View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2994_low_9 (Length: 448)

Name: NF2994_low_9
Description: NF2994
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2994_low_9
NF2994_low_9
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (1-432)||(9786857-9787288)
chr2 (1-425)||(21159952-21160374)
chr2 (1-372)||(14700681-14701052)
chr2 (1-418)||(28457630-28458041)
chr2 (1-372)||(27257425-27257793)
chr2 (1-372)||(36667622-36667991)
chr2 (1-371)||(23924785-23925152)
chr2 (3-372)||(43991571-43991932)
chr2 (1-423)||(13230095-13230510)
chr2 (1-418)||(29223713-29224123)
chr2 (1-418)||(29337012-29337422)
chr2 (1-418)||(36040015-36040426)
chr2 (1-418)||(32522927-32523337)
chr2 (1-296)||(41977710-41978003)
chr2 (1-418)||(24662882-24663295)
chr2 (1-187)||(40200162-40200348)
chr2 (1-226)||(42700726-42700949)
chr2 (193-372)||(36557465-36557644)
chr2 (1-159)||(36557315-36557473)
chr2 (1-187)||(31758500-31758686)
chr2 (218-418)||(42702175-42702370)
chr2 (238-372)||(5784513-5784646)
chr2 (320-392)||(31758294-31758365)
chr2 (170-257)||(11651893-11651980)
chr2 (346-423)||(8687769-8687842)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (1-425)||(1232244-1232666)
chr3 (1-418)||(33247986-33248398)
chr3 (1-418)||(3588398-3588809)
chr3 (1-418)||(7652975-7653386)
chr3 (1-418)||(10385823-10386234)
chr3 (1-401)||(2357171-2357569)
chr3 (1-372)||(26335157-26335517)
chr3 (1-424)||(49434089-49434506)
chr3 (1-372)||(20837134-20837502)
chr3 (1-372)||(48167947-48168315)
chr3 (1-419)||(45527644-45528056)
chr3 (1-418)||(22097665-22098075)
chr3 (1-372)||(23193963-23194328)
chr3 (1-418)||(9989394-9989804)
chr3 (1-418)||(52307838-52308249)
chr3 (1-372)||(27850304-27850672)
chr3 (5-372)||(36469193-36469557)
chr3 (1-372)||(4742756-4743122)
chr3 (1-418)||(37471440-37471850)
chr3 (97-418)||(8615501-8615816)
chr3 (3-233)||(37022867-37023097)
chr3 (1-193)||(20963009-20963200)
chr3 (185-372)||(23385436-23385622)
chr3 (238-418)||(27030672-27030847)
chr3 (1-102)||(8625931-8626032)
chr3 (1-151)||(23411748-23411886)
chr3 (170-230)||(17405041-17405101)
chr3 (188-223)||(23411714-23411749)
chr3 (218-256)||(20963676-20963714)
chr3 (308-418)||(20963711-20963817)
chr3 (320-392)||(25805002-25805073)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (1-401)||(22233603-22234002)
chr8 (1-401)||(13509974-13510372)
chr8 (1-401)||(13599504-13599902)
chr8 (1-372)||(16958590-16958961)
chr8 (1-401)||(22222428-22222818)
chr8 (1-401)||(22228770-22229160)
chr8 (2-391)||(22242997-22243385)
chr8 (1-372)||(22180641-22181010)
chr8 (1-372)||(4861704-4862072)
chr8 (1-418)||(8743036-8743447)
chr8 (1-423)||(11308740-11309156)
chr8 (1-418)||(9067920-9068331)
chr8 (1-418)||(28925896-28926307)
chr8 (1-418)||(27348024-27348435)
chr8 (1-418)||(28370091-28370502)
chr8 (1-418)||(41577084-41577495)
chr8 (1-418)||(3298800-3299210)
chr8 (5-324)||(34006530-34006845)
chr8 (1-369)||(12538200-12538572)
chr8 (91-418)||(16580083-16580404)
chr8 (1-190)||(17993087-17993275)
chr8 (10-187)||(21692669-21692846)
chr8 (56-371)||(1607326-1607639)
chr8 (221-426)||(17992884-17993085)
chr8 (188-391)||(24040737-24040937)
chr8 (1-199)||(13849082-13849278)
chr8 (1-161)||(36736959-36737117)
chr8 (320-392)||(21692187-21692258)
chr8 (1-37)||(22227261-22227297)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (1-372)||(3544631-3545002)
chr7 (1-418)||(2477656-2478069)
chr7 (1-371)||(22909158-22909526)
chr7 (1-373)||(1274626-1274996)
chr7 (1-372)||(2797316-2797685)
chr7 (1-418)||(10346058-10346469)
chr7 (1-418)||(31158029-31158440)
chr7 (1-372)||(24482784-24483154)
chr7 (1-418)||(8107641-8108052)
chr7 (1-372)||(22321554-22321922)
chr7 (1-418)||(2631394-2631805)
chr7 (1-372)||(23795134-23795503)
chr7 (1-336)||(19471943-19472275)
chr7 (20-418)||(12190841-12191231)
chr7 (1-372)||(12090213-12090582)
chr7 (1-418)||(12183864-12184273)
chr7 (1-426)||(29032547-29032955)
chr7 (1-418)||(31878599-31879008)
chr7 (1-324)||(6172604-6172924)
chr7 (1-372)||(45500464-45500832)
chr7 (31-418)||(31664278-31664658)
chr7 (100-372)||(22818452-22818721)
chr7 (87-418)||(1953955-1954270)
chr7 (1-113)||(22820401-22820513)
chr7 (9-87)||(31882433-31882511)
chr7 (272-418)||(19472285-19472427)
chr7 (1-46)||(1954291-1954336)
chr7 (274-401)||(19063524-19063651)
chr7 (346-392)||(27954734-27954780)
chr7 (183-236)||(29864586-29864639)
chr7 (320-392)||(28958516-28958587)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-372)||(30218139-30218513)
chr4 (1-372)||(53895419-53895787)
chr4 (1-385)||(19247581-19247962)
chr4 (1-418)||(21677420-21677831)
chr4 (4-391)||(1187986-1188370)
chr4 (1-418)||(4838889-4839300)
chr4 (1-372)||(22047721-22048090)
chr4 (19-372)||(55326816-55327167)
chr4 (1-372)||(33110455-33110825)
chr4 (1-325)||(5273315-5273637)
chr4 (1-372)||(323478-323847)
chr4 (1-418)||(26069723-26070136)
chr4 (1-370)||(42532639-42533007)
chr4 (1-324)||(52618591-52618911)
chr4 (1-372)||(40995300-40995671)
chr4 (1-418)||(20948743-20949154)
chr4 (1-372)||(46691790-46692158)
chr4 (1-337)||(26373384-26373716)
chr4 (1-324)||(35416449-35416768)
chr4 (1-187)||(9417186-9417372)
chr4 (163-392)||(6639997-6640226)
chr4 (256-372)||(44432060-44432175)
chr4 (232-426)||(8894921-8895111)
chr4 (1-46)||(21668658-21668703)
chr4 (1-70)||(8895205-8895275)
chr4 (346-392)||(9417532-9417578)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (1-425)||(737-1154)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (1-401)||(25976960-25977358)
chr6 (1-391)||(34006523-34006911)
chr6 (1-432)||(1454780-1455200)
chr6 (1-432)||(1466472-1466892)
chr6 (1-418)||(5988755-5989166)
chr6 (1-372)||(24878905-24879274)
chr6 (1-418)||(3539045-3539456)
chr6 (1-425)||(14270663-14271081)
chr6 (1-418)||(26515181-26515592)
chr6 (1-418)||(32806516-32806926)
chr6 (1-371)||(24161009-24161376)
chr6 (1-372)||(9932558-9932927)
chr6 (2-401)||(13173578-13173967)
chr6 (1-372)||(21631220-21631592)
chr6 (2-401)||(13182111-13182500)
chr6 (1-372)||(21596281-21596653)
chr6 (1-297)||(34913803-34914097)
chr6 (1-392)||(15642436-15642827)
chr6 (1-425)||(9518199-9518614)
chr6 (91-372)||(32821841-32822119)
chr6 (1-235)||(16698086-16698318)
chr6 (1-392)||(26604359-26604749)
chr6 (238-418)||(14479558-14479733)
chr6 (163-392)||(6867966-6868194)
chr6 (163-255)||(25541255-25541346)
chr6 (302-401)||(34913459-34913558)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (1-418)||(27166851-27167261)
chr5 (1-372)||(37251658-37252026)
chr5 (1-418)||(9404422-9404833)
chr5 (1-418)||(11723029-11723440)
chr5 (1-372)||(16904362-16904731)
chr5 (1-418)||(34456295-34456704)
chr5 (1-418)||(30606829-30607240)
chr5 (1-418)||(11766753-11767163)
chr5 (1-418)||(31845978-31846388)
chr5 (1-418)||(33434601-33435011)
chr5 (1-372)||(34869499-34869868)
chr5 (1-372)||(14344509-14344870)
chr5 (33-418)||(7314963-7315342)
chr5 (1-372)||(6269930-6270299)
chr5 (1-391)||(24835756-24836131)
chr5 (1-257)||(7315358-7315613)
chr5 (2-425)||(39655790-39656208)
chr5 (1-158)||(32226911-32227067)
chr5 (1-128)||(519311-519438)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-401)||(14195-14594)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (1-418)||(116321-116731)
scaffold0019 (1-66)||(169161-169226)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (4-372)||(11738554-11738919)
chr1 (1-418)||(38121685-38122096)
chr1 (1-418)||(39000934-39001345)
chr1 (1-372)||(432094-432462)
chr1 (1-401)||(8996015-8996413)
chr1 (1-372)||(12167969-12168338)
chr1 (1-418)||(16832536-16832946)
chr1 (1-418)||(33491951-33492362)
chr1 (1-372)||(9667449-9667817)
chr1 (1-322)||(36083848-36084167)
chr1 (1-418)||(40999857-41000267)
chr1 (1-418)||(44505021-44505434)
chr1 (1-418)||(49249070-49249473)
chr1 (1-372)||(13217802-13218167)
chr1 (1-226)||(15161612-15161836)
chr1 (1-385)||(9268662-9269045)
chr1 (163-392)||(13830307-13830532)
chr1 (218-426)||(15161093-15161296)
chr1 (1-168)||(16130748-16130914)
chr1 (163-393)||(39454122-39454354)
chr1 (222-372)||(16129699-16129848)
chr1 (222-391)||(16130234-16130402)
chr1 (170-392)||(6244221-6244436)
chr1 (346-392)||(7612385-7612431)
chr1 (350-426)||(36080210-36080281)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-372)||(8782-9151)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (1-401)||(11957-12353)
scaffold0298 (1-401)||(15727-16123)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (1-418)||(28652-29063)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-418)||(25403-25814)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-401)||(12205-12603)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (1-418)||(76205-76615)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (1-372)||(6772-7140)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (1-385)||(16226-16608)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-260)||(12241-12491)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (178-401)||(35211-35434)
scaffold0160 (1-133)||(35076-35205)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (163-393)||(9364-9596)
[»] scaffold0447 (4 HSPs)
scaffold0447 (132-269)||(7205-7341)
scaffold0447 (132-269)||(11819-11955)
scaffold0447 (33-102)||(7340-7409)
scaffold0447 (33-102)||(11954-12023)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (132-269)||(9814-9950)
scaffold0383 (33-102)||(9949-10018)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (238-418)||(1562-1737)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (281-372)||(1-92)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 9786857 - 9787288
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9786857 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 9786956  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9786957 aagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgttaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 9787056  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| |    
T  9787057 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaatggtagatatacttacatatgtcta 9787156  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9787157 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatgcctagattcatgatatctcaacaaatcttgataagaatctactcctaacatcttgctt 9787256  T
Q  401 tcctttgtgtttctctctagaaatgcaacttt 432  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9787257 tgctttgtgtctctctctagaaatgcaacttt 9787288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21160374 - 21159952
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21160374 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 21160275  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21160274 aagatatattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 21160176  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| || |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  21160175 taaata-gctagaatcatatattgaatgatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 21160077  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21160076 tgatagctttgcaaaagatgaagaagagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctactcctaacaccttactt 21159977  T
Q  401 tcctttgtgtttctctctagaaatg 425  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||    
T  21159976 tgctttgtgtgtctctcttgaaatg 21159952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14701052 - 14700681
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14701052 taatcgacgatttcccaacctattaaacgacctaaaaatattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 14700953  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14700952 aagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttctcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaacaacaacaatattgaa 14700853  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  14700852 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatagttagtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtaactacatatgtcta 14700753  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14700752 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagtttccttgcctagactcaagatgtctcaacaaatcttg 14700681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 28457630 - 28458041
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28457630 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaaattctagattaaatgtaattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 28457729  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||    
T  28457730 aagatagattgttattctatttcttaaacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcatt--acacaagaataacaacaatattaaa 28457827  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  28457828 taaataagctagaactatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 28457927  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||    ||| |    
T  28457928 tgatagcattgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcttaacaaatcttgagttgaatctactcctaac----tacct 28458023  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  28458024 tgctttgtgtttctctct 28458041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27257793 - 27257425
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  27257793 taatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataattt 27257694  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27257693 aagatagattgttattctatttc-tagatttaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatttaagaataacaacaatattgaa 27257595  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  27257594 taaat-agctagaactatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtcta 27257497  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27257496 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttg 27257425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 36667622 - 36667991
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  36667622 taatcgacgatttcccaacggattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgcctagagtgataactt 36667721  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36667722 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 36667820  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  36667821 taaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 36667919  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36667920 tgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 36667991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 23924785 - 23925152
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23924785 taattgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaaacctagattaaaagtgattatcaaaaattaacatccatgtctagagtgataactt 23924884  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23924885 aagatagattattattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 23924983  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  23924984 taaat-agctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-aacaagagtagatgtagatacatatgtcta 23925081  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatctt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  23925082 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatctt 23925152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43991932 - 43991571
Alignment:
Q  3 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43991932 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattacgtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctacagtgataacttaa 43991833  T
Q  103 gatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaata 202  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43991832 gatagattgttattctattttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 43991733  T
Q  203 aataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatg 302  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  43991732 aat-agctagcaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtctatg 43991635  T
Q  303 atagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43991634 atagctttgcaaaggatgaagaa------aagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 43991571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 13230095 - 13230510
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13230095 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgaactaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 13230194  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13230195 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 13230293  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  13230294 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtcta 13230391  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||  ||||    ||| |    
T  13230392 tgatagctttgtaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcataac----tacct 13230487  T
Q  401 tcctttgtgtttctctctagaaa 423  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  13230488 tgctttgtgtttctctctagaaa 13230510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 29224123 - 29223713
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  29224123 taatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataactt 29224024  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29224023 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 29223925  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  29223924 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaa--ctacaagagtagatgtagctacatatgtcta 29223827  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  29223826 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 29223731  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  29223730 tgctttgtgtttctctct 29223713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 29337422 - 29337012
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  29337422 taatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataactt 29337323  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29337322 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 29337224  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  29337223 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaa--ctacaagagtagatgtagctacatatgtcta 29337126  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  29337125 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 29337030  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  29337029 tgctttgtgtttctctct 29337012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 36040015 - 36040426
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36040015 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 36040114  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcat-taaatacaagaataacaacaatattga 199  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  36040115 aagatagattgttattctatttat-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaaaaaataaaagcaagaataacaacaatattga 36040213  T
Q  200 ataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcg 299  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||     
T  36040214 ataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaact-acaagagtagatgtagctacatatgtct 36040311  T
Q  300 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttact 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    |||     
T  36040312 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacc 36040407  T
Q  400 ttcctttgtgtttctctct 418  Q
    || ||||||||||||||||    
T  36040408 ttgctttgtgtttctctct 36040426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32523337 - 32522927
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  32523337 taatcgacgatttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtttagagtgataactt 32523238  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||    
T  32523237 aagatggattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagtaagaataacaacactattgaa 32523139  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| |    
T  32523138 taaat-cgctataaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagggtagaaatagctacatatgtcca 32523041  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||  | |||| ||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  32523040 tgatagctttgcaaaggacgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaataaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 32522945  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  32522944 tgctttgtgtttctctct 32522927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41978003 - 41977710
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41978003 taatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 41977904  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41977903 aagataaattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 41977805  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatg 296  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  41977804 taaat-agctaaaatcgtatattaaaatatcaaaagtttacataatggcttgtttgaataccttaaaacccacaatggtagatgtagctatatatg 41977710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 24662882 - 24663295
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggatta-aaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataact 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||| |   ||||||||||| ||| ||||    
T  24662882 taatcgacgatttcccaacctattaaacgaccaaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaaatcctatgtctagaatgaaaact 24662981  T
Q  100 taagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattg 198  Q
    || |||| ||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24662982 ta-gatagattattattttaat-cttagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaatgcaagaataataacaatattg 24663079  T
Q  199 aataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24663080 aataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctcaaaactcacaagcgtagatgtagctacatatgtc 24663179  T
Q  299 gatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttac 398  Q
     |||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||    ||    
T  24663180 tatgcaagcttcgcaaaggatgaaagaaagatgaagattcaatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtatgaaactactcctaaca----ac 24663275  T
Q  399 tttcctttgtgtttctctct 418  Q
     || ||||||||||||||||    
T  24663276 cttgctttgtgtttctctct 24663295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40200348 - 40200162
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||    
T  40200348 taatcgacgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctggaatgaaaactt 40200249  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataa 187  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  40200248 aagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaggaataa 40200162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 42700726 - 42700949
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  42700726 taatcgacgatttcccaaccgattaaattaccaaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacttccatgtctagagtgataactt 42700825  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  42700826 aatatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattaaa 42700924  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaa 226  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||    
T  42700925 caaat-agctagaaccatatattaaa 42700949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 193 - 372
Target Start/End: Original strand, 36557465 - 36557644
Alignment:
Q  193 atattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttaca 292  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||    
T  36557465 atattgaataaataagttagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtacctaca 36557564  T
Q  293 tatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36557565 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattaaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttg 36557644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 36557315 - 36557473
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36557315 taatcgacgatttcccagccgtttgaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 36557414  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaat 159  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36557415 aagatagattgttattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcatattgaat 36557473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31758686 - 31758500
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||    
T  31758686 taatcaacgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatttatgtctggaatgaaaactt 31758587  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataa 187  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31758586 aagatagcttgttattctatttcttagatccaaaagcattggtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa 31758500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 418
Target Start/End: Original strand, 42702175 - 42702370
Alignment:
Q  218 tatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaagg 317  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42702175 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttatttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 42702273  T
Q  318 atgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctc 417  Q
    | |||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| || |||||||||||||||    
T  42702274 aggaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----taccttgctttgtgtttctctc 42702369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 238 - 372
Target Start/End: Original strand, 5784513 - 5784646
Alignment:
Q  238 ttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatt 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  5784513 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaact-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 5784611  T
Q  338 tcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
     |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5784612 ccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 5784646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31758365 - 31758294
Alignment:
Q  320 gaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
    |||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  31758365 gaagaaaagatgaagatt-catgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaaca 31758294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11651980 - 11651893
Alignment:
Q  170 cattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttga 257  Q
    ||||||| |||| ||| | ||||||||  ||| ||  ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11651980 cattaaacacaaaaatgaaaacaatatcaaattaaatagctagaatcatatattagatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 11651893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 423
Target Start/End: Original strand, 8687769 - 8687842
Alignment:
Q  346 agattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctctagaaa 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  8687769 agatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----taccttgctttgtgtttctctctagaaa 8687842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 1232244 - 1232666
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  1232244 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctatagtgataactt 1232343  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1232344 aagatatattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgaaagaataacaacaatattgaa 1232442  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1232443 taaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagaaattacataatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 1232541  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  1232542 taatagctttgcaaaggatgaagaagagataaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctactcctaacaccttattt 1232641  T
Q  401 tcctttgtgtttctctctagaaatg 425  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  1232642 tgctttgtgtttctctctagaaatg 1232666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33248398 - 33247986
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33248398 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttcgagataaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 33248299  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  33248298 aagatagattgttattctagttcttagacccaaaaatattggtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacataaga-taacaacaatattgaa 33248200  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |    
T  33248199 taaattagctagaatcatatattaaaatatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgcagctacatatgtcta 33248100  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  33248099 tgatagctttgcaaaggatgaaaaagagatgaagattcaatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac----tacct 33248004  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  33248003 tgctttgtgtttctctct 33247986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3588809 - 3588398
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3588809 taatcgacgatttcccaaccgactaaatgacccaaaagcattaagtcctagattataagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 3588710  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3588709 aagatagattgttattctatctc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaataataaaagcaagaataacaacaatattgaa 3588611  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  3588610 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 3588512  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  3588511 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 3588416  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  3588415 tgctttgtgtttctctct 3588398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 7652975 - 7653386
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7652975 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 7653074  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||    
T  7653075 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaa 7653173  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  7653174 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 7653272  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  7653273 agatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 7653368  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  7653369 tgctttgtgtttctctct 7653386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 10385823 - 10386234
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10385823 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 10385922  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||    
T  10385923 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatacaagcaagaataacaacaatattgaa 10386021  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  10386022 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaggattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 10386120  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  10386121 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctcgaatctactcctaac----tacct 10386216  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  10386217 tgctttgtgtttctctct 10386234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2357569 - 2357171
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  2357569 taatcgatgatttcccaatcaattaattgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatct--gtctagagtgataactt 2357472  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2357471 aatatagattattattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 2357372  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  2357371 taaataagctagaaccatatattagaagatcaagagtttacatcatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaatgttagatgtagctacatatgtcta 2357272  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    |   ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||| |||    
T  2357271 tacaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacatcttgctt 2357172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26335517 - 26335157
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  26335517 taattgacgatttccaaacctattaaacgacccataagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagttataactt 26335418  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26335417 aagatagattgttattctattttttagatccaaaagtatttgtcaatatcgttttgaatctcaataaagcaataaatacaagaataacaacaatattgaa 26335318  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26335317 taaataagctaaaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 26335218  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||           |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26335217 tgatagctttgcaaaggatg-----------aagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttg 26335157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 49434506 - 49434089
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||    
T  49434506 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgtaaactt 49434407  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  49434406 aagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttaaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattaaa 49434307  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| |    
T  49434306 taaataagttagaactatatattaaaagatgaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacgcacaa-gataaatgtagctacatatgtcta 49434208  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||  ||||| ||||||||||||  ||| || |||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||||   |||||||||| |||||     || |    
T  49434207 tgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactcataatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-----acct 49434113  T
Q  401 tcctttgtgtttctctctagaaat 424  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  49434112 tgctttgtgtttctctctagaaat 49434089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20837502 - 20837134
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  20837502 taatcgatgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaatatccatgtctagagtgataactt 20837403  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  20837402 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaataatattgaa 20837304  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||| |    
T  20837303 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagaatggatgtagctacatatgtcta 20837206  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20837205 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 20837134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 48167947 - 48168315
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48167947 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 48168046  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48168047 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatgtcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 48168145  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  48168146 taaat-agctaaaacaatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtcta 48168243  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||| |||    |||| | ||||||||||||||||||||    
T  48168244 tgatagctttgcataggatgaagtgaagatgcagattccatgataagatccctgatgtctcaacaaatcttg 48168315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 45528056 - 45527644
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45528056 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 45527957  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcatt-aaatacaagaataacaacaatattga 199  Q
    |||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  45527956 aagatagatttttattttatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaaatgcaagaataacaacaatattga 45527858  T
Q  200 ataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcg 299  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||     
T  45527857 ataaat-agctagaaccatgtattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctagatatgtct 45527760  T
Q  300 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttact 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    |||     
T  45527759 atgatagctttgcaaaggatgatgaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacc 45527664  T
Q  400 ttcctttgtgtttctctcta 419  Q
    || |||||||||||||||||    
T  45527663 ttgctttgtgtttctctcta 45527644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 22098075 - 22097665
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22098075 taatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 22097976  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||    
T  22097975 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagtaagaataacaacaatattgaa 22097877  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  22097876 taaat-ggctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 22097779  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  22097778 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 22097683  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  22097682 tactttgtgtttctctct 22097665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23194328 - 23193963
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23194328 taatcgacgatttcctaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgtttatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 23194229  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  23194228 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaat---aacaatattgaa 23194133  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  23194132 taaat-agatagaaccatatattaaatgatcaaaagattacgtaatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctc 23194034  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  23194033 tgatag-tttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttg 23193963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9989804 - 9989394
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9989804 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 9989705  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9989704 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 9989606  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  9989605 taaat-tgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 9989508  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  9989507 tgatagctttgcaaaggttgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 9989412  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  9989411 tgctttgtgtttctctct 9989394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 52307838 - 52308249
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52307838 taatcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 52307937  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  52307938 aagatagattattattctatttat-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaa 52308036  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  52308037 taaataagctagaaccatgtattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 52308135  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| |||||||||| ||||||| |||   |||||||||| |||||    ||| |    
T  52308136 agatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctaaacaaatattggctagaatctactcctaac----tacct 52308231  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  52308232 tgctttgtgtttctctct 52308249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 27850304 - 27850672
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27850304 taatcgacgatttctcaaccgattaaattagccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 27850403  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27850404 acgatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 27850502  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||| |    
T  27850503 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttaaatacctcaaaac-cacaagattggatgtagctacatatgtcta 27850600  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27850601 tgatagctttgcaaaggatgaagaaatgatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 27850672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 372
Target Start/End: Original strand, 36469193 - 36469557
Alignment:
Q  5 cgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaaga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36469193 cgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaaga 36469292  T
Q  105 tatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaa 204  Q
    || ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36469293 tagattgttattctatgtc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaacaataaaatgcaagaataacaacaatattgaataaa 36469391  T
Q  205 taagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgat 304  Q
    |  |||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||    
T  36469392 t-tgctagaaccatgtattaaaagatctaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagttgtagctacatatgtctatgat 36469489  T
Q  305 agctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36469490 agctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 36469557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 4742756 - 4743122
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4742756 taatcgacaatttccaaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 4742855  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4742856 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaa-caataaaagcaagaataacaacaatattgaa 4742953  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  4742954 taaat-agctagaaccatatatt-aatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 4743050  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||    
T  4743051 tgatagctttgcaaacgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatctctcaacaaatcttg 4743122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 37471440 - 37471850
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  37471440 taatcgacgatttctcaactgattaaattatccaaaagaattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataactt 37471539  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37471540 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 37471638  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  37471639 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaac-cacaagagtagatatagctacatatgtcta 37471736  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||  |||||||||||| |||    ||||||||| |||||    |||||    
T  37471737 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgtcgtctcaacaaattttggcttgaatctactcctaac----tactt 37471832  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  37471833 tgctttgtgtttctctct 37471850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 97 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 8615816 - 8615501
Alignment:
Q  97 acttaagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatat 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||    
T  8615816 acttaagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatat 8615718  T
Q  197 tgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatg 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  8615717 tgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatg 8615619  T
Q  297 tcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatctt 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||    |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    |    
T  8615618 tctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----t 8615523  T
Q  397 actttcctttgtgtttctctct 418  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  8615522 accttgctttgtgtttctctct 8615501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37023097 - 37022867
Alignment:
Q  3 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttg--gattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  37023097 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaatcatatagattaaaagtgattatcaaatatcaacatccatgtctagagtgataactt 37022998  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37022997 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaaatatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 37022899  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaa 233  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37022898 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaa 37022867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 20963009 - 20963200
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  20963009 taatcgatgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattgagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgatacctt 20963108  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||    
T  20963109 aagatatattgttattctatttc-tagattcaaaagtatatgttcatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaataataacaacaa 20963200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 185 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23385622 - 23385436
Alignment:
Q  185 taacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatg 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||    
T  23385622 taacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctaaaaac-tacaagaatagatg 23385524  T
Q  285 tagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || |||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23385523 tagctaaatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgtagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 23385436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 238 - 418
Target Start/End: Original strand, 27030672 - 27030847
Alignment:
Q  238 ttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatt 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  27030672 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaact-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 27030770  T
Q  338 tcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctct 418  Q
     |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||    
T  27030771 ccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----taccttgctttgtgtttctctct 27030847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 8626032 - 8625931
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  8626032 taatcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataaatt 8625933  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  8625932 aa 8625931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23411886 - 23411748
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||    
T  23411886 taatcgacgatttcccaaccgaataaattacccaaaagaattaagttctagattaaaagtgattatcaaa-----------atgtctagagtgataactt 23411798  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatca 151  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  23411797 aagatagatcgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatca 23411748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Original strand, 17405041 - 17405101
Alignment:
Q  170 cattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgat 230  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  17405041 cattaaacacaagaataataacaatattgaataaaagatctagaaccatatattaaatgat 17405101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23411749 - 23411714
Alignment:
Q  188 caacaatattgaataaataagctataaccatatatt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23411749 caacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 23411714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 256
Target Start/End: Original strand, 20963676 - 20963714
Alignment:
Q  218 tatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttg 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20963676 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg 20963714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 418
Target Start/End: Original strand, 20963711 - 20963817
Alignment:
Q  308 tttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttg 407  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| || |||||    
T  20963711 tttgcaaatgatgaagagaagatgaagattccacgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----taccttgctttg 20963806  T
Q  408 tgtttctctct 418  Q
    |||||||||||    
T  20963807 tgtttctctct 20963817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25805073 - 25805002
Alignment:
Q  320 gaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
    |||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  25805073 gaagaaaagatgaagatt-catgacaagattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatcaacttctaaca 25805002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 22233603 - 22234002
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22233603 taatcgacgatttcccaacagattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 22233702  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22233703 aagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaa 22233802  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||  ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22233803 taaa-cagctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 22233901  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||| |||    
T  22233902 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgctt 22234001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13510372 - 13509974
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13510372 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 13510273  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13510272 aagatatattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 13510174  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  13510173 taaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 13510075  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||    
T  13510074 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaacatcttgctt 13509975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13599902 - 13599504
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13599902 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 13599803  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13599802 aagatatattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 13599704  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  13599703 taaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 13599605  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||    
T  13599604 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaacatcttgctt 13599505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16958961 - 16958590
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  16958961 taatcgacgatttcccaacctattaaacgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaaaatctatgtctaaagtgataactt 16958862  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16958861 aaaatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaatacaagaataacaacaatagtgaa 16958762  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16958761 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattaaataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 16958662  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16958661 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttg 16958590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 22222428 - 22222818
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22222428 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 22222527  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22222528 aagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaa 22222627  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| || |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22222628 taaat-agctagaatcatatat-----------aagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 22222715  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaa--atatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttac 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||| |    
T  22222716 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgc 22222815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 22228770 - 22229160
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22228770 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagtttaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 22228869  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22228870 aagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaa 22228969  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| || |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22228970 taaat-agctagaatcatatat-----------aagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 22229057  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaa--atatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttac 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||| |    
T  22229058 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgc 22229157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 391
Target Start/End: Original strand, 22242997 - 22243385
Alignment:
Q  2 aatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22242997 aatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactta 22243096  T
Q  102 agatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaat 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22243097 agatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacatttaattcaagaataacaataatattgaat 22243195  T
Q  202 aaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgat 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  22243196 aaataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagctacatatgtctat 22243295  T
Q  302 gatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaac 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  22243296 gatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctacttctaac 22243385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22181010 - 22180641
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22181010 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 22180911  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22180910 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 22180812  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  22180811 taaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagtagatgtagctacatatgtcta 22180713  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22180712 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 22180641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 4861704 - 4862072
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4861704 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 4861803  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4861804 aagataaattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 4861902  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  4861903 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtcta 4862000  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  4862001 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttg 4862072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 8743036 - 8743447
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8743036 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 8743135  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8743136 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaa 8743234  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  8743235 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 8743333  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  8743334 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 8743429  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  8743430 tgctttgtgtttctctct 8743447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 11308740 - 11309156
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11308740 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 11308839  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11308840 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacagtaaaagcaagaataacaacaatattgaa 11308938  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  11308939 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 11309037  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  11309038 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtggagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 11309133  T
Q  401 tcctttgtgtttctctctagaaa 423  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  11309134 tgctttgtgtttctctctagaaa 11309156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 9067920 - 9068331
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9067920 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 9068019  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9068020 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 9068118  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  9068119 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 9068217  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  9068218 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 9068313  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  9068314 tgctttgtgtttctctct 9068331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 28925896 - 28926307
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28925896 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 28925995  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28925996 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 28926094  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  28926095 taaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 28926193  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  28926194 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 28926289  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  28926290 tgctttgtgtttctctct 28926307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27348435 - 27348024
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27348435 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 27348336  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27348335 aagatggattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 27348237  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  27348236 taaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaagac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 27348138  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  27348137 tgataactttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 27348042  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  27348041 tgctttgtgtttctctct 27348024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28370502 - 28370091
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28370502 taatcgacgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 28370403  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28370402 aagatagattgttattttatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 28370304  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||||| |    
T  28370303 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtaaatgtagctacatatgtcta 28370205  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  28370204 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 28370109  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  28370108 tgctttgtgtttctctct 28370091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 41577084 - 41577495
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  41577084 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaagatccatgtttagagtgataactt 41577183  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41577184 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtacgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaa 41577282  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  41577283 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaagc-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 41577381  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  41577382 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 41577477  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  41577478 tgctttgtgtttctctct 41577495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3299210 - 3298800
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3299210 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 3299111  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3299110 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 3299012  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  3299011 taaat-tgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 3298914  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  3298913 tgatagctttgcaatggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 3298818  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  3298817 tgctttgtgtttctctct 3298800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 324
Target Start/End: Original strand, 34006530 - 34006845
Alignment:
Q  5 cgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaaga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34006530 cgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcaatgtatagagtgataacttaaga 34006629  T
Q  105 tatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaa 204  Q
    || |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34006630 tagattgttattctattt-atagattcaaaattatgtgtccatatcattttgaatctcaataaa-caataaaagcaagaataacaacaatattgaataaa 34006727  T
Q  205 taagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgat 304  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  34006728 t-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtctatgat 34006825  T
Q  305 agctttgcaaaggatgaaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34006826 agctttgcaaaggatgaaga 34006845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12538572 - 12538200
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  12538572 taatcgacgattttctaatcgattaaatgacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatatctagagtgataactt 12538473  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattga------atctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaat 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| || |      |||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||    
T  12538472 aagataaattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttaattttaaatctcaataaaataataaaatcaagaataacaacaat 12538374  T
Q  195 attgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacata 294  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  12538373 attgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacata 12538275  T
Q  295 tgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatc 369  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  12538274 tgtctaagatagctttgcaaatgatgaagaagagatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatc 12538200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16580404 - 16580083
Alignment:
Q  91 gtgataacttaagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaa 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  16580404 gtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaa 16580306  T
Q  191 caatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagtta 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||    
T  16580305 caatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagcta 16580207  T
Q  291 catatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaa 390  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||    
T  16580206 catatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaa 16580107  T
Q  391 catcttactttcctttgtgtttctctct 418  Q
    |    ||| || ||||||||||||||||    
T  16580106 c----taccttgctttgtgtttctctct 16580083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17993275 - 17993087
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17993275 taatcgacgattttccaagcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 17993176  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaa 190  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17993175 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa 17993087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21692846 - 21692669
Alignment:
Q  10 atttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaagatatat 109  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||| ||| ||    
T  21692846 atttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaatttaaaatagat 21692747  T
Q  110 tgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataa 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21692746 tgttattctatttcttggatccaaaagcatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa 21692669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1607639 - 1607326
Alignment:
Q  56 aaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatatt 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |   |||| |||||| | | |||||| |||| ||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |     
T  1607639 aaagtgattatcaaagattaaatcctatatctagaataaaaactta-gatagattattattctaactct-agatccaaaattatttttcaataacatttc 1607542  T
Q  156 gaatctcaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtt 254  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |  ||| | ||||||||| | |||||    
T  1607541 aaatcttaaataaagcattaagtacaagaataataacaatatttaataaataaggtagaaccatatattaaataaataaa-gattacataatagtttgtt 1607443  T
Q  255 tgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatg 354  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |  |||||||||    
T  1607442 tgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgcctatgaaagctttgcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgctaagattcatg 1607343  T
Q  355 atgtctcaacaaatctt 371  Q
    |||||||||||||||||    
T  1607342 atgtctcaacaaatctt 1607326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 221 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17993085 - 17992884
Alignment:
Q  221 attaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatg 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17993085 attaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 17992986  T
Q  321 aagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctctag 420  Q
    ||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||  ||||    ||| || | ||||||||||||||||    
T  17992985 aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttggattgaatctactcttaac----taccttgccttgtgtttctctctag 17992890  T
Q  421 aaatgc 426  Q
    ||||||    
T  17992889 aaatgc 17992884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24040937 - 24040737
Alignment:
Q  188 caacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtag 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||    
T  24040937 caacaatattgaataaata-gctaaaaccatatattaaat-atcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cataagagtagatatag 24040841  T
Q  288 ttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttc 387  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  24040840 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttc 24040741  T
Q  388 taac 391  Q
    ||||    
T  24040740 taac 24040737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 13849082 - 13849278
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||    
T  13849082 taatcgatgatttcccaatctattaattgatctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtatagaatgaaaactt 13849181  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattga 199  Q
    | |||| |||||||||||| | || |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13849182 a-gatagattgttattctactcct-agattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctttaaatacaagaataataacaatattga 13849278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 36736959 - 36737117
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||  | |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  36736959 taatcgatgatttcccaatctattaaatgactcaaaagcttcaagttctagattaatagtgattatcaaagattaaaatctatgtctagagtgaaaactt 36737058  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatct 161  Q
     ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36737059 -agatagattattattcta-ttcctagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatct 36737117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21692258 - 21692187
Alignment:
Q  320 gaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
    |||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  21692258 gaagaaaagatgaagatt-catgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaaca 21692187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 22227261 - 22227297
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaa 37  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22227261 taatcgacgatttcccaacagattaaatgacccaaaa 22227297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 3544631 - 3545002
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3544631 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 3544730  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3544731 aagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaatacaagaataacaacaatattgaa 3544830  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3544831 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaagtaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 3544930  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3544931 tgatagctttgcaaaggatggagaagagatgaagatttaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttg 3545002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2478069 - 2477656
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2478069 taatcgacgatttcctaacctattaaacgacccaaaagcattaagttctagatgaaaagtgattatcaaatattaacatttatgtctagagtgataactt 2477970  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2477969 aagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagccttaaatagaagaataacaacaatattgaa 2477870  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |    
T  2477869 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatggagctacatatgtcta 2477770  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  2477769 tgatagctttgcaaaggatgaggaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac----tacct 2477674  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  2477673 tgctttgtgtttctctct 2477656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22909526 - 22909158
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22909526 taatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 22909427  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22909426 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 22909328  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  22909327 tatata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagtagatgtagctacatatgtcta 22909229  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatctt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22909228 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgactagatccatgatgtctcaacaaatctt 22909158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1274996 - 1274626
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1274996 taatcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 1274897  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1274896 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 1274798  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |    
T  1274797 taaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataataacttgtttgaatacctcaaaacccagaagggtagatgtagctacatatgtcta 1274699  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttga 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||  || || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1274698 tgatagctttgcataggatgaagaagagataaagattcaatgccgagatccatgatgtctcaacaaatcttga 1274626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 2797316 - 2797685
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2797316 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 2797415  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2797416 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 2797514  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  2797515 taaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 2797613  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  2797614 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttg 2797685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 10346058 - 10346469
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10346058 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 10346157  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10346158 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 10346256  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  10346257 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 10346355  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  10346356 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 10346451  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  10346452 tgctttgtgtttctctct 10346469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 31158029 - 31158440
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31158029 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 31158128  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31158129 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 31158227  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  31158228 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaggttacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 31158326  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  |  ||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  31158327 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 31158422  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  31158423 tgctttgtgtttctctct 31158440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24483154 - 24482784
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24483154 taatcgacgatt-ctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtctag-attaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 24483057  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24483056 aagataaattattattctagttcttagacccaaaagtaattgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaa 24482957  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctc-aaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcg 299  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  24482956 taaataaactagaaccatattttaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctctaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtct 24482857  T
Q  300 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24482856 atgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttg 24482784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 8107641 - 8108052
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  8107641 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataactt 8107740  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||    
T  8107741 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaa 8107839  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  8107840 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ttacaagagtagatgtagctacatatgtcta 8107938  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  8107939 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 8108034  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  8108035 tgctttgtgtttctctct 8108052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 22321554 - 22321922
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22321554 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 22321653  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  22321654 aagatatattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaata-tgaa 22321751  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  22321752 taaataagctagaaccatatattaaaggatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 22321850  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22321851 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattcaatgaaaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 22321922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2631805 - 2631394
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2631805 taatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 2631706  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||    
T  2631705 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaataatattgaa 2631607  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  2631606 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgttta 2631508  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  2631507 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 2631412  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  2631411 tgctttgtgtttctctct 2631394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23795503 - 23795134
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23795503 taatcgacgatttcccaatcgactaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 23795404  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23795403 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatatgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaattttgaa 23795305  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||| |    
T  23795304 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatggagctacatatgtcta 23795206  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    | ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23795205 taatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 23795134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 19471943 - 19472275
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19471943 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 19472042  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19472043 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 19472141  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  19472142 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 19472239  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagat 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  19472240 tgatagctttacaaaggatgaagaaaggatgaagat 19472275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 12191231 - 12190841
Alignment:
Q  20 cgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaagatatattgttattcta 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12191231 cgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaattttaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattcta 12191132  T
Q  120 tttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccata 219  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||    
T  12191131 tttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcat-ttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-atccagaaccata 12191035  T
Q  220 tattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggat 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12191034 tattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtaaatacatatgtctatgatagctttgcaaaggat 12190936  T
Q  320 gaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctct 418  Q
    |||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||    
T  12190935 gaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----taccttgctttgtgtttctctct 12190841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 12090213 - 12090582
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12090213 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 12090312  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaac-aatattga 199  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  12090313 aagatagattgttattctagttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaataataacaacaaatattga 12090411  T
Q  200 ataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcg 299  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||     
T  12090412 ataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacatattagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagattagatgtagctacatatgtct 12090509  T
Q  300 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12090510 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 12090582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 12184273 - 12183864
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||     
T  12184273 taatcgacgatttcccaactgattaaattacccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaattttaacatccatgtatagagtgataactc 12184174  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12184173 aagatagattgttattctatctc-tagattcaaaagtatgtatccatatcat-ttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 12184076  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |    
T  12184075 caaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaaaagtagatgtagctacatatgtcta 12183978  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||  |||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  12183977 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 12183882  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  12183881 tgctttgtgtttctctct 12183864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 29032547 - 29032955
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | |            ||||||||||    
T  29032547 taatcgatgatttctcaatcaattaattgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaaaa------------gtgataactt 29032634  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29032635 aagatatatttttattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatttcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 29032734  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  29032735 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttagatgtagctacatatgtcta 29032834  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||       
T  29032835 tgcaagcttggcaaatgatgaaagaaagatgaagattccatgtctagactcatgatgtctcaacaaatcttgaatagaatctactcctaacacctta--- 29032931  T
Q  401 tcctttgtgtttctctctagaaatgc 426  Q
      |||||||||||||| |||||||||    
T  29032932 --ctttgtgtttctctatagaaatgc 29032955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31879008 - 31878599
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  31879008 taatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctagagtgataactt 31878909  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31878908 aagatagattgttattatatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaactgcaagaataacaacaatattgaa 31878810  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||      
T  31878809 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtctt 31878712  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  31878711 tgatagttttgcaaaggatgaa-aaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaac----tacct 31878617  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  31878616 tgctttgtgtttctctct 31878599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6172924 - 6172604
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6172924 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagtcctagattaaaactgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 6172825  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  6172824 aagatagattgttattctatttc-tagattaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaacgcaagaataacagcaatattgaa 6172726  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  6172725 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatatagctacatatgtcta 6172628  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6172627 tgatagctttgcaaaggatgaaga 6172604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 45500464 - 45500832
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  45500464 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataactt 45500563  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45500564 aagatacattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 45500662  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||      
T  45500663 taaataa-ctataaccatatattaaatggtcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatataactacatatgtctg 45500760  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||  | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  45500761 tgatagctttgcaaatgatgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttg 45500832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 418
Target Start/End: Original strand, 31664278 - 31664658
Alignment:
Q  31 cccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaagatatattgttattctatttcttagatc 130  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||     
T  31664278 cccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctagattgataacttaagatagattgttattctagttc-tagatt 31664376  T
Q  131 caaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgat 230  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31664377 caaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgat 31664475  T
Q  231 caaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatat 330  Q
    |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  31664476 caaaagattacataatagcctgttcgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctagatatgtttatgatagctttgtaaaggattaagaaaagat 31664574  T
Q  331 gaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctct 418  Q
    ||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||    
T  31664575 gaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----taccttgctttgtgtttctctct 31664658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22818721 - 22818452
Alignment:
Q  100 taagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattga 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  22818721 taagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattga 22818623  T
Q  200 ataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcg 299  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||     
T  22818622 ataaata-gctagaaccatacattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagaatggatgtagctacatatgtct 22818525  T
Q  300 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22818524 atgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 22818452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1954270 - 1953955
Alignment:
Q  87 tagagtgataacttaagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaata 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  1954270 tagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaagcaataaaagcaagaata 1954172  T
Q  187 acaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgta 286  Q
             ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||    
T  1954171 ---------ttgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaac-cacaatagtagatata 1954083  T
Q  287 gttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctactt 386  Q
    | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||  ||  | |||| |||||||||| |||||||||||    |||||||||     
T  1954082 gctacatatgtctatgatagcttttcaaaggatgaagaagaattgaagattcaatgacaagatccatgatgtcttaacaaatcttggcttgaatctactc 1953983  T
Q  387 ctaacatcttactttcctttgtgtttctctct 418  Q
    |||||    ||| || ||||||||||||||||    
T  1953982 ctaac----tacattgctttgtgtttctctct 1953955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22820513 - 22820401
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22820513 taatcgacgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaattgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 22820414  T
Q  101 aagatatattgtt 113  Q
    |||||| ||||||    
T  22820413 aagatagattgtt 22820401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 31882511 - 31882433
Alignment:
Q  9 gatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtct 87  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31882511 gatttcccaaccgattaaatcacccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtct 31882433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 418
Target Start/End: Original strand, 19472285 - 19472427
Alignment:
Q  272 acaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatctt 371  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||    
T  19472285 acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgcagaaaggatgaagattccaagacaagatccatgatgtctcaacaaatctt 19472384  T
Q  372 gataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctct 418  Q
    |    ||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||    
T  19472385 ggcttgaatctactcctaac----taccttgctttgtgtttctctct 19472427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 1954336 - 1954291
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagt 46  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1954336 taatcgacgatttcctaaccgattaaatgacccaaaagcattaagt 1954291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19063651 - 19063524
Alignment:
Q  274 aagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttga 373  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| | |||||||||  || | ||||| |||||||||||||||||| ||      
T  19063651 aagggtagatataactacatatgtctatgatagctttacatagaatgaagaagagatgaagattcaatgcttagatccatgatgtctcaacaaattttag 19063552  T
Q  374 taagaatctacttctaacatcttacttt 401  Q
       ||||||||| |||||| ||||||||    
T  19063551 gttgaatctactcctaacaccttacttt 19063524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 392
Target Start/End: Original strand, 27954734 - 27954780
Alignment:
Q  346 agattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
T  27954734 agattcatgatgtctcaacaaattttggaaagaatccacttctaaca 27954780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29864639 - 29864586
Alignment:
Q  183 aataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaag 236  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||    
T  29864639 aataataataatattgaataaataagctagaaccatatatttaagtatcaaaag 29864586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 392
Target Start/End: Original strand, 28958516 - 28958587
Alignment:
Q  320 gaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
    |||||||||||||||| |||||  | |||||||| || |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  28958516 gaagaaaatatgaaga-ttcatgacaagattcataatttctctacaaatcttgggaagaatccacttctaaca 28958587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 30218139 - 30218513
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30218139 taatcgatgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 30218238  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30218239 aagatagattgttattctatttcttagaacaaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaatagcaacaatattgaa 30218338  T
Q  201 ta---aataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgt 297  Q
    ||   ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30218339 taaataataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgt 30218438  T
Q  298 cgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30218439 ctatgatagctttgctaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgacgtctcaacaaatcttg 30218513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 53895787 - 53895419
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  53895787 taatagacgatttcccaacctattaaacgacccaaaaacattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaactt 53895688  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53895687 aagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaatattgaa 53895588  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |    
T  53895587 taaataagctagaaccatatattaaa--at-aagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccagaagggtagatgtagctacatatgtcta 53895491  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53895490 tgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagactccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 53895419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 19247581 - 19247962
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19247581 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 19247680  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19247681 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaagctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 19247779  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  19247780 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtcta 19247877  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctact 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  19247878 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatattggtttgaatctact 19247962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 21677420 - 21677831
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21677420 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 21677519  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21677520 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaatcaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 21677618  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  21677619 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtcta 21677717  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||    ||||||| | |||||    |||||    
T  21677718 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattttatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctattcctaac----tactt 21677813  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  21677814 tgctttgtgtttctctct 21677831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1188370 - 1187986
Alignment:
Q  4 tcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1188370 tcgacgatttcccaaccgattaaatcacccaaaagcatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaag 1188271  T
Q  104 atatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataa 203  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  1188270 atagattgctattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaataataacaacaatattaaataa 1188172  T
Q  204 ataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatga 303  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||    
T  1188171 ataa-ctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgcctatga 1188074  T
Q  304 tagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaac 391  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  1188073 tagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactcctaac 1187986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 4838889 - 4839300
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4838889 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 4838988  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4838989 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 4839087  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  4839088 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 4839186  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  4839187 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 4839282  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  4839283 tgctttgtgtttctctct 4839300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22048090 - 22047721
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22048090 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 22047991  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22047990 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattctgaatctcaataaaacaataaaaacaaaaataacaacaatattgaa 22047892  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  22047891 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 22047793  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22047792 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccataatgtctcaacaaatcttg 22047721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 55327167 - 55326816
Alignment:
Q  19 ccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaagatatattgttattct 118  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55327167 ccgattaaattacccaaaaacattaagctctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattct 55327068  T
Q  119 atttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccat 218  Q
    |||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  55327067 atttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaattttgaataaataagctagaaccat 55326969  T
Q  219 atattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaagga 318  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||    
T  55326968 atattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgcttgaatacctcaaaac-cacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttggaatgga 55326870  T
Q  319 tgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  55326869 tgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttg 55326816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 33110455 - 33110825
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33110455 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccctgaacattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgataactt 33110554  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| | | ||||  | |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33110555 aagatagactcttatgtt-tttcctagattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctttaaatacaagaataacaacaatattgaa 33110653  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| |    
T  33110654 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatggcttgtgtgaatacctcaaaacccacaagggtatatataactacatatgtcta 33110753  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33110754 cgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagatgtcatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttg 33110825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 5273315 - 5273637
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5273315 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 5273414  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5273415 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaattttgaa 5273513  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  5273514 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 5273612  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5273613 tgatagctttgcaaaggatgaagaa 5273637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 323847 - 323478
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  323847 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagcgtgataactt 323748  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  323747 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccgtatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 323649  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  323648 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgttta 323550  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  323549 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 323478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26070136 - 26069723
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  26070136 taatcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagttctagactaaaagtgattatcaaatattaacatacatgtctagagtgataactt 26070037  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26070036 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtctgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 26069938  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtag--atgtagttacatatgtc 298  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  26069937 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatatgtagctacatatgtc 26069839  T
Q  299 gatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttac 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    |||    
T  26069838 tatgatagctttgcaaaggatgaagaagagttgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttctaac----tac 26069743  T
Q  399 tttcctttgtgtttctctct 418  Q
     || ||||||||||||||||    
T  26069742 cttgctttgtgtttctctct 26069723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 42532639 - 42533007
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42532639 taatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 42532738  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaa-tatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattga 199  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  42532739 aagatagattgttattctagttc-tagattcaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatcttaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattga 42532837  T
Q  200 ataaataagctataa-ccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtc 298  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  42532838 ataaat-agctagaacccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtc 42532935  T
Q  299 gatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatct 370  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  42532936 tatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgacgtctcaacaaatct 42533007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52618911 - 52618591
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52618911 taattgacgatttcccgatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 52618812  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52618811 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtttgtgtccatatcattttgaatctcaataaatcattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 52618713  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |    
T  52618712 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaatagtagatgtagctacatatgtcta 52618615  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  52618614 tgatagctttgcaaaggatgaaga 52618591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 40995300 - 40995671
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40995300 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgactcaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 40995399  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40995400 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 40995498  T
Q  201 taaataagctataaccata---tattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgt 297  Q
    ||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  40995499 taaat-agctagaaccatatattattaaatgatcaaaagattacataatagcttttttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatatagctacatatgt 40995596  T
Q  298 cgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  40995597 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttg 40995671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 20949154 - 20948743
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||| ||||| |||| | ||||| ||| |||||| |||||| |  | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||| |||||    
T  20949154 taatcgatgattttccaatctattaattgatccaaaaacattaaattctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtctggaatgaaaactt 20949055  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    | |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949054 a-gatagattgttattctattcct-agatccaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctataaatacaagaataacaacaatattgaa 20948957  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  20948956 taaataagctagaaccatatattaaaatatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggatagatgtagctacatatattta 20948857  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||| ||||    ||| |    
T  20948856 tgatagcttgacaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcgacaaatcttgggttgaatctacttttaac----tacct 20948761  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  20948760 tgctttgtgtttctctct 20948743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 46691790 - 46692158
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  46691790 taatcgatgatttcccaaccgattaattgacctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcaatgtttagagggataactt 46691889  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46691890 aagatagattgttattctatttc-tagatttaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 46691988  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||| |    
T  46691989 taaat-agctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatataactacatatgtcta 46692086  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  46692087 tgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttg 46692158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 26373384 - 26373716
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  26373384 taatcgacgatttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataactt 26373483  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    ||| || |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |  |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26373484 aaggtagattgttattctattt-atagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaaca-taaaagcaagaataacaacaatattgaa 26373581  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |  ||| ||| || ||||||| |    
T  26373582 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacatgaggtgatatagctatatatgtcta 26373679  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  26373680 tgatagctttgcaaaggataaagaagaaatgaagatt 26373716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 35416449 - 35416768
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35416449 taattgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 35416548  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  35416549 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaatatcaataatattgaa 35416647  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||| |    
T  35416648 taaat-tgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttg-ttgaatacatcaaaac-cacaagagtagatgtaactacatatgtcta 35416744  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaaga 324  Q
    |||||| | |||||| ||||||||    
T  35416745 tgatagttgtgcaaaagatgaaga 35416768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 9417186 - 9417372
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |  | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  9417186 taatcgacgatttcccaacctattaaacaaaccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattgtaaaatattaacatctatgtctagaatgaaaactt 9417285  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataa 187  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9417286 acgatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa 9417372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 163 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6640226 - 6639997
Alignment:
Q  163 aataaagcattaaatacaagaataacaa-caatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatac 261  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  6640226 aataaagcattaaacacaagaacaataatcaataatgaataaataaattagaaccttatattaaatgatcaaa-gattccataatagcttgtttgaatac 6640128  T
Q  262 ctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggat-gaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtct 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||  ||||||||| ||| |  ||||||| |||||||    
T  6640127 ctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgaaagctttggaaaagatagaagaaag-atgaagattacatgctaagattcaagatgtct 6640029  T
Q  361 caacaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  6640028 caacaaattttgggaagaatctactcctaaca 6639997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 372
Target Start/End: Original strand, 44432060 - 44432175
Alignment:
Q  256 gaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatga 355  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| |||||    
T  44432060 gaatacctcaaaact-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaagggtgaagattccatggcaagatccatga 44432158  T
Q  356 tgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||||| ||||||||    
T  44432159 tgtctcaagaaatcttg 44432175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8895111 - 8894921
Alignment:
Q  232 aaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatg 331  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || | |||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||    ||  |||| ||||||| |||| |  ||| |||    
T  8895111 aaaagattacataatagcttgcttaagtacctctaaacccacaagggcagatttagctacatattctcatagtagccttgcaaaagatggaagaaagatg 8895012  T
Q  332 aagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctctagaaatgc 426  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||     | || | ||||||||||||||||||||||    
T  8895011 aagatttcatgacaagattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatctacttctaaca----cccttgcattgtgtttctctctagaaatgc 8894921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 21668658 - 21668703
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21668658 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagt 21668703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 8895275 - 8895205
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaag-tcttggattaaaagtgattatcaaa 70  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||    
T  8895275 taatcgatgatttctcaacctattaaacgatccaaaagcattaagttcttgatttcaaagtgattatcaaa 8895205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 392
Target Start/End: Original strand, 9417532 - 9417578
Alignment:
Q  346 agattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  9417532 agattcatgatgtctcaacaaatcttggaaataatccacttctaaca 9417578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 737 - 1154
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  737 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaatcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 836  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  837 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 935  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  936 taaataagctaca-ccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagctacatatgtctg 1034  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||       
T  1035 tgataactttgcaaaggacgaagaagatatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttggatagaatctactcctaacacctta--- 1131  T
Q  401 tcctttgtgtttctctctagaaatg 425  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  1132 --ctttgtgtttctctctagaaatg 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25977358 - 25976960
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25977358 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 25977259  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25977258 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaatcattaaatacaaaaataacaacaatattgaa 25977160  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  25977159 taaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 25977060  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||    ||||||||| |||||| ||| |||    
T  25977059 tgatagctttgcaaa-gatgaagaaaagatgaagattccataacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctt 25976961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34006911 - 34006523
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34006911 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 34006812  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34006811 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaa 34006713  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  34006712 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 34006614  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaac 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||    
T  34006613 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggtttgaatctactcctaac 34006523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1455200 - 1454780
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1455200 taatcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 1455101  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||| |||||||      ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1455100 aagatagattgtaattctat------gattcaaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaataaaacatcaaatacaagaataacaacaatattgaa 1455007  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1455006 taaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttacatatgtcta 1454907  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||  ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||     || |    
T  1454906 tgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-----acct 1454812  T
Q  401 tcctttgtgtttctctctagaaatgcaacttt 432  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1454811 tgctttgtgtttctctatagaaatgcatcttt 1454780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1466892 - 1466472
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1466892 taatcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 1466793  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||| |||||||      ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1466792 aagatagattgtaattctat------gattcaaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaataaaacatcaaatacaagaataacaacaatattgaa 1466699  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1466698 taaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttacatatgtcta 1466599  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||  ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||     || |    
T  1466598 tgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-----acct 1466504  T
Q  401 tcctttgtgtttctctctagaaatgcaacttt 432  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1466503 tgctttgtgtttctctatagaaatgcatcttt 1466472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 5988755 - 5989166
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  5988755 taattgacgatttccctaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctaaattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaactt 5988854  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5988855 aagatagattgttat-ctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaatattgaa 5988953  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  5988954 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtaaatgtagctacatatgtcta 5989053  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  5989054 tgatagctttgcaaatgatgaa-aaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac----tacct 5989148  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  5989149 tgctttgtgtttctctct 5989166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24879274 - 24878905
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  24879274 taatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataactt 24879175  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24879174 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgtatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaa 24879076  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||||| |    
T  24879075 taaataagctatagccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtatatgtagctacatatgtcta 24878977  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24878976 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttg 24878905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3539456 - 3539045
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3539456 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 3539357  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3539356 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 3539258  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  3539257 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 3539159  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  3539158 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 3539063  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  3539062 tgctttgtgtttctctct 3539045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14271081 - 14270663
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14271081 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 14270982  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14270981 aagatagattgctattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaa 14270883  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  14270882 taaataagctagaaccatatattaaaaaatcaagaaattacataattgcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtatatatagctacatatgtcta 14270783  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||   | |||||||  |||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||     || |    
T  14270782 tgatagttttgcaaaagatgaagaaaagatgaagattcactgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-----acct 14270688  T
Q  401 tcctttgtgtttctctctagaaatg 425  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  14270687 tgctttgtgtttctctctagaaatg 14270663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 26515181 - 26515592
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26515181 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 26515280  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26515281 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 26515379  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  26515380 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 26515478  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  26515479 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 26515574  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  26515575 tgctttgtgtttctctct 26515592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 32806516 - 32806926
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32806516 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 32806615  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32806616 aagatagatttttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaccaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 32806714  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |    
T  32806715 taaat-agctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtaggtgtagatacatatgtcta 32806812  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  32806813 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 32806908  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  32806909 tgctttgtgtttctctct 32806926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 24161009 - 24161376
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24161009 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtccttgattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtcgagagtgataactt 24161108  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24161109 aagatagattattattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 24161207  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  24161208 taaataa-ctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtcta 24161305  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatctt 371  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  24161306 tgatagctttgccaagaatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatctt 24161376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 9932558 - 9932927
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9932558 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 9932657  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9932658 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 9932756  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  9932757 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtata 9932855  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9932856 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 9932927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 401
Target Start/End: Original strand, 13173578 - 13173967
Alignment:
Q  2 aatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactta 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  13173578 aatcgaagatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataactta 13173677  T
Q  102 agatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaat 201  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13173678 agatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaat 13173776  T
Q  202 aaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgat 301  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||| ||    
T  13173777 aaat-agctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagggtagatg--------tatgtctat 13173867  T
Q  302 gatagctttgcaaaggatgaagaaa--atatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttact 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||  || ||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||    
T  13173868 gatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcc--gactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttact 13173965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21631592 - 21631220
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21631592 taatcgacgatttctcaatctattaaacgacccaaaaacattaagttctagattataagtgattatcaaagattaacatctatgtctagagtgataactt 21631493  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631492 aagatagattgttattctatttcttagattcaaaagcatttttcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 21631393  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||||| |    
T  21631392 taaataagctagaaccatgtattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctcaaatc-cacaagagtagatgtaactacatatgtcta 21631294  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaa--atatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21631293 tgatagctttacaaaggatgaagaaaagagatgaagattctatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttg 21631220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 401
Target Start/End: Original strand, 13182111 - 13182500
Alignment:
Q  2 aatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  13182111 aatcgacgattttccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataactta 13182210  T
Q  102 agatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaat 201  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13182211 agatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaaaacaagaataacaacaatattgaat 13182309  T
Q  202 aaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgat 301  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||| ||    
T  13182310 aaat-agctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagggtagatg--------tatgtctat 13182400  T
Q  302 gatagctttgcaaaggatgaagaaa--atatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttact 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||  || ||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||    
T  13182401 gatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcc--gactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttact 13182498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 21596281 - 21596653
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21596281 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 21596380  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21596381 aagatagtttgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 21596479  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  21596480 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagtttagatgtagctacatatgtcta 21596577  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatac----ctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  21596578 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttg 21596653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34914097 - 34913803
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34914097 taatcgacgatttcccaactgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 34913998  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34913997 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacagcaatattgaa 34913899  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgt 297  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34913898 taaat-agatagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgt 34913803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15642827 - 15642436
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggatta-aaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataact 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||| |   ||||||||||| ||| |||     
T  15642827 taatcgacgatttcctaacctattaaacgatccaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatgaaagattaaatactatgtctagaatgaaaaca 15642728  T
Q  100 taagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattg 198  Q
    || |||| ||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||| || |||||| |||||  ||||||||| |||||||||     
T  15642727 ta-gatagattattattctaatcct-agatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaaggcaagaataataacaatattc 15642630  T
Q  199 aataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15642629 aataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttatttgaatacctcaaaacccacaagggtagatttagctacatatgtc 15642530  T
Q  299 gatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
     |||  ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15642529 tatgcaagcttagcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtaagaatctactcctaaca 15642436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 9518199 - 9518614
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggatta-aaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataact 99  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||  |  |||| ||||||||||||||| ||| |   ||||||||||| | | ||||    
T  9518199 taatcgacgatttctcaatctattaaacgacccaaaagtattaagttcttaattacaaagtgattatcaaagattaaatcctatgtctagaataaaaact 9518298  T
Q  100 taagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattg 198  Q
    ||      ||| ||||||||   || |||| ||||| |||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  9518299 tag-----attattattctaaccct-agattcaaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataacaattatg 9518392  T
Q  199 aataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtc 298  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9518393 aataaataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtc 9518492  T
Q  299 gatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttac 398  Q
     |||  | ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  9518493 tatgcaaacttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgctaaaattcatgatgtctcaacaaatcttcataagaatctacttctaacatctca- 9518591  T
Q  399 tttcctttgtgtttctctctagaaatg 425  Q
         ||||||||||||||||||||||    
T  9518592 ----ttttgtgtttctctctagaaatg 9518614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 32822119 - 32821841
Alignment:
Q  91 gtgataacttaagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaa 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32822119 gtgataacttatgatatattgttattctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacagtaaatacaagaataacaa 32822020  T
Q  191 caatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagtta 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||    
T  32822019 caatattgaataaataagctagaaccatatattaaa-aatctaaagattacataattgcttatttgaatacctcaaaacccacaa--gtagatgtagcta 32821923  T
Q  291 catatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||  || | ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  32821922 catttgtctatgatagcttttaaaaggatggagaagagatgaagattcaatgcatagatccatgatttatcaacaaatcttg 32821841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16698318 - 16698086
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16698318 taatcgacgatttccaaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 16698219  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16698218 aagataggttgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 16698120  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaa 235  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  16698119 taaat-agttagaaccatatattaaatgatcaaaa 16698086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26604749 - 26604359
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggatta-aaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataact 99  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || | || ||||||||||  | ||||| |||||||||||||||  || |  |||||||||||| | | ||||    
T  26604749 taatcgacgatttcccaatctattaaacgatcaaatagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaaacttaaactctatgtctagaataaaaact 26604650  T
Q  100 taagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattg 198  Q
    |  |||| ||| ||||||||   || | |||||||| ||||| |||||| ||| |  ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26604649 tt-gatagattattattctaaccct-acatccaaaagtatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaaaaacaagaataataacaatattg 26604552  T
Q  199 aataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtc 298  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26604551 aataaataagctagaatcttatattaaatgatcaaa-gattacataatagcttttttgaatacctcaatacccacaaggatagatgtagctacatatgtc 26604453  T
Q  299 gatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
     |||| ||||||||||| |||| |  ||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26604452 tatgaaagctttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctacttctaaca 26604359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 238 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 14479733 - 14479558
Alignment:
Q  238 ttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatt 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14479733 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt 14479635  T
Q  338 tcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctct 418  Q
     |||  | |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||    
T  14479634 ccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----taccttgctttgtgtttctctct 14479558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 392
Target Start/End: Original strand, 6867966 - 6868194
Alignment:
Q  163 aataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacc 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || |||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6867966 aataaagcattaaacacaagactaataaaaatatcaaaaaaatgagctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacc 6868065  T
Q  263 tcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctca 362  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||| || |  ||  |||| ||||||| |||| |  ||||||||||| | |||  | ||||||||||| | ||     
T  6868066 ttaaaacccacaagggtagatgtagctacaaattttcatagtagccttgcaaaagatggaagaaatatgaagactccatgacaagattcatgatat-tct 6868164  T
Q  363 acaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
    ||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  6868165 acatatcttgggaggaatctacttctaaca 6868194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25541346 - 25541255
Alignment:
Q  163 aataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgttt 255  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  25541346 aataaagcaagaaacacaagaataataacaatatttaataaataagctagaaccttatatgaaatgatc-aaagattacataatagcttgttt 25541255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34913558 - 34913459
Alignment:
Q  302 gatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttacttt 401  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||  || |||| || ||| ||||||||||||||||||    ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  34913558 gatagctttgcataggatgatgaagagatgaagattcaatgcctaaatccataatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgcttt 34913459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 27166851 - 27167261
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27166851 taatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 27166950  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27166951 aagataaattgttattctatttc-tagattcaaaaatatatgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 27167049  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  27167050 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtcta 27167147  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  27167148 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtcccaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 27167243  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  27167244 tgctttgtgtttctctct 27167261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 37251658 - 37252026
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  37251658 taatcgacgatttcccaaacgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataactt 37251757  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37251758 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 37251856  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  37251857 taaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatatcta 37251955  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  37251956 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccat-ccttgactcatgatgtctcaataaatcttg 37252026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9404833 - 9404422
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9404833 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 9404734  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9404733 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaa 9404635  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  9404634 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 9404536  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  9404535 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 9404440  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  9404439 tgctttgtgtttctctct 9404422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 11723029 - 11723440
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11723029 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 11723128  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11723129 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 11723227  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  11723228 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 11723326  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  11723327 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 11723422  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  11723423 tgctttgtgtttctctct 11723440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 16904362 - 16904731
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16904362 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 16904461  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16904462 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 16904560  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  16904561 taaataggctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 16904659  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16904660 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 16904731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 34456704 - 34456295
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  34456704 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtc--gagtgataactt 34456607  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34456606 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaa 34456508  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  34456507 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 34456409  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  34456408 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 34456313  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  34456312 tgctttgtgtttctctct 34456295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 30606829 - 30607240
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30606829 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 30606928  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30606929 aagatagattattattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaa 30607027  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  30607028 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 30607126  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| |||||||||||||||||| |||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  30607127 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatattggcttgaatctactcctaac----tacct 30607222  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  30607223 tgctttgtgtttctctct 30607240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11767163 - 11766753
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11767163 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 11767064  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11767063 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaataataaaagcaagaataacaacaatattgaa 11766965  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  11766964 taaat-tgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 11766867  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  11766866 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 11766771  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  11766770 tgctttgtgtttctctct 11766753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31846388 - 31845978
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31846388 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 31846289  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31846288 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 31846190  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  || |||||| |||||||||| |    
T  31846189 taaat-tgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagattaaatgtagctacatatgtcta 31846092  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  31846091 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 31845996  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  31845995 tgctttgtgtttctctct 31845978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33435011 - 33434601
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33435011 taatcgtcgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 33434912  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33434911 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 33434813  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||| |    
T  33434812 taaat-tgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgagtacctcaaaac-tacaagaggagatgtagctacatatgtcta 33434715  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  33434714 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 33434619  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  33434618 tgctttgtgtttctctct 33434601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 34869499 - 34869868
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34869499 taatcgaggatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 34869598  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| || |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34869599 aagaaagattgttattttatttct-agattcaaaagtacgtgtccatatcattttaaatctcaatagaacattatatgcaagaataacaacaatattgaa 34869697  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  34869698 taaata-gctagaaccatatattaaatgatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 34869796  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34869797 tgatagctttgcaaagaatgaataagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 34869868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14344870 - 14344509
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14344870 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 14344771  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14344770 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaa 14344672  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||||| || |||||||||||        ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  14344671 taaataagttagaaccatatatt--------aaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 14344581  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14344580 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 14344509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 33 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7315342 - 7314963
Alignment:
Q  33 caaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaagatatattgttattctatttcttagatcca 132  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  7315342 caaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattca 7315244  T
Q  133 aaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatca 232  Q
    ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7315243 aaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatca 7315144  T
Q  233 aaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatga 332  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  7315143 aaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtga 7315045  T
Q  333 agatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctct 418  Q
    ||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||    
T  7315044 agattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----taccttgctttgtgtttctctct 7314963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6270299 - 6269930
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttccc-aaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataact 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6270299 taatcgacgatttccccaaccgattaaattaccaaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataact 6270200  T
Q  100 taagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattga 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6270199 taagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtacatgtccatatcattttgagtctcaataaaacaataaagacaagaataacaacaatattga 6270101  T
Q  200 ataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcg 299  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||     
T  6270100 ataaat-agctagaaatatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatatagctacatatgtct 6270003  T
Q  300 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||| |||| |||| ||||||||||||    
T  6270002 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagattccttgacaagatccatgttgtcacaacaaatcttg 6269930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24836131 - 24835756
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||             ||    
T  24836131 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgt-------------tt 24836045  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24836044 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 24835946  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  24835945 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 24835847  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaac 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||    
T  24835846 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcctgacttgaatctactcctaac 24835756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7315613 - 7315358
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7315613 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 7315514  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7315513 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaa 7315415  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttga 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7315414 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 7315358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 425
Target Start/End: Original strand, 39655790 - 39656208
Alignment:
Q  2 aatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggatta-aaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||| |   ||||||||||| | | |||||    
T  39655790 aatcgacgatttcccaatctattaaacgacccaaaaccattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaaatcctatgtctagaattaaaactt 39655889  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattga 199  Q
    | |||| ||| ||||| ||   || |||| ||||| |||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||| ||||||||| || || |||||    
T  39655890 a-gatagattattattttaaccct-agattcaaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataagaagattga 39655987  T
Q  200 ataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcg 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39655988 ataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtct 39656087  T
Q  300 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttact 399  Q
     ||  |||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||| ||||      
T  39656088 ttgcaagcttgacaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttttgtagaatctactcctaacacctta-- 39656185  T
Q  400 ttcctttgtgtttctctctagaaatg 425  Q
       | |||||||||||||||||||||    
T  39656186 ---cgttgtgtttctctctagaaatg 39656208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32227067 - 32226911
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32227067 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcactaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattgacattcatgtctagagtgataactt 32226968  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaa 158  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  32226967 aagacagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaa 32226911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 519438 - 519311
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||    
T  519438 taatcgacaatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatttagaatgaaaactt 519339  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttaga 128  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  519338 aagatagattgttattctatttcttaga 519311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14594 - 14195
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaag-tcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataact 99  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14594 taatcgacgattttccaatctattaaacgatccaaaagcattaagctcttg-atttaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaact 14496  T
Q  100 taagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattga 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14495 taagatagattgttattctatttcttatatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaactatattga 14396  T
Q  200 ataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcg 299  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      
T  14395 ataaataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttac-taatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtat 14297  T
Q  300 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttact 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||| ||    
T  14296 atgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagattccatccctaaactcatgatgtctcaacaaatcttgagttgaatctactcctaacaccttgct 14197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 116321 - 116731
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  116321 taatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 116420  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  116421 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaa 116519  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  116520 ttaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtcta 116617  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  116618 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaggattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 116713  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  116714 tgctttgtgtttctctct 116731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 169161 - 169226
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattat 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  169161 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatttaaagtgattat 169226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 372
Target Start/End: Original strand, 11738554 - 11738919
Alignment:
Q  4 tcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11738554 tcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaag 11738653  T
Q  104 atatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataa 203  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11738654 atagattgttattctatttc-tagattcaaaattatgtgtccatatcattttgaatctcagtaaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 11738752  T
Q  204 ataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatga 303  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  11738753 at-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtctatga 11738850  T
Q  304 tagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  11738851 tagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtgtcaacaaatcttg 11738919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 38121685 - 38122096
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38121685 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 38121784  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38121785 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 38121883  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  38121884 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 38121982  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  38121983 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 38122078  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  38122079 tgctttgtgtttctctct 38122096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 39000934 - 39001345
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39000934 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattgacatccatgtctagagtgataactt 39001033  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39001034 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 39001132  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  39001133 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 39001231  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  39001232 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 39001327  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  39001328 tgctttgtgtttctctct 39001345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 432094 - 432462
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  432094 taatcgacgatttcccaaccgattaattcacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 432193  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  432194 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 432292  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||| |    
T  432293 taaat-tgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagaatggatgtagctacatatgtcta 432390  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  432391 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttg 432462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 8996015 - 8996413
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  8996015 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaatttttagattaaaagtgattatcaaatattagcatccatgtctagagtgataactt 8996114  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  || |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8996115 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaaggatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaataataacaacaatattgaa 8996213  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8996214 taaata-gctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacatcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 8996312  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||| |||||| ||| |||    
T  8996313 tgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcgcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctt 8996412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 12167969 - 12168338
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12167969 taatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 12168068  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12168069 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtcaatattattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 12168167  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  12168168 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 12168266  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12168267 tgatagctttgcaaaggatgaagaaatggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 12168338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 16832536 - 16832946
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  16832536 taatcgacgatttcctaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataactt 16832635  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16832636 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaaatatgtgtccatatcattttgaatctaaataacatattaaatgcaagaatagcaacaatattgaa 16832734  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| || |    
T  16832735 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatatagctacatatatcta 16832832  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  16832833 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 16832928  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  16832929 tactttgtgtttctctct 16832946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 33491951 - 33492362
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33491951 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 33492050  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||    
T  33492051 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaa 33492149  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  33492150 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaac-tacaagagtagatgtggctacatatgtcta 33492248  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  33492249 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 33492344  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  33492345 tgctttgtgtttctctct 33492362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 9667449 - 9667817
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9667449 taatcgacgatttaccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 9667548  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9667549 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 9667647  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||| |||||||||| |    
T  9667648 taaat-tgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagaatgtatgtagctacatatgtcta 9667745  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9667746 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 9667817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36084167 - 36083848
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  36084167 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaatgcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaactt 36084068  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36084067 aagatagattgttattatatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaa 36083968  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |    
T  36083967 taaataagctagaaccatatattaaaagat-aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggtagatgtaactacatatgtcta 36083870  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaa 322  Q
    ||  |||||  |||||||||||    
T  36083869 tgcaagcttgacaaaggatgaa 36083848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 40999857 - 41000267
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40999857 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 40999956  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |  ||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40999957 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaagaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 41000055  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||| |    
T  41000056 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatataactacatatgtcta 41000153  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  41000154 tgatagatttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 41000249  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  41000250 tgctttgtgtttctctct 41000267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 44505021 - 44505434
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  44505021 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataattt 44505120  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44505121 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 44505219  T
Q  201 taaataagctataa-ccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttg-tttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtc 298  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  44505220 taaat-agctagaacccatatattaaataatcaaaagattacataatagcttgttttgaatacctcaaaaaccacaagtttagatgtagctacatatgtc 44505318  T
Q  299 gatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttac 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |  ||| |||||||||||||||||| |||    ||||||||| |||||    |||    
T  44505319 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaattttggcttgaatctactcctaac----tac 44505414  T
Q  399 tttcctttgtgtttctctct 418  Q
     || ||||||||||||||||    
T  44505415 cttgctttgtgtttctctct 44505434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 49249473 - 49249070
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  49249473 taatcgacgatttcccaaccgattaaattactcaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatttctagagtgataactt 49249374  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49249373 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatataattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 49249275  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||        ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  49249274 taaataagctagaaccatatatt--------aaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 49249184  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  49249183 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 49249088  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  49249087 tactttgtgtttctctct 49249070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 13217802 - 13218167
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  13217802 taatcgacgatttcccagctaattaaattatccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataactt 13217901  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||  |   ||||||||||||||||||    
T  13217902 aagataaattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatcttaataaaacattaaaggc---aataacaacaatattgaa 13217997  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  13217998 taaat-agctagaaccgtatattaaattatcaaaagattacataatatcttgtttgaatgcctcaaaac-cacaagagtagatgtagctacatatgtcta 13218095  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | || | ||||||||||||||||||||||    
T  13218096 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagttccatgatgtctcaacaaatcttg 13218167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15161836 - 15161612
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15161836 taatcgactatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctatattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 15161737  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctc-aataaagcattaaatacaagaataacaacaatattga 199  Q
    |||||| ||| ||||||||  || | ||||||||| ||||||| |||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15161736 aagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgttaatatccttttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattga 15161638  T
Q  200 ataaataagctataaccatatattaaa 226  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15161637 ataaat-agctagaaccatatattaaa 15161612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9269045 - 9268662
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaag-tcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataact 99  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| |||||  || || |||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||  |||    
T  9269045 taatcgacgatttcccaatcaattaaacgacctaaaagcattaagctcttgatttcaaggtgattatcaaagattaaattctatgtctagaatgaacact 9268946  T
Q  100 taagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattg 198  Q
    || |||| ||| |||||||  | || |||||||||| ||||||||||||  || |  |||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  9268945 ta-gatagattattattctgatcct-agatccaaaagtatttgtcaataaaatttcaaatctcaaataaagctttagatgcaagaataataacaatattg 9268848  T
Q  199 aataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtc 298  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9268847 aataaata-gctagaaacatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttggttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtc 9268749  T
Q  299 gatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctact 385  Q
      ||  || || ||||||||| ||  ||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||   |||||||||||    
T  9268748 tttgcaagtttggcaaaggataaaagaaagatgaagatttcatgtctagactcatgatgtctcaataaatattaggaagaatctact 9268662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 163 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13830532 - 13830307
Alignment:
Q  163 aataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtt-tacataatggcttgtttgaatac 261  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  13830532 aataaagtattaaatacaataataacaa---tattgaataaataagctagaaccatatattaaatgatcaa--gtaatacataatagcttgtttgaatac 13830438  T
Q  262 ctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctc 361  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||    
T  13830437 ctaaaaacccacaagggtaaatgtagctacatatgtctatgaaaactttgcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcatgctaagattcatgacgtctc 13830338  T
Q  362 aacaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  13830337 aacaaatcttaggaagaatctactcctaaca 13830307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15161296 - 15161093
Alignment:
Q  218 tatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaagg 317  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15161296 tatattaaaaaatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccataagagtagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcagagg 15161197  T
Q  318 atgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctc 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||     || |||||||||||||||    
T  15161196 atgaagaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctactcctaatatc-----ttgctttgtgtttctctc 15161102  T
Q  418 tagaaatgc 426  Q
    |||||||||    
T  15161101 tagaaatgc 15161093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16130914 - 16130748
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16130914 taatcgacgattccctaaccgattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 16130815  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaa 168  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  16130814 aagatagattgttattttatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaa 16130748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 39454354 - 39454122
Alignment:
Q  163 aataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttaca---taatggcttgtttgaat 259  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||   |||| ||||||||||||    
T  39454354 aataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaaa-gattacaaattaatagcttgtttgaat 39454256  T
Q  260 acctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtc 359  Q
    |||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |  ||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||    
T  39454255 accttaaaaaccacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatactaagattcatgatatc 39454156  T
Q  360 tcaacaaatcttgataagaatctacttctaacat 393  Q
    || ||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  39454155 tctacaaatcctaggaagaatctacttctaacat 39454122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 222 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16129848 - 16129699
Alignment:
Q  222 ttaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatga 321  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16129848 ttaaatgatcaaaagattacataatagattgtttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatga 16129750  T
Q  322 agaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    |||| | |||||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16129749 agaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 16129699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 222 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16130402 - 16130234
Alignment:
Q  222 ttaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatga 321  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  16130402 ttaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-tcacaagagtagatatagctacatatgtctatgataactttgcaaatgatga 16130304  T
Q  322 agaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaac 391  Q
    |||| | |||||||||  ||  | |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  16130303 agaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactcctaac 16130234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6244436 - 6244221
Alignment:
Q  170 cattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 269  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  6244436 cattaaacacaagaatgataacaatattgaataaaagagctggaaccatatattaaatgatcaagagtttaca-------ttgtttgaatacctcaaaac 6244344  T
Q  270 gcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatc 369  Q
     ||||||||||||||||| || || | |  ||  |||||||||||| |||| |  ||  ||||||||| |||  | | ||||||||| |||| |||||||    
T  6244343 ccacaagggtagatgtagctatatgttttcatagtagctttgcaaaagatggaagaaggatgaagattccatgacaatattcatgatatctctacaaatc 6244244  T
Q  370 ttgataagaatctacttctaaca 392  Q
    || | ||||||||||| ||||||    
T  6244243 tttagaagaatctactcctaaca 6244221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 392
Target Start/End: Original strand, 7612385 - 7612431
Alignment:
Q  346 agattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaaca 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  7612385 agattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaaca 7612431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 350 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 36080281 - 36080210
Alignment:
Q  350 tcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctctagaaatgc 426  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||     || || ||||||||||||||||||||||||    
T  36080281 tcatgatgtctcaacaagtcttggatagaatctactcctaac-----accttgctttgtgtttctctctagaaatgc 36080210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9151 - 8782
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9151 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 9052  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9051 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 8953  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  8952 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 8854  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8853 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 8782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 11957 - 12353
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  11957 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataactt 12056  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12057 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 12155  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||| |    
T  12156 taaat-agctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgtcta 12252  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||| ||| |||    
T  12253 tgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctt 12352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 15727 - 16123
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  15727 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataactt 15826  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15827 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 15925  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||| |    
T  15926 taaat-agctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgtcta 16022  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||| ||| |||    
T  16023 tgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctt 16122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 28652 - 29063
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28652 taatcgacgattttccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 28751  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28752 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 28850  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  28851 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatgtcta 28949  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  28950 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 29045  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  29046 tgctttgtgtttctctct 29063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 25403 - 25814
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25403 taatcgacgatttccaaaccgattaatttacccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 25502  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25503 aagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 25601  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| || |    
T  25602 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-tacaagagtagatgtagctacatatatcta 25700  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  25701 tgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 25796  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  25797 tgctttgtgtttctctct 25814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12603 - 12205
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  12603 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataactt 12504  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagc-attaaatacaagaat-aacaacaatattg 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12503 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaattaaatgcaagaataaacaacaatattg 12405  T
Q  199 aataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtc 298  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||    
T  12404 aataaat-agctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgtc 12308  T
Q  299 gatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttac 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||| ||| |    
T  12307 tatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgc 12208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 76205 - 76615
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  76205 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 76304  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  76305 aagatagattgttattttatttc-tagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 76403  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||| |    
T  76404 taaat-agctagaaccatacattaaatgatcaaaagattacataataacttgtttgaatacctcaaaa-tcacaagagtagatgtatctacatatgtcta 76501  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| |    
T  76502 tgatagctttgcaaaggatgaagaattgttgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----tacct 76597  T
Q  401 tcctttgtgtttctctct 418  Q
    | ||||||||||||||||    
T  76598 tgctttgtgtttctctct 76615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 7140 - 6772
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7140 taatcgacgattttccaaccaattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 7041  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7040 aaaatatattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaagaaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 6942  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||| |    
T  6941 taaat-agctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac-cacaagaatggatgtagctacatatgtcta 6844  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6843 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 6772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 16226 - 16608
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||  || |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  16226 taatcgatgatttcccaatctattaatcgatccaaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaagattaacatctatgtctagaatgaaaactt 16325  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    | |||| ||||||||  || ||| ||||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16326 a-gatagattgttata-taattcctagatccaaaagtattagttaatatcatttcaaatctcaataaagccttaaatacaagaataacaaccatattgaa 16423  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcga 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  16424 taaataagctagaaccatatattaaaagatcaagggtttacataatagcttatttaaatacctcaaaacccacaagggtatatgtagatacatatgtcta 16523  T
Q  301 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctact 385  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16524 agatagcttggcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctact 16608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 12241 - 12491
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12241 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 12340  T
Q  101 aagatatattgttattctatttcttagatccaaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||        ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12341 aagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa--------taaaagcaagaataacaacaatattgaa 12431  T
Q  201 taaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaata 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12432 taaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 12491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 178 - 401
Target Start/End: Original strand, 35211 - 35434
Alignment:
Q  178 acaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  35211 acaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaaaaatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaatg 35310  T
Q  278 gtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataag 377  Q
    || ||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||   ||    
T  35311 gtggatgtacctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcataccgagactcataatgtctcaacaaatcttgggtag 35410  T
Q  378 aatctacttctaacatcttacttt 401  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||    
T  35411 aatctactcctaacaccttgcttt 35434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 35076 - 35205
Alignment:
Q  1 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaag-tcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataact 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||    
T  35076 taatcgacgatttcccaaccgattaaatgaccaaaaagcattaagttctagatttaaaagtgattatcaaatattaacatcta----tagagtgataact 35171  T
Q  100 taagatatattgttattctatttcttagatccaa 133  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35172 taaggtagattgttattctatttcttaaatccaa 35205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 393
Target Start/End: Original strand, 9364 - 9596
Alignment:
Q  163 aataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttaca---taatggcttgtttgaat 259  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||   |||| ||||||||||||    
T  9364 aataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaaa-gattacaaattaatagcttgtttgaat 9462  T
Q  260 acctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtc 359  Q
    |||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |  ||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||    
T  9463 accttaaaaaccacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatactaagattcatgatatc 9562  T
Q  360 tcaacaaatcttgataagaatctacttctaacat 393  Q
    || ||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  9563 tctacaaatcctaggaagaatctacttctaacat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7205
Alignment:
Q  132 aaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatc 231  Q
    |||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7341 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagata-gctagaaccatatattaaatgatc 7243  T
Q  232 aaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 269  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7242 aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 7205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11955 - 11819
Alignment:
Q  132 aaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatc 231  Q
    |||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11955 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagata-gctagaaccatatattaaatgatc 11857  T
Q  232 aaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 269  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856 aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 11819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 7409 - 7340
Alignment:
Q  33 caaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaa 102  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7409 caaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 7340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 12023 - 11954
Alignment:
Q  33 caaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaa 102  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12023 caaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 11954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9950 - 9814
Alignment:
Q  132 aaaaatatttgtcaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatc 231  Q
    |||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9950 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagata-gctagaaccatatattaaatgatc 9852  T
Q  232 aaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 269  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9851 aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 9814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 10018 - 9949
Alignment:
Q  33 caaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaa 102  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10018 caaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 238 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1737 - 1562
Alignment:
Q  238 ttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacgcacaagggtagatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatt 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  1737 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaact-acaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 1639  T
Q  338 tcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctacttctaacatcttactttcctttgtgtttctctct 418  Q
     |||    |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||    ||| || ||||||||||||||||    
T  1638 ccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac----taccttgctttgtgtttctctct 1562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 372
Target Start/End: Original strand, 1 - 92
Alignment:
Q  281 gatgtagttacatatgtcgatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatacctagattcatgatgtctcaacaaatcttg 372  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1 gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagaggaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttg 92  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 18872 times since January 2019
Visitors: 3804