Q  232 aatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgaca 331  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  9141060 aatctcgtctaagcattgtagaagactggaaaagtaaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgaca 9140961  T
Q  332 aagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||  |||| ||||||||    
T  9140960 tagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatcttcactactcagtttgtgtctctgctataagacaag 9140892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 418
Target Start/End: Original strand, 14904267 - 14904506
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactc--aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  14904267 agttcatcaggagatgcaagacctaaagcttcaaaagctattcaaaggatttaatctcgtctaggcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgtcca 14904366  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||| || |||||| |||| ||||    
T  14904367 ttttgaaaggatttgaagacattggatgcttattctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtaaacaaccattatctccaccactcagttt 14904466  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaa-gacaacagccttgcctgca 418  Q
     |||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  14904467 gtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgca 14904506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 181 - 400
Target Start/End: Original strand, 3105332 - 3105550
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||    ||||| |||     
T  3105332 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtattccaacggctat 3105430  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||  || | |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3105431 tttgaaaggattgaaaagtattggatggttattcttcaaagagcgttgacatagtatgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 3105530  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||  |||||||| ||||    
T  3105531 tgtctctgctacaaggcaag 3105550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12601277 - 12601102
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||| ||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12601277 aaagcgtcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagacttgaatagtgaatcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattg 12601178  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12601177 gatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 12601102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 400
Target Start/End: Original strand, 17398598 - 17398805
Alignment:
Q  183 gttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||| ||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  17398598 gttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgcctaaa-attgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattt 17398696  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 382  Q
    |||||||         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17398697 tgaaagg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactaactccactactctgtttttg 17398787  T
Q  383 tctacgctacaagacaag 400  Q
    |||  |||||||||||||    
T  17398788 tctctgctacaagacaag 17398805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 19911791 - 19912013
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| | |||| ||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  19911791 agttcatcaggagatgcaagacttaaagctttaaaggttgttcaatagattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagagcagtgaagcaacgacta 19911890  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctc-aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19911891 ttttgaaaggatttgaaagcattggatgcttattctttgaaagagcgttgacatagtataattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactcagtt 19911990  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | || ||  ||||||||||||||    
T  19911991 tgtgcctctgctacaagacaaga 19912013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 56034774 - 56034580
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||   |||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  56034774 agttcatcagaagatgcaagacttaaagcttcaaagactgttcaatggatttaatctcgtccaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgacta 56034675  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
     |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  56034674 ttttgaaataatttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtctaaaatgtacaactactatctccactactc 56034580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 13575820 - 13575986
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13575820 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacataaccatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagcaaa 13575919  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
      ||||||| || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13575920 tgaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 13575986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23509370 - 23509162
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  23509370 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 23509272  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| | |  |||    
T  23509271 tttgaagttaatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtgctaaaaatc 23509173  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  23509172 tcaacgtctct 23509162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 401
Target Start/End: Original strand, 25651046 - 25651235
Alignment:
Q  211 caaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgctt 310  Q
    |||||| ||||||| ||||  || || ||||||  || ||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25651046 caaaagttgtttaacggattcaaacttgtctaaagatcgcagaagacttgaaaagtgaagcaacggctattttggaaggatttgaaggcattgaatgctt 25651145  T
Q  311 gttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  25651146 attcttcaaagagcgttgacgtagtacgtttgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 25651235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 235 - 399
Target Start/End: Original strand, 56533027 - 56533191
Alignment:
Q  235 ctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaa-gagcgttgacaaa 333  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  56533027 ctcgtctaaggattgcagaagactgaaaaaatgaagcaacggctattttgaaaggatttgaatgcattagatgtttgttcctcaaaagagcgttgacaaa 56533126  T
Q  334 gtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  56533127 gtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaa 56533191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 55732230 - 55732064
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  55732230 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 55732131  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  55732130 gaaatcaacaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 55732064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 277 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16853606 - 16853482
Alignment:
Q  277 ctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16853606 ctaatttgaagggatttgaaagcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacatctgtatgaagtgtacaaccactacctccactactctg 16853507  T
Q  377 tttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  16853506 tttttgtctctgctacaagacaaga 16853482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 18007087 - 18007296
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  18007087 aagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgca-aaaatgttccttcaagataggaatgga 18007185  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg-ttgattat 545  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |  ||    
T  18007186 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtgcttaaagat 18007284  T
Q  546 ctcaacgtctct 557  Q
    ||||||||||||    
T  18007285 ctcaacgtctct 18007296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 350 - 557
Target Start/End: Original strand, 18774686 - 18774891
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||    
T  18774686 tgtacaaccactatctccacgaccctaagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcataatt-gttccttcaagataggaatgaattt 18774784  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctca 549  Q
    |||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  ||||||    
T  18774785 gaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaagatctca 18774883  T
Q  550 acgtctct 557  Q
    ||||||||    
T  18774884 acgtctct 18774891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 55380490 - 55380271
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaaga-tgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||  |||| || |||| |||||  | |||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||    
T  55380490 agttcattaggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggctgttcaatggatttaatcatgcctaa-cattgcagaagaccagaagagtgaagcaacaact 55380392  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  55380391 attttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtt 55380292  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    | |||||  ||||||||||||    
T  55380291 tgtgtctctgctacaagacaa 55380271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 8997284 - 8997492
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||   ||||||||||| | || |||||||||  ||||||||    
T  8997284 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtatgtcctcgctacaagacaagataacagttctgcctgcagaagt-gttccttcaagacaggaatgaa 8997382  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| | |  |||    
T  8997383 tttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtgctaaaaatc 8997481  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  8997482 tcaacgtctct 8997492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 33378488 - 33378279
Alignment:
Q  295 aaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaa 394  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378488 aaggcattggatgcttgtccttcaaagagagttgacaaagtac--------aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaa 33378397  T
Q  395 gacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggat 493  Q
    |||||| | |||||   | |||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||    
T  33378396 gacaagaaaaacagttctacctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgattcttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagat 33378298  T
Q  494 tactggtggatgatcaaag 512  Q
     | |||||  |||||||||    
T  33378297 cattggtgattgatcaaag 33378279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14833594 - 14833449
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14833594 ttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttcaatagattcaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactatt 14833495  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgtt 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  14833494 ttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgtt 14833449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 235 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16940160 - 16939995
Alignment:
Q  235 ctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaag 334  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||    
T  16940160 ctcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttgaaaggattgaaaggcattgaatgcttattcttcaaggagcgttgacatag 16940062  T
Q  335 tacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    |||||||||||||    
T  16940061 tacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactgctatgtttttgtccctactacaagacaaga 16939995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 54680333 - 54680167
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  54680333 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggattatagacaaaatttgtcatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 54680234  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54680233 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaattgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 54680167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 347 - 539
Target Start/End: Original strand, 16819380 - 16819570
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||    
T  16819380 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtccttgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcccacaagataggaatgaa 16819478  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgtt 539  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  16819479 tttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtgtt 16819570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29121810 - 29121643
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  29121810 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtataggactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 29121711  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | ||||||||||| |||     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29121710 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaaacgtctgaagaaaactgcacctgaagacaaagtgctcttgaa 29121643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3793526 - 3793376
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  3793526 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 3793427  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    | ||||||| || || |||||||||| ||     |||||||||||||||||    
T  3793426 ggaatcaacaaaaagaaagcttaaagtgtctgaagaaaactgctcctgaag 3793376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 264 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6641800 - 6641679
Alignment:
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6641800 agtgaaacaacggctaattcaaaaggatttgaaggcatttgatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactac 6641701  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtct 385  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6641700 ctccactactctgtttatgtct 6641679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 22675223 - 22675392
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagc 100  Q
    ||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  22675223 attaaaattgacaattggatatgctaatatttgttcaagtgtataggaccatagacaaaatttgacatcttaaagaggtcttggaagaacaatagagagc 22675322  T
Q  101 aaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||| ||||||| ||   ||| ||||||||||     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22675323 aaaggaatcaacaaaattgaatcttaaagcgtctgaagaaaacttctcctaaagacaaagtgctcctgaa 22675392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3498069 - 3497941
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  3498069 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaatttgacatcttaaaaaggttttggaagaacaatatagagcaaa 3497970  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  3497969 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgt 3497941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19885127 - 19884957
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19885127 aaaattgtcaattggattttctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatcttaaaatggtcttggaagaataatagagagcaa 19885028  T
Q  103 agaaatcaacgaa--gaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaaa 166  Q
     | ||||||| ||   ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19885027 tggaatcaacaaaccaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcttgaaa 19884957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 55731978 - 55731836
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||||||||||||| | || || |||||||||     
T  55731978 cagttcatcaggagatgcaacttaaaacttcaaaagttgtttaatggattcaaactcgtctaacaattgcaaaagactggagaggtaaatcaacgactat 55731879  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagc 324  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  55731878 tttgaaaggatttgaagg-attggatgcttattcttcaaagagc 55731836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40860861 - 40860647
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatcta-atctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacg 275  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||| |||   |||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  40860861 gctacagttcatcaggagatggaacttaaagtttcaaaagttgtttcaagga-ctataactcgcctagaaattgcagaagactggaaaagtatggcaatg 40860763  T
Q  276 actaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactct 375  Q
     ||||||||||| |         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  40860762 gctaatttgaaatg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtatgatgtgtacaaccactacttccactactct 40860672  T
Q  376 gtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  40860671 gtttttgtctctgctacaagacaag 40860647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 270 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1672499 - 1672368
Alignment:
Q  270 gcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccac 369  Q
    |||||| |||||||||||||| || || || |||| || || | | ||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1672499 gcaacggctaatttgaaaggacttaaaagctttgggtgtttatccttcaaagaacgttgacaaaatacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccac 1672400  T
Q  370 tactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1672399 tactctgttcttgtctacgctacaaaacaaga 1672368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 270 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1674974 - 1674843
Alignment:
Q  270 gcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccac 369  Q
    |||||| |||||||||||||| || || || |||| || || | | ||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1674974 gcaacggctaatttgaaaggacttaaaagctttgggtgtttatccttcaaagaacgttgacaaaatacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccac 1674875  T
Q  370 tactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1674874 tactctgttcttgtctacgctacaaaacaaga 1674843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40846236 - 40846078
Alignment:
Q  243 agcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattg 342  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||  || | | ||||| |||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  40846236 agcattgcagaagaccaggaaagtgaagcaacgactaattcaaatgaagttgaaagcattggatgcttgctttttgaagagcgttgacaaagtacaattg 40846137  T
Q  343 tacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||    
T  40846136 tacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtatctctgctacaagacaaga 40846078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 3105125 - 3105294
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||    
T  3105125 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatcttaaattggttttggaagaacaaataaagagca 3105224  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |  | |||||| || | |||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3105225 agtacatcaacaaaaagggaagcttaaagtgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaggtgctcctgaa 3105294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 298 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22190928 - 22190827
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22190928 gcattggatgctgattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagac 22190829  T
Q  398 aa 399  Q
    ||    
T  22190828 aa 22190827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22191278 - 22191190
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22191278 aaaattgtcaactggataagctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaa 22191190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 11915835 - 11915700
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||  |||| || ||||||    
T  11915835 cattgcagaagactaaaagagtgaagcaacgactatttcaaatggatttgaaggcattggatgcttattctttgaagagcgttggaaaaggacaattgta 11915736  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11915735 caaagtgtacaaccaccgcctccactactctgtttt 11915700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 400
Target Start/End: Original strand, 15475060 - 15475274
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacga 276  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| | | |||||||||  |||||| |||| | |||||||   ||||||     
T  15475060 gctacagttcatcaggaaattgaactcaaagtttcaaaagctgtttcaaggattttaactcgtctaaagattgcagaagagtagaaaagtatggcaacgg 15475159  T
Q  277 ctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    ||| ||||||| |         ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15475160 ctattttgaaatg---------cattggatgcttactcctcaaagagcgttgacatagtacgtttatacgaagtgtacaaccaatacttccactactctg 15475250  T
Q  377 tttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
      |||||||  |||||||||||||    
T  15475251 agtttgtctctgctacaagacaag 15475274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20977539 - 20977436
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20977539 gcattggatgcttattcctcaaggagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagac 20977440  T
Q  398 aaga 401  Q
    ||||    
T  20977439 aaga 20977436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14571465 - 14571295
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  14571465 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacgtcctaaattggtcttggaagaacaaataaagagca 14571366  T
Q  102 aagaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    |  | |||||| || ||| |||||||||||||     ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  14571365 agtacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtctgaagtgctcctgaa 14571295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 25650814 - 25650983
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||| |||||||||| ||||  |||||    
T  25650814 aaaaatgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaagaaggtattggaagaacaaataaagagca 25650913  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  25650914 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaaaataaagcgctcctgaa 25650983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16853915 - 16853787
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||||   |||||||    
T  16853915 aaaattgtcaattggatatgctaatagttgttcaagcgtacaggactatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtctttgaagaacaattaagagcaaa 16853816  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  16853815 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgt 16853787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Original strand, 36210131 - 36210278
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| ||  ||| |||||||||| ||    
T  36210131 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcataa-atgttccttcaagatagg 36210229  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  36210230 aatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 36210278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 40861113 - 40861025
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40861113 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaa 40861025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Original strand, 9751569 - 9751672
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9751569 gcattggatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtatgtttgcacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagac 9751668  T
Q  398 aaga 401  Q
    ||||    
T  9751669 aaga 9751672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 489
Target Start/End: Original strand, 14778473 - 14778611
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||  |||||| ||||    
T  14778473 tgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagaaaggaatggattt 14778571  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  14778572 gaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 14778611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 298 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 38513960 - 38513861
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    |||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38513960 gcattggatgttaattcttcaaagagcgttgacatagtacgattgtacgaagtgtacaaccactactttcactactctgtttttgtctctgctacaagac 38513861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 45833832 - 45833705
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| || ||||||    
T  45833832 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttttggaagaacaaaagagagcaa 45833733  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    |  ||||||| || ||||||||| ||||    
T  45833732 acgaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 45833705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10693290 - 10693160
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtctt-aaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||  ||||||    
T  10693290 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacagtactatagacaaaatttgacatcttaaaaaaggtcttggaaaaacaataaagagcaa 10693191  T
Q  103 agaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt 132  Q
    || ||||||| || | |||||||||||||||    
T  10693190 aggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgt 10693160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10907056 - 10906926
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtctt-aaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||  ||||||    
T  10907056 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacagtactatagacaaaatttgacatcttaaaaaaggtcttggaaaaacaataaagagcaa 10906957  T
Q  103 agaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt 132  Q
    || ||||||| || | |||||||||||||||    
T  10906956 aggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgt 10906926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17247691 - 17247529
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaat 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||||||| |||    
T  17247691 tgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactataaaaaaattttgacatcctaaaaaggtcttggaagaacaacaaagagcaaaggaat 17247592  T
Q  109 caacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||| || ||| |||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17247591 caacaaaaaggaaagcttaaagtgtctccagaaaactgctcctgaagacaaagcgctcttgaa 17247529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 17398353 - 17398442
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17398353 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaagtttgacattttaaattggtcttggaagaacaa 17398442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8106102 - 8105940
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||     |||||||  |||||||    
T  8106102 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggattatagacaaaaattgacatcttaaaaaggtctt-----aacaataaagagcaaa 8106008  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8106007 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 8105940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 489
Target Start/End: Original strand, 17993824 - 17993962
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||  ||| |||||||| | |||||| ||||    
T  17993824 tgtacaaccactacctccacaactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataatagctctgcctgcagaa-atgtcccttcaagttaggaatggattt 17993922  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  17993923 gaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 17993962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 37435196 - 37435323
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  37435196 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaa 37435295  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    |  ||||||| || ||||||||| ||||    
T  37435296 atgaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 37435323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3396057 - 3395895
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaa 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||  || | | | |||  ||||||||||| || |||||||| ||    
T  3396057 tgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaagttgagatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcaaaggaa 3395958  T
Q  108 tcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||| || ||||||||||||||||     || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3395957 tcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaactgctcctgaagtcaaagtgctcatgaa 3395895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10073305 - 10073192
Alignment:
Q  57 aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac 151  Q
    |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||    
T  10073305 aaaatttgacatcttaaaaaggttatggaagaacaatagagagcaaaggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaagtgctcctgaagac 10073206  T
Q  152 aaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||||||||    
T  10073205 aaagtgctcctgaa 10073192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 413444 - 413337
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  413444 aaaattgtcaattggatatgctaatagttgttcaagtgtacaaggctatagacaaaatttgacat-ttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 413346  T
Q  104 gaaatcaac 112  Q
    | |||||||    
T  413345 ggaatcaac 413337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Original strand, 27188667 - 27188771
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaaga 396  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  27188667 gcattggatgcttattcctcaaggagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtataaccactatctgcactactctgttttttgtctctgctacaaga 27188766  T
Q  397 caaga 401  Q
    |||||    
T  27188767 caaga 27188771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6517926 - 6517756
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||    
T  6517926 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtttataggactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagca 6517827  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt------gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6517826 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 6517756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 350 - 489
Target Start/End: Original strand, 14710809 - 14710947
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||  ||| |||||||||  |||||| ||||    
T  14710809 tgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctatagaa-atgttccttcaagaaaggaatggattt 14710907  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  14710908 gaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 14710947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 19620767 - 19620894
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  19620767 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagaacaaaagagagcaa 19620866  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||    
T  19620867 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagc 19620894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 401
Target Start/End: Original strand, 39419787 - 39419866
Alignment:
Q  322 agcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39419787 agcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccattactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 39419866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 12810869 - 12810991
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  12810869 aaaattgtcaattggatatgctaataattgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaa 12810968  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagctt 125  Q
     | ||||||| || |||||||||    
T  12810969 tggaatcaacaaaaaggaagctt 12810991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 14604587 - 14604749
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaa 107  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||  ||||||||||| || |||| ||| ||    
T  14604587 tgtcaattggatatgctaatatttgtttaggtgtacatgaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaaaagagagctaaggaa 14604686  T
Q  108 tcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||| || ||||||||| || |||     || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14604687 tcaacaaaaaggaagcttgaaacgtctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgctcctgaa 14604749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 38514311 - 38514225
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac 90  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||    
T  38514311 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacatctaaaattgatcgtgaaagaac 38514225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16940404 - 16940315
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa-atttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  16940404 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagactacagacaaatatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaa 16940315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 56034983 - 56034866
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacga 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||  ||||||||||| || |||||||  ||||||| |    
T  56034983 tggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaaaagagagcaaatgaatcaacaa 56034884  T
Q  115 agaggaagcttaaagcgt 132  Q
    | || |||||| ||||||    
T  56034883 aaagaaagcttgaagcgt 56034866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Original strand, 3499331 - 3499407
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  3499331 tggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaattagtcatgcaagaacaa 3499407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 17700467 - 17700543
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtc 80  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17700467 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaatatttgacatcttaaattggtc 17700543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Original strand, 39419426 - 39419502
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  39419426 tggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggactacagacaatatttgacatcttaaattggtcctgaaagaacaa 39419502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9141298 - 9141131
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |  || | | | |||  ||||||||||| || |||||||    
T  9141298 aaaattgtcaattggatatgctaatatttattcaagtgtacagcaccatagacaaaatttaatatcattattaggttatggaagaacaaaagagagcaaa 9141199  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || ||||||||||| ||||     || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9141198 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaggcgtctgaagagaagtgctcctgaagacaaaagtgctcctgaa 9141131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 401
Target Start/End: Original strand, 3499682 - 3499784
Alignment:
Q  299 cattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 398  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||  | |||||||||    
T  3499682 cattggatgctatttcttcaatgagcgttgacatagtacatttgtacgaagtgtacaaccactacttctactactctgagtttgtctctgttacaagaca 3499781  T
Q  399 aga 401  Q
    |||    
T  3499782 aga 3499784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14833829 - 14833720
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || | | | || | ||||||||||| || ||||||    
T  14833829 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttggaatcattattaggacctggaagaacaaaagagagcaa 14833730  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    ||||||||||    
T  14833729 agaaatcaac 14833720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Original strand, 19911615 - 19911676
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttga 65  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19911615 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccataggcaaaatttga 19911676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15139403 - 15139296
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    |||| |||||| | |||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||  || | | ||||||||||||    
T  15139403 aaagattcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtttaagcattgcagaagaccaggagagtgaagcaacgactaattcaaatgaagttgaaggcattg 15139304  T
Q  304 gatgcttg 311  Q
    ||||||||    
T  15139303 gatgcttg 15139296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17540530 - 17540395
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||   | |||| ||||| || ||||||| | ||| |   |||| ||||| |||| || ||||||    
T  17540530 cattgcaaaagactgaaagaatgaagcaacaactaattcagatggatgtgaagccagtggatgcctattcgttggagagtgttgaaaaaggacaattgta 17540431  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17540430 cgaagtgtacaaccattatctccactactctgtttt 17540395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23750572 - 23750501
Alignment:
Q  330 caaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  23750572 caaagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 23750501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 391 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19242235 - 19242091
Alignment:
Q  391 acaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaag 490  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||  ||||  |||| || || ||| |||||||||| |||     
T  19242235 acaagacaagataacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcattcataggacaacatccaaatcaggaaaaa 19242137  T
Q  491 gattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||| | ||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  19242136 gatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtg 19242091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 29680241 - 29680355
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatca 110  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   || | | | |||  | ||||||||| || |||||||| |||||    
T  29680241 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaatttggaatcattattaggttctagaagaacaaaagagagcaaaggaatca 29680340  T
Q  111 acgaagaggaagctt 125  Q
    || || |||||||||    
T  29680341 acaaaaaggaagctt 29680355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1672850 - 1672797
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagaca 57  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1672850 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagaca 1672797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1675325 - 1675272
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagaca 57  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1675325 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagaca 1675272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Original strand, 9751219 - 9751292
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattg 77  Q
    |||| |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  9751219 aaaattgtcaattagatacgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagacaaaatttgtcatctgaaattg 9751292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 14903994 - 14904123
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  || | | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  14903994 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtatacatgaccatagacaaaaatttgagatcatcattaggttctggaagaacaaaagagagcaa 14904093  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    |  ||| ||| || | ||||||||||||||    
T  14904094 atgaataaacaaaaaagaagcttaaagcgt 14904123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 6642123 - 6642067
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6642123 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatatacaaaa 6642067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14571223 - 14571175
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14571223 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggat 14571175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16848574 - 16848526
Alignment:
Q  353 acaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16848574 acaaccactacctccactactctgtttttgtctctcctacaagacaaga 16848526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3793342 - 3793287
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaag 216  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3793342 ctgaaaatcactagaagctgcagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaag 3793287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 385
Target Start/End: Original strand, 14154015 - 14154110
Alignment:
Q  291 tttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacga-ttgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    |||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||| |  |||| | |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  14154015 tttgaaagcattggatgcttatacttcaaagaacgttgatattgtacaacttgtacgaagtgtacaaccaccttctccactactctgtttttgtct 14154110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11901322 - 11901184
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||     ||| ||||   |||| || ||||||    
T  11901322 cattgcagaagactagaaacatgaagcaacgactaattcaaaagattttgaaggcattggatgcttattctctggagaacgttagaaaaggacaattgta 11901223  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    | |||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  11901222 cgaagtgtacaatcactatctacactaatctgtatttgt 11901184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 19888806 - 19888868
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaattt 63  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  19888806 attaaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaatattt 19888868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 40846522 - 40846465
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatattt-gttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40846522 aaaattgtcaattggatatgctaatattttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaa 40846465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23123631 - 23123532
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||   |||| || | || |||||||||||||| |||| | ||||||| || |||||||||| |||||    
T  23123631 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaagattgttcaatgaatttaatctcgtctaagtattgtagaagactgaaagagtgaagcaatgacta 23123532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 12417277 - 12417336
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| | ||||||||    
T  12417277 attaaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccaaagacaaaa 12417336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 16324188 - 16324247
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  16324188 attaaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggatcatagacaaaa 16324247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16632875 - 16632748
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||  |||| | | |||  ||||| ||||| || ||||||    
T  16632875 aaaattgtcaattggatatgctaatctttgttcaagtgtacaagaccacagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaaaaacaaaagagagcaa 16632776  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
     | ||||||| || ||||||||| ||||    
T  16632775 tggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 16632748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Original strand, 41114746 - 41114877
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| ||  || | ||||||||||||||||||||| ||  |   |||| ||||| |||| || ||||||    
T  41114746 cattgcaaaagactagaagaatgaagcaacggctatttcaaatgaatttgaaggcattggatgcttttttgttggagagagttgaaaaaggacaattgta 41114845  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    |   ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  41114846 cgtcgtgtacaaccactatttccaccactctg 41114877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2652171 - 2652121
Alignment:
Q  10 gtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  2652171 gtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcacgaccatagacaaaa 2652121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3486402 - 3486372
Alignment:
Q  135 aaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3486402 aaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 3486372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19244028 - 19243982
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 396  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  19244028 tgtacaaccactacctccacaactctgcctgtgtctacgctacaaga 19243982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 376
Target Start/End: Original strand, 8685513 - 8685550
Alignment:
Q  339 attgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8685513 attgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctg 8685550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 14902168 - 14902217
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  14902168 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 14902217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 413305 - 413273
Alignment:
Q  133 gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  413305 gaaaactgctcctgaagacaaagcgctcctgaa 413273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 190)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 3220878 - 3220659
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3220878 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatga 3220779  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3220778 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 3220679  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3220678 ctcaacgtctctttcacgcc 3220659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19139526 - 19139310
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  19139526 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 19139427  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19139426 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 19139327  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  19139326 ctcaacgtctctttcac 19139310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19128994 - 19128778
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  19128994 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 19128895  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128894 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 19128795  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  19128794 ctcaacgtctctttcac 19128778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19429174 - 19428958
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19429174 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 19429075  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||    
T  19429074 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctaatcat 19428975  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  19428974 ctcaacgtctctttcac 19428958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 23469495 - 23469713
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469495 aagtgtacaaccactacctccactcctctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 23469594  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  23469595 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggagtactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 23469694  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23469695 tcaacgtctctttcacgcc 23469713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 30314731 - 30314948
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30314731 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtcctcgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 30314829  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30314830 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 30314929  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30314930 tcaacgtctctttcacgcc 30314948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 6151316 - 6151097
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  6151316 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 6151217  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6151216 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 6151117  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6151116 ctcaacgtctctttcacgcc 6151097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19418597 - 19418383
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418597 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 19418499  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||    
T  19418498 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctaatcatc 19418399  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  19418398 tcaacgtctctttcac 19418383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 6318551 - 6318769
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  6318551 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcataatttgtgtcctcaagatgggaatgaa 6318650  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6318651 tttgaagcttattcttcaaaggagtacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgttctgattatc 6318750  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6318751 tcaacgtctctttcacgcc 6318769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 9341390 - 9341171
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9341390 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 9341291  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9341290 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9341191  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9341190 ctcaacgtctctttcacgcc 9341171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 9368534 - 9368315
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9368534 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 9368435  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9368434 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9368335  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9368334 ctcaacgtctctttcacgcc 9368315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 9856506 - 9856725
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9856506 aagtgtacaaccactacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 9856605  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9856606 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9856705  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9856706 ctcaacgtctctttcacgcc 9856725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 15780744 - 15780963
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  15780744 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 15780843  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15780844 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgagtat 15780943  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15780944 ctcaacgtctctttcacgcc 15780963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 15791333 - 15791552
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  15791333 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 15791432  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15791433 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgagtat 15791532  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15791533 ctcaacgtctctttcacgcc 15791552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 36293165 - 36292946
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  36293165 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 36293066  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36293065 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 36292966  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36292965 ctcaacgtctctttcacgcc 36292946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 36303768 - 36303549
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  36303768 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 36303669  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36303668 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 36303569  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36303568 ctcaacgtctctttcacgcc 36303549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 20161264 - 20161481
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20161264 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaa 20161362  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20161363 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 20161462  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20161463 tcaacgtctctttcacgcc 20161481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 20196203 - 20195986
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20196203 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaa 20196105  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20196104 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 20196005  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20196004 tcaacgtctctttcacgcc 20195986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 3348661 - 3348877
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  3348661 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 3348760  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3348761 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 3348860  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  3348861 ctcaacgtctctttcac 3348877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 3359258 - 3359474
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  3359258 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 3359357  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3359358 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 3359457  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  3359458 ctcaacgtctctttcac 3359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 18449616 - 18449397
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  18449616 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaaaatgggaatga 18449517  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18449516 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgactat 18449417  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18449416 ctcaacgtctctttcacgcc 18449397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19225179 - 19224965
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225179 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 19225081  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||    
T  19225080 tttgaagctaattcttcaaaggacaacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaatgactctttagacgtgctaatcatc 19224981  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  19224980 tcaacgtctctttcac 19224965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 18769172 - 18769389
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769172 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagataagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 18769271  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||  ||    
T  18769272 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctc 18769370  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18769371 tcaacgtctctttcacgcc 18769389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Original strand, 23185160 - 23185400
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23185160 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgcaacataaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgg 23185259  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23185260 aaaagtgaagcaacgactagtttgaaaggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccac 23185359  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23185360 tacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaaga 23185400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 26121156 - 26120936
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  26121156 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaataa 26121057  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgttgatta 544  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  26121056 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttaagacgtgctaatta 26120957  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26120956 tctcaacgtctctttcacgcc 26120936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 210188 - 210406
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  210188 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 210286  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  210287 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 210386  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  210387 ctcaacgtctctttcacgcc 210406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 242069 - 241851
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  242069 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 241971  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  241970 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 241871  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  241870 ctcaacgtctctttcacgcc 241851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 252654 - 252436
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  252654 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 252556  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  252555 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 252456  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  252455 ctcaacgtctctttcacgcc 252436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 723811 - 724029
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  723811 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 723909  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  723910 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 724009  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  724010 ctcaacgtctctttcacgcc 724029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 849002 - 849220
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  849002 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 849100  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  849101 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 849200  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  849201 ctcaacgtctctttcacgcc 849220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 6161271 - 6161052
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  6161271 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaaaacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 6161172  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6161171 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 6161072  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6161071 ctcaacgtctctttcacgcc 6161052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 32088304 - 32088522
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  32088304 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 32088402  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32088403 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 32088502  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32088503 ctcaacgtctctttcacgcc 32088522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 13688601 - 13688821
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  13688601 aagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 13688700  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13688701 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 13688800  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13688801 tctcaacgtctctttcacgcc 13688821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 26111478 - 26111258
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26111478 aagtgtacaaccacaacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 26111379  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgttgatta 544  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  26111378 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttaagacgtgctaatta 26111279  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26111278 tctcaacgtctctttcacgcc 26111258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 36078182 - 36077962
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  36078182 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 36078083  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36078082 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 36077983  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36077982 tctcaacgtctctttcacgcc 36077962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 36088768 - 36088548
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  36088768 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 36088669  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36088668 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 36088569  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36088568 tctcaacgtctctttcacgcc 36088548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 366 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 43248553 - 43248353
Alignment:
Q  366 ccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttca 464  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43248553 ccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttca 43248454  T
Q  465 aagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctctttcacgc 564  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43248453 aaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcacgc 43248354  T
Q  565 c 565  Q
    |    
T  43248353 c 43248353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 44481337 - 44481121
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  44481337 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 44481238  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  44481237 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgtttat 44481138  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  44481137 ctcaacgtctctttcac 44481121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 44491953 - 44491737
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  44491953 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 44491854  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  44491853 atttgaagtttatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgtttat 44491754  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  44491753 ctcaacgtctctttcac 44491737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 29076976 - 29076758
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  29076976 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 29076878  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29076877 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 29076778  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29076777 ctcaacgtctctttcacgcc 29076758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 29087227 - 29087009
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  29087227 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 29087129  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29087128 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 29087029  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29087028 ctcaacgtctctttcacgcc 29087009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 31215261 - 31215046
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31215261 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctataagacaagacaacagctatgcctgcataatttatgccttcaagatgggaatgaa 31215162  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  31215161 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtggatgatcaaaagatttcaaacaactctttagacgtgctaatcctc 31215062  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  31215061 tcaacgtctctttcac 31215046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 32077731 - 32077949
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  32077731 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 32077829  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32077830 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgatggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 32077929  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32077930 ctcaacgtctctttcacgcc 32077949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 18158500 - 18158284
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18158500 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccactctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 18158402  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  18158401 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 18158303  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18158302 tcaacgtctctttcacgcc 18158284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 23457339 - 23457528
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23457339 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 23457437  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23457438 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggagtactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 23457528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 182 - 528
Target Start/End: Original strand, 15425108 - 15425453
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   || |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |    
T  15425108 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaatggaatcaaactcgtctaaagattgcagaagactgagaaagtgaagcaacgactatt 15425207  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15425208 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttattcgtcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 15425307  T
Q  382 gtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaa 480  Q
    ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||| |   ||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||| ||||| || || | | ||| |    
T  15425308 gtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 15425406  T
Q  481 tcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 528  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  15425407 tcaggcaaaggatcattggtgaatgatcaaaag-cttcaaacgactct 15425453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 347 - 534
Target Start/End: Original strand, 30325287 - 30325473
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30325287 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtcctcgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 30325385  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagac 534  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30325386 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagac 30325473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 182 - 528
Target Start/End: Original strand, 15336043 - 15336388
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   || |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |    
T  15336043 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaatggaatcaaactcgtctaaagattgcagaagactgagaaagtgaagcaacgactatt 15336142  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15336143 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttattcgtcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 15336242  T
Q  382 gtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaa 480  Q
    ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||| |   ||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||| ||||| || || | | ||| |    
T  15336243 gtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 15336341  T
Q  481 tcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 528  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||| |  |||||||||||||    
T  15336342 tcaggcaaaggatcattggtgactgatcaaaag-cttcaaacgactct 15336388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 182 - 528
Target Start/End: Original strand, 15516412 - 15516757
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   || |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |    
T  15516412 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaatggaatcaaactcgtctaaagattgcagaagactgagaaagtgaagcaacgactatt 15516511  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516512 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttattcgtcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 15516611  T
Q  382 gtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaa 480  Q
    ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||| |   ||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||| ||||| || || | | ||| |    
T  15516612 gtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 15516710  T
Q  481 tcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 528  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||| |  |||||||||||||    
T  15516711 tcaggcaaaggatcattggtgactgatcaaaag-cttcaaacgactct 15516757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 16747246 - 16747030
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16747246 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgccttcaagatggaaatgaa 16747148  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  16747147 tttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 16747049  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16747048 tcaacgtctctttcacgcc 16747030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 18153980 - 18153765
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||    
T  18153980 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaa--ttgttccttcaagataggaatgaa 18153883  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||| | || |||    
T  18153882 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacaactctttagacgtgctaatcatc 18153784  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18153783 tcaacgtctctttcacgcc 18153765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16207504 - 16207283
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  16207504 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaacgctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtaaagcaactacta 16207405  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16207404 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 16207305  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  16207304 ttgtctctgctacaagacaaga 16207283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17797639 - 17797399
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || ||||  |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  17797639 ctgaaaatcaccagaagctgcagctcatcaggagatgcaacttaaagcctcaaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaaccattacagaagactgg 17797540  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17797539 aaaagtgatgcaacggctagtttgaaaggaattgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccac 17797440  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  17797439 tacctccactactctgtttttgtctctgctataagacaaga 17797399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 40213205 - 40213418
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  40213205 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacactacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 40213303  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || | || |||    
T  40213304 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacctgctaatcatc 40213402  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  40213403 tcaacgtctctttcac 40213418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 164 - 401
Target Start/End: Original strand, 30421365 - 30421603
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaa 263  Q
    |||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30421365 aaaatcaccagaagctgcagttcatcagaagatgcaacataaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaa 30421464  T
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttc--ctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccact 361  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  30421465 agtgaagcaacgactagtttgaatggatttgaaggcattggatgcttgttcttttcaaagagcgttgacaaagtac-attgtacgaagtttacaaccact 30421563  T
Q  362 acctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  30421564 acctccactactctgtttttgtctctgcaacaagacaaga 30421603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 164 - 401
Target Start/End: Original strand, 45538376 - 45538613
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaa 263  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  45538376 aaaatcaccagaagctgcagttcatcatgggatgcaacttaaggcttcaaaagttgtttaatggattcaacctcgtctaaagattgcagaagactggaaa 45538475  T
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45538476 agtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaagacattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaatcacgtttgtacgaagtgtacaaccactac 45538575  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45538576 ctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 45538613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 370 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 795401 - 795206
Alignment:
Q  370 tactctgtttttg-tctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagt 468  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  795401 tactctgttttcggtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaagg 795303  T
Q  469 actacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  795302 actacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcacgcc 795206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 3843768 - 3843560
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  3843768 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 3843670  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  3843669 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 3843571  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  3843570 tcaacgtctct 3843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 164 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24551488 - 24551251
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaa 263  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  24551488 aaaatcaccagaagctgcagttcatcatgggatgcaacttaaggcttcaaaagttgtttaatggattcaacctcgtctaaagattgcagaagactggaaa 24551389  T
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24551388 agtgaagcaacgactattttgaaaagatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttaacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactac 24551289  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  24551288 ctccactactttgtttttgtctctactacaagacaaga 24551251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 36105412 - 36105172
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||| |||    
T  36105412 ctgaaaatcaccagaagctatagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagattgg 36105313  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    ||||||  | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36105312 aaaagtataacaacggctattttggaaggatttgaaggcattggatgtttattcttcaaagagcgttgatatagtacgtttgtacaaagtgtacaaccac 36105213  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36105212 tacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaaga 36105172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 177 - 401
Target Start/End: Original strand, 40845338 - 40845561
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacga 276  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  40845338 gctatagttcatcaggagatgcagcttaaagcttcaaaagttgtttaa-ggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacga 40845436  T
Q  277 ctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40845437 ctattttggaaggattggaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctg 40845536  T
Q  377 tttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||    
T  40845537 tttttgtctctgctacaagagaaga 40845561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 347 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 1750339 - 1750193
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1750339 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaa 1750240  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggat 493  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1750239 tttgaagctgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 1750193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 21933079 - 21932735
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| |    
T  21933079 ttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcataagactgaaagagtgaaacaacggctatt 21932980  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21932979 ttgaaaggatttaaaggcattgtatgcttgtttttcaaagagcgttgacaaagtaaaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtgttt 21932880  T
Q  382 gtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaa 480  Q
    ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||| |   ||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||| ||||| || || | | ||| |    
T  21932879 gtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 21932781  T
Q  481 tcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 528  Q
    ||||||||| ||| | |||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  21932780 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaag--tttcaaacgactct 21932735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 185 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 39693730 - 39693494
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  39693730 tcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaatgactattt 39693631  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 382  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  39693630 tgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtg 39693531  T
Q  383 tctacgctacaagacaa-gacaacagccttgcctgca 418  Q
    |||  |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  39693530 tctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgca 39693494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19943435 - 19943212
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaaga-tgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||  | || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  19943435 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggctattcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaact 19943336  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcc-tcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgt 377  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19943335 attttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctttaaaaagcgttgacaaagtaaaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgt 19943236  T
Q  378 ttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||| ||||   |||||||||||||    
T  19943235 tttggtctctcctacaagacaaga 19943212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 347 - 504
Target Start/End: Original strand, 6576554 - 6576712
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  6576554 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 6576653  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggat 504  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6576654 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggat 6576712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 7018416 - 7018624
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  7018416 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 7018514  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  7018515 tttgaacttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 7018613  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  7018614 tcaacgtctct 7018624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1237831 - 1237614
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1237831 ttcatcatgggatgcaacttaaggcttcaaaagctgtttaatggattcaacctcgtctaaagattgcagaagaccggaaaagtgaagcaacgactatttt 1237732  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1237731 gaaaggatttgaaggcattggatatttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacttttgtgcgaagtgtacaaccactacctccactactctgttgttgt 1237632  T
Q  384 ctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  1237631 ctctgctacaagagaaga 1237614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 12757716 - 12757936
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||| ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  12757716 agttcatcaggagatgcaagacttaaaactttaaaggatgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacaacta 12757815  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12757816 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 12757915  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||   ||||||||||||    
T  12757916 gtgtctctactacaagacaag 12757936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16189182 - 16188962
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||| |||||||||||  || ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16189182 agttcattaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgtttaatggatttaatctcgtccaaccattgcagaagactggaagagtgaagcaacgacta 16189083  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  16189082 ttttgaaatgatttgaaggcattggatgcttattcttctaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtat 16188983  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  16188982 gtgtctctgctacaagacaag 16188962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19156394 - 19156174
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||| |||||||||   | ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19156394 agttcatcaagagatgcaagaattaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctatgcattgcagaagactagaagagtgaagcaacgacta 19156295  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19156294 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaaatgtacaaccactatctccactactcagttt 19156195  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  19156194 gtgtctctgctacaagacaag 19156174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Original strand, 602658 - 602894
Alignment:
Q  167 atcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaa 264  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||  || ||| ||||||| | |||| |  ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  602658 atcacaagaagctaaagttcatcaggaaatgcaagacttaaaacttcaaaggttgttcattggattcaatctcgtctaagcattgcagaagacttgaaga 602757  T
Q  265 gtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacc 364  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  602758 gtgaagcaatgactattttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatc 602857  T
Q  365 tccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  602858 tccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 602894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Original strand, 16681251 - 16681474
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16681251 gctaaagttcatcaggagatgcaagacttagagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaac 16681350  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||    
T  16681351 gtctagtttgaaaggatttgaaggcattagatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctctagtactc 16681450  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagaca 398  Q
     |||| |||||  |||||||||||    
T  16681451 agtttgtgtctctgctacaagaca 16681474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 18121062 - 18121280
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  |||    
T  18121062 agttcatcaggagatgcaagacttaaagtttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaactgcta 18121161  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  18121162 ttttgaaaggatttaaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcattaacaaagtacaattgtacgaagtgt---accactacctcaactactctgttt 18121258  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  18121259 ctgtctctgctacaagacaaga 18121280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 559
Target Start/End: Original strand, 20259652 - 20259862
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  20259652 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 20259750  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||  ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||||| | |  |||    
T  20259751 ttcaaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtgaatgatcaaaggaaatc-aacgactttttagacgtgctaaaaatc 20259849  T
Q  547 tcaacgtctcttt 559  Q
    |||||||||||||    
T  20259850 tcaacgtctcttt 20259862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 559
Target Start/End: Original strand, 21046282 - 21046492
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  21046282 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 21046380  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||  ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||||| | |  |||    
T  21046381 ttcaaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtgaatgatcaaaggaaatc-aacgactttttagacgtgctaaaaatc 21046479  T
Q  547 tcaacgtctcttt 559  Q
    |||||||||||||    
T  21046480 tcaacgtctcttt 21046492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 182 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33083055 - 33082872
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||    
T  33083055 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagatcagaagagtgaagcaacgacta 33082956  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33082955 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactac 33082872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9320784 - 9320546
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaa-ggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaa 262  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  9320784 aaaatcaccagaagctgcagttcatcagaggatgcaacttaaggcttcaaaagctgtttaattggattcaacctcgtctaaagattgcagaagactggaa 9320685  T
Q  263 aagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctc-aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccact 361  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  9320684 aagtgaagcaacaattattttgaaaggatttgaacgcattggatgcttattcttcaaaagagcgttgacaaagtatatttgtacgaagtgtacaaccact 9320585  T
Q  362 acctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  9320584 acctccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 9320546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 17525681 - 17525902
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| | ||| || |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  17525681 agttcatcaggagatgcaagacttaaatcttcaaaaggttgttcaatggatttaatatcgtctaagcactgcagaagactggaagagtgaaacaacaact 17525780  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  17525781 attttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatcttcactactcagtt 17525880  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    | |||||   ||||||||||||    
T  17525881 tgtgtctctactacaagacaag 17525902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 204 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17914633 - 17914463
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  17914633 aaagcttcaaaagttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgtaagagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcatta 17914534  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17914533 gatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtataaccactatctccactactc 17914463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 22167058 - 22167266
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22167058 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagataagataacagctttgcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 22167156  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  22167157 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 22167255  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  22167256 tcaacgtctct 22167266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 22211423 - 22211632
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  22211423 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagccctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 22211521  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgttgattat 545  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | |  ||    
T  22211522 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttaagacgtgctaaaaat 22211620  T
Q  546 ctcaacgtctct 557  Q
    ||||||||||||    
T  22211621 ctcaacgtctct 22211632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22673974 - 22673755
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||    |||||| |||||| |||||||  ||||||  ||| |    
T  22673974 agttcatccggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcgtctggagattgcagaagactagaaaagtatagcaacatctatt 22673875  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22673874 ttggaaggattagaagacattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactttgttttt 22673775  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  22673774 gtctctgctacaagacaaga 22673755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 22135893 - 22136081
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22135893 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 22135991  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  22135992 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 22136081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 17441761 - 17441980
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| | |||| || |||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||    
T  17441761 agttcatcaggagatgcaagacttaaagctttaaaggttgttcaatggacttaatctcctctaagcattgcagaagactggaagactaaagcaacgacta 17441860  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  17441861 ttttgaaaggatttgaag-cattggatgcttattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtactaagtgtacaaccactatctccactactcatttt 17441959  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||   ||||||||||||    
T  17441960 gtgtctctactacaagacaag 17441980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 182 - 383
Target Start/End: Original strand, 23263564 - 23263768
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaa-agcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||||||||||||  || || | ||||||| | |||| ||  ||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  23263564 agttcatcaggagatgcaaaacttaagaacttcaaaggttgttcaatagatttaatctcgtctaaacaatgcagaagactagaagagtgaaacaatgact 23263663  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23263664 attttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacagttgtacgaagtgtacaaccactacctccactaccatgtt 23263763  T
Q  379 tttgt 383  Q
    |||||    
T  23263764 tttgt 23263768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 29693513 - 29693293
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||| ||||   ||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  29693513 agttcattaggagatgcaagacttaaagctccaaagactgtttaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaaccacta 29693414  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  29693413 ttttgaaaggatttgaaagcattgtatgcttgttctttgaagagctttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccactactcagttt 29693314  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||| ||||||    
T  29693313 gtgtctctgctacaggacaag 29693293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6407913 - 6407703
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||    ||||| |||     
T  6407913 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtattacaacggctat 6407815  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||         ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6407814 tttg---------gaaggcattggatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttctacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 6407724  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  6407723 tgtctctgctacaagacaaga 6407703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22663312 - 22663109
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||| |  |||||| |||||||||||| |  |||||| |||| |    
T  22663312 agttcattaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctgaagattgcagaagactggaaaaatatagcaacaactatt 22663213  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  22663212 ttggaaagattagaagacattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccaatatctccactactctattttt 22663113  T
Q  382 gtct 385  Q
    ||||    
T  22663112 gtct 22663109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 401
Target Start/End: Original strand, 24832993 - 24833230
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagg-atctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaa 262  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  24832993 aaaatcaccagaagctgcagttcatcagaggatgcaacttaaggcttcaaaagctgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgcagaagactg-aa 24833091  T
Q  263 aagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctc-aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccact 361  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24833092 aagtgaagcaatggctactttgaagggatttgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacatggtacgtttgtacgaagtgtacaaccact 24833191  T
Q  362 acctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||  | ||||||||||||    
T  24833192 acctccattactct-attttgtctctgttacaagacaaga 24833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 18321112 - 18321333
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||||   || |||||||||||  |||    
T  18321112 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcatgagaccaaaagagtgaagcaacagcta 18321211  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  18321212 ttttcaaaggatttgagggcattggatgcttgttctttgaagggcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccactactcagttt 18321311  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||   |||||||||||||    
T  18321312 gtgtctctactacaagacaaga 18321333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17701919 - 17701722
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| || | || ||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17701919 aaagcttcaaaggttgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagatcagaagagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattg 17701820  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  |||||  |||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  17701819 gatgctaattcctttaagagcgttggcaaagtataattgtacgaagtttacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaggacaaga 17701722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24646536 - 24646316
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||| |||||||||   | ||||||||||| | |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||  |||    
T  24646536 agttcatcaagagatgcaagagttaaagcttcaaaggttgttcaattgatttaatctcgtctaagcattgcataagactaaaagagtgtagcaacagcta 24646437  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24646436 ttttgaaaggatttgcaggcattggatgcttattctttgaagagtgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 24646337  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  24646336 gtgtctctgctacaagacaag 24646316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 510
Target Start/End: Original strand, 45567943 - 45568184
Alignment:
Q  269 agcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctcca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  45567943 agcaacggctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgattatccttcaaagagcgttgacaaagtacttctgtacgaagtgtacgaccactaccttca 45568042  T
Q  369 ctactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| || |||  || |||||| |||||||  |||| ||||| ||    
T  45568043 ctactctgtttatgtctacgctataagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccctcagaataggaatggatttgaatgtgatccttcatag 45568141  T
Q  468 tactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
     || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  45568142 gacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 45568184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Original strand, 14989417 - 14989625
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||| |  |||||  |||| |||||||||  | ||||| |||||||    
T  14989417 ttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagccgtttaaaggattcaaactcgtctgaagattgctgaagattggaaaagtataacaacggctaattt 14989516  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    |         ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14989517 g---------gaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaattgtacaaccactatctccactactctgtttttgt 14989607  T
Q  384 ctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  14989608 ctctgctacaagacaaga 14989625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 232 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18679961 - 18679774
Alignment:
Q  232 aatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgaca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  18679961 aatctcgtctaagcattgcaaaagaccagaggagtaaagcaacgactattttgataggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgaca 18679862  T
Q  332 aagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgca 418  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||  |||  |||||||| | |||||| |||||||||    
T  18679861 tagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctctactactcagtttgtgtctctgcttaaagacaagaataacagctttgcctgca 18679774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 45538171 - 45538338
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  45538171 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacaacttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 45538270  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45538271 gaaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 45538338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23370794 - 23370591
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |  ||||| ||||| | || |||| ||||| ||||||||    
T  23370794 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac-----aagacaagacaacacctctgcctacagaaat-gttcctttaagataggaatgaa 23370701  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||  ||| |||| ||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  23370700 ttcaaagttgatccttcgtaggactacacccaaatcaggaaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 23370602  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  23370601 tcaacgtctct 23370591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17267671 - 17267452
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||| || || || ||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||  |||    
T  17267671 agttcatcaagagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggttc-aatctcgtccaagcattgcaaaagaccgcaggagtgaagcaacagcta 17267573  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17267572 ttttgaaaggatttgaaagcattagatgcttgttctttgaagagcattgacatagtacaattgtacgaattgtacaaccactatctccactactcagttt 17267473  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||  || ||||||||||    
T  17267472 ttgtctctgccacaagacaag 17267452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 232 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18719147 - 18718978
Alignment:
Q  232 aatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgaca 331  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  18719147 aatctcgttcaagcattgcaaaagaccagaggagtgaagcaacgactattttgataggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgtca 18719048  T
Q  332 aagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||    
T  18719047 tagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctaaaagacaaga 18718978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 30421159 - 30421322
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30421159 aaaattgtcaattggatatgctaatattttttcaagtgtacaggaccatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagcaaa 30421258  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcct 162  Q
    | ||| ||| || ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30421259 ggaattaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaacaaaactgctcctgaagacaaactgctcct 30421322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 385
Target Start/End: Original strand, 20382347 - 20382552
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactc--aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||| || ||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||    
T  20382347 agttcatcaggagatgcaagtcttaaagcttcaaaggctgttcaatggattcaatctcgtccatgcattgcaaaagactagaggagtgaagcaacggcta 20382446  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     | |||||||||||||| | | |||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  20382447 ttctgaaaggatttgaaagtagtggatgtttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactaatcagttt 20382546  T
Q  380 ttgtct 385  Q
     |||||    
T  20382547 gtgtct 20382552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 20255542 - 20255652
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||| ||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20255542 aaagcgtcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattacagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattg 20255641  T
Q  304 gatgcttgttc 314  Q
    |||||||||||    
T  20255642 gatgcttgttc 20255652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1238104 - 1237936
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||    
T  1238104 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaa 1238005  T
Q  103 agaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || | ||||||||||||| |     ||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  1238004 aggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcatctgaagaaaactgctcatgaagataaagcgctcctgaa 1237936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Original strand, 24832771 - 24832923
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  24832771 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggattatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 24832870  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaaga 150  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  24832871 gaaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaaga 24832923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 43645071 - 43644876
Alignment:
Q  202 tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcat 301  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||| |||||  ||| ||||||| |||| ||||||  || | ||||||||||||    
T  43645071 tcaaagcttcaaaggttgttcaaatgatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagaaacggctaattcaaatgaatttgaaggcat 43644973  T
Q  302 tggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 398  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||    
T  43644972 tggatgcttgttctttgaagagcgttaataaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcggtttgtgtctctgctacaggaca 43644876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 17441539 - 17441706
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  17441539 aaaattgtcaattgcatatgctaatatttgttgaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaa 17441638  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||     || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17441639 aggaatcaacgaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgctcctgaa 17441706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21541042 - 21540768
Alignment:
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21541042 atttgaaaggaatagaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacga--------agtgtacgaccactacctccactactctattt 21540951  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacaccca 478  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||  ||| ||||||  || |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||    
T  21540950 atgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaacca 21540852  T
Q  479 aatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttca-aacgactctttagacgtg-ttgattatctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||| ||| | |||||  |||||||  | ||||| ||||||||||| |||||| || |  ||||||||| |||||||||    
T  21540851 aatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgactctttcac 21540768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43639971 - 43639760
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||||||    |||||||||     
T  43639971 cagttcatcatgagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgcctaaaaattgcaaaagactggaaaagtatgacaacgactat 43639872  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttt 379  Q
    |||||         ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||   |||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  43639871 tttga---------aaggcattgaatgcttatttttcaaagagcgttgacatgttacgtttgcacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 43639781  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  43639780 ttgtctctgctacaagacaag 43639760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 15335758 - 15335925
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  15335758 aaaattgtcaattggatatgctaataattgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 15335857  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||| ||     |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  15335858 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagtgtctgaagaaaactgctcctgaagttaaagcgctcctgaa 15335925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 15424823 - 15424990
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  15424823 aaaattgtcaattggatatgctaataattgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 15424922  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||| ||     |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  15424923 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagtgtctgaagaaaactgctcctgaagttaaagcgctcctgaa 15424990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 15516127 - 15516294
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  15516127 aaaattgtcaattggatatgctaataattgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 15516226  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||| ||     |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  15516227 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagtgtctgaagaaaactgctcctgaagttaaagcgctcctgaa 15516294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 401
Target Start/End: Original strand, 18151713 - 18151820
Alignment:
Q  294 gaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctaca 393  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18151713 gaaggcattggatgcttattcttcaaagagcattgacatagtacgtttgtacgaattgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctaca 18151812  T
Q  394 agacaaga 401  Q
    ||||||||    
T  18151813 agacaaga 18151820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 380
Target Start/End: Original strand, 18685388 - 18685550
Alignment:
Q  218 tgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaa-aagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcct 316  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |    
T  18685388 tgttcaaaggatataatcacgtcta-gcattgcaagaagaccagaagagtgaagcaacaactattttgaaagaatttgaaggcattagatgcttattttt 18685486  T
Q  317 caaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
      ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18685487 tgaagagcgttgaaaaactacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 18685550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 380
Target Start/End: Original strand, 18722637 - 18722799
Alignment:
Q  218 tgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaa-aagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcct 316  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |    
T  18722637 tgttcaaaggatttaatcacggcta-gcattgcaagaagacaagaagagtgaagcaacgactattttgaaagaatttgaaggcattagatgcttattttt 18722735  T
Q  317 caaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
      ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18722736 tgaagagcgttgaaaaactacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 18722799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 380
Target Start/End: Original strand, 18730982 - 18731144
Alignment:
Q  218 tgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaa-aagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcct 316  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |    
T  18730982 tgttcaaaggatttaatcacggcta-gcattgcaagaagacaagaagagtgaagcaacgactattttgaaagaatttgaaggcattagatgcttattttt 18731080  T
Q  317 caaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
      ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18731081 tgaagagcgttgaaaaactacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 18731144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 23271239 - 23271428
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||     
T  23271239 aagtgtacaaccactacttccactactctgcctgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgg 23271337  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  23271338 atttgaatttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtg 23271428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17797857 - 17797688
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||   ||||||    
T  17797857 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactttagacaaaatttgacatcttaaaaagatcttggaagaataataaatagcaaa 17797758  T
Q  104 gaaatcaac---gaagaggaagcttaaagc----gtgaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaaa 166  Q
    | |||||||    || ||||||||||||||    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17797757 ggaatcaacaaaaaaaaggaagcttaaagcatctgaaaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaaa 17797688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21301102 - 21301000
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  21301102 gcattggatgcttactcctcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagac 21301003  T
Q  398 aag 400  Q
    |||    
T  21301002 aag 21301000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6408154 - 6407985
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||    
T  6408154 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagca 6408055  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6408054 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtttgaagaaaactgctcctgaagttaaagtgctcctgaa 6407985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 40845086 - 40845255
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||    
T  40845086 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagca 40845185  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40845186 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 40845255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9321022 - 9320854
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaat-ttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||    
T  9321022 aaaattgtcaattggatatgctaatattttttcaagtgtacaggactatagacaaaatattgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaa 9320923  T
Q  103 agaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || | ||||| |||||||||     ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9320922 aggaatcaacaaaaagggaagattaaagcgtctgaagaaaactactcctgaagataaagcgctcctgaa 9320854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 28903495 - 28903349
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  28903495 gtacaaagtgtacaaccactagctccactactctg-ttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatagg 28903398  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  28903397 aatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaa 28903349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Original strand, 13430699 - 13430801
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  13430699 gcattggatgcttattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgctacaagac 13430798  T
Q  398 aag 400  Q
    |||    
T  13430799 aag 13430801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 264 - 401
Target Start/End: Original strand, 19956378 - 19956514
Alignment:
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||||    
T  19956378 agtgaagcaacgactaattctaaaggatttgaaggcattggatactttttcattgaagagcgttgaaaaaggacaattgtactaattgtacaaccactac 19956477  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  || |||||||||||    
T  19956478 ctccaataccctg-ttttgtctctgcaacaagacaaga 19956514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 18120847 - 18121007
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  || | ||| |||  ||||||||||| || |||||||  ||||    
T  18120847 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgagatcatcaataggttctggaagaacaaaagagagcaaatgaatc 18120946  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||| || ||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18120947 aacaaaaaggaagcttaaagcgtttgaagagaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 18121007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22745905 - 22745779
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |  ||||||    
T  22745905 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggacgatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaaaagagcaa 22745806  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaag 129  Q
    || ||||||| || |||||||||||||    
T  22745805 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaag 22745779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 23184959 - 23185125
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||| |||||||    
T  23184959 aaaattgtcaattggatatgctaatattttttcaagtgtataagaccatagacaaaatttgacatcttaaaaagattttggaagaacaatagagagcaaa 23185058  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
      ||  ||| || ||||||||||||||||     ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23185059 tgaactaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaatttgctcttgaagacaaagtgctcctgaa 23185125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36105656 - 36105494
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagcaaagaaat 108  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||  ||||||| | ||    
T  36105656 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtattggaagaacaaataaagagcaaatacat 36105557  T
Q  109 caacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||| || | |||||||||||| ||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36105556 caacaaaaagggaagcttaaagtgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 36105494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Original strand, 17519173 - 17519320
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  17519173 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctcttcctgcagaa-atgttccttcaagatagg 17519271  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||  ||||||||||||||    
T  17519272 aatggatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaa 17519320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19707639 - 19707499
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||| ||| |||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  19707639 cattgcagaagaccagaagagtgaagcaacggctaattcaaatgaatttgaaggcattgaatggttgttctttgaagaacgttgacaaagtacaattgta 19707540  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||    
T  19707539 cgaagtgtacaaccactacatcctctactcagtttgtgtct 19707499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21301452 - 21301364
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  21301452 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaattagtcttgaaagaacaa 21301364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22674237 - 22674145
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaa-aatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  22674237 attaaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaagaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaa 22674145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 33559961 - 33560049
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  33559961 aaaattgtcaattggatacgttaatatttgttcaagtgtacaggattatagacaaaatttgacatcttaaattgatcttgaaagaacaa 33560049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Original strand, 3598045 - 3598198
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtctt-aaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||  | ||||||||||||||||  || |||    
T  3598045 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacattttaaaaaagatcttggaagaacaatacagaacaa 3598144  T
Q  103 agaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaaga 150  Q
    || ||||||| |||| |||| ||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  3598145 aggaatcaacaaagagggaaacttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaaga 3598198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 342 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 40003265 - 40003097
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  40003265 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgactgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatagg 40003167  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||| |||||||  | |||||||  || || ||| ||||||||| |||| ||| | |||||  |||||||    
T  40003166 aatggatttgaacgtaattcttcttaggacaacatccaaatcagacaaaagatcattggtgattgatcaa 40003097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 350 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 8032062 - 8031923
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatt 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||||||  ||| |||||||||| |||||| |||    
T  8032062 tgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcttgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatt 8031964  T
Q  449 tgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    ||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  8031963 tgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 8031923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 13430350 - 13430501
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||    
T  13430350 aaaattgtcaattgaatatgctaatattttttcaagtgtacat-actatagacaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaaataaagagcaa 13430448  T
Q  103 agaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
      | |||||| || ||| |||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  13430449 gtacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 13430501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21288481 - 21288381
Alignment:
Q  300 attggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||    
T  21288481 attggatgcttactcctcaaagagcgttgacatagttcgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactttgagtttgtctctgctacaagacaa 21288382  T
Q  400 g 400  Q
    |    
T  21288381 g 21288381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21288833 - 21288745
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  21288833 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtataggactatagacaaaatttgacatcttaaattagtcttgaaagaacaa 21288745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21933334 - 21933169
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||  |||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||  |||  |||||||||||||| ||||||    
T  21933334 aaaattgtcaattggatatgcaaatatttgt--aagtgtgcaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaatagagagcaa 21933237  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||     || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21933236 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaactgctcctgaagtcaaagtgctcttgaa 21933169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 14989173 - 14989342
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||   |||||| |||||||| ||  |||||    
T  14989173 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatcttaaa-aagtcttgaaagaacaagtaaagagca 14989271  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag-acaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14989272 aatacatcaacaaaaatggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagttaaaagtgctcctgaa 14989342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1745590 - 1745501
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaa-attggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  1745590 aaaattgtcaattggatacgctaatatttattcaagtgtacatgactatagacaatatttgacatcttaagattggtcttgaaagaacaa 1745501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16189434 - 16189305
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  16189434 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtataggaccatacacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaa 16189335  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    |  ||||||| || ||||||||| ||||||    
T  16189334 atgaatcaacaaaaaggaagcttgaagcgt 16189305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19927476 - 19927351
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaa 107  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  19927476 tgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtataggactttagacaaaaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaaggaa 19927377  T
Q  108 tcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt 132  Q
     |||| || | |||||||||||||||    
T  19927376 ccaacaaaaagggaagcttaaagcgt 19927351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 45293045 - 45292958
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  45293045 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaa-ttgtcatcttaaattggtcttgaaagaacaa 45292958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 22461656 - 22461783
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| |   |||| ||||| |||| || ||||||    
T  22461656 cattgcagaagactagaagaatgaagcaacgactaattcaaatggatttgaaggcattggatgcttattcgttggagagagttgaaaaaggacaattgta 22461755  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactac 372  Q
    |  |||| |||||||||| |||||||||    
T  22461756 cggagtgcacaaccactatctccactac 22461783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19156620 - 19156450
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggag 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||   || | | | |||  | ||||||||| || |||    
T  19156620 attaaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttggaatcattattaggttctagaagaacaaaagagag 19156521  T
Q  100 caaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||||  |||||| || ||||||||||||||||     || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19156520 caaagggatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgctcctgaa 19156450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 17525446 - 17525502
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17525446 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaa 17525502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 19461190 - 19461051
Alignment:
Q  351 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttg 450  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| ||||||| || |||||  |||||    
T  19461190 gtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctataagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaatataggaatagatttg 19461092  T
Q  451 aagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaagg 491  Q
    ||  |||| ||||| || || ||| || |||||| ||||||    
T  19461091 aacttgatccttcataggacaacatcccaatcagacaaagg 19461051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 19558868 - 19558729
Alignment:
Q  351 gtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttg 450  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| ||||||| || |||||  |||||    
T  19558868 gtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctataagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaatataggaatagatttg 19558770  T
Q  451 aagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaagg 491  Q
    ||  |||| ||||| || || ||| || |||||| ||||||    
T  19558769 aacttgatccttcataggacaacatcccaatcagacaaagg 19558729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22663590 - 22663498
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  22663590 attaaaattgtcaactgaatatgctaatatttgttcaagtgtataggattatagacaaaaatttgacatcataaaaaggtcttggaagaacaa 22663498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 43774322 - 43774234
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  43774322 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtctacaggattatagacaatatttgacatcttaaattggtcctgaaagaacaa 43774234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Original strand, 1082230 - 1082297
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  1082230 taatatttgttcaagtatacaggacaatagacaaaatttgtaatcttaaattggtcttggaagaacaa 1082297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 20382112 - 20382279
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| | | |||  || |||||||| || ||| ||    
T  20382112 aaaattgtcaattggagatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatctttattaggttctgaaagaacaaaagagagtaa 20382211  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
     | ||||||| || ||||||||| ||||||     || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20382212 tggaatcaacaaaaaggaagcttgaagcgtctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgctcctgaa 20382279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24551710 - 24551643
Alignment:
Q  27 atatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaata 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  24551710 atatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaattgacatcttaaaaaggtcttggaagaataata 24551643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24646772 - 24646645
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatag-acaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||  | |||    
T  24646772 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtatacaggaccatagaaaaaaatttgacatcttaaataggttttggaagaacaaaagataccaa 24646673  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
     | ||||||| || ||||||||| ||||    
T  24646672 tggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 24646645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29379610 - 29379555
Alignment:
Q  346 aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29379610 aaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaaga 29379555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 92
Target Start/End: Original strand, 45567575 - 45567658
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  45567575 tgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggtctatagacaatatttgacatcttaaattgatcctgaaagaacaa 45567658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2811234 - 2811130
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagct 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| |||  || | ||| || |  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  2811234 taatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttacatcttaaataggttatgaatgaataaaaaagagcaaagaaatcaac-aaaaggaagct 2811136  T
Q  125 taaagc 130  Q
    ||||||    
T  2811135 taaagc 2811130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18680233 - 18680172
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttga 65  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18680233 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaatttga 18680172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 43640228 - 43640139
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  43640228 aaaattgtcaattggatacactaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaacttgacatcctaaattggtattggaagaacaa 43640139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22745685 - 22745594
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagc 271  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  22745685 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagactggaagtgtgaagc 22745594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25164129 - 25164047
Alignment:
Q  319 aagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  25164129 aagagtgttgtcatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcaatttgtgtctctgctacaagacaaga 25164047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 18151378 - 18151530
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||  | ||||| |||||||| ||  |||||    
T  18151378 aaaattgtcaattggatatgctcatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacaacttaaaaag-tcttgaaagaacaagtaaagagca 18151476  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  18151477 aatacatcaacaaaaatggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 18151530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18719401 - 18719340
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttga 65  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  18719401 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaattga 18719340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 363
Target Start/End: Original strand, 33560295 - 33560360
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33560295 gcattggatgctaattcttcaaagagcgttgacataatacgtttgtacgaagtgtacaaccactac 33560360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1745240 - 1745136
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtac-aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 396  Q
    ||||||||||||  | | |||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |   ||||||||    
T  1745240 gcattggatgctaatacttcaaagtgcgttgacatagtacgtctgtacgaaagtgtacaacaactacttccactactctgtttctgtatctactacaaga 1745141  T
Q  397 caaga 401  Q
    |||||    
T  1745140 caaga 1745136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 16681022 - 16681078
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16681022 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 16681078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17702161 - 17702105
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17702161 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 17702105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17914894 - 17914838
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17914894 aaaattgtcaattggatatgataatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaa 17914838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21541402 - 21541315
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttga-cgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaac 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | | |||||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  21541402 taatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaagtttgatcattttaaa-aggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatcaac 21541315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29693752 - 29693696
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29693752 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 29693696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 224
Target Start/End: Original strand, 3598301 - 3598343
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3598301 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaa 3598343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 602451 - 602580
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  ||||||||||| || |||| |    
T  602451 aaaattgtcaattggaattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagaacaaaagagagcta 602550  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    || ||||||| || |||||| || ||||||    
T  602551 aggaatcaacaaaaaggaagtttgaagcgt 602580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19943672 - 19943583
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||  | |||||||||    
T  19943672 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgtttaagtgtacaagaccatagacaaaaacttgacatcttaaataggttctagaagaacaa 19943583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26833067 - 26833034
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26833067 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 26833034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28903917 - 28903808
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||   |   || ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  28903917 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaagttgatcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaa 28903818  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    || |||||||    
T  28903817 aggaatcaac 28903808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 40003643 - 40003534
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||   |   || ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  40003643 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaagttgatcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaa 40003544  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    || |||||||    
T  40003543 aggaatcaac 40003534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2810882 - 2810800
Alignment:
Q  317 caaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  2810882 caaagagcgttgacatagtact-ttgtacgaactgtacaaccacctc-tccactactctgtttttatctctgctacaagacaaga 2810800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 18320907 - 18320963
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18320907 aaaattgtcaattggatatgctaatctttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 18320963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 22461340 - 22461396
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  22461340 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 22461396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 23352803 - 23352859
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  23352803 aaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtatgcatgaccatagacaaaa 23352859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26833491 - 26833435
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  26833491 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 26833435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 33083299 - 33083243
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||    
T  33083299 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtgcaggaccatggacaaaa 33083243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 18772707 - 18772618
Alignment:
Q  290 atttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |   ||| |||||  |||| || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18772707 atttgaaggcattggatgcttattctttggagaacgttggaaaaggacaatagtacaaa-tgtacaaccattacctccactactctttttt 18772618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 23783952 - 23783918
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23783952 taatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaa 23783918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 39696620 - 39696579
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtaca 45  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39696620 aaaattgtcaagtggatatgctaatatttgttcaagtgtaca 39696579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 19707943 - 19707887
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  19707943 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgtaagaccatagacaaaa 19707887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 64
Target Start/End: Original strand, 19956076 - 19956124
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttg 64  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  19956076 tggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaattttg 19956124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 266)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 6490350 - 6490565
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6490350 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaa 6490449  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6490450 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 6490549  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  6490550 tcaacgtctctttcac 6490565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 6501004 - 6501219
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6501004 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaa 6501103  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6501104 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 6501203  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  6501204 tcaacgtctctttcac 6501219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 10655264 - 10655482
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10655264 aagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagattttgcgccttcaagatgggaatgaa 10655363  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10655364 tttgaagattattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttcgacgtgctgattatc 10655463  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10655464 tcaacgtctctttcacgcc 10655482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 10626942 - 10627160
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  10626942 aagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagattctgcgccttcaagatgggaatgaa 10627041  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10627042 tttgaagattattattcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 10627141  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10627142 tcaacgtctctttcacgcc 10627160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 23635944 - 23635726
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635944 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 23635845  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23635844 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 23635745  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23635744 tcaacgtctctttcacgcc 23635726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 12237615 - 12237832
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12237615 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaatagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaa 12237713  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12237714 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 12237813  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12237814 tcaacgtctctttcacgcc 12237832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 12249441 - 12249658
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12249441 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaa 12249539  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12249540 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 12249639  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12249640 tcaacgtctctttcacgcc 12249658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 24706555 - 24706773
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706555 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 24706654  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  24706655 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattctc 24706754  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24706755 tcaacgtctctttcacgcc 24706773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40800246 - 40799858
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagct 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  40800246 taatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaataatagagagcaaagaaatcaacaaaaaggaagct 40800147  T
Q  125 taaagcgt-----gaaaactgctcctgaagaca--aagtgctc-----ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttca 212  Q
    ||||||||     ||||| |||||||||||     | ||  ||     ||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||    
T  40800146 taaagcgtctgaagaaaagtgctcctgaagtggtgacgtcatcagaagctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaagagatgcatcataaagcttca 40800047  T
Q  213 aaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgt 312  Q
    || | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  40800046 aaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagcgaagcaacgactagtttgaaagtatttgaaggaattggatacttgt 40799947  T
Q  313 tcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  40799946 tcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagataaga 40799858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 6220702 - 6220921
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6220702 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 6220801  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6220802 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 6220901  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6220902 ctcaacgtctctttcacgcc 6220921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 9993894 - 9994108
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9993894 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 9993992  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9993993 tttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 9994092  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  9994093 tcaacgtctctttcac 9994108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 19789257 - 19789038
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19789257 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 19789158  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19789157 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgttggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 19789058  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19789057 ctcaacgtctctttcacgcc 19789038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 4174757 - 4174976
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  4174757 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 4174856  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4174857 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 4174956  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4174957 ctcaacgtctctttcacgcc 4174976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 350 - 565
Target Start/End: Original strand, 9380660 - 9380874
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9380660 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaattt 9380759  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctca 549  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | || ||||||    
T  9380760 gaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatctc-aacgactctttagacatgctaatcatctca 9380858  T
Q  550 acgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||    
T  9380859 acgtctctttcacgcc 9380874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 350 - 565
Target Start/End: Original strand, 9391206 - 9391420
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9391206 tgtaccaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaattt 9391305  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctca 549  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || ||||||    
T  9391306 gaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatctc-aacgactctttagacgtgctaatcatctca 9391404  T
Q  550 acgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||    
T  9391405 acgtctctttcacgcc 9391420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 13372670 - 13372889
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  13372670 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 13372769  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13372770 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 13372869  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13372870 ctcaacgtctctttcacgcc 13372889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 13383264 - 13383483
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  13383264 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 13383363  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13383364 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 13383463  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13383464 ctcaacgtctctttcacgcc 13383483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 13393858 - 13394077
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  13393858 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 13393957  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13393958 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 13394057  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13394058 ctcaacgtctctttcacgcc 13394077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 19778620 - 19778401
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19778620 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 19778521  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19778520 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgttggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 19778421  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19778420 ctcaacgtctctttcacgcc 19778401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 23757533 - 23757314
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  23757533 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 23757434  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23757433 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 23757334  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23757333 ctcaacgtctctttcacgcc 23757314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 23768129 - 23767910
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  23768129 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 23768030  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23768029 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 23767930  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23767929 ctcaacgtctctttcacgcc 23767910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 37759905 - 37759686
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  37759905 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 37759806  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37759805 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 37759706  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37759705 ctcaacgtctctttcacgcc 37759686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 39672883 - 39673102
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  39672883 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtatgttcaagatgggaatga 39672982  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39672983 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 39673082  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39673083 ctcaacgtctctttcacgcc 39673102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 11216722 - 11216939
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11216722 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 11216821  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || |||    
T  11216822 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatctc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 11216920  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11216921 tcaacgtctctttcacgcc 11216939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24660135 - 24659919
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  24660135 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 24660036  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24660035 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 24659936  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  24659935 ctcaacgtctctttcac 24659919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 37885813 - 37885597
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  37885813 aagtgtacaaccactacttccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 37885714  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37885713 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 37885614  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  37885613 ctcaacgtctctttcac 37885597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 6180528 - 6180747
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  6180528 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcataatttgtacgttcaagatgggaatga 6180627  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6180628 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcattggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 6180727  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6180728 ctcaacgtctctttcacgcc 6180747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9535842 - 9535628
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535842 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccatgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 9535744  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  9535743 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 9535644  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  9535643 tcaacgtctctttcac 9535628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 9981886 - 9982100
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9981886 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacatctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 9981984  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9981985 tttgaagctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgatcaaaggatttcaaatgactctttagacgtgctgattatc 9982084  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  9982085 tcaacgtctctttcac 9982100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 13121897 - 13121678
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  13121897 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatga 13121798  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13121797 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactccttagacgtgctgattat 13121698  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13121697 ctcaacgtctctttcacgcc 13121678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 13132140 - 13131921
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  13132140 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatga 13132041  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13132040 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactccttagacgtgctgattat 13131941  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13131940 ctcaacgtctctttcacgcc 13131921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 14465826 - 14465607
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  14465826 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatga 14465727  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14465726 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactccttagacgtgctgattat 14465627  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14465626 ctcaacgtctctttcacgcc 14465607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 19887355 - 19887569
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887355 aagtgtacaaccactaactccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 19887453  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19887454 tttgaagctaattcttcaaagtagtacacccaaatcaggcaaacgattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 19887553  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  19887554 tcaacgtctctttcac 19887569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 20673196 - 20673415
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  20673196 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 20673295  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20673296 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 20673395  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20673396 ctcaacgtctctttcacgcc 20673415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 20683781 - 20684000
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  20683781 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 20683880  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20683881 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 20683980  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  20683981 ctcaacgtccctttcacgcc 20684000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 23647983 - 23647764
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  23647983 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 23647884  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23647883 atttgaagcttattcttcaaatgactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 23647784  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23647783 ctcaacgtctctttcacgcc 23647764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 28314232 - 28314451
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  28314232 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 28314331  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28314332 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 28314431  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28314432 ctcaacgtctctttcacgcc 28314451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 504168 - 504384
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  504168 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 504267  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  504268 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 504367  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  504368 ctcaacgtctctttcac 504384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 526534 - 526750
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  526534 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 526633  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  526634 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 526733  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  526734 ctcaacgtctctttcac 526750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 5579634 - 5579850
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  5579634 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 5579733  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5579734 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5579833  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  5579834 ctcaacgtctctttcac 5579850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 5628018 - 5628234
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  5628018 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 5628117  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5628118 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5628217  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  5628218 ctcaacgtctctttcac 5628234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 5865694 - 5865910
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  5865694 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 5865793  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5865794 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5865893  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  5865894 ctcaacgtctctttcac 5865910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 5876293 - 5876509
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  5876293 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 5876392  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5876393 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5876492  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  5876493 ctcaacgtctctttcac 5876509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 12286979 - 12287195
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12286979 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 12287078  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12287079 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 12287178  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  12287179 ctcaacgtctctttcac 12287195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20721348 - 20721132
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  20721348 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 20721249  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20721248 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 20721149  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  20721148 ctcaacgtctctttcac 20721132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 24383519 - 24383735
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  24383519 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 24383618  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24383619 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 24383718  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  24383719 ctcaacgtctctttcac 24383735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24670715 - 24670499
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  24670715 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 24670616  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24670615 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 24670516  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  24670515 ctcaacgtctctttcac 24670499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 35187612 - 35187396
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  35187612 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 35187513  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35187512 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 35187413  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  35187412 ctcaacgtctctttcac 35187396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 37866680 - 37866464
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  37866680 aagtgtacaaccactacctcaactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 37866581  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37866580 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcgggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 37866481  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  37866480 ctcaacgtctctttcac 37866464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 41683913 - 41683697
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  41683913 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 41683814  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41683813 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 41683714  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  41683713 ctcaacgtctctttcac 41683697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 41694482 - 41694266
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  41694482 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 41694383  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41694382 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 41694283  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  41694282 ctcaacgtctctttcac 41694266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 13557809 - 13557590
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13557809 aagtgtacaaccactatctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcatgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 13557710  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13557709 gtttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 13557610  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13557609 ctcaacgtctctttcacgcc 13557590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 28324848 - 28325067
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  28324848 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 28324947  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28324948 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttaaacgtgctgattat 28325047  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28325048 ctcaacgtctctttcacgcc 28325067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 29461214 - 29461431
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29461214 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaa 29461312  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  29461313 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagatgtgctaattatc 29461412  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29461413 tcaacgtctctttcacgcc 29461431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 29472066 - 29472283
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29472066 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaa 29472164  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  29472165 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagatgtgctaattatc 29472264  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29472265 tcaacgtctctttcacgcc 29472283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 12296801 - 12297017
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12296801 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 12296900  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12296901 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgcctctttagacgtgctgattat 12297000  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  12297001 ctcaacgtctctttcac 12297017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 18484280 - 18484060
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  18484280 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 18484181  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18484180 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 18484081  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18484080 tctcaacgtctctttcacgcc 18484060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 38194960 - 38194740
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  38194960 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 38194861  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38194860 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 38194761  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38194760 tctcaacgtctctttcacgcc 38194740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 38205496 - 38205276
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  38205496 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 38205397  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38205396 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 38205297  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38205296 tctcaacgtctctttcacgcc 38205276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 39372289 - 39372069
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  39372289 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 39372190  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39372189 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 39372090  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39372089 tctcaacgtctctttcacgcc 39372069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 39382926 - 39382706
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  39382926 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 39382827  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39382826 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 39382727  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39382726 tctcaacgtctctttcacgcc 39382706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4743972 - 4743754
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  4743972 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 4743874  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4743873 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 4743774  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4743773 ctcaacgtctctttcacgcc 4743754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 5510930 - 5510712
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  5510930 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 5510832  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5510831 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5510732  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5510731 ctcaacgtctctttcacgcc 5510712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 5521108 - 5520890
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  5521108 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 5521010  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5521009 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5520910  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5520909 ctcaacgtctctttcacgcc 5520890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 5537022 - 5537240
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  5537022 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 5537120  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5537121 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5537220  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5537221 ctcaacgtctctttcacgcc 5537240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 7794608 - 7794822
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7794608 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 7794706  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||    
T  7794707 tttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgaaaatcatc 7794806  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  7794807 tcaacgtctctttcac 7794822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 933861 - 933644
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933861 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 933763  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||    
T  933762 tttgaaactaattcttcaaaggactacatccaaatcagacaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacatgctaatcatc 933663  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  933662 tcaacgtctctttcacgcc 933644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 401
Target Start/End: Original strand, 20627197 - 20627606
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20627197 aaaattgtcaattgaatatgccaatatttgttcaagtgtaccggaccatatacaaaatttaacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagcaaa 20627296  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgtg-----aaaactgctcctgaagaca--aagtgctc-----ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcag 191  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||      ||||||||| ||||||     | ||  ||     ||||||||||  ||| | | |||||||||||    
T  20627297 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaacaaaactgcttctgaagtagtgacgtcatcagaagctgaaaatcaccagaagttgcagttcatcag 20627396  T
Q  192 gagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggat 291  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  20627397 gagatgcaacttaaagcttcaaaagatgtttaatggattcaaactcgtctaatgattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaatggat 20627496  T
Q  292 ttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgcta 391  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  20627497 ttgaaggcattggatgcttgtttatcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttatctctgcta 20627596  T
Q  392 caagacaaga 401  Q
    ||||| ||||    
T  20627597 caagataaga 20627606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 8774893 - 8774673
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||||||||||    
T  8774893 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatg 8774794  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8774793 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 8774694  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8774693 tctcaacgtctctttcacgcc 8774673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 8785478 - 8785258
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||||||||||    
T  8785478 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatg 8785379  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8785378 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 8785279  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8785278 tctcaacgtctctttcacgcc 8785258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 5547606 - 5547824
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||    
T  5547606 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctacagaatt-gtacactcaagatgggaatga 5547704  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5547705 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5547804  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5547805 ctcaacgtctctttcacgcc 5547824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 7804519 - 7804733
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804519 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaatacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 7804617  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||    
T  7804618 tttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgcaaatcatc 7804717  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  7804718 tcaacgtctctttcac 7804733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 10099302 - 10099084
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  10099302 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 10099204  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10099203 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 10099104  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10099103 ctcaacgtctctttcacgcc 10099084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 48337475 - 48337261
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48337475 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 48337377  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||   || |||    
T  48337376 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattactggtgaatgatcaaaggattctaaacgactctttagacgtgcaaatcatc 48337277  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  48337276 tcaacgtctctttcac 48337261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 14476458 - 14476237
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  14476458 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacactacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatga 14476359  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgat--t 543  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |    
T  14476358 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactccttagacgtgctgattat 14476259  T
Q  544 atctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14476258 atctcaacgtctctttcacgcc 14476237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 11272383 - 11272600
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  11272383 aagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 11272482  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11272483 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 11272582  T
Q  545 tctcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11272583 tctcaacgtctctttcac 11272600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 28169315 - 28169102
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28169315 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 28169217  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  28169216 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaatgattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 28169118  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  28169117 tcaacgtctctttcac 28169102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 11164063 - 11163846
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11164063 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctacagaatttttgccttcaagatgggaatgaa 11163964  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||  ||    
T  11163963 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctc 11163865  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11163864 tcaacgtctctttcacgcc 11163846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 13261674 - 13261890
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13261674 aagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 13261772  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  13261773 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaagggactc-aacgaatctttagacgtgttaatcatc 13261871  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13261872 tcaacgtctctttcacgcc 13261890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 47207931 - 47207690
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaa-gcattgcaaaagactg 259  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||| || |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  47207931 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgcaacataaaacttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaaagcattgcagaagactg 47207832  T
Q  260 gaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaacca 359  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47207831 gaaaagtgaagcaacggctagtttgaaatgatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacca 47207732  T
Q  360 ctacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47207731 ctacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaaga 47207690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4404506 - 4404290
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  4404506 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagttgggaatgaa 4404408  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||| |  | |||    
T  4404407 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacaactctttagacgtgctattcatc 4404309  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4404308 tcaacgtctctttcacgcc 4404290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4457149 - 4456933
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  4457149 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagttgggaatgaa 4457051  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||| |  | |||    
T  4457050 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacaactctttagacgtgctattcatc 4456952  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  4456951 tcaatgtctctttcacgcc 4456933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 18851693 - 18851909
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  18851693 aagtatacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 18851791  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  18851792 tttgaagctaattctttaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 18851890  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18851891 tcaacgtctctttcacgcc 18851909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4754557 - 4754341
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  4754557 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 4754459  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  4754458 atttgaagtt-atttttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta- 4754361  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4754360 ctcaacgtctctttcacgcc 4754341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 8995957 - 8996170
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  8995957 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaa 8996055  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  ||     
T  8996056 tttgaagtcgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaata 8996154  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  8996155 tcaacgtctctttcac 8996170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 9006509 - 9006722
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  9006509 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaa 9006607  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| | |  |||    
T  9006608 tttgaagtcgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgaatctttagacgtgctaaaaatc 9006706  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  9006707 tcaacgtctctttcac 9006722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 17910003 - 17910217
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17910003 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacatctatgcctgcagaatttatgccttcaagatgggaatgaa 17910101  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | |||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  17910102 tttgaagttaattcctaaaaggacaacacccaaatcaggaaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 17910201  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  17910202 tcaacgtctctttcac 17910217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27883617 - 27883404
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  27883617 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 27883519  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  27883518 tttgaaattgattcttcaaaggactacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaacatc 27883420  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  27883419 tcaacgtctctttcac 27883404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 161 - 528
Target Start/End: Original strand, 47405356 - 47405721
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47405356 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcacgagatgcaacataaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgg 47405455  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47405456 aaaaatgaagcaacaactagtttgaaaggatttgaaggcatttgatgtttgttcttcaaagagtgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccac 47405555  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgatt 459  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||  ||| ||||||  || |||||| |||||||  ||||     
T  47405556 tacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaataggaatgcatttgaaattgatc 47405654  T
Q  460 cttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 528  Q
    ||||| || || | | ||| |||||||||| ||| | |||||  |||||||||   |||||||||||||    
T  47405655 cttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaag--cttcaaacgactct 47405721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 38314933 - 38314719
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  38314933 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatga 38314835  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || ||    
T  38314834 atttgaagctgtttcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcat 38314736  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  38314735 ctcaacgtctctttcac 38314719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 1064372 - 1064159
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  1064372 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 1064274  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  1064273 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 1064175  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    |||| |||||||||||    
T  1064174 tcaaagtctctttcac 1064159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16077163 - 16076950
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | || |||||||||||||||||||    
T  16077163 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagcaat-gttccttcaagatgggaatgaa 16077065  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  16077064 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagaaactc-aacgactctttagacgtgctcaaaatc 16076966  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  16076965 tcaacgtctctttcac 16076950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 181 - 400
Target Start/End: Original strand, 24775489 - 24775708
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  24775489 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactat 24775588  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24775589 tttgaaaggatttgaaggcattgaatgcttattcttcaaagagctttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacatccactactctgtttt 24775688  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  24775689 tgtctctgctacaagacaag 24775708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 164 - 401
Target Start/End: Original strand, 53056665 - 53056902
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaa 263  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  53056665 aaaatcactagaagctgcagttcatcatgggatgcaacttaaggtttcaaaagctgtttaatggattcaacatcgtctaaagattgcagaagactggaaa 53056764  T
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53056765 agtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgtttacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactac 53056864  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  53056865 ctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 53056902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 1794483 - 1794701
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  1794483 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatg 1794581  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |    
T  1794582 aatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatca 1794680  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1794681 tctcaacgtctctttcacgcc 1794701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 1053943 - 1053730
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | || |||||||||||||||||||    
T  1053943 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgtagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 1053845  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  1053844 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaattaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 1053746  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  1053745 tcaacgtctctttcac 1053730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 181 - 399
Target Start/End: Original strand, 46349799 - 46350018
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46349799 cagttcatcaggagaagcaacttaagacttcaaaagttgttcaattgatccaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 46349898  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt-t 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  46349899 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcagagaacattgacaaagtacgattgtacgaagtgtacaaccactgcctccactactatgttct 46349998  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  46349999 ttgtctctgctacaagacaa 46350018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2561393 - 2561172
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2561393 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaacta 2561294  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561293 ttttgaaaggatttgaagaaattggatgcttgttcttcaaagatcgttgacaaagtacaagtgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 2561194  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  2561193 ttgtctctgctacaagacaaga 2561172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 1784071 - 1784289
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtctacgctacaagacaagaca-acagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  1784071 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaaacacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatg 1784169  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |    
T  1784170 aatttgaagttaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatca 1784268  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1784269 tctcaacgtctctttcacgcc 1784289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2785268 - 2785049
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  2785268 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactatt 2785169  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctc-aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2785168 ttgaaaggatttgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-att 2785070  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  2785069 tgtctctgctacaagacaaga 2785049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 49642716 - 49642937
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  49642716 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatagatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgacta 49642815  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49642816 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgattgttcttttaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 49642915  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  49642916 gtgtctctgctacaagacaaga 49642937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11223767 - 11223548
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| || || |  ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  11223767 cagttcatcaggagatacaactttgagcttcaaaagctgttcaatgggttcaatctcgtctatgcattgcagaagactgaaaaagtgaagcaacgactat 11223668  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  11223667 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtatgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctg-ttt 11223569  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  11223568 tgtctctgctacaagacaaga 11223548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14955631 - 14955412
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||     
T  14955631 cagttcatcaggagatgtaactcaaagcttcaaaagctgtttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaggtaaagcaacaactat 14955532  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14955531 tttgaaagtatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttt 14955433  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | |||  ||||||||||||||    
T  14955432 tatctctgctacaagacaaga 14955412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14581372 - 14581158
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14581372 aagtgtacaaccactacctccactaccctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaatttgttccttcaagataggaatgaa 14581273  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  14581272 tttgaagttaattcttcaaaggacttcatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 14581174  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  14581173 tcaacgtctctttcac 14581158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 184 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28582309 - 28582106
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  28582309 ttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctatgcattgcagaagattggaagagtgaagcaacgactatt 28582210  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28582209 ttgaaaggatttaatggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaaatacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagttttt 28582110  T
Q  382 gtct 385  Q
    ||||    
T  28582109 gtct 28582106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 8740128 - 8740340
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  8740128 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgct-ccttcaagatgggaatgaa 8740226  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||| | |  |||    
T  8740227 tttgaagttgatccttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaacac-aacgactc-ttagacgtgctaaaaatc 8740324  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  8740325 tcaacgtctctttcac 8740340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 2246601 - 2246393
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| || | || |||||||||| ||||||||    
T  2246601 aagtgtacaactactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcataaat-gttccttcaagataggaatgaa 2246503  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  2246502 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 2246404  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  2246403 tcaacgtctct 2246393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6090937 - 6090716
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||| | || | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  |||    
T  6090937 agttcatcaggagatgcaagacttaaaacttcaaaggttgctcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacatcta 6090838  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6090837 atttgaaaggatttgaaggcattgaatgcttgttctttaaaaagctttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 6090738  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||| ||||||||||    
T  6090737 ttgtctctgctgcaagacaaga 6090716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 347 - 515
Target Start/End: Original strand, 16666128 - 16666295
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  16666128 aagtgtacaaccactacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagatgtgaatgaa 16666226  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggat 515  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16666227 tttgaagttgattcttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggat 16666295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 177 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22140972 - 22140748
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| || ||||  || |||| ||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||    
T  22140972 gctacagttcatcaggagatgcaacttaaagtttcaaaagctgttcaacggattcaaactcgcctaaggattgcagaagactagataagtgaaccaacga 22140873  T
Q  277 ctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    ||| |||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22140872 ctattttgaagggttttgaaaacattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacatagtacgtatgtacgaagtgtataaccactacctccactactctg 22140773  T
Q  377 tttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  22140772 tttttgtctctgctacaagacaaga 22140748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 18121576 - 18121797
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||| | |||| || ||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18121576 agttcatcaggagatgcaagatttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtttgagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaacta 18121675  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18121676 ttttgaaaggatttaaaggcattgaatgctttttcttcaaagagcgtttacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtgt 18121775  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  18121776 ttgtctctgctacaagacaaga 18121797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 401
Target Start/End: Original strand, 38177605 - 38177818
Alignment:
Q  190 aggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaa 287  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| | |||| || | || ||||||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  38177605 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatgaatttaatctcgtctgagcaatgcagaagattggaagagtgaagcaacaactattttgaaa 38177704  T
Q  288 ggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      
T  38177705 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgactct 38177804  T
Q  388 gctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||    
T  38177805 gctacaagacaaga 38177818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 13199243 - 13199453
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt--gtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  | |||||||||| ||||||    
T  13199243 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgat-ccttcaagataggaatg 13199341  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |    
T  13199342 aatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaa 13199440  T
Q  545 tctcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||||    
T  13199441 tctcaacgtctct 13199453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37467538 - 37467318
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| |||||||   |||| || |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37467538 agttcatcaggagatgcaaaacttaaatcttcaaagcttgttcaatggatttaatctcatctaagcattgtagaagactggaagagtgaagcaacgacta 37467439  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  37467438 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacccagttt 37467339  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  37467338 gtgtctctgctacaagacaag 37467318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 17281434 - 17281648
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||  ||| ||||||| |||  ||||||    
T  17281434 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctatacctgcagaa-atgttccttcaaaatgaaaatgaa 17281532  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg-ttgattat 545  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || |  |  ||    
T  17281533 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatctggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacatgctaaaaaat 17281631  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  17281632 ctcaacgtctctttcac 17281648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 205 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41495179 - 41494983
Alignment:
Q  205 aagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattgg 304  Q
    |||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41495179 aagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaaacattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattgg 41495080  T
Q  305 atgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  ||||||||| ||||    
T  41495079 atgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtatctgctacaagataaga 41494983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 16671163 - 16671376
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  16671163 aagtgtacaaccactacctccactacttttctcttgtccacactacaagacaagacaacagctctgcctgtagaatt-gttccttcaagatgtgaatgaa 16671261  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  16671262 tttgaagttgattcttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 16671360  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||| ||||||||||    
T  16671361 tcaacatctctttcac 16671376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 398
Target Start/End: Original strand, 49553443 - 49553661
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||||| | |||||||  ||| |||  |||||||||||||||| |||| || || |||||||||  |||||    
T  49553443 agttcatcaggagatgcaagacttaaagtttcaaaggctgtttaatagatttaacatcgtctaagcattgcagaagattgaaagagtgaagcagtgacta 49553542  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49553543 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttcttcagagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctattt 49553642  T
Q  380 ttgtctacgctacaagaca 398  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  49553643 ttgtctctgctacaagaca 49553661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 12726184 - 12726405
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||||||||| | | || || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  12726184 agttcatcaggagattcaagacttaaagcttcaaaggctattcaatggattcaatctcgtctaagctttgcagaagactagaagagtgaagtaacgacta 12726283  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726284 ttttgaaaggatttgaaagcattggatgcttactctttaaagagagttaacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 12726383  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  12726384 ttgtctctgctacaagacaaga 12726405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 18142706 - 18142927
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||| | | || || ||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18142706 agttcatcaggagatgcaagatttaaagcttcaaaggctattcaatggattcaatctcgtttgagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaacta 18142805  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18142806 ttttgaaaggatttaaaggcattgaatgctttttcttcaaagagcgtttacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtgt 18142905  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  18142906 ttgtctctgctacaagacaaga 18142927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 347 - 512
Target Start/End: Original strand, 16391615 - 16391780
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  16391615 aagtatacaaccactatctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatgtgtaccctcaagatgggaatgaa 16391714  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaag 512  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16391715 tttgaagcttattcttcaaatgagtacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaag 16391780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29855614 - 29855393
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaa-gtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| ||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  29855614 cagttcatcatgggatgcaacttaagacttcaaaagctgtttaatggattcaacctcgtctaaagattgcagaagactaaaaaaagtgaagcaacggcta 29855515  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855514 gtttgaaagaatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaaaagcgttgacagagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 29855415  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    || |||  ||||||||||||||    
T  29855414 ttatctctgctacaagacaaga 29855393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 231 - 418
Target Start/End: Original strand, 13780589 - 13780777
Alignment:
Q  231 taatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgac 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  13780589 taatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttatttgaagagcgttgac 13780688  T
Q  331 aaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgca 418  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  13780689 aaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccacgactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctttgcctgca 13780777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5213779 - 5213562
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||| |||  |||||| ||||||||||||||  |||||| |||| |    
T  5213779 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtataaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacaactatt 5213680  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5213679 ttggaaggatttgaaggcattagatgcttattattcaaa-agcgttgacgtagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttt 5213582  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5213581 gtctatgctacaagacaaga 5213562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13948538 - 13948321
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  13948538 tcatcaggagatgcaagacttaaagcgtcaaaggatgttcaattgatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaatagtgaagcaacgactattt 13948439  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| | || ||    
T  13948438 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccattactcaggttgtg 13948339  T
Q  383 tctacgctacaagacaag 400  Q
    |||   ||||||||||||    
T  13948338 tctctactacaagacaag 13948321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33583434 - 33583214
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagg-atctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    ||||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||| | || ||  || || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||     
T  33583434 agttcatcagaggatgcaacttaaggcttcaaaagttgttttatgggattcaaccttgtctaaggattgtagaagactggaaaagtgaagcaacggctat 33583335  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctc-aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  33583334 tttgaaaggatttgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccaatactct-att 33583236  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  33583235 ttgtctctgctacaagacaaga 33583214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 403 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 16386251 - 16386096
Alignment:
Q  403 aacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgg 502  Q
    ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16386251 aacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaatttgaatctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgg 16386153  T
Q  503 atgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctcttt 559  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16386152 ataatcaaaggatttcatacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 16386096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 14392958 - 14393179
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||| ||||||| |||  || |||| |||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||    
T  14392958 agttcattaggagatacaagacttaaagtttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaagagtgaaacaacgacta 14393057  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  14393058 ttttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacttagttt 14393157  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  14393158 gtgtctctgctacaagacaaga 14393179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 29933559 - 29933748
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  29933559 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaatagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 29933657  T
Q  447 tttgaagct-gattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||  | ||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29933658 tttgaacttcgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 29933748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 29982713 - 29982902
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  29982713 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaatagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 29982811  T
Q  447 tttgaagct-gattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||  | ||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29982812 tttgaacttcgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 29982902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 52920610 - 52920390
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||||| | || | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  52920610 agttcatcaggagatgcaagacttaaagtttcaaaggctgctcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacaacta 52920511  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  52920510 attt-aaagtatttgaaggcatttgatgcttgttctttaaagagcgttgacaaattaaaattgtacgaagtatacaaccactacctctactaccctgttt 52920412  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  | ||||||||||||    
T  52920411 ttgtctctgatacaagacaaga 52920390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20646360 - 20646138
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaaga-tgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||  |||| || | || | |||||||| |||||||| | |||||  ||| |||||||||||| ||    
T  20646360 agttcatcaggagatgcaagacttaaagctttaaaaggctgttcaatgtatttcatctcgtccaagcattgtagaagaccagaagagtgaagcaacgtct 20646261  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20646260 attttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtt 20646161  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | |||||  ||||||||||||||    
T  20646160 tgtgtctctgctacaagacaaga 20646138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 401
Target Start/End: Original strand, 46796317 - 46796542
Alignment:
Q  166 aatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaag 265  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  46796317 aatcacaagaagctgcagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttaaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaag 46796415  T
Q  266 tgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacct 365  Q
    |    ||||| |||||||||||||         |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  46796416 tattacaacggctaatttgaaagg---------cattagatacttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatct 46796506  T
Q  366 ccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  46796507 ccactactttgtttttgtctctgctacaagacaaga 46796542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 182 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14969532 - 14969341
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||| |||| ||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  14969532 agttcatgaggatatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtaaagcaacaacta 14969433  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccacta 371  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14969432 ttttgaaaggatttgatggcattggatgcttattcttcaaatagcgttgacaaagtacatttttacgaagtgtacaaccactatctccacta 14969341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 204 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13824250 - 13824091
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13824250 aaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaaacaatgaagaagactggaagagtgaagcaacaactattttgaaatgatttgaaggcattg 13824151  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13824150 gatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactac 13824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16476513 - 16476343
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt-ttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||  ||||||||||    
T  16476513 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttcttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaccatgggaatga 16476414  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatt 516  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||||| |||||   |||||||| |||| ||||||    
T  16476413 atttgaagcttatccttcaaaggactacaccccaaacaggcacaggatccttggtggataatcacaggatt 16476343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 29906181 - 29906369
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||| |||||| |    
T  29906181 aagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatt-ttccttcaagataggaatgga 29906279  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29906280 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 29906369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 29947346 - 29947534
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||| |||||| |    
T  29947346 aagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatt-ttccttcaagataggaatgga 29947444  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29947445 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 29947534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 29996500 - 29996688
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||| |||||| |    
T  29996500 aagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatt-ttccttcaagataggaatgga 29996598  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29996599 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 29996688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 266 - 399
Target Start/End: Original strand, 25398295 - 25398428
Alignment:
Q  266 tgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacct 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25398295 tgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattgcatatttgctcttcaaagagcgttgacaaagcacaattgtacgaagtgtacaaccactacct 25398394  T
Q  366 ccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25398395 ccactactctgtttttgtctctgctacaagacaa 25398428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 231 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31303540 - 31303371
Alignment:
Q  231 taatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgac 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |  ||||||||||||    
T  31303540 taatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaaggaacaactattttgaaaggatttgaagacatttgatgtttgttctttgaagagcgttgac 31303441  T
Q  331 aaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  31303440 aaagtacaattgtacgaagtgtacaacaactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 31303371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 271 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16032639 - 16032511
Alignment:
Q  271 caacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccact 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16032639 caacgactattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccact 16032540  T
Q  371 actctgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||    
T  16032539 actctgtttttgtctctgctacatgacaa 16032511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 181 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21641070 - 21640867
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||  || |||| ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| |||     
T  21641070 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcctcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgcctaag-attgtagaagactggaaaagtatagcaacggctat 21640972  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21640971 tttggaaggattgaaaagcattggatgcttatttttcaaagagcgttgacatagtacgtttttacgaagtgtacaaccactatctccactactctatttt 21640872  T
Q  381 tgtct 385  Q
    |||||    
T  21640871 tgtct 21640867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11869527 - 11869361
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  11869527 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 11869428  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  11869427 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctaaagaaaactgctcctgaagacagagcgctcatgaa 11869361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 12963039 - 12963260
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||  | |||| || |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  12963039 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaagggttgttcaagggatttaatcttgtctaagcaatgcagaagactgggagagtgaagcaacaacta 12963138  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  12963139 ttttagaaggttttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagtgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtat 12963238  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  12963239 gtgtctctgctacaagacaaga 12963260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15903399 - 15903198
Alignment:
Q  187 atcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttg 284  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || ||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  15903399 atcaggagatgcaagacttaaagcttcaaacgctgttcaatggattcaatctcgtctaagcattacagaagactagaagagtgaagcaacgactattttg 15903300  T
Q  285 aaaggatttgaaggcattggatgc-ttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||    
T  15903299 aaaggatttgaaagcattgcatgctttgttctttgaagagcattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacaactatctccactactcagtttgtgt 15903200  T
Q  384 ct 385  Q
    ||    
T  15903199 ct 15903198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 16658572 - 16658793
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  ||  || ||||||| | |||| ||  |||  ||||||||| ||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  16658572 agttcatcaggagatgcaagacttgaaacttcaaaggttgttcaattgattcaatctcgtccaagcattacaaaagaccagagcagtgaagcaacgacta 16658671  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16658672 ttttgaaaggatttgaaagcattggatgcttattctttgaagagcgttgacataatacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactacttagttt 16658771  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  16658772 gtgtctctgctacaagacaaga 16658793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 373
Target Start/End: Original strand, 17238884 - 17239069
Alignment:
Q  190 aggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaa 287  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| | || | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  17238884 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgatcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcatcgactattttgaaa 17238983  T
Q  288 ggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactact 373  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17238984 ggatttgaaagcattggatgattgttctttgaatagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 17239069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 47208151 - 47207985
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47208151 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacagaaccatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtattggaagaacaatagagagcaaa 47208052  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
      ||||||| || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47208051 tgaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 47207985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Original strand, 53056460 - 53056612
Alignment:
Q  19 atatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaaga- 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| || |     
T  53056460 atatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaaaagcaaaggaatcaacaaaaag 53056559  T
Q  118 ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53056560 ggaagcttaaagcgtttgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 53056612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 204 - 379
Target Start/End: Original strand, 29951416 - 29951591
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | | || || |||| ||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29951416 aaagcttcaaaggtttttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagaccagaggagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattg 29951515  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29951516 gatgcttgttctttgaagagagttaacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatctccaccactcagttt 29951591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 204 - 379
Target Start/End: Original strand, 30000570 - 30000745
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | | || || |||| ||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30000570 aaagcttcaaaggtttttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagaccagaggagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattg 30000669  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  30000670 gatgcttgttctttgaagagagttaacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatctccaccactcagttt 30000745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11869292 - 11869130
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||  ||||||| | ||  ||||||||||||| | | || ||||||||    
T  11869292 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaggggatgcaacttaaggcttcaaaatttgtttaatgaattcaatctcgtctaagaaatacagaagactgg 11869193  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagag 323  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11869192 aaaagtgaagcaacgtctagtttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagag 11869130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 453
Target Start/End: Original strand, 12567271 - 12567376
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12567271 aagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-ttgttccttcaagatgggaatgaa 12567369  T
Q  447 tttgaag 453  Q
    |||||||    
T  12567370 tttgaag 12567376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 453
Target Start/End: Original strand, 15216341 - 15216446
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  15216341 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaa 15216439  T
Q  447 tttgaag 453  Q
    |||||||    
T  15216440 tttgaag 15216446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 15651071 - 15651259
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  15651071 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaattttt-ccttcaaaataggaatgaa 15651169  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  15651170 tttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 15651259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 15662706 - 15662914
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  15662706 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaattttt-ccttcaaaataggaatgaa 15662804  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| | |  |||    
T  15662805 tttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgaccctttagacgtgctaaaaatc 15662903  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  15662904 tcaacgtctct 15662914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 21736344 - 21736136
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||    
T  21736344 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaatt-gttcccacaagataggaatgaa 21736246  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||||| | |  |||    
T  21736245 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgacactttagacgtgctaaagatc 21736147  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  21736146 tcaacgtctct 21736136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 51341108 - 51340886
Alignment:
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51341108 atttgaaaggaattgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacga--------agtgtacgaccactacctccactactctgttt 51341017  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacaccca 478  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||  |||| ||||| ||||| ||| |||    
T  51341016 ttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcccgcagaa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcatagtacaacaacca 51340918  T
Q  479 aatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    ||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  51340917 aatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 51340886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11223983 - 11223822
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaat 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| |||    
T  11223983 tgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaataataaagagcaaaggaat 11223884  T
Q  109 caacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||| || |||||| ||||||| |     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11223883 caacaaaaaggaagtttaaagcatctgaagagaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 11223822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20725267 - 20725092
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  20725267 aaagcttcaaaggctgttcaaaagatctaatcacgtcta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactaattcaaaaggatttgaagacattg 20725169  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  20725168 gatgcttgtttcttgaagagcgttgaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaataactatctccactactctgtttt 20725092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 400
Target Start/End: Original strand, 21636634 - 21636844
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagga-tctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||   |||||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  21636634 cagttcatcaggagttggaacttaaagcttcaaaagctgtttcaaggactctaa-ctcgcctagaaattgcagaagactggaaaagtatggcaacgacta 21636732  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||| |         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21636733 ttttgaaatg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgttt 21636823  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  21636824 ttgtctctgctacaagacaag 21636844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 50300659 - 50300493
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  50300659 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacaagactttagacaaaatttgacatcttaaaaaggttttggaagaacaataaagagcaaa 50300560  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||     ||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  50300559 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactactcctgaagataaggcgctcctgaa 50300493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 21605618 - 21605829
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagga-tctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||   |||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  21605618 cagttcatcaggagatggaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggactctaa-ctcgcctagaaattgcagaagactggaaaagtatgacaacgacta 21605716  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||| |         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21605717 ttttgaaatg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacataatacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 21605807  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  21605808 ttgtctctgctacaagacaaga 21605829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 49666370 - 49666580
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||     
T  49666370 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtataacaacgactat 49666468  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||  ||| ||         | ||| ||||||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  49666469 tttgaaaggattgaaagaca---------tattcttcaaagagcattgacatattacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgattc 49666559  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  49666560 tgtctctgctacaagacaaga 49666580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28582549 - 28582382
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||  |||  |||||||||||||| ||| ||    
T  28582549 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgaaatcttaaaaaggttctggaagaacaatagagagtaa 28582450  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28582449 agaaatcaacaaaaaggaagcttaaaacgtctgaagagaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 28582382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29855868 - 29855701
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||  || ||||    
T  29855868 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaattcgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagaacaaa 29855769  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29855768 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 29855701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 280 - 421
Target Start/End: Original strand, 11909078 - 11909220
Alignment:
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11909078 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtctttacgaagtgtacgaccactacctccactactttgttt 11909177  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaa 421  Q
     |||||| | ||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  11909178 atgtctatgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 11909220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 385
Target Start/End: Original strand, 12388851 - 12389031
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| |||||  ||||| | |||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  12388851 aaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcatgtcta-gaattgcagaagatcagaacagtgaagctacgactaattcaaaagaattttaaggcattg 12388949  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    ||||||| ||| |  |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12388950 gatgcttcttctttgaagagcgttggcaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 12389031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 369
Target Start/End: Original strand, 19888893 - 19889088
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaaga-tgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaa 273  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  || ||||||| |||||| |||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  19888893 gctaaagttcatcaagagatgcaagacttaaagcttaaaaagactgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagatgagtgaagcaa 19888992  T
Q  274 cgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccac 369  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||  |||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19888993 cgactattttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaataggattgacatattacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccac 19889088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 50300372 - 50300245
Alignment:
Q  236 tcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaa-gagcgttgacaaag 334  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  50300372 tcgtctaaggattgcagaagactggaaaagtgaagcaactgcta-tttgaagggatttgaacgcattggatgtatgttcctcaaaagagcgttgacaaag 50300274  T
Q  335 tacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  50300273 tacgtttgtacgaagtgtacaaccactac 50300245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 399
Target Start/End: Original strand, 30054181 - 30054390
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||  || |||| ||||  |||||| |||||| |||||||  |||||||||||     
T  30054181 cagttcatcaggagatgcaattcaaagcttcaaaagctgtttcaagaattcaaactcgcctaaa-attgcagaagacttgaaaagtatagcaacgactac 30054279  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaa-gagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    |||||||||         |||||| ||||| |||  |||| ||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30054280 tttgaaagg---------cattgggtgcttattcaacaaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaaatgtacaaccactaactccactactctgttt 30054370  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  30054371 ttgtctctgctacaagacaa 30054390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 47405169 - 47405336
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || || |||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  47405169 aaaattgtcaattagatatgctaatatctgttcaagtgtatatgactatagaaaaaaattaacatcttaaaaacgtcttggaagaacaatagagagcaaa 47405268  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47405269 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaaagtgctcctgaa 47405336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 316 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11868338 - 11868253
Alignment:
Q  316 tcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  11868338 tcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaaaacaaga 11868253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15851092 - 15850884
Alignment:
Q  295 aaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaa-ccactacctccactactctgtttttgtctacgctaca 393  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15851092 aaggcattggatgcttgtccttcaaagagagttgacaaagtac--------aaagtgtacaaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctaca 15851001  T
Q  394 agacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaagga 492  Q
    ||||||| | || |||  ||||| |||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||    
T  15851000 agacaagaaaaatagctctgcctccagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaaga 15850902  T
Q  493 ttactggtggatgatcaa 510  Q
    | | |||||  |||||||    
T  15850901 tcattggtgattgatcaa 15850884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 10529389 - 10529243
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggga 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  10529389 gtacgaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatagga 10529291  T
Q  442 atgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    ||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  10529290 atggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 10529243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 31113987 - 31114175
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||| | ||||||      
T  31113987 aagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctgcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagttaggaatggt 31114085  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  31114086 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattaatgttgaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtg 31114175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 264 - 401
Target Start/End: Original strand, 22804061 - 22804198
Alignment:
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||     
T  22804061 agtgaagcaacggctattttgaaaggacttgaaggcattcgatgattgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtaaaaccactat 22804160  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||  ||| |||||  |||||| |||||||    
T  22804161 ctccactactcaatttgtgtctctgctacaggacaaga 22804198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15833486 - 15833281
Alignment:
Q  295 aaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaa 394  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15833486 aaggcattggatgcttgtccttcaaagagagttgacaaagtac--------aaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaa 15833395  T
Q  395 gacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggat 493  Q
    |||||| | ||||||  |||||||||||  ||| ||||||  || |||||  |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| |||    
T  15833394 gacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttca--ataggaattgatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagat 15833298  T
Q  494 tactggtggatgatcaa 510  Q
     | |||||  |||||||    
T  15833297 cattggtgattgatcaa 15833281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14955900 - 14955733
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  14955900 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacagaaaaatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 14955801  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||| ||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  14955800 gaaattaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgcagataaagcgctcctgaa 14955733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31303831 - 31303664
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | |  ||||||||||| || ||||||    
T  31303831 aaaattgtcaattgaatatgttaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgacatcttaaatagtttctggaagaacaaaagagagcaa 31303732  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |  ||||||| || |||||||||||||| |     || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31303731 aagaatcaacaaaaaggaagcttaaagcatctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgctcctgaa 31303664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 2028729 - 2028640
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2028729 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaattggtcttggaagaacaa 2028640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 350 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27173063 - 27172900
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccacta-ctctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatt 448  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  27173063 tgtacaaccacgacctccacgaactctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcaga-tttgttctttcaagataggaatgaatt 27172965  T
Q  449 tgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagg 513  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  27172964 tgaagttaattcttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaagattaatggtgaaagatcaaagg 27172900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 40851404 - 40851316
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40851404 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaa 40851316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Original strand, 9700108 - 9700211
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9700108 gcattggatgcttattcctcaaggagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtataaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagac 9700207  T
Q  398 aaga 401  Q
    ||||    
T  9700208 aaga 9700211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Original strand, 14321683 - 14321742
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14321683 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 14321742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 17961545 - 17961419
Alignment:
Q  387 cgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggc 486  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||    
T  17961545 cgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcaga-tttgttccttcaagatagcaatgaatttgaagttgattatgcaaaggactgcatccaaatcaggc 17961447  T
Q  487 aaaggattactggtggatgatcaaagga 514  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  17961446 aacagatcactggtggatgatcaaagga 17961419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 18006490 - 18006364
Alignment:
Q  387 cgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggc 486  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||    
T  18006490 cgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcaga-tttgttccttcaagatagcaatgaatttgaagttgattatgcaaaggactgcatccaaatcaggc 18006392  T
Q  487 aaaggattactggtggatgatcaaagga 514  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  18006391 aacagatcactggtggatgatcaaagga 18006364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22141185 - 22141018
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||   ||||||||||||||||   |||||||    
T  22141185 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgatatcttgaaaaagtcttggaagaacaattaagagcaaa 22141086  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||| ||     |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  22141085 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagtgtctgaagaaaactgctcctgaagttaaagcgctcctgaa 22141018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33583698 - 33583537
Alignment:
Q  10 gtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaat 108  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  33583698 gtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaaattgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaaggaat 33583599  T
Q  109 caacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||| || |||||| ||||| | |     |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  33583598 caacaaaaaggaagtttaaaacatatgaagaaaactgctcctgaagataaggcgctcctgaa 33583537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33598318 - 33598157
Alignment:
Q  10 gtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaat 108  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  33598318 gtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaaattgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaaggaat 33598219  T
Q  109 caacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||| || |||||| ||||| | |     |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  33598218 caacaaaaaggaagtttaaaacatatgaagaaaactgctcctgaagataaggcgctcctgaa 33598157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 401
Target Start/End: Original strand, 12752682 - 12752795
Alignment:
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  12752682 atttgaaaggaattgaaggcattggatacttatccttcaaagagcgttgacaaagtac--------aaagtgtacgaccactatctccacaactctgttt 12752773  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  12752774 atgtctacgctacaagacaaga 12752795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Original strand, 1728087 - 1728190
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1728087 gcattggatgcttattcctcaaggaacattgacatagtgcgtttgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgctacaagac 1728186  T
Q  398 aaga 401  Q
    ||||    
T  1728187 aaga 1728190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 40851167 - 40850990
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagga-tctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacg 275  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| |||   |||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  40851167 gctacagttcatcaggagatggaacttaaagcttcaaaagctggttcaaggactctaa-ctcgcctagaaattgcagaagactggaaaagtatggcaacg 40851069  T
Q  276 actaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||| ||||||| |         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  40851068 actattttgaaatg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtatgtttgtacgaagtgtacaaccactac 40850990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 41045778 - 41045640
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||| | |||||| ||||    
T  41045778 tgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagttaggaatggattt 41045680  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||  |||| ||||| || || ||| |||||||| |||||    
T  41045679 gaacttgatccttcataggacaacatccaaatcatgcaaa 41045640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 485
Target Start/End: Original strand, 51989144 - 51989282
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||     
T  51989144 aagtgtacaaccactacctccacgaatctgtttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgg 51989242  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcagg 485  Q
    |||||||  |||||||| | || || ||| ||||||||||    
T  51989243 atttgaacgtgattctttataggacaacatccaaatcagg 51989282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2561622 - 2561449
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaataggga---- 98  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||| ||        
T  2561622 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgatcatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaatagagagcaa 2561523  T
Q  99 --gcaaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
      |||||  ||||||| || ||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2561522 atgcaaatgaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaactgctcctgaagacaaagtgctcttgaa 2561449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5216431 - 5216262
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||    
T  5216431 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtccaggactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagca 5216332  T
Q  102 aagaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || ||| ||||||||||| |     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5216331 aatacatcaacaaaaaggaaagcttaaagcttctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 5216262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 24775216 - 24775380
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatag--ggagca 101  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||  ||||||||||| ||   |||||    
T  24775216 aaaattgtcaattgaatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagaaaaaatttgatatcttaaaaaggtactggaagaacaaaagtaagagca 24775315  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctc 160  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||||||||     ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  24775316 aaggaatcaacaaaaatggaagcttaaagcgtttgaagaaaaatgctcctgaagataaagcgctc 24775380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 49666113 - 49666202
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  49666113 aaaattgtcaattggatattctaatattttttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaaatggtcttggaagaacaa 49666202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 372
Target Start/End: Original strand, 19249391 - 19249558
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  19249391 aaagcttcaaaggttgttcaaacgatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacagctaattcaaaaggatttgaaggcattg 19249489  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactac 372  Q
    |||| |||||| |  ||||||| ||| | || || ||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  19249490 gatgtttgttctttgaagagcgctgaaataggacaattgtacgaagtgtacaaccacttactccactac 19249558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 343 - 510
Target Start/End: Original strand, 45861689 - 45861856
Alignment:
Q  343 tacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac-aagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggga 441  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||  ||| ||||||  || |||    
T  45861689 tacaaagtgtacgaccactacctccactactatgtttatgtctacgctacaagacaaaaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaatagga 45861787  T
Q  442 atgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    ||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  45861788 atggatttgaacttgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 45861856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 366 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 49990280 - 49990084
Alignment:
Q  366 ccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttca 464  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||    
T  49990280 ccactactctgcttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcagaaat-gttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttca 49990182  T
Q  465 aagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttca-aacgactctttagacgtg-ttgattatctcaacgtctctttcac 562  Q
     || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||  ||||| ||||||||| | |||||| || |  ||||||||| |||||||||    
T  49990181 taggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaag--tttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctttcac 49990084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 46349545 - 46349672
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  46349545 aaaattgtcaattagatatgctaatatttgttcaagtgtacaggattataaacaaaatttaacatcctaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 46349644  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagc 130  Q
    | ||||||| || | |||||||||||||    
T  46349645 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagc 46349672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2785536 - 2785371
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  2785536 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacag---tatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagcaa 2785440  T
Q  103 agaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | | |||||| || | |||||||||||||||     |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  2785439 atacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgttcctgaagataaagcgctcatgaa 2785371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 49553205 - 49553335
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagg-gagca 101  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||    
T  49553205 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgacatcttaaataagttctggaagaacaacaggagagca 49553304  T
Q  102 aagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    ||  ||||||| || ||||||||| ||||||    
T  49553305 aatgaatcaacaaaaaggaagcttgaagcgt 49553335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 13148309 - 13148141
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||| |||||||||||| || ||||  | ||||||||||| || |||||||||| ||    
T  13148309 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactatgcgtgcgtctacgatacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaatt-gttccttcaagatagg 13148211  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  13148210 aatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 13148141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 30053974 - 30054063
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa-atttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  30053974 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagacaaatatttgatatcttaaattagtcttgaaagaacaa 30054063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17022070 - 17021990
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagccttgcctgcagaa 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  17022070 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa 17021990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21606473 - 21606389
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactata-gacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  21606473 tgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactataggaaaaaatttgacatcttaaaatggtcttggaataacaa 21606389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22151289 - 22151142
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| | |||||||| ||    
T  22151289 gtacaaagcgtacaaccactacctccacgattctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttctttcaagatagg 22151191  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| |  || ||| ||||||||||||||    
T  22151190 aatggatttgaacgtgatccttcataagacaacatccaaatcaggcaaa 22151142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Original strand, 45858803 - 45858875
Alignment:
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  45858803 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtctgtacgaagtgt 45858875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6091174 - 6091047
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  6091174 aaaattgtcaattgcatattctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaa 6091075  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
     ||||||||| || | ||||||| ||||    
T  6091074 tgaaatcaacaaaaatgaagcttgaagc 6091047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12968446 - 12968311
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||| |||||| |||   ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |  |||| |||||  |||| || ||| ||    
T  12968446 cattgcagaagactagaagcatgaagtaacgactaattcaaaagaatttgaaggcattggatacttattctttgaagaacgttggaaaaggacaattata 12968347  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12968346 cgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 12968311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 92
Target Start/End: Original strand, 21605357 - 21605448
Alignment:
Q  2 ttaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  21605357 ttaaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagcgtacaagactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggatgaacaa 21605448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 52920847 - 52920720
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||  |||  ||||||||||| || |||| |    
T  52920847 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggatcatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaaaagagagcta 52920748  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || ||||||||| ||||    
T  52920747 aggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 52920720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 1727741 - 1727811
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaa 74  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1727741 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaatatttgacatcttaaa 1727811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15833835 - 15833747
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||    
T  15833835 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaagtctatagacaaaatttgatatcttaaattgatcctgaaagaacaa 15833747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15851381 - 15851293
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||    
T  15851381 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggtttatagacaaaatttgatatcttaaattgatcctgaaagaacaa 15851293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20646596 - 20646468
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  || | | | |||  | ||||||||| || |||||||    
T  20646596 aaaattgtcaattggatatgctaatattttttcaagtgtacaggaccatagacaaaatttgatatcattattaggttctagaagaacaaaagagagcaaa 20646497  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    | ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  20646496 ggaatcaacaaaatggaagcttaaagcgt 20646468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 23538185 - 23538312
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||| |||||||||| | |||| |||||  || ||  |||| |||||||||||||| |||||| ||| | | ||| |||||| |||| || ||||||    
T  23538185 cattgcagaagactggaagaatgaaacaacggttatttcaaaagaatttgaaggcattgaatgcttattctttagagaacgttgaaaaaggacaattgta 23538284  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactac 372  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||    
T  23538285 cgaagtgtacaaccactatctccactac 23538312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 380
Target Start/End: Original strand, 26417706 - 26417833
Alignment:
Q  253 aagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgt 352  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||| |   ||| |||||  |||  || ||||||||||||||    
T  26417706 aagactagaagaatgaagcaacggctaattcaaaagaatttgaaggcattggatgctcattctttggagaacgttggaaaatgacaattgtacaaagtgt 26417805  T
Q  353 acaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  26417806 acaaccactatcttcactactctgtttt 26417833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 38177406 - 38177477
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaa-aatttgacgtcttaaa 74  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  38177406 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgacaatagacaataatttgacatcttaaa 38177477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 41495419 - 41495289
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggag 99  Q
    ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||   || | | | |||  ||||||||||| || |||    
T  41495419 attaaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaaatttggaatcattattaggttctggaagaacaaaagagag 41495320  T
Q  100 caaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  41495319 caaaggaatcaacaaaaaggaagcttaaagc 41495289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 164
Target Start/End: Original strand, 18121371 - 18121504
Alignment:
Q  37 aagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt--- 132  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||  |||  |||||||||||||| |||||||  || |||| || | ||||||||||||||       
T  18121371 aagtatacaggaccatagacaaaagtttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaatagagagcaaatgaagcaacaaaaatgaagcttaaagcgtctg 18121470  T
Q  133 --gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctga 164  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121471 aagagaactgctcctgaagacaaagtgctcctga 18121504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 21636375 - 21636463
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaaca 91  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  21636375 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagcgtacaagacgatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttagaagaaca 21636463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 92
Target Start/End: Original strand, 12725995 - 12726069
Alignment:
Q  20 tatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac--aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  12725995 tatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaa 12726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 14392723 - 14392850
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  ||||||||||| || |||| |    
T  14392723 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagaacaaaagagagcta 14392822  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || |||||||  | ||||||||| ||||    
T  14392823 aggaatcaacagaaaggaagcttgaagc 14392850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14969756 - 14969629
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||  | ||||||    
T  14969756 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagatcatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttatggaagaacaaacgagagcaa 14969657  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    |  ||||||| || ||||| ||| ||||    
T  14969656 atgaatcaacaaaaaggaatcttgaagc 14969629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 45858423 - 45858514
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    ||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  45858423 attaaaattttcaattggataagctaatatttgttcaagtgtacaggtctataaacaatatttgacatcttaaattgatcctgaaagaacaa 45858514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 49990695 - 49990605
Alignment:
Q  22 tgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttga-cgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  49990695 tgttaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaagtttgatcattttaaa-aggtcttggaagaacaatagagagcaaaaaattcaac 49990605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 19197573 - 19197631
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa 59  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19197573 attaaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaa 19197631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37412692 - 37412590
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    |||||||||||||  ||||  | ||| |||||||  || || |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  37412692 gcattggatgcttaatcctataggagagttgacattgtgcgtttgtacgaaatgtacaaccactatctccactactctgtttctgtcttcactacaagac 37412593  T
Q  398 aag 400  Q
    |||    
T  37412592 aag 37412590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 12968788 - 12968731
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaat 61  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12968788 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaat 12968731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 46796102 - 46796171
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtctta 72  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  46796102 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatctta 46796171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 29951155 - 29951283
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaatt-ggtcttggaagaacaatagggagca 101  Q
    |||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||  ||| |||| ||||||||||| || ||||     
T  29951155 aaaattgtcaattggacttgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatatcttttattaggtcctggaagaacaaaagagagct 29951254  T
Q  102 aagaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  29951255 aagaagtcaacaaaaaggaagcttgaagc 29951283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 30000309 - 30000437
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaatt-ggtcttggaagaacaatagggagca 101  Q
    |||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||  ||| |||| ||||||||||| || ||||     
T  30000309 aaaattgtcaattggacttgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatatcttttattaggtcctggaagaacaaaagagagct 30000408  T
Q  102 aagaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  30000409 aagaagtcaacaaaaaggaagcttgaagc 30000437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 49642496 - 49642552
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  49642496 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 49642552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Original strand, 12752340 - 12752427
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaac 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  || || ||  |||||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  12752340 taatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaagtttggagtttttaaaaggtcttggaagaacaaaagagagcaaaagaatcaac 12752427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 3522706 - 3522644
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagaca-aaatttga 65  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  3522706 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacagaaatttga 3522644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 46828422 - 46828346
Alignment:
Q  19 atatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac---aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  46828422 atatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaaaaattgacatcttaaaaaggtcttgaaagaacaa 46828346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13824478 - 13824354
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggag 99  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||   |||||||  | ||| |||||||||| || |||    
T  13824478 attaaaattgtcaactggatacgctaatatttgctcaagtgtacaggatcatagacaaaaatttgttatcttaaaaggttct-ggaagaacaaaagagag 13824380  T
Q  100 caaagaaatcaacgaagaggaagctt 125  Q
    ||| | ||||||| || |||||||||    
T  13824379 caatggaatcaacaaaaaggaagctt 13824354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Original strand, 16658359 - 16658420
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttga 65  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  16658359 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtatacaggatcatagacaaaatttga 16658420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 25397979 - 25398036
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttc-aagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  25397979 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaaagtgtacaggaccatagacaaaa 25398036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13948771 - 13948651
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||   || | | | |||  ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  13948771 tcaattggatatgctaatatttgttcaaatgtacaggaccatagacaaaaatttggaatcattattaggttctggaaaaacaaaagagagcaaaggaatc 13948672  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  13948671 aacaaaaaggaagcttaaagc 13948651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16032922 - 16032866
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16032922 aaaattgtcaattggatatgctaatattttttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 16032866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 4242910 - 4242969
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||    
T  4242910 attaaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagaaaaaa 4242969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 22803814 - 22803873
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||    
T  22803814 attaaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaaatgtacaagaccaaagacaaaa 22803873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 46828505 - 46828423
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac---aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  46828505 tcaattggatatgctaatatttgttcaa--gtacaggactatagacaaaaaaaattgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaa 46828423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 512740 - 512690
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagaca-aaatttgacgtcttaaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||    
T  512740 taatatttgttcaagtgtacatgaccatagacataaatttaacatcttaaa 512690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 19705807 - 19705753
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttg 64  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  19705807 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcatgaccatagactaaaatttg 19705753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 51341470 - 51341392
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||| || || ||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  51341470 taatatttgttcaagtatacaggaccataaacaaagtttgatgtttttaaaaggtcttggaagaacaaaagagagcaaa 51341392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 1470146 - 1470109
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatga 48  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1470146 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatga 1470109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 6713510 - 6713473
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtg 41  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6713510 aaaaatgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtg 6713473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14073128 - 14073079
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  14073128 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcatgaccataaacaaaa 14073079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16812257 - 16812204
Alignment:
Q  355 aaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagc 408  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  16812257 aaccactatctccactactttgtttttgtctctgctataagacaagaaaacagc 16812204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 8728734 - 8728790
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  8728734 aaaaatgtcaattagatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 8728790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 9080621 - 9080677
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  9080621 aaaaatgtcaattagatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 9080677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12397558 - 12397502
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  12397558 aaaattgtcaattagatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 12397502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 12962818 - 12962874
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12962818 aaaattgtcaattagatatgctaatattttttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 12962874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 16199523 - 16199579
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  16199523 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgcgcaggaccatagacaaaa 16199579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16487127 - 16487067
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaagacaaca 406  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  16487127 aagtgttcaaccagtacctccactactctgctttctgtctacgctcacagacaagacaaca 16487067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 165
Target Start/End: Original strand, 18142635 - 18142667
Alignment:
Q  133 gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18142635 gaaaactgctcctgaagacaaagtgttcctgaa 18142667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 19249124 - 19249180
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  19249124 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccataaacaaaa 19249180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #265
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22151701 - 22151645
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa 59  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22151701 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaa 22151645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #266
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 26417402 - 26417458
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||    
T  26417402 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccataggcaaaa 26417458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 14800 - 14584
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14800 aagtgtacaaccactacctccactactctgctttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatga 14701  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14700 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 14601  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  14600 ctcaacgtctctttcac 14584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 54164 - 54381
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54164 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccatgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 54262  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  54263 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 54362  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  54363 tcaacgtctctttcacgcc 54381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 169 - 401
Target Start/End: Original strand, 5496 - 5728
Alignment:
Q  169 cagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtga 268  Q
    |||||| |||| | ||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||||||||||| |    
T  5496 cagaagctgctgctgttcatcagaagatgcaatttaaagattcaaaagttgtttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtaa 5595  T
Q  269 agcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctcca 368  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  5596 agcaacaactattttgaaaggatttgaaggcatttgatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacatttatatgaagtgtacaaccactacctcca 5695  T
Q  369 ctactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  5696 ctactatgtttttgtctctgctacaagacaaga 5728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 165
Target Start/End: Original strand, 5301 - 5421
Alignment:
Q  51 atagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcc 144  Q
    |||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||     ||||||||||||    
T  5301 atagacaaaatttgatattttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaaggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtttgaagaaaactgctcc 5400  T
Q  145 tgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||||| |||| |||| ||||    
T  5401 tgaagataaagcgctcatgaa 5421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 221)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20989872 - 20989656
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20989872 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatga 20989773  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20989772 atttgaagcttattcttcaaaggactgcacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 20989673  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  20989672 ctcaacgtctctttcac 20989656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 14745750 - 14745968
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14745750 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccctcaagatgggaatgaa 14745849  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14745850 tttgaagcttattcttcaaaggagtacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 14745949  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14745950 tcaacgtctctttcacgcc 14745968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 15888410 - 15888627
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888410 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 15888508  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15888509 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 15888608  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15888609 tcaacgtctctttcacgcc 15888627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5685738 - 5685522
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  5685738 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 5685639  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5685638 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 5685539  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  5685538 ctcaacgtctctttcac 5685522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9433483 - 9433267
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  9433483 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 9433384  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9433383 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9433284  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  9433283 ctcaacgtctctttcac 9433267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 6867306 - 6867525
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6867306 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 6867405  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6867406 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagaatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 6867505  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6867506 ctcaacgtctctttcacgcc 6867525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 1367848 - 1367631
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367848 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 1367750  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1367749 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 1367650  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1367649 tcaacgtctctttcacgcc 1367631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9444079 - 9443863
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  9444079 aagtgtacaaccactacctccactactctgtgttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 9443980  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9443979 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9443880  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  9443879 ctcaacgtctctttcac 9443863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 21003089 - 21003305
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21003089 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttctaccttcaagatgggaatga 21003188  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21003189 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaatggatttcaaacgaatctttagacgtgctgattat 21003288  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  21003289 ctcaacgtctctttcac 21003305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 541304 - 541085
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  541304 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 541205  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  541204 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 541105  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  541104 ctcaacgtctcttttacgcc 541085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 6877938 - 6878157
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  6877938 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacattcaagttgggaatga 6878037  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6878038 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagaatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 6878137  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6878138 ctcaacgtctctttcacgcc 6878157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 37344419 - 37344200
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37344419 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 37344320  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37344319 atttgaagcttattcttcaaaagactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 37344220  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37344219 ctcaacgtctctttcacgcc 37344200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 467662 - 467881
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  467662 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 467761  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  467762 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 467861  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  467862 ctcaacgtctctttcacgcc 467881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4222829 - 4222610
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  4222829 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 4222730  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4222729 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 4222630  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4222629 ctcaacgtctctttcacgcc 4222610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 8617605 - 8617386
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  8617605 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 8617506  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8617505 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 8617406  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8617405 ctcaacgtctctttcacgcc 8617386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 8628168 - 8627949
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  8628168 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 8628069  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8628068 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 8627969  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8627968 ctcaacgtctctttcacgcc 8627949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 11096274 - 11096055
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  11096274 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 11096175  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11096174 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 11096075  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11096074 ctcaacgtctctttcacgcc 11096055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 24930684 - 24930903
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24930684 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 24930783  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24930784 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 24930883  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24930884 ctcaacgtctctttcacgcc 24930903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 26653406 - 26653625
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26653406 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatga 26653505  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26653506 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 26653605  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26653606 ctcaacgtctctttcacgcc 26653625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 26699735 - 26699954
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26699735 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatga 26699834  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26699835 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 26699934  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26699935 ctcaacgtctctttcacgcc 26699954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 31116592 - 31116809
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116592 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 31116691  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||    
T  31116692 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 31116790  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31116791 tcaacgtctctttcacgcc 31116809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 454880 - 455099
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  454880 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 454979  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  454980 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 455079  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    || |||||||||||||||||    
T  455080 cttaacgtctctttcacgcc 455099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 2705693 - 2705912
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  2705693 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 2705792  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2705793 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 2705892  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2705893 ctcaacgtctctttcacgcc 2705912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 2716297 - 2716516
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||    
T  2716297 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgagaatga 2716396  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2716397 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 2716496  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2716497 ctcaacgtctctttcacgcc 2716516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4212230 - 4212011
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||    
T  4212230 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatggaaatga 4212131  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4212130 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 4212031  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4212030 ctcaacgtctctttcacgcc 4212011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 11005404 - 11005185
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  11005404 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 11005305  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11005304 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 11005205  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11005204 ctcaacgtctctttcacgcc 11005185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 17950199 - 17950418
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  17950199 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 17950298  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17950299 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 17950398  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  17950399 cgcaacgtctctttcacgcc 17950418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 17960805 - 17961024
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  17960805 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 17960904  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17960905 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 17961004  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17961005 ctcaacgtctctttcacgcc 17961024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 48710572 - 48710791
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  48710572 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 48710671  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48710672 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 48710771  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48710772 ctcaacgtctctttcacgcc 48710791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 20491225 - 20491008
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20491225 aagtgtacaatcactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgccttcaagatgagaatgaa 20491127  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20491126 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 20491027  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20491026 tcaacgtctctttcacgcc 20491008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 44280715 - 44280498
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44280715 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaa 44280617  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44280616 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 44280517  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44280516 tcaacgtctctttcacgcc 44280498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 167101 - 166882
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  167101 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 167002  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  167001 atttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 166902  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  166901 ctcaacgtctctttcacgcc 166882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 177693 - 177474
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  177693 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 177594  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  177593 atttgaagtttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 177494  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  177493 ctcaacgtctctttcacgcc 177474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9171204 - 9170990
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171204 aagtgtacaaccactacctccactactctgttct-gtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 9171106  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||    
T  9171105 tttgaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacatgctaatcatc 9171006  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  9171005 tcaacgtctctttcac 9170990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 22089342 - 22089123
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22089342 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacagtcatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 22089243  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22089242 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 22089143  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22089142 ctcaacgtctctttcacgcc 22089123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 22099957 - 22099738
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22099957 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacaaccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 22099858  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22099857 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 22099758  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22099757 ctcaacgtctctttcacgcc 22099738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 26294110 - 26294329
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26294110 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 26294209  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26294210 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgtataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 26294309  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26294310 ctcaacgtctctttcacgcc 26294329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 589431 - 589214
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  589431 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctaggcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 589333  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  589332 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggatcactggtgattgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 589233  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  589232 tcaacgtctctttcacgcc 589214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 3165953 - 3165736
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3165953 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacaggtatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaa 3165855  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3165854 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 3165755  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3165754 tcaacgtctctttcacgcc 3165736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 350 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24734969 - 24734756
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatt 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24734969 tgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatt 24734870  T
Q  449 tgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctc 548  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24734869 tgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 24734770  T
Q  549 aacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||    
T  24734769 aacgtctctttcac 24734756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 350 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24744916 - 24744703
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatt 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24744916 tgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatt 24744817  T
Q  449 tgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctc 548  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24744816 tgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctc 24744717  T
Q  549 aacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||    
T  24744716 aacgtctctttcac 24744703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 8002145 - 8002365
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  8002145 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 8002244  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8002245 aatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgatta 8002344  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8002345 tctcaacgtctctttcacgcc 8002365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 8012790 - 8013010
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  8012790 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 8012889  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8012890 aatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgatta 8012989  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8012990 tctcaacgtctctttcacgcc 8013010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 26390177 - 26390393
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26390177 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 26390276  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26390277 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaattcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 26390376  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  26390377 ctcaacgtctctttcac 26390393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 26400819 - 26401035
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26400819 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 26400918  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26400919 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaattcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 26401018  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  26401019 ctcaacgtctctttcac 26401035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 9085502 - 9085284
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  9085502 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 9085404  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9085403 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9085304  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9085303 ctcaacgtctctttcacgcc 9085284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 9095216 - 9094998
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  9095216 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 9095118  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9095117 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9095018  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9095017 ctcaacgtctctttcacgcc 9094998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 21770024 - 21770238
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770024 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 21770122  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||    
T  21770123 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgcaaatcatc 21770222  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  21770223 tcaacgtctctttcac 21770238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 1987760 - 1987540
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  1987760 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 1987661  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1987660 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 1987561  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1987560 tctcaacgtctctttcacgcc 1987540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 1998381 - 1998161
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  1998381 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 1998282  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1998281 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 1998182  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1998181 tctcaacgtctctttcacgcc 1998161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9159948 - 9159734
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9159948 aagtgtacaaccactacctccactactctgttct-gtctacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 9159850  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  9159849 tttaaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 9159750  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  9159749 tcaacgtctctttcac 9159734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9170403 - 9170189
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9170403 aagtgtacaaccactacctccactactctgttct-gtctacgctacaagacaanacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 9170305  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||    
T  9170304 tttnaagctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaangattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacntgctaatcatc 9170205  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  9170204 tcaacgtctctttcac 9170189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18441415 - 18441201
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  18441415 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 18441317  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  18441316 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatc 18441217  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  18441216 tcaacgtctctttcac 18441201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 40042190 - 40042408
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  40042190 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 40042288  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40042289 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 40042388  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40042389 ctcaacgtctctttcacgcc 40042408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 40052739 - 40052957
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||    
T  40052739 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaagga 40052837  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40052838 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 40052937  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40052938 ctcaacgtctctttcacgcc 40052957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 30945313 - 30945533
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  30945313 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaggttgttcaacggatttaatctcgtctaagtattgtagaagattggaaaagtgaagcaacaactat 30945412  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30945413 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactttgtttt 30945512  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  30945513 tgtctcagctacaagacaaga 30945533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 42866047 - 42865827
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||||||||||    
T  42866047 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatg 42865948  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42865947 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 42865848  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42865847 tctcaacgtctctttcacgcc 42865827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 42876673 - 42876453
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||||||||||    
T  42876673 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatg 42876574  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42876573 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 42876474  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42876473 tctcaacgtctctttcacgcc 42876453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 30944280 - 30944500
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||     
T  30944280 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaggttgttcaacggatttaatctcgtctaagtattgcagaagattggaaaagtgaagcaacaactat 30944379  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30944380 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacaaaatacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 30944479  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  30944480 tgtctctgctacaagacaaga 30944500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18419334 - 18419120
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  18419334 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctcttcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 18419236  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  18419235 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatc 18419136  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  18419135 tcaacgtctctttcac 18419120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 40054835 - 40055048
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | || |||||||||| ||||||||    
T  40054835 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacaaccatgcctgcataaat-gttccttcaagataggaatgaa 40054933  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  40054934 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 40055032  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  40055033 tcaacgtctctttcac 40055048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 181 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14426748 - 14426544
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||  || ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  14426748 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcagaagctgtttaatggattcaaactcatctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactat 14426649  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426648 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtactaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 14426549  T
Q  381 tgtct 385  Q
    |||||    
T  14426548 tgtct 14426544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Original strand, 48236839 - 48237079
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  48236839 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgcataagactga 48236938  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  48236939 aaaggtgaagcaacgacaagtttgaaaggatttgaaggcatcagatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccac 48237038  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  48237039 tacctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaaga 48237079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 161 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 33605907 - 33605668
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaa-ggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactg 259  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||| || |||| |||||||||||||||| |||| | |||||    
T  33605907 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgcaacataaagcttcaaaaggcttttcaacggatttaatctcgtctaagcaatgcagatgactg 33605808  T
Q  260 gaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaacca 359  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33605807 gaaaattgaagcaatgactattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacgaagtgtacaacca 33605708  T
Q  360 ctacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  33605707 ctaccttcactactatgtttttgtctctgctacaagacaa 33605668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 44467267 - 44467045
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  44467267 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacgact 44467168  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467167 attttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttaaagagtgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 44467068  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  44467067 tttgtctctgctacaagacaaga 44467045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 347 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 30049738 - 30049522
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  30049738 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaat-gttcattcaagatgggaatga 30049640  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || ||    
T  30049639 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcat 30049541  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgc 564  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30049540 ctcaacgtctctttcacgc 30049522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 164 - 401
Target Start/End: Original strand, 28622296 - 28622533
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaa 263  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  28622296 aaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgcagaatactagaaa 28622395  T
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  28622396 agtgaagcaacggctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgtttttcaaagggcgttgacaaagtacaattgtacgaggtgtacaaccactac 28622495  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28622496 ctctacttctctgtttttgtctctgctacaagacaaga 28622533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 347 - 511
Target Start/End: Original strand, 19985894 - 19986058
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985894 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 19985993  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 511  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985994 tttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 19986058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Original strand, 9709739 - 9709979
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9709739 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgcaacataaagcttcaaagcctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgg 9709838  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  9709839 aagagtgaagcaacgcctagtttgaaaggatttgaaggcattagatgcttgttcttcaaagagcgttgacatagtacaactgtacgaagtgtaaaaccac 9709938  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9709939 tacatccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaaga 9709979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 21283329 - 21283550
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | |    
T  21283329 agttcatcaggatatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtaaagcaacgtcca 21283428  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21283429 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttattcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 21283528  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||   |||||||||||||    
T  21283529 ttgtctctactacaagacaaga 21283550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 33691668 - 33691889
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactca--aagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  ||  |||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33691668 agttcatcaggagatgcaagacataaagcttcaaaggctgttaaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgacta 33691767  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33691768 ttttgaaagaatttaaaggcgttagatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtataaccactacctccactactctgttt 33691867  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  33691868 ttgtctctgctacaagacaaga 33691889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 35952644 - 35952865
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagg-atctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35952644 cagttcatcagaggatgcaacttaaggcttcaaaagctgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgaagaagactggaaaagtgaagcaacgacta 35952743  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35952744 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttcatcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccattactctgttt 35952843  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||   |||||||||||||    
T  35952844 ttgtctctactacaagacaaga 35952865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 559
Target Start/End: Original strand, 3476421 - 3476631
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  3476421 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 3476519  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  3476520 tttgaagttaatccttcacaggactacacccaaatcaggcaaaggattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 3476618  T
Q  547 tcaacgtctcttt 559  Q
    |||||||||||||    
T  3476619 tcaacgtctcttt 3476631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9069762 - 9069543
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9069762 ttcatcaggagatgcaaaacttaaagcttcaaaggttgttcaagggatttaatatcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactatt 9069663  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9069662 ttgaaaggatttaaaggcattgtatgcttgttcttcaaggagcattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagttttt 9069563  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  9069562 gtctctgctacaagacaaga 9069543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 26209629 - 26209837
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  26209629 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 26209727  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  26209728 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 26209826  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  26209827 tcaacgtctct 26209837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 182 - 528
Target Start/End: Original strand, 23279915 - 23280261
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | | || |  |||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23279915 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctattcat-ggatttaatcttgtctaagcattgtagaagactggaaaagtggagcaacggcta 23280013  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg-tt 378  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  23280014 gtttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 23280113  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacaccc 477  Q
    |||||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||  ||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||| ||||| || || | | ||    
T  23280114 tttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-aagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataacc 23280212  T
Q  478 aaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 528  Q
    | |||||||||| ||| | || ||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  23280213 atatcaggcaaaagatcattgctgattgatcaaag--tttcaaacgactct 23280261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 29590212 - 29590004
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  29590212 aagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 29590114  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  29590113 tttgaagttgatccttcatatgactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 29590015  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  29590014 tcaacgtctct 29590004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4821694 - 4821455
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||   ||  || |||||||||  ||| || |||||| |    
T  4821694 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatccggagatacaacttaaagcttcaaaagctgtttaacaaattcaaactcgtctaaagattacagaagactag 4821595  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4821594 aaaagtggagcaacggctattttgaaag-atttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgaaaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccac 4821496  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4821495 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 4821455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 177 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28409246 - 28409020
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaactcaaa--gcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  || |  |||||||| | |||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  28409246 gctaaagttcatcaagagatgcaagacataaggcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaaacattgcagaagactagaagagtgaagcaac 28409147  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28409146 aattattttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactc 28409047  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||   |||||||||||||    
T  28409046 tgtttttgtctctactacaagacaaga 28409020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15468118 - 15467897
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| ||  ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  15468118 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaagggtgttcaatagatttaatctcgtctaggcaatgcagaagactggaagagtgaatcaacgacta 15468019  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  15468018 ttttaaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaggtgtacaaccattacctccactactctgaat 15467919  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  15467918 ttgtctctgctacaagacaaga 15467897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 182 - 385
Target Start/End: Original strand, 22577977 - 22578182
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22577977 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaagggtgttcaatagatttaatctcgtttaagcattgcagaagactgtaagagtgaagcaacaacta 22578076  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22578077 ttttgaaaggatttgaaggcattgaatgattgttcttaaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 22578176  T
Q  380 ttgtct 385  Q
    ||||||    
T  22578177 ttgtct 22578182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 182 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 13303012 - 13302773
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||| |||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13303012 agttcattaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatatcgtctaagcattgtagaagactagaagagtgaagcaacgacta 13302913  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  13302912 ttttgaaaggatttgaaggcattagatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatcaccactactcagttt 13302813  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaa-gacaacagccttgcctgca 418  Q
     |||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  13302812 gtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgca 13302773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 10883129 - 10883350
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||||| | |||| || |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10883129 agttcatcaggagatgcaagacttaaagtttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaatcatttcagaagactggaagagtgaagcaacgacta 10883228  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10883229 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcctgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaatcactacctccactactcagttt 10883328  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
      ||||  ||||||||||||||    
T  10883329 gcgtctctgctacaagacaaga 10883350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24788343 - 24788122
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||| |||||||||||  || ||||||||||| | |||| ||  ||| |||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  24788343 agttcattaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatagatttaatatcatctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacgaata 24788244  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24788243 ttttgaaaggatttgaaggcattgggtgcttgttcttcaaagagaattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 24788144  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||   |||||||||||||    
T  24788143 ttgtctctactacaagacaaga 24788122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15088720 - 15088517
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaactc--aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |    
T  15088720 ttcatcaggagatgcaagacgtaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacgactatt 15088621  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  15088620 ttgaaaggatttgaagacattggatgcttgttcttttaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgt 15088521  T
Q  382 gtct 385  Q
    ||||    
T  15088520 gtct 15088517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 164 - 400
Target Start/End: Original strand, 16111824 - 16112060
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaa 263  Q
    |||||||  ||| ||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||  || |||||||||  | |||| ||||| | |||    
T  16111824 aaaatcaccagaagctgcagttgatcagaggatgcaacttaaagcttcaaaagttgttttatggattcaacctcgtctaaagagtgcagaagacggaaaa 16111923  T
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  16111924 agtgaagcaacgacttttttggaagaaattgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactat 16112023  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16112024 ctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaag 16112060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 164 - 401
Target Start/End: Original strand, 12174280 - 12174517
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagg-atctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaa 262  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||| | || ||  || |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12174280 aaaatcaccagaagctgcagttcatcagaggatgcaacttaa-gcttcaaaagctgttttatgggattcaacctcgtctaaggattgcagaagactggaa 12174378  T
Q  263 aagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctc-aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccact 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12174379 aagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccact 12174478  T
Q  362 acctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  12174479 acctttagtactctg-ttttgtctctgctacaagacaaga 12174517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 346 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 15216537 - 15216328
Alignment:
Q  346 aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||    
T  15216537 aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatga 15216439  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| ||||   ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  ||    
T  15216438 atttgaagttgatctgtcataggactacacccaaatcaggcaatagattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaat 15216340  T
Q  546 ctcaacgtctct 557  Q
    ||||||||||||    
T  15216339 ctcaacgtctct 15216328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 13682540 - 13682332
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  13682540 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctattcctgcagaa-atgttccttcaaaatgggaatgaa 13682442  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || ||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  13682441 tttgaagttaatccttcacaagactacacccaaatcaggcaaaatattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 13682343  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  13682342 tcaacgtctct 13682332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21695603 - 21695382
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  21695603 agttcatcaagagatgcaagacttaaagcttcaaaagttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgacta 21695504  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  21695503 tttcaaaatgatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccagtacctcaactactcagttt 21695404  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  21695403 gtgtctctgctacaagacaaga 21695382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 2913564 - 2913784
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||| | |||| || | || ||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  2913564 agttcatcaggagatgcaagacttaaatcttcaaaggctgttcaatgaatttaatctcatctaaacaatgcagaagactagaaaagtggagcaacgacta 2913663  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2913664 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 2913763  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  2913764 gtgtctctgctacaagacaag 2913784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 204 - 385
Target Start/End: Original strand, 19237024 - 19237204
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19237024 aaagcttcaaaggctgttcaaaggatttaatctcgtcta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacggctactttgaaaggatttgaaggcattg 19237122  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19237123 gatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaactacaattatacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtct 19237204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 188 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2500234 - 2500020
Alignment:
Q  188 tcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttga 285  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  2500234 tcaggagatgcaagacttaaagcttcaaatgttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaactattttga 2500135  T
Q  286 aaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  2500134 aaggatttgaaagcattggatgcttatcctttgaagagagttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactttctccactactcagtttgtgtct 2500035  T
Q  386 acgctacaagacaag 400  Q
      |||||||||||||    
T  2500034 ctgctacaagacaag 2500020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 13137851 - 13138071
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||| |||||||||||  || ||||||||||| | |  | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  13137851 agttcataaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttaatcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacaacta 13137950  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13137951 ttttgaaaagatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccattactcagttt 13138050  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  13138051 atgtctctgctacaagacaag 13138071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21692489 - 21692269
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| | || || |  | ||||||| ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||     
T  21692489 agttcattaggagatgcaagacttaaagcttcaaaagttattcaatgattttaatctcttctaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactg 21692390  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21692389 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtatgaagtgtacaaccactacctccactactcagttt 21692290  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  21692289 gtgtctctgctacaagacaag 21692269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 389 - 562
Target Start/End: Original strand, 38403331 - 38403502
Alignment:
Q  389 ctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaa 488  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38403331 ctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 38403429  T
Q  489 aggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctctttcac 562  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  38403430 aagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcac 38403502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 555
Target Start/End: Original strand, 12734247 - 12734453
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||    
T  12734247 aagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctacgctataagacaagacaacaactctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaataaa 12734345  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  12734346 tttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaagagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 12734444  T
Q  547 tcaacgtct 555  Q
    |||||||||    
T  12734445 tcaacgtct 12734453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 185 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13648928 - 13648711
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||    
T  13648928 tcatcaggagatgcgagacttaaagcttcaaaagatgttcaatggatttaatcgcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacggctattt 13648829  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 382  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  13648828 tgaaaggatttaaagacattggatgcttgatctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcaatttgtg 13648729  T
Q  383 tctacgctacaagacaag 400  Q
    |||  |||||||||||||    
T  13648728 tctctgctacaagacaag 13648711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8183130 - 8182911
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | |  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||     
T  8183130 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttaaaaagttgtataaaagtttcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacaactat 8183032  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||  ||| || | ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8183031 tttgaaaggattgaaagacacttgatgcttattcttcaaagagcgttgacataatacgtctgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 8182932  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  8182931 tgtctctgctacaagacaaga 8182911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 204 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13880282 - 13880086
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13880282 aaagcttcaaaggctgttcaatggacttaatctcgtctaagcattgcagaagactcgacgagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcatta 13880183  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||    
T  13880182 gatgcttattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcactttgtgtctctgctacaagacaag 13880086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 2265477 - 2265695
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  |||  || |||||||||  |||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||| |    
T  2265477 agttcatcaggagatgcaacttaaagctttaaaagctgtttaacagattcaaactcgtctaaagattgcagaagactgaaaaagtatagcaacggctatt 2265576  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| ||||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2265577 ttggaaggatttgaaggtatttaatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactgctctg-tttt 2265675  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  2265676 gtctttgctacaagacaaga 2265695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 400
Target Start/End: Original strand, 13730638 - 13730851
Alignment:
Q  189 caggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaa 286  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| ||| ||||||    
T  13730638 caggagatgcaaggcttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcataagactaaaagagtgaagcaacggctattttgaa 13730737  T
Q  287 aggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 386  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||     
T  13730738 aagatttgaatgcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccactactcagtttgtgtctc 13730837  T
Q  387 cgctacaagacaag 400  Q
     | |||||||||||    
T  13730838 tgttacaagacaag 13730851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14426952 - 14426786
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  14426952 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 14426853  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426852 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 14426786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14193244 - 14193111
Alignment:
Q  252 aaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtg 351  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  14193244 aaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattgaatgcttgttcttcaaagagcgttaacaaagtacaagtgtacgaagtg 14193145  T
Q  352 tacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14193144 tacaaccactacctctactactctgtttttgtct 14193111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11793109 - 11792870
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| | |||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||    
T  11793109 agttcatcaggagatgcaagacttaaagctttaaaggttgttcaatggacttaatctcgtctaagcattgcgaaagaccataagagtgaagcaacgacta 11793010  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||  ||||    
T  11793009 ttttgaaagcatttgaaagcatttgatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccaccacttagttt 11792910  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgca 418  Q
     |||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  11792909 gtgtctctgctacaagacaagaataacagctttgcctgca 11792870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 356
Target Start/End: Original strand, 16542977 - 16543152
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||  || ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16542977 cagttcatcaggagatgcaacataatgcttcaaaagctgtttaatggattcaaactcgtttaatgattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactat 16543076  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaa 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  16543077 tttgaaatgatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagctctgacaaagtacgtttgtacgatgtgtacaa 16543152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16622685 - 16622510
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||  || ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16622685 cagttcatcaggagatgcaacataatgcttcaaaagctgtttaatggattcaaactcgtttaatgattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactat 16622586  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaa 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  16622585 tttgaaatgatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagctctgacaaagtacgtttgtacgatgtgtacaa 16622510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 9709553 - 9709719
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9709553 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacataaccatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagcaaa 9709652  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
      ||||||| || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9709653 tgaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 9709719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 16316513 - 16316734
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||| |||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||  |||    
T  16316513 agttcatcaggggatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatcacgtctaagaattgcagaagaccagaagagtgaagcaacagcta 16316612  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16316613 ttttgaaaggatttgaagccattggatgcttgttctttgaagagcgttgaaatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 16316712  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  16316713 gtgtctctgctacaagacaaga 16316734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 24882501 - 24882709
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||  | ||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  24882501 aagtgtacaaccactacctcaacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 24882599  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  24882600 tttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagatc 24882698  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  24882699 tcaacgtctct 24882709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 15704457 - 15704666
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  15704457 agttcatcagaagatgaaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactatt 15704556  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |         |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15704557 ttggaaggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtt---------tgtacaaccactacttccactactctg-tttt 15704646  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  15704647 gtctctgctacaagacaaga 15704666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 12366704 - 12366925
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||||| |||||  || ||||||||||  | |||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  12366704 agttcatcaggaggtgcaaaacttaaagcttcaagggctgttcaatggatttaatctcgtttaagcattgcagaagactgggagagtgaagcaacaacta 12366803  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |    
T  12366804 ttttgaaaggatttgaaagcattggatgtctgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtatacaaccactacctccactaatcagtct 12366903  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  12366904 gtgtctctgctacaagacaaga 12366925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 401
Target Start/End: Original strand, 29935379 - 29935535
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29935379 cattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttaaagagcgttgacatagtacaattgta 29935478  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||    
T  29935479 cgaagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaaga 29935535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11319582 - 11319387
Alignment:
Q  205 aagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattgg 304  Q
    |||||||||| |||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11319582 aagcttcaaaggatgttcaatggatttaatcttgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagtaacaactattttgaaaggatttgaatgcattgg 11319483  T
Q  305 atgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||| ||||  |  ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  11319482 atgcgtgttttttgaagagcgttgacaaattacaattgcacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctactacaagacaag 11319387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 270 - 401
Target Start/End: Original strand, 19711059 - 19711190
Alignment:
Q  270 gcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccac 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  19711059 gcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcattgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatttccac 19711158  T
Q  370 tactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19711159 tactctgtttttgtctctactacaagacaaga 19711190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30026107 - 30025887
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| | || | || |||| || |||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||    
T  30026107 agttcatcaagagatgcaagacttaaagcttcaaacgctggtcaatggatttagtctcgtataagcatcgcagaagactgaaagagtgaagcaacggcta 30026008  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  30026007 ttttgaaaagaattgaaggcattcgatgcttgttcttttaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccaatatctctactactcagttt 30025908  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  30025907 gtgtctctgctacaagacaag 30025887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 331842 - 331627
Alignment:
Q  186 catcaggagatgca-actcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt- 283  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||| | ||||  ||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||     
T  331842 catcaggagatgcggacttaaagcttcaaaggttgttttatggattcaaggtcgtccaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacagctattttt 331743  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  331742 gaaaggatctgaaggcattggatgcttattgctcaaa-agcgttgacaaagtacaaatgtacgaagtgtacaaccactacctccactacacagtttgtgt 331644  T
Q  384 ctacgctacaagacaag 400  Q
    ||  |||||||||||||    
T  331643 ctctgctacaagacaag 331627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 8933739 - 8933634
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  8933739 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaa 8933641  T
Q  447 tttgaag 453  Q
    |||||||    
T  8933640 tttgaag 8933634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 30944077 - 30944242
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||||  |||||||    
T  30944077 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgatatcttaaa-aggtctttgaagaacaataaagagcaaa 30944175  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
      ||||||| || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30944176 tgaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtttgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 30944242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14425642 - 14425429
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacga 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||   ||||||     
T  14425642 gctanagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgcctaa-cattgcagaagactgganaagtatggcaacgg 14425544  T
Q  277 ctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    ||| ||||||| |         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14425543 ctattttgaaatg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatattacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctg 14425453  T
Q  377 tttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||||||  || ||||||||||    
T  14425452 tttttgtctttgcaacaagacaag 14425429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 206 - 401
Target Start/End: Original strand, 5000803 - 5000999
Alignment:
Q  206 agcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactg-gaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattgg 304  Q
    ||||||||| | |||| || ||||  ||||||| | ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  5000803 agcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgcccaagcattgcaaaagaccaagagaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaagcattga 5000902  T
Q  305 atgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||    
T  5000903 atgcttgttctttgaagaacgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctactacaagacaaga 5000999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 33691445 - 33691612
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||| ||||||    
T  33691445 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaatagagagcaa 33691544  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || |||||| |||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33691545 aggaatcaacaaaaaggaagtttaaagcgtctgaagagaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 33691612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 385
Target Start/End: Original strand, 39284543 - 39284725
Alignment:
Q  202 tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcat 301  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| || ||| |||||||  |||||  ||| |||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  39284543 tcaaagcttcaaaggctgttcaaaggatttaatcacgccta-gcattgctgaagaccagaagagtgaaacaacgactaattcaaatgaatttgaaggcat 39284641  T
Q  302 tggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39284642 tggatgtttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtct 39284725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 28622086 - 28622252
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  28622086 aaaattgtcaattgtatatgctaacatttgttcaagtgtacaagactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 28622185  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | ||||||||||||||     ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28622186 ggaatcaacaaaaatgaagcttaaagcgtatgaagaatactgctcatgaagacaaagtgctcctgaa 28622252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Original strand, 13893979 - 13894174
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  13893979 aaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacggctaattcaaaaggatttgaaggcattg 13894077  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     ||| |||||| | ||| ||| |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    
T  13894078 aatgtttgttctttaaaaagcattgaaaaaggacaattgtacaacgtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtctctgcaacaagacaaga 13894174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 400
Target Start/End: Original strand, 19339216 - 19339426
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagga-tctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||  ||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  19339216 cagttcatcaggagattgaacttaaagtttcaaaacctgtttcaaggactctaa-ctcgcctaaagattgcagaagactggaaaagtgtggcaacgacta 19339314  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||| |         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19339315 ttttgaaatg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgagt 19339405  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  19339406 ttgtctctgctacaagacaag 19339426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33606125 - 33606001
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  33606125 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 33606026  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaa 128  Q
    | ||||||| |  ||||||||||||    
T  33606025 ggaatcaacaataaggaagcttaaa 33606001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 48236659 - 48236782
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaat 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| |||| |||    
T  48236659 tgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagtaaaggaat 48236758  T
Q  109 caacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  48236759 caacaaaaaggaagcttaaagcgt 48236782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 347 - 453
Target Start/End: Original strand, 38593816 - 38593921
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  38593816 aagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagataacagtcatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaa 38593914  T
Q  447 tttgaag 453  Q
    |||||||    
T  38593915 tttgaag 38593921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 401
Target Start/End: Original strand, 16309964 - 16310084
Alignment:
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||     
T  16309964 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctacactactcagtttg 16310063  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  16310064 tgtctctgctacaagacaaga 16310084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1293157 - 1293011
Alignment:
Q  246 attgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtac 345  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1293157 attgcaaaagactggaaaagtatagcaacaactattttgaaagg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtac 1293067  T
Q  346 aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  1293066 gaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctcttctacaagacaaga 1293011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 16542762 - 16542922
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaat 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||| |||    
T  16542762 tgtcaattggatatggtaatatttgttcaagtgtacaggattatagacaaaatttgtcatcttaaaaaggtgttggaagaacaataaagagcaaaggaat 16542861  T
Q  109 caacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||| || ||||||||| ||||||     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16542862 caacaaaaaggaagctt-aagcgtctgaagaaaactgcttctgaagacaaagtgctcttgaa 16542922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16622900 - 16622740
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaat 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||| |||    
T  16622900 tgtcaattggatatggtaatatttgttcaagtgtacaggattatagacaaaatttgtcatcttaaaaaggtgttggaagaacaataaagagcaaaggaat 16622801  T
Q  109 caacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||| || ||||||||| ||||||     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16622800 caacaaaaaggaagctt-aagcgtctgaagaaaactgcttctgaagacaaagtgctcttgaa 16622740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 5826406 - 5826318
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5826406 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaaatggtcttggaagaacaa 5826318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 24794681 - 24794891
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagga-tctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||   |||||| ||||||||||||||   |||||| |||     
T  24794681 agttcatcaggaattggaactcaaagtttcaaaagttgtttcaaggactctaa-ctcgcctagaaattgcagaagactggaaaagtatggcaacggctat 24794779  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaaga-gcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||| |         |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24794780 tttgaaatg---------cattggatgcttattcctcaaagaagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgttt 24794870  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  24794871 ttgtctctgctacaagacaag 24794891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27871803 - 27871699
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaaga-gcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 396  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27871803 gcattggatgcttattcttcaaagaagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaaga 27871704  T
Q  397 caaga 401  Q
    |||||    
T  27871703 caaga 27871699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 48062547 - 48062635
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  48062547 aaaattgtcaattgaatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacattttaaattggtcttggaagaacaa 48062635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 48062786 - 48062997
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||  || |||| |||   ||||   ||||||||||||||   ||||||||||     
T  48062786 cagttcatcaagagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaagaattcaaactcgcctagaaattgtcgaagactggaaaagtatggcaacgactat 48062885  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  48062886 tttgaaagg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagcgtacaaccactatctccattactctgtttc 48062976  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  48062977 tgtctctgctacaagacaaga 48062997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13880543 - 13880376
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagaca-aaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  13880543 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacataaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaa 13880444  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||     || || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  13880443 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaagtgcttctgaagtcaaagtgctcctgaa 13880376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13880766 - 13880604
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  13880766 aaagcttcaaaggctgttcaaaagatttaatcacgccta-gcattgcagaagactagaagagtgaagcaacgactaattcaaaaggatttgaaggcactg 13880668  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagt-gtacaaccactacctc 366  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13880667 gatgcttgttctttgaagagcgttgaaaaaggacaattgtacgaagtggtacaaccactacctc 13880604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 32264683 - 32264895
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| ||||||  || |||| |||   |||||| ||||||||||||||   |||||| |||     
T  32264683 cagttcatcaggagatgcgacttaaagcttcaaaagttatttcaaggattcaaactcgcctagaaattgcagaagactggaaaagtatggcaacggctat 32264782  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaaga-gcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||| |         ||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  32264783 tttgaaatg---------cattggatgtttattcttcaaagaagcgttgacatagtacgtttgtacagagtgtacaaccagtacctccactgctctgttt 32264873  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  32264874 ttgtctctgctacaagacaaga 32264895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 32264442 - 32264530
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32264442 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaa 32264530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 233 - 401
Target Start/End: Original strand, 41842282 - 41842450
Alignment:
Q  233 atctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaa 332  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   | | |||||||||||||||||||  || | | |||||| |||||||| ||||||  | |||| |||||||||     
T  41842282 atctcgtctaagcactgcataagatcaggagagtgaagcaacgactaattcaaatgaagttgaagacattggatacttgttttttaaagtgcgttgacag 41842381  T
Q  333 agtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  41842382 agtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctgcactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 41842450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 4821914 - 4821807
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  4821914 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttaaagtgtacaggactatagaaaaaatttgacatcttaaataggtcttggaagaacaataaagagcaaa 4821815  T
Q  104 gaaatcaa 111  Q
    | ||||||    
T  4821814 ggaatcaa 4821807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 401
Target Start/End: Original strand, 13018527 - 13018682
Alignment:
Q  246 attgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtac 345  Q
    |||||| |||||| | | |||||||||||||||| ||| || | | |||||||||||||||||| | |  |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13018527 attgcagaagactaggagagtgaagcaacgactattttaaatgaagttgaaggcattggatgctggatttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtac 13018626  T
Q  346 aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  13018627 gaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctgtgctacaggacaaga 13018682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Original strand, 48805953 - 48806056
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  48805953 gcattggatgctatttcttcaaagagcgttgacatagtacgttcgtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgattttgtctctgctacaagac 48806052  T
Q  398 aaga 401  Q
    ||||    
T  48806053 aaga 48806056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 347 - 489
Target Start/End: Original strand, 8999014 - 8999155
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  8999014 aagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 8999112  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  8999113 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 8999155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 30945110 - 30945275
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||| |  |||||||    
T  30945110 aaaattgtcaattgaacatgttaatatttgttcaaatgtacaggactatagacaaaatttgatatcttaaa-aggtctttgaagaacaaaaaagagcaaa 30945208  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
      | ||||| || |||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945209 tgagtcaacaaaaaggaagcttaaaacgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 30945275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 347 - 408
Target Start/End: Original strand, 6044292 - 6044353
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagc 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6044292 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagc 6044353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 35952389 - 35952519
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac--aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||  |||||    
T  35952389 aaaattgtcaattggatatgctaatacttgttcaagtgtacaagactatagacaaaaaaattgacatcttaaaaaggccttggaagaacaataaagagca 35952488  T
Q  102 aagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  35952489 aaggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgt 35952519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 8183387 - 8183298
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa-atttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8183387 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggagtatagacaaatatttgacatcttaaattggtcttggaagaacaa 8183298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 338
Target Start/End: Original strand, 16556667 - 16556752
Alignment:
Q  253 aagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16556667 aagactggaaaagtgaagcaacggctattttgaaaggattttaaggcattgattgcttgttcttcaaagagcgttgaaaaagtacg 16556752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16608995 - 16608910
Alignment:
Q  253 aagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16608995 aagactggaaaagtgaagcaacggctattttgaaaggattttaaggcattgattgcttgttcttcaaagagcgttgaaaaagtacg 16608910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 27872131 - 27872047
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27872131 tgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaattcgatatcttaaattggtcttggaagaacaa 27872047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30026323 - 30026203
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  30026323 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttatggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 30026224  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||| || ||||||||| ||||    
T  30026223 aacaaaaaggaagcttgaagc 30026203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2500464 - 2500337
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || |||| |    
T  2500464 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttatggaagaacaaaagagagcta 2500365  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || ||||||||| ||||    
T  2500364 aggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 2500337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Original strand, 12174049 - 12174168
Alignment:
Q  10 gtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaat 108  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  12174049 gtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtataggactatagacaaaaaattgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaaggaat 12174148  T
Q  109 caacgaagaggaagcttaaa 128  Q
    |||| || | ||||||||||    
T  12174149 caacaaaaaagaagcttaaa 12174168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 16111601 - 16111731
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttg-ttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaatt-ggtcttggaagaacaatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||  ||| |    
T  16111601 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgattcaagtgtaaaggactatagacaaaaattgacatcttaaaaaaggtcttggaagaacaataaagagaa 16111700  T
Q  102 aagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  16111701 aaggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgt 16111731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13692520 - 13692372
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||         ||| |||||    
T  13692520 aaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtataagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaactattttga---------aagacattg 13692430  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccact 361  Q
    |||||||| || | | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13692429 gatgcttgatctttatagagtgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccact 13692372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 2913340 - 2913508
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  2913340 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgatatctttagtaggttctggaagaacaaaagagagcaa 2913439  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || |||||||||||||| |     || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2913440 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcatatgaagagaagtgctcctgaagacaaaagtgctcctgaa 2913508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14425862 - 14425693
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  14425862 aaaattgtcaattggatatgttnatatttnttcaagtatacaggactatagacaaaattttgatatcttaaattggtcttggaagaacaaataaagagca 14425763  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |  | |||||| || | |||||||||||| ||     |||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  14425762 agtacatcaacaaaaagggaagcttaaagtgtctgaagaaaactgctacngaagacaaagtgcttctgaa 14425693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15469906 - 15469774
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||  |||  |||||||||||||| ||||||    
T  15469906 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagcatacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttatggaagaacaatagagagcaa 15469807  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgtgaa 135  Q
    || ||||||| || | |||||||||| ||||||    
T  15469806 aggaatcaacaaatacgaagcttaaaacgtgaa 15469774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4494912 - 4494785
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||| | || ||||||    
T  4494912 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtataggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacgaaagagagcaa 4494813  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
     ||||||||| || ||||||||| ||||    
T  4494812 tgaaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 4494785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 22577739 - 22577862
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatag-acaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagg-gagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||    
T  22577739 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagaaaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaaggagagca 22577838  T
Q  102 aagaaatcaacgaagaggaagctt 125  Q
    ||  ||||||| || |||||||||    
T  22577839 aatgaatcaacaaaaaggaagctt 22577862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 7339615 - 7339769
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaa 115  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||  ||    
T  7339615 tggatatgctaatatttgttcgagtgtacaggactatagacaaaatttgtcatcttaaaaatgtcttggaagaacaataaagagcaaatgaataaaaaaa 7339714  T
Q  116 gaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
     |||| |||||||||||     ||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  7339715 aaggatgcttaaagcgtctgaagaaaagtgttcatgaagaaaaagtgctcctgaa 7339769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 489
Target Start/End: Original strand, 11087124 - 11087265
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  ||| |||| ||||| |||||| |    
T  11087124 aagtgtacaaccactacctccatgactctgcttgtgtctacactacaagacaagataacagctctgcctgcataa-atgttcctttaagataggaatgga 11087222  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  11087223 tttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 11087265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11319839 - 11319677
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaa 107  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||   || | | | |||  ||||||||||| || |||||| ||||    
T  11319839 tgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttggaatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcaatgaaa 11319740  T
Q  108 tcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||| || ||||||||||||||||     || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11319739 tcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaagtgctcctgaagccaaagtgctcctgaa 11319677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 2265250 - 2265419
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||  ||||     
T  2265250 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcagaactttagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagct 2265349  T
Q  102 aagaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || ||| |||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2265350 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 2265419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9070012 - 9069852
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  |||  |||| ||||||||| ||||||    
T  9070012 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggatgaacaatagagagcaa 9069913  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
     |||||||||       |||||||||||||     || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9069912 tgaaatcaac-------aagcttaaagcgtctaaagagaactgctcctgaagtcaaagtgctcctgaa 9069852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 400
Target Start/End: Original strand, 21381394 - 21381605
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagga-tctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||||||||  |||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||  |||||| |||    
T  21381394 cagttcatcaggagattgaacttatagtttcaaaagttgtttcaaggactctaa-ctcgcctaaagattgcagaagactggaaaagtgtggcaacggcta 21381492  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtac-aaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
     ||||||| |         |||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||      
T  21381493 ttttgaaatg---------cattggatgcctattcttcaaagagcgttgacatagtacgtctgtacgaaaatgtacaaccactacttccactactctgag 21381583  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||||  || ||||||||||    
T  21381584 tttgtctctgcaacaagacaag 21381605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 347 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 48382365 - 48382304
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtctacgctacaagacaagacaacag 407  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48382365 aagtgtacaaccgctacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaagacaacag 48382304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Original strand, 13174680 - 13174827
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||||  |||  ||||||||| ||    
T  13174680 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtctctacactacaagacaagaaaaacagctttgcatgcagaa-atgttacttcaagatagg 13174778  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||  ||||||||||||||    
T  13174779 aatggatttgaacgtgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaa 13174827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 401
Target Start/End: Original strand, 13260684 - 13260792
Alignment:
Q  293 tgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctac 392  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||  |||||    
T  13260684 tgaaagcattggatgcttgttcttggaagagcattgagatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacccagtttgtgtctctgctac 13260783  T
Q  393 aagacaaga 401  Q
    |||||||||    
T  13260784 aagacaaga 13260792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13303263 - 13303131
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggag 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  || | | | |||  ||||||||||| || |||    
T  13303263 attaaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaaatttgaaatcattattaggttatggaagaacaaaagagag 13303164  T
Q  100 caaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    ||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  13303163 caaagaaatcaacaaaaaagaagtttaaagcgt 13303131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Original strand, 23279759 - 23279879
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||  |||  |||||||||||||| ||||||    
T  23279759 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcataaaaaggttctggaagaacaatagagagcaa 23279858  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagc 123  Q
    |  ||||||| || |||||||    
T  23279859 aagaatcaacaaaaaggaagc 23279879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 48800360 - 48800524
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  48800360 aaaattgtcaaatggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagaacaaaagagagcaa 48800459  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcct 162  Q
     | ||||||| || ||||||||| |||| |     || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  48800460 tggaatcaacaaaaaggaagcttgaagcatctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgctcct 48800524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 363
Target Start/End: Original strand, 9098286 - 9098385
Alignment:
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  9098286 agtgaagcaacggctaattcaaaaggatttgaatgcattagatgtttgttctttgaagagcgttgaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactac 9098385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 400
Target Start/End: Original strand, 4412036 - 4412138
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||  || ||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  4412036 gcattggatgcttaattctcaaagagcgttgacattgtgcgtctgtacgaactgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctactacaagac 4412135  T
Q  398 aag 400  Q
    |||    
T  4412136 aag 4412138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 331 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4494628 - 4494558
Alignment:
Q  331 aaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  4494628 aaagtacaattgtacgaagtgtacaaccgctacctccactactctctttttgtctctgctacaagacaaga 4494558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 10882889 - 10883059
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggag 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||   || | | | |||  ||||||||||| || |||    
T  10882889 attaaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttggaatcattattaggttctggaagaacaaaagagag 10882988  T
Q  100 caaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||| ||||||| || | ||||||||||||||     || || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  10882989 caaaggaatcaacaaaaatgaagcttaaagcgtctgaagagaagtgctactgaagtcaaagtgctcctgaa 10883059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Original strand, 24794473 - 24794546
Alignment:
Q  19 atatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| ||||||||    
T  24794473 atatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaatatttgacaacttaaaaaggtcttgaaagaacaa 24794546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 460 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 48382297 - 48382201
Alignment:
Q  460 cttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctct 557  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||    
T  48382297 cttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacatgctaaaaatctcaacgtctct 48382201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13692772 - 13692612
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatca 110  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||| | | |||  ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  13692772 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaaattgatatctttattaggttctggaagaacaaaagagagcaaaggaatca 13692673  T
Q  111 acgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
       || ||||||||||| ||||     || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13692672 ggaaaaaggaagcttaaggcgtctgaagagaagtgctcctgaagacaaaagtgctcctgaa 13692612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15088921 - 15088801
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||| || |||||||| |||  ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15088921 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtggaggaccatagacaaaaattttacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 15088822  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||| || ||||||||| ||||    
T  15088821 aacaaaaaggaagcttgaagc 15088801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 16556525 - 16556581
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16556525 aaaactgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagacaaaa 16556581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16609137 - 16609081
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16609137 aaaactgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagactatagacaaaa 16609081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 19338979 - 19339066
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19338979 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaagactataga-aaatattgacatcttaaattggtcttgaaagaacaa 19339066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 489 - 565
Target Start/End: Original strand, 38593935 - 38594010
Alignment:
Q  489 aggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  38593935 aggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-caactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcacgcc 38594010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 44467489 - 44467370
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||| |||  ||||||||||| |  ||||||    
T  44467489 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcataaataggttctggaagaacaaaatagagcaa 44467390  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaag 122  Q
     | ||||||| || ||||||    
T  44467389 tggaatcaacaaaaaggaag 44467370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 332068 - 331963
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagc 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| || |||| ||| || |||| || |||||||    
T  332068 taatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaaatttgacatcttatattggttctggaagaacaaaagagagctaaggaaacaac-aaaaggaagc 331970  T
Q  124 ttaaagc 130  Q
    |||||||    
T  331969 ttaaagc 331963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 602828 - 602636
Alignment:
Q  319 aagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt-tttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctg 416  Q
    ||||| ||||||||| | |  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||    
T  602828 aagagagttgacaaaatgcatttgtacgaagcgtacaaccacttcctccactactctgttctttgtctacgctacaggacaagaaaaacagctctgcctg 602729  T
Q  417 cagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||||  ||| || ||||  |  ||||| |||||||    |||||||| || |||| | |||||||||||||||||| | |||||  |||||||    
T  602728 cagaa-atgttccctcaaattcagaatggatttgaaatcaattcttcataggactatatccaaatcaggcaaaggatcattggtgcttgatcaa 602636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Original strand, 21381182 - 21381259
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtctt-aaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || ||||||||    
T  21381182 tggatatgctaatatttgttcaagtgtataagactatagacaatatttgacatcttaaaattggtcctgaaagaacaa 21381259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28409473 - 28409344
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  || |||||||| || ||||||    
T  28409473 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtactggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctgtaagaacaaaagagagcaa 28409374  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    |  |||| || || |||||| || ||||||    
T  28409373 atgaatcgacaaaaaggaagtttgaagcgt 28409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 16316300 - 16316424
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaa 107  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  || |||||||| || |||| ||| ||    
T  16316300 tgtcaattagatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctgaaagaacaaaagagagctaaggaa 16316399  T
Q  108 tcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||    
T  16316400 tcaacaaaaaggaagcttgaagcgt 16316424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 13137655 - 13137810
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacga 114  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  ||||||||||| || |||  ||| ||||||| |    
T  13137655 tggatatactaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgatctctttattaggttctggaagaacaaaagagaggtaaggaatcaacaa 13137754  T
Q  115 agaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||||| |||| |     || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13137755 aaaggaagcttgaagcatctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgctcctgaa 13137810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 243
Target Start/End: Original strand, 7339831 - 7339893
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  7339831 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaaattgtttaatggatttaaactcgtctaa 7339893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 29935096 - 29935222
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatattt-gttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || | | | |||  ||||||||||| || ||||     
T  29935096 aaaattgtcaattggatatgctaatattttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgatatcattattaggttctggaagaacaaaagagagct 29935195  T
Q  102 aagaaatcaacgaagaggaagcttaaa 128  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  29935196 aaggaatcaacaaaaaggaagcttaaa 29935222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 13031806 - 13031934
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||| | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  13031806 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacataaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagaacaa-agagagcaa 13031904  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
     | ||||||| | || ||||||| ||||||    
T  13031905 tggaatcaacaaggatgaagcttgaagcgt 13031934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 309
Target Start/End: Original strand, 13472548 - 13472665
Alignment:
Q  193 agatgcaactcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggat 291  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||    || ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13472548 agatgaaacttaaagctttaaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagatcataagagtgaagcaacaactattttgaaaggat 13472647  T
Q  292 ttgaaggcattggatgct 309  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  13472648 ttgatggcatttgatgct 13472665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13649123 - 13648970
Alignment:
Q  19 atatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaaga 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  | ||||||||| || |||||||| ||||||| || |    
T  13649123 atatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctagaagaacaaaagagagcaaaggaatcaacaaaaa 13649024  T
Q  118 ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||| |||| ||||     || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13649023 ggaagtttaaggcgtctgaagagaagtgctcctgaagacaaaagtgctcctgaa 13648970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 13730429 - 13730558
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactataga-caaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||  || | | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  13730429 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagataaaaatttgaaatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcaa 13730528  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    || ||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  13730529 aggaatcaacaaaaaggaaacttaaggcgt 13730558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4494708 - 4494637
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgca 251  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  4494708 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgca 4494637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Original strand, 19710740 - 19710827
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaac 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || || ||   ||||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  19710740 taatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaagtttgatgtttttaaaaagtcttggaagaacaaaagagagcaaatgaatcaac 19710827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Original strand, 12366474 - 12366596
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaa 107  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  |||||||| || || |||||| | ||    
T  12366474 tgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagaaaaaaagagagcaatggaa 12366573  T
Q  108 tcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||||| || ||||||||| ||||    
T  12366574 tcaacaaaaaggaagcttgaagc 12366596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14193518 - 14193429
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||    
T  14193518 aaaattgtcaattggatatcctaatatgtgttcaagtgtacaagaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaa 14193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 5000573 - 5000629
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  5000573 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagaaaaaa 5000629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 13018243 - 13018299
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13018243 aaaattgtcaatttgatatgctaatattggttcaagtgtacatgaccatagacaaaa 13018299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15216910 - 15216826
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||   |   || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15216910 taatatttgttcaagtgtacaggaccataggcaaagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaagaaatc 15216826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27871911 - 27871863
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggat 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27871911 cagttcatcaggaaatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggat 27871863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 7487597 - 7487656
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaattt 63  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  7487597 aaaattgtcaattggatatactaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaattt 7487656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 362
Target Start/End: Original strand, 13032167 - 13032210
Alignment:
Q  319 aagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccacta 362  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  13032167 aagagcgttgacaaagtataattgtacgaagtgtacaaccacta 13032210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 14304099 - 14304158
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  14304099 attaaaaatgtcaattgaatatgataatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 14304158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 74
Target Start/End: Original strand, 9396651 - 9396709
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaa 74  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || | ||||||||    
T  9396651 tggatatgctaatatttgttcaagtgtgcatgaccatagactaaaatttatgtcttaaa 9396709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Original strand, 48805605 - 48805651
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtctt 71  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  48805605 taatatttgttcaagtgtacaagactatagacaatatgtgacatctt 48805651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 8998598 - 8998706
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||   |  | | ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  8998598 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaagttgatcaacat-aataggtcttggaagaacaaaagagagcaa 8998696  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    || |||||||    
T  8998697 aggaatcaac 8998706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9065873 - 9065824
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  9065873 tcaattggatatattaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 9065824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 45
Target Start/End: Original strand, 15701009 - 15701050
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtaca 45  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15701009 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtaca 15701050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4821793 - 4821761
Alignment:
Q  133 gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4821793 gaaaactgctcctgaagacaaagcgctcctgaa 4821761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 48
Target Start/End: Original strand, 7185310 - 7185342
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatga 48  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7185310 tggatatgctaatatttgttcaagtgtacatga 7185342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 9097958 - 9098014
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  9097958 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaactgtgcaggaccatagacaaaa 9098014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13881035 - 13880979
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  13881035 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatatacaaaa 13880979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 6926 - 7144
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6926 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 7025  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7026 tttgaagctaattctttaaaggactacacccaaaccaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggttttcaaacgactctttagacgtgctgattatc 7125  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7126 tcaacgtctctttcacgcc 7144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 187)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 29244431 - 29244215
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  29244431 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 29244332  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29244331 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 29244232  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  29244231 ctcaacgtctctttcac 29244215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 29255010 - 29254794
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  29255010 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 29254911  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29254910 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 29254811  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  29254810 ctcaacgtctctttcac 29254794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 43082856 - 43082640
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  43082856 aagtgtacaaccactacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 43082757  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43082756 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 43082657  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  43082656 ctcaacgtctctttcac 43082640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 17857456 - 17857675
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17857456 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 17857555  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17857556 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 17857655  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17857656 ctcaacgtctctttcacgcc 17857675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 7005826 - 7006042
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  7005826 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 7005925  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7005926 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 7006025  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  7006026 ctcaacgtctctttcac 7006042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 43093465 - 43093249
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  43093465 aagtgtacaaccactacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 43093366  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43093365 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 43093266  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  43093265 ctcaacgtctctttcac 43093249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 9897593 - 9897812
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9897593 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 9897692  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9897693 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9897792  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9897793 ctcaacgtctctttcacgcc 9897812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 9908181 - 9908400
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9908181 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 9908280  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9908281 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9908380  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9908381 ctcaacgtctctttcacgcc 9908400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 36251863 - 36252082
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  36251863 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 36251962  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36251963 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 36252062  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36252063 ctcaacgtctctttcacgcc 36252082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 40222542 - 40222323
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  40222542 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 40222443  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40222442 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 40222343  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40222342 ctcaacgtctctttcacgcc 40222323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 40251403 - 40251184
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  40251403 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 40251304  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40251303 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 40251204  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40251203 ctcaacgtctctttcacgcc 40251184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 1099214 - 1099433
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  1099214 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 1099313  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1099314 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 1099413  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1099414 ctcaacgtctctttcacgcc 1099433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4220692 - 4220473
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  4220692 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 4220593  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4220592 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 4220493  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4220492 ctcaacgtctctttcacgcc 4220473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 11388828 - 11389047
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  11388828 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 11388927  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11388928 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 11389027  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11389028 ctcaacgtctctttcacgcc 11389047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 22914883 - 22915102
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22914883 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 22914982  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22914983 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 22915082  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22915083 ctcaacgtctctttcacgcc 22915102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 24327753 - 24327972
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24327753 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 24327852  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24327853 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacatgctgattat 24327952  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24327953 ctcaacgtctctttcacgcc 24327972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 32218083 - 32217864
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  32218083 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 32217984  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32217983 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 32217884  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32217883 ctcaacgtctctttcacgcc 32217864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 34790236 - 34790455
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  34790236 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 34790335  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34790336 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 34790435  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34790436 ctcaacgtctctttcacgcc 34790455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 34804379 - 34804598
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  34804379 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 34804478  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34804479 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtggtgattat 34804578  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34804579 ctcaacgtctctttcacgcc 34804598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 21172486 - 21172703
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172486 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcttgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 21172584  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  21172585 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 21172684  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21172685 tcaacgtctctttcacgcc 21172703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10267203 - 10266987
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  10267203 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 10267104  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10267103 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 10267004  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  10267003 ctcaacgtctctttcac 10266987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10277780 - 10277564
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  10277780 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 10277681  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10277680 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 10277581  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  10277580 ctcaacgtctctttcac 10277564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 11395191 - 11395407
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  11395191 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 11395290  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11395291 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 11395390  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  11395391 ctcaacgtctctttcac 11395407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 11405507 - 11405723
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  11405507 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 11405606  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11405607 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 11405706  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  11405707 ctcaacgtctctttcac 11405723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 24338423 - 24338639
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24338423 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatga 24338522  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24338523 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgatggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacatgctgattat 24338622  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  24338623 ctcaacgtctctttcac 24338639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 39170114 - 39170330
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  39170114 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 39170213  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39170214 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 39170313  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  39170314 ctcaacgtctctttcac 39170330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4210100 - 4209881
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  4210100 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 4210001  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4210000 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 4209901  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4209900 ctcaacgtctctttcacgcc 4209881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 9762789 - 9763008
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9762789 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 9762888  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9762889 atttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9762988  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9762989 ctcaacgtctctttcacgcc 9763008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 9773325 - 9773544
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9773325 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 9773424  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9773425 atttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 9773524  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9773525 ctcaacgtctctttcacgcc 9773544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 16769152 - 16768933
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  16769152 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 16769053  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16769052 atttgaagcttattcttcaaaggaccacacccaaatcaggcaaagtattactggtgaataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 16768953  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16768952 ctcaacgtctctttcacgcc 16768933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 18392656 - 18392875
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  18392656 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 18392755  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18392756 atttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgactat 18392855  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18392856 ctcaacgtctctttcacgcc 18392875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 22960351 - 22960570
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||    
T  22960351 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgagaatga 22960450  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22960451 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 22960550  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22960551 ctcaacgtctctttcacgcc 22960570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 28721336 - 28721550
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28721336 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 28721434  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  28721435 tttgaagttaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 28721534  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  28721535 tcaacgtctctttcac 28721550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 2561698 - 2561481
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2561698 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaa 2561600  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2561599 tttgaagataattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatc 2561500  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2561499 tcaacgtctctttcacgcc 2561481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 18768926 - 18769142
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18768926 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 18769024  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  18769025 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 18769123  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18769124 tcaacgtctctttcacgcc 18769142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27221591 - 27221371
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  27221591 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 27221492  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27221491 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 27221392  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27221391 tctcaacgtctctttcacgcc 27221371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 35253192 - 35252972
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  35253192 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35253093  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35253092 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 35252993  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35252992 tctcaacgtctctttcacgcc 35252972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 35263801 - 35263581
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  35263801 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35263702  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35263701 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 35263602  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35263601 tctcaacgtctctttcacgcc 35263581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 35274426 - 35274206
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  35274426 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35274327  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35274326 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 35274227  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35274226 tctcaacgtctctttcacgcc 35274206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 21650551 - 21650769
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  21650551 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 21650649  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21650650 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 21650749  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21650750 ctcaacgtctctttcacgcc 21650769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 34478137 - 34477919
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  34478137 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 34478039  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34478038 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 34477939  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34477938 ctcaacgtctctttcacgcc 34477919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 43355231 - 43355013
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  43355231 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatgggaatga 43355133  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43355132 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 43355033  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43355032 ctcaacgtctctttcacgcc 43355013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 30488842 - 30489062
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||| |    
T  30488842 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaacg 30488941  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30488942 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatta 30489041  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30489042 tctcaacgtctctttcacgcc 30489062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 43345616 - 43345398
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||| |||||    
T  43345616 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt-gtacactcaagatggaaatga 43345518  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43345517 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 43345418  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43345417 ctcaacgtctctttcacgcc 43345398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 27978402 - 27978618
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  27978402 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgagaatgaa 27978500  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  27978501 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 27978599  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27978600 tcaacgtctctttcacgcc 27978618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 28064931 - 28065147
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  28064931 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgagaatgaa 28065029  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  28065030 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 28065128  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28065129 tcaacgtctctttcacgcc 28065147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 355 - 562
Target Start/End: Original strand, 28731930 - 28732136
Alignment:
Q  355 aaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagc 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28731930 aaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagt 28732028  T
Q  455 tgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtc 554  Q
    | |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  28732029 taattcctcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtc 28732128  T
Q  555 tctttcac 562  Q
    ||||||||    
T  28732129 tctttcac 28732136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 38586107 - 38586320
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  38586107 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctaaaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 38586205  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  38586206 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 38586304  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  38586305 tcaacgtctctttcac 38586320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 24415042 - 24415258
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24415042 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgagaatgaa 24415140  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  24415141 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 24415239  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24415240 tcaacgtctctttcacgcc 24415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 26867280 - 26867064
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26867280 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 26867182  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  26867181 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattgttggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 26867083  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26867082 tcaacgtctctttcacgcc 26867064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 26879869 - 26879656
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26879869 aagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 26879771  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  26879770 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattgctggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 26879672  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  26879671 tcaacgtctctttcac 26879656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 181 - 528
Target Start/End: Original strand, 6574023 - 6574371
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaa-gcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6574023 cagttcatcagaagatgcaacataaagcttcaaaggttgttcaattgatttaatctcgtctaatgcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgacta 6574122  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtac-gattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg-t 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6574123 gtttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 6574222  T
Q  378 ttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacc 476  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| | ||||||  |||||||| ||  ||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||| ||||| || || | | |    
T  6574223 ttttgtctctgctacaaaacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataac 6574321  T
Q  477 caaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 528  Q
    || |||||||||| ||| | |||||  |||||||||   |||||||||||||    
T  6574322 catatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaag--cttcaaacgactct 6574371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 36784824 - 36785031
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36784824 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-------gcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 36784915  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  36784916 tttgaagttgatccctcaaatgactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatc 36785015  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  36785016 tcaacgtctctttcac 36785031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Original strand, 20151915 - 20152118
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaac-tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactg 259  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20151915 ctgaaaatcaccagaagctgcagctcatcaggagatgcaacattaaagcttcaaaagttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactg 20152014  T
Q  260 gaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaacca 359  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20152015 gaaaagtgaagcaacggttagtttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacca 20152114  T
Q  360 ctac 363  Q
    ||||    
T  20152115 ctac 20152118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 967522 - 967730
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  967522 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 967620  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  967621 tttgaagttgatccgtcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 967719  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  967720 tcaacgtctct 967730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 347 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4099993 - 4099819
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  4099993 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 4099894  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaa 520  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4099893 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaa 4099819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 177 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25829339 - 25829114
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25829339 gctaaagttcatcaggagatgcaagacttagagcttcaaaggatgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaac 25829240  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25829239 gactattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 25829140  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
      ||| |||||  ||| |||||||||    
T  25829139 attttgtgtctctgctgcaagacaag 25829114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30667189 - 30666969
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  30667189 agttcatcaggagatgcaagaattaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagaatgaagcaacgacta 30667090  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30667089 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgatctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 30666990  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  30666989 gtgtctctgctacaagacaag 30666969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6392834 - 6392613
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaag-gatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||  |||||| || || |||||||||| ||||||| | |||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6392834 cagttcatcagaggatgcatcttaaggcttcaaaagctgtttaatgtgattcaacctcgtctaaggattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgacta 6392735  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctc-aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  6392734 ttttgaaaggatttgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgcgcaaccactacctccactactctg-t 6392636  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  6392635 tttgtctctgctacaagacaaga 6392613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 24275235 - 24275027
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  24275235 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 24275137  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||  |||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  24275136 tttgaatttgatccgtcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 24275038  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  24275037 tcaacgtctct 24275027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 401
Target Start/End: Original strand, 28711582 - 28711819
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaa 263  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||| | | ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||  || || ||||||  |||||| |||||||||||    
T  28711582 aaaatcaccagaagctgcagttcataatgggatgcaacttaaggcttcaaaagctgtttaatggattcaaccttgtctaaagattgcagaagactggaaa 28711681  T
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    ||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28711682 agtaaagcaacgactatttcgaatgaatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgaaaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactac 28711781  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  28711782 ctccactactctgtttttgtctctgctaaaagacaaga 28711819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 31800788 - 31801008
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||| || ||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||     
T  31800788 cagttcatcatgggatgcaacttaaagcttcaaaagctgcttagtggatccaaactcgtctatttattgcagaagactggaaaagtgaaacaacaactat 31800887  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31800888 tttgaaaggatttgaaagcattggatgtttgatcttcaaagagcgttgacaaagtacatttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 31800987  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  31800988 tgtctctgctacaagacaaga 31801008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 161 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23235228 - 23234987
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagact 258  Q
    ||||||||||  ||| |||  ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23235228 ctgaaaatcaccagaagctctagttcatcatgagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagact 23235129  T
Q  259 ggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaacc 358  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23235128 ggaagagtaaagcaacgactattttgaaagaatttgaaggcattggatgcttattctttgaagagtgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacc 23235029  T
Q  359 actacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  23235028 actatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 23234987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 13963878 - 13964098
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||| ||||||||   | ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  13963878 agttcatcagtagatgcaagatttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagactgaaagagtgaagcaacgacta 13963977  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13963978 ttttgaaagaatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 13964077  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  13964078 gtgtctctgctacaagacaag 13964098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 347 - 559
Target Start/End: Original strand, 17969228 - 17969438
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  17969228 aagtgtacaaccactacatccactactctatttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 17969326  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  17969327 tttgaagttaatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 17969425  T
Q  547 tcaacgtctcttt 559  Q
    |||||||||||||    
T  17969426 tcaacgtctcttt 17969438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33074424 - 33074205
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  33074424 agttcatcaggagatgcaacttaaaacttcaaaagctgtttaaaggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactatt 33074325  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| |  |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33074324 ttggacagattggaaggcattagatgcttattcttcaaaaaacgttgacataatacgattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttttt 33074225  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  33074224 gtctctgctacaagacaaga 33074205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 19498010 - 19498218
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||    
T  19498010 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctactctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcctttaagataggaatgaa 19498108  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  19498109 tttgaacttgatccttcataggactacacccaaatcatgcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 19498207  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  19498208 tcaacgtctct 19498218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22802659 - 22802440
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||| |||| || |||||| | |||     
T  22802659 cagttcatcaggagatgcaacttaaagattcaaaagctatttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactagaaaggtaaagcaatggctat 22802560  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22802559 tttgaaaggatttgaaggcatatgatgcttattcttcaaagagagttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttt 22802461  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  22802460 tgtctctgctacaagacaaga 22802440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 20568650 - 20568871
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| | ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |    
T  20568650 agttcatcaggagatgcaagacttaaagctttaaaggctgttccatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaacaa 20568749  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  20568750 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatccccactactcagttt 20568849  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     ||| |  |||| |||||||||    
T  20568850 gtgtatctgctataagacaaga 20568871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 22774568 - 22774380
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  22774568 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 22774470  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  22774469 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 22774380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 411 - 565
Target Start/End: Original strand, 24427670 - 24427823
Alignment:
Q  411 tgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24427670 tgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagtcaaaggattactggtgaatgatcaa 24427769  T
Q  511 aggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||  || |||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||    
T  24427770 aggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatcttaacgtctctttcacgcc 24427823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38781575 - 38781377
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||  ||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38781575 aaagcttcaaaggttgttcaattgatttaatctcgtctaaacaatgtagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattg 38781476  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactct-gtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  38781475 aatgattgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacatccactactctattttttgtctctgctacaagacaaga 38781377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 401
Target Start/End: Original strand, 28701113 - 28701350
Alignment:
Q  164 aaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaa 263  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||||  |||  || ||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  28701113 aaaatcaccagaagctgcagttcatcatgggatgcaacttaaggcttcaaaagctgtttaatagattcaacctcgtcttaagattgcagaagactggaaa 28701212  T
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    ||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||    
T  28701213 agtaaagcaacagatattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagggcgttgacaaagtaagtttgtacgaagtgtacaaccattac 28701312  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  28701313 ctccactactttgtttttgtccctgctacaagacaaga 28701350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Original strand, 34321840 - 34322057
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||  |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||    
T  34321840 ttcatcaggagatgcaacttaaagcctcaaaagctgtttaaaggattcaaactcgtctaaagattgcagaagcctggaaaagtatagcaacgactatttt 34321939  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  34321940 gaaaggattgaaaggcattggattcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactatcttcactactctatttttgt 34322039  T
Q  384 ctacgctacaagacaaga 401  Q
     |  ||||||||||||||    
T  34322040 ttctgctacaagacaaga 34322057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 177 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24576241 - 24576014
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaa-tctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaa 273  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24576241 gctaaagttcattaggagatgcaatacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaaatctcatctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaa 24576142  T
Q  274 cgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactact 373  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24576141 caactattttgaaaggatttaaaggcattggttgtttgttcgttgaagagagttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactact 24576042  T
Q  374 ctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
      |||| |||||  ||||||||||||||    
T  24576041 tagtttgtgtctctgctacaagacaaga 24576014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 186 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 30621412 - 30621177
Alignment:
Q  186 catcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    |||||||||||||||   | |||| |||||| | |||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  30621412 catcaggagatgcaagaattaaaggttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtgtaagcattgcagaagactggaagagtgaagcagcgactatttt 30621313  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  30621312 gaaaggatttgaaggcattggatgtttgatctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtaaaaccactatctccactactcagtttgtgt 30621213  T
Q  384 ctacgctacaagacaa-gacaacagccttgcctgca 418  Q
    || |||||||| |||| || |||||| |||||||||    
T  30621212 ctccgctacaacacaatgataacagcgttgcctgca 30621177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 186 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 30624033 - 30623798
Alignment:
Q  186 catcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    |||||||||||||||   | |||| |||||| | |||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  30624033 catcaggagatgcaagaattaaaggttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtgtaagcattgcagaagactggaagagtgaagcagcgactatttt 30623934  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  30623933 gaaaggatttgaaggcattggatgtttgatctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtaaaaccactatctccactactcagtttgtgt 30623834  T
Q  384 ctacgctacaagacaa-gacaacagccttgcctgca 418  Q
    || |||||||| |||| || |||||| |||||||||    
T  30623833 ctccgctacaacacaatgataacagcgttgcctgca 30623798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 21537148 - 21537369
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  21537148 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtttaaacattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgacta 21537247  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21537248 ttttgaaaggttttggaggcattggatgcttgctttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 21537347  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  ||||||||||||||    
T  21537348 gtgtctttgctacaagacaaga 21537369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 184 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 22317792 - 22317447
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||| |||||||||  || ||||||||||| | | || |  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  22317792 ttcatcaagagatgcaagacttaaagcttcaaaggcttttcattggatttaatctcatctaagcattgcataagactagaagagtgaagcaacgactatt 22317693  T
Q  282 tt-gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22317692 tttgaaaggatttaaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtatacaaccactacctccactattcagtttt 22317593  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaa 479  Q
    | |||  ||| ||||||||| | ||||||  |||||||| |   ||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||| ||||| || || | | |||     
T  22317592 tatctctgctgcaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccat 22317494  T
Q  480 atcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactct 528  Q
    |||||| ||| ||| | |||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  22317493 atcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaag--tttcaaacgactct 22317447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 30557220 - 30557441
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagg-atctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||  ||||||||| || |||||||||  ||||||| || ||  || |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  30557220 cagttcatcagaggatgcaacttaaggcttcaaaaattgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgcagaggactgaaaaagtgaagcatcgacta 30557319  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaa-gagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
     |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  30557320 ttttgaaagaatttgaacacattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactct-at 30557418  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  30557419 tttgtctctgctacaagacaaga 30557441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Original strand, 18376830 - 18377027
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| |  || |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18376830 aaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagattttaatagtgaatcaactactattttgaaaggatttgaaggcattg 18376929  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  18376930 gatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaggacaaga 18377027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 22188002 - 22188222
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22188002 agttcatcaggacatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagtattgcagaagactgaaagagtgaagcaacaacta 22188101  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22188102 ttttgaatagatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttaacaaagtataattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 22188201  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  22188202 gtgtctctgctacaagacaag 22188222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 25037159 - 25037379
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || ||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  25037159 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatcttgtcgaagcattgcagaagactggaagagtgatgtaacgacta 25037258  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25037259 atttgaaaggatttgaaagcattggatgtttgttctttgaaaagcgttgacaaagtacaattgttcgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 25037358  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  25037359 gtgtctctgctacaagacaag 25037379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 25041266 - 25041486
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || ||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  25041266 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatcttgtcgaagcattgcagaagactggaagagtgatgtaacgacta 25041365  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25041366 atttgaaaggatttgaaagcattggatgtttgttctttgaaaagcgttgacaaagtacaattgttcgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 25041465  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  25041466 gtgtctctgctacaagacaag 25041486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19540616 - 19540395
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | | |||||||||||| |||    
T  19540616 agttcatcatgagatgcaagacttaaagcttcaaatgttgttcaatggatttaatctcatctaagcattgcagaagactaggagagtgaagcaacggcta 19540517  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     || |||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19540516 tttcgaaaggttttgaaggtattggatgcttgttctttaaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 19540417  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||  |||||||| |||||    
T  19540416 gtgtctctgctacaaggcaaga 19540395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 365
Target Start/End: Original strand, 45087079 - 45087269
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaa-gatgtttaaagg-atctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||| || ||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45087079 gctacagttcatcagaggatgcaacttaaagcttcaaaaagttgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgcagaagactggaaaagtgaagcaac 45087178  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacct 365  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45087179 gactattttgaaaggatttgaatgcattagatgcttattctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacct 45087269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 31327866 - 31328086
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaa-gatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| || ||||  || |||| ||||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  31327866 cagttcatcaggagatgcaacttaaagtttcaaaaagttgttcaacggattcaaactcgcctaaagattgcagaagactagagaagtgaagcaacgacta 31327965  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31327966 ttttggagggttttgaaagcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtatgttcgaacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-tt 31328064  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  31328065 ttgtctctgctacaagacaaga 31328086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 31334587 - 31334807
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaa-gatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| || ||||  || |||| ||||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  31334587 cagttcatcaggagatgcaacttaaagtttcaaaaagttgttcaacggattcaaactcgcctaaagattgcagaagactagagaagtgaagcaacgacta 31334686  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31334687 ttttggagggttttgaaagcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtatgttcgaacgaagtgtacaaccactacctccactactctg-tt 31334785  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  31334786 ttgtctctgctacaagacaaga 31334807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 20151726 - 20151881
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaa 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||    
T  20151726 tggatatggtaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagcaaagtaattaacaaa 20151825  T
Q  116 gaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaaa 166  Q
     ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20151826 aaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaaa 20151881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 9015270 - 9015488
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  9015270 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatcttgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaaacaacaacta 9015369  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9015370 ttttgaaaggatttgaaagcattggatgcttattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtac--ggtgtacaaccactatctccactactcagttt 9015467  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     | |||  |||| ||||||||    
T  9015468 gtatctctgctataagacaag 9015488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 19300029 - 19300238
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  19300029 aagtgtacaaccactacctccacaactctgagtgtgtctacgctaccagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 19300127  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgttgattat 545  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||| | |  ||    
T  19300128 tttgaagtttatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggtactc-aacgactctttaagacgtgcttaagat 19300226  T
Q  546 ctcaacgtctct 557  Q
    ||||||||||||    
T  19300227 ctcaacgtctct 19300238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 19313036 - 19313245
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| | ||||||    
T  19313036 aagtgtacaaccactatctccacaactctgagtgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagatagaaatgaa 19313134  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgttgattat 545  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||| | |  ||    
T  19313135 tttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggtactc-aacgactctttaagacgtgcttaagat 19313233  T
Q  546 ctcaacgtctct 557  Q
    ||||||||||||    
T  19313234 ctcaacgtctct 19313245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 22763864 - 22763676
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  22763864 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaccagctctacctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 22763766  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||  |||| | ||| || |  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  22763765 tttgaacttgatccgtcataggagaacatccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 22763676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 173 - 418
Target Start/End: Original strand, 24850556 - 24850805
Alignment:
Q  173 agatgctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaa 269  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||| |||||||  |||||  ||| ||||||    
T  24850556 agatgctgaagtacatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctacgcattgctgaagaccagaagagtgaa 24850655  T
Q  270 gcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccac 369  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  24850656 gcaacgaatattttgaaaggatttcaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaagtgtacgaaatgtacaaccactacatccac 24850755  T
Q  370 tactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgca 418  Q
    ||||| || | |||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  24850756 tactcagtgtgtgtctctgctacaagacaagaataacagctttgcctgca 24850805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 10009649 - 10009871
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactg-gaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||  | |||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||    
T  10009649 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaagggctgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccaagaggagtgaagcaacaact 10009748  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10009749 attttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagaacgttgacatagtacaattgtacgaaatgtacaaccactatctccactactcagtt 10009848  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | |||||  ||||||||||||||    
T  10009849 tgtgtctctgctacaagacaaga 10009871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 20646626 - 20646835
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  20646626 aagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgca-aaaatgttccttcaagataggaatgga 20646724  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg-ttgattat 545  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |  ||    
T  20646725 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtgcttaaagat 20646823  T
Q  546 ctcaacgtctct 557  Q
    ||||||||||||    
T  20646824 ctcaacgtctct 20646835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24377301 - 24377080
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgact 278  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| | ||| || |||| ||||| || ||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  24377301 agttcatcaagagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgact 24377203  T
Q  279 aatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24377202 attttgaaaggttttgagagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtt 24377103  T
Q  379 tttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    | |||||  ||||||||||||||    
T  24377102 tgtgtctctgctacaagacaaga 24377080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 232 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40782625 - 40782457
Alignment:
Q  232 aatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgaca 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  40782625 aatctcgtccaagcattgcaaaagaccagaggagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaagcattggatgtttgttctttgaagagcgttgaca 40782526  T
Q  332 aagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||  |||||||||||||    
T  40782525 tagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccaatacttagtttgtgtctctgctacaagacaag 40782457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 28711376 - 28711543
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  28711376 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtactagactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 28711475  T
Q  104 gaaatcaac-gaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | |||||||  || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28711476 ggaatcaacaaaaaaggaagcttaaagcgtttgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 28711543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 19356529 - 19356321
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | | ||  || |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  19356529 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtctcctcgttacaagacaagttaacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 19356431  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  19356430 tttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaaagattactgatggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagatc 19356332  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  19356331 tcaacgtctct 19356321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 22776200 - 22776408
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |  |  |||| ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |    
T  22776200 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggtttcagactcgcctaaa-attgcaaaagacttgaaaagtatagcaacggctatt 22776298  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||||         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22776299 ttgaaagg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccagtactctgttttt 22776389  T
Q  382 gtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  22776390 gtctctgctacaagacaag 22776408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 22781578 - 22781786
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |  |  |||| ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |    
T  22781578 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggtttcagactcgcctaaa-attgcaaaagacttgaaaagtatagcaacggctatt 22781676  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||||         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22781677 ttgaaagg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccagtactctgttttt 22781767  T
Q  382 gtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  22781768 gtctctgctacaagacaag 22781786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 28550829 - 28551039
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||||| ||||||  || |||| ||||  |||||| ||||||||||||||  || ||| ||||     
T  28550829 cagttcatcaggagatgcaatttaaaacctcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgcctaaa-attgcagaagactggaaaagtatagaaacaactat 28550927  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28550928 tttgaaagg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 28551018  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  28551019 tgtctctgctacaagacaaga 28551039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 28700875 - 28701042
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  28700875 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacagggctatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 28700974  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28700975 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 28701042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 385
Target Start/End: Original strand, 35743883 - 35744105
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagga-tctaatctcgtctaagcattgcaaaagactg 259  Q
    ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  || || ||   |||||||  |||||| || | ||    
T  35743883 ctgaaaatcaccagaagctgtagttcatcaggagatgcaacttaaagcgtcaaaagttgtttaacagactcaaa---cgtctaaagattgcagaatattg 35743979  T
Q  260 gaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaacca 359  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||| |    
T  35743980 gaaaagtatagcaacgactattttggaaggatttgaaggcattgaatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaaatgtacaacta 35744079  T
Q  360 ctacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35744080 ctatctccactactcagtttttgtct 35744105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44840622 - 44840414
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||| |||| ||||||| | ||||| ||||||   ||||||||||     
T  44840622 cagttcatcaagagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgcctaa-cattgcaga-gactgaaaaagtatggcaacgactat 44840525  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44840524 tttgaaagg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 44840434  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||  |||| ||||||||    
T  44840433 tgtctctgctataagacaag 44840414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 280 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 1084106 - 1083884
Alignment:
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1084106 atttgaaaggaattgaaggcattagatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtac--------aaagtgtacgaccactacctccactactctgttt 1084015  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacaccca 478  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||    
T  1084014 ttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaacca 1083916  T
Q  479 aatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    ||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  1083915 aatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 1083884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Original strand, 41121644 - 41121840
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||| || ||| |||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41121644 aaagcttcaaaggctgttcaaaggatttaatcacgccta-gcattgcagaagattggatgagtgaagcaaagactaattcaaaaggatttgaaggcattg 41121742  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||  ||| || |  |||||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||    
T  41121743 gattattgctctttgaagagcattgacaaagtacaattgtgcgaaatgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctctgctacaggacaaga 41121840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22260603 - 22260432
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||    
T  22260603 tcatcaggagatgcaagacttaaagcgtcaaaagttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaaatattt 22260504  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtac 354  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  22260503 tggaaggatttgaaggaactggatgcttgttctttgaagagctttgacatagtacaattgtaagaagtgtac 22260432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 31967954 - 31968164
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||  || ||||  |||  |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||     
T  31967954 cagttcatcagaagatgcaacttaaagcctcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgcataaa-attgcagaagactggaaaagtatagcaacaactat 31968052  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||| |         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31968053 tttgaaatg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacataatacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 31968143  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  31968144 tgtctctgctacaagacaaga 31968164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24779518 - 24779323
Alignment:
Q  205 aagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattgg 304  Q
    |||||||||| | |||| || ||||  ||||||||| |||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  24779518 aagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgaaaaagaccagaggagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaagcatcgg 24779419  T
Q  305 atgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||| |||||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  24779418 atgtttgttctttgaagagtgttgacatagtacaattgtatgaagtgtataaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 24779323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 400
Target Start/End: Original strand, 39037595 - 39037762
Alignment:
Q  233 atctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaa 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||  || | | ||||||||||| |||||||| |  |  ||||||||||||||    
T  39037595 atctcgtctaagcattgcagaagattaggaaagtgaagcaacggctaattcaaatgaagttgaaggcattagatgcttgctttttgaagagcgttgacaa 39037694  T
Q  333 agtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||    
T  39037695 agtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacatgacaag 39037762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 28140519 - 28140739
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| | |||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||| ||||    
T  28140519 agttcatcgggagatgcaagacttaaaacttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagatcattggagtgaagcaacaacta 28140618  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  28140619 ttttgaaaggatttgaaaacattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacaaagtgtaccatcactatctccactactcagttt 28140718  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||| ||||    
T  28140719 gtgtctctgctacaaggcaag 28140739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 347 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 22779946 - 22779811
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  22779946 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 22779848  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatca 483  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||    
T  22779847 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatca 22779811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 1586944 - 1587153
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||| |  |||||| ||||||| ||||||    ||||| ||| |    
T  1586944 agttcatcaggagatggaacttaaagcttcaaaagttgtttaaaggattcaaactcatctgaagattgcagaagactgaaaaagtattacaacggctatt 1587043  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||||         |||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1587044 ttgaaagg---------cattggatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctg-tttt 1587133  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  1587134 gtctctgctacaagacaaga 1587153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 6573802 - 6573965
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  6573802 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaatctgacatcttaaaaagatcttggaagaacaatagggagcaaa 6573901  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcct 162  Q
    | ||| ||| || |||||||||||| | |     ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6573902 ggaattaacaaaaaggaagcttaaaacatctgaagaaaaatgcttctgaagacaaagtgctcct 6573965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22318049 - 22317882
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  |||  | |||||||||||| ||||||    
T  22318049 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctagaagaacaatagagagcaa 22317950  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||     || |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22317949 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaactgctcctgaagtcaaagtgctactgaa 22317882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 400
Target Start/End: Original strand, 22785562 - 22785775
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||  |  || |||| ||||  |||||| || |||||||| ||  ||||||||    
T  22785562 gctacagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctatttcaagatttcaaactcgcctaaa-attgcagaaaactggaaatgtatagcaacga 22785660  T
Q  277 ctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    ||| |||||||||         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22785661 ctattttgaaagg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacttttgtacaaagtgtataaccactatctccactactctg 22785751  T
Q  377 tttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    | ||| |||   ||||||||||||    
T  22785752 tctttatctctactacaagacaag 22785775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 295 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40332172 - 40332069
Alignment:
Q  295 aaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaa 394  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  40332172 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactaactccattactctgtttttgtctctgctacaa 40332073  T
Q  395 gaca 398  Q
    ||||    
T  40332072 gaca 40332069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 295 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14581600 - 14581494
Alignment:
Q  295 aaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaa 394  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  14581600 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccacttctctgattttgtctctgctacaa 14581501  T
Q  395 gacaaga 401  Q
    |||||||    
T  14581500 gacaaga 14581494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22802911 - 22802782
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||     
T  22802911 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagtaat 22802812  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt 132  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  22802811 gaaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgt 22802782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Original strand, 23595494 - 23595688
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||| |  ||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  23595494 aaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcacaccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactaattcaaatgaatttgaaggcattg 23595592  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  23595593 gattcttgttc-tctga-agcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtagaaccactacctcctctactcagtttgtgtctctgctacaggacaaga 23595688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 45086798 - 45086927
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  45086798 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactacagacaaaatttgatatcttaaaaaggttttggaagaacaataaagagcaaa 45086897  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt 132  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  45086898 gaagtcaacaaaaagggaagcttaaagcgt 45086927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3277219 - 3277032
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||  || || |||| |  |||||| ||||||| ||||||  | ||||| |||||    
T  3277219 agttcattaggagatggaacttaaagcttcaaaagttgtttaaagaattcaaacttgtctgaagattgcagaagactgaaaaagtataacaacggctaat 3277120  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtt 378  Q
    |||         ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3277119 ttg---------gaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgatatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactatgtt 3277032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 28550588 - 28550740
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  28550588 aaaattgtcaattggatattctaatatttgttcaagtgtacaagactctagacaaaaatttgacatcttaaattggtcttggaagaacaaataaagagca 28550687  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  28550688 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtttgagaaaactgctcctgaag 28550740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 31967712 - 31967843
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  31967712 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaaataaagagca 31967811  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt 132  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  31967812 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgt 31967843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 34321565 - 34321735
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa--tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagc 100  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||  ||||    
T  34321565 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagc 34321664  T
Q  101 aaagaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||| | |||||| || ||| ||| |||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34321665 aaatacatcaacaaaaagggaagtttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 34321735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 347 - 408
Target Start/End: Original strand, 28374534 - 28374595
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagc 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28374534 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagc 28374595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 40332519 - 40332430
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40332519 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaattgatcttggaagaacaa 40332430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 510
Target Start/End: Original strand, 24814609 - 24814813
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  24814609 gcattgggtgcttgtccatcaaagagagttgacaaagtacga--------agtgtacaaccactacctccactactccgcttttttctacgctacaagac 24814700  T
Q  398 aag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattac 496  Q
    ||| | ||||||  |||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| |     
T  24814701 aagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcat 24814799  T
Q  497 tggtggatgatcaa 510  Q
    |||||  |||||||    
T  24814800 tggtgattgatcaa 24814813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23235444 - 23235277
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  | ||||||||| || ||||||    
T  23235444 aaaattgtcaactggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctagaagaacaaaagagagcaa 23235345  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
       ||||||| || || |||||||||||||     || || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23235344 ttgaatcaacaaaaagtaagcttaaagcgtctgaagagaagtgctcttgaagtcaaagtgctcctgaa 23235277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 380
Target Start/End: Original strand, 26619066 - 26619201
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||||| |||||| ||| |   ||| |||||| |||| || ||||||    
T  26619066 cattgcagaagactggaagaatgaagcaacaactatttcaaaagaatttgaaggcattgaatgcttattctttggagaacgttgaaaaaggacaattgta 26619165  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26619166 cgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 26619201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 31327619 - 31327785
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||||||  |||||||    
T  31327619 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagcgtacatgactatagacaaaacttgatatcttaaaaaggtcctggaagaacaataaagagcaaa 31327718  T
Q  104 gaaatcaacgaagag-gaagcttaaagcg-----tgaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctga 164  Q
    |  |||||| || || ||||||||| |||      |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  31327719 ggcatcaacaaaaagagaagcttaacgcgcctgaagaaaactgctcctgaagttaaagcgctcctga 31327785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 31334340 - 31334506
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||||||  |||||||    
T  31334340 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagcgtacatgactatagacaaaacttgatatcttaaaaaggtcctggaagaacaataaagagcaaa 31334439  T
Q  104 gaaatcaacgaagag-gaagcttaaagcg-----tgaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctga 164  Q
    |  |||||| || || ||||||||| |||      |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  31334440 ggcatcaacaaaaagagaagcttaacgcgcctgaagaaaactgctcctgaagttaaagcgctcctga 31334506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 1586702 - 1586871
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||    
T  1586702 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcgagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagca 1586801  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||      ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  1586802 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaaaaaaactgctcctgaagttaaaatgctcctgaa 1586871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 13963673 - 13963782
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  13963673 aaaattgtcaattagatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaa 13963772  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    || |||||||    
T  13963773 aggaatcaac 13963782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 401
Target Start/End: Original strand, 22455002 - 22455111
Alignment:
Q  292 ttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgcta 391  Q
    |||||||||||||||||||| |  |  || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||    
T  22455002 ttgaaggcattggatgcttgctttttgaaaagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccagtacctccactactcagtttgtgtctctgcta 22455101  T
Q  392 caagacaaga 401  Q
    || |||||||    
T  22455102 catgacaaga 22455111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 31800545 - 31800716
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatga---ctatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggag 99  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||| | |||||   |||||||||||||||||  ||     
T  31800545 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacaagatcactatagacaaaaatttgacatattaaaaatgtcttggaagaacaataaagaa 31800644  T
Q  100 caaagaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31800645 caaaggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagtgctcctgaa 31800716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25189535 - 25189404
Alignment:
Q  243 agcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattg 342  Q
    ||||||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||  || | | ||||||||||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  25189535 agcattgcagaagaccaggagagtgaagcaatgactaattcaaatgaagttgaaggcattggattcttgctttttgaagagcgttgacaaagtacaattg 25189436  T
Q  343 tacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25189435 tacgaaatgtacaaccactacctccactactc 25189404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 510
Target Start/End: Original strand, 23392686 - 23392898
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||  ||||||||||    
T  23392686 gcattggatgctttcttctcaaagagcgttgacctagtacaactgtacgaagtgtacaaccactacttccattactctaagtttgtctctgctacaagac 23392785  T
Q  398 aa-gacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattac 496  Q
    || || ||||||  |||||||||||  ||| ||||||  || | |||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| |     
T  23392786 aatgataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaatagaaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcat 23392884  T
Q  497 tggtggatgatcaa 510  Q
    |||||  |||||||    
T  23392885 tggtgattgatcaa 23392898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 9015031 - 9015161
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgacta---tagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggag 99  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||  |||||||| |||  ||||||||||| || |||    
T  9015031 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgaccatagtagacaaaaatttgaaatcttaaataggttctggaagaacaaaagagag 9015130  T
Q  100 caaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||    
T  9015131 caaaggaatcaacaaaatggaagcttgaagc 9015161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Original strand, 24425571 - 24425629
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaca 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24425571 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 24425629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 38781817 - 38781690
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||  |||  ||||||||||| || ||||||    
T  38781817 aaaattgtcaactggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgtcatcttaaaaaggttctggaagaacaaaagagagcaa 38781718  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
       ||||||| || ||||||||| ||||    
T  38781717 ttgaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 38781690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24576486 - 24576364
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  |||||||| || |||||||||    
T  24576486 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagaaaaaaagggagcaa 24576387  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagctt 125  Q
     | ||||||| || |||||||||    
T  24576386 tggaatcaacaaaaaggaagctt 24576364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44840862 - 44840692
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||    
T  44840862 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtataggactatagacaaaaatttgacatcctaaagtggtcttggaagaacaaataaagagca 44840763  T
Q  102 aagaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    |  | |||||| || ||| |||||||||||||     ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  44840762 agtacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtctgaagtgctcctgaa 44840692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14581892 - 14581803
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  14581892 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtccaggactatagacaaaaatttgacatcttaaattggttttgggagaacaa 14581803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 21536912 - 21537037
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||| | | ||| |||||||||||| || |||| |    
T  21536912 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttttggaagaacaaaagagagcta 21537011  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaa 128  Q
     ||||||||| || ||||| ||||||    
T  21537012 tgaaatcaacaaaaaggaaacttaaa 21537037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 22775974 - 22776127
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagca 101  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  22775974 aaaattgtcaatttgatatgctaatatttgttcgagtgtacaggactatagacaaaaatttgacattgtaaattggtcttggaagaacaaataaagagca 22776073  T
Q  102 aagaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    |  | |||||| || ||| |||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  22776074 agtacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 22776127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 22781352 - 22781505
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagca 101  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  22781352 aaaattgtcaatttgatatgctaatatttgttcgagtgtacaggactatagacaaaaatttgacattgtaaattggtcttggaagaacaaataaagagca 22781451  T
Q  102 aagaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    |  | |||||| || ||| |||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  22781452 agtacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 22781505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3277429 - 3277338
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgac--tatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  3277429 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatatagacaaaaattttacatcttaaaaaggtcttggaagaacaa 3277338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25829541 - 25829373
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||   ||   | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  25829541 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttggaatcactattaggttctggaagaacaaaagagagcaa 25829442  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||     || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25829441 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagagaagtgctcctgaagacaaaagtgctcctgaa 25829373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33074680 - 33074512
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||| |  |||||||||| |  ||||  ||||||    
T  33074680 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacagtactatagacaaaaatttaacatcttataaaggtcttggaaaacaaataaagagcaa 33074581  T
Q  103 agaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | | |||||| || | ||||||||||| |||     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33074580 atacatcaacaaaaagggaagcttaaaacgtctgaagaaaattgctcctgaagataaagtgctcctgaa 33074512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38631391 - 38631223
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || | | | |||  ||||| ||||| || ||||||    
T  38631391 aaaattgtcaattggataagttaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgaaatcattattaggttctggaaaaacaaaagagagcaa 38631292  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagaca-aagtgctcctgaa 165  Q
    |||||||||| || | ||||||| |||| |     || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38631291 agaaatcaacaaaaatgaagcttgaagcatctgaagagaagtgctcctgaagacagaagtgctcctgaa 38631223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 401
Target Start/End: Original strand, 23184346 - 23184425
Alignment:
Q  322 agcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  23184346 agcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtagaaccactacctcctctactcagtttgtgtctctgctacaggacaaga 23184425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22272268 - 22272139
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgc-ttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgt 343  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| |   |||| ||||| |||| |  |||||    
T  22272268 cattgcagaagactggaagaatgaagcaatgactaattcaaatggatttgaaggcattggatgcttttttcgttggagagagttgaaaaaggaaaattgt 22272169  T
Q  344 acaaagtgtacaaccactacctccactact 373  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22272168 aagaagtgtacaaccactatctccactact 22272139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 24793648 - 24793757
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||   || ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  24793648 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaagttgaacaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaa 24793747  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    || |||||||    
T  24793748 aggaatcaac 24793757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 22755504 - 22755312
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||  || ||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  22755504 gtacaaggtgtacgaccactacttccactactctg-ttttgtctgcgctacaagacaagtataacagctctgtctgcagaa-atgttccttcaagatagg 22755407  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| |  || | | ||||||||| |||| ||| | |||||  ||||| |||| | || ||||||||||||||||||    
T  22755406 aatggatttgaacttgatccttcatatgacaatatccaaatcagacaaaagatcattggtgactgatc-aaggttctc-aacgactctttagacgtg 22755312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30621617 - 30621497
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagaca-aaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||| | | |||  |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  30621617 tcaattggatatgctaataattgttcaagtgtacaggaccatagacataaatttgatatctttattaggttctggaagaacaatagagagcaatggaatc 30621518  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||| || ||||||||| ||||    
T  30621517 aacaaaaaggaagcttcaagc 30621497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30624238 - 30624118
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagaca-aaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||| | | |||  |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  30624238 tcaattggatatgctaataattgttcaagtgtacaggaccatagacataaatttgatatctttattaggttctggaagaacaatagagagcaatggaatc 30624139  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||| || ||||||||| ||||    
T  30624138 aacaaaaaggaagcttcaagc 30624118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 40782908 - 40782852
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40782908 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaa 40782852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19115257 - 19115087
Alignment:
Q  205 aagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattgg 304  Q
    |||||||||| | |||| |||| || |||||||| |||   |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||   | |||| ||||| || |||    
T  19115257 aagcttcaaaggttgttcaaagaatttaatctcgcctact-attgcagaagactggaagaatgaagcaacaactaattcagatggatgtgaagccagtgg 19115159  T
Q  305 atgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    |||| | ||| |   |||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19115158 atgcctattcgttggagagtgttgaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctg 19115087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30667426 - 30667299
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||| | | |||  |||||||||||||| ||||||    
T  30667426 aaaattgtcaattggatatgctaataattgttcaagtgtacaggactttagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagaacaatagagagcaa 30667327  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
       ||||||| || ||||||||| ||||    
T  30667326 ttgaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 30667299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44881302 - 44881171
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||| |  ||||||  || || ||||||||||||||||| || ||  |   |||| ||||| |||| || ||||||    
T  44881302 cattgcagaagactggaagaatgaagcagcagctaattcaaatgggtttgaaggcattggatgtttttttgttggagagagttgaaaaaggacaattgta 44881203  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44881202 cgaagtgtacaaccactatctccactactctg 44881171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19540835 - 19540706
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||| |||||||||  | || | | ||| |||||||||||| || |||| |    
T  19540835 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgctcaagtgtacagaaccatagacaaaaatttgatatatttattaggttttggaagaacaaaagagagcta 19540736  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    || ||||||| || || |||||||||||||    
T  19540735 aggaatcaacaaaaagaaagcttaaagcgt 19540706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 20568411 - 20568467
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20568411 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaa 20568467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Original strand, 44366819 - 44366863
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44366819 tggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaa 44366863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 25036931 - 25037058
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagaca-aaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||| | | |||  |||||||| || || ||||||    
T  25036931 aaaattgtcaattggatatgctaataattgttcatgtgtacaggaccatagacagaaatttgatatctttattaggttctggaagaaaaaaagagagcaa 25037030  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || | ||||||||||||    
T  25037031 aggaatcaacaaaaacgaagcttaaagc 25037058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 25041038 - 25041165
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagaca-aaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||| | | |||  |||||||| || || ||||||    
T  25041038 aaaattgtcaattggatatgctaataattgttcatgtgtacaggaccatagacagaaatttgatatctttattaggttctggaagaaaaaaagagagcaa 25041137  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || | ||||||||||||    
T  25041138 aggaatcaacaaaaacgaagcttaaagc 25041165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 1084477 - 1084392
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatca 110  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||| || || ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  1084477 taatatttgttcaagtatacaggaccaaagacaaagtttgatgtttttaaaaggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatca 1084392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 24814223 - 24814332
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||   |   || ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  24814223 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaagttgatcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaa 24814322  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    || |||||||    
T  24814323 aggaatcaac 24814332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 10009430 - 10009486
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10009430 aaaattgtcaattggatatactaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaa 10009486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 17966812 - 17966868
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  17966812 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtataggaccatagacaaaa 17966868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 18430594 - 18430650
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  18430594 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtactggaccatagacaaaa 18430650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 22187782 - 22187838
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22187782 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtatacaggaccatagacaaaa 22187838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22260835 - 22260783
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaattt 63  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22260835 tcaattggatatgctaatatttattcaagtgtacaggaccatagacaaaattt 22260783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24377506 - 24377450
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  24377506 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaaaaccatagacaaaa 24377450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 44881585 - 44881533
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaattt 63  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  44881585 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaattt 44881533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Original strand, 19297270 - 19297348
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaag 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||   || ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  19297270 taatatttgttcaagtgtacaggaccatagac-aaagttgactaattcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaag 19297348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20568165 - 20568134
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20568165 tgtacaaccactacctccactactctgttttt 20568134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21846541 - 21846482
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  21846541 attaaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaggtgtgcaggaccatagacaaaa 21846482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 28140297 - 28140356
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaattt 63  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  28140297 aaaattgtcaattggacatgctaatatttgttcaggtgtacaagaccatagacaaaattt 28140356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Original strand, 19312628 - 19312709
Alignment:
Q  22 tgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaag 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||   || ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  19312628 tgttaatatttgttcaagtgaacaggaccatagac-aaagttgaccaattcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaag 19312709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22258231 - 22258181
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  22258231 tgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 22258181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14867618 - 14867569
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  14867618 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcatgatcatagacaaaa 14867569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 24302609 - 24302666
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaat 61  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||    
T  24302609 aaaaatgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcagaactatagataaaat 24302666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 26618763 - 26618820
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactgg-atatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  26618763 aaaattgtcaactgggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 26618820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Original strand, 21025130 - 21025186
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa 59  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21025130 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaa 21025186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 5)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 40493 - 40712
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  40493 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 40592  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40593 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 40692  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40693 ctcaacgtctctttcacgcc 40712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 32944 - 33160
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32944 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 33042  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  33043 tttgaagctaattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatc 33141  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33142 tcaacgtctctttcacgcc 33160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30428 - 30283
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  30428 ttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttcaatagattcaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactatt 30329  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgtt 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  30328 ttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgtt 30283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10089 - 9888
Alignment:
Q  199 aactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaagg 298  Q
    |||| ||||||||||| | ||||  |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||   ||| |||| | ||||||||||||  || | |||||||||    
T  10089 aacttaaagcttcaaaggctgttctaaggatttaatcacgtcta-gcattgcagaagatcagaagagtgcaacaacgactaattcaaatgaatttgaagg 9991  T
Q  299 cattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 398  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||    
T  9990 cattagatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtaaaaccactacctccactactatgtttgtgtctctgctacaggaca 9891  T
Q  399 aga 401  Q
    |||    
T  9890 aga 9888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30663 - 30554
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || | | | || | ||||||||||| || ||||||    
T  30663 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttggaatcattattaggacctggaagaacaaaagagagcaa 30564  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    ||||||||||    
T  30563 agaaatcaac 30554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 6882 - 7098
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  6882 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 6981  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6982 atttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 7081  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  7082 ctcaacgtctctttcac 7098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 7795 - 8012
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7795 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 7894  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||  ||    
T  7895 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctc 7993  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7994 tcaacgtctctttcacgcc 8012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 10642 - 10859
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10642 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 10741  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||  ||    
T  10742 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctc 10840  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10841 tcaacgtctctttcacgcc 10859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 31348 - 31132
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  31348 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 31249  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31248 atttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 31149  T
Q  546 ctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||    
T  31148 ctcaacgtctctttcac 31132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 42561 - 42775
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42561 aagtgtacaacgactacctccactactctgtttt-gtcctcgctacaagacaagacatcagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 42659  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  42660 tttgaagctaattcctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatc 42759  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||| |||||    
T  42760 tcaacgtctccttcac 42775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 12572 - 12353
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12572 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctactctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 12473  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12472 atttgaagcttattcttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattat 12373  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12372 ctcaacgtctctttcacgcc 12353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 8178 - 7958
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  8178 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 8079  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8078 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgacta 7979  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7978 tctcaacgtctctttcacgcc 7958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 36997 - 37217
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  36997 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 37096  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgatta 544  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37097 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgacta 37196  T
Q  545 tctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37197 tctcaacgtctctttcacgcc 37217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 347 - 499
Target Start/End: Original strand, 47631 - 47785
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-tgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgcct-tcaagatgggaatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  47631 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 47730  T
Q  445 aatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactgg 499  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47731 aatttgaagtttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgg 47785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 2259 - 2476
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2259 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcttgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaa 2357  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||    
T  2358 tttgaagctaattcttcaaaggactacaccaaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattacaaacgactctttagacgtgcaaatcatc 2457  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2458 tcaacgtctctttcacgcc 2476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 3014 - 2825
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3014 aagtgtacaaccaatacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccctcaagatgggaatgaa 2916  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2915 tttgaagcttattcttcaaaggagtacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 2825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 12156 - 12370
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12156 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 12254  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |  ||     
T  12255 tttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatt 12354  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  12355 tcaacgtctctttcac 12370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 347 - 458
Target Start/End: Original strand, 15987 - 16097
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15987 aagtgtacaaccactacctacactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaa-ttgttccttcaagatgggaatgaa 16085  T
Q  447 tttgaagctgat 458  Q
    ||||||| ||||    
T  16086 tttgaagttgat 16097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 13648 - 13864
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||    
T  13648 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcataattatt-ccttcaagatgggaatgaa 13746  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || |||    
T  13747 tttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtggtaatcatc 13845  T
Q  547 tcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13846 tcaacgtctctttcacgcc 13864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 181 - 385
Target Start/End: Original strand, 561 - 765
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||  || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  561 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcagaagctgtttgatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactat 660  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  661 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtactaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 760  T
Q  381 tgtct 385  Q
    |||||    
T  761 tgtct 765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 357 - 523
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  357 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaa 456  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  457 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 400
Target Start/End: Original strand, 1667 - 1880
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||| |||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||     
T  1667 gctacagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgcctaa-cattgcagaagactggaaaagtatggcaacgg 1765  T
Q  277 ctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg 376  Q
    ||| ||||||| |         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1766 ctattttgaaatg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatattacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctg 1856  T
Q  377 tttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||||||  || ||||||||||    
T  1857 tttttgtctttgcaacaagacaag 1880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 1447 - 1536
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1447 aaaattgtcaattggatatgttaatatttattcaagtatacaggactatagacaaaattttgatatcttaaattggtcttggaagaacaa 1536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 565
Target Start/End: Original strand, 36775 - 36992
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-cagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  36775 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatga 36873  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | || ||    
T  36874 atttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcat 36972  T
Q  546 ctcaacgtctctttcacgcc 565  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36973 ctcaacgtctctttcacgcc 36992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5511 - 5298
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  5511 aagtgtacaactactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 5413  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  5412 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 5314  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  5313 tcaacgtctctttcac 5298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22882 - 22661
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22882 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgacta 22783  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagtgttgacaaagtacaattgtatgaagcgtacaaccactacctccactactctgttt 22683  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  22682 ttgtctctgctacaagacaaga 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23103 - 22974
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23103 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttaaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagcaa 23004  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    |  ||||||| || | ||||||||||||||    
T  23003 aagaatcaacaaaaatgaagcttaaagcgt 22974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Original strand, 52143 - 52361
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctac----gctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaa 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||| ||||||  |||||||| || | || |||||||||||||||    
T  52143 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacctacgctgcaagacaagataacagctctgcctgcataaat-gttccttcaagatgggaa 52241  T
Q  443 tgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgat 542  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52242 tgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactgatgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttaat 52341  T
Q  543 tatctcaacgtctctttcac 562  Q
     |||||||||||||||||||    
T  52342 catctcaacgtctctttcac 52361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 7)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 56822 - 57030
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  56822 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 56920  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  56921 tttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 57019  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  57020 tcaacgtctct 57030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 182 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32691 - 32452
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||   |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32691 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaagactgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagtaacgacta 32592  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32591 ttttgaaaggatttgaatgcatttgatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 32492  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaa-gacaacagccttgcctgca 418  Q
     |||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  32491 gtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgca 32452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 49538 - 49318
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactc--aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||   |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  49538 agttcatcaggagatgcaagtcttaaagcttcaaagtttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagatttgaagagtgaagcaactacta 49439  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  49438 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacaactatctccactactcagttt 49339  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  49338 gtgtctctgctacaagacaag 49318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 394
Target Start/End: Original strand, 339 - 464
Alignment:
Q  269 agcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctcca 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  339 agcaacggctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtctgtacgaagtgtacgaccactacctcca 438  T
Q  369 ctactctgtttttgtctacgctacaa 394  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  439 ctactctgtttatgtcttcgctacaa 464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Original strand, 3 - 70
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  3 taatatttgttcaagtgtacaggactatagacaatatttgacatcttaaattgatcctgaaagaacaa 70  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 49760 - 49593
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatag-acaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  |  | |   |||  ||||||||||| || ||||||    
T  49760 aaaattgtcaattggatatgctaatttttgttcaagtgtacatgaccatagaaaaaaatttgaaattattataaggtgctggaagaacaaaagagagcaa 49661  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || ||||||||||| ||||    || || ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  49660 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaggcgtcgaagagaagtgctcttgaagacaaaagtgctcctgaa 49593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 421
Target Start/End: Original strand, 464 - 518
Alignment:
Q  368 actactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaa 421  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  464 actactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 5)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 163 - 401
Target Start/End: Original strand, 215385 - 215623
Alignment:
Q  163 gaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaa 262  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||||| |||    
T  215385 gaaaatcaccagaagctgcagtttatcaggagatgcaacttaaaacttcaaaagctgtttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactagaa 215484  T
Q  263 aagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccacta 362  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  215485 aagtgaagcaacggctattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccacta 215584  T
Q  363 cctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  215585 cctccactactctgttttcgtctctgctacaagacaaga 215623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 141021 - 140812
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  141021 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgag 140923  T
Q  447 tttgaagctgattcttc-aaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattat 545  Q
    ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  ||    
T  140922 tttgaagttgatccttcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaat 140824  T
Q  546 ctcaacgtctct 557  Q
    ||||||||||||    
T  140823 ctcaacgtctct 140812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 127862 - 127654
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  127862 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgga 127764  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  127763 tttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaacgattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 127665  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  127664 tcaacgtctct 127654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 215161 - 215316
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaa 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||    
T  215161 tggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaaaagatcttggaagaacaataaagagcaaaggaatcaacaaa 215260  T
Q  116 ga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
     | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  215261 aagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcactcctgaa 215316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 350 - 562
Target Start/End: Original strand, 7693 - 7905
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatt 448  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| | ||||||||  |||||||||    
T  7693 tgtacaaccactacctccacgactctgagtgtgtctgcgctacaagacaagtataacagctctgcctgcagaa-atgttcattcaagatatgaatgaatt 7791  T
Q  449 tgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg-ttgattatct 547  Q
    ||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||||| || |  ||||    
T  7792 tgaacttgatgcttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactcttttgacgtgcttaaagatct 7890  T
Q  548 caacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||    
T  7891 caacgtctctttcac 7905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 1605 - 1825
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  1605 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagctgtttaatggattcaaactcgtttaaatattgcagaagacttgaaaagtgaagcaacgactat 1704  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1705 tttgaaaggatttgaaggcactggatgattgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttttacgaagtgtacaaccactaccttcactgctctgtttt 1804  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  1805 tgtctctgctacaagacaaga 1825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 279 - 445
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| |  |||||||    
T  279 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacagaactatagacaaaatttgacatcttaaaaaggttttggaagaacaacaaagagcaaa 378  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
      ||||||  || ||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  379 tgaatcaataaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaaggcaaagtgcttctgaa 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 6647 - 6866
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  6647 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaacttgtctaaggattgcagaagactggaaaagtgaagcaccgactatt 6746  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6747 ttgaaaagatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcattgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccagtactctattttt 6846  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||| ||||||    
T  6847 gtctctgctacaacacaaga 6866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 6376 - 6528
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||    
T  6376 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaa 6475  T
Q  103 agaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    || ||||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  6476 aggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 6528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 161 - 418
Target Start/End: Original strand, 89941 - 90199
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | || | || |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  89941 ctgaaaatcaccagaagctgcagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaggttgatcaatgtatttaatctcgtctaagtattacagaagactgg 90040  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| |    
T  90041 aagagtgaaccaacggctattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaaatacaagtgtacgaagtgtacaacccc 90140  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  90141 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 90199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 89740 - 89906
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  89740 aaaattgtcaattagatatgctaatatttgttaaagtgtacaggatcatagacaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaatagagagcaaa 89839  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||     ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  89840 ggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgtctgaagaaaattgttcctgaagacaaagtgctcctgaa 89906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 350 - 562
Target Start/End: Original strand, 10331 - 10541
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||    
T  10331 tgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttcctttaagatgggaatgaattt 10429  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctca 549  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| | |  ||||||    
T  10430 gaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagatgtgctaaaaatctca 10528  T
Q  550 acgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||    
T  10529 acgtctctttcac 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 347 - 511
Target Start/End: Original strand, 6259 - 6423
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6259 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgccttaaagatgggaatgaa 6358  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaa 511  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6359 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 175540 - 175327
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  175540 aagtgtacaaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaggacaagacaacagctttgtttgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 175442  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  175441 tttgaagctgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 175343  T
Q  547 tcaacgtctctttcac 562  Q
    ||||||||||||||||    
T  175342 tcaacgtctctttcac 175327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 350 - 537
Target Start/End: Original strand, 40388 - 40574
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatt 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||    
T  40388 tgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtcttcgctacaagacaagtataacagctttgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatt 40486  T
Q  449 tgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  40487 tgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtg 40574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 537
Target Start/End: Original strand, 58934 - 59120
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatt 448  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| || ||| | | |||| ||||||| | ||||||  ||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||    
T  58934 tgtacaatcactacctccacgaatctgcttgtgtttgcactacgagacaagtataacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagataggaatggatt 59032  T
Q  449 tgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||  |||| ||||| |  || ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  59033 tgaacttgatccttcataagacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtg 59120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 180452 - 180424
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  180452 aagtgtacaaccactacctccactactct 180424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 347 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 1
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  155 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaataaa 56  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtg 501  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Original strand, 29929 - 30002
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattg 77  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29929 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaatatttgacatcttaaattg 30002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 78273 - 78492
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||  ||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  78273 agttcatcatgagatgcagcttaaagcttcaaaagctatttatcggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactatt 78372  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  78373 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttattctttaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctacactactatgttttt 78472  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  78473 gtctctgctacaagacaaga 78492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 78047 - 78200
Alignment:
Q  18 gatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaaga 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || |    
T  78047 gatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgacatcttaaaaagatcttggaagaacaataaagagcaaaggaatcaacaaaaa 78146  T
Q  118 gg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||| |||||||||     |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  78147 ggaaagattaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagatatagtgctcctgaa 78200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 25388 - 25428
Alignment:
Q  20 tatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  25388 tatgttaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 25428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 6)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 117314 - 117148
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  117314 aagtgtacaaccactacctccgctactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatt-gttccttcaagatgggaatgaa 117216  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 514  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117215 tttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 117148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Original strand, 475317 - 475464
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  475317 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatagg 475415  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| || || ||  ||||||||||||||    
T  475416 aatgaatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaa 475464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Original strand, 481837 - 481984
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  481837 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatagg 481935  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| || || ||  ||||||||||||||    
T  481936 aatgaatttgaacatgatccttcataggacaacttccaaatcaggcaaa 481984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 510
Target Start/End: Original strand, 156693 - 156861
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||| ||||||||||| | ||||||  | ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  156693 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactatgcgtgcgtctacgatacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaa-ttgttccttcaagatagg 156791  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  156792 aatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 156861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 114
Target Start/End: Original strand, 481441 - 481551
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||   |   |||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  481441 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaagttaatcaatttaaa-aggtcttggaagaacaaaagagagcaa 481539  T
Q  103 agaaatcaacga 114  Q
    || |||||||||    
T  481540 aggaatcaacga 481551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 112617 - 112564
Alignment:
Q  10 gtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaattt 63  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  112617 gtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggatcatagacaaaattt 112564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 36680 - 36901
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| | || | || | || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  36680 agttcatcaagagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgctcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagatgactagaaaagtgaagcaacgacta 36779  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36780 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttaaagagtgttgacaaagaacaattgtacgaagtgtacaaccactacctctactactctgttt 36879  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  36880 ttgtctctgctacaagacaaga 36901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 42325 - 42104
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| | || | || | || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  42325 agttcatcaagagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgctcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagatgactagaaaagtgaagcaacgacta 42226  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42225 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttaaagagtgttgacaaagaacaattgtacgaagtgtacaaccactacctctactactctgttt 42126  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  42125 ttgtctctgctacaagacaaga 42104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 36444 - 36571
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  36444 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttatggaagaacaaaagagagcaa 36543  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
     | ||||||  || ||||||||| ||||    
T  36544 tggaatcaaataaaaggaagcttgaagc 36571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42561 - 42434
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  42561 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttatggaagaacaaaagagagcaa 42462  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
     | ||||||  || ||||||||| ||||    
T  42461 tggaatcaaataaaaggaagcttgaagc 42434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3529 - 3289
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactgg 260  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| |||| |||    
T  3529 ctgaaaatcaccagaagctatagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagattgg 3430  T
Q  261 aaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccac 360  Q
    ||||||  | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3429 aaaagtataacaacggctattttggaaggatttgaaggcattggatgtttattcttcaaagagcgttgatatagtacgtttgtacaaagtgtacaaccac 3330  T
Q  361 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3329 tacctccactgctctgtttttgtctctgctacaagacaaga 3289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3773 - 3611
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagcaaagaaat 108  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||  ||||||| | ||    
T  3773 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtattggaagaacaaataaagagcaaatacat 3674  T
Q  109 caacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||| || | |||||||||||| ||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3673 caacaaaaagggaagcttaaagtgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 3611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 347 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 35753 - 35543
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  35753 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 35655  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  35654 tttgaagttaatccttcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 35556  T
Q  547 tcaacgtctcttt 559  Q
    |||||||||||||    
T  35555 tcaacgtctcttt 35543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 182 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 61007 - 60791
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |    
T  61007 agttcatcaggagatgcaacttaaaacttcaaaagttgtttaaaggatttaaactcgtctaaaaattgcagaagactggaaaagtatagcaacggctatt 60908  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  60907 ttggaaggattggaaggcattgaatgcttgttcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttttt 60808  T
Q  382 gtctacgctacaagaca 398  Q
    ||||   ||||||||||    
T  60807 gtctcttctacaagaca 60791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 61249 - 61083
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||    
T  61249 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagca 61150  T
Q  102 aagaaatcaacgaagag-gaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcct 162  Q
    || | |||||| || || | |||||||||| |     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  61149 aatacatcaacaaaaagtggagcttaaagcatctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcct 61083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 173 - 401
Target Start/End: Original strand, 27325 - 27555
Alignment:
Q  173 agatgctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaag 270  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || | || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  27325 agatgctgaagttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaag 27424  T
Q  271 caacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccact 370  Q
    ||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27425 caacagctattttgataggattcgaaggcattggatgcttgctcttcaaagagcgttgacaaagtaccattgtacgaagtgtacaaccactacctccact 27524  T
Q  371 actctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27525 actctgtttttgtctctgctacaagataaga 27555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 27113 - 27240
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa-atttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || | || |||||||| |||  || || ||||| || ||||||    
T  27113 aaaactgtcaattgaatatgattatatttgttcaagtgtacaggaccatagaaaaatatctaacatcttaaataggttctgaaataacaaaagagagcaa 27212  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || ||||||||| ||||    
T  27213 aggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 27240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 347 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 40718 - 40552
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  40718 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaat-gttccttcaagatgggaatgaa 40620  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 514  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40619 tttgaagttgatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaagga 40552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 161 - 401
Target Start/End: Original strand, 9991 - 10234
Alignment:
Q  161 ctgaaaatcagaagatgctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagac 257  Q
    ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||| || |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  9991 ctgaaaatcaccagaagctgaagttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatctcatctaagctttgcagaagac 10090  T
Q  258 tggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaac 357  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  10091 tagaagagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttttttaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacgac 10190  T
Q  358 cactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  10191 cactacctccactactctgtttgtgtctcttctacaagacaaga 10234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 319 - 401
Target Start/End: Original strand, 14816 - 14898
Alignment:
Q  319 aagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  14816 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacgaccactacctccactactctgtttgtgtctcttctacaagacaaga 14898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 9818 - 9927
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacga 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||| | || ||||||||||| || |||||| | ||||||| |    
T  9818 tggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccataaacaaaaatttgacatcttaaatagttc-tggaagaacaaaagagagcaatggaatcaacaa 9916  T
Q  115 agaggaagctt 125  Q
    | |||||||||    
T  9917 aaaggaagctt 9927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 347 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19466 - 19242
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt--ctacgctacaagacaagacaacagcct-tgcctgca----gaatttgtgccttcaagatgg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | | |||||  |    |||||||||||||||||||||    
T  19466 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgttccaacgctacaagacaagacaacaccttatgcctcgacaccgaatttgtgccttcaagatgg 19367  T
Q  440 gaatgaatttgaagct-gattcttc-aaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    |||||||||||||| |  |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19366 gaatgaatttgaagttaaattcctcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 19267  T
Q  538 ttgattatctcaacgtctctttcac 562  Q
     | || |||||||||||||||||||    
T  19266 ctaatcatctcaacgtctctttcac 19242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 357 - 562
Target Start/End: Original strand, 16985 - 17203
Alignment:
Q  357 ccactacctccactactctgtttttgtcta-cgctacaagacaagacaacagccttgcctg---ca-gaatttgtgccttcaa-gatgggaatgaa--tt 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||    || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  16985 ccactacctccactactctgtttttgtccaacgctacaagacaagacaacacctatgcctcgtacacgaatttgtgccttcaaagatgggaatgaaattt 17084  T
Q  449 tgaagctgattcttcaaagtac-tacacccaaatcaggcaaaggatt-actggtggatgatcaaagg-atttcaaacgact-ctttagacgtgttgat-t 543  Q
    ||||| | |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||      
T  17085 tgaagttaattcctcaaaggacctacacccaaatcaggcaaaggattaactggtgaatgatcaaaggaatttcaaacgactactttagacgtgctaatca 17184  T
Q  544 atctcaacgtctctttcac 562  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17185 atctcaacgtctctttcac 17203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9358 - 9140
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||| || ||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |    
T  9358 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcatcaaag-attgcagaagattggaaaagtatagcaacgactatt 9260  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9259 ttggaaggattagaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactgtgttttt 9160  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  9159 gtctatgctacaagacaaga 9140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 9626 - 9537
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  9626 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttgaaagaacaa 9537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14830 - 14633
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14830 aaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattg 14731  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  14730 gatgcttgtactttgaagagcgttgacaaagtacaattttacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaga 14633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15104 - 14978
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagaca-aaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || | | | |||  ||||||||||| || |||| |    
T  15104 aaaattgtcaattgaatacgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacacaaatttgaaatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcga 15005  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaag 129  Q
    || ||||||| || | |||||||||||    
T  15004 aggaatcaacaaaaatgaagcttaaag 14978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7907 - 7690
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  7907 ttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaagagtgaagccacgactatt 7808  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  7807 ttggaaggatttaaaggcattgtatgtttattcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcag--ttt 7710  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  7709 gtctctgctacaagacaaga 7690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8132 - 7969
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||  |||  |||||||||||||| ||||||    
T  8132 aaaattgtcaattagatatgctaatatttgttcaagtgtacaggatcatagacaaaactttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaatagagagcaa 8033  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcc 161  Q
    || ||||||| || || |||||||||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8032 aggaatcaacaaaaagaaagcttaaagcgtctgaagaaaattgctcctgaagacaaagtgctcc 7969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 7)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 377464 - 377684
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  377464 agttcatcaggagatgcaagacttaaaacttcaaatgttgttgaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccggaagagtgaagcaacgacta 377563  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  377564 tattgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcattgacaaagtacaattgtaccaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 377663  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  377664 gtgtctctgctacaagacaag 377684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 185 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 211599 - 211383
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttg 284  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  211599 tcatcaggagatgcagcttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttg 211500  T
Q  285 aaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtc 384  Q
     |||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  211499 taaggattttaatgcatttgatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtatacaactactacctccactactctgtttttgtc 211400  T
Q  385 tacgctacaagacaaga 401  Q
    |  ||||||||||||||    
T  211399 tctgctacaagacaaga 211383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 379
Target Start/End: Original strand, 244256 - 244388
Alignment:
Q  247 ttgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtaca 346  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| || |||||||     
T  244256 ttgcagaagaccagaagagtgaagcaacaactaattcaaaaggatttgaagacattggatgcttgttctttgaagagcgttgaaaaaggacaattgtacg 244355  T
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244356 aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 244388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 220392 - 220224
Alignment:
Q  231 taatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgac 330  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  220392 taatctcgtctaagcattgcagaagaccaggagagtgaagcaacggctaattcaaatgaatttgaag-cattggatgcttgttatttgaagagcgttgac 220294  T
Q  331 aaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||  |||| ||||||||    
T  220293 aaagtacaattgtacgaagtgtataaccactacctccactactcagtttgtgcctctgctaaaagacaag 220224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 377244 - 377370
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| | | |||  ||||||||||| || |||| |    
T  377244 aaaattgtcaattggatatgctaatttttgttcaagtatacatgactatagacaaaaatttgatatctttattaggttctggaagaacaaaagagagcta 377343  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaag 129  Q
    || ||||||| || |||||||||||||    
T  377344 aggaatcaactaaaaggaagcttaaag 377370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 211846 - 211761
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaaga 88  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  211846 aaaattgtcaattggatatactaatatttgttctagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaaagggtctttgaaga 211761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 127
Target Start/End: Original strand, 30547 - 30663
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatca 110  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || | | | |||  ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  30547 tcaattggatatactaatatttgttcaagtgtacatgactacagacaaaaattggaatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcaaaggaatca 30646  T
Q  111 acgaagaggaagcttaa 127  Q
    || ||  ||||||||||    
T  30647 acaaaatggaagcttaa 30663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 182 - 418
Target Start/End: Original strand, 20876 - 21115
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||   |    
T  20876 agttcatcaagagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaattgatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacggtca 20975  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20976 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgtcgaccaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 21075  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgca 418  Q
    ||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  21076 ttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 21115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 20640 - 20768
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  20640 aaaattgtcaattggataagataatatttgttcaattgtacatgaccatagaaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagctaa 20739  T
Q  104 gaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    | ||||||| || |||||| || ||||||    
T  20740 ggaatcaacaaaaaggaagtttgaagcgt 20768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 12865 - 13053
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || | || | || |||||||||| ||||||||    
T  12865 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcatgaaaaaat-gttccttcaagataggaatgaa 12963  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  12964 tttgaagttgatacttcaaaggactacaaccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 13053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10175 - 9954
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | | || || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  10175 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctattcaatggattcaatctcgtctaagctttgcagaagactagaagagtgaagtaacgacta 10076  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10075 ttttgaaaggatttgaaagcattggatgcttactctttgaagagcgttcacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 9976  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  9975 ttgtctctgctacaagacaaga 9954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 10373 - 10290
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac--aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  10373 tcaattggatttgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaa 10290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 60227 - 60002
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  60227 gctaaagttcatcagaagatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttcaatggatttaatctcgtccaagaattgcagaagactggaaaagtgaagcaac 60128  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||    
T  60127 gactattttgaaaggatttgaagccattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctcttctactc 60028  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||| |||||  |||||||||||||    
T  60027 agtttgtgtctctgctacaagacaag 60002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 177 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 7913
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  8137 gctaaagttcatcaggagatgcaaaacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtccaagcattgtagaagactgtaaaagtgaagcaac 8038  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactc 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||      
T  8037 gactattttgaaaggatttgaattcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacga 7938  T
Q  375 tgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
     |||| |||||  ||||||||||||    
T  7937 agtttgtgtctctgctacaagacaa 7913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8339 - 8171
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  || | | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  8339 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcaa 8240  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    || ||||||| || || |||||||| ||||     || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8239 aggaatcaacaaaaagtaagcttaaggcgtctgaagagaagtgctcctgaagacaaaagtgctcctgaa 8171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 60451 - 60329
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || | | | |||  ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  60451 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcaaaggaatc 60352  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    ||| || | ||||||||| ||||    
T  60351 aacaaaaatgaagcttaaggcgt 60329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1872 - 1675
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1872 aaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaggagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattg 1773  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||    
T  1772 gatgcttgtactttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaaga 1675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 400
Target Start/End: Original strand, 18550 - 18746
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18550 aaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattg 18649  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||    
T  18650 gatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattttacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctggtacaagacaag 18746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 18289 - 18416
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||| || |||||||||  |||| | | ||| |||||||||||| || ||||||    
T  18289 aaaattgtcaattggaaatgctaatatttgttcaagtgtacagaaccataaacaaaaatttgatatctttattaggttttggaagaacaaaagagagcaa 18388  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || ||||||||| ||||    
T  18389 aggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 18416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 185 - 385
Target Start/End: Original strand, 25883 - 26085
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25883 tcatcaggagatgcaagacttaaagcgtcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactattt 25982  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||    
T  25983 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagggttgacatagtacaattgtatgaagtgtacaaccactatctcgactactcagtttgtg 26082  T
Q  383 tct 385  Q
    |||    
T  26083 tct 26085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 226 - 353
Target Start/End: Original strand, 44655 - 44782
Alignment:
Q  226 ggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcg 325  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||    
T  44655 ggatttaatctcgtctaagtattgtagaagactggaaaagtgaagcaacgtctattttgaaaggatttgaaggcattagatgcttgttctttgaagagcg 44754  T
Q  326 ttgacaaagtacgattgtacaaagtgta 353  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  44755 ttgacataatacaattgtacgaagtgta 44782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 15945 - 15737
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||    
T  15945 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacatctctgcctgcagaa-atgttccttcaagaaaggaatgaa 15847  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    || |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  | |  |||    
T  15846 ttagaagttgatccttcataggactacacccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgttctaaaaatc 15748  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  15747 tcaacgtctct 15737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 7147 - 7063
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||   |   || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7147 taatatttgttcaagtgtacaggaccataggcaaagttaatcaatttcaataggtcttggaagaacaatagagagcaaagaaatc 7063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 7)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 232 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 212509 - 212339
Alignment:
Q  232 aatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaa-ggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgac 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  212509 aatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacaactatttttaaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgac 212410  T
Q  331 aaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  212409 aaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaaga 212339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 327
Target Start/End: Original strand, 6105 - 6250
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  6105 ttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttcaatagattcaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactatt 6204  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgtt 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  6205 ttgaaaggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgtt 6250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 245911 - 246081
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  245911 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacgtcctaaattggtcttggaagaacaaataaagagca 246010  T
Q  102 aagaaatcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    |  | |||||| || ||| |||||||||||||     ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  246011 agtacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagtctgaagtgctcctgaa 246081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 61257 - 61119
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||  |||||| ||||    
T  61257 tgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagaaaggaatggattt 61159  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  61158 gaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 61119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 212791 - 212629
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaa 107  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||  ||||||||||| || |||| ||| ||    
T  212791 tgtcaattggatatgctaatatttgtttaggtgtacatgaccatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaaaagagagctaaggaa 212692  T
Q  108 tcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||| || ||||||||| || |||     || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  212691 tcaacaaaaaggaagcttgaaacgtctgaagagaagtgctcctgaagtcaaagtgctcctgaa 212629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 5870 - 5979
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || | | | || | ||||||||||| || ||||||    
T  5870 aaaattgtcaattgaatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttggaatcattattaggacctggaagaacaaaagagagcaa 5969  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    ||||||||||    
T  5970 agaaatcaac 5979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 229
Target Start/End: Original strand, 246153 - 246201
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  246153 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggat 246201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 2210 - 2000
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  2210 aagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaa 2112  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| | ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  2111 tttgaagttgatccgtcacaggactacacccaaattaggcaaaagattaatggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 2013  T
Q  547 tcaacgtctcttt 559  Q
    |||||||||||||    
T  2012 tcaacgtctcttt 2000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 6)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9764 - 9545
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || || ||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||||     
T  9764 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagttgtttcaaggattcaaacttgtctaag-attgcagaagactgggaaagtatagcaacgactat 9666  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9665 tttgaaaggattgaagggcattggatgcttattctacaaacagcgttgacatagtacgactgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 9566  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||   |||||||||||||    
T  9565 tgtctctactacaagacaaga 9545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19213 - 19016
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    ||||||| ||| | |||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||     
T  19213 aaagcttgaaaggctgttcaatggatttaatctcgtcaaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacggctattttggaaggatttaaaggcattt 19114  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  19113 gatgcttgttcttcaaagagcgttggaaaagtacaagtgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttttgtctctgctacaagaaaaga 19016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 22038 - 22257
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||||  |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||      
T  22038 agttcattagaagatgcaacttaaaggttcaaaagttgtttaaaggattaaaactcgtctaaagattgcagaagactggagaagtatagcaacgactatc 22137  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22138 tttgaaggattggaaggcattggatgcttattcttcaatgagcgttgacataatacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccagtactctgttttt 22237  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  22238 gtctctgctacaagacaaga 22257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19477 - 19315
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| |||||| |||||||  |||  |||||||||||||| ||||||    
T  19477 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtagaggaccataaacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctggaagaacaatagagagcaa 19378  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctc 160  Q
    || ||||||| || |||||||||||||| |     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19377 aggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcatctgaagaaaactgctcctgaacacaaagtgctc 19315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 21783 - 21952
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||    
T  21783 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagca 21882  T
Q  102 aagaaatcaacgaagag-gaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    || | |||||| || || ||||||||||  ||     ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21883 aatacatcaacaaaaagtgaagcttaaaatgtctgaagaatactgctcctgaagacaaagtgcacctgaa 21952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10000 - 9836
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa--tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa-tagggagcaaagaaa 107  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||  | |    
T  10000 tcaattggatgtgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataaagagcaagtaca 9901  T
Q  108 tcaacgaagagg-aagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||     ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  9900 tcaacaaaaagggaagcttaaagcgtcagaagaaaactgctcctgaagtcggaagtgctcctgaa 9836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 4852 - 5073
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||    
T  4852 agttcatcagaagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagactgaaagagtgaagcgacgacta 4951  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  4952 ttttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttctttatagagcgttgacaaagtacaattgtatgaagtgtacaaccactacctccattaccatgttt 5051  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||   ||||||||||||||    
T  5052 ttgtccctgctacaagacaaga 5073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Original strand, 4627 - 4671
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  4627 tggatatgttaatatttgttcaagtgtataggaccatagacaaaa 4671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 678 - 461
Alignment:
Q  185 tcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatt 282  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  678 tcatcaggagatgcaagacttaaagcgtcaaaggatgttcaattgatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaatagtgaagcaacgactattt 579  T
Q  283 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| | || ||    
T  578 tgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccattactcaggttgtg 479  T
Q  383 tctacgctacaagacaag 400  Q
    |||   ||||||||||||    
T  478 tctctactacaagacaag 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 911 - 791
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||   || | | | |||  ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  911 tcaattggatatgctaatatttgttcaaatgtacaggaccatagacaaaaatttggaatcattattaggttctggaaaaacaaaagagagcaaaggaatc 812  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  811 aacaaaaaggaagcttaaagc 791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 226 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13731 - 13557
Alignment:
Q  226 ggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcg 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||    
T  13731 ggatttaatctcgtctaagcattgcagaagattggaatagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttctttgaagagcg 13632  T
Q  326 ttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  13631 ttgacatagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaag 13557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14054 - 13886
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||   || | | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  14054 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagaccataaacaaaaatttggaatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcaa 13955  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagac-aaagtgctcctgaa 165  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||     || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13954 aggaatcaacgaaaaggaagcttaatgcgtcagaagagaagtgctcctgaagacaaaagtgctcctgaa 13886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1866 - 1645
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  1866 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtctaagctttgcagaagactagaagagtgaaacaacgacta 1767  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1766 ttttgaaaggatttgaaagcattggatgcttactctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtaggaagtgtacaaccactacctccactactttgttt 1667  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||  |||| |||||||||    
T  1666 ttgtctctgctagaagacaaga 1645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2073 - 1946
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa--tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagca 101  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  |||| |  ||||||| |||| ||||||||||| || |||||    
T  2073 aaaattgtcatctggatatgctaatatttgttca-gtgtacaagaccatagacaaaaaatttggcaacttaaataggtcctggaagaacaaaagagagca 1975  T
Q  102 aagaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    ||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  1974 aaggaatcaataaaaaggaagcttaaagc 1946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 103778 - 103556
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| | |||| || | || |||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  103778 agttcatcaggagatgcaagacttaaagcttgaaaggttgttaaatgaatttaattttgtctaaacattgcagaagactggaagagtgaagcaacggcta 103679  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  103678 ttttgaaatgatattaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtgcaaccactacctccactactttgttt 103579  T
Q  380 ttgtctac-gctacaagacaaga 401  Q
    || ||| | ||||||||||||||    
T  103578 ttttcttctgctacaagacaaga 103556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 103987 - 103872
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacga 114  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||  |||  || |||||||| || |||||||  ||||||| |    
T  103987 tggatatgctaatattttttcaagtgtacaggaccttagacaaaaatttgacatcttaaaaaggttctgaaagaacaaaagagagcaaatgaatcaacaa 103888  T
Q  115 agaggaagcttaaagc 130  Q
    | ||||||||| ||||    
T  103887 ataggaagcttgaagc 103872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 12415 - 12195
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||||||||||  |||  || ||||||||||| | |||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12415 agttcatcaggagacacaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaacta 12316  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  12315 ttttgaaagaatttgaaagcattggatgcttattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagatt 12216  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  12215 gtgtctctgctacaagacaag 12195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12656 - 12526
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggag 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || |||    
T  12656 attaaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagag 12557  T
Q  100 caaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
     || | ||||||| || ||||||||| ||||    
T  12556 taatggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 12526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 421
Target Start/End: Original strand, 164940 - 165093
Alignment:
Q  269 agcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctcca 368  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  164940 agcaacaactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtctgtacgaagtgtacgaccactacctcca 165039  T
Q  369 ctactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaa 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  165040 ctactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 165093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 332
Target Start/End: Original strand, 65335 - 65485
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||     
T  65335 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctatttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagaaacgactat 65433  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaa 332  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  65434 tttgaaaggattaaagggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacaa 65485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 332
Target Start/End: Original strand, 144380 - 144530
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  144380 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctatttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacgactgt 144478  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaa 332  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  144479 tttgaaaggattaaagggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacaa 144530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 65093 - 65224
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||| ||||  |||||    
T  65093 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtatacaagactatagacaaaaatttggcatcttgaaatggtcttggaagaacaaataaagagca 65192  T
Q  102 aagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt 132  Q
    || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  65193 aatacatcaacaaaaagggaagcttaaagcgt 65224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 135060 - 135149
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| || |||| ||||||||||||    
T  135060 aaaattgtcaattggatatcctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaaatttggcatcttgaaatggtattggaagaacaa 135149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Original strand, 164589 - 164656
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  164589 taatatttgttcaagtgtacaggtctatagacaatatttgacatcttaaattgatcctgaaagaacaa 164656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 59979 - 59920
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  59979 attaaaaatgtcaattgaatatgttaatatttcttcaagtgtacaggaccatagataaaa 59920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 399
Target Start/End: Original strand, 7063 - 7282
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || | ||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  7063 agttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttgaaggattcaaacccgtctgaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactatt 7162  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt- 380  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  7163 ttggaaggattggaaagcattggatgcttattcttcaaacaacgttgacatggtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttta 7262  T
Q  381 tgtctac-gctacaagacaa 399  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  7263 tgtctgctgctacaagacaa 7282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 6804 - 6893
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa-atttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  6804 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacataactatagacaaatatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaa 6893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 5595 - 5815
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||  || | ||||||||| | |||| || |||| |||||||||| ||| |||| | |||| ||||| |||| ||||||  |||    
T  5595 agttcatcaggagatgcaagacttagagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtccaagtattgtagaagattggaagagtggagcaacatcta 5694  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  5695 ttttgaaaggatatgaaggcattggatgcttgttcttttaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaactactatctccactactcagttt 5794  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag 400  Q
     |||||  |||||||||||||    
T  5795 gtgtctctgctacaagacaag 5815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 5359 - 5527
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaata-gggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| | | |||||    
T  5359 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagcgtacaggaccatagacaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaatgagagca 5458  T
Q  102 aagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||  ||||||| || ||||| ||| ||||||     || || |||||||||||  ||||||||||||||    
T  5459 aatgaatcaactaaaaggaaccttgaagcgtctgaagagaagtgctcctgaagtaaaagtgctcctgaa 5527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 270 - 510
Target Start/End: Original strand, 38080 - 38319
Alignment:
Q  270 gcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccac 369  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38080 gcaatgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtccgtacgaagtgtacgaccactacctccac 38179  T
Q  370 tactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagt 468  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| || |||| || |||||| |||||||  |||| ||||| ||     
T  38180 tactctg-ttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccatcaaaataggaatggatttgaacgtgatccttcatagg 38277  T
Q  469 actacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  38278 acaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 38319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 143292 - 143087
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||| | | || || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  143292 ttcatcacgagatgcaagactcaaagcttgaaaggctattcaatggatttaatctcgtcaaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactatt 143193  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||         |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  143192 ttggaaggatttaaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttggaaaagtac---------aagtgtacaaccactacctccactacttagttttt 143102  T
Q  382 gtctacgctacaaga 396  Q
    ||||| |||||||||    
T  143101 gtctatgctacaaga 143087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Original strand, 59332 - 59539
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||| || |||||| || |||  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  59332 aagtgtacaaccattatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcagaatt-gt-ccttcaagataggaatgaa 59429  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  |||    
T  59430 tttgaagttcatccttcataggactacacctaaattaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatc 59528  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  59529 tcaacgtctct 59539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 143519 - 143366
Alignment:
Q  18 gatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaag 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| | |||||  |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||     
T  143519 gatatgctaatatttgttcaagtgtataggaccatagacaaaaatttgacatattaaaaaggttctggaagaacaatagagagcaaaggaatcaagaaaa 143420  T
Q  117 aggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    ||||||||||||||||     ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  143419 aggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcttgaagacaaagtgctcctgaa 143366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 347 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 29691 - 29524
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  29691 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 29593  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaa-agtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 514  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29592 tttgaagttgatccttcaataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagga 29524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 182 - 401
Target Start/End: Original strand, 99115 - 99331
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaat 281  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||   ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||| |    
T  99115 agttcatcaggaagtgcaacttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaag-ttgcagatgaccggaaaagtatagcaacgactatt 99213  T
Q  282 ttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  99214 ttggaaggattacaaggcattggatgcttattcttcaaagcgc--tgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttttt 99311  T
Q  382 gtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  99312 gtctctgctacaagacaaga 99331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 385
Target Start/End: Original strand, 19377 - 19582
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||| || |||| |||| ||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19377 agttcatgaggagatgcaagacttaaagcttcaaaagttgttcaatggatttaatttcgcctaagaattgcagaagactagaagagtgaagcaacaacta 19476  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  19477 ttttgaaaggatttaaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacataatacaattgtacgaagtgtacaaccactatattcactactcagttt 19576  T
Q  380 ttgtct 385  Q
     |||||    
T  19577 gtgtct 19582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 98843 - 98932
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatag-acaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  98843 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatggaaaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaa 98932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 19149 - 19198
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19149 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaa 19198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 350 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 1418 - 1213
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  1418 tgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaattt 1320  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctca 549  Q
    |||| |||| ||||| || |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  ||||||    
T  1319 gaagttgatccttcataggactatatccaaatcaggcaaaagattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaaaatctca 1221  T
Q  550 acgtctct 557  Q
    ||||||||    
T  1220 acgtctct 1213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 350 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 2033 - 1828
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaattt 449  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  2033 tgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaattt 1935  T
Q  450 gaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctca 549  Q
    |||| |||| ||||| || |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |  ||||||    
T  1934 gaagttgatccttcataggactatatccaaatcaggcaaaagattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaaaatctca 1836  T
Q  550 acgtctct 557  Q
    ||||||||    
T  1835 acgtctct 1828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15315 - 15130
Alignment:
Q  190 aggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaa 287  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| | || | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  15315 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgatcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcatcgactattttgaaa 15216  T
Q  288 ggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactact 373  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15215 ggatttgaaagcattggatgattgttctttgaatagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 15130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 58517 - 58329
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  58517 aagtgtacaaccactacctccacgaccctaagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttccttcaagataggaatgaa 58419  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||    
T  58418 tttgaagttgatccttcataggactacacctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagtcgtg 58329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6188 - 5992
Alignment:
Q  204 aaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattg 303  Q
    |||||||||||   |||| ||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||  ||| |  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  6188 aaagcttcaaagactgttcaaaggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagaccgaagcaacaactaattcaaaaggatttgaaggcattg 6090  T
Q  304 gatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||  |||||| |||||||    
T  6089 gatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctctactactctatttgtgtctctgctacaggacaaga 5992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 347 - 537
Target Start/End: Original strand, 28836 - 29025
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccacta-cctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatga 445  Q
    |||||||||||||||| |||| || || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||| ||||| |||||||    
T  28836 aagtgtacaaccactatcctctacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcctttaagattggaatga 28934  T
Q  446 atttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtg 537  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  28935 atttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtg 29025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Original strand, 17684 - 17891
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaattt 283  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||  ||||||  ||||||| ||| |||    
T  17684 ttcatcaggagatacaacttaaagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactacaaaagtatagcaacgtctatttt 17782  T
Q  284 gaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt 383  Q
    ||||||         |||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17783 gaaagg---------cattggatgcttatccttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgt 17873  T
Q  384 ctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  17874 ctctgctacaagacaaga 17891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 17439 - 17528
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17439 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacatcttaaattggtcttggaagaacaa 17528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 270 - 421
Target Start/End: Original strand, 15617 - 15769
Alignment:
Q  270 gcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccac 369  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  15617 gcaacggctagtttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatctttcaaagagcattgacaaagtacgtctgtacgaagtgtacgaccactatctccac 15716  T
Q  370 tactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaa 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  15717 tactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 15769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Original strand, 15267 - 15343
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  15267 tggataagctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaatatttgacatcttaaattgatcctgaaagaacaa 15343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 45
Target Start/End: Original strand, 27741 - 27782
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtaca 45  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27741 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtaca 27782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 6)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 34719 - 34930
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  || |||| |||   |||||| ||||||||||||||   ||||||| ||     
T  34719 cagttcttcaggagatgcaacttaaagtttcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgcctagaaattgcagaagactggaaaagtatggcaacgaatat 34818  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||| |         |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34819 tttgaaatg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 34909  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  34910 tgtctctgctacaagacaaga 34930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Original strand, 25580 - 25791
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  || |||| |||   |||||||||||||||||||||   |||||   ||     
T  25580 cagttcatcaggagatgcaacttaaagtttcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgcctagaaattgcaaaagactggaaaagtatggcaacagatat 25679  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||| |         |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25680 tttgaaatg---------cattggatgcttattcttcaaaaagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 25770  T
Q  381 tgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||   |||||||||||||    
T  25771 tgtctctactacaagacaaga 25791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 25324 - 25412
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25324 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgatatcttaaattggtcttggaagaacaa 25412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 34478 - 34566
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34478 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaggtgtacaggactatagacaaaatttgatatcttaaattggtcttggaagaacaa 34566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 36154 - 36281
Alignment:
Q  245 cattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgta 344  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||  || || ||| |||||||||||||||| ||| |   |||| ||||| || | || ||||||    
T  36154 cattgcagaagactggaagaatgaagcaacaactatttcaaatggttttaaaggcattggatgctttttcgttggagagagttgaaaatggacaattgta 36253  T
Q  345 caaagtgtacaaccactacctccactac 372  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||    
T  36254 cgaagtgtacaaccactatctccactac 36281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Original strand, 35857 - 35904
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaattt 63  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  35857 tggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaattt 35904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8136 - 7963
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  8136 cagttcatcagaagatgtaacttaaagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacgactat 8038  T
Q  281 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtaca 355  Q
    ||||||||||||  |  ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  8037 tttgaaaggattgaattgcattcgatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtaca 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 314 - 162
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||    
T  314 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacaacttaaaatggtcttggaagaacaaataaagagca 215  T
Q  102 aagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    || | |||||| ||  |||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  214 aatacatcaacaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8377 - 8225
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aatagggagca 101  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||    
T  8377 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaaatttgacaacttaaaatggtcttggaagaacaaataaagagca 8278  T
Q  102 aagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaag 149  Q
    || | |||||| ||  |||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  8277 aatacatcaacaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaag 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 73 - 10
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaag 244  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||    
T  73 cagttcatcagaagatgtaacttaaagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgtctaag 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 862 - 654
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||| |||||| || |||||||||| |||||||     
T  862 aagtgtacaaccactacctccacaactctgagcgtgtctacactacaagacaagatagcagctctgcctgtagaatt-gttccttcaagataggaatgat 764  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||| | |  |||    
T  763 tttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggtactc-aacgactctttaaacgtgcttaagatc 665  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  664 tcaacgtctct 654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 347 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 5242 - 5034
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||| |||||| || |||||||||| |||||||     
T  5242 aagtgtacaaccactacctccacaactctgagcgtgtctacactacaagacaagatagcagctctgcctgtagaatt-gttccttcaagataggaatgat 5144  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatc 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||| | |  |||    
T  5143 tttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggtactc-aacgactctttaaacgtgcttaagatc 5045  T
Q  547 tcaacgtctct 557  Q
    |||||||||||    
T  5044 tcaacgtctct 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 1234 - 1156
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaag 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||   || ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  1234 taatatttgttcaagtgtacaggaccatagac-aaagttgactaattcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaag 1156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5614 - 5536
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaag 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||   || ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  5614 taatatttgttcaagtgtacaggaccatagac-aaagttgaccaattcaataggtcttggaagaacaaaagagagcaaag 5536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 243 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10099 - 9942
Alignment:
Q  243 agcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattg 342  Q
    ||||||||| |||||   || |||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  10099 agcattgcagaagaccataagagtgaagcaacggctaattcaaatgaatttgaaggcattcgatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattg 10000  T
Q  343 tacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  9999 tacaaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtcgctgctacaagacaag 9942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 347 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 934 - 744
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||    
T  934 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtccttgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt-gttcccacaagataggaatgaa 836  T
Q  447 tttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgtt 539  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  835 tttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtgtt 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16006 - 15779
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagat-gtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaa 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||  |||||||||     
T  16006 gctaaagttcatcaggagatgcaagacttaaagcttcaaaagattgttcaatggattcaatctcgtccaagaattgcaaaagaccagaggagtgaagcac 15907  T
Q  274 cgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtac-gattgtacaaagtgtacaaccactacctccactac 372  Q
    | | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||    
T  15906 caattattttgaaaggacttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaaattgtacgaagtgtacaaccaccatctctactac 15807  T
Q  373 tctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    || |||| |||||  ||||| |||||||    
T  15806 tcagtttgtgtctctgctactagacaag 15779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16224 - 16168
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16224 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaagaccatagacaaaa 16168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 1536 - 1703
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaa 103  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||||  |||||||    
T  1536 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtcttagaagaacaataaagagcaaa 1635  T
Q  104 gaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    | ||||||| || | |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1636 ggaatcaacaaaaagggaagcttaaagcgtctgaagaaaactgctcctgaagataaagcgctcctgaa 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 246 - 401
Target Start/End: Original strand, 2702 - 2856
Alignment:
Q  246 attgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtac 345  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  2702 attgcagaagactggaaaagtattgcaacgactattttggaagg-ttggaaagcattggatgcgtattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtac 2800  T
Q  346 aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2801 gaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 2856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 342 - 513
Target Start/End: Original strand, 17873 - 18044
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  17873 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatagg 17971  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagg 513  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  17972 aatggatttgaacatgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcaatggtgaatgatcaaagg 18044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 280 - 421
Target Start/End: Original strand, 1802 - 1944
Alignment:
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1802 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtctatacgaagtgtacgaccactacctccactactttgttt 1901  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaa 421  Q
     |||||| | ||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  1902 atgtctatgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 401
Target Start/End: Original strand, 25384 - 25525
Alignment:
Q  260 gaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaacca 359  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||  || ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  25384 gaaaagtatagcaacgactattttgaaaggattgaagggcattggatagttattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaacca 25483  T
Q  360 ctacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25484 ctatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 25525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 264
Target Start/End: Original strand, 23469 - 23551
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23469 cagttcatcaggagatgcaacttaaagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaa 23551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 401
Target Start/End: Original strand, 15811 - 15865
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15811 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 15865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 165
Target Start/End: Original strand, 23382 - 23414
Alignment:
Q  133 gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23382 gaaaactgctcctgaagacaaagtgctcctgaa 23414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 299 - 510
Target Start/End: Original strand, 20409 - 20611
Alignment:
Q  299 cattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 398  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20409 cattggatgcttgtccttcaaagagagttgacaaagtac--------aaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 20500  T
Q  399 ag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattact 497  Q
    || | ||||||  |||||| ||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |    
T  20501 agaaaaacagctctgcctgtagaa-atgt-ccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcatt 20598  T
Q  498 ggtggatgatcaa 510  Q
    ||||  |||||||    
T  20599 ggtgattgatcaa 20611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Original strand, 20067 - 20144
Alignment:
Q  16 tggatatgttaatatttgttcaa-gtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||||| | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||    
T  20067 tggatacgctaatatttgttcaaagtatacaggactatagacaaaatttgatatcttaaattgatcctgaaagaacaa 20144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 430 - 557
Target Start/End: Original strand, 38120 - 38246
Alignment:
Q  430 ttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctt 529  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  38120 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 38218  T
Q  530 tagacgtgttgattatctcaacgtctct 557  Q
    |||||||| | |  ||||||||||||||    
T  38219 tagacgtgctaaagatctcaacgtctct 38246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 314
Target Start/End: Original strand, 686 - 825
Alignment:
Q  177 gctacagttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaac 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || ||| |||||||   |||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||      
T  686 gctaaagttcatcaggagatgcaagacttaaaacttcaaagactgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaatagtgaagcact 785  T
Q  275 gactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttc 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  786 gactattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttc 825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 8)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 182 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39488
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  39631 agttcatcaggagatgcaagatttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaggcattacaaaagactagaagagtgaagcaacaacta 39532  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagag 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  39531 atttgaaaggatttgaaggcattagatgcatgttctttaaagag 39488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 182 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 137691 - 137548
Alignment:
Q  182 agttcatcaggagatgcaac--tcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgacta 279  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  137691 agttcatcaggagatgcaagatttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaggcattacaaaagactagaagagtgaagcaacaacta 137592  T
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagag 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  137591 atttgaaaggatttgaaggcattagatgcatgttctttaaagag 137548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 159234 - 159043
Alignment:
Q  206 agcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattgga 305  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||  |    
T  159234 agcttcaaaggatgttcaaaggatttaatcacgtctaa-cattgcaaaagatcagaagagtgaagcaacggctaattcaaatgaatttgaaggcattata 159136  T
Q  306 tgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagaca 398  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||| ||||    
T  159135 tgcttgttctttgaagagcgttgacaaaggacaattgtatgaagtgtaaaaccactacctctactactttgtttgtgtctctgctacaggaca 159043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 325 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37463 - 37387
Alignment:
Q  325 gttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  37463 gttggcaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaaga 37387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 325 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 135523 - 135447
Alignment:
Q  325 gttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  135523 gttggcaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaaga 135447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 39854 - 39727
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatag-acaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||   || | | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  39854 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagaaaaaaatttggaatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcaa 39755  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || ||||||||| ||||    
T  39754 aggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 39727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 137914 - 137787
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatag-acaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||   || | | | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  137914 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagaaaaaaatttggaatcattattaggttctggaagaacaaaagagagcaa 137815  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
    || ||||||| || ||||||||| ||||    
T  137814 aggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 137787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 159515 - 159461
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaa 58  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  159515 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaa 159461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 112
Target Start/End: Original strand, 11277 - 11380
Alignment:
Q  9 tgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaat 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11277 tgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaatttgatatcttaaaaaggtcttggaagaacaataaagagcaaagaaat 11376  T
Q  109 caac 112  Q
    ||||    
T  11377 caac 11380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5161 - 5014
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  5161 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcgtgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatagg 5063  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||| |||||||  |||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  5062 aatggatttgaacatgattcttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 5014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 347 - 423
Target Start/End: Original strand, 8103 - 8179
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8103 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatt 8179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 87268 - 87356
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  87268 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacatcttaaattggtcttgaaagaacaa 87356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 399
Target Start/End: Original strand, 87623 - 87724
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  87623 gcattggatgcaaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtctgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttctgtctctgctacaagac 87722  T
Q  398 aa 399  Q
    ||    
T  87723 aa 87724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7362 - 7195
Alignment:
Q  1 attaaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaac-aataggga 98  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| |||    
T  7362 attaaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtttacaggactatagacaaaaatttgacatcttaaaaaggtcttggaagaacaaataagga 7263  T
Q  99 gcaaagaaatcaacgaaga-ggaagcttaaagcgt-----gaaaactgctcctgaagacaaagtgctc 160  Q
    ||||| | |||||| || | ||||||||||||| |     |||||||||| |||||||||||||||||    
T  7262 gcaaatacatcaaccaaaagggaagcttaaagcatctgaagaaaactgctactgaagacaaagtgctc 7195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6043 - 5991
Alignment:
Q  349 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6043 gtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 5991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 423 - 557
Target Start/End: Original strand, 9907 - 10040
Alignment:
Q  423 ttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaac 522  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  9907 ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactgcatctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aac 10005  T
Q  523 gactctttagacgtgttgattatctcaacgtctct 557  Q
    ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  10006 gactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctct 10040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 218 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9963 - 9825
Alignment:
Q  218 tgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctc 317  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||||   || ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |     
T  9963 tgtttaatggatttaatctcgtctaagcattatagaagaccaaaagagtgaagtaacgactattttgaaaggacttgaaagcattggatgcttgtgcttt 9864  T
Q  318 aaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaa 356  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9863 gaagagcgttgacatagtacaattgtacaaagtgtacaa 9825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10236 - 10109
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||| |||  || |||||||| || ||| ||    
T  10236 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaaatttgatatcttcaataggttctgaaagaacaaaagagaggaa 10137  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagc 130  Q
     | ||||||| || ||||||||| ||||    
T  10136 tggaatcaacaaaaaggaagcttgaagc 10109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 7354 - 7181
Alignment:
Q  317 caaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctg-tttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcc 414  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||    
T  7354 caaagagtgttgacaaagtacatatgtacgaagtgtacgaccactacctccacttctctgttttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcc 7255  T
Q  415 tgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||||||   || |||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  7254 tgcagaa-aagttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 7181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7730 - 7643
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaac 112  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||| || || ||  ||||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  7730 taatatttgttcaagtatacaggaccatagacaaaggttgatgtttttaaaaggtcttggaagaaaaaaagagagcaaaggaatcaac 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 270 - 489
Target Start/End: Original strand, 1674 - 1886
Alignment:
Q  270 gcaacgactaatttgaaaggatttgaag-gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctcca 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||    
T  1674 gcaacgactaatttgaagggatttgaaaagcattgggtgcttgtccttcaaaaagagttgacaaagtacga--------agtttacaaccactacctcca 1765  T
Q  369 ctactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaag 467  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||  | ||  ||| |||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| ||    
T  1766 ctactctgcttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcct-aaaaaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcatag 1864  T
Q  468 tactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
     || ||  ||||||||||||||    
T  1865 gacaacttccaaatcaggcaaa 1886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 2394 - 2482
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2394 aaaattgtcaattggatatgcttatatttgttcaagtgtacagaactatagacaaaatttgacatcttaaattggtcttggaagaacaa 2482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 399
Target Start/End: Original strand, 2738 - 2815
Alignment:
Q  322 agcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2738 agcgttgacatagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgctacaagacaa 2815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 287
Target Start/End: Original strand, 2618 - 2723
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaa 280  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||  || |||| ||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||     
T  2618 cagttcatcaggaaatgcaacctaaagtttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgcctaa-aattgcagaagactggaaaagtatagcaacggctat 2716  T
Q  281 tttgaaa 287  Q
    |||||||    
T  2717 tttgaaa 2723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 495 - 583
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  495 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaggactatagacaaaattttacatcttaaattggtcttggaagaacaa 583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 400
Target Start/End: Original strand, 846 - 945
Alignment:
Q  300 attggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  846 attggatgcttattcttcaaagagcgttgacataatacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctg-ttttgtctctgctacaagacaa 944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 266
Target Start/End: Original strand, 736 - 821
Alignment:
Q  181 cagttcatcaggagatgcaactcaaagcttcaaaagatgtttaaagga-tctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagt 266  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||   |||||| |||||| |||||||    
T  736 cagttcatcaggagatgaaacttaaagtttcaaaagctgtttcaaggactctaa-ctcgtctataaattgcagaagactagaaaagt 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7469 - 7366
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  7469 gcattggatgctaattcatcaaagagcgttgacatagtacatttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgctacaagac 7370  T
Q  398 aaga 401  Q
    ||||    
T  7369 aaga 7366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7833 - 7745
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||    
T  7833 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaattttacatgactatatacaaaatttgacatcttaagttgatcctgaaagaacaa 7745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 347 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7446 - 7375
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgca 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7446 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgca 7375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 317 - 489
Target Start/End: Original strand, 3937 - 4110
Alignment:
Q  317 caaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttttt-gtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcc 414  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||  | ||    
T  3937 caaagagcgttgacaaagtacatctgtacgaagtgtacgaccactacctccacttctctgtttttcgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctacc 4036  T
Q  415 tgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||||||   || |||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| |  || ||| ||||||||||||||    
T  4037 tgcagaa-aagttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataagacaacatccaaatcaggcaaa 4110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Original strand, 3560 - 3647
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatcaac 112  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||  |||| || || ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  3560 taatatttgttcaagtatacaggaccatagataaaggttgatgtttttaaaaggtcttggaagaacaaaagagagcaaaggaatcaac 3647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 264 - 401
Target Start/End: Original strand, 43908 - 44044
Alignment:
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||| || |||||||||||||     
T  43908 agtgaagcaaaggctaattcaaaaagatttgaaggcattggatgcctgttccttgaagagcgttgaaaaaggacatttgtacgaattgtacaaccactat 44007  T
Q  364 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    
T  44008 ctccactactctg-ttttgtctctgcaacaagacaaga 44044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 510
Target Start/End: Original strand, 6553 - 6757
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  6553 gcattgggtgcttgtccatcaaagagagttgacaaagtacga--------agtgtacaaccactacctccactactccgcttttttctacgctacaagac 6644  T
Q  398 aag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattac 496  Q
    ||| | ||||||  |||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| |     
T  6645 aagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcat 6743  T
Q  497 tggtggatgatcaa 510  Q
    |||||  |||||||    
T  6744 tggtgattgatcaa 6757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 52948 - 52892
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52948 aaaactgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaa 52892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 56900 - 56844
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56900 aaaactttcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaa 56844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6276
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||   |   || ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  6167 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaagttgatcaaatttaataggtcttggaagaacaaaagagagcaa 6266  T
Q  103 agaaatcaac 112  Q
    || |||||||    
T  6267 aggaatcaac 6276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 61776 - 61629
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga-caacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||  ||| |||||||||| ||    
T  61776 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctaca-aaaatgttccttcaagatagg 61678  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaa 489  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  61677 aatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 61629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 401
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1755
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1701 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17053 - 16831
Alignment:
Q  280 atttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | | | | ||||||||| ||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17053 atttgaaaggaattgaaggcattggattcatatccttcaaagagcattgacaaagtacga--------agtgtacgaccactacctccactactctattt 16962  T
Q  380 ttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacaccca 478  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||  ||| ||||||  || |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||    
T  16961 atgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaacca 16863  T
Q  479 aatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||  |||||||    
T  16862 aatcaagcaaaagatcattggtgattgatcaa 16831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 40780 - 40638
Alignment:
Q  243 agcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattg 342  Q
    ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||  |||| | |||| |  ||||||||||| |||| || ||||    
T  40780 agcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacggctaattcaaaagaatttgaaggcatatgatggtggttctttgaagagcgttgaaaaagaacaattg 40681  T
Q  343 tacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 385  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40680 taagaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttatgtct 40638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 342 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11804 - 11637
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatggg 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||| |||  |||||||||| ||    
T  11804 gtacaaagtgtaaaaccactacctccactactctg-ttttgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaa-ttgatccttcaagatagg 11707  T
Q  441 aatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaa 510  Q
    |||| |||||||  |||| ||||| || || ||  |||||||||| ||| ||| | |||||  |||||||    
T  11706 aatggatttgaacgtgatccttcataggacaactaccaaatcaggtaaaagatcattggtgattgatcaa 11637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 812 - 708
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgt-ttttgtctacgctacaaga 396  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  812 gcattggatgcttattcctcaaggagcgttgacatagttcgtttgtacgaagtgtacaatcactatctgcactactctgttttttgtctctgctacaaga 713  T
Q  397 caaga 401  Q
    |||||    
T  712 caaga 708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3307 - 3219
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  3307 aaaattgtcaattggatacgctaatatttcttcaagtgtacaggattatagacaatatttgacatcttaaattggtcctgaaagaacaa 3219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 510
Target Start/End: Original strand, 966 - 1170
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||    
T  966 gcattgggtgcttgtccatcaaagagagttgacaaagtacga--------agtgtacaaccactacctccactactatgcttatgtctactctacaagac 1057  T
Q  398 aag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattac 496  Q
    ||| | |||||   |||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| |     
T  1058 aagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcat 1156  T
Q  497 tggtggatgatcaa 510  Q
    |||||  |||||||    
T  1157 tggtgattgatcaa 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 510
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1363
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagac 397  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||    
T  1159 gcattgggtgcttgtccatcaaagagagttgacaaagtacga--------agtgtacaaccactacctccactactatgcttatgtctactctacaagac 1250  T
Q  398 aag-acaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatcaggcaaaggattac 496  Q
    ||| | |||||   |||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| |     
T  1251 aagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcat 1349  T
Q  497 tggtggatgatcaa 510  Q
    |||||  |||||||    
T  1350 tggtgattgatcaa 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 5013 - 5100
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  5013 aaaattgtcaattggatacgttaatatttgttcaagtgtacaagactatagacaata-ttgacatcttaaattggtcttgaaaaaacaa 5100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 396
Target Start/End: Original strand, 5347 - 5446
Alignment:
Q  298 gcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaa-gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 396  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  5347 gcattggatgcctattcttcaaagagcgttgacatagtacgtatgtagaaaagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaaga 5446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9340 - 9281
Alignment:
Q  342 gtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9340 gtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaaga 9281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 9045 - 9173
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatag-acaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||| | |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  9045 aaaattgtcaactggatatggtaatatttgttcaagtgtacaggatcgtagaaaaaaatttgacatcttaaataggttctggaagaacaaaagagagcaa 9144  T
Q  103 agaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    |  ||||||| || ||||||||| ||||||    
T  9145 atgaatcaac-aaaaggaagcttgaagcgt 9173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 373
Target Start/End: Original strand, 1510 - 1619
Alignment:
Q  264 agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactac 363  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | || ||| |  |||| |||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||||     
T  1510 agtgaagcaacgactatttcaaaaggatttgaaggcattggacgtttattctttgaagaacgttggaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactat 1609  T
Q  364 ctccactact 373  Q
    ||||||||||    
T  1610 ctccactact 1619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1223
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  1167 aaaattgtcaattggatatactaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 1223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 11838 - 11750
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaa 92  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||    
T  11838 aaaattgtcaattggatacgctaatatttgttcaagtgtacaagactataaacaaaatttgacatcttaagttgatcctgaaagaacaa 11750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 74696 - 74588
Alignment:
Q  271 caacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccact 370  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| || |  || ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  74696 caacggctaattcaaaaggatttgaaggaattagatgcttgctctttgaaaagcattgacaaagtacaattgtatgaagtgtacaaccactacctctact 74597  T
Q  371 actctgttt 379  Q
    ||| |||||    
T  74596 actttgttt 74588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 1410 - 1323
Alignment:
Q  293 tgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |  ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1410 tgaaggcattagatgcttattttttgaagagcgttgaaaaactacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 1323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 380
Target Start/End: Original strand, 1 - 88
Alignment:
Q  293 tgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |  ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1 tgaaggcattagatgcttattttttgaagagcgttgaaaaactacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttt 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5759 - 5633
Alignment:
Q  253 aagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgt 352  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||| ||| |   ||| |||||  ||| ||| ||||||| ||||||    
T  5759 aagactagaagaatgaagcaacgactatttcaaatgaatttgaaggcattggatgcttattctttggagaacgttggaaaa-tacaattgtacgaagtgt 5661  T
Q  353 acaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  5660 acaaccactacctccactactcagtttt 5633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 473 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 16601 - 16518
Alignment:
Q  473 cacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctct 557  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||    
T  16601 cacccaaattaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttttgacgtgctaaaaatctcaacgtctct 16518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 370
Target Start/End: Original strand, 2039 - 2090
Alignment:
Q  319 aagagcgttgacaaagtacgattgtacaaagtgtacaaccactacctccact 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2039 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccact 2090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 489
Target Start/End: Original strand, 1114 - 1218
Alignment:
Q  384 ctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattcttcaaagtactacacccaaatca 483  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||||    
T  1114 ctacgctacaagacaagataacagctctgtctgcagaaat-gttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatca 1212  T
Q  484 ggcaaa 489  Q
    ||||||    
T  1213 ggcaaa 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8718 - 8649
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtctta 72  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8718 aaaattgtcaattggatatgctaatatttattcaagtgtacaggactatagacaaaaatttgacatctta 8649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 4900 - 4988
Alignment:
Q  184 ttcatcaggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagatgtttaaaggatctaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaag 270  Q
    ||||||| |||||||||  || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  4900 ttcatcaagagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaag 4988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 132
Target Start/End: Original strand, 4759 - 4807
Alignment:
Q  84 gaagaacaatagggagcaaagaaatcaacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  4759 gaagaacaaaagggagcaaaggaatcaacaaaaaggaagcttaaagcgt 4807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Original strand, 13216 - 13258
Alignment:
Q  18 gatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13216 gatatgctaatatttgttcaagtgtacatgaccatagacaaaa 13258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 46023 - 45965
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatt 62  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  46023 aaaattgtcaattggatttgctaatatttgttcaagtgtacaagacaatagacaaaatt 45965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 381
Target Start/End: Original strand, 31856 - 31890
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31856 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 31890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 381
Target Start/End: Original strand, 35199 - 35233
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35199 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttt 35233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 60560 - 60682
Alignment:
Q  11 tcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagac-aaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaacaatagggagcaaagaaatc 109  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||| | | |||  || ||||| || ||| ||| ||| ||||    
T  60560 tcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaaaatttgatatctttattaggttctgaaagaaaaaaaggaagctaaggaatc 60659  T
Q  110 aacgaagaggaagcttaaagcgt 132  Q
    ||| || ||||||||| ||||||    
T  60660 aacaaaaaggaagcttgaagcgt 60682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9945 - 9892
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaag 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  9945 aagtgtacaaccactacctgcactactctgtttttatctctgctacaaaacaag 9892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 380
Target Start/End: Original strand, 384 - 417
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  384 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 352 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 84429 - 84380
Alignment:
Q  352 tacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  84429 tacaaccactacctccactactcagtttttgtctctactacaagacaaga 84380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 145312 - 145256
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa 60  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  145312 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggaccatagacaaaa 145256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3016 - 2969
Alignment:
Q  352 tacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  3016 tacaaccactacctccactactctatttttgtccctgctacaagacaa 2969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1898 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1898
Description:

Target: scaffold1898; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 1191 - 1257
Alignment:
Q  25 taatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaatttgacgtcttaaattggtcttggaagaaca 91  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| || || ||  |||||||||||||||    
T  1191 taatatttgttcaagtatacaggaccatagacaaagtttgatgtttttaaaaggtcttggaagaaca 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1782 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1782
Description:

Target: scaffold1782; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 42
Target Start/End: Original strand, 693 - 731
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgt 42  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  693 aaaattgtcaattggatatgttaatatttgttcaagtgt 731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22076 - 22030
Alignment:
Q  350 tgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaaga 396  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  22076 tgtacaaccactacctccacaactctgcctgtgtctacgctacaaga 22030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1709 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1709
Description:

Target: scaffold1709; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 42 - 1
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtaca 45  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42 aaaattgtcaattggatatgctaatatttgttcaagtgtaca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 4861 - 4788
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatatgttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaaa-tttgacgtcttaaatt 76  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  4861 aaaattgtcaattagatatgctaatatttgttcaagtgtgcaggactattgacaaaagtttaacgtctttaatt 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 375
Target Start/End: Original strand, 4540 - 4568
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4540 aagtgtacaaccactacctccactactct 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 375
Target Start/End: Original strand, 6250 - 6278
Alignment:
Q  347 aagtgtacaaccactacctccactactct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6250 aagtgtacaaccactacctccactactct 6278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Original strand, 10925 - 10981
Alignment:
Q  4 aaaactgtcaactggatat-gttaatatttgttcaagtgtacatgactatagacaaa 59  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10925 aaaattgtcaattggatattgctaatatttgttcaagtgtacaggaccatagacaaa 10981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 19219 times since January 2019
Visitors: 3808