View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3704-Insertion-5 (Length: 688)

Name: NF3704-Insertion-5
Description: NF3704
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3704-Insertion-5
NF3704-Insertion-5
[»] chr7 (197 HSPs)
chr7 (7-673)||(42603062-42603740)
chr7 (358-675)||(21990810-21991128)
chr7 (358-663)||(11833178-11833484)
chr7 (358-675)||(9785465-9785783)
chr7 (358-667)||(41288112-41288422)
chr7 (358-675)||(10094589-10094906)
chr7 (358-668)||(36578996-36579307)
chr7 (358-675)||(48304047-48304366)
chr7 (358-675)||(45457211-45457529)
chr7 (362-674)||(17508863-17509176)
chr7 (362-674)||(17544038-17544351)
chr7 (358-675)||(1280792-1281110)
chr7 (358-675)||(24319878-24320196)
chr7 (358-675)||(21603608-21603924)
chr7 (358-675)||(6667543-6667861)
chr7 (358-675)||(36253078-36253396)
chr7 (362-668)||(22747168-22747475)
chr7 (358-675)||(40761736-40762054)
chr7 (374-668)||(26161106-26161404)
chr7 (358-675)||(39532630-39532948)
chr7 (358-667)||(3266542-3266840)
chr7 (358-675)||(2622740-2623058)
chr7 (365-675)||(42644820-42645114)
chr7 (358-676)||(4621035-4621341)
chr7 (360-621)||(32643170-32643432)
chr7 (362-673)||(45482214-45482514)
chr7 (362-668)||(17473420-17473718)
chr7 (362-668)||(17579496-17579794)
chr7 (358-668)||(32740907-32741209)
chr7 (358-651)||(27535600-27535893)
chr7 (358-636)||(44482533-44482807)
chr7 (358-675)||(10574529-10574831)
chr7 (365-668)||(36719222-36719518)
chr7 (358-675)||(46025710-46026002)
chr7 (374-668)||(5684519-5684805)
chr7 (374-668)||(5709569-5709855)
chr7 (358-668)||(28664611-28664907)
chr7 (475-667)||(9719745-9719938)
chr7 (371-668)||(24988168-24988446)
chr7 (358-675)||(37375711-37376004)
chr7 (358-528)||(37593379-37593549)
chr7 (358-676)||(21954488-21954792)
chr7 (478-675)||(15674386-15674585)
chr7 (358-652)||(9137127-9137406)
chr7 (358-515)||(26017327-26017478)
chr7 (371-515)||(29804361-29804499)
chr7 (359-515)||(38273198-38273354)
chr7 (358-512)||(28015654-28015802)
chr7 (358-515)||(21328967-21329118)
chr7 (537-675)||(15017210-15017349)
chr7 (378-661)||(29352388-29352656)
chr7 (361-515)||(5238246-5238397)
chr7 (358-515)||(30992493-30992643)
chr7 (358-675)||(25112660-25112953)
chr7 (556-675)||(43847218-43847337)
chr7 (358-463)||(8180162-8180267)
chr7 (371-515)||(47750028-47750166)
chr7 (358-515)||(49167219-49167370)
chr7 (358-507)||(32587197-32587343)
chr7 (358-515)||(21552124-21552275)
chr7 (358-512)||(31254786-31254940)
chr7 (358-460)||(43847337-43847439)
chr7 (358-515)||(47156679-47156830)
chr7 (358-475)||(15674018-15674135)
chr7 (358-497)||(23808655-23808792)
chr7 (358-512)||(9137704-9137858)
chr7 (358-515)||(134814-134965)
chr7 (358-515)||(18753989-18754140)
chr7 (358-512)||(31724917-31725071)
chr7 (373-490)||(33530159-33530270)
chr7 (358-515)||(34893401-34893552)
chr7 (358-515)||(38649027-38649178)
chr7 (358-494)||(7986207-7986337)
chr7 (358-515)||(40477001-40477152)
chr7 (358-514)||(10624093-10624248)
chr7 (415-515)||(34594242-34594342)
chr7 (358-515)||(24470698-24470850)
chr7 (358-515)||(24475646-24475798)
chr7 (358-509)||(39707584-39707734)
chr7 (358-515)||(772737-772888)
chr7 (358-515)||(37399892-37400043)
chr7 (358-515)||(46918693-46918844)
chr7 (362-475)||(6622733-6622846)
chr7 (358-515)||(37714773-37714930)
chr7 (395-515)||(6646301-6646421)
chr7 (361-484)||(35141335-35141452)
chr7 (358-514)||(46881502-46881658)
chr7 (556-674)||(38276993-38277105)
chr7 (378-515)||(2532235-2532366)
chr7 (374-515)||(22751696-22751831)
chr7 (358-464)||(38277157-38277263)
chr7 (358-515)||(39090382-39090533)
chr7 (378-495)||(41748216-41748327)
chr7 (358-455)||(14657576-14657673)
chr7 (358-494)||(19895353-19895483)
chr7 (358-515)||(25854881-25855031)
chr7 (358-494)||(37890159-37890289)
chr7 (371-515)||(42490997-42491134)
chr7 (358-515)||(40775561-40775709)
chr7 (416-515)||(43483882-43483981)
chr7 (426-515)||(5024787-5024876)
chr7 (426-515)||(14733797-14733885)
chr7 (451-504)||(27704833-27704886)
chr7 (358-494)||(35134871-35135000)
chr7 (358-494)||(35362777-35362906)
chr7 (358-481)||(7765532-7765656)
chr7 (538-645)||(14657693-14657794)
chr7 (372-515)||(14707876-14708011)
chr7 (362-454)||(15017112-15017204)
chr7 (358-493)||(22379378-22379507)
chr7 (358-460)||(45949360-45949455)
chr7 (589-644)||(6496071-6496126)
chr7 (358-515)||(8611292-8611444)
chr7 (362-453)||(20206157-20206248)
chr7 (441-512)||(26638365-26638436)
chr7 (362-417)||(34871153-34871208)
chr7 (586-676)||(5238100-5238190)
chr7 (358-408)||(32312916-32312966)
chr7 (374-464)||(38338855-38338944)
chr7 (358-515)||(43806819-43806970)
chr7 (358-404)||(48643481-48643527)
chr7 (371-480)||(4028498-4028607)
chr7 (586-675)||(17223281-17223370)
chr7 (358-494)||(23732063-23732192)
chr7 (599-668)||(27050360-27050429)
chr7 (431-515)||(39544776-39544860)
chr7 (358-475)||(39989844-39989963)
chr7 (358-515)||(5436140-5436307)
chr7 (374-489)||(14762352-14762467)
chr7 (601-652)||(25531623-25531674)
chr7 (415-494)||(36350482-36350561)
chr7 (609-668)||(37593274-37593333)
chr7 (374-512)||(17222411-17222546)
chr7 (362-509)||(26771187-26771336)
chr7 (359-464)||(33901983-33902089)
chr7 (426-515)||(6496169-6496257)
chr7 (358-407)||(16273777-16273826)
chr7 (358-461)||(47296027-47296134)
chr7 (438-514)||(17230413-17230489)
chr7 (359-503)||(25308670-25308813)
chr7 (436-488)||(32521774-32521826)
chr7 (371-494)||(35306166-35306289)
chr7 (206-274)||(42604250-42604318)
chr7 (400-484)||(43398687-43398771)
chr7 (589-668)||(37714634-37714713)
chr7 (439-497)||(2407760-2407818)
chr7 (603-652)||(22493205-22493254)
chr7 (358-419)||(24533554-24533615)
chr7 (436-485)||(46339237-46339286)
chr7 (358-406)||(15123672-15123720)
chr7 (363-399)||(17611648-17611684)
chr7 (363-399)||(28407719-28407755)
chr7 (358-414)||(32083623-32083679)
chr7 (358-418)||(33095791-33095851)
chr7 (379-483)||(43451649-43451753)
chr7 (587-675)||(46881327-46881415)
chr7 (606-673)||(9137558-9137625)
chr7 (545-584)||(9934076-9934115)
chr7 (437-480)||(20116769-20116812)
chr7 (437-488)||(21266570-21266621)
chr7 (358-464)||(24698997-24699104)
chr7 (538-668)||(31703363-31703487)
chr7 (439-490)||(34899475-34899526)
chr7 (439-490)||(38798953-38799004)
chr7 (537-584)||(45949513-45949560)
chr7 (358-483)||(8319641-8319760)
chr7 (358-412)||(10037921-10037975)
chr7 (539-644)||(10623977-10624076)
chr7 (437-515)||(25531747-25531825)
chr7 (426-488)||(35261477-35261539)
chr7 (358-395)||(15670465-15670502)
chr7 (426-475)||(17611584-17611633)
chr7 (449-490)||(23274322-23274363)
chr7 (449-490)||(23274404-23274445)
chr7 (449-490)||(23274486-23274527)
chr7 (449-490)||(23274568-23274609)
chr7 (449-490)||(23303794-23303835)
chr7 (96-152)||(24495335-24495392)
chr7 (358-399)||(35133212-35133253)
chr7 (358-399)||(37837254-37837295)
chr7 (358-403)||(40658009-40658054)
chr7 (436-480)||(433536-433580)
chr7 (619-667)||(2843237-2843285)
chr7 (437-485)||(7640621-7640669)
chr7 (363-399)||(9977011-9977047)
chr7 (363-399)||(12141108-12141144)
chr7 (619-667)||(14627875-14627923)
chr7 (436-488)||(17222845-17222897)
chr7 (442-490)||(25255399-25255447)
chr7 (363-399)||(25286989-25287025)
chr7 (363-399)||(28044557-28044593)
chr7 (363-399)||(31481888-31481924)
chr7 (371-399)||(35261554-35261582)
chr7 (537-652)||(39707456-39707564)
chr7 (363-399)||(46700288-46700324)
chr7 (436-488)||(46822195-46822247)
chr7 (363-399)||(48061676-48061712)
[»] chr3 (191 HSPs)
chr3 (358-668)||(13701665-13701975)
chr3 (358-675)||(14585610-14585928)
chr3 (358-675)||(40012935-40013253)
chr3 (358-675)||(49627767-49628076)
chr3 (358-668)||(53155093-53155404)
chr3 (358-675)||(22485113-22485432)
chr3 (358-668)||(48855032-48855343)
chr3 (358-675)||(1074557-1074875)
chr3 (358-673)||(53402771-53403087)
chr3 (358-675)||(36691462-36691780)
chr3 (358-675)||(11819231-11819550)
chr3 (358-675)||(54706395-54706696)
chr3 (364-667)||(39610366-39610667)
chr3 (358-675)||(31270474-31270775)
chr3 (374-673)||(35174858-35175157)
chr3 (358-675)||(33637551-33637860)
chr3 (358-675)||(40883538-40883847)
chr3 (358-675)||(55455014-55455328)
chr3 (374-675)||(54238698-54238999)
chr3 (358-668)||(19645347-19645656)
chr3 (358-675)||(24483359-24483660)
chr3 (371-621)||(4081910-4082161)
chr3 (358-675)||(30155953-30156262)
chr3 (362-675)||(31462422-31462727)
chr3 (358-675)||(48652112-48652421)
chr3 (358-668)||(41867996-41868297)
chr3 (358-675)||(3457087-3457388)
chr3 (358-674)||(32080426-32080734)
chr3 (358-675)||(45047662-45047963)
chr3 (362-661)||(55446219-55446510)
chr3 (358-673)||(105711-106014)
chr3 (358-668)||(48401268-48401558)
chr3 (496-668)||(36624496-36624669)
chr3 (358-584)||(4206222-4206444)
chr3 (362-667)||(34103425-34103720)
chr3 (372-676)||(19860956-19861261)
chr3 (358-602)||(38530162-38530391)
chr3 (374-627)||(4817559-4817810)
chr3 (358-514)||(34960592-34960747)
chr3 (372-571)||(51990558-51990752)
chr3 (358-489)||(2192413-2192544)
chr3 (426-668)||(48401017-48401234)
chr3 (358-515)||(3312736-3312889)
chr3 (358-494)||(55090362-55090498)
chr3 (375-675)||(2147904-2148189)
chr3 (358-509)||(36623926-36624076)
chr3 (537-663)||(27189247-27189373)
chr3 (358-515)||(33977594-33977745)
chr3 (358-515)||(22844346-22844497)
chr3 (374-515)||(28994994-28995129)
chr3 (358-515)||(36540366-36540517)
chr3 (378-515)||(40797327-40797458)
chr3 (358-515)||(50520077-50520228)
chr3 (358-515)||(3961445-3961602)
chr3 (378-515)||(43897238-43897375)
chr3 (358-512)||(43839186-43839334)
chr3 (358-515)||(1165065-1165216)
chr3 (358-471)||(19148328-19148442)
chr3 (358-515)||(20200727-20200878)
chr3 (358-515)||(20202909-20203060)
chr3 (358-515)||(33076579-33076730)
chr3 (358-512)||(41598139-41598293)
chr3 (358-515)||(43029977-43030128)
chr3 (358-666)||(53962275-53962568)
chr3 (359-515)||(22286422-22286571)
chr3 (371-515)||(37051888-37052030)
chr3 (416-515)||(913037-913136)
chr3 (359-515)||(11225640-11225798)
chr3 (358-503)||(4019904-4020043)
chr3 (361-510)||(38379420-38379572)
chr3 (358-500)||(42167724-42167866)
chr3 (358-515)||(21084402-21084558)
chr3 (358-514)||(21803826-21803976)
chr3 (358-485)||(51059994-51060121)
chr3 (358-515)||(1806128-1806279)
chr3 (358-515)||(3088333-3088484)
chr3 (358-515)||(10977537-10977688)
chr3 (358-515)||(29776359-29776510)
chr3 (371-516)||(32237678-32237817)
chr3 (378-514)||(42106433-42106563)
chr3 (358-515)||(46732415-46732572)
chr3 (358-494)||(50981129-50981265)
chr3 (358-494)||(51084263-51084399)
chr3 (358-452)||(25111832-25111926)
chr3 (358-490)||(27831418-27831543)
chr3 (426-515)||(31730921-31731009)
chr3 (358-515)||(44984528-44984685)
chr3 (518-668)||(39429330-39429475)
chr3 (415-494)||(21586214-21586293)
chr3 (361-515)||(25939168-25939316)
chr3 (358-515)||(31550222-31550376)
chr3 (358-515)||(32089600-32089751)
chr3 (378-494)||(40365539-40365650)
chr3 (384-584)||(40702668-40702861)
chr3 (358-483)||(45664547-45664666)
chr3 (374-484)||(51256723-51256832)
chr3 (426-515)||(47587104-47587193)
chr3 (358-494)||(20251972-20252101)
chr3 (374-474)||(40401206-40401306)
chr3 (358-434)||(48212723-48212799)
chr3 (415-515)||(54240380-54240480)
chr3 (358-515)||(2598372-2598522)
chr3 (586-649)||(3312618-3312681)
chr3 (373-512)||(25084321-25084460)
chr3 (616-675)||(37451886-37451945)
chr3 (428-515)||(50460484-50460571)
chr3 (358-515)||(11846842-11846993)
chr3 (358-464)||(28929197-28929303)
chr3 (374-515)||(29182295-29182430)
chr3 (586-668)||(47733769-47733851)
chr3 (371-464)||(7869129-7869222)
chr3 (374-470)||(46926743-46926833)
chr3 (538-662)||(48212501-48212619)
chr3 (371-458)||(7658361-7658449)
chr3 (426-494)||(25373825-25373893)
chr3 (546-598)||(34960754-34960806)
chr3 (426-494)||(40716561-40716629)
chr3 (415-515)||(47914313-47914413)
chr3 (358-449)||(2522742-2522833)
chr3 (358-584)||(39340432-39340640)
chr3 (374-420)||(47733447-47733493)
chr3 (544-644)||(31730823-31730917)
chr3 (358-494)||(33794072-33794202)
chr3 (358-510)||(33937078-33937226)
chr3 (598-658)||(3961666-3961726)
chr3 (426-482)||(22893445-22893501)
chr3 (363-406)||(23799749-23799792)
chr3 (445-488)||(26318807-26318850)
chr3 (538-584)||(4019831-4019877)
chr3 (374-475)||(14740379-14740474)
chr3 (426-512)||(25135057-25135143)
chr3 (358-412)||(27189117-27189171)
chr3 (436-490)||(50194200-50194254)
chr3 (358-415)||(30293187-30293244)
chr3 (436-488)||(25631371-25631423)
chr3 (616-668)||(32408732-32408784)
chr3 (598-646)||(38528664-38528712)
chr3 (363-399)||(46304322-46304358)
chr3 (448-500)||(48212637-48212689)
chr3 (586-649)||(566322-566385)
chr3 (617-648)||(5327396-5327427)
chr3 (358-397)||(7448710-7448749)
chr3 (358-397)||(7456852-7456891)
chr3 (601-644)||(20044755-20044798)
chr3 (426-485)||(30648554-30648613)
chr3 (359-418)||(32408549-32408608)
chr3 (537-584)||(53427031-53427078)
chr3 (632-675)||(55090521-55090564)
chr3 (538-584)||(21084573-21084619)
chr3 (374-408)||(31731412-31731446)
chr3 (439-493)||(35501503-35501557)
chr3 (624-674)||(40716384-40716434)
chr3 (598-652)||(42167917-42167971)
chr3 (436-490)||(43017057-43017111)
chr3 (598-668)||(50637870-50637940)
chr3 (109-154)||(51490230-51490276)
chr3 (516-584)||(26412523-26412592)
chr3 (374-415)||(28876861-28876902)
chr3 (618-667)||(32607499-32607548)
chr3 (358-406)||(34767375-34767424)
chr3 (358-407)||(40461661-40461710)
chr3 (599-652)||(48822245-48822298)
chr3 (374-415)||(51742192-51742233)
chr3 (362-399)||(54149242-54149279)
chr3 (374-418)||(534393-534437)
chr3 (426-490)||(4711651-4711715)
chr3 (363-399)||(9998718-9998754)
chr3 (363-399)||(10108487-10108523)
chr3 (363-399)||(10233321-10233357)
chr3 (619-667)||(12116128-12116176)
chr3 (436-488)||(12116275-12116327)
chr3 (371-399)||(20464774-20464802)
chr3 (363-399)||(24396300-24396336)
chr3 (538-578)||(25084263-25084303)
chr3 (535-571)||(25849913-25849949)
chr3 (436-480)||(32607654-32607698)
chr3 (358-414)||(33070537-33070593)
chr3 (363-399)||(35175654-35175690)
chr3 (619-667)||(35499194-35499242)
chr3 (363-399)||(35864762-35864798)
chr3 (539-571)||(36734631-36734663)
chr3 (436-488)||(36906299-36906351)
chr3 (363-399)||(36910567-36910603)
chr3 (363-399)||(37041019-37041055)
chr3 (438-490)||(38859979-38860031)
chr3 (436-480)||(39917243-39917287)
chr3 (363-399)||(41818477-41818513)
chr3 (363-399)||(43017139-43017175)
chr3 (363-399)||(45568246-45568282)
chr3 (363-399)||(52922918-52922954)
chr3 (358-394)||(54240482-54240518)
[»] chr5 (167 HSPs)
chr5 (358-667)||(17095896-17096206)
chr5 (358-676)||(20483333-20483652)
chr5 (358-667)||(6635404-6635714)
chr5 (358-675)||(17331476-17331794)
chr5 (362-675)||(6281192-6281506)
chr5 (358-674)||(7771476-7771793)
chr5 (358-675)||(17699701-17700019)
chr5 (358-668)||(177759-178069)
chr5 (371-668)||(2555018-2555316)
chr5 (358-675)||(34431208-34431530)
chr5 (358-675)||(17732042-17732359)
chr5 (358-675)||(18653930-18654248)
chr5 (358-668)||(33164124-33164434)
chr5 (382-667)||(980705-980994)
chr5 (358-668)||(23881771-23882082)
chr5 (362-675)||(32347382-32347687)
chr5 (395-675)||(42609292-42609573)
chr5 (358-668)||(6681532-6681842)
chr5 (358-675)||(39531063-39531383)
chr5 (358-667)||(26294729-26295022)
chr5 (358-673)||(42396165-42396483)
chr5 (362-673)||(28040779-28041091)
chr5 (431-668)||(3079062-3079300)
chr5 (358-668)||(39179500-39179794)
chr5 (358-675)||(11734500-11734792)
chr5 (392-675)||(23428400-23428675)
chr5 (358-580)||(26293853-26294076)
chr5 (366-668)||(29097944-29098238)
chr5 (358-675)||(27241212-27241521)
chr5 (358-675)||(3740505-3740798)
chr5 (362-673)||(25962069-25962366)
chr5 (358-506)||(32309814-32309962)
chr5 (358-515)||(42505068-42505223)
chr5 (358-584)||(41554720-41554932)
chr5 (358-514)||(37219298-37219447)
chr5 (371-515)||(40564839-40564977)
chr5 (545-668)||(11858065-11858186)
chr5 (540-668)||(12439501-12439629)
chr5 (358-485)||(42781340-42781467)
chr5 (362-584)||(33486242-33486450)
chr5 (362-512)||(12439354-12439498)
chr5 (358-650)||(7150984-7151262)
chr5 (358-515)||(31646123-31646274)
chr5 (358-515)||(13161654-13161811)
chr5 (358-584)||(14910345-14910557)
chr5 (358-584)||(18472395-18472607)
chr5 (555-675)||(43494008-43494128)
chr5 (358-515)||(6074405-6074556)
chr5 (358-515)||(34844210-34844361)
chr5 (426-512)||(43494186-43494272)
chr5 (358-499)||(6012716-6012857)
chr5 (358-515)||(10923803-10923954)
chr5 (372-515)||(20145902-20146039)
chr5 (358-584)||(40774994-40775206)
chr5 (358-515)||(5378596-5378747)
chr5 (358-515)||(6886847-6886998)
chr5 (445-562)||(12891895-12892013)
chr5 (358-491)||(17218042-17218168)
chr5 (358-515)||(28618896-28619047)
chr5 (371-515)||(29310036-29310174)
chr5 (358-515)||(17325333-17325482)
chr5 (358-504)||(19645706-19645845)
chr5 (358-515)||(20271008-20271160)
chr5 (374-515)||(8811837-8811972)
chr5 (374-515)||(28500983-28501118)
chr5 (358-515)||(28662364-28662515)
chr5 (374-515)||(31254942-31255084)
chr5 (358-483)||(37425448-37425567)
chr5 (538-674)||(17687354-17687484)
chr5 (372-515)||(8957500-8957637)
chr5 (595-675)||(12891824-12891904)
chr5 (358-482)||(6639321-6639447)
chr5 (515-644)||(35402214-35402342)
chr5 (589-668)||(39915648-39915727)
chr5 (374-515)||(3495140-3495275)
chr5 (358-515)||(32387758-32387909)
chr5 (359-515)||(39532008-39532161)
chr5 (358-515)||(6647578-6647733)
chr5 (358-494)||(15710859-15710989)
chr5 (358-515)||(35906563-35906714)
chr5 (358-566)||(2415651-2415847)
chr5 (359-515)||(39415923-39416078)
chr5 (358-465)||(41358378-41358479)
chr5 (359-510)||(39530817-39530967)
chr5 (374-512)||(39591345-39591477)
chr5 (539-668)||(12215288-12215410)
chr5 (545-666)||(35275835-35275950)
chr5 (358-455)||(17687504-17687601)
chr5 (358-475)||(26905304-26905421)
chr5 (362-486)||(586081-586202)
chr5 (358-414)||(9196686-9196742)
chr5 (358-506)||(11647502-11647650)
chr5 (358-494)||(29154535-29154665)
chr5 (358-515)||(4070845-4070995)
chr5 (374-494)||(41383745-41383867)
chr5 (375-512)||(14535195-14535332)
chr5 (358-490)||(39308422-39308546)
chr5 (436-512)||(12524405-12524481)
chr5 (601-668)||(17523421-17523488)
chr5 (374-489)||(17566141-17566256)
chr5 (616-675)||(18573467-18573526)
chr5 (426-485)||(26240416-26240475)
chr5 (358-494)||(32390326-32390463)
chr5 (392-460)||(11858192-11858257)
chr5 (436-486)||(11976800-11976850)
chr5 (538-675)||(14535046-14535177)
chr5 (371-475)||(24288641-24288737)
chr5 (371-475)||(24373485-24373581)
chr5 (358-512)||(25770903-25771055)
chr5 (537-666)||(32309321-32309444)
chr5 (358-494)||(34866746-34866877)
chr5 (362-512)||(40268317-40268467)
chr5 (371-484)||(39558171-39558284)
chr5 (373-515)||(9034629-9034762)
chr5 (426-485)||(15571092-15571151)
chr5 (358-413)||(19200251-19200306)
chr5 (417-475)||(37425351-37425409)
chr5 (362-475)||(374596-374709)
chr5 (358-403)||(4726672-4726717)
chr5 (516-584)||(4726740-4726809)
chr5 (358-399)||(11867905-11867946)
chr5 (619-668)||(25487763-25487812)
chr5 (358-415)||(29663030-29663087)
chr5 (586-675)||(42512867-42512956)
chr5 (436-488)||(4954174-4954226)
chr5 (363-399)||(13007480-13007516)
chr5 (358-499)||(17067442-17067587)
chr5 (378-474)||(19335745-19335841)
chr5 (437-485)||(20257542-20257590)
chr5 (358-460)||(33999951-34000057)
chr5 (540-584)||(34874094-34874138)
chr5 (436-488)||(43148909-43148961)
chr5 (363-406)||(4771100-4771143)
chr5 (363-406)||(8096300-8096343)
chr5 (385-460)||(13677415-13677490)
chr5 (374-485)||(32755427-32755536)
chr5 (601-644)||(34906332-34906375)
chr5 (358-515)||(9406407-9406562)
chr5 (436-486)||(13422106-13422156)
chr5 (586-668)||(26905521-26905603)
chr5 (426-488)||(34881899-34881961)
chr5 (388-454)||(35275749-35275815)
chr5 (587-652)||(374453-374518)
chr5 (439-488)||(2979174-2979223)
chr5 (402-510)||(12215431-12215540)
chr5 (415-484)||(15710036-15710104)
chr5 (358-415)||(16575167-16575224)
chr5 (437-490)||(16758708-16758761)
chr5 (436-497)||(24874691-24874752)
chr5 (358-403)||(28423705-28423750)
chr5 (441-490)||(41630671-41630720)
chr5 (619-667)||(2057834-2057882)
chr5 (363-399)||(6011939-6011975)
chr5 (436-488)||(7241966-7242018)
chr5 (436-488)||(7247141-7247193)
chr5 (363-399)||(8984790-8984826)
chr5 (363-399)||(9113526-9113562)
chr5 (358-398)||(13677511-13677551)
chr5 (436-488)||(18677310-18677362)
chr5 (363-399)||(24229585-24229621)
chr5 (617-673)||(26240593-26240649)
chr5 (363-399)||(26877910-26877946)
chr5 (619-667)||(27266855-27266903)
chr5 (619-667)||(34881753-34881801)
chr5 (371-399)||(38598048-38598076)
chr5 (601-641)||(39531636-39531676)
chr5 (436-488)||(41184285-41184337)
[»] chr2 (205 HSPs)
chr2 (358-668)||(12890772-12891084)
chr2 (358-674)||(35333654-35333971)
chr2 (358-668)||(33012203-33012514)
chr2 (358-667)||(13878664-13878974)
chr2 (358-667)||(14018789-14019099)
chr2 (358-674)||(20560788-20561104)
chr2 (358-658)||(44942451-44942752)
chr2 (358-673)||(36868158-36868474)
chr2 (358-675)||(5754436-5754748)
chr2 (358-675)||(38534960-38535278)
chr2 (358-668)||(31908472-31908782)
chr2 (358-641)||(34416418-34416702)
chr2 (358-674)||(12704836-12705152)
chr2 (358-675)||(28230752-28231070)
chr2 (362-652)||(4739500-4739791)
chr2 (358-675)||(29542940-29543259)
chr2 (358-674)||(9689640-9689957)
chr2 (358-675)||(43696016-43696334)
chr2 (361-668)||(32015408-32015716)
chr2 (362-675)||(43473804-43474101)
chr2 (358-673)||(17267781-17268097)
chr2 (358-675)||(41797742-41798060)
chr2 (358-675)||(9978333-9978642)
chr2 (358-675)||(11937521-11937831)
chr2 (358-675)||(4426314-4426631)
chr2 (358-675)||(32314590-32314891)
chr2 (385-675)||(22597283-22597575)
chr2 (362-607)||(11942584-11942830)
chr2 (358-675)||(28261560-28261861)
chr2 (358-675)||(34471114-34471422)
chr2 (360-675)||(4732218-4732526)
chr2 (358-668)||(27095861-27096155)
chr2 (359-675)||(10286670-10286980)
chr2 (358-658)||(18089067-18089353)
chr2 (358-675)||(25068000-25068307)
chr2 (358-675)||(38384121-38384430)
chr2 (358-675)||(13740309-13740633)
chr2 (362-674)||(4603975-4604279)
chr2 (358-579)||(16136322-16136544)
chr2 (360-668)||(11798195-11798489)
chr2 (358-668)||(15920030-15920319)
chr2 (452-675)||(34962818-34963049)
chr2 (360-584)||(37883886-37884096)
chr2 (360-675)||(17767227-17767533)
chr2 (397-675)||(6431112-6431375)
chr2 (544-675)||(7072790-7072921)
chr2 (371-515)||(5071052-5071190)
chr2 (358-515)||(4878403-4878556)
chr2 (358-494)||(34962650-34962786)
chr2 (358-512)||(41177155-41177303)
chr2 (371-515)||(3397661-3397799)
chr2 (358-515)||(4703440-4703597)
chr2 (372-515)||(35353934-35354071)
chr2 (374-490)||(44589206-44589322)
chr2 (358-515)||(30933542-30933692)
chr2 (358-507)||(106557-106707)
chr2 (374-515)||(2251033-2251167)
chr2 (358-515)||(11931166-11931317)
chr2 (361-515)||(17792767-17792920)
chr2 (358-515)||(25622713-25622864)
chr2 (358-483)||(40038978-40039103)
chr2 (358-515)||(43567167-43567317)
chr2 (358-584)||(26491534-26491746)
chr2 (360-515)||(20570267-20570422)
chr2 (358-515)||(3603279-3603430)
chr2 (358-515)||(25771739-25771890)
chr2 (358-515)||(27665844-27666002)
chr2 (358-584)||(15673633-15673849)
chr2 (362-513)||(12366164-12366309)
chr2 (359-490)||(25237001-25237126)
chr2 (358-515)||(40125681-40125830)
chr2 (374-515)||(43928985-43929120)
chr2 (358-515)||(44167381-44167531)
chr2 (358-510)||(13548574-13548727)
chr2 (358-515)||(31811871-31812034)
chr2 (358-494)||(6090204-6090334)
chr2 (443-515)||(7072714-7072786)
chr2 (371-494)||(9715226-9715343)
chr2 (359-494)||(13268887-13269016)
chr2 (373-515)||(31125063-31125199)
chr2 (358-515)||(3465223-3465374)
chr2 (358-456)||(3527354-3527452)
chr2 (358-452)||(7071430-7071523)
chr2 (378-512)||(11561362-11561496)
chr2 (358-515)||(27023808-27023959)
chr2 (358-515)||(27191002-27191153)
chr2 (358-515)||(27840816-27840967)
chr2 (358-494)||(3390738-3390868)
chr2 (410-515)||(7640071-7640176)
chr2 (438-581)||(8027747-8027882)
chr2 (382-652)||(11580824-11581080)
chr2 (358-474)||(13113361-13113477)
chr2 (358-584)||(19580671-19580883)
chr2 (415-515)||(36508223-36508323)
chr2 (415-515)||(38822366-38822466)
chr2 (358-515)||(16570646-16570799)
chr2 (358-515)||(18141150-18141301)
chr2 (358-480)||(32711882-32712004)
chr2 (358-515)||(34480259-34480410)
chr2 (358-494)||(19953853-19953983)
chr2 (385-493)||(45693792-45693900)
chr2 (358-515)||(9207025-9207176)
chr2 (437-515)||(10589389-10589467)
chr2 (586-652)||(20124653-20124719)
chr2 (371-481)||(27666510-27666620)
chr2 (374-484)||(33839068-33839178)
chr2 (358-494)||(44441694-44441824)
chr2 (358-513)||(5930719-5930868)
chr2 (360-515)||(23256302-23256450)
chr2 (439-515)||(25516786-25516862)
chr2 (359-515)||(31271670-31271826)
chr2 (589-668)||(823845-823924)
chr2 (371-513)||(5172091-5172232)
chr2 (359-464)||(12183006-12183105)
chr2 (358-428)||(16379763-16379833)
chr2 (416-584)||(29734423-29734587)
chr2 (617-674)||(27666359-27666416)
chr2 (521-675)||(11426791-11426940)
chr2 (371-515)||(19904802-19904942)
chr2 (601-652)||(26254835-26254886)
chr2 (534-652)||(45694284-45694396)
chr2 (358-515)||(8064457-8064607)
chr2 (598-668)||(40039204-40039274)
chr2 (382-483)||(4615265-4615366)
chr2 (358-407)||(11550335-11550384)
chr2 (438-515)||(17056212-17056289)
chr2 (438-515)||(17068659-17068736)
chr2 (438-515)||(17095229-17095306)
chr2 (438-515)||(17118557-17118634)
chr2 (359-515)||(45035278-45035428)
chr2 (358-673)||(7581762-7582058)
chr2 (598-649)||(13548797-13548848)
chr2 (359-414)||(17304188-17304243)
chr2 (439-490)||(36692054-36692105)
chr2 (436-494)||(20036697-20036755)
chr2 (519-572)||(29812430-29812484)
chr2 (401-475)||(38233903-38233977)
chr2 (383-496)||(6510787-6510900)
chr2 (598-675)||(11561568-11561644)
chr2 (374-415)||(15786254-15786295)
chr2 (616-653)||(20598581-20598618)
chr2 (358-403)||(25516924-25516969)
chr2 (437-494)||(31262695-31262752)
chr2 (437-490)||(32448483-32448536)
chr2 (436-481)||(36234189-36234234)
chr2 (374-414)||(13547196-13547236)
chr2 (436-480)||(14955719-14955763)
chr2 (382-450)||(20607133-20607201)
chr2 (616-652)||(20607228-20607264)
chr2 (436-488)||(27248996-27249048)
chr2 (436-488)||(30420853-30420905)
chr2 (363-399)||(37876408-37876444)
chr2 (436-488)||(40659777-40659829)
chr2 (436-479)||(6174009-6174052)
chr2 (581-668)||(6510637-6510724)
chr2 (439-490)||(9169127-9169178)
chr2 (358-417)||(14826310-14826368)
chr2 (439-490)||(18763648-18763699)
chr2 (601-652)||(19904679-19904730)
chr2 (537-623)||(20570173-20570253)
chr2 (537-584)||(34480198-34480245)
chr2 (610-652)||(8781723-8781765)
chr2 (436-490)||(8806048-8806102)
chr2 (534-584)||(11550426-11550476)
chr2 (587-665)||(12994098-12994175)
chr2 (616-650)||(15261327-15261361)
chr2 (358-416)||(28228609-28228667)
chr2 (388-482)||(29938613-29938707)
chr2 (536-570)||(37614061-37614095)
chr2 (617-675)||(44149956-44150014)
chr2 (440-482)||(45134254-45134296)
chr2 (599-668)||(2550325-2550394)
chr2 (539-584)||(2763364-2763409)
chr2 (436-485)||(4228310-4228359)
chr2 (587-668)||(8531447-8531528)
chr2 (436-485)||(9986187-9986236)
chr2 (358-399)||(11985030-11985071)
chr2 (371-408)||(15261123-15261160)
chr2 (358-515)||(17054720-17054875)
chr2 (436-485)||(17319507-17319556)
chr2 (437-490)||(25508935-25508988)
chr2 (470-515)||(38450535-38450580)
chr2 (462-515)||(43711654-43711707)
chr2 (436-488)||(84026-84078)
chr2 (456-488)||(2278793-2278825)
chr2 (363-399)||(4903947-4903983)
chr2 (375-475)||(5369039-5369139)
chr2 (363-399)||(5427671-5427707)
chr2 (358-398)||(8809544-8809584)
chr2 (534-582)||(13268807-13268855)
chr2 (106-157)||(15988899-15988951)
chr2 (438-494)||(17074642-17074698)
chr2 (363-399)||(25508870-25508906)
chr2 (619-667)||(27249147-27249195)
chr2 (436-480)||(29173583-29173627)
chr2 (371-399)||(30923267-30923295)
chr2 (363-399)||(31193138-31193174)
chr2 (363-399)||(31788718-31788754)
chr2 (436-488)||(32913424-32913476)
chr2 (436-488)||(34600398-34600450)
chr2 (371-399)||(35220590-35220618)
chr2 (619-667)||(36234045-36234093)
chr2 (363-399)||(37994545-37994581)
chr2 (363-399)||(38445428-38445464)
chr2 (363-395)||(41328005-41328037)
[»] chr6 (101 HSPs)
chr6 (358-675)||(31705313-31705631)
chr6 (358-676)||(23654397-23654715)
chr6 (358-668)||(23101063-23101374)
chr6 (362-668)||(2304497-2304804)
chr6 (358-668)||(35219568-35219879)
chr6 (366-674)||(4393919-4394228)
chr6 (358-668)||(8693326-8693620)
chr6 (358-668)||(1106518-1106833)
chr6 (358-668)||(15589780-15590074)
chr6 (358-675)||(6295904-6296222)
chr6 (358-675)||(6302714-6303032)
chr6 (358-667)||(23637777-23638085)
chr6 (358-675)||(12481034-12481343)
chr6 (358-668)||(21507509-21507803)
chr6 (371-675)||(13871294-13871593)
chr6 (362-647)||(29920576-29920862)
chr6 (358-675)||(14782810-14783115)
chr6 (463-675)||(31937180-31937393)
chr6 (358-562)||(19402507-19402712)
chr6 (358-622)||(30813267-30813523)
chr6 (358-658)||(12653973-12654259)
chr6 (449-675)||(6419604-6419831)
chr6 (358-512)||(4660740-4660894)
chr6 (358-652)||(2488308-2488588)
chr6 (359-673)||(4921564-4921852)
chr6 (358-584)||(10744815-10745027)
chr6 (374-515)||(31748251-31748386)
chr6 (371-515)||(34020897-34021035)
chr6 (358-584)||(20496426-20496638)
chr6 (358-515)||(8978411-8978568)
chr6 (358-471)||(31936288-31936401)
chr6 (358-513)||(4663489-4663638)
chr6 (595-667)||(19402703-19402775)
chr6 (358-515)||(8644522-8644673)
chr6 (358-450)||(5146300-5146392)
chr6 (359-512)||(14730917-14731070)
chr6 (358-515)||(23843093-23843244)
chr6 (358-485)||(5527303-5527422)
chr6 (358-494)||(548541-548671)
chr6 (358-486)||(6127855-6127983)
chr6 (371-515)||(15469929-15470068)
chr6 (358-515)||(20845302-20845458)
chr6 (358-515)||(5416894-5417044)
chr6 (358-515)||(13233777-13233928)
chr6 (382-512)||(16328769-16328899)
chr6 (371-515)||(16913619-16913760)
chr6 (362-494)||(28943579-28943710)
chr6 (358-441)||(4085059-4085142)
chr6 (362-433)||(6419538-6419609)
chr6 (358-472)||(21942096-21942210)
chr6 (374-515)||(33541216-33541351)
chr6 (371-515)||(8632878-8633016)
chr6 (358-486)||(9043785-9043913)
chr6 (601-668)||(1915085-1915152)
chr6 (392-515)||(3359053-3359176)
chr6 (426-668)||(29284908-29285132)
chr6 (374-488)||(31680756-31680871)
chr6 (358-515)||(19760082-19760233)
chr6 (410-484)||(35039016-35039090)
chr6 (358-415)||(5545068-5545125)
chr6 (400-512)||(7870451-7870563)
chr6 (358-495)||(31804530-31804659)
chr6 (382-484)||(3610044-3610146)
chr6 (374-509)||(7076824-7076961)
chr6 (358-484)||(15985633-15985758)
chr6 (378-515)||(20028391-20028527)
chr6 (358-485)||(892608-892729)
chr6 (394-461)||(1418807-1418875)
chr6 (371-515)||(15176100-15176239)
chr6 (371-515)||(15127811-15127950)
chr6 (586-647)||(1418981-1419042)
chr6 (587-652)||(3610230-3610295)
chr6 (587-652)||(5527510-5527575)
chr6 (618-675)||(15175958-15176015)
chr6 (385-485)||(31395574-31395674)
chr6 (426-515)||(32804589-32804677)
chr6 (426-490)||(7976042-7976106)
chr6 (436-488)||(12653124-12653176)
chr6 (377-485)||(18248756-18248864)
chr6 (436-488)||(28634958-28635010)
chr6 (363-399)||(33052969-33053005)
chr6 (534-657)||(12156302-12156419)
chr6 (393-508)||(12343499-12343613)
chr6 (437-488)||(17334933-17334984)
chr6 (358-408)||(1944455-1944505)
chr6 (598-652)||(8508299-8508353)
chr6 (618-652)||(15470153-15470187)
chr6 (436-485)||(12059618-12059667)
chr6 (382-475)||(16352228-16352321)
chr6 (436-485)||(25064419-25064468)
chr6 (426-494)||(904583-904651)
chr6 (589-645)||(3358949-3359005)
chr6 (363-399)||(3913375-3913411)
chr6 (436-488)||(8497148-8497200)
chr6 (363-399)||(11321345-11321381)
chr6 (363-399)||(12170721-12170757)
chr6 (601-645)||(16328967-16329011)
chr6 (436-488)||(23947162-23947214)
chr6 (363-399)||(31297072-31297108)
chr6 (363-399)||(32327021-32327057)
chr6 (436-488)||(35001770-35001822)
[»] chr1 (181 HSPs)
chr1 (358-675)||(15390907-15391225)
chr1 (358-675)||(44517295-44517614)
chr1 (358-674)||(28677794-28678102)
chr1 (362-675)||(14265432-14265745)
chr1 (358-675)||(42276503-42276821)
chr1 (358-669)||(32784233-32784545)
chr1 (358-668)||(13488191-13488502)
chr1 (378-667)||(45193303-45193593)
chr1 (358-668)||(45750633-45750944)
chr1 (374-675)||(27534845-27535147)
chr1 (358-673)||(3232938-3233237)
chr1 (358-675)||(29205433-29205734)
chr1 (405-675)||(29726299-29726570)
chr1 (358-674)||(33486691-33487002)
chr1 (358-675)||(4882032-4882332)
chr1 (362-668)||(51418139-51418446)
chr1 (358-675)||(10627148-10627471)
chr1 (371-675)||(7995247-7995533)
chr1 (358-668)||(37822018-37822311)
chr1 (364-673)||(423953-424262)
chr1 (358-652)||(15790931-15791225)
chr1 (358-675)||(32878856-32879159)
chr1 (358-668)||(18343768-18344063)
chr1 (358-668)||(42491048-42491335)
chr1 (358-675)||(12871769-12872072)
chr1 (393-675)||(47551243-47551511)
chr1 (358-668)||(9298086-9298382)
chr1 (358-528)||(17347873-17348041)
chr1 (412-674)||(4870751-4871005)
chr1 (358-515)||(25032758-25032915)
chr1 (358-627)||(13152636-13152893)
chr1 (371-515)||(34566975-34567113)
chr1 (358-584)||(15276115-15276327)
chr1 (358-584)||(44513671-44513883)
chr1 (358-667)||(10304734-10305029)
chr1 (371-475)||(33938712-33938816)
chr1 (358-584)||(46589381-46589593)
chr1 (358-515)||(2350916-2351066)
chr1 (374-515)||(13691448-13691583)
chr1 (515-668)||(33938825-33938979)
chr1 (358-494)||(13969309-13969439)
chr1 (358-515)||(33703179-33703330)
chr1 (358-584)||(12147717-12147929)
chr1 (401-515)||(15312325-15312439)
chr1 (575-673)||(17347747-17347845)
chr1 (358-515)||(33177267-33177418)
chr1 (358-515)||(44562418-44562569)
chr1 (358-515)||(38646878-38647029)
chr1 (358-442)||(16140993-16141077)
chr1 (358-584)||(12967402-12967613)
chr1 (358-515)||(8893586-8893737)
chr1 (374-515)||(10599173-10599314)
chr1 (358-515)||(49652129-49652280)
chr1 (358-514)||(11121271-11121421)
chr1 (358-515)||(11877117-11877274)
chr1 (416-513)||(20413094-20413191)
chr1 (358-515)||(38644466-38644617)
chr1 (445-675)||(28399086-28399302)
chr1 (358-668)||(50107584-50107881)
chr1 (371-584)||(52839763-52839962)
chr1 (358-515)||(6212583-6212734)
chr1 (358-515)||(26771400-26771551)
chr1 (538-673)||(29938388-29938516)
chr1 (358-493)||(34659310-34659439)
chr1 (362-515)||(630457-630604)
chr1 (358-515)||(22344581-22344732)
chr1 (358-515)||(23257382-23257533)
chr1 (371-512)||(36621648-36621783)
chr1 (437-644)||(40862568-40862761)
chr1 (358-463)||(25689508-25689613)
chr1 (358-515)||(37662650-37662797)
chr1 (358-499)||(48003522-48003662)
chr1 (374-513)||(29551436-29551576)
chr1 (609-668)||(20411727-20411786)
chr1 (428-515)||(21326767-21326854)
chr1 (374-512)||(40992595-40992727)
chr1 (426-515)||(1768221-1768309)
chr1 (362-482)||(5844458-5844572)
chr1 (358-483)||(10782751-10782876)
chr1 (371-515)||(45659308-45659446)
chr1 (537-668)||(26097846-26097971)
chr1 (362-474)||(29938550-29938662)
chr1 (399-490)||(6788175-6788266)
chr1 (589-652)||(8737521-8737584)
chr1 (358-485)||(13999281-13999407)
chr1 (358-515)||(15698492-15698643)
chr1 (358-515)||(26199874-26200025)
chr1 (371-488)||(2597249-2597366)
chr1 (358-483)||(32301664-32301788)
chr1 (358-485)||(900376-900496)
chr1 (586-658)||(13869802-13869874)
chr1 (359-490)||(28213372-28213497)
chr1 (603-675)||(32301486-32301558)
chr1 (361-580)||(27469380-27469585)
chr1 (358-492)||(16574753-16574887)
chr1 (373-515)||(23791288-23791424)
chr1 (358-515)||(10877641-10877792)
chr1 (358-463)||(12537881-12537985)
chr1 (358-483)||(30678581-30678705)
chr1 (358-515)||(43504112-43504263)
chr1 (359-486)||(26097689-26097815)
chr1 (359-406)||(28666476-28666523)
chr1 (358-512)||(2486212-2486366)
chr1 (358-416)||(22031771-22031829)
chr1 (360-582)||(25278508-25278715)
chr1 (358-494)||(30853616-30853745)
chr1 (426-515)||(33125543-33125632)
chr1 (553-652)||(29802797-29802890)
chr1 (372-416)||(32538888-32538932)
chr1 (403-515)||(38783361-38783473)
chr1 (415-515)||(47392430-47392530)
chr1 (436-488)||(50165944-50165996)
chr1 (436-488)||(50271985-50272037)
chr1 (358-433)||(10188545-10188620)
chr1 (586-657)||(13999132-13999203)
chr1 (358-494)||(14716945-14717071)
chr1 (586-649)||(24114563-24114626)
chr1 (439-490)||(34878146-34878197)
chr1 (587-674)||(38783216-38783303)
chr1 (358-473)||(46930423-46930537)
chr1 (538-584)||(13969475-13969521)
chr1 (567-613)||(20413051-20413097)
chr1 (586-652)||(45425359-45425425)
chr1 (437-493)||(8224490-8224544)
chr1 (358-515)||(8737827-8737983)
chr1 (358-403)||(8758062-8758107)
chr1 (601-674)||(25032987-25033060)
chr1 (601-650)||(31427049-31427098)
chr1 (539-584)||(33177434-33177479)
chr1 (358-418)||(1141084-1141144)
chr1 (436-488)||(5701443-5701495)
chr1 (426-490)||(7836651-7836715)
chr1 (539-646)||(25689684-25689785)
chr1 (363-399)||(26535591-26535627)
chr1 (363-399)||(27456744-27456780)
chr1 (517-584)||(37684903-37684971)
chr1 (517-584)||(37700546-37700614)
chr1 (598-666)||(39080811-39080879)
chr1 (619-667)||(40646707-40646755)
chr1 (404-471)||(12370292-12370359)
chr1 (439-490)||(13144680-13144731)
chr1 (437-488)||(27872921-27872972)
chr1 (439-490)||(36775578-36775629)
chr1 (363-398)||(51373659-51373694)
chr1 (586-652)||(2513484-2513550)
chr1 (534-584)||(13691594-13691644)
chr1 (436-490)||(24583123-24583177)
chr1 (360-418)||(28399013-28399071)
chr1 (601-663)||(29551648-29551710)
chr1 (436-490)||(32679006-32679060)
chr1 (374-464)||(33144827-33144917)
chr1 (449-515)||(34039329-34039395)
chr1 (436-486)||(38520380-38520430)
chr1 (438-480)||(41081551-41081593)
chr1 (436-490)||(44543445-44543499)
chr1 (436-490)||(47133076-47133130)
chr1 (516-584)||(5832467-5832536)
chr1 (371-400)||(5856160-5856189)
chr1 (437-474)||(7421077-7421114)
chr1 (616-657)||(10188789-10188830)
chr1 (449-510)||(15575805-15575866)
chr1 (437-490)||(19061082-19061135)
chr1 (371-490)||(31919162-31919277)
chr1 (436-488)||(7997973-7998025)
chr1 (536-584)||(8743968-8744016)
chr1 (616-668)||(8937785-8937837)
chr1 (436-480)||(11454129-11454173)
chr1 (363-399)||(11462283-11462319)
chr1 (436-480)||(11709552-11709596)
chr1 (619-667)||(19715891-19715939)
chr1 (363-399)||(21947419-21947455)
chr1 (439-499)||(27579996-27580056)
chr1 (586-646)||(29069725-29069785)
chr1 (363-399)||(35484192-35484228)
chr1 (363-399)||(36894209-36894245)
chr1 (442-486)||(41740552-41740596)
chr1 (371-399)||(44915894-44915922)
chr1 (436-512)||(45425223-45425299)
chr1 (363-399)||(47133157-47133193)
chr1 (619-667)||(50148407-50148455)
chr1 (436-488)||(51868490-51868542)
[»] chr4 (212 HSPs)
chr4 (358-673)||(393929-394245)
chr4 (358-675)||(43244036-43244354)
chr4 (358-675)||(45350725-45351043)
chr4 (358-675)||(45360204-45360522)
chr4 (358-675)||(7083476-7083789)
chr4 (358-662)||(42197714-42198019)
chr4 (371-675)||(20399570-20399876)
chr4 (359-668)||(31522101-31522411)
chr4 (358-674)||(20887412-20887728)
chr4 (358-663)||(39837755-39838060)
chr4 (358-675)||(6911828-6912146)
chr4 (358-674)||(11209968-11210285)
chr4 (358-668)||(626214-626516)
chr4 (371-667)||(32616527-32616824)
chr4 (358-675)||(44756694-44757015)
chr4 (359-675)||(38943813-38944121)
chr4 (358-663)||(8517114-8517417)
chr4 (358-675)||(7060471-7060780)
chr4 (358-673)||(13965710-13966009)
chr4 (358-668)||(36124012-36124314)
chr4 (362-675)||(30202186-30202500)
chr4 (358-675)||(19745537-19745856)
chr4 (358-675)||(19793950-19794269)
chr4 (371-675)||(24568383-24568686)
chr4 (384-675)||(22757242-22757524)
chr4 (358-675)||(25658315-25658627)
chr4 (358-657)||(24100306-24100599)
chr4 (358-675)||(477676-477985)
chr4 (358-675)||(39523557-39523873)
chr4 (362-673)||(24611457-24611770)
chr4 (358-675)||(26742127-26742436)
chr4 (358-675)||(51152272-51152580)
chr4 (362-673)||(6882106-6882406)
chr4 (378-676)||(26674519-26674809)
chr4 (358-675)||(8712678-8712974)
chr4 (372-673)||(7860878-7861177)
chr4 (358-667)||(24825805-24826105)
chr4 (362-668)||(50801372-50801664)
chr4 (358-675)||(27394978-27395282)
chr4 (358-676)||(28837212-28837521)
chr4 (475-667)||(13586012-13586205)
chr4 (358-676)||(5814493-5814797)
chr4 (480-667)||(29922991-29923179)
chr4 (371-675)||(53647780-53648060)
chr4 (358-592)||(46267897-46268131)
chr4 (378-644)||(6082121-6082366)
chr4 (358-675)||(56236486-56236795)
chr4 (358-507)||(18502497-18502646)
chr4 (358-674)||(55600201-55600509)
chr4 (358-652)||(27090894-27091174)
chr4 (362-515)||(3159271-3159424)
chr4 (358-584)||(14346664-14346876)
chr4 (358-486)||(7084278-7084408)
chr4 (373-515)||(23926335-23926471)
chr4 (362-491)||(29266563-29266691)
chr4 (358-584)||(29473997-29474209)
chr4 (358-584)||(43157010-43157222)
chr4 (537-675)||(2447948-2448086)
chr4 (358-512)||(31932559-31932713)
chr4 (358-584)||(46728589-46728801)
chr4 (358-675)||(12716787-12717090)
chr4 (371-515)||(3673782-3673920)
chr4 (371-515)||(5388807-5388945)
chr4 (539-668)||(43278089-43278218)
chr4 (556-668)||(43493141-43493253)
chr4 (415-515)||(47466211-47466311)
chr4 (358-509)||(56172128-56172279)
chr4 (358-515)||(23002602-23002752)
chr4 (358-515)||(37431465-37431622)
chr4 (371-515)||(50981396-50981534)
chr4 (381-508)||(15182775-15182901)
chr4 (358-515)||(9662147-9662298)
chr4 (358-501)||(30416296-30416434)
chr4 (358-515)||(41486869-41487019)
chr4 (358-584)||(29589030-29589242)
chr4 (426-584)||(1657297-1657447)
chr4 (572-675)||(29268647-29268750)
chr4 (358-515)||(4634577-4634728)
chr4 (358-515)||(46716563-46716714)
chr4 (358-515)||(53903873-53904024)
chr4 (449-675)||(22049165-22049377)
chr4 (358-475)||(41837663-41837780)
chr4 (358-584)||(38434832-38435043)
chr4 (358-515)||(42972332-42972484)
chr4 (358-515)||(14542181-14542332)
chr4 (358-515)||(23067517-23067668)
chr4 (358-512)||(31994325-31994484)
chr4 (358-515)||(37869087-37869237)
chr4 (360-512)||(39797270-39797418)
chr4 (371-515)||(33020609-33020747)
chr4 (426-515)||(51646391-51646480)
chr4 (375-512)||(24789486-24789625)
chr4 (375-512)||(24818634-24818773)
chr4 (358-668)||(40198212-40198511)
chr4 (587-665)||(3159152-3159230)
chr4 (358-515)||(15729650-15729801)
chr4 (358-515)||(44374944-44375095)
chr4 (358-515)||(54420409-54420560)
chr4 (358-486)||(2945461-2945583)
chr4 (416-512)||(32189276-32189372)
chr4 (426-584)||(26576234-26576384)
chr4 (358-515)||(7242455-7242606)
chr4 (379-515)||(34115338-34115476)
chr4 (378-495)||(40861252-40861363)
chr4 (358-494)||(4959243-4959373)
chr4 (358-509)||(22121743-22121898)
chr4 (394-511)||(46829705-46829822)
chr4 (382-513)||(16992168-16992293)
chr4 (415-515)||(30469843-30469943)
chr4 (415-515)||(52555460-52555560)
chr4 (358-515)||(9474207-9474359)
chr4 (358-512)||(20961745-20961893)
chr4 (358-512)||(46775527-46775675)
chr4 (371-668)||(56062144-56062427)
chr4 (445-515)||(11817350-11817420)
chr4 (598-668)||(24789344-24789414)
chr4 (598-668)||(24818845-24818915)
chr4 (358-494)||(28990613-28990747)
chr4 (384-515)||(4518603-4518734)
chr4 (358-515)||(6408739-6408890)
chr4 (358-515)||(47923555-47923706)
chr4 (358-484)||(12755105-12755230)
chr4 (358-472)||(13169115-13169229)
chr4 (413-515)||(35658249-35658351)
chr4 (358-515)||(56250458-56250616)
chr4 (375-515)||(10715981-10716114)
chr4 (375-515)||(10929751-10929884)
chr4 (601-673)||(22121596-22121668)
chr4 (358-414)||(23964059-23964115)
chr4 (436-488)||(44947604-44947656)
chr4 (374-485)||(3171295-3171405)
chr4 (437-488)||(12265654-12265705)
chr4 (358-456)||(12519972-12520064)
chr4 (537-584)||(29257458-29257505)
chr4 (358-464)||(42914726-42914833)
chr4 (437-515)||(4622445-4622523)
chr4 (415-484)||(6789596-6789666)
chr4 (436-490)||(11299875-11299929)
chr4 (378-515)||(22066745-22066876)
chr4 (375-515)||(10680692-10680826)
chr4 (375-515)||(10894332-10894466)
chr4 (375-515)||(17220079-17220213)
chr4 (538-579)||(29266721-29266762)
chr4 (358-415)||(38545822-38545879)
chr4 (358-399)||(48257428-48257469)
chr4 (361-485)||(56335768-56335890)
chr4 (619-667)||(1531953-1532001)
chr4 (436-480)||(25274083-25274127)
chr4 (426-490)||(36204234-36204298)
chr4 (537-644)||(41837510-41837611)
chr4 (436-488)||(47417854-47417906)
chr4 (467-515)||(50002948-50002996)
chr4 (358-414)||(50274379-50274435)
chr4 (106-157)||(53375010-53375062)
chr4 (537-584)||(4959408-4959455)
chr4 (436-499)||(22301031-22301094)
chr4 (441-512)||(24398575-24398645)
chr4 (437-488)||(27593675-27593726)
chr4 (439-490)||(36194898-36194949)
chr4 (537-584)||(47704180-47704227)
chr4 (617-668)||(56171999-56172050)
chr4 (426-488)||(1532100-1532162)
chr4 (378-416)||(1645293-1645331)
chr4 (402-512)||(9255011-9255120)
chr4 (598-668)||(12754318-12754388)
chr4 (358-515)||(19885635-19885786)
chr4 (358-515)||(29576790-29576941)
chr4 (439-485)||(36161906-36161952)
chr4 (363-408)||(43853716-43853762)
chr4 (371-416)||(45032732-45032778)
chr4 (358-475)||(51958678-51958793)
chr4 (618-667)||(2624541-2624590)
chr4 (378-407)||(3169773-3169802)
chr4 (442-515)||(9549733-9549806)
chr4 (358-403)||(9549832-9549877)
chr4 (358-399)||(18936065-18936106)
chr4 (516-584)||(29576933-29577002)
chr4 (618-667)||(29965680-29965729)
chr4 (436-485)||(51318180-51318229)
chr4 (587-644)||(54549023-54549080)
chr4 (363-399)||(4142565-4142601)
chr4 (619-667)||(4643903-4643951)
chr4 (436-488)||(4644050-4644102)
chr4 (436-488)||(6973002-6973054)
chr4 (363-395)||(7273606-7273638)
chr4 (619-667)||(9283956-9284004)
chr4 (436-488)||(9645369-9645421)
chr4 (371-399)||(10258710-10258738)
chr4 (363-395)||(10496612-10496644)
chr4 (601-645)||(13169340-13169384)
chr4 (363-399)||(19853313-19853349)
chr4 (363-399)||(21686043-21686079)
chr4 (616-644)||(22621610-22621638)
chr4 (619-667)||(25273928-25273976)
chr4 (363-399)||(26633472-26633508)
chr4 (436-480)||(29966526-29966570)
chr4 (374-418)||(31444758-31444802)
chr4 (358-418)||(32872538-32872597)
chr4 (436-480)||(34024283-34024327)
chr4 (358-414)||(35338685-35338741)
chr4 (363-399)||(42032319-42032355)
chr4 (363-395)||(43095909-43095941)
chr4 (619-667)||(43154010-43154058)
chr4 (436-480)||(45227886-45227930)
chr4 (619-667)||(47417707-47417755)
chr4 (426-493)||(49067003-49067068)
chr4 (619-667)||(49410268-49410316)
chr4 (436-488)||(49410415-49410467)
chr4 (619-667)||(50766508-50766556)
chr4 (436-488)||(53616495-53616547)
chr4 (619-667)||(53616646-53616694)
chr4 (363-399)||(56040447-56040483)
[»] scaffold0294 (2 HSPs)
scaffold0294 (362-668)||(3726-4033)
scaffold0294 (382-467)||(5877-5962)
[»] scaffold0536 (1 HSPs)
scaffold0536 (358-667)||(3056-3361)
[»] chr8 (158 HSPs)
chr8 (358-657)||(14600361-14600661)
chr8 (358-675)||(24790833-24791149)
chr8 (358-675)||(2234133-2234451)
chr8 (362-673)||(7579522-7579834)
chr8 (373-673)||(31407429-31407727)
chr8 (362-658)||(2024891-2025188)
chr8 (358-676)||(37612800-37613102)
chr8 (362-675)||(4757313-4757610)
chr8 (358-667)||(30026545-30026855)
chr8 (358-675)||(41361880-41362199)
chr8 (358-675)||(43936843-43937158)
chr8 (358-673)||(39067353-39067668)
chr8 (358-675)||(28296778-28297088)
chr8 (374-675)||(24210389-24210690)
chr8 (362-668)||(9501741-9502030)
chr8 (365-668)||(11162038-11162345)
chr8 (358-675)||(19720157-19720479)
chr8 (374-673)||(10338510-10338801)
chr8 (358-667)||(10148101-10148402)
chr8 (358-675)||(31202606-31202914)
chr8 (358-675)||(24699980-24700300)
chr8 (380-675)||(31308296-31308592)
chr8 (358-675)||(1809901-1810203)
chr8 (358-675)||(22787640-22787949)
chr8 (381-668)||(3204472-3204759)
chr8 (358-626)||(23970851-23971115)
chr8 (392-668)||(37128193-37128461)
chr8 (412-675)||(12329775-12330039)
chr8 (358-592)||(5526033-5526268)
chr8 (358-675)||(2968680-2968981)
chr8 (360-662)||(32778637-32778925)
chr8 (358-674)||(13575872-13576174)
chr8 (358-515)||(13570430-13570585)
chr8 (358-519)||(15286695-15286857)
chr8 (358-519)||(15467064-15467226)
chr8 (400-639)||(40490238-40490467)
chr8 (358-584)||(3925360-3925571)
chr8 (358-584)||(16937008-16937220)
chr8 (358-505)||(1215010-1215151)
chr8 (358-584)||(12248380-12248592)
chr8 (358-515)||(31712743-31712896)
chr8 (544-668)||(13570589-13570715)
chr8 (358-515)||(9992960-9993111)
chr8 (371-584)||(16937954-16938158)
chr8 (371-515)||(14530598-14530736)
chr8 (371-515)||(18190533-18190671)
chr8 (537-668)||(10334331-10334456)
chr8 (358-515)||(32104506-32104657)
chr8 (358-515)||(41996837-41996988)
chr8 (371-515)||(27534094-27534232)
chr8 (358-515)||(8054477-8054628)
chr8 (358-584)||(15665772-15665986)
chr8 (358-515)||(16996558-16996709)
chr8 (358-458)||(38545479-38545580)
chr8 (378-584)||(32256410-32256602)
chr8 (358-515)||(5457365-5457516)
chr8 (358-515)||(44295610-44295761)
chr8 (359-488)||(26673446-26673575)
chr8 (512-675)||(38545971-38546134)
chr8 (374-515)||(18196831-18196966)
chr8 (373-515)||(18204266-18204408)
chr8 (378-515)||(4928222-4928359)
chr8 (358-515)||(10951960-10952116)
chr8 (358-515)||(10959965-10960121)
chr8 (371-515)||(11298444-11298582)
chr8 (371-515)||(12243898-12244036)
chr8 (358-515)||(4429355-4429514)
chr8 (358-434)||(10334866-10334942)
chr8 (373-515)||(32920938-32921074)
chr8 (358-491)||(26538702-26538829)
chr8 (374-515)||(32062088-32062223)
chr8 (371-515)||(9270315-9270452)
chr8 (378-581)||(10043008-10043195)
chr8 (358-481)||(13977738-13977855)
chr8 (416-515)||(7014188-7014287)
chr8 (361-480)||(7256476-7256594)
chr8 (587-666)||(10633074-10633153)
chr8 (380-494)||(15237231-15237339)
chr8 (358-420)||(7291551-7291613)
chr8 (358-515)||(23767033-23767184)
chr8 (358-494)||(7280798-7280928)
chr8 (358-515)||(36545451-36545601)
chr8 (415-515)||(5989907-5990007)
chr8 (415-515)||(16809157-16809257)
chr8 (539-649)||(6219947-6220051)
chr8 (358-484)||(9799680-9799800)
chr8 (358-481)||(35778768-35778891)
chr8 (358-515)||(2629204-2629358)
chr8 (373-494)||(7269150-7269265)
chr8 (358-515)||(10632790-10632952)
chr8 (358-494)||(18994197-18994326)
chr8 (358-515)||(32413084-32413235)
chr8 (374-515)||(37720134-37720268)
chr8 (615-668)||(1039815-1039868)
chr8 (358-503)||(12111003-12111148)
chr8 (426-515)||(12357089-12357178)
chr8 (359-515)||(17019394-17019544)
chr8 (359-515)||(17549831-17549981)
chr8 (374-484)||(26046287-26046397)
chr8 (601-675)||(4928118-4928192)
chr8 (586-668)||(19488984-19489066)
chr8 (358-412)||(31874455-31874509)
chr8 (358-475)||(21471895-21472012)
chr8 (358-407)||(37659256-37659305)
chr8 (436-488)||(4809151-4809203)
chr8 (358-406)||(11967996-11968044)
chr8 (358-414)||(20993202-20993258)
chr8 (358-414)||(27989079-27989135)
chr8 (358-414)||(28046381-28046437)
chr8 (358-515)||(5328243-5328392)
chr8 (436-515)||(31874374-31874453)
chr8 (437-488)||(33299041-33299092)
chr8 (437-512)||(34365863-34365938)
chr8 (358-444)||(7281932-7282018)
chr8 (449-503)||(10334813-10334867)
chr8 (361-484)||(33526708-33526833)
chr8 (428-514)||(39092820-39092906)
chr8 (374-514)||(23422118-23422258)
chr8 (358-414)||(4021160-4021216)
chr8 (358-398)||(6833743-6833783)
chr8 (358-418)||(9627835-9627895)
chr8 (436-488)||(11725867-11725919)
chr8 (106-157)||(18087259-18087310)
chr8 (363-399)||(19443852-19443888)
chr8 (436-488)||(28240028-28240080)
chr8 (359-483)||(36006163-36006285)
chr8 (363-398)||(3240636-3240671)
chr8 (358-413)||(26912038-26912093)
chr8 (439-490)||(30568187-30568238)
chr8 (436-490)||(3240552-3240606)
chr8 (358-400)||(6314917-6314959)
chr8 (598-668)||(20992962-20993032)
chr8 (105-154)||(33986853-33986903)
chr8 (438-488)||(42447874-42447924)
chr8 (426-488)||(43192182-43192244)
chr8 (436-497)||(9619202-9619263)
chr8 (437-494)||(14918411-14918468)
chr8 (436-485)||(16794481-16794530)
chr8 (623-652)||(32726607-32726636)
chr8 (106-154)||(34612221-34612270)
chr8 (619-667)||(2655910-2655958)
chr8 (436-480)||(9498444-9498488)
chr8 (619-667)||(9619353-9619401)
chr8 (363-399)||(9637208-9637244)
chr8 (374-418)||(9802062-9802106)
chr8 (616-652)||(14186910-14186946)
chr8 (544-592)||(15288677-15288725)
chr8 (544-592)||(15469046-15469094)
chr8 (363-395)||(15596952-15596984)
chr8 (363-399)||(17693412-17693448)
chr8 (439-475)||(21237975-21238011)
chr8 (363-399)||(23230897-23230933)
chr8 (540-584)||(23766973-23767017)
chr8 (441-485)||(23851344-23851388)
chr8 (619-667)||(23851490-23851538)
chr8 (371-399)||(27498173-27498201)
chr8 (363-399)||(40211099-40211135)
chr8 (363-399)||(40618872-40618908)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (358-675)||(74312-74630)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (361-675)||(6787-7097)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (358-675)||(12905-13218)
scaffold0121 (363-399)||(31075-31111)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (358-668)||(35239-35541)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (364-673)||(6287-6596)
[»] scaffold1350 (1 HSPs)
scaffold1350 (415-675)||(1722-1984)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (358-652)||(403903-404204)
[»] scaffold0432 (1 HSPs)
scaffold0432 (358-666)||(2103-2384)
[»] scaffold0999 (1 HSPs)
scaffold0999 (358-627)||(1900-2157)
[»] scaffold1379 (2 HSPs)
scaffold1379 (378-652)||(752-1033)
scaffold1379 (556-668)||(130-242)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (358-510)||(20907-21059)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (358-515)||(36818-36969)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (358-515)||(25181-25332)
[»] scaffold0722 (1 HSPs)
scaffold0722 (358-515)||(5195-5346)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (358-515)||(11445-11596)
[»] scaffold0580 (4 HSPs)
scaffold0580 (406-515)||(503-612)
scaffold0580 (406-515)||(8242-8351)
scaffold0580 (618-662)||(698-742)
scaffold0580 (618-662)||(8437-8481)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (358-515)||(105334-105491)
[»] scaffold0542 (2 HSPs)
scaffold0542 (378-480)||(4137-4239)
scaffold0542 (589-667)||(3938-4016)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (358-582)||(136744-136953)
[»] scaffold0316 (1 HSPs)
scaffold0316 (415-504)||(11923-12012)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (358-457)||(22301-22400)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (437-512)||(404489-404564)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (358-515)||(9998-10149)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (358-494)||(244949-245074)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (358-443)||(201732-201817)
scaffold0007 (603-675)||(201952-202024)
scaffold0007 (100-157)||(185513-185571)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (358-434)||(11223-11299)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (358-511)||(93989-94129)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (358-456)||(847-939)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (460-515)||(9423-9478)
[»] scaffold0603 (1 HSPs)
scaffold0603 (358-399)||(7979-8020)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (426-515)||(35965-36054)
scaffold0006 (587-652)||(35842-35907)
[»] scaffold0886 (1 HSPs)
scaffold0886 (587-674)||(3626-3713)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (439-490)||(1514-1565)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (364-443)||(41343-41422)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (437-488)||(83282-83333)
[»] scaffold1294 (1 HSPs)
scaffold1294 (449-515)||(1069-1135)
[»] scaffold0274 (1 HSPs)
scaffold0274 (449-510)||(19294-19353)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (449-510)||(5595-5654)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (371-515)||(15363-15507)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (363-399)||(53202-53238)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (365-408)||(3837-3881)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (426-494)||(11327-11394)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 197)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 673
Target Start/End: Original strand, 42603062 - 42603740
Alignment:
Q  7 agaaacatctagacaaagatgattgaaatacaatagtgttgattgcaat-------agtaaaatgtgtattatttaataaagggaaaggttaacaaat-- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  42603062 agaaacatctagacaaagatgattgaaatacaatagtgttgattgcaatttgcaatagtaaaatgtgtattatttaataaagggaaaggttaacaaatct 42603161  T
Q  98 -------------------ctccgaaacacttgttaaggaaatataaaagaaaatattctctgaaaattgtgtattctaattaatgtttcaaatgcaccg 178  Q
                       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42603162 ctctaaaaaaaaaaaaaatctccgaaacacctgttaaggaaatataaaagaaaatattctctgaaaattgtgtattctaattaatgtttcaaatacaccg 42603261  T
Q  179 gttatcaagacccataaatatgaatatttatggtccattagttgaataattgtagatgattaaaatgaaataaatacatgtaggttagtagaaaaagata 278  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42603262 gttaacaagactcataaatataaatatttatgttccgttagttgaatagttgtagattattaaaatgaaataaatacatgtaggtcagtagaaaaagata 42603361  T
Q  279 ttatatcaatattatataatggaacaagacccaaaaatatgggtatttatagtccgttagannnnnnnnnnnnnnnnnnaaaataaacgatgttcattca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||                    ||||||||||||||||||||    
T  42603362 ttatatcaatattatataatggaacaagacccataaatatgggtattcatagtccgttag-------tttttttttttttaaataaacgatgttcattca 42603454  T
Q  379 ttcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataaca 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42603455 ttcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaacaaaacggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaatagca 42603554  T
Q  479 taaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaa 578  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  42603555 taaaacggcaaagttcctatgcctaca---------aatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagatctgtaacgttgacgacatcaa 42603645  T
Q  579 agtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcaca 673  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  42603646 agtcattgtcattgatcggatatgcacttgcttaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacaggaaataaaaaacaca 42603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 21991128 - 21990810
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21991128 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 21991029  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  21991028 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactgtatttatgtctccggaatactcatgtctccgga 21990929  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  21990928 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatcagcacttgctcaaagctaatctttcaagctgaatcaaataaacaccgcactaagac 21990829  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  21990828 gggaaatcaaaaacacacc 21990810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 358 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 11833484 - 11833178
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11833484 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcgcattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 11833385  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  11833384 acaacatccatattaatagcataaaacggcaaagtatttatgcctataaatatgactaatatgactatatttatgtctctggaatactcatgtcttcgga 11833285  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||| ||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11833284 tctacaacgttaacgacgcaaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 11833185  T
Q  657 gggaaat 663  Q
    | |||||    
T  11833184 gagaaat 11833178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 9785783 - 9785465
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  9785783 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagggtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaactaaatgaatgaatttgtgaacaaactc 9785684  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||    
T  9785683 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctctagaatactcatgtttccgga 9785584  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9785583 tctgcaacgttgacgactccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagat 9785484  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  9785483 gagaaatcaaaaacacacc 9785465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 41288422 - 41288112
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41288422 aaaataaacgatattctttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 41288323  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||| ||    
T  41288322 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacttgtgcctgcaaatatgactaatatgactatatttaagtctccgaaatactcatgtatccgga 41288223  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  41288222 tctacaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaagac 41288123  T
Q  657 gggaaatcaaa 667  Q
    || ||||||||    
T  41288122 ggaaaatcaaa 41288112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 10094906 - 10094589
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10094906 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtatattaatacaatagaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 10094807  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || | |||||||||||||   ||    
T  10094806 acaacatcaatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatataact-tatttttgtctccgaaatactcatgtctttgga 10094708  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10094707 tctgcaacgttaacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 10094608  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10094607 gggaaatcaaaaacacacc 10094589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 36578996 - 36579307
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36578996 aaaataaacgatattcattcgttcaaattgatagagtacattaatataatataaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 36579095  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||    
T  36579096 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcccacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactaatgtctccgga 36579195  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  36579196 tctgcaacattgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctacaattgctcaaagctaatctttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaagac 36579295  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||||    
T  36579296 gggaaatcaaaa 36579307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 48304047 - 48304366
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48304047 aaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaatttcactaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 48304146  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||  |    
T  48304147 ataacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtcaccggaatactcatgtgtccgta 48304246  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcatt-gatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48304247 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattcgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 48304346  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||||| |||| ||||||    
T  48304347 cgagaaataaaaaacacacc 48304366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 45457211 - 45457529
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45457211 aaaataaacaatattgattcattcaaattgatagagtacatcgacacagtacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 45457310  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||    
T  45457311 acaacatccatattaatagcataaaacggcaaaatatatatgcctacaaacaggactaatatgactatattcatgtctccagaatactcatgtctccgga 45457410  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  45457411 tctgcaacgttgacgactccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaagac 45457510  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  45457511 gagaaatcaaaaacacacc 45457529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 362 - 674
Target Start/End: Original strand, 17508863 - 17509176
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17508863 taaatgatattcattcttttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaa 17508962  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  17508963 catccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgactgatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctg 17509062  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  17509063 cgacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcactaagacggaa 17509162  T
Q  661 aatcaaaagcacac 674  Q
    |||||||| |||||    
T  17509163 aatcaaaaacacac 17509176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 362 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 17544351 - 17544038
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17544351 taaatgatattcattcttttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaa 17544252  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  17544251 catccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgactgatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctg 17544152  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  17544151 cgacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcactaagacggaa 17544052  T
Q  661 aatcaaaagcacac 674  Q
    |||||||| |||||    
T  17544051 aatcaaaaacacac 17544038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 1280792 - 1281110
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1280792 aaaataaacgatattcatttattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 1280891  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | | |||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||| ||||| ||    
T  1280892 atagcatccatgttaatagcataaaatggaaaagtacatatgcctacaactatgactaatatgactatattcgtgtctccagaatactcatatctccgga 1280991  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1280992 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgttcggatctgcacttgctcaaaggtaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 1281091  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  1281092 gggaaatcaaaaacacacc 1281110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 24319878 - 24320196
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24319878 aaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaactc 24319977  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatg-ttctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||  ||||    
T  24319978 acaacatccatgttgatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgattaatatgactatattcaagtttccagaatactcatgtcatcaga 24320077  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24320078 tctgcaatgttgacgacaccaaagtcattgtcatagatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 24320177  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || |||| |||| ||||||    
T  24320178 ggaaaataaaaaacacacc 24320196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 21603924 - 21603608
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  21603924 aaaattaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcattaaaaagaaaaagggtgaatctgtgaacaaactc 21603825  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |  ||| ||| ||    
T  21603824 acaacatccatgttaatagcgtaaaacggcaaaatacctatgcctacaaatatgactaatatgactacatttatgtctccggaatatt--tgtttccgga 21603727  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21603726 tctgcaacgttgacgacgttaaagtcattgtcattgatcggatctgcactttctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 21603627  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  21603626 gggaaatcaaaaacacacc 21603608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 6667861 - 6667543
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6667861 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagcacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactc 6667762  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| |||| | ||    
T  6667761 acaacatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacatatgcctacaaatatgactagtgtgattatatttatgtctccggaatactcaggtcttcgga 6667662  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||    
T  6667661 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatatgcacttgatcaaagccaatctttcaacttgagtcaattaaacaccgcactaagac 6667562  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || |||| |||| ||||||    
T  6667561 ggaaaataaaaaacacacc 6667543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 36253396 - 36253078
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36253396 aaaataaacgatactcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggaagaatctgtgaacaaactc 36253297  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| | ||||||||| ||    
T  36253296 acaacatccgtgttaatagcataaaacgacaaaatatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccgaaattcccatgtctccgga 36253197  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||     
T  36253196 tctacaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgtcctaagat 36253097  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  36253096 gggaaatcaaaaacacacc 36253078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 362 - 668
Target Start/End: Original strand, 22747168 - 22747475
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  22747168 taaacgatattgattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaatttactaaaaacaaaaaggatgattctgtgaacaaactcacat 22747267  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||| || |||||    
T  22747268 catccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatttctacaaatctg 22747367  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  22747368 caacgttgacgacgccaaattcattgtcaatgatcagatctgcacttgctcagagctaatctttcaaccttaatcaattaaacaccgccctaagacggga 22747467  T
Q  661 aatcaaaa 668  Q
    | ||||||    
T  22747468 actcaaaa 22747475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 40762054 - 40761736
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40762054 aaaaaaaacgatattcatttattcaaattgatagagtatatcgatacagtacaaatccaaattcgctaaaaaagaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 40761955  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  40761954 atatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcttacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccgga 40761855  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  40761854 tctgtaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgttcaaagctaatatttcaaccttaatcaaataaacaccgcactaatac 40761755  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    | ||||| |||| ||||||    
T  40761754 gagaaataaaaaacacacc 40761736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 374 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 26161404 - 26161106
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26161404 attcattcaaattgatagagtatatcgata-aatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaa 26161306  T
Q  474 ta----acataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttg 568  Q
    ||     ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26161305 tagcacgcataaaacgacaaagtacctaggcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccgggatactcatgtctccggatctgcaacgttg 26161206  T
Q  569 acgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  26161205 acgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaatgaaccccgcactaagacagaaaatcaaaa 26161106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 39532630 - 39532948
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  39532630 aaaataaacgatattaattcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatgtgtgaacaaactc 39532729  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | | ||||||||||| ||||  |  |||||||||||| ||| ||    
T  39532730 acatcattcatgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcatacaaatatgattgaaatgactatattcatgtccccagaatactcatgtttccgga 39532829  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  39532830 tctgcaatgttgacgactccaaagtcattatcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaaggc 39532929  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  39532930 gggaaataaaaaacacacc 39532948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3266840 - 3266542
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3266840 aaaataaacaatattcattcattcaaattgataaagtacattgatacaatacaaattcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactc 3266741  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||   || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||||| || || | | ||||||||||||| ||    
T  3266740 aca---tccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgacta---------tatttaagtctccgaagtactcatgtctccgga 3266653  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3266652 tctacaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaagac 3266553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 2623058 - 2622740
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2623058 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatctatataatataaatctaaatttgataaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactc 2622959  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  2622958 acaacattcatgttaatagcataagacgacaaaatacctatgcctacaaatatgactaacattactatattcatgtctccggaatactcatgtcttcgga 2622859  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||     
T  2622858 tctgcaatgttgacgacgccaaagttattgtcattgattggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaatttgaatcaaataaacaccgcacaaagat 2622759  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  2622758 gggaaataaaaaacacacc 2622740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 365 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 42645114 - 42644820
Alignment:
Q  365 acgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacat 464  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42645114 acgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaagtctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacat 42645015  T
Q  465 ctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagatctgcaac 564  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||| ||||||||||    
T  42645014 ccatgttaatagcataaaacggcaaattacatatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccggatctgcaac 42644931  T
Q  565 gttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatc 664  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  42644930 gttgacgacgccaaaatcattgtcattgatcggatctgtacttgctcaaagctaatatttcaacctgaattaaataaacaccgcactaagacggaaaata 42644831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 358 - 676
Target Start/End: Original strand, 4621035 - 4621341
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4621035 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaattcaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgttaacaaactc 4621134  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||| || || | ||||||||||||||| ||    
T  4621135 acaacattcatgttaatagcataaaatgacaaagtacatatgcctacaaatatgacta-------tatatttaagtctccgaaatactcatgtctccgga 4621227  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4621228 tctgcaatgttgatgacaccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgttcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaaac 4621321  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacca 676  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  4621322 gtgaaatcaaaaacacacca 4621341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 360 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 32643432 - 32643170
Alignment:
Q  360 aataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcac 459  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32643432 aataaacgatattcattcattcaagttgatagagtacaccgatacaatataaatccaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcac 32643333  T
Q  460 aacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatc 558  Q
    | | || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||    
T  32643332 atcttccatgttaatagcataaaacggcaagatacttatgcctacaaatatgactaatatgattatattcaagtctccggaatcctcatgtctccggatc 32643233  T
Q  559 tgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatc 621  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  32643232 tgcaacgtggacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgcttaaagctaatc 32643170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 362 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 45482514 - 45482214
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  45482514 taaacgatattaattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaaaaa---ggatgaatctgtgaacaaactcacaa 45482418  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||         |||| | || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  45482417 catccatgttaatagcataaaacgacaaagtatctatacctacaaatatgacta---------tattcaagtctccggaatactcatgtctccggatctg 45482327  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  45482326 caacgttgacagcgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacggga 45482227  T
Q  661 aatcaaaagcaca 673  Q
    ||| |||| ||||    
T  45482226 aataaaaaacaca 45482214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 362 - 668
Target Start/End: Original strand, 17473420 - 17473718
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17473420 taaatgatattcattctttcaaattgatagagtacatcggtacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaa 17473519  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||         ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||||||    
T  17473520 catccatgttaataggataaaatggcaaagtacatatgcttacaaatatgacta---------tattcctgtctccggaatactcatgtctctggatctg 17473610  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  17473611 cgacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcacaaagacggga 17473710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 362 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 17579794 - 17579496
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17579794 taaatgatattcattctttcaaattgatagagtacatcggtacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaa 17579695  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||         ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||||||    
T  17579694 catccatgttaataggataaaatggcaaagtacatatgcttacaaatatgacta---------tattcctgtctccggaatactcatgtctctggatctg 17579604  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  17579603 cgacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcacaaagacggga 17579504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 32741209 - 32740907
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32741209 aaaataaacgatattcatttattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatctaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 32741110  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  32741109 acaacatccatgttaatagcataaaacaacaaagtatatatgcctacaaatatg---------actatatttatgtctctggaatactcatgtctccgga 32741019  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    | |||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  32741018 tttgcaacgttagcgacgccaaaatcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaatagacaccacactaagac 32740919  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||| ||||    
T  32740918 gggaaataaaaa 32740907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 358 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 27535893 - 27535600
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| | |||||||| ||| |||||||||    
T  27535893 aaaataaacgatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatacaaattcgtcaaaaacaacaaggatgaatatgt-aacaaactc 27535795  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||| ||  |||||||||||| ||| ||    
T  27535794 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttgtgcctacaaatatgactaatgtgaatatagtcatgtctccagaatactcatgtttccgga 27535695  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcact 651  Q
    ||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27535694 tctacaatgttaacgacgccaaagtcattgtcattggtcgaacctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgagtcaaataaacaccgcact 27535600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 358 - 636
Target Start/End: Original strand, 44482533 - 44482807
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  44482533 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaataaactc 44482632  T
Q  458 acaacatctatgttaataa----cataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctc 552  Q
    ||| |||| |||||||||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  44482633 acatcatccatgttaatatatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgacta---------tattaatgtctccggaatactcatgtctc 44482723  T
Q  553 cagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatca 636  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44482724 cggatctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatatttcaacctgaatca 44482807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 10574831 - 10574529
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaac-aaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  10574831 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatataaatctaaattcgctaaaaaataaaaaggatgaatttgtgaacaaact 10574732  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||    
T  10574731 cacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatgtgcctataaatatgactaatatgactatattt----------------ttgtctccaga 10574648  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  10574647 tctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacatgaatcaaataaacaccgaactaagac 10574548  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || |||| |||| ||||||    
T  10574547 ggaaaattaaaaacacacc 10574529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 365 - 668
Target Start/End: Original strand, 36719222 - 36719518
Alignment:
Q  365 acgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaactcacaaca 463  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36719222 acgatattcattcattcaaattgatagagtgcatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaaca 36719321  T
Q  464 tctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgca 562  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| |||||| |    
T  36719322 tccatgttaatagcataaaacggcgaagtacttatgcctaca---------aatatgactatattcatgtctccgaaatactcatgtctccggatctgga 36719412  T
Q  563 acgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaa 662  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||    
T  36719413 acgttgatgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctgtacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataagcaccccactaagacggaaaa 36719512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 46025710 - 46026002
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  46025710 aaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctttgaacaaactc 46025809  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||         |||||||||||                |||||||||  ||    
T  46025810 acagcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaat---------atgactatatt----------------catgtctccgaat 46025884  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  46025885 ctgcaacgttgacaacgctaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagacg 46025984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 374 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 5684805 - 5684519
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||   |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  5684805 attcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaattcaaactcgctaaaaacaaccaggatgaatgtgtgaacaaacttacagcatccatgttaa 5684706  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacga 572  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||         |||||||| |||| ||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  5684705 tagcataaaacggcaaagtacatatgcctataaatatg---------actatattcatgtctctggaatagtgttgtctccggatctgtaacgttgacga 5684615  T
Q  573 caccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
       |||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  5684614 tgtcaaagtaattgacattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaacaaacaccatactaagacggaaaatcaaaa 5684519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 374 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 5709855 - 5709569
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||   |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  5709855 attcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaattcaaactcgctaaaaacaaccaggatgaatgtgtgaacaaacttacagcatccatgttaa 5709756  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacga 572  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||         |||||||| |||| ||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  5709755 tagcataaaacggcaaagtacatatgcctataaatatg---------actatattcatgtctctggaatagtgttgtctccggatctgtaacgttgacga 5709665  T
Q  573 caccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
       |||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  5709664 tgtcaaagtaattgacattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaacaaacaccatactaagacggaaaatcaaaa 5709569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 28664611 - 28664907
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28664611 aaaataaacgatatccatctattcaaattgatagattacatcgatacaatgcaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactc 28664710  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||  ||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||| | ||||||||||| |||| |               |||||||||||||||   ||    
T  28664711 acagcattcatgctaatagcataagacggcaaaatatctatgccaataaatatgactattatgcca--------------gaatactcatgtctctgaat 28664796  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28664797 ctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacg 28664896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Original strand, 9719745 - 9719938
Alignment:
Q  475 aacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgac 573  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  9719745 aacataaaacggtaaaatatctatgcctacaaatatgactaatatgattatattcttgtctctggaatactcatgtcttctgatctgcaacgttgactac 9719844  T
Q  574 accaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9719845 gccaaaatcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaatcaaa 9719938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 371 - 668
Target Start/End: Original strand, 24988168 - 24988446
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  24988168 ttcattcatttaaattgatagaatacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatatgaacaaaatcacaacatctatgt 24988267  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgac 570  Q
    |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||           |||       |||| | | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24988268 taatagtataaaacgacaaagtatttatgcctacaa-----------atg-------ttatctcc-ggaatactcatgtatccggatctgcaacgttgac 24988348  T
Q  571 gacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24988349 aacaccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaaccaaaa 24988446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 37375711 - 37376004
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37375711 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacat-gatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaagggatgaatatgtgaacaaactc 37375809  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||         |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  37375810 acagcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctaca---------aatatgactatattcatgtctcctgaatactcatgtctccaga 37375900  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||               ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  37375901 tctgcaacgttgacgacgccaaagtc---------------atctgcatttgctcaatgttaatctttcaacctgaatcaaataaactacgcactaagac 37375985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 358 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 37593549 - 37593379
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37593549 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactc 37593450  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatt 528  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37593449 acaatatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgtctacaaatatgactactataactatatt 37593379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 358 - 676
Target Start/End: Original strand, 21954488 - 21954792
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | | | |||  |||| |||| ||||||   ||||||||    
T  21954488 aaaataaacgatattcatttattaaaattgatagactacatcgttacaatataaatccaaaattgctaaaatgaaaaaggataaatctgcagacaaactc 21954587  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||  |||||||  |||||||||||         |||| | || || |||||||||||| |||| ||    
T  21954588 agaacatccatgttaatagcataaaacggaaaaatatctatgcctgtaaatatgacta---------tattcaagtgtccggaatactcatgactccgga 21954678  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  21954679 tctgcaacgttgacgacgccaaagtca------ttgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacacgacactaagac 21954772  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacca 676  Q
    |  |||| |||| |||||||    
T  21954773 gaaaaataaaaaacacacca 21954792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 478 - 675
Target Start/End: Original strand, 15674386 - 15674585
Alignment:
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacacc 576  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| || ||    
T  15674386 ataaaatggcaaagtacctatgcctacaaatatgccaaatatgactatattcatgtctctggaatactcatgttttcgaatctgcaacgttgacaacgcc 15674485  T
Q  577 aaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac-gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||||| ||| ||||| | || |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  15674486 aacgtcattgtcgttgattgaatttgcacttgctaaaagctaatctttcaacctgaataaaataaacaccacactaagacggggaaatcaaaaacacacc 15674585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 358 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 9137406 - 9137127
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||| | | | ||||||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  9137406 aaaataaacgatattc-ttcattcaaattgatagagtgcatcgacccagtacaaattcaaagttgctaaaaacaaaaaggatgaatttacgaacaaactc 9137308  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||         ||| | || || |||||||| |||||||| ||    
T  9137307 acatcatccatgttaatagcataaaatgacaaagtacttatgtctacaaatatgactaa---------attcaagtctccggaatacttatgtctccgga 9137217  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||||||||||| |||||      |||| |||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9137216 tctgcaacgttgacgacgccaaa------gtcaatgatcgaatatgcactttctcaaagctaatcttttaaccttaatcaaataaacaccacacta 9137127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 26017327 - 26017478
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26017327 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataaattcac------taaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactc 26017420  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  26017421 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgacta 26017478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 29804361 - 29804499
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29804361 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatataata------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacgacatccatgt 29804454  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29804455 taatagcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgacta 29804499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38273354 - 38273198
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    |||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  38273354 aaataaacaatatttattcatttaaattgacagagtacattgatacaatataaatccaaagtccttaaaaacaaaaaggatgaatttgctaacaaactca 38273255  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38273254 caacatccatgttaatagcataaaacagcaaagtacatatgccaacaaatatgacta 38273198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28015802 - 28015654
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28015802 aaaataaaagatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 28015709  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  28015708 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatga 28015654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 21328967 - 21329118
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21328967 aaaataaaggacattcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaattc 21329060  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  21329061 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtgcacaagcctacaaatatgacta 21329118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 675
Target Start/End: Original strand, 15017210 - 15017349
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcatt-gatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatc 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15017210 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacgctaaagtcattgtcattggatcggagttgcacttactcaaagctaatatttcaacctgaatc 15017309  T
Q  636 aaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| |||| || || |||| |||| ||||||    
T  15017310 aaataaacaccggactaagatggaaaataaaaaacacacc 15017349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 378 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 29352656 - 29352388
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||  || | |||| ||  | ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||  |||||||||      
T  29352656 attcaaattgatagaatatatcgatataattcaattccaaagtctctaaaaacaaaatggatgaatcagcgaataa-ctcacaacattcatgttaatagt 29352558  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacacc 576  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||         |||| | || | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |     
T  29352557 ataaaatagaaaagtacatatgcctacaaatatgacta---------tattcaagtctttggaatactcatctctccggatctgcaacgttgacgacgca 29352467  T
Q  577 aaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaa 661  Q
    ||||||||      |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29352466 aaagtcat------tgatcgaatctacacttgcacaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacgggaa 29352388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 361 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5238397 - 5238246
Alignment:
Q  361 ataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaca 460  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| || |||||||||||||    
T  5238397 ataaaagatatttattcattcaaattgacagagtacatccatacaatacaaattcaaaatcgttaaaaataaaaaggatgaatttgagaacaaactcaca 5238298  T
Q  461 acatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
     |||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  5238297 tcatccatgttaataacataaaacg--acagtacatatg-ctacaaatatgacta 5238246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 30992493 - 30992643
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  30992493 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaa-ggatgaatatgtgaacagactc 30992585  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||    
T  30992586 acaacatctatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcatacacatatgacta 30992643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 25112953 - 25112660
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||  |||||||||  ||||||||||    
T  25112953 aaaataaacgatagtcattcattcaaaatgatagagtacatcgatacaatataaaatcaaagtcgctaaaaataaaaaagatgaatctacgaacaaactc 25112854  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||         | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||         ||||||| |||||| | || || ||||||||| |||||||| |    
T  25112853 aca---------tcaacaacataaaacgacaaagtgcttatgcctaca---------aatatgagtatattcaagtctccggaatactcgtgtctcca-a 25112773  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
     ||||||| ||||||| | ||||      || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |||    
T  25112772 actgcaacattgacgatatcaaa------gttattgatcggatatgcacttgctcaaagttaatctttcaacttaaatcaaataaacatcgtactaagac 25112679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 556 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 43847337 - 43847218
Alignment:
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  43847337 atctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaatctaatctttcaacctgaatcaaataaacacaacactaaga 43847238  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     || |||| |||| ||||||    
T  43847237 tggaaaataaaaaacacacc 43847218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8180267 - 8180162
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  8180267 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattcatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactc 8180168  T
Q  458 acaaca 463  Q
    ||||||    
T  8180167 acaaca 8180162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47750166 - 47750028
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||      | | ||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  47750166 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaattc------gctaaaaacatcaaggatgaatatgtgaacagactcacaacatccatgt 47750073  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  47750072 taatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 47750028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 49167370 - 49167219
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||     ||||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  49167370 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtatatc-----aatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 49167277  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  49167276 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 49167219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 507
Target Start/End: Original strand, 32587197 - 32587343
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| || |||||| ||  | ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  32587197 aaaataaacaatattcattcattcaaattgatcgagtacat---tacaatacaatttcaaagtcactaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactc 32587293  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaa 507  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  32587294 acaacatccatgttaatatcataatacggccaagtacatatacctacaaa 32587343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 21552124 - 21552275
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||  ||||      |||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21552124 aaaacaaacgacattcattcatttaaattgatagagtatattgatgtaata------caaatttgctaaaaacaaaagggatgaatctatgaacaaactc 21552217  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21552218 acatcatccatgttaataacataaaacagcaaagtacataagcctacaaatatgacta 21552275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Original strand, 31254786 - 31254940
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | | |||| |||| ||| || ||   ||||||||||    
T  31254786 aaaataaaggatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatacaaattcaaagttgctaaaaataaaaaggacgattcgacgaacaaactc 31254885  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  | || |||||  ||||||||||||||||    
T  31254886 acaacatatatattaataacataaattgacatagtacacatgcctacaaatatga 31254940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 43847439 - 43847337
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  43847439 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaataaactc 43847340  T
Q  458 aca 460  Q
    |||    
T  43847339 aca 43847337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47156830 - 47156679
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  47156830 aaaataaaagatattcattcattcaaattaaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatttgtgaacagactc 47156737  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  47156736 acaacatccatgttaataacataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgacta 47156679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 475
Target Start/End: Original strand, 15674018 - 15674135
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||| | |||||| |||||||||||||    
T  15674018 aaaataagcgatattcattcattcaaattgattgagtacatcgataaaatacaaattcaaattcactaaaaacgaaaagaatgaatatgtgaacaaactc 15674117  T
Q  458 acaacatctatgttaata 475  Q
    |||||||| || ||||||    
T  15674118 acaacatccatattaata 15674135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23808792 - 23808655
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||     
T  23808792 aaaataaacgatattcattcattcaaattgagagagtatatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaatcaaaaaggttgaatctgtgaacaaact- 23808694  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtactta 497  Q
     || |||| |||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  23808693 -cagcatccatgttaatagaataaaatgacaaagtactta 23808655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 9137858 - 9137704
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||  ||| | ||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  9137858 aaaataaaagatatttattcattcaaattgatagagtacatcaatttaataaaaatctaaagttgtttaaaacaaaaaaggatgaatctgcgaacaaact 9137759  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
     |||||||| ||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  9137758 tacaacatccatgttaatagcat-aaatggaaaagtagttatgcctacaaatatga 9137704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 134814 - 134965
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||       | | ||||||||| |||||||||| ||||||  |||    
T  134814 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaattt------gctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaggctc 134907  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  || ||||  ||||||||| |||||||||    
T  134908 acaacatccatgttaataacataaagcgaaaaggtacagatgcctacacatatgacta 134965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18754140 - 18753989
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  18754140 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatcattgaacagactc 18754047  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  18754046 acaacattcatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgacta 18753989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 31725071 - 31724917
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||| || || |||||||||  || |||||||  ||||||||     
T  31725071 aaaataaacgatatttattcattcaaattgaaaaagtgcatcgatacaatacaaatttaaagtcattgaaaacaaaaatgacgaatctgcaaacaaactt 31724972  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
      | |||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  31724971 gtatcatccatgttaataacataaaacgacagagtaaatatgcctacaaatatga 31724917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 373 - 490
Target Start/End: Original strand, 33530159 - 33530270
Alignment:
Q  373 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||      | | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33530159 cattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgtaaattc------gctaaaaacaaaagagatgaatctgtgaacaaactcacagcatccatgtta 33530252  T
Q  473 ataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  33530253 ataacataacacggcaaa 33530270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34893552 - 34893401
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||      | | |||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  34893552 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatgaaaattc------gctaaaaatattaaggatgaatctgtgaacaaactc 34893459  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  34893458 acaatatccatgttaatagcataaaacaacaaagtactaaagcctacacatatgacta 34893401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 38649027 - 38649178
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  38649027 aaaacaaaagatattcattcattcaaattagtagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactc 38649120  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || |||| |||||||||    
T  38649121 acaacatccatgttaatagcaaaaaacggcaaagtactaaagcttacacatatgacta 38649178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7986337 - 7986207
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||      |||||| | | |||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  7986337 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtagatcgatataata------caaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaggctc 7986244  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7986243 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtac 7986207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40477152 - 40477001
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||     ||||||| | |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| | |||     
T  40477152 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagaacatc-----aatataa-tgcaaattcacttaaaacaaaaaggatgaatctgtgaatagacta 40477059  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||    
T  40477058 acaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacaaatgtctacacatattacta 40477001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 10624248 - 10624093
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  10624248 aaaataaacgatattcattcatttaaattgattatgtacatcgatacaagacaaattaaaagttgttaaaaacaaaa-ggatgaatctgcaaacaaactc 10624150  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    ||| |||| |||||||  | || ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  10624149 acatcatccatgttaaacagattaaacgacaaagtacatatgtctacaaatacgact 10624093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 515
Target Start/End: Original strand, 34594242 - 34594342
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  34594242 caaattcgctaaaaacaaaaatgattaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtgcatatgcctacaaacatgact 34594341  T
Q  515 a 515  Q
    |    
T  34594342 a 34594342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24470850 - 24470698
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||       |||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||  ||    
T  24470850 aaaataaaagatattcattcatttaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaataaaaaaggatgaatctgtgaacaggct 24470757  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  24470756 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgccttcacatatgacta 24470698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24475798 - 24475646
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||       |||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||  ||    
T  24475798 aaaataaaagatattcattcatttaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaataaaaaaggatgaatctgtgaacaggct 24475705  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  24475704 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgccttcacatatgacta 24475646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39707734 - 39707584
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||  ||| ||| | ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39707734 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtggatcaatacaatacatatcgaaagtcgctaaaaatgaaaaggatgaatctgcgaacaaactc 39707635  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaata 509  Q
    ||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  39707634 acagcatccatg-taatagcacaaaacggcaaagtatatatgcatacaaata 39707584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 772888 - 772737
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||| |||    
T  772888 aaaacaaatgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatac------aatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaagctc 772795  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  772794 acaatatccatgttaatagtataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgacta 772737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37400043 - 37399892
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||      | | |||||||||  | | ||| |||||||| ||||    
T  37400043 aaaataaattatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatataatgtaaattc------gctaaaaacaaaaaagctaaatttgtgaacagactc 37399950  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  37399949 acaacatctatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgacta 37399892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 46918844 - 46918693
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||       |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  46918844 aaaataaattatattcattcattcaaattaacagagtatatcgatacaatg------caaattcgataaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactc 46918751  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||    
T  46918750 acagcatacatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagcctatacatatgacta 46918693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 362 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6622846 - 6622733
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  6622846 taaacgatattcattcattcaaactgatagaatatatcgatacaatacaaatacaaaattgttcaaaataaaaaccatgaatctgcaaacaaactcacaa 6622747  T
Q  462 catctatgttaata 475  Q
    ||||||||| ||||    
T  6622746 catctatgtaaata 6622733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37714930 - 37714773
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||| |     |||| ||||  ||||||| || ||||||||||    
T  37714930 aaaataaacgatattcattcatttaaattgaccgagcacattgatacaatacaaattcaaagttaagaaaaataaaaaagatgaatatgcgaacaaactc 37714831  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||   | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  37714830 acaacatccatgtaaataacataaaacaaaagagtatatatgcctacaaatatgacta 37714773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 395 - 515
Target Start/End: Original strand, 6646301 - 6646421
Alignment:
Q  395 acatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||    
T  6646301 acatcgatacagtacaaattcaaactcggtaaaaacaaaaatgatgaatcgacgaataaactcacaacatccatgttaatagcataaaatggtagagtac 6646400  T
Q  495 ttatgcctacaaatatgacta 515  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  6646401 atatgcctacaaatatgacta 6646421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 361 - 484
Target Start/End: Original strand, 35141335 - 35141452
Alignment:
Q  361 ataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaca 460  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       |||||||| | |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35141335 ataaatgatattcattcatttaaactgatagagtacatcgatacaatg------caaattcgcttaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcaca 35141428  T
Q  461 acatctatgttaataacataaaac 484  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  35141429 acatccatgttaataatataaaac 35141452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 46881658 - 46881502
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |  |||||||  ||||||||| | | | |||||||||  || |||| ||||||||||||     
T  46881658 aaaataaacgatgttcattcatgtaaattgattgagtactttaatacaatgcaaattcaaaattgctaaaaacaaaaatgacgaatttgtgaacaaactt 46881559  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
      |||||| |||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  46881558 gtaacatccatgttaatagtataaaacgacatagtacatatgcctataaatatgact 46881502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 556 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 38277105 - 38276993
Alignment:
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||    
T  38277105 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcat------tgatcggatttgaacttgctcaaagctaatatttcaacatgaatcaaataaacattgcactaaga 38277012  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacac 674  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  38277011 cgggaaataaaaaacacac 38276993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 2532366 - 2532235
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||      |||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| | |    
T  2532366 attcaaattgatagagtacatcgatgtaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactcacaacatgcatgttaaaagc 2532273  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  2532272 ataaaacggaaaagtacattagcctacaaatataacta 2532235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22751831 - 22751696
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||   || ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22751831 attcactcaagtttatagagtacatcgatacaatataaattc------gttaaaaacaaacaagacgaggctgcgaacaaattcacaacatctatgttaa 22751738  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||    
T  22751737 taacataaaacggtaaagtacaaaagcctacacatatgacta 22751696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 38277263 - 38277157
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||  | |||||||||  ||||||||||  ||||||||     
T  38277263 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacgatataaatcccaagtccctaaaaacaaaaatgatgaatctgctaacaaactt 38277164  T
Q  458 acaacat 464  Q
    |||||||    
T  38277163 acaacat 38277157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39090533 - 39090382
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||   ||||||      | | |||||||||  ||||||| ||||||||| |||    
T  39090533 aaaataaatgatattcattcattcaaattgataaagtacgttgatacaaggaaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaacctc 39090440  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  39090439 acaatatccatgttaatatcataaaatggcaaagtactaaagcctacacatatgacta 39090382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 495
Target Start/End: Original strand, 41748216 - 41748327
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||      | | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  41748216 attcaaattgatatagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacgaaaaggataaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagc 41748309  T
Q  478 ataaaacggcaaagtact 495  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41748310 ataaaacggcaaagtact 41748327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 455
Target Start/End: Original strand, 14657576 - 14657673
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14657576 aaaataaaagatattcattaattcaaattgattaagtacattgatacaatacaatttcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaataaac 14657673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 19895353 - 19895483
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |  |||    
T  19895353 aaaataaaaaatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaataggctc 19895446  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19895447 acaacatccatgttaatagcataaaacggcacagtac 19895483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 25854881 - 25855031
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaac-aaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||  ||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||| |||    
T  25854881 aaaacaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgat--------aatgtaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatctgtaaacagact 25854972  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||   ||| |||| |||||||||    
T  25854973 cacaacatccatgttaatagcataaaacaacaaagtacaattgcttacacatatgacta 25855031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 37890159 - 37890289
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||   ||||||| || ||||||||||    
T  37890159 aaaatcaatgatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatacaatg------caaattcgttaaaaacaaataagatgaatttgcgaacaaactc 37890252  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||| |||| ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  37890253 acatcatccatgttgacaacataaaacggaaaagtac 37890289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42491134 - 42490997
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||       |||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  42491134 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgacataatg------caaattcgctaaaaacaaaa-ggataaatttgtgaacaggctcacaacatccatgt 42491042  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||    
T  42491041 taatagcataaaacggcaaagtacaaatgtctacacatattacta 42490997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40775709 - 40775561
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | |||| ||   |||||||| ||||||||  |||    
T  40775709 aaaataaaagatattcattcatccaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaaaaa---ggatgaatatgtgaacatgctc 40775619  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||    
T  40775618 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgacta 40775561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 416 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43483981 - 43483882
Alignment:
Q  416 aaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  43483981 aaattcgctaaaaacgaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtattaaagcctacacatatgacta 43483882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Original strand, 5024787 - 5024876
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| |||| | ||||||| || ||||||    
T  5024787 aaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcatgaaacgacaaaatactaaagcctacacatttgacta 5024876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Original strand, 14733797 - 14733885
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  14733797 aaaacaaaaaggataaat-tgtgaacaaactcacgacatccatgttaatagcataaaatggcaaagtgcataagcctacaaatatgacta 14733885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 451 - 504
Target Start/End: Original strand, 27704833 - 27704886
Alignment:
Q  451 caaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctac 504  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27704833 caaactcacaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacatatgcctac 27704886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 35134871 - 35135000
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||       | |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35134871 aaaataaatgatattcattcattcaaatcaatatagtacatcgatacaatgcaaattcac------taaaaataaaatg-atgaatctgcgaacaaactc 35134963  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  35134964 acaacatccatactaataacataaaacgacaaagtac 35135000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 35362777 - 35362906
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||       |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  35362777 aaaattaaagatattcattcatttaaattgatagagtatatcgatacaatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaataaactc 35362870  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  35362871 acaaaatccatgttaatagca-aaaacggctaagtac 35362906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 481
Target Start/End: Original strand, 7765532 - 7765656
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaa-ttgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   | |||| |||  |||| ||| || ||||||| |    
T  7765532 aaaataaacgatattcattaattcaaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaagtatctaaaaataaataggataaatatgcgaacaaatt 7765631  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataa 481  Q
    ||||||||| || |||||| |||||    
T  7765632 cacaacatccatattaatagcataa 7765656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 645
Target Start/End: Original strand, 14657693 - 14657794
Alignment:
Q  538 gaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaa 637  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||      ||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  14657693 gaatactcatgtctccggatctgcaacattgatgacgccaaagtca------ttgatcgaatatgcatttgctcaaagttaatctttcaatctgaatcaa 14657786  T
Q  638 ataaacac 645  Q
    ||||||||    
T  14657787 ataaacac 14657794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 14708011 - 14707876
Alignment:
Q  372 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtt 471  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||       | ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14708011 tcattcattcaaaatgatagagtacattgatacaatacaaattcac------taaaaacaaaaaggatgact-tgtgaacaaactcataacatttatgtt 14707919  T
Q  472 aataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| | |||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  14707918 aat-atataaaatggcaaagtacaaaagcctacacatatgacta 14707876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 454
Target Start/End: Original strand, 15017112 - 15017204
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaa 454  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |  ||||||||| ||||||||    
T  15017112 taaacgatatttattgattcaaattgataaaatacatcgatacaatacaaattcaaattcgttaaaaataataatgatgaatctatgaacaaa 15017204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 493
Target Start/End: Original strand, 22379378 - 22379507
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||       || |||||||||  |||||||||  |||||| |||    
T  22379378 aaaataaatgatatacatccattcaaattgataaagtacatcgatgcaatgtaaattct------ttaaaaacaaaaaagatgaatctaagaacaatctc 22379471  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagta 493  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22379472 acaacaaccatgttaatagcataaaacggcaaagta 22379507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 460
Target Start/End: Original strand, 45949360 - 45949455
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||       ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  45949360 aaaacaaacgacattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacgaa-------tcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacaaactc 45949452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 6496126 - 6496071
Alignment:
Q  589 attgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaaca 644  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6496126 attgatcggatctgcacttgttcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaaca 6496071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 8611292 - 8611444
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaa-ct 456  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       ||||| || | | ||||||| |||||||| ||||| |    ||    
T  8611292 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaatacgctaagaacaaaaaggatgaatatgtgagcctggct 8611385  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  8611386 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatacctacacatatgacta 8611444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20206248 - 20206157
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaa 453  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |   | ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  20206248 taaacgatattcattcattcaaattgacagagtacatcgatacaacacaaattcaaagtatctaaaaacaaaaagaatgaatctgcgaacaa 20206157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 512
Target Start/End: Original strand, 26638365 - 26638436
Alignment:
Q  441 aatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  26638365 aatctgtgaataaactcacaacatccatgttattatcataaaacgacaaagtccttatgcatacaaatatga 26638436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 417
Target Start/End: Original strand, 34871153 - 34871208
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaa 417  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34871153 taaacgatattcatttatacaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaa 34871208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 5238190 - 5238100
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacca 676  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  5238190 gtcattgattgaatctgcatttggttaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaataccgcaccaagacgggaaatcacaaacacacca 5238100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 32312966 - 32312916
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata 408  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312966 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata 32312916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 464
Target Start/End: Original strand, 38338855 - 38338944
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacat 464  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||    
T  38338855 attcgttcaaatagatagaata-atcgatacaatataaattcaaagttgttaaaaacaaaaagaatgaatatatgaacaaactcacaacat 38338944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 43806819 - 43806970
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||   ||    
T  43806819 aaaataaattatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaagaatgatgaatctgtgaacaggatc 43806912  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||  |||| |||| |||||||||    
T  43806913 acaacatccatgttaatagtataaaacggcaagatacaaatgcttacacatatgacta 43806970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 404
Target Start/End: Original strand, 48643481 - 48643527
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatac 404  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48643481 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac 48643527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4028607 - 4028498
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||| | ||| |||| |||| |||| ||| ||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  4028607 ttcatttattcaaattaataaagtatattgatacaatataaatttaaaatagttaaaaataaaaaggattaatttgcaaacaatctcacaatatctatgt 4028508  T
Q  471 taataacata 480  Q
    ||||||||||    
T  4028507 taataacata 4028498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 17223370 - 17223281
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  17223370 gtcattgatcagatctgcgcttaatcaaagctagtctttctacctgaatcaaataatcatcgcactaagacaggaaatcaaaagcgcacc 17223281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 23732063 - 23732192
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||      ||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23732063 aaaataaatgatattcattcatttaaattgataaagtacattgatataatgtaaattc------gtcaagaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactc 23732156  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  23732157 ac-acatcaattttaatagcataaaacgacaaagtac 23732192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 668
Target Start/End: Original strand, 27050360 - 27050429
Alignment:
Q  599 tctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  27050360 tctgcatttgctcaaagctaatctttcgacatgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaataaaaa 27050429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 431 - 515
Target Start/End: Original strand, 39544776 - 39544860
Alignment:
Q  431 aaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  39544776 aaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaatatccatgttaataacataaaatcgcacagtacctatacctaaaaatttgacta 39544860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 358 - 475
Target Start/End: Original strand, 39989844 - 39989963
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaa--acaaaatggatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | | | |||  | |||| ||||||| |||  ||||| |    
T  39989844 aaaataaatgatattcatgcattcaaattgatagagtacgtcaatacaatataaatttaaagttgctaaaaataaaaaaaggatgaacctgcaaacaagc 39989943  T
Q  456 tcacaacatctatgttaata 475  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  39989944 tcacaacatccatgttaata 39989963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5436307 - 5436140
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaatt--cgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||| ||| || |||| |||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||   |||| |||| |||||||||| ||||||||     
T  5436307 aaaataaatgatatttattctttcaaattaaaagagtacattgatagaatataaattcaaacttacgaagaaaaaaaaaaggatgaatctttgaacaaat 5436208  T
Q  456 tcacaacatctatg--------ttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||| ||         |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5436207 tcacaacatcgatccatgttaattaatagcataaaatggcaaagtatctatgcctacaaatatgacta 5436140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 14762467 - 14762352
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |  |||||| |  ||||||| ||  |||||||||| |||||| || ||||    
T  14762467 attcattcaaattgatagattacattgatactatacaaattcaaagtcgctataaacaacacagatgaatttgcaaacaaactcataacatccattttaa 14762368  T
Q  474 taacataaaacggcaa 489  Q
    || |||||||| ||||    
T  14762367 tagcataaaactgcaa 14762352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 25531674 - 25531623
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25531674 tgcacttgctcaaagctaatcattcaaccttaatcaaataaacaccgcacta 25531623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 36350561 - 36350482
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  36350561 caaattcgtaaaaaataaaaaggatgaatttgtgaacaacctcacaacatccatgttaatagcataaaatgacaaagtac 36350482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 37593333 - 37593274
Alignment:
Q  609 ctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  37593333 ctcaaagctaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagacgggaaataaaaa 37593274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17222546 - 17222411
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||    
T  17222546 attcattcaagttgatagagtacatggatataata-aaattgaaagtcattaaaaacaaaaaggatgaatctggaaacatactcacatcatccat-ttaa 17222449  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    || ||| |||||  |||||| |||||| || ||||||||    
T  17222448 tagcat-aaacgaaaaagtatttatgcatataaatatga 17222411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 509
Target Start/End: Original strand, 26771187 - 26771336
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtaca--tcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcac 459  Q
    |||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||| ||  |||||||||||    
T  26771187 taaatgatattcattcatttaagttgatagagtatactttgatacaatataaattcaaagtcggtaaaaacaaaaatgatgaatatgcaaacaaactcac 26771286  T
Q  460 aacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaata 509  Q
    || ||  |||||| ||| ||||||| ||  | ||  ||||||||||||||    
T  26771287 aatattcatgttattaaaataaaacagctgaatatctatgcctacaaata 26771336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 464
Target Start/End: Original strand, 33901983 - 33902089
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaa-ttcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || || ||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  33901983 aaataaacgatattcattcacttaaattgatagaatatattgatacaatacacattcaaaggtcgttaaaaacaaaaaggattaatttgcgaataaactc 33902082  T
Q  458 acaacat 464  Q
    |||||||    
T  33902083 acaacat 33902089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6496257 - 6496169
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  6496257 aaaacaaaagggatgaacatgcgaacaaactcacaacatc-atgttaataacattaaacagtaaactacgcatgcccacaaatatgacta 6496169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16273826 - 16273777
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaat 407  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16273826 aaaataaaagatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaat 16273777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 47296134 - 47296027
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattca-aattga---tagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaa 453  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||  ||| | | | |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  47296134 aaaataaacgatattcattccttcataattgacggtagagtacatcaatacaatataaataaaaagttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgggaacaa 47296035  T
Q  454 actcacaa 461  Q
    ||||||||    
T  47296034 actcacaa 47296027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 17230489 - 17230413
Alignment:
Q  438 atgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||   ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  17230489 atgaatctgcgaacaacctcacaacatccatgttaatagcataaaatcacaacgtatttatgcctacacatatgact 17230413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 25308813 - 25308670
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| | || || |||||||||||| ||||||   ||| |||  ||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  25308813 aaataaacgatatttattcattcgaattgatatattatattgatacaatataagttcaaagctgtttaaatgaaaat-gatgaatatacgaacaaactca 25308715  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgccta 503  Q
    ||| ||  ||||||||| ||||||||| || | || |||||||||    
T  25308714 caaaattcatgttaatagcataaaacgacatattatttatgccta 25308670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 32521774 - 32521826
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  32521774 ggatgaatttgtgaacaaactcacaacatccaagttaataacatataacggca 32521826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 35306166 - 35306289
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaa-caaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatg 469  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||  |||| | || ||||||  ||||||||||||  ||| |||    
T  35306166 ttcattcattcaaattaatagagcacatcgatacaata-aaatttaaagtggttaaaaataaaaaagaataaatctgcaaacaaactcacactatccatg 35306264  T
Q  470 ttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||    
T  35306265 ttaatagtataaaacggcagagtac 35306289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 274
Target Start/End: Original strand, 42604250 - 42604318
Alignment:
Q  206 ttatggtccattagttgaataattgtagatgattaaaatgaaataaatacatgtaggttagtagaaaaa 274  Q
    ||||||||| |||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42604250 ttatggtccgttagttgattagccgtagatgattgaaatgaaataaatacaggtatgttagtagaaaaa 42604318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 43398771 - 43398687
Alignment:
Q  400 gatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaac 484  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||   |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  43398771 gatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaataaaatagatgaatctaccaacaaactcataacattcatgttaataacataaaac 43398687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 37714713 - 37714634
Alignment:
Q  589 attgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||    
T  37714713 attgattgaatctgcacttgatcaaaattaatctttcaacctgaatcaaataaacattgcactaagacggaaaataaaaa 37714634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2407818 - 2407760
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtactta 497  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||    
T  2407818 tgaatctgcgaacaaactcacaacacctatgttagtagcatacaacggcaaaatactta 2407760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 603 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 22493254 - 22493205
Alignment:
Q  603 cacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22493254 cacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaagatcgcacta 22493205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 419
Target Start/End: Original strand, 24533554 - 24533615
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaat 419  Q
    |||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  24533554 aaaataaaagatatttattcaatcaaattgatagagtacatcaatataatacaaattcaaat 24533615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 46339286 - 46339237
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  46339286 ggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacg 46339237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 406
Target Start/End: Original strand, 15123672 - 15123720
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 406  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15123672 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtagatcaatacaa 15123720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17611684 - 17611648
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17611684 aaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 17611648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 28407719 - 28407755
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28407719 aaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 28407755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 32083679 - 32083623
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32083679 aaaataaatgatatttattaattcaaattgatagagtacgtcgatacaatacaaatt 32083623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 418
Target Start/End: Original strand, 33095791 - 33095851
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaa 418  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||  |||||||||    
T  33095791 aaaataaacgatattcattcattcaaatcgataaaatacatcgatataattcaaattcaaa 33095851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 483
Target Start/End: Original strand, 43451649 - 43451753
Alignment:
Q  379 ttcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataaca 478  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| ||    |||||||||  |||||||  || ||||||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  43451649 ttcaaattgatagagtacatggatatattacaaattcaaagtcaccaaaaacaaaaacgatgaatacgtaaacaaactcacattatccatgttaatatca 43451748  T
Q  479 taaaa 483  Q
    |||||    
T  43451749 taaaa 43451753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 46881415 - 46881327
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||| | || || ||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  46881415 tcattgattgaatttgaacttgatcaaaactaatatttcaacctaaatcaaataaacattgcactaagacggaaaatcaaaaacacacc 46881327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 9137625 - 9137558
Alignment:
Q  606 ttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcaca 673  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||    
T  9137625 ttgctcaaaactaatctttcaaactgaatcaaataaacattgcgctaagacgggaaataaaaaacaca 9137558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 9934115 - 9934076
Alignment:
Q  545 catgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9934115 catgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaagtcat 9934076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 20116812 - 20116769
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  20116812 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 20116769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 21266621 - 21266570
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  21266621 gatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggca 21266570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 24699104 - 24698997
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaac-aaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||  || ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||  | ||||| |||| | |||||| ||| ||||||||    
T  24699104 aaaataaacgaaatttattcattaaaattaatagaatacatcgataaaatttaaattcaaaatcactaaaaacaaaaaagaatgaatatgtaaacaaact 24699005  T
Q  457 cacaacat 464  Q
    || |||||    
T  24699004 cataacat 24698997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31703487 - 31703363
Alignment:
Q  538 gaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaa 637  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||      |||| | || | |||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31703487 gaatacttatgccttcagatctgcaacattgacgacatcaaaatcat------tgattgtatatacacttattcaaagctaatctttcaatctgaatcaa 31703394  T
Q  638 ataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||| ||  ||||| ||||| |||||||||    
T  31703393 ataaatactacactaagacggaaaatcaaaa 31703363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 490
Target Start/End: Original strand, 34899475 - 34899526
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  34899475 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaa 34899526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 38799004 - 38798953
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  38799004 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataagacggcaaa 38798953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 584
Target Start/End: Original strand, 45949513 - 45949560
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45949513 ggaatagtcatgcctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 45949560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 8319760 - 8319641
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||       | | |||||||| | |||||||||  ||||||| |||||| | ||||    
T  8319760 aaaacaaatgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgata------tagtgcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaatagactc 8319667  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    |||  ||| ||||||||| |||||||    
T  8319666 acagtatccatgttaatagcataaaa 8319641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 412
Target Start/End: Original strand, 10037921 - 10037975
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaa 412  Q
    ||||||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10037921 aaaataaaatatattcattctttcaaattgatagaatacattgatacaatataaa 10037975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 539 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 10624076 - 10623977
Alignment:
Q  539 aatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaa 638  Q
    ||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||| ||||||||      |||| | || || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10624076 aatactcatgttttcgaatctacaacgttgacgacacaaaagtcat------tgattgaatttgtacttgatcaaagctaatctttcaacttgaatcaaa 10623983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 437 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25531825 - 25531747
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| |  || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  25531825 gatgaatttgcgaacaaaccaacaacatccatgttaatagcataaaccaacagagtatctatgcctacaaatatgacta 25531747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 35261539 - 35261477
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||||||    
T  35261539 aaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaatatccaagttaatagcatacaacggca 35261477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 395
Target Start/End: Original strand, 15670465 - 15670502
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagta 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15670465 aaaataaacgatattcattcattcaaattgattgagta 15670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 17611633 - 17611584
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaata 475  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  17611633 aaaacataagggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaata 17611584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23274363 - 23274322
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23274363 aacaaattcacaacatcaatgttaataacataaaatggcaaa 23274322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23274445 - 23274404
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23274445 aacaaattcacaacatcaatgttaataacataaaatggcaaa 23274404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23274527 - 23274486
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23274527 aacaaattcacaacatcaatgttaataacataaaatggcaaa 23274486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23274609 - 23274568
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23274609 aacaaattcacaacatcaatgttaataacataaaatggcaaa 23274568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23303835 - 23303794
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23303835 aacaaattcacaacatcaatgttaataacataaaatggcaaa 23303794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24495392 - 24495335
Alignment:
Q  96 atctccgaaacacttgttaaggaaatataaaagaaaatattctc-tgaaaattgtgta 152  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24495392 atctccgaggcacttgttaaagaattataaaagaaaatattatcttgaaaattgtgta 24495335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35133253 - 35133212
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35133253 aaaataaaggatattcattcattcaaattgatagaatacatc 35133212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 399
Target Start/End: Original strand, 37837254 - 37837295
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37837254 aaaacaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 37837295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40658054 - 40658009
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgata 403  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40658054 aaaataaattatattcattcattcaaattgatagggtacatcgata 40658009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 433536 - 433580
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  433536 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 433580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 2843237 - 2843285
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  2843237 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 2843285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 485
Target Start/End: Original strand, 7640621 - 7640669
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  7640621 gatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg 7640669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 9977011 - 9977047
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9977011 aaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatc 9977047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 12141108 - 12141144
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12141108 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 12141144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 14627875 - 14627923
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  14627875 atctttcaatatgaatcaaataaacaccgtactaagacgagaaatcaaa 14627923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 17222845 - 17222897
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||||    
T  17222845 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttactagcatataacggca 17222897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 25255447 - 25255399
Alignment:
Q  442 atctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||    
T  25255447 atctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatacaacgacaaa 25255399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 25286989 - 25287025
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25286989 aaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatc 25287025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 28044557 - 28044593
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28044557 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 28044593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 31481888 - 31481924
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31481888 aaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 31481924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35261582 - 35261554
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261582 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 35261554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 537 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 39707564 - 39707456
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatca 636  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||   |||||||||      |||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| |    
T  39707564 ggaatactcatgtctccggatatgcaacgttaatgatgtcaaagtcat------tgattggatctgcacttgctcaaagttaatacttcaacttgaat-a 39707472  T
Q  637 aataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||| ||||||    
T  39707471 aataaacactgcacta 39707456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 46700324 - 46700288
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46700324 aaacgatattcattcattctaattgatagagtacatc 46700288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 46822247 - 46822195
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  46822247 ggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggca 46822195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 48061712 - 48061676
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48061712 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 48061676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 191)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 13701665 - 13701975
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13701665 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctttgaacaaactc 13701764  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  13701765 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccaaa 13701864  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13701865 tctgcaac-ttaacgacaccaaagtcattgtcattgatcagatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaggac 13701963  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||||    
T  13701964 gggaaatcaaaa 13701975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 14585928 - 14585610
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14585928 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgagcaaactc 14585829  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  14585828 acggcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactgtattcatgtctccggaatactcatgtctccaga 14585729  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14585728 tctgcaatgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctgatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 14585629  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  14585628 gggaaatcaaaaacacacc 14585610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 40012935 - 40013253
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40012935 aaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgatcaaactc 40013034  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||    
T  40013035 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaacgtacatatccctacaaatatgactaatttgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgga 40013134  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  40013135 tctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgattgaatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagat 40013234  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  40013235 gggaaatcaaaaacacacc 40013253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 49627767 - 49628076
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  49627767 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaatggatgaatttgtgaacaatccc 49627866  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  49627867 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctctggaatactcatgtctccgga 49627957  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49627958 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctaaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 49628057  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  49628058 gggaaatcaaaaacacacc 49628076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 53155093 - 53155404
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  53155093 aaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaatgaataatctgtgaacaaactc 53155192  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  53155193 acaacatccatgttaatagcgtaaaaaggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtcttcggaatactcatgtctccgga 53155292  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  53155293 tctgcaaagttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagac 53155392  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    || |||||||||    
T  53155393 ggaaaatcaaaa 53155404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 22485432 - 22485113
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcatt-cattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22485432 aaaataaacgatattcatttcatttaaattgatacaatacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaatggatgaatctatgaacaaact 22485333  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccag 555  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||| | |    
T  22485332 cacaacatccatgttcatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatacttatgtcttcgg 22485233  T
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22485232 atctgcaacgttgaggacgccaaagtcattgtcattgaccggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 22485133  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  22485132 cggaaaatcaaaaacacacc 22485113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 48855343 - 48855032
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  48855343 aaaataaacgatattaattcattcaaattgatagagtacatcgaaacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaataaactc 48855244  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||    
T  48855243 acaacatccatgttaataacataaaacggcaatgtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctccgga 48855144  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  48855143 tctgcaacggtgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacatgaatcaaataaacaccacactaagac 48855044  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    || |||| ||||    
T  48855043 ggaaaataaaaa 48855032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 1074557 - 1074875
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1074557 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 1074656  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||||| | || || ||||||||||||||||| ||    
T  1074657 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtaaatatgtctacaaatatgactaacatgattatattcaagtctccggaatactcatgtctccgga 1074756  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||    
T  1074757 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataatcactacactaagac 1074856  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  1074857 gggaaatcaaaaacacacc 1074875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 358 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 53403087 - 53402771
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  53403087 aaaattaacaatattcatgcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaacta 53402988  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||    
T  53402987 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttaccaacatgattaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctctgga 53402888  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  53402887 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacagcgcactaagac 53402788  T
Q  657 gggaaatcaaaagcaca 673  Q
    |||||||||||| ||||    
T  53402787 gggaaatcaaaaacaca 53402771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 36691462 - 36691780
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||| ||| |||| ||| ||||| ||| |||    
T  36691462 aaaataaacgatattcattcattcaaatcgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacgaaaaggataaatttgtgagcaacctc 36691561  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||    
T  36691562 acaacatctatgttaataacataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccaga 36691661  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  36691662 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcgaatatgcacttgcgcaaagttaatctttcaacctggatcaaataaacaccgtactaagac 36691761  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || |||| |||| ||||||    
T  36691762 ggaaaataaaaaacacacc 36691780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 11819550 - 11819231
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttc--aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |   ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11819550 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctataaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaac 11819451  T
Q  456 tcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctcca 554  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||| |     
T  11819450 tcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaa-gtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtcttcg 11819352  T
Q  555 gatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagg 654  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11819351 gatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgttattgatcggatatgctcctgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaag 11819252  T
Q  655 acgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  11819251 acgggaaataaaaaacacacc 11819231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 54706395 - 54706696
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  54706395 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgttacaatacaaatccatattcgctaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaactc 54706494  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||| |||    
T  54706495 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccggat 54706578  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54706579 ctgcaacgttgacgacgccaaagccattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaggtaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 54706678  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  54706679 ggaaatcaaaaacacacc 54706696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 364 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 39610667 - 39610366
Alignment:
Q  364 aacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaaca 463  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||       
T  39610667 aacgatattcattcattcaaattaatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcaca--- 39610571  T
Q  464 tctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgca 562  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||| ||  |||| ||    
T  39610570 tccatgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctccgaagtactcatgtcaccgaatctaca 39610471  T
Q  563 acgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaa 662  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  39610470 acattgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaatctaaatcaaataaacaacgtactaagacgagaaa 39610371  T
Q  663 tcaaa 667  Q
    |||||    
T  39610370 tcaaa 39610366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 31270775 - 31270474
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31270775 aaaatatacgatatttattcattcaaatggatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 31270676  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||                |||||||||| |||    
T  31270675 acaacatccatgttaattgcatacaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgattaatatgactatat----------------tcatgtctccggat 31270592  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31270591 ctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcgaataaacaccgcactaagacg 31270492  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  31270491 ggaaatcaaaaacacacc 31270474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 374 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 35175157 - 35174858
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  35175157 attcattcaaattgatatagtac-tcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaggaatgaatttgtgaacaaactcacatcatccatgttaa 35175059  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacga 572  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  35175058 tagcataaaacgacaaagtacttatgcctacacatatgactagtatgactatattcatgtctccagaatactcatgtctccatatctgcaacgttgatga 35174959  T
Q  573 caccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcac 672  Q
    | |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  35174958 cgccaaagtcattgtcattgatcaaatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaagcaaaaacac 35174859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 33637860 - 33637551
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33637860 aaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 33637761  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||         |||||||| | || || ||||| ||||||||| | ||    
T  33637760 acatcatccatgttaatagcataaaatggcaaggtacctatgcctacaaatatg---------actatattcaagtctccggaatcctcatgtctacgga 33637670  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  33637669 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattttcattgatcggatctgcttttgttcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagac 33637570  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  33637569 gggaaatcaaaaacacacc 33637551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 40883538 - 40883847
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40883538 aaaataaacaatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 40883637  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||         |||| |||| || | ||||||||||||| | ||    
T  40883638 acatcatccgtgttaatagcataaaacgacaaagtacccaagcctacaaatatgacta---------tattcatgtatccgaaatactcatgtcttcgga 40883728  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  40883729 tctgcaacgtcgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaagaaacaccgcactaagac 40883828  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  40883829 gggaaatcaaaaacacacc 40883847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 55455328 - 55455014
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  55455328 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaagaaggatgaatctgtgaataaactc 55455229  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||         |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||    
T  55455228 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatg---------actatattcatgtctccggaatactcatgtctccgga 55455138  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaa------gtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 650  Q
    ||||||||||| ||||| |||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55455137 tctgcaacgttaacgacgccaaagtcattgtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 55455038  T
Q  651 taggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||| |||||| |||| ||||||    
T  55455037 taagac-ggaaataaaaaacacacc 55455014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 374 - 675
Target Start/End: Original strand, 54238698 - 54238999
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  54238698 attcattcaaattgataaagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacaaccatgttaa 54238797  T
Q  474 taacataaaacggcaaagta-cttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacg 571  Q
     | ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||    |||||||||||||||     
T  54238798 cagcatgaaacggcaaagtaccatatgtctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcgtgtctttgaatctgcaacgttgaca 54238897  T
Q  572 acaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagca 671  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  54238898 acgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctcaaatctaatctttcaacctgaatcaaat--acaccgcactaagacgggaaatcaaaaaca 54238995  T
Q  672 cacc 675  Q
    ||||    
T  54238996 cacc 54238999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 19645656 - 19645347
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  19645656 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaattcaaattcaaattcgctaaaaatgaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 19645557  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||   ||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  19645556 acaacatc-atgttaaaagcataaaacataaaattatcgatgcctacaaatatgactcatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtcttcgga 19645458  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||    
T  19645457 tctgcaatattgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaat-agctccgcactaagac 19645359  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||||    
T  19645358 gggaaatcaaaa 19645347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 24483359 - 24483660
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||| |||| |||| || ||||||||||||||    
T  24483359 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatagaatacaaatccaaattcgctaaaaataaaaaggataaacctgtgaacaaactc 24483458  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||    
T  24483459 acaacatccatgttaatatcataaaacggcaaagtccttatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccagat 24483542  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||   ||||||| || |    
T  24483543 ctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatatttcaacctaaatcaagtaaatgtcgcactaagatg 24483642  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    | |||| |||| ||||||    
T  24483643 gaaaataaaaaacacacc 24483660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 371 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 4082161 - 4081910
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4082161 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaccaaaaaggatgaatctgtaaacaaactcacaacatccatgt 4082062  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttga 569  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||| | | |||||||||||||||    
T  4082061 taatagcataaaacggaaaagtacatatggctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaataatcatgtattcggatctgcaacgttga 4081962  T
Q  570 cgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatc 621  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4081961 cgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgttcaaagctaatc 4081910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 30155953 - 30156262
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  30155953 aaaataaacgatactcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggaagaatatgtgaacaaactc 30156052  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||         |||||||||||||| |||| || | ||||| |||||| || ||    
T  30156053 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtatatatgcctaca---------aatatgactatattcatgtctccgaaatacccatgtccccgga 30156143  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  30156144 tctgcaaccttgacgacgccaaaatcattgttattgatcggatctgaacttgctcaaagctaatttttcaaccagaatcaaataaacaccgcactaagac 30156243  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  30156244 gggaaataaaaaacacacc 30156262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 362 - 675
Target Start/End: Original strand, 31462422 - 31462727
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||    
T  31462422 taaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacaaactcaaaa 31462521  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||| |||||| || | ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  31462522 catccatgttaatagaataaaacggcaaagtacatatgcctaca---------aatatgattatattcatatctctggaataatcatgtctctggatctg 31462612  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  31462613 caccgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacgccgcactaagaccgta 31462712  T
Q  661 aatcaaaagcacacc 675  Q
    ||| |||| ||||||    
T  31462713 aataaaaaacacacc 31462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 48652112 - 48652421
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  48652112 aaaataaatgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaactccaaattcgctaaaaacaaaaagcatgaatctgtgaacaaactc 48652211  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||         |||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||    
T  48652212 acatcatccatgttaatagcataaaacagcaaggtacctatgcctaca---------aatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctccgga 48652302  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  48652303 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattttcattgatcggatctgctcttgttcaaagttaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagac 48652402  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  48652403 gggaaataaaaaacacacc 48652421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 41867996 - 41868297
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41867996 aaaataaacgatatgcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 41868095  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||         |||||||||||||| | || || | ||||||||||||||| |     
T  41868096 acaccatc-atgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgtctaca---------aatatgactatattcaagtctcagaaatactcatgtctccggt 41868185  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | || |||||| | |||    
T  41868186 tctgcaacgttgacgatgctaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaaaatacgccgcacaaagac 41868285  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    || |||||||||    
T  41868286 ggaaaatcaaaa 41868297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 3457388 - 3457087
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  3457388 aaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgcgaacaaactc 3457289  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||                || ||||||  |||    
T  3457288 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatataattaatatgactatat----------------tcttgtctctggat 3457205  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3457204 ctgcaatgttgacgacgccaaaatcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgtactaagacg 3457105  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  3457104 ggaaataaaaaacacacc 3457087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Original strand, 32080426 - 32080734
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  32080426 aaaataaacgatattctttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactc 32080525  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | | |||| ||||||||| ||||||| | ||| |||| || |||||||         |||||||||||||| | || || | ||| ||||||||||| ||    
T  32080526 atatcatccatgttaatagcataaaaagacaaggtacctacgcctaca---------aatatgactatattcaagtctccgaaatcctcatgtctccgga 32080616  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  32080617 tctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatcattcaagctgaatcaaataaacatcgcactatgac 32080716  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacac 674  Q
    | |||||||||| |||||    
T  32080717 gagaaatcaaaaacacac 32080734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 45047963 - 45047662
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  45047963 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacgaaaatgatgaatcagtgaacaaactc 45047864  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||                |||||||| |||    
T  45047863 acatcatccatgttaataggataaaacggcaaagtacatatgcctacatatataactaatatgactatattt----------------atgtctccggat 45047780  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | |    
T  45047779 ctgcaacgttgacgacgccgaagtcattgtcattgatcgaatctgcacttgctaaaagctaatctttcaatctgaataaaataaacaccgcactaaaatg 45047680  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     |||||||||| ||||||    
T  45047679 agaaatcaaaaacacacc 45047662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 362 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 55446510 - 55446219
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  55446510 taaacgatattcattcattcaaattgacagagtatatcgatacaatgcaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaagtcacat 55446411  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| || |||||||         |||||||| | || |   ||||||||||| |||| ||||||    
T  55446410 catctatgttaatagcataaaacagcaaagtatctatgcatataaatatg---------actatattcaagtcttcagaatactcatgactccggatctg 55446320  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  55446319 caacgttgacgacgctaaagtcattgtcattgattggatctgcacttgctcaaagctaatccttcaatctgaatcaaataaaccccgcactaagacggga 55446220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 358 - 673
Target Start/End: Original strand, 105711 - 106014
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||  | | ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  105711 aaaataaacaatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaat-caaagtcactaagaacaaaaaggatgaatctccgaacaaactc 105809  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |  | |    ||| |||||||||||||||||  ||    
T  105810 acatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgact-atataattgaagt----ttccggaatactcatgtctccgaat 105904  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  105905 ctgcaacgttgacgacacaaaa------gtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacacgacactaagacg 105998  T
Q  658 ggaaatcaaaagcaca 673  Q
    |||||| |||| ||||    
T  105999 ggaaataaaaaacaca 106014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 48401558 - 48401268
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  48401558 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 48401459  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||                |||| |||    
T  48401458 acatcatccatgttaatagcatataacagcaaagtacatatgcctacaaatat---------gactatatttatgt----------------ctccggat 48401384  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatcttt-----caacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  48401383 ctgcaacgttgacgacgccaaagtcattatcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatcttttaacctaacctgaattaaataaacaccgcacaa 48401284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 496 - 668
Target Start/End: Original strand, 36624496 - 36624669
Alignment:
Q  496 tatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgat 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  36624496 tatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccagaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgatgccaaagccattgtcattgat 36624595  T
Q  595 cggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36624596 cggatctgcacttgcttaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaatcaaaa 36624669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 4206222 - 4206444
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    ||| ||| | |||||||||||    
T  4206222 aaaataaacaatgttcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatataaatccaaattcgtt-aaaataa----gataaatttatgaacaaactc 4206316  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| |||||||| ||    
T  4206317 acaacatccatattaatagtataaaacggcaaagtacatatgcttacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccgaaatacttatgtctcccga 4206416  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4206417 tctacaacgttgacgacgccaaagtcat 4206444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 362 - 667
Target Start/End: Original strand, 34103425 - 34103720
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||| | |||| |||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  34103425 taaacaatattcattcgttcaaattgatagagtatatcgatataatacaaatttatattcgctaaaaataaagaggatgaat-tgtgaacaaattcacaa 34103523  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||         |||  | || || ||||||||||| |||||  |||||    
T  34103524 catccatgttaatagcacaaaacggcaaagtatttatgactacaaatatgacta---------tatccaagtctccggaatactcatttctccgtatctg 34103614  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34103615 caacgttgacgacgctgaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaa-tctaatctttcgacctgaatcaaataaacaccgcactaaaacggga 34103713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 372 - 676
Target Start/End: Original strand, 19860956 - 19861261
Alignment:
Q  372 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtt 471  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||  | |||| ||   ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  19860956 tcattcattcaagttgataaagtacatcgatacaatgcaaatctaaattcactaaaaaaaa---ggatgaatcagttaacaaacttacaacatccatgtt 19861052  T
Q  472 aataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaata---tgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgtt 567  Q
    |||| |||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19861053 aatagcataaaacggtaaaatatctatacctacaaatatgactaataatatgactatattcaagtctctagaatactcatgtctccggatctgcaacgtt 19861152  T
Q  568 gacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||   ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| |||    
T  19861153 gacgatgtcaaagtcattgtcattgatcgaatatgcacttgctcaaagttaatatttcaacctgaatcaagtaaacattgcactaagactggaaataaaa 19861252  T
Q  668 agcacacca 676  Q
    | |||||||    
T  19861253 aacacacca 19861261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 358 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 38530391 - 38530162
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttca-ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38530391 aaaataaacgatattcaattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaacccaaattttttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaagaaact 38530292  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||                |||||||||| ||    
T  38530291 caaagcatccatgttaataacataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgattatat----------------tcatgtctccgga 38530208  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctg 602  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38530207 tctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctg 38530162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 374 - 627
Target Start/End: Original strand, 4817559 - 4817810
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4817559 attcattcaaattgatagagtacattggtacaatataaattcaaattcgttaaaaacaaaaagcatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaa 4817658  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacga 572  Q
    ||  |||||| || ||||||||||||||    ||||     |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  4817659 tagtataaaatggaaaagtacttatgcc----aata-----aatatgactatattcatgtatccggaatactcatgtcttcggatctggaacgttgacga 4817749  T
Q  573 cacc-----aaagtcatggtcattgatcgga-tctgcacttgctcaaggctaatctttcaa 627  Q
    | ||     |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4817750 cgccaaattaaagtcattgtcattgatcggattctgcacttactcaaagctaatctttcaa 4817810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 358 - 514
Target Start/End: Original strand, 34960592 - 34960747
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  34960592 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagac-acatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtaaacaaactc 34960690  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34960691 acagcttccatgttaataacataaaacggcaaaatacttatgcctacaaatatgact 34960747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 372 - 571
Target Start/End: Original strand, 51990558 - 51990752
Alignment:
Q  372 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||| |      |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  51990558 tcattcattcaaattgatagagtacattaatacaattcaaatccaaattcgct------aaaagggatgaatttgtgaacaaactcacaacatcaatgtt 51990651  T
Q  472 aataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgac 570  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51990652 aatagcataaaacggaaaagtacctatgcctataaatttaactaatatgactatatttatgtctccagaatactcatgtctccggatctgcaacgttgac 51990751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 358 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 2192544 - 2192413
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2192544 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaattc 2192445  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaa 489  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2192444 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaa 2192413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 426 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 48401234 - 48401017
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactat 525  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||         ||||||    
T  48401234 aaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcatataacagcaaagtacatatgcctacaaatat---------gactat 48401144  T
Q  526 atttatgttctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttc 625  Q
    ||||||||                |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  48401143 atttatgt----------------ctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttt 48401060  T
Q  626 aacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  48401059 aacctgaatcaaataaacaccgcacaaagactggaaattaaaa 48401017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3312889 - 3312736
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  3312889 aaaataaacgaaattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatatc----caaattctctaaaaacaaaaaggttgaatctgtgaacaaagtc 3312794  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3312793 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaaatacctatgcctacaaatatgacta 3312736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 55090362 - 55090498
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  55090362 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacaaactc 55090461  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
     || |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  55090462 ccatcatccatgttaatagcataaaaaggcaaggtac 55090498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 375 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 2148189 - 2147904
Alignment:
Q  375 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaat 474  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||    
T  2148189 ttcattcaaattgatagagtacgttgatacaatataaattcaaagtcactataaacaaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccatattaat 2148090  T
Q  475 aacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgac 573  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||         |||||||| | || |  ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| |||    
T  2148089 agcataaaacggcaaagtacaaatgtctacaaatatg---------actatattcaagtcttcggaatactcatctct-caggtctacaacgttgatgac 2148000  T
Q  574 accaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac-gggaaatcaaaagcac 672  Q
    || |||      |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  2147999 actaaa------gtcattgatcagatctacacttgctcaaagataatc-ttcaactcgaatcaaataaacaccgcactaagacggggaaatcaaaaacac 2147907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 358 - 509
Target Start/End: Original strand, 36623926 - 36624076
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||    
T  36623926 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcggtacaatataaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaat-tgttaacaaaatc 36624024  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaata 509  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  36624025 acaacatccatgttaatagcataaaacggtaaattacatatgcctacaaata 36624076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 537 - 663
Target Start/End: Original strand, 27189247 - 27189373
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatca 636  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27189247 ggaatacttatgtctctagatctgtaacgttgacgacgccaaagtcaatgtcattgatcagatctacacttgctcaaagctaatctttcaacctgaataa 27189346  T
Q  637 aataaacaccgcactaggacgggaaat 663  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||    
T  27189347 aataaacaccgcaccaagacgggaaat 27189373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 33977594 - 33977745
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||| |  |||||||||||      |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  33977594 aaaataaaatatattcattcattcaaattgaaaaggtacatcgata------aaatgcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacagactc 33977687  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||    
T  33977688 acaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatataacta 33977745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22844497 - 22844346
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  22844497 aaaataaatgatattcattcattcgaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattc------gcttaaaacaaaaaggacgaatatgtgaacaaactc 22844404  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  22844403 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtactaaagcctacgcatatgacta 22844346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Original strand, 28994994 - 28995129
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  28994994 attcattcaaatcgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatccatgttaa 28995087  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  28995088 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 28995129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 36540366 - 36540517
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||       | ||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  36540366 aaaataaatgatatccattcattcaaattgatatagtacatcgatacactgaaaattcag------taaaaacaaaaaggttgaatctgtaaacaaactc 36540459  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  36540460 acaacatctatattaataacataaaacggcaaagtactgaagcctacacaaatgacta 36540517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 378 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40797458 - 40797327
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  40797458 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatctatgttaatagc 40797365  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  40797364 ataaaacgacaaagtactaaagcctacacatatgacta 40797327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 50520228 - 50520077
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||| ||||    
T  50520228 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaacagactc 50520135  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  50520134 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgacta 50520077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 3961445 - 3961602
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||  |  ||||||||  ||||||| ||  |||||||||    
T  3961445 aaaataaacgatattcatttattcaaattgataaagtatatcgatacaatacaaattcaaagtcactataaacaaaaatgatgaatttgcaaacaaactc 3961544  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    ||||  ||||||||||||||||||||    
T  3961545 acaacatccatattaataacataaaacgatggagtatatatgcctacaaatatgacta 3961602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 378 - 515
Target Start/End: Original strand, 43897238 - 43897375
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  43897238 attcaaattgatagagtacaataatacaatataaatccaaaattgttcaaaacaaaaaagataaatttgtgaacaaactcaaaacatataggttaataac 43897337  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  43897338 ataaaacaacaaagtacatatacctactaatatgacta 43897375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Original strand, 43839186 - 43839334
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||       | | |||| |||| | ||||||||||||||| ||||    
T  43839186 aaaatagatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaattt------gctaaaaataaaaagaatgaatctgtgaacagactc 43839279  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  43839280 acaacatccatgttaatatcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatga 43839334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 1165065 - 1165216
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  1165065 aaaataaaatatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagactc 1165158  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||    
T  1165159 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgacta 1165216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 19148442 - 19148328
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgtt-cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  19148442 aaaataaacgatatttcattcattcaaattgatagtgtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaattaaaaggatgaatatgtgaacaaact 19148343  T
Q  457 cacaacatctatgtt 471  Q
    |||| |||| |||||    
T  19148342 cacatcatccatgtt 19148328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 20200727 - 20200878
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||      |||||||| | ||||  ||| |||||||| || ||||| ||||    
T  20200727 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataata------caaattcgctaaaaatgaaaaggatgaatatgcgaacagactc 20200820  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  20200821 acaacatccatgttaatagtataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 20200878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 20202909 - 20203060
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||      |||||||| | ||||  ||| |||||||| || ||||| ||||    
T  20202909 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataata------caaattcgctaaaaatgaaaaggatgaatatgcgaacagactc 20203002  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  20203003 acaacatccatgttaatagtataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 20203060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33076730 - 33076579
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |       |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  33076730 aaaacaaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatggtg------caaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagactc 33076637  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  33076636 acaatatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgccaacacatatgacta 33076579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Original strand, 41598139 - 41598293
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |  || ||||||||| | || ||| ||  |||||||||    
T  41598139 aaaataaacgatattcatttatttaaattgatatagtacatcaatacgatacaaattcaaagttattaaaaacaaaaggaattaatatgcaaacaaactc 41598238  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
     ||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41598239 gcaacatccattttaataacataaaatggcagagtacatatgcctacaaatatga 41598293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43030128 - 43029977
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  43030128 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata------taatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctc 43030035  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  43030034 acatcatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacaattgcctacacatatgacta 43029977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 53962568 - 53962275
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| ||| |||  || |||||||   ||||||||   |||||| ||    
T  53962568 aaaatacatgatattcattcattcaaattgatagagtatattgatacattacaaatttaaaatcgg-cagaacaaaaattatgaatctacaaacaaattc 53962470  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||         |||| | || | || |||| ||||||| || ||    
T  53962469 acaacatccatgttaacagtataaaacaacagagtatctatgcctacaaatatgacta---------tattcaagtctttgaaatattcatgtcccctga 53962379  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||| ||||||||| ||      |||||   ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53962378 tctccaacgttgatga------agtcaaaatcaatgattggatctgcacttgctcaaagctaatcttttaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 53962285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Original strand, 22286422 - 22286571
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||       |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||  ||||    
T  22286422 aaataaaagatattcattcattcaa-ttgagagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaggctca 22286514  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  22286515 caacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 22286571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37052030 - 37051888
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||       | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  37052030 ttcattcattcaaattgacagagtacatcgatgcaatacaaattcac------taaaaacaaaaaggatgaatttgtgaaaaaactcacaacatccatgt 37051937  T
Q  471 taataa----cataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37051936 taatatatagcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgacta 37051888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 416 - 515
Target Start/End: Original strand, 913037 - 913136
Alignment:
Q  416 aaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  913037 aaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgacta 913136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11225798 - 11225640
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||| ||| |||| || ||||||| |||    
T  11225798 aaataaacgatattcattcattcaaattgatataatatatcgatacaatagaaatttaaagttgttaaaaacaaaaaggacgaatttgcgaacaaaatca 11225699  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagt--acttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||| || |||  || |||||||||||| |||||||    
T  11225698 caacatttatgttagtagcataagacgacagagtacacatatgcctacaaacatgacta 11225640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4020043 - 4019904
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||   |||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  4020043 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtgcatcgatacaatg------caaattcgcaaaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaactc 4019950  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgccta 503  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||    
T  4019949 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacataagccta 4019904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 510
Target Start/End: Original strand, 38379420 - 38379572
Alignment:
Q  361 ataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaca 460  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  38379420 ataaacgatatttatttattcaaattgataaagtacattgatacaatacaaattcaaagttgttaaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaactcaca 38379519  T
Q  461 acatcta---tgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatat 510  Q
    ||||  |   |||||||| |||||||||| | | ||| || ||||||||||||    
T  38379520 acattcatgttgttaatagcataaaacggaagattacatacgcctacaaatat 38379572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 500
Target Start/End: Original strand, 42167724 - 42167866
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||  | ||||||||  ||||||||     
T  42167724 aaaataaatgatattcattcattcaaattgacagagaatatcgatacaatataaatttaaaattgctaaaaacaaaaatggtgaatctgcaaacaaactt 42167823  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgc 500  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  42167824 acaacaaccatgttaataacataaaacgacagagtacatatgc 42167866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 21084402 - 21084558
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||||||||   |||||||||| |||||| |||    
T  21084402 aaaataaacgatatccattcgttcgaattgatagagtacatcgatacaata-caatacaaattcgctaaaaacaaagatgatgaatctgcgaacaatctc 21084500  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    | | |||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| || |||||||||    
T  21084501 atatcattcatgttaatagcataaaacgacaaaatacttaagcctgcatatatgacta 21084558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 21803976 - 21803826
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21803976 aaaataaaagatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagactc 21803883  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||   |||||||| ||||||||    
T  21803882 acaacatccatgttaatagcatgaaacatcaaagtacaagtgcctacacatatgact 21803826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 51060121 - 51059994
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| | ||| ||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  51060121 aaaataaacgatgtttattcatttaaatcgatagagtaaatcgatagaatacagatttaaagtccttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactt 51060022  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    |||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  51060021 acaacatccacattaataacacaaaacg 51059994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 1806128 - 1806279
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||      |||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  1806128 aaaacaaacgacattcattcattcgaattgatggagtacatcgatttaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatcattgaacaaactc 1806221  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  1806222 acaacatccttgttaatagcataatacggcaaaatacataagcctataaatatgacta 1806279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 3088333 - 3088484
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  3088333 aaaataaaagatatttattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaggctc 3088426  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  3088427 acaacatccatattaatagcataaaacaacaaagtacaaatgcctacacatatgacta 3088484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10977688 - 10977537
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||        || |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  10977688 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatatagtacatcgata------tcatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctc 10977595  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||    
T  10977594 acatcatccatgttaatagcataaaacagcaaagtacaattgcctacacatatgacta 10977537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 29776359 - 29776510
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  29776359 aaaataaatgatattcatttattcaaattgatagagtacattgatacaatg------caaattcgataaaaacaaaaaggatgaatctgcgatcaaactc 29776452  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||  | |||| || |||||||||    
T  29776453 acaacaaccatgttaatagcgtaaaacgacaaagtacaaaagcctgcacatatgacta 29776510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 371 - 516
Target Start/End: Original strand, 32237678 - 32237817
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  32237678 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatg------caaattcgctaacaacaaagaggatgaatctgcgaacaaacacacaacatccatgt 32237771  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaa 516  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||  | ||||||| ||||||||||    
T  32237772 taatagcataaaactgcaaagcacaaaagcctacacatatgactaa 32237817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 378 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 42106563 - 42106433
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  42106563 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattc------gttaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagc 42106470  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    ||||||||  | |||||| |  |||||| ||||||||    
T  42106469 ataaaacgagagagtactaaaacctacacatatgact 42106433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 46732415 - 46732572
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |||| |||  |||  ||| | | ||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  46732415 aaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtgcaatgatgtaatacaaacccaagatcgctaacaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaaccc 46732514  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || | |||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  46732515 acgatatctattttaataacataaaacgacatagcatttatgcctacaaatatgacta 46732572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 50981129 - 50981265
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||| ||| | |||||||||  ||||||| || ||| ||||||    
T  50981129 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatatagtacaaatttaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaataaactc 50981228  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||||| || || |||| | ||||||||| || |||||    
T  50981229 acaacttccatattaaaagcataaaacgacatagtac 50981265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 51084263 - 51084399
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||| ||| | |||||||||  ||||||| || ||| ||||||    
T  51084263 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatatagtacaaatttaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaataaactc 51084362  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||||| || || |||| | ||||||||| || |||||    
T  51084363 acaacttccatattaaaagcataaaacgacatagtac 51084399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 452
Target Start/End: Original strand, 25111832 - 25111926
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaaca 452  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  25111832 aaaataaatgatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatataaattcaaagttattaaaaagaaaaaggatgaatctatgaaca 25111926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27831543 - 27831418
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||       |||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  27831543 aaaataaatgatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatttaa-------ttcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgcgaacaaactc 27831451  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  27831450 acaacatccatgtcaatagcataaaacgacaaa 27831418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31731009 - 31730921
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  31731009 aaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatc-atgttaataacattaaacggtaaactacgcatgcctacaaatatgacta 31730921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 44984528 - 44984685
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| |||| ||  || ||||||||||    
T  44984528 aaaataaacgatatccattcatttaaattgatagagtatattgatacaatacaaattcaaaatctctaaaaacaaaagggataaacatgcgaacaaactc 44984627  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    | | |||| || ||||||  ||||||| | | ||||| |||  |||||||||||||||    
T  44984628 agagcatccatattaatagtataaaacagaagagtacatatatctacaaatatgacta 44984685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 518 - 668
Target Start/End: Original strand, 39429330 - 39429475
Alignment:
Q  518 atgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggc 616  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||   |||||||||      |||| |||| ||||||||||||  ||    
T  39429330 atgactatattcaagtctctagaatactcatgtcttcggatctgaaacgttgacgatttcaaagtcat------tgattggatttgcacttgctcagagc 39429423  T
Q  617 taatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  39429424 taatctttcaacctaaattaaataaacaccacactaagatgggaaatcaaaa 39429475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21586293 - 21586214
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21586293 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatatgaacaaactcacaacatcgatgttaatagcataaaacagcaaagtac 21586214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 361 - 515
Target Start/End: Original strand, 25939168 - 25939316
Alignment:
Q  361 ataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaca 460  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||      ||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  25939168 ataaatgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatac------aatgcaaattcattaaaaataaaaaggatgaatctacgaacaaattcaca 25939261  T
Q  461 acatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| | || |||||||  | ||||||| |||||||||    
T  25939262 acatccatgttgatagcataagatggtaaagtacaaaagcctacacatatgacta 25939316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31550376 - 31550222
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||  || ||||||||  ||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  31550376 aaaataaacgatattcattcatttaaattagtagagtacattgatacggtacaaattcaaggtcgctaaaaacaaataggatgaatctgcgaacaaactc 31550277  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
       ||||| ||||||||| ||||||||| ||   ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  31550276 ---acatccatgttaatagcataaaacgacatcatacatatgcctgcaaatataacta 31550222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 32089600 - 32089751
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||       |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  32089600 aaaataaattatattcattcactcaaattgatagagtacattaatacaatg------caaattcgttaaaaacaaaaacgatgaatctgtgcacaaactc 32089693  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||| | ||| |||||  |||||||| ||||||||  | ||||||| || ||||||    
T  32089694 acaacaaccatgataatagtataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatgtgacta 32089751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 40365650 - 40365539
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataa 476  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  40365650 attcaaattgatatagtacatcgatacaatg------caaattcgttaaaaataaaaaaggatgcatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatag 40365557  T
Q  477 cataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  40365556 cataaaacgacaaagtac 40365539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 40702861 - 40702668
Alignment:
Q  384 attgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaac-aaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaa 482  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||  || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||    
T  40702861 attgatagaatacactgatacaatacaaattcaaaaccgctcaaaaataaaatggatgaatctgcgaacaaacttacatcatccatgttaagagcataaa 40702762  T
Q  483 acggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagt 581  Q
    | | |||||||| ||| | ||||         ||||| |||||||| | || |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  40702761 atgacaaagtacatatccataca---------aatataactatattcaagtctctgaaatactcatgtctcaggatctgcaacattgacgacgccaaagt 40702671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 45664666 - 45664547
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |      ||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||  |||    
T  45664666 aaaataaatgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatgt------aaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtaaacaggctc 45664573  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||    
T  45664572 acaacatccatgttaatagcataaaa 45664547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 51256832 - 51256723
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||  | |||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  51256832 attcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatt-aaagtcaataaaaataaaaatgatgaatctgcaaacaaactcacaatatatatgttaa 51256734  T
Q  474 taacataaaac 484  Q
    ||||| |||||    
T  51256733 taacacaaaac 51256723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Original strand, 47587104 - 47587193
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| || ||||   | |||||||||||||||||    
T  47587104 aaaacaaaatggatgaatctgcgaacaaactcacatcattcatgttaatagcataaaacgacagagtataaaagcctacaaatatgacta 47587193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20252101 - 20251972
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||        || |||||||| | |||||||||  |||||||| |||||||| |||    
T  20252101 aaaacaaatgatattcattcattcaaattgataaagtacatcaata--------atgcaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatatgtgaacagact 20252010  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  20252009 cacaacatccatgttaatagtataaaacggcaaagtac 20251972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 474
Target Start/End: Original strand, 40401206 - 40401306
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||   || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  40401206 attcattcaaattgatatagtacatcgatacaatgcaaatttaatgccgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtaaacaaactcacatcatatatgttaa 40401305  T
Q  474 t 474  Q
    |    
T  40401306 t 40401306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 48212799 - 48212723
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaa 434  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  48212799 aaaataaacaatatttattcattccaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcaaagtcgttaaaaacaaaa 48212723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 54240480 - 54240380
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  54240480 caaattcgctaaaaacaaataggatgaatctgtaaacaggctcacaacatctatgttaatagtataaaacgacaaaatacaaatgcctacacatatgact 54240381  T
Q  515 a 515  Q
    |    
T  54240380 a 54240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 2598522 - 2598372
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |       ||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  2598522 aaaataaatgatattcatgtattcaaattgatatagtacatcgatacaatacaaatcccta-------aaaacaaaaaggatgaatttgcaaacaaactc 2598430  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| ||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  2598429 acaatattcatgttaatagcataacacgacaaagtacaaatgcctacacatatgacta 2598372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 3312681 - 3312618
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgca 649  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3312681 gtcattaataggatctacacttgctcaaagctaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgca 3312618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25084460 - 25084321
Alignment:
Q  373 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| | ||| ||||   ||  ||| ||| ||  |||||||| |||||||  ||||||    
T  25084460 cattcatttaaattgatagagtatattaatacaatacaaattcaaaattgttaaaaatgtaaatgataaatttgcaaacaaacttacaacatgcatgtta 25084361  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25084360 ataacattaaacagcaaaatacatatgcctacaaatatga 25084321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 616 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 37451945 - 37451886
Alignment:
Q  616 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  37451945 ctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagatggaaaatcaaaagcacacc 37451886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 428 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 50460571 - 50460484
Alignment:
Q  428 aacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  50460571 aacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgttaacaacataaaacaacaaagtacaaaagcctacacatatgacta 50460484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11846993 - 11846842
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||      |||| |||||||| | |||| |||| |||||| | ||||||||  ||     
T  11846993 aaaataaatgatattcattcattcaaattgacagagtacatcaata------aaatgcaaattcgctaaaaataaaaaggatgagtatgtgaacaggctg 11846900  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| || ||||||  ||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  11846899 acaacatccattttaatagtataaaacggaaaaatacaaatgcctacacatatgacta 11846842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 464
Target Start/End: Original strand, 28929197 - 28929303
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||| |  ||||||||||    
T  28929197 aaaataaatgatatttgttcatttaaattgatagatcacatcgatataatacaaattcaaattcgttaaaaacaaaaacaatgaatttacgaacaaactc 28929296  T
Q  458 acaacat 464  Q
    |||||||    
T  28929297 acaacat 28929303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Original strand, 29182295 - 29182430
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||| | | |||| ||||  ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  29182295 attcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaatttgctaaaaataaaaatgatgaatctatgaacaggctcacaacatccatgttaa 29182388  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || ||||||| | |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  29182389 tagcataaaatgacaaaatacaaatgcctacacatatgacta 29182430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 47733769 - 47733851
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||| | || |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  47733769 gtcattgattgaatatgcatttgctcaaaactaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaataaaaa 47733851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 464
Target Start/End: Original strand, 7869129 - 7869222
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacat 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| | |||||| ||  | | ||| |||||||||||||| |||||    
T  7869129 ttcattcattcaaattgatagagtatatcgataaaatataaattgaaaatcgctaaaaacagaaaaggtaaatttgtgaacaaactcataacat 7869222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 46926833 - 46926743
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  46926833 attcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagactcacaacatccatgt 46926743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 48212619 - 48212501
Alignment:
Q  538 gaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaa 637  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||| || ||||||||||      |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |    
T  48212619 gaatactcatgtcttcggatctgcaatattgacaacgccaaagtcat------tgattggatctgcacttgctcagagctaatccttcaatctgaatcta 48212526  T
Q  638 ataaacaccgcactaggacgggaaa 662  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||    
T  48212525 ataaacactgcactaagacgagaaa 48212501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 371 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 7658449 - 7658361
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattc-gttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  7658449 ttcattcattcaaattgatatagtacattgatacaatataaatttaaagtcactgaaaaacaaaaaggatgaatctatgaagaaactca 7658361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 426 - 494
Target Start/End: Original strand, 25373825 - 25373893
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25373825 aaaacaaaaaggatgaatctgcgaaaaaactcacaacattcatgttaatagcataaaacgacaaagtac 25373893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 546 - 598
Target Start/End: Original strand, 34960754 - 34960806
Alignment:
Q  546 atgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcgga 598  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34960754 atgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcgga 34960806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 426 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 40716629 - 40716561
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  40716629 aaaataaaatggatgaatttgtgaacaaactcacaccatcaatgttaggagcataaaacggcaaagtac 40716561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 515
Target Start/End: Original strand, 47914313 - 47914413
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||  ||| ||||| | ||||||    
T  47914313 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagcctgacaacatccatgttaatagcataaaatgacaaagtacaaatgtctacacacatgact 47914412  T
Q  515 a 515  Q
    |    
T  47914413 a 47914413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 449
Target Start/End: Original strand, 2522742 - 2522833
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtga 449  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||||  |||||||||||||    
T  2522742 aaaataaacgatattcattcattcagaccgacagagtacattgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtga 2522833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 39340640 - 39340432
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||       |||||||  | ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  39340640 aaaataaataatattcattctttcaaattgatagggtatatcgatacaatg------caaattccctaaaaacaaaaaggatgaatttgcgaacaaactc 39340547  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||||    ||||| |||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||         |||| | || || ||||||| ||||||||| ||    
T  39340546 acaacatct----taatagcataaaacggaaaagtataaaagcctacacatatgacta---------tattcaagtctccggaatacacatgtctccgga 39340460  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||    
T  39340459 tctgcaacgttgacgacgacaaagtcat 39340432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 47733493 - 47733447
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaatt 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47733493 attcattcaaattgacagagtacattgatacaatataaattcaaatt 47733447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 31730917 - 31730823
Alignment:
Q  544 tcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaac 643  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||      ||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31730917 tcatgtctctagatctgcaacattgatgacgccaaagttat------tgatcggatttgcacttgttcaaagttaatctttcaacttgaatcaaataaac 31730824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 33794202 - 33794072
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | || ||||||||       ||| ||| || ||||||||| || |||| ||| || |||||||    
T  33794202 aaaataaatgatattcatttattcaaattgatagagcaaattgatacaatg------caagttctttaaaaacaaaaaggttgaagctgcgatcaaactc 33794109  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
     ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33794108 gcaacattcatgttaataacataaaacagcaaagtac 33794072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 510
Target Start/End: Original strand, 33937078 - 33937226
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaa-caaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||     |||| | |||||||||||||||||| || || ||||  ||||  ||||||| | ||||||||      
T  33937078 aaaataaacgatgttcattcatttaaattga-----tacaacaatacaatataaattcaaagtcattaaaaataaaaaatgatgaatttatgaacaaata 33937172  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatat 510  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||| | |||| ||| ||||| |||||||||    
T  33937173 cacaaaatccatgttaatagtataaaatgacaaaatacatatgcatacaaatat 33937226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 598 - 658
Target Start/End: Original strand, 3961666 - 3961726
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgg 658  Q
    |||| || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3961666 atctacatttgctcaaagttaatcttacaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 3961726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 482
Target Start/End: Original strand, 22893445 - 22893501
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaa 482  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22893445 aaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaacacacaacaactatgttaatagcataaa 22893501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 406
Target Start/End: Original strand, 23799749 - 23799792
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 406  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23799749 aaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatagatacaa 23799792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 445 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 26318850 - 26318807
Alignment:
Q  445 tgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26318850 tgtgaacaaactcacaacatctatgttaatataataaaacggca 26318807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 538 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 4019877 - 4019831
Alignment:
Q  538 gaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4019877 gaatactcatgcctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 4019831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 475
Target Start/End: Original strand, 14740379 - 14740474
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||       |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||    
T  14740379 attcattcaaattgaaagagtacatcgatgtaatg------caaattcgttaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacagcctcacagcatccatgttaa 14740472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 512
Target Start/End: Original strand, 25135057 - 25135143
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||| || || |||||||| || ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25135057 aaaacgaaaaggatgaatatgcgaataagcttacaacatccatcttaatgacataaatcggcagagtacttatgcctaaaaatatga 25135143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 412
Target Start/End: Original strand, 27189117 - 27189171
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaa 412  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27189117 aaaataaatgatattcatttattcaaattgatatagtacattgatacaatataaa 27189171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Original strand, 50194200 - 50194254
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  50194200 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaa 50194254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 30293244 - 30293187
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc 415  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  30293244 aaaataaacgatattcattcaatcaaattgatagaatatattgatacaatacaaattc 30293187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 25631371 - 25631423
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||    
T  25631371 ggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggca 25631423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 616 - 668
Target Start/End: Original strand, 32408732 - 32408784
Alignment:
Q  616 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  32408732 ctaatctttcaacccgaatcaaataaacaccgtactgagacaggaaatcaaaa 32408784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 598 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 38528712 - 38528664
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacacc 646  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38528712 atctgcacttgttcaaagctaatctttcaacctggatctaataaacacc 38528664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 46304322 - 46304358
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46304322 aaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 46304358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 48212689 - 48212637
Alignment:
Q  448 gaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgc 500  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  48212689 gaacaaactcacaacatccatgttaataacataacacgacagagtacctatgc 48212637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 566385 - 566322
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgca 649  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  566385 gtcattgattgaatctgcaattgataaaagctagtctttcaacctgaatcaaataaacaacgca 566322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 648
Target Start/End: Original strand, 5327396 - 5327427
Alignment:
Q  617 taatctttcaacctgaatcaaataaacaccgc 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5327396 taatctttcaacctgaatcaaataaacaccgc 5327427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 397
Target Start/End: Original strand, 7448710 - 7448749
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtaca 397  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7448710 aaaacaaacgatattcattcattcaaattgatagagtaca 7448749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 397
Target Start/End: Original strand, 7456852 - 7456891
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtaca 397  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7456852 aaaacaaacgatattcattcattcaaattgatagagtaca 7456891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 601 - 644
Target Start/End: Original strand, 20044755 - 20044798
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaaca 644  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20044755 tgcacttgctcaaaactaatcttccaacctgaatcaaataaaca 20044798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 485
Target Start/End: Original strand, 30648554 - 30648613
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  30648554 aaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg 30648613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 418
Target Start/End: Original strand, 32408549 - 32408608
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaa 418  Q
    ||||||||||  |||| | ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32408549 aaataaacgaaattcacttattcagatcgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaa 32408608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 53427078 - 53427031
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53427078 ggaatactcaagtcttcggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 53427031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 632 - 675
Target Start/End: Original strand, 55090521 - 55090564
Alignment:
Q  632 aatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  55090521 aatcaaataaacaccgcactaagatgggaaatcaaaaacacacc 55090564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 538 - 584
Target Start/End: Original strand, 21084573 - 21084619
Alignment:
Q  538 gaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21084573 gaatacccatatctccagatctgcaatgttgacgacaccaaattcat 21084619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 31731446 - 31731412
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaata 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31731446 attcattcaaattgatagagtacatcaatacaata 31731412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 493
Target Start/End: Original strand, 35501503 - 35501557
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagta 493  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  35501503 tgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaatatcataaaatgacaaagta 35501557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 624 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 40716434 - 40716384
Alignment:
Q  624 tcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacac 674  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  40716434 tcaacctgaatctaataaacactgcactaagacggaaaatcaaaatcacac 40716384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 598 - 652
Target Start/End: Original strand, 42167917 - 42167971
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42167917 atctgcacttgattaaagcaaatctttcaatctgaatcaaataaacaccacacta 42167971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 43017111 - 43017057
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  43017111 ggatgaatatgtgaataaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaa 43017057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 598 - 668
Target Start/End: Original strand, 50637870 - 50637940
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||| ||||| |||||||||    
T  50637870 atctgcacttgctcggagctaatctttcaacctaaaataaataaaaagcgcactaagacggaaaatcaaaa 50637940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 51490276 - 51490230
Alignment:
Q  109 ttgttaaggaaatataaaagaaaatattctc-tgaaaattgtgtatt 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51490276 ttgttaaggaattataaaagaaaatattctcttgaaaattttgtatt 51490230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 26412592 - 26412523
Alignment:
Q  516 atatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||| || | || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26412592 atatgactatatttaagtctttgaaatattcatgtctccggatttgcaacgttgacgacgccaaactcat 26412523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 28876902 - 28876861
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  28876902 attcattcaaattgatagagtatatcaatacaatacaaattc 28876861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 32607548 - 32607499
Alignment:
Q  618 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  32607548 aatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 32607499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 34767424 - 34767375
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaa-ttgatagagtacatcgatacaa 406  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34767424 aaaataaatgatattcattcattcaaaattgatagagtacatcaatacaa 34767375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 407
Target Start/End: Original strand, 40461661 - 40461710
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaat 407  Q
    |||||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40461661 aaaataaatgatattaatttattcaaattgataaagtacatcgatacaat 40461710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 48822298 - 48822245
Alignment:
Q  599 tctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48822298 tctgcacttaatcaaagttaatctttcaaccttaatcaaataaacactgcacta 48822245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 51742233 - 51742192
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc 415  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  51742233 attcattcaaattgatagagtatattgatacaatacaaattc 51742192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 54149279 - 54149242
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54149279 taaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 54149242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 534437 - 534393
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaa 418  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  534437 attcattcaagttgataaagtatatcgatacaataaaaattcaaa 534393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4711715 - 4711651
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||    
T  4711715 aaaacataaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaa 4711651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9998754 - 9998718
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9998754 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 9998718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10108523 - 10108487
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10108523 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 10108487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10233357 - 10233321
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10233357 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 10233321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 12116176 - 12116128
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  12116176 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 12116128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12116327 - 12116275
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  12116327 ggatgaatctaagaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 12116275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 399
Target Start/End: Original strand, 20464774 - 20464802
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464774 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 20464802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 24396300 - 24396336
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24396300 aaacgatattcattaattcaaattgatagagtacatc 24396336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 538 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 25084303 - 25084263
Alignment:
Q  538 gaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaa 578  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25084303 gaatattcatgtctcatgatctgcaacgttgacgacaccaa 25084263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 535 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 25849949 - 25849913
Alignment:
Q  535 ctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacg 571  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25849949 ctggaatattcatgtctccggatctgcaacgttgacg 25849913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 32607698 - 32607654
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  32607698 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaggttaatagcata 32607654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 33070593 - 33070537
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  33070593 aaaatgaacgatatttattcattcaaattgatggagtgtattgatacaatataaatt 33070537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35175690 - 35175654
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35175690 aaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 35175654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 35499194 - 35499242
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  35499194 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaa 35499242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 35864762 - 35864798
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35864762 aaacgatattcgttcattcaaattgatagagtacatc 35864798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 539 - 571
Target Start/End: Original strand, 36734631 - 36734663
Alignment:
Q  539 aatactcatgtctccagatctgcaacgttgacg 571  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36734631 aatactcatgcctccagatctgcaacgttgacg 36734663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 36906351 - 36906299
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  36906351 ggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggca 36906299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 36910567 - 36910603
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36910567 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 36910603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37041055 - 37041019
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37041055 aaacgatattcattcattcagattgatagagtacatc 37041019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 490
Target Start/End: Original strand, 38859979 - 38860031
Alignment:
Q  438 atgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||    
T  38859979 atgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaa 38860031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 39917243 - 39917287
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  39917243 ggatgaatctgtgaataaactcacaacatccaagttaatagcata 39917287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41818513 - 41818477
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41818513 aaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 41818477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 43017175 - 43017139
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43017175 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 43017139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 45568246 - 45568282
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45568246 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 45568282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 52922918 - 52922954
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52922918 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 52922954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 54240518 - 54240482
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagt 394  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54240518 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagt 54240482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 167)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Original strand, 17095896 - 17096206
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17095896 aaaataaacgacattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 17095995  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||| ||||||    
T  17095996 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctccgaagtactcatgtttccaga 17096095  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  17096096 tctgcaccgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcatttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaagac 17096195  T
Q  657 gggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||||    
T  17096196 gggaaatcaaa 17096206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 358 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 20483652 - 20483333
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20483652 aaaataaacgatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 20483553  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  20483552 acaacatccatgttaatagcataaaatggaaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtcttcggaatactcatgtcttcaga 20483453  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  20483452 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgatcaaagctaatctttcaacttgagtcaaataaacaccgtactaagac 20483353  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacca 676  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  20483352 gggaaatcaaaaacacacca 20483333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6635714 - 6635404
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6635714 aaaataaacgattttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 6635615  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||  ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | || ||||||||||||||||| ||    
T  6635614 acagtatccatgataatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgattatattcaaatctccggaatactcatgtctccgga 6635515  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6635514 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcatttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagac 6635415  T
Q  657 gggaaatcaaa 667  Q
    || ||||||||    
T  6635414 ggaaaatcaaa 6635404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 17331794 - 17331476
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17331794 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 17331695  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||   || ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||    
T  17331694 acatattccatgttaatagcataaaacggcaagatacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctccgga 17331595  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17331594 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattggtcggatctgctcttgttcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 17331495  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  17331494 gggaaatcaaaaacacacc 17331476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 362 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 6281506 - 6281192
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  6281506 taaacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacat 6281407  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  6281406 catccatgttaatagcataaaacagcaaaatacatatgcctacaaatatgactaatatgattatattcatgtcttcggaatactcatttctccggatctg 6281307  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6281306 caacaatgatgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacggga 6281207  T
Q  661 aatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||| ||||||    
T  6281206 aatcaaaaacacacc 6281192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Original strand, 7771476 - 7771793
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  7771476 aaaataaacgatatttattcattcaaattgatatagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaagctc 7771575  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||    
T  7771576 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgattaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgga 7771675  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  7771676 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagat 7771775  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacac 674  Q
    || ||||||||| |||||    
T  7771776 ggaaaatcaaaaacacac 7771793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 17700019 - 17699701
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17700019 aaaataaacgatattcattgaatcaaattgatagagtacatcgatacaaaacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 17699920  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||    
T  17699919 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgtctacaaatatgactagtatgactatattcatgtctctggaacactcatttctccgga 17699820  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||    
T  17699819 tctgcaacattgacgacgccaaagttattgtcattgatcagatctgtacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacgatgcactaagac 17699720  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  17699719 gggaaataaaaaacacacc 17699701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 177759 - 178069
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  177759 aaaaaaaatgatattcattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 177858  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||| | || || ||||||||||||||||| ||    
T  177859 acaacatccatgttaatagcctaaaacggcaaagtacctatgcctactaatatggctaatatgaccgtattcaagtctccggaatactcatgtctccgga 177958  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  177959 tctgcaacgttgacaacgccaaagtcattgtcattgatcagatctacacttgctcaa-gctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcaccacgac 178057  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||||    
T  178058 gggaaatcaaaa 178069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 371 - 668
Target Start/End: Original strand, 2555018 - 2555316
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2555018 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttcttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgt 2555117  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttga 569  Q
    ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2555118 taatagcgtaaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttga 2555217  T
Q  570 cgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
     |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  2555218 tgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcactttctcaaagctaatatttcaacctgaatcaaataaacaccacactaagacggaaaataaaaa 2555316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 34431530 - 34431208
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34431530 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactc 34431431  T
Q  458 acaac-------atctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgt 549  Q
    ||||        ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34431430 acaagtcacaatatccaagttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatattgatgtctctggaatactcatgt 34431331  T
Q  550 ctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgca 649  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34431330 ctccagatctgtaacgttgacgacgac-aagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatc--tcaacctgaatcaaataaacaccgca 34431234  T
Q  650 ctaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||| ||| |||||| |||| ||||||    
T  34431233 ctaagacaggaaataaaaaacacacc 34431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 17732042 - 17732359
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  17732042 aaaataaatgatattcactcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaagag-atgaatctgtgaacaaactc 17732140  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | || | ||||||||||||| | ||    
T  17732141 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgattatattcatctctccgaaatactcatgtctacgga 17732240  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17732241 tctgcaaggttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttacacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagat 17732340  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  17732341 gggaaataaaaaacacacc 17732359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 18654248 - 18653930
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  18654248 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagactacattgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaactc 18654149  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatt--tatgttctggaatactcatgtctccag 555  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||| | ||||| | |||||||||    
T  18654148 acagcatccatgttaatagcataaaacggcaaaatacttatgcctacaaatatgactaatgtgactatattcaaatattc-gaaatacccgtgtctccag 18654050  T
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18654049 atctgctacattgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaacctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactatga 18653950  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  18653949 tgggaaatcaaaaacacacc 18653930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 33164124 - 33164434
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  33164124 aaaataaacgatattcattcattcaaattgacagagtacatcgatataatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaagggatgaatccgtaaacaaactc 33164223  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||||| ||||||||||| ||    
T  33164224 acatcatccatgttaatagcataaaacggtaaggcatctatgcctacaaatatgactaatatgattatattcaagtctccggaatcctcatgtctccgga 33164323  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33164324 tctgcaacgttgacgac-gcaaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 33164422  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||||    
T  33164423 gggaaatcaaaa 33164434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 667
Target Start/End: Original strand, 980705 - 980994
Alignment:
Q  382 aaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtt---aataaca 478  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||    
T  980705 aaattaatagagtagatcgatacaatataaatttaaattcgttaaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttgttaatagca 980804  T
Q  479 taaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacacca 577  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || | ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  980805 taaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccgaaatactcttgtctccagacttgtaacgttgacgacacca 980904  T
Q  578 aagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  980905 aagtcattgtcattgctcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaagtcaaa 980994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 23881771 - 23882082
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  23881771 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgcaaaaaagaaaaaggatgaatttgtggacaaactc 23881870  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | ||||||||||||||| ||    
T  23881871 acaacatccatgttaatagcataaaccgacaaagtatctatgactacaaatatgactaatatgactatatacatgtcaccgaaatactcatgtctccgga 23881970  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23881971 tctacaacattgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgtacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 23882070  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
     | |||||||||    
T  23882071 tgaaaatcaaaa 23882082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 362 - 675
Target Start/End: Original strand, 32347382 - 32347687
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  32347382 taaacgatattcattcattcaaattgacagtgtacatcgatacaatacgaattcaaattcgctaaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaata 32347481  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttct-ggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  32347482 catccatgttaatagcataaaacggcaaagtagttatgcctaca---------aatatgactatattcatgttttcggaatactcatgtctccggatctg 32347572  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  32347573 caatgttgacgacgccaaagttattgtcatcgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaattaaataaacaccgtactaagacggga 32347672  T
Q  661 aatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||| ||||||    
T  32347673 aatcaaaaacacacc 32347687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 395 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 42609573 - 42609292
Alignment:
Q  395 acatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  42609573 acatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaagaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgttaatgacataaaacggcaaagtat 42609474  T
Q  495 ttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattga 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42609473 ttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcctgcctccggatctgcaacgtcgacgacaccaaagtcattgtcattga 42609374  T
Q  594 tcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  42609373 tcgaatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacatgaatcaaataaacatcatactaagacgtgaaatcaaaaacacacc 42609292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 6681532 - 6681842
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  6681532 aaaataaacgatattcattcattctaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactt 6681631  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  |    
T  6681632 acatcatcaatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatg-ctacaaacatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccgaa 6681730  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||    
T  6681731 tctgcaacgttgacgacaccaaaatcattgtcattgatcggatttgcgcttactcaaaactaatctttcaacctggaacaaataaacatcgcactaagac 6681830  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    | ||||| ||||    
T  6681831 gagaaataaaaa 6681842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 39531063 - 39531383
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttc----aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaa 453  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |     ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  39531063 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatatgaatccaaattcgctagctaaaaacgaaaaggatgaatttgtgaacaa 39531162  T
Q  454 actcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctc 552  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || ||||||||||||||||    
T  39531163 actcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaacatgattatattcaagtctccggaatactcatgtctc 39531262  T
Q  553 cagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  39531263 tggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat--tcattgatcggatctgcactttctcaaagctaatctttcaacccgaatcaaataaacatcgtacta 39531360  T
Q  653 ggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     ||  |||||| |||| ||||||    
T  39531361 agagtggaaataaaaaacacacc 39531383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Original strand, 26294729 - 26295022
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26294729 aaaataaacggtattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactc 26294828  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||| |||    
T  26294829 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaaatacttatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccggat 26294912  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26294913 ctgcaacgttaacgacaccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaaactaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 26295012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 358 - 673
Target Start/End: Original strand, 42396165 - 42396483
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  42396165 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagaatatatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaagggattaatatgtgaacaaactc 42396264  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcct---acaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctcc 553  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||     
T  42396265 acaacattcatgttaataacataaaacggaaaagtacctatgcctacaacaaatatgactaatatgattatattcatgtctcaagaatactcatgtctca 42396364  T
Q  554 agatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactag 653  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||     
T  42396365 ggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgat-gaatatgcacttgctcaaagctaatatttgagcatgaatcaaataaacatcgcactaa 42396463  T
Q  654 gacgggaaatcaaaagcaca 673  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  42396464 gacgggaaatcaaaaacaca 42396483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 362 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 28041091 - 28040779
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||     
T  28041091 taaaagatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgagtaaactcacat 28040992  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||  |||||    
T  28040991 catccatgttagtagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccataatacacatgtctccgaatctg 28040892  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||    
T  28040891 caatgttgacgacgccaaagtcactgtcattgatcggatttgcacttgctcagagctaatatttaaacctgaatcaaataaacaccacactaagatagga 28040792  T
Q  661 aatcaaaagcaca 673  Q
    |||||||| ||||    
T  28040791 aatcaaaaacaca 28040779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 431 - 668
Target Start/End: Original strand, 3079062 - 3079300
Alignment:
Q  431 aaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatattta 530  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3079062 aaaaaggatgagtctgtgaacaaactcacagcatccatgttaataacataaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatgattaatatgactatattta 3079161  T
Q  531 tgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacc 629  Q
    ||| | | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  3079162 tgtctatcgaacactcatgtcttcagatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagcaaatctttcaact 3079261  T
Q  630 tgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  3079262 cgaatcaaataaacatcgcactaagacgggaaatgaaaa 3079300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 39179500 - 39179794
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  39179500 aaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatttatgaacaaactc 39179599  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||                |||||| ||| |||    
T  39179600 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatatctacaaatatgactaatgtgactatat----------------tcatgtatccggat 39179683  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39179684 ttgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctagtctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggatg 39179783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 11734500 - 11734792
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11734500 aaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 11734599  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||         |||||||||||                || |||||| |||    
T  11734600 acaacaaccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaat---------atgactatatt----------------caagtctccggat 11734674  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11734675 ctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcagttgcgcaaagctaatctttcaatctgaatcaaataaacatcgcactaagacg 11734774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 392 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 23428675 - 23428400
Alignment:
Q  392 agtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaag 491  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  23428675 agtatatcgatacaatacaaattcaaattcgctataaacgaaaaggataaatatgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggaaaag 23428576  T
Q  492 tacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcat 590  Q
    ||| ||||||||||||||||||||         ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23428575 tacctatgcctacaaatatgacta---------tatttatgtctccgaaatactcatgtctccggatctacaacgttgacgacgccaaagtcattgtcat 23428485  T
Q  591 tgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  23428484 tgatcggatctacacttgctcaaagctaatctttctacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaatcaaaaacacacc 23428400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 358 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 26294076 - 26293853
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26294076 aaaataaacgatattcattcattcaaatagatagagtacgtcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 26293977  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||||| | |||||||| ||    
T  26293976 acaacatccatattaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatattaaaatctccggaatatttatgtctccgga 26293877  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaag 580  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  26293876 tctgcaacgttgacgacgccaaag 26293853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 366 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 29098238 - 29097944
Alignment:
Q  366 cgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 465  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||     
T  29098238 cgatattcactcattcaaattgatagaatacatcggtacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaagggatgaatttgtgaacaaactcacatcata 29098139  T
Q  466 tatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaac 564  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||         |||| | || || ||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  29098138 catgttaatagcataaaacggcaaggtacatatgcctacaaatatgacta---------tattcaagtctccggaatcctcatgtctcttgatctgcaac 29098048  T
Q  565 gttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatc 664  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29098047 gttgacgacgccaaaatcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaata 29097948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 27241521 - 27241212
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27241521 aaaataaactatattcattaattcaaattcatagagtacatcgatacaatagaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactc 27241422  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||         ||||||||| ||| || ||||||||  ||| ||| ||    
T  27241421 acaacatccacgttaatagcataaaacggcaaaatacctaggcctacaaatatg---------actatatttttgtctccggaatacttctgtatccgga 27241331  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||  ||    
T  27241330 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgatcaaagctaatctttgaacctgaatcaaacaaacaccatactaaaac 27241231  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  27241230 gggaaatcagaaacacacc 27241212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 3740798 - 3740505
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatgga-tgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  3740798 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatccaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggaatgaatctatgaacaaact 3740699  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||         |||||||||||                ||||| ||| ||    
T  3740698 cacaacatccatgttactagcataaagcggcaaagtacctatgcctataaat---------atgactatatt----------------catgtatccgga 3740624  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  3740623 tctgcaacattaacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcagttgctcaaagctaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcactcagac 3740524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 362 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 25962366 - 25962069
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||| | |||| |||| |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  25962366 taaacgatatccattcattcaaattgataaagtacatcgataaaatttaaatccaaaatcgctaaaaataaaaaggataaatctgcgaagaaactcacaa 25962267  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatg-ttctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||         |||||||| | | ||| ||||||  ||||||||| |||||     
T  25962266 cattcatgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatg---------actatattcaagtttccggaatatccatgtctccggatcta 25962176  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||||||||||||| | |||      |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  25962175 caacgttgacgacgcaaaa------gtcattgatcagatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacgaga 25962082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 358 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 32309962 - 32309814
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  32309962 aaaataaacgatattgattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataaattcaaagtcgttaaaaataaaaaagatgaatctgcgaacaaactc 32309863  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaa 506  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||    
T  32309862 acaacatccatgttaataggataaaacgacagagtatttatgcctacaa 32309814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 42505068 - 42505223
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42505068 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcagtctc--taaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactc 42505165  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  42505166 acaacatccatgttaatagcatgaaacgacagagtatctatgcctacaaatatgacta 42505223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 41554932 - 41554720
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  41554932 aaaataaaagatatccattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaaggataaatctgtgaacaaactc 41554839  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||          ||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||    
T  41554838 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctccgga 41554748  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41554747 tctgcaacgttgacgattccaaagtcat 41554720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 358 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 37219447 - 37219298
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||      | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37219447 aaaataaacgaaattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgaaaattc------gct-aaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 37219355  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  37219354 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgact 37219298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 40564839 - 40564977
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| | | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40564839 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaata------caaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaacatctatgt 40564932  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  40564933 taatagcataaaacgacaaagtacataagcctacaaatatgacta 40564977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 545 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 11858186 - 11858065
Alignment:
Q  545 catgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaaca 644  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |  || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11858186 catgtctccggatctgcaacgttgacgacgcctaagtcattg--atcgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaaca 11858089  T
Q  645 ccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||| |||||||||| ||||    
T  11858088 ccgcactaagacgggaaataaaaa 11858065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 540 - 668
Target Start/End: Original strand, 12439501 - 12439629
Alignment:
Q  540 atactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaat 639  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12439501 atactcatgtctccggaactgcaatcttgacgacgccaaagtcattgtcgttgatcggatcttcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaat 12439600  T
Q  640 aaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  12439601 aaacaccgcactaaaacggaaaatcaaaa 12439629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 358 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 42781467 - 42781340
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  42781467 aaaataaacgatatttatttattcaaattgatagagtgcatcgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaataaaaaggatgaatttgttaacaaactc 42781368  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42781367 acaacatccatgttaatagcataaaacg 42781340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 362 - 584
Target Start/End: Original strand, 33486242 - 33486450
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||      | | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33486242 taaaagatattcattcattcaaattgatagaatacatcgataaaataaaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaa 33486335  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |         |||||| || ||  |||||| |||| |||| ||||||    
T  33486336 catccacgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgacca---------tatttaagtctccagaatacccatgcctccggatctg 33486426  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  33486427 caacgttgacgactccaaagtcat 33486450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 362 - 512
Target Start/End: Original strand, 12439354 - 12439498
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||      |||||||||||||||||| | |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  12439354 taaacgatattcattcattcaacttgataaagtatat------aatataaattcaaattcgctaaaaataaaaatgataaatctgtgaacaaactcacat 12439447  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12439448 catccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatga 12439498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 7151262 - 7150984
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||||||    
T  7151262 aaaataaacgatattcattcattaaaatcgatagagtaaattgatacaatacaaattcaaagtcgttaaaaacaaaaaagatgaatccacgaacaaactc 7151163  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |   || | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||         || ||||||||||| | || |  |||||||| |||||||  ||    
T  7151162 agtgcaaccatgttaataacataaaacgacaaagtacataaacctaca---------aacatgactatattcaagtcttcggaatactaatgtctctgga 7151072  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 650  Q
    ||||||||||||| ||| |||||      ||||||||||| || || |||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7151071 tctgcaacgttgatgacgccaaa------gtcattgatcgaatttgtacttactcaaaaccagtctttcaacctgaatcaaataaacatcgcac 7150984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31646274 - 31646123
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  31646274 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctc 31646181  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  31646180 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgcctacacatatgacta 31646123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13161811 - 13161654
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||| | |||||||||  ||||||||     
T  13161811 aaaataaatgattttcattcactaaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaagtcatttaaaacaaaaagcatgaatctgctaacaaactt 13161712  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| | | ||  || |||||||||||||||||    
T  13161711 acaacattcatgttaatagcataaaacggtagaatatctaagcctacaaatatgacta 13161654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 14910345 - 14910557
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||      | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14910345 aaaataaacgatattcattcattcaaattgttagagtacaacgatacaataaaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaaaaaactc 14910438  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||          |||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  14910439 atagcatccatgttaatagcataaaacggcaaaatactaaaacctaca---------catataactatatttaagtctccggaatactcatgtctccgga 14910529  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||||    
T  14910530 tctgcatcgttgacaacttcaaagtcat 14910557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 18472395 - 18472607
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  || |||      | | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18472395 aaaataaatgatattcatttattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaagttc------gctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactc 18472488  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||          |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  18472489 acatcatccatgttaatagcataaaacaacaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatgtaagtctccggaatactcatgtctccaga 18472579  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  18472580 tctacaacgttgacgactacaaagtcat 18472607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 555 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 43494128 - 43494008
Alignment:
Q  555 gatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagg 654  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  43494128 gatctgcaacattgacgatgtcaaagtcattgtcattgattggatatgcacttgctcaaagttagtctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaa 43494029  T
Q  655 acgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  43494028 acggaaaatcaaaaacacacc 43494008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 6074405 - 6074556
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||      |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6074405 aaaacaaacgacattcattcattcacattgatagagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactc 6074498  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| || || || | ||||||| |||||||    
T  6074499 acaacatccatgttaatagcacaaaacggcatagaacataagtctacaaacatgacta 6074556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34844361 - 34844210
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||      | | |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  34844361 aaaagaaacgatattcattaatgcaaattgatagagtacatctatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactc 34844268  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  34844267 acaacatccatgttaatagtataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgacta 34844210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 426 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 43494272 - 43494186
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43494272 aaaacaaaaggcaagaatctgtgaacaaactcacaacatccgtgttaataacataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatga 43494186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 499
Target Start/End: Original strand, 6012716 - 6012857
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||| |||||| ||  |||||||||    
T  6012716 aaaataaatgataatcattaatttaaattgatagagtacattaatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaataaaatgaatgaatttgcaaacaaactc 6012815  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatg 499  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  6012816 acaacatcaatgttaataacataaatcggcagagtacatatg 6012857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 10923803 - 10923954
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| | |||| | ||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||    
T  10923803 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatc-----aatataa-tgcaaaattgttaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 10923896  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  10923897 acaacgtctatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgcctatacatatgacta 10923954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 372 - 515
Target Start/End: Original strand, 20145902 - 20146039
Alignment:
Q  372 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||      |||||||| | ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20145902 tcattcattcaaattgatagagtgtatcgatgcaata------caaattcgctaaaaacaataagaatgaatatgtgaacaaactcacaacatcaatgtt 20145995  T
Q  472 aataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  20145996 aatagcataaaatgacaaagtacataagcctacaaatatgacta 20146039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 40775206 - 40774994
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||| | | ||||  ||| |||||||  |||||||||||||    
T  40775206 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac------aatgaaaatttgctaaaaattaaaaggatgaacatgtgaacaaactc 40775113  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatg-ttctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||          ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||    
T  40775112 agaggatctatgttaatagcataaaacgacaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtttccggaatacccatgtctccgga 40775022  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40775021 tctgcaacgttgaagactccaaagtcat 40774994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5378747 - 5378596
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  5378747 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaatcaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 5378654  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||  || |||||| |||||||||    
T  5378653 acaacatccatgttaatagcataaaacaacaaggtacaaattcctacacatatgacta 5378596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 6886847 - 6886998
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||  |||    
T  6886847 aaaataaaagatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctc 6886940  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  6886941 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgcctacacatatgacta 6886998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 445 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12892013 - 12891895
Alignment:
Q  445 tgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatac 543  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | || | |||||    
T  12892013 tgtgaacaaactcacatcatccatgttaataacataaagcggcaaaatacatatacctacaaatataactaatatgactatatttaaatctccgaaatac 12891914  T
Q  544 tcatgtctccagatctgca 562  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  12891913 ttatgtctccggatctgca 12891895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 17218168 - 17218042
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||    
T  17218168 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------aaaattcgctaaaaacgaaa-ggatgaatctatgaacaatctc 17218076  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaag 491  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  17218075 acaacatccatgttaataatataaaatggcaaag 17218042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28619047 - 28618896
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||  |||    
T  28619047 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgata------taatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtcaacaggctc 28618954  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  28618953 acatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgacta 28618896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 29310036 - 29310174
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||    
T  29310036 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctcacatcatccatgt 29310129  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||    |||||||| |||||||||    
T  29310130 taatagcataaaacggcaaagtagaattgcctacacatatgacta 29310174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 17325333 - 17325482
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||      |||||| | | |||||||||  ||||||||||| ||||||||     
T  17325333 aaaacaaacgatattcattcattcaaattgatagattacatcgatgcaata------caaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtaaacaaact- 17325425  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  17325426 -caacatccatgttaatagcataaaatgacaaagtacataagcctacatatatgacta 17325482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 504
Target Start/End: Original strand, 19645706 - 19645845
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19645706 aaaataaatgatattcattcattcaaatcgata-agtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactc 19645798  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctac 504  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  19645799 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaaatacaaatgcctac 19645845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20271160 - 20271008
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatgga-tgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||      | | |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  20271160 aaaacaaaagatattcattcattcaaattagtagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaaagaatgaatctgtgaacaaact 20271067  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| |||||||||    
T  20271066 cacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtactaaagtctacacatatgacta 20271008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Original strand, 8811837 - 8811972
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||      | | ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8811837 attcattcaaattgatagagtacattgatacaatgaaagttc------gctaaaaacgaaaatgatgaatttgtgaacaaactcacatcatccatgttaa 8811930  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  8811931 tagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgacta 8811972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28501118 - 28500983
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      | | |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28501118 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgtaaattc------gctgaaaataaaaaggatgaacctgcgaacaaactcacaacatccatgttaa 28501025  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || || |||||| ||||||||  |  |||||| |||||||||    
T  28501024 tagcaaaaaacgacaaagtacaaacacctacagatatgacta 28500983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28662515 - 28662364
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||      | | |||||||||  ||||| ||| ||||||||| |    
T  28662515 aaaataaacaatattcattcattcaaattgaaagagtacgtcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgagtctatgaacaaacac 28662422  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  28662421 ataacatccatgttaatagcataaaacggcaaaatactaaagcctacacatatgacta 28662364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Original strand, 31254942 - 31255084
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatg-gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||   ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||    
T  31254942 attcattcaaattaatagagtacgacgatacaatacaaattcaaaatcgtttaaaataaaaaacgatgaatctgcaaacaaactcacaacatttatttta 31255041  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  31255042 ataacataaaatgatagagtacatatggctacaaatattacta 31255084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 37425567 - 37425448
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |      | |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  37425567 aaaataaatgatattcattaattcaaattgatagagtagatcgatacaataagaattcga------taaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactc 37425474  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  37425473 acaacatctatgttaatagcataaaa 37425448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 538 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 17687484 - 17687354
Alignment:
Q  538 gaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaa 637  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  |||||||||      ||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||    
T  17687484 gaatactcatgtctccggatctgcaacattgatgacgtcaaagtcat------tgatcggatatgcatttgctcaaatttaatctttcaatctgaatcaa 17687391  T
Q  638 ataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacac 674  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  17687390 ataaacaccgtactaagatgggaaatcaaaaacacac 17687354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 372 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8957637 - 8957500
Alignment:
Q  372 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtt 471  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||       | | ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||  |||||    
T  8957637 tcattcattccaattgatagagtacatcgatgcaatataagtta------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtggacaaattcacaacattcatgtt 8957544  T
Q  472 aataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  8957543 aataacataaaacgacaaagtacacaagccaacaaatatgacta 8957500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 595 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 12891904 - 12891824
Alignment:
Q  595 cggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||| ||||||    
T  12891904 cggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctggatcaaataaacaccgcactaagatggaaaattaaaaacacacc 12891824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6639447 - 6639321
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagta--catcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  || ||| | |||| |||| | | |||| || ||| ||||    
T  6639447 aaaataaacgatattcattcattcaaattggtagagtatacatcgatacaatataaatttcaaatcgctaaaaataaaaagaaagaatatgcgaataaac 6639348  T
Q  456 tcacaacatctatgttaataacataaa 482  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||    
T  6639347 tcacaacattcatgttaataacataaa 6639321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 515 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 35402342 - 35402214
Alignment:
Q  515 aatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaa 613  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||| |||| |  ||||| || ||||||||||| ||||    
T  35402342 aatatgactatattcaagtctctggaatactgatgtctctagatctacaacgttgatgatgccaaaatcattg--attgaccgaatctgcacttgttcaa 35402245  T
Q  614 ggctaatctttcaacctgaatcaaataaaca 644  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402244 agttaatctttcaacctgaatcaaataaaca 35402214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 39915727 - 39915648
Alignment:
Q  589 attgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  39915727 attgattggatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaataaaataaacaccgcactatgacaggaaataaaaa 39915648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3495275 - 3495140
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  3495275 attcgttcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctcacaacaaccatgttaa 3495182  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  3495181 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcttacacatatgacta 3495140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32387909 - 32387758
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |       |||||||||| | |||||||  ||| ||| || ||||||||||    
T  32387909 aaaataaataatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatacactg------caaattcgttaacaacaaaaaagataaatttgcgaacaaactc 32387816  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||| |||||||||    
T  32387815 acaacatccatattaataacataaaacgacaaggtacaaaagcctacacatatgacta 32387758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Original strand, 39532008 - 39532161
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| ||  |||||||||||| |||| | ||||||| ||| |   || ||||  |||||||||| || ||||||||    
T  39532008 aaataaacgatattcattcaattaaattaattaagtacatcgatataatacatattcaaagtcgct---aagaaaaacgatgaatctgcgagcaaactca 39532104  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39532105 caacatcaattttaatagcataaaacggtcgagtacatatgcctacaaatatgacta 39532161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 6647578 - 6647733
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgat----agagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaa 453  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||       |||||||| | |||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  6647578 aaaataaatgatattcattcattcaaattgattgatagaatacatcgatacaatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgcgaataa 6647671  T
Q  454 actcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||    
T  6647672 actcacaacatccatgttaatagcttaaaacggaaaagtacaaaagcctacacatatgacta 6647733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15710989 - 15710859
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||       | ||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  15710989 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagaatacatcaatacaatgcaaattcac------taaaaccaaaaaggatgaatatgcgaacaaactc 15710896  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  15710895 acaacatccatgttaatagcataaaacaacaaagtac 15710859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35906714 - 35906563
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||| |||||||| | ||||| ||| | |||||| ||||||||  |||    
T  35906714 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacat-----caatat-aatgcaaattcgctaaaaactaaaagtatgaatatgtgaacaggctc 35906621  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||   |||||||| |||||||||    
T  35906620 acatcatccatgttaatagcataaaacgacaaaatacaattgcctacacatatgacta 35906563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 2415847 - 2415651
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||       | |||| |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  2415847 aaaataaattatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatgtaatgcaaattcac------taaaaataaaaaggatgaatttgtgaacagactc 2415754  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||| ||       |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| | ||    
T  2415753 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtataaatgcctacacat-------atatgactatatttatgtcttcggaataatcatgtcttcgga 2415661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Original strand, 39415923 - 39416078
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||| || | |||||||| |   ||||||||||    
T  39415923 aaataaacgatatttattcattcaaattgattaagtacatcgatacaatacatattcaaagtcgctggaaa-aagaaggatgaatattcaaacaaactca 39416021  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| ||| || |||||| || |||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39416022 caaaatccattttaatagcaaaaaatgacagagtacatatgcctacaaatatgacta 39416078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 41358479 - 41358378
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |      ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  41358479 aaaatgaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgt------aaattcgttaaaaacaaaacggatgaatatgcgaacaaactc 41358386  T
Q  458 acaacatc 465  Q
    ||||||||    
T  41358385 acaacatc 41358378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 359 - 510
Target Start/End: Original strand, 39530817 - 39530967
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| || | ||| ||| ||  | ||||||||| |||||||| |   || |||||||    
T  39530817 aaataaacgatatttattcattcaaattgatagggtatatcgatacagtacatatttaaaatcactaaaaacaaaaaggatgaatataaaaataaactca 39530916  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatat 510  Q
    || |||| ||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  39530917 catcatc-atgttaacagcataaaacggcatggtacatatgcctacaaatat 39530967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39591477 - 39591345
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |      || |||| |||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  39591477 attcatttaaattgatagagtacctcaatacaatacaaattta------ttaaaaataaaaaggttgaatctgcgaacaaactcataacatccatgttaa 39591384  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||||||    
T  39591383 taacataaaacgacaaaatacataagcctacatatatga 39591345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 539 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12215410 - 12215288
Alignment:
Q  539 aatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaa 638  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||||      ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  12215410 aatactcatgtcgtcggatctgcaacgttgacgacgcaaaagtcat------tgatcggatatgcacttgctcaaaactaatctttcaa-ctaaatcaaa 12215318  T
Q  639 taaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||| || || | ||||||||||    
T  12215317 taaacaccgcattaagatgagaaatcaaaa 12215288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 545 - 666
Target Start/End: Original strand, 35275835 - 35275950
Alignment:
Q  545 catgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaaca 644  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||      |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35275835 catgtctccatatctgcatcgttgacgacgccaaagttat------tgattggatctgtacttgctcaaagctaacctttcaaccggaatcaaataaaca 35275928  T
Q  645 ccgcactaggacgggaaatcaa 666  Q
     ||||  | |||||||||||||    
T  35275929 tcgcataaagacgggaaatcaa 35275950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 17687601 - 17687504
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| | |||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17687601 aaaataaacgatattcattcattcaaaattattgagtacattgttacaatataatttcaaattcactaaaaacaaaagggaagaatctgtgaataaac 17687504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 475
Target Start/End: Original strand, 26905304 - 26905421
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  26905304 aaaataaatgatattcattcattaaaattgatataataccttgatacaatacaaatttatattcgctaaaaacaaaaatggtgaatgtgtgaacaaactc 26905403  T
Q  458 acaacatctatgttaata 475  Q
     ||||||| |||||||||    
T  26905404 gcaacatccatgttaata 26905421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 586202 - 586081
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| ||  |  ||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  586202 taaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatactacat-aatttaaagtccctataaacaaaa-agatgattctatgaa-aaactcacaa 586106  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacgg 486  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  586105 catccatgttaatagcataaaacgg 586081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 9196686 - 9196742
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9196686 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatataaatt 9196742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 11647650 - 11647502
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||  | |||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||  ||||||| || | ||||||||    
T  11647650 aaaataaacattattcattcacttcaattaatagagtacatcaatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgtacaaactc 11647551  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaa 506  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||| | |||| ||| || ||||||||    
T  11647550 acaacatccacgttaataatttaaaatgacaaaatacataagcctacaa 11647502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 29154665 - 29154535
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    ||  | |||||||||  ||||||| || ||||| ||||    
T  29154665 aaaataaatgatattcatttattcaaattgatagagtatattaatacaatataaattc----tc--taaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacatactc 29154572  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29154571 acatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtac 29154535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4070995 - 4070845
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||| |||||||| | |||| |||| |||| ||||| |||| |  |||    
T  4070995 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgata------taatgcaaattcgctaaaaataaaaaggataaatctatgaagaggctc 4070902  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  4070901 acagcatccatgttaatagcataaaac-gcaaagtacaaatacctacacatatgacta 4070845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 41383867 - 41383745
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaa-tataaattcaaattcgttcaaaac-aaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtt 471  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||| | ||||  ||||  || |||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  41383867 attcattcaaaatgataaagtacaacgatacaaatacaaattcaaagtcgctaaaaaggaaaaaagacgaatatgtgaacaaaatcacaacatcaatgtt 41383768  T
Q  472 aataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  41383767 aataacataaaatggcagagtac 41383745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14535332 - 14535195
Alignment:
Q  375 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaat 474  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||||| ||||| ||| |  || |||| |||| |||||||||||  || |||||| ||| ||| ||||||||    
T  14535332 ttcattcaaattgatatattagattgatacaatacaaatttaaagtgtttaaaaataaaaaggatgaatctgcaaataaactcgcaaaatcaatgttaat 14535233  T
Q  475 aacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |  ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  14535232 aggataaaacggcagagtacatatgtctataaatatga 14535195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 490
Target Start/End: Original strand, 39308422 - 39308546
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||       |||||||| | |||| || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  39308422 aaaataaatgatattcattcattcaatttgataaagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaa-aagatg-atgaatctgcgaacaaactc 39308513  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39308514 acatcatctatattaatagcataaaacggcaaa 39308546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 512
Target Start/End: Original strand, 12524405 - 12524481
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  12524405 ggatgaatatgtgaacaaactcacaacattcatgttaatagcataaaatgacaaagtacaaaagcctacaaatatga 12524481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 668
Target Start/End: Original strand, 17523421 - 17523488
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  17523421 tgcacttgatcaaaactaatctttcgacctgaatcaaataaacaccgcaataagacgggaaataaaaa 17523488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 489
Target Start/End: Original strand, 17566141 - 17566256
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |  |||||| |  ||||||| ||  |||||||||| |||||| || ||||    
T  17566141 attcattcaaattgatagattacattgatactatacaaattcaaagtcgctataaacaacacagatgaatttgcaaacaaactcataacatccattttaa 17566240  T
Q  474 taacataaaacggcaa 489  Q
    || |||||||| ||||    
T  17566241 tagcataaaactgcaa 17566256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 616 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 18573526 - 18573467
Alignment:
Q  616 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||    
T  18573526 ctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaaacgagaaagcaaaagcacacc 18573467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 485
Target Start/End: Original strand, 26240416 - 26240475
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26240416 aaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcgcaacatctatgttaatagcataaaacg 26240475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 32390326 - 32390463
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgata--caatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    ||||||||  || |||||||||| | ||||||| |||| |||||||  | |||||| | |||||||  | |||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  32390326 aaaataaattatattcattcatttatattgatatagtagatcgatagtcgatataa-tgcaaattcactaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaac 32390424  T
Q  456 tcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32390425 tcacagtatccatgttaatagcataaaacgacaaagtac 32390463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 11858257 - 11858192
Alignment:
Q  392 agtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaca 460  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11858257 agtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaaaaa---ggatgaatctgtgaacaaactcaca 11858192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 486
Target Start/End: Original strand, 11976800 - 11976850
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacgg 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11976800 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacataaaacgg 11976850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 538 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 14535177 - 14535046
Alignment:
Q  538 gaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaa 637  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||      |||| | |||| |||||| |||| || |||||||||| | |||||||    
T  14535177 gaatactcatgtatccggatctgcaacgttgatgacgcaaaagtcat------tgattgaatctacacttgatcaaagccaatctttcaatccgaatcaa 14535084  T
Q  638 ataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| || || | ||||| |||| ||||||    
T  14535083 ataaacaccgcattaagatgagaaataaaaaacacacc 14535046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 475
Target Start/End: Original strand, 24288641 - 24288737
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||      ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24288641 ttcattcattcaaattaatagagtacatcaatacaata------caaattcgtt--aaataaaaatgatgattctgcgaacaaactcacaacatccatgt 24288732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24373581 - 24373485
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||      ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24373581 ttcattcattcaaattaatagagtacatcaatacaata------caaattcgtt--aaataaaaatgatgattctgcgaacaaactcacaacatccatgt 24373490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25771055 - 25770903
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||  ||| |||||||| | |||| |||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  25771055 aaaataaaggatattcatttattcaaattgatagagtacatcgat-tgata-caatacaaattcgctaaaaataaaaggtatggatctgcgaacaaactc 25770958  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||||  |  || ||||||  |||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  25770957 acaatgttcatcttaatagaataaaatgacaaagtacataagcctacaaatatga 25770903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 537 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 32309444 - 32309321
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatca 636  Q
    |||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||      ||||  ||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  32309444 ggaatattcatgtcttccaatctgtaacgttgacgacacaaaagtcat------tgattcgatttgcacttgctcaaagttaatcttacaacctgaatca 32309351  T
Q  637 aataaacaccgcactaggacgggaaatcaa 666  Q
    |||||| | || |||| ||||| |||||||    
T  32309350 aataaatatcgtactaagacggaaaatcaa 32309321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 34866877 - 34866746
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaaca-aaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||       |||||||| | |||| | |||  ||||||| || |||||||||    
T  34866877 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatatagtgcatcaatacaatg------caaattcgctaaaaaaacaaaaagatgaatatgcgaacaaact 34866784  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  34866783 cacaacatccatgttaatagcaaaaaacgtcaaagtac 34866746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 512
Target Start/End: Original strand, 40268317 - 40268467
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||  || || ||||| | || || | |||||||  ||| || ||   |||||||||||||    
T  40268317 taaacgatattctttcatttaaattgatagagtacatcaataatatttagattcagagtcattaataacaaaaatgataaacctacaaacaaactcacaa 40268416  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
      |  ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  40268417 agttcatgttaataacctaaaacggcaaagttcataagcctacaaatatga 40268467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 484
Target Start/End: Original strand, 39558171 - 39558284
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||| | ||||| ||| | |||||| ||  |||||| | ||||||| |||||    
T  39558171 ttcatccattcaaattaatagagtacattgatataatacaaatccaaagtcgctaaaaactaaaagtatgaatttgcaaacaaattgacaacatttatgt 39558270  T
Q  471 taataacataaaac 484  Q
    ||||| ||||||||    
T  39558271 taatagcataaaac 39558284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 515
Target Start/End: Original strand, 9034629 - 9034762
Alignment:
Q  373 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||  | ||| |||| || || |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  9034629 cattcattcaaattgatagagtacatcgatac------aatgcaaattcg--ctaaaaaaaacgg-tggatctgtgaacaggctcacaacatccatgtta 9034719  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||  ||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||| ||||    
T  9034720 atggcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatataacta 9034762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15571151 - 15571092
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  15571151 aaaacataatggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg 15571092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 413
Target Start/End: Original strand, 19200251 - 19200306
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaat 413  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19200251 aaaataaacaatattcattcattcaaattaataaagtacatcgatacaacataaat 19200306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 37425409 - 37425351
Alignment:
Q  417 aattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaata 475  Q
    |||||| | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37425409 aattcgataaaaacaaaaatgatgaatatgtgatcaaactcacaacatctatgttaata 37425351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 374709 - 374596
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||| |  || ||||||||||  || |||||| |||| ||||| |||    
T  374709 taaatgatattcatttattcaatttgatagagtacattgatatactacaaattcaaaatttttaaaaacaaaataaataaatctgggaacgaactcgcaa 374610  T
Q  462 catctatgttaata 475  Q
    |||| || ||||||    
T  374609 catccatattaata 374596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 403
Target Start/End: Original strand, 4726672 - 4726717
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgata 403  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4726672 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacattgata 4726717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 516 - 584
Target Start/End: Original strand, 4726740 - 4726809
Alignment:
Q  516 atatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||||||||||||  | || |||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4726740 atatgactatatttaaatctccggaatagtcatgtctccggatctgcaacgtagatgacaccaaagtcat 4726809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11867946 - 11867905
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11867946 aaaaaaaacgatgttcatttattcaaattgatagagtacatc 11867905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 25487812 - 25487763
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  25487812 atctttcaacctgaatcaaataaacaatgcactaagacgggaaataaaaa 25487763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Original strand, 29663030 - 29663087
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc 415  Q
    |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29663030 aaaataagtgatattcactcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaattc 29663087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 675
Target Start/End: Original strand, 42512867 - 42512956
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| | |||||  |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||| ||||||    
T  42512867 gtcattgtttggatcaacacttgatcaaagctaatctctcaacctgaatcaaataaataccgtacaaagacggaaaaacaaaaccacacc 42512956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 4954226 - 4954174
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  4954226 ggatgaatatgtgaacaaactcacaacatcaaagttaatagcatataacggca 4954174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 13007516 - 13007480
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13007516 aaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 13007480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 499
Target Start/End: Original strand, 17067442 - 17067587
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||   | | || |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  17067442 aaaacaaacgatagtcatttattcaaatggatagagtacattgatgcaatacaaattcgaaactgctaaacacaaaaaggatgaatctacgaacaaactc 17067541  T
Q  458 acaacatctat----gttaataacataaaacggcaaagtacttatg 499  Q
    ||| |||| ||    ||||||| |||||||||| | ||||| ||||    
T  17067542 acatcatccatacaggttaatagcataaaacggtagagtacatatg 17067587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19335841 - 19335745
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaat 474  Q
    ||||||||||||| |||| || | || |||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  19335841 attcaaattgataaagtatattggtataataaaaattaaaagtcacttaaaacaaaaaggatgaatctaggaacaaactcacaacattcatgttaat 19335745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 437 - 485
Target Start/End: Original strand, 20257542 - 20257590
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  20257542 gatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacg 20257590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 34000057 - 33999951
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtaca-tcgatacaatataaattcaaattcgttca---aaacaaaatggatgaatctgtgaacaa 453  Q
    ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| ||| |||||     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  34000057 aaaataaataatattcatttattcaaattgatagagtataatcaatacaatgcaaatttaaagtcgttattacaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaa 33999958  T
Q  454 actcaca 460  Q
    |||||||    
T  33999957 actcaca 33999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 540 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34874138 - 34874094
Alignment:
Q  540 atactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34874138 atactcatgtctccggatatgcaacgttgacgacgccaaagtcat 34874094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 43148961 - 43148909
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  43148961 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 43148909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4771143 - 4771100
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 406  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4771143 aaacgatattcattcattcaaattgatagagtatatagatacaa 4771100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 406
Target Start/End: Original strand, 8096300 - 8096343
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 406  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8096300 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatagatacaa 8096343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 13677490 - 13677415
Alignment:
Q  385 ttgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaca 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| | ||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  13677490 ttgatagagtacatcgttacaatacaaatttaaaatcgctaaaaacgaaaatgatgaatctgcaaacaaactcaca 13677415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 32755536 - 32755427
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||  ||| ||  || ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  32755536 attcattcaaattgatagagta-atccatacaatacaaatttaaaatcgctaaaaacaaaaaagat-aagttgcgaacaagatcacaacatttatgttaa 32755439  T
Q  474 taacataaaacg 485  Q
    || ||| |||||    
T  32755438 tatcatgaaacg 32755427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 601 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 34906375 - 34906332
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaaca 644  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34906375 tgcacttgctcaaagctaaactttcaaccttaatcaaataaaca 34906332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9406562 - 9406407
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||  |  | |||||| ||||||||| ||| | |||| ||||   |||||| ||  ||||||||     
T  9406562 aaaataaacgatattcatttatttaaattgataaaata--ttcaaacaatacaaattcaaagtcgataaaaataaaaatcatgaatatgaaaacaaactt 9406465  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
     || |||||||||||||| ||||||| | |  ||||| || |||||||||||||||||    
T  9406464 gcatcatctatgttaatagcataaaaagacggagtacataagcctacaaatatgacta 9406407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 13422156 - 13422106
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacgg 486  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13422156 ggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacgg 13422106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 26905521 - 26905603
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||| ||||    
T  26905521 gtcattgattgaatctgcatttcctcaaagataatatttccacctgaatcaaataaacaccacattaagacgagaaataaaaa 26905603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 34881961 - 34881899
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  34881961 aaaacataaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 34881899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 454
Target Start/End: Original strand, 35275749 - 35275815
Alignment:
Q  388 atagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaa 454  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  |||| |||| |||||||| || |||||||    
T  35275749 atagagtacattgatacaatacaaattcaaagtcgtaaaaaataaaaaggatgaatttgcgaacaaa 35275815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 374518 - 374453
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||||  |||| |||||||| |||| | || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  374518 tcattgactggatatgcacttgatcaaagttactctttcaacttgaatcaaacaaacaccgcacta 374453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 488
Target Start/End: Original strand, 2979174 - 2979223
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  2979174 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggca 2979223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 12215540 - 12215431
Alignment:
Q  402 tacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaa-ctcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgc 500  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||| |||||||||| || | | |||||| ||||||| ||||||   ||||||||| ||  |    
T  12215540 tacaatacaaattcaaagtcgttaaaaataaaaaggataaatttgtgaacaaaacttataccatctacgttaatagcataaaggtgcaaagtacctaaac 12215441  T
Q  501 ctacaaatat 510  Q
    ||||||||||    
T  12215440 ctacaaatat 12215431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 484
Target Start/End: Original strand, 15710036 - 15710104
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaac 484  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  15710036 caaattcgttaaaaacaaaatagatgaatccacgaataaactcacaaattc-atgttaataacataaaac 15710104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16575224 - 16575167
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc 415  Q
    |||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16575224 aaaataaacgatattaatttgtttaaattgatagagtacattgatacaataaaaattc 16575167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 16758761 - 16758708
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||  |||||||||    
T  16758761 gatgaatcagtgaacaaactcacaacatccaagtcaataacatgcaacggcaaa 16758708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24874752 - 24874691
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtactta 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  24874752 ggatgaatctgtgaacaaattcacatcacccaagttaataacatacaacgacaaattactta 24874691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 403
Target Start/End: Original strand, 28423705 - 28423750
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgata 403  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28423705 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatatagtacattgata 28423750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 41630720 - 41630671
Alignment:
Q  441 aatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||    
T  41630720 aatctgtgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaacgacaaa 41630671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 2057834 - 2057882
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  2057834 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 2057882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 6011939 - 6011975
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6011939 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 6011975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 7242018 - 7241966
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  7242018 ggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggca 7241966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 7247193 - 7247141
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  7247193 ggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggca 7247141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 8984790 - 8984826
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8984790 aaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 8984826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 9113526 - 9113562
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9113526 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 9113562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13677551 - 13677511
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacat 398  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13677551 aaaataaacgatattcattcattcaagttgatagaatacat 13677511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 18677310 - 18677362
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  18677310 ggatgaatctgcgaacaaacacacaacatccaagttaatagcatataacggca 18677362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 24229585 - 24229621
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24229585 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 24229621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 673
Target Start/End: Original strand, 26240593 - 26240649
Alignment:
Q  617 taatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcaca 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  26240593 taatcgttcaacctgaatcaaataaacatcacactaagacggaaaataaaaaacaca 26240649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 26877910 - 26877946
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26877910 aaacgatattcattcattcgaattgatagagtacatc 26877946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 27266855 - 27266903
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  27266855 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 27266903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 34881801 - 34881753
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  34881801 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 34881753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38598076 - 38598048
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598076 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 38598048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 641
Target Start/End: Original strand, 39531636 - 39531676
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataa 641  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39531636 tgcacttgattaaagctaatctttcaacctgaatcaaataa 39531676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 41184285 - 41184337
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  41184285 ggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggca 41184337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 205)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 12890772 - 12891084
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12890772 aaaataaacgatattcattaattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 12890871  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaa-tatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccag 555  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  12890872 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctaaaaaatatgactaatatgactatatttatttctctggaatactcatgtctctag 12890971  T
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890972 atctacaacgttgacgacaccaaagaaattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 12891071  T
Q  656 cgggaaatcaaaa 668  Q
    || ||||||||||    
T  12891072 cgagaaatcaaaa 12891084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 35333971 - 35333654
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35333971 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactc 35333872  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  35333871 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtcttcggaatactcatgtctccgga 35333772  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35333771 tctgcaacgttgatgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 35333672  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacac 674  Q
    || |||| |||| |||||    
T  35333671 ggaaaataaaaaacacac 35333654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 33012514 - 33012203
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33012514 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactc 33012415  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  33012414 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgccttcaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatatctccgga 33012315  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33012314 tatgcaacgttgacgacgccaaaatcattgtcgttgatcggatttgcacttgatcaaagctaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcactaagac 33012215  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||||    
T  33012214 gggaaatcaaaa 33012203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Original strand, 13878664 - 13878974
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13878664 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatcaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 13878763  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| || ||    
T  13878764 acatcatccatgttaataccataaaacggcaaagtacttatacctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctctgaagtactcatgtccccgga 13878863  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  13878864 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccctactaaaac 13878963  T
Q  657 gggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||||    
T  13878964 gggaaatcaaa 13878974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Original strand, 14018789 - 14019099
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14018789 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatcaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 14018888  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| || ||    
T  14018889 acatcatccatgttaataccataaaacggcaaagtacttatacctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctctgaagtactcatgtccccgga 14018988  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  14018989 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccctactaaaac 14019088  T
Q  657 gggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||||    
T  14019089 gggaaatcaaa 14019099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Original strand, 20560788 - 20561104
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20560788 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 20560887  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatg-ttctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||    
T  20560888 acaacatccatgttaatagtataaaacggcaaagtacacatgcctacaaatatgactaatatgactata-ttatgtttccggaatacccatgtctccgga 20560986  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20560987 tttgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctactcttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagat 20561086  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacac 674  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  20561087 gggaaataaaaaacacac 20561104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 358 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 44942752 - 44942451
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44942752 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcgctataaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 44942653  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| | ||    
T  44942652 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtcttcgga 44942553  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  44942552 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaagctgaatcaaataaacaccgcactaagac 44942453  T
Q  657 gg 658  Q
    ||    
T  44942452 gg 44942451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 358 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 36868474 - 36868158
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  36868474 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatataatataaatttaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgtacaaactc 36868375  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||    
T  36868374 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatacgactatattcatgtctccagaatactcatgtctcctga 36868275  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36868274 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgaacggatttgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 36868175  T
Q  657 gggaaatcaaaagcaca 673  Q
    | |||||||||| ||||    
T  36868174 gagaaatcaaaaacaca 36868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 5754748 - 5754436
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5754748 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 5754649  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||    
T  5754648 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgaccaatatgactatattcatgtctccggaatacttatgtctccgga 5754549  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5754548 tctgcaacgttgacgacaccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 5754455  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  5754454 gagaaatcaaaaacacacc 5754436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 38534960 - 38535278
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38534960 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacat-gatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 38535058  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaa-gtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccag 555  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||    
T  38535059 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaatgtacatatgtctacaaatatgattaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtatctag 38535158  T
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38535159 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcatggatcgaacctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 38535258  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  38535259 cgggaaataaaaaacacacc 38535278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 31908472 - 31908782
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31908472 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatagaaatccaaatttgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 31908571  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  31908572 acagcattcatgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgattatgtttttgtctctggaatacttatgtctccgga 31908671  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31908672 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaa-ctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 31908770  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
     |||||||||||    
T  31908771 aggaaatcaaaa 31908782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 358 - 641
Target Start/End: Original strand, 34416418 - 34416702
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||  || |||||||||||||||||     
T  34416418 aaaataaacgatattcattcattcgaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaagacgaatctgtgaacaaactt 34416517  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  34416518 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccgga 34416617  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataa 641  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34416618 tctgcaatgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataa 34416702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 12705152 - 12704836
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12705152 aaaataaaggatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactc 12705053  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||||  |    
T  12705052 acaacatccgtgttaatagcataaaacg-caaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgattatattcatgtctccagaatactcatgtctccgaa 12704954  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  12704953 tctgcagcgttgacgacgccaaagtcattgtgattgatctgatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagac 12704854  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacac 674  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  12704853 gggaaataaaaaacacac 12704836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 28230752 - 28231070
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  28230752 aaaataaacgatattcgttcattcaaattgttagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatcactaaacaaactc 28230851  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| | || |||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  28230852 acagcctccatgttaatagtataaaacagcaaaatacatatgcctacaaatatgattaatatgactatattcatgtctctagaatattcatgtctccaga 28230951  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28230952 tctgcaatgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctgatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 28231051  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||| || |||| ||||||    
T  28231052 gggatataaaaaacacacc 28231070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 362 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 4739791 - 4739500
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4739791 taaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaa 4739692  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |   | |||||||||||||| ||||||    
T  4739691 catccatgttaatagcataaaacaacaaagtatctatgcctacaaatatgactaatgtgacaatattcaagtcttcagtatactcatgtctccggatctg 4739592  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4739591 caacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 4739500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 29543259 - 29542940
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| | | |||| ||||||||||||     
T  29543259 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaagaaagaatttgtgaacaaacta 29543160  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||| ||    
T  29543159 acaacatccgtgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccgaaatacccatgtctccgga 29543060  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaat-aaacaccgcactagga 655  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  29543059 tctgcaacgttgatgacgccaaaatcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaaacaccgcactaaga 29542960  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  29542959 cgggaaatcaaaaacacacc 29542940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Original strand, 9689640 - 9689957
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  9689640 aaaataaacgatatacattcatttaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 9689739  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  9689740 atagcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatactacaaatatgactatattcatgtctctggaatacttatgtctccgga 9689839  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  9689840 tctgcaatgctgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactgagac 9689939  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacac 674  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  9689940 gggaaataaaaaacacac 9689957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 43696334 - 43696016
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  43696334 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatcgatgaacaaactc 43696235  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| | ||    
T  43696234 acatcatccatgttaatatcataaaacggcaaagtacatgtgcttacaaatatgactaatatgactatattcatgtcttcggaatactcatgtcttcgga 43696135  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43696134 tctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgttcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 43696035  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     |||||| |||| ||||||    
T  43696034 aggaaattaaaaacacacc 43696016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 361 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 32015716 - 32015408
Alignment:
Q  361 ataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaca 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |||||  | ||||| |||||||||||| | |    
T  32015716 ataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaagcaaaaatgttgaatatgtgaacaaacttaaa 32015617  T
Q  461 acatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatct 559  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32015616 acatccatgttaatagcataaaacagcaaagtatttatgcctacaaatatgactaatatgactatattaaagtctctggaatattcatgtctccagatct 32015517  T
Q  560 gcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggg 659  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||     
T  32015516 gcaacgttgacgatgccaaagtcattgacattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgtactaagacgga 32015417  T
Q  660 aaatcaaaa 668  Q
    |||| ||||    
T  32015416 aaataaaaa 32015408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 362 - 675
Target Start/End: Original strand, 43473804 - 43474101
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  43473804 taaacgatattcattcattcaaatcgatataatacattgatataatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacag 43473903  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagatctgc 561  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||    
T  43473904 catccatgttaatagcataaaacggcaaagtactcatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccagatctgc 43473987  T
Q  562 aacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaa 661  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43473988 aatgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 43474087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 358 - 673
Target Start/End: Original strand, 17267781 - 17268097
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17267781 aaaataaacgatattcatttattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactc 17267880  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||| ||| | ||    
T  17267881 acaacatacacgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtcttcggaatactcatttctacgga 17267980  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |  ||    
T  17267981 tctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaattttttaacctgaatcaaataatcaccacacaaaaac 17268080  T
Q  657 gggaaatcaaaagcaca 673  Q
    |||||||||||| ||||    
T  17268081 gggaaatcaaaaacaca 17268097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 41798060 - 41797742
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41798060 aaaataaacgatgttcgttcattcaaatt-atagagttcattgatacaatacaaatttaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 41797962  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttat----gt-tctggaatactcatgtctc 552  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    || ||||||||||||||||||     
T  41797961 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcctacaaatataactaatatgactatatatattcaagtctctggaatactcatgtctt 41797862  T
Q  553 cagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  41797861 cggatctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgaacggatctgcacttgctcaaagctaatctt---acctgaatcaaataaacaccacacta 41797765  T
Q  653 ggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     ||||||||||||||| ||||||    
T  41797764 agacgggaaatcaaaaacacacc 41797742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 9978333 - 9978642
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| | ||||| ||| | |||||| |||||||||||||    
T  9978333 aaaataaactatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacacatccaaattcgctaaaaacgaaaagaatgaatatgtgaacaaactc 9978432  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |         ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9978433 acatcatccatgttaatatcataaaacggaaaagtacttacgcctacaaatatgacga---------tatttatgtctctggaatactcatgtctccgga 9978523  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9978524 tctgcaacgttgatgacgccaaaatcattgtcattgattggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 9978623  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  9978624 gggaaatcaaaaacacacc 9978642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 11937521 - 11937831
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11937521 aaaataaatgatattcatttatccaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaatttcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaactaactc 11937620  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||  |||||||||||||| | ||    
T  11937621 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgacta-------gtctccagaatactcatgtcttcgga 11937713  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    | ||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  11937714 tatgcaacgttgacgacgctaaggtcattgtcactgatcggatctgcacttgctcaatactaatctttcaacct-aatcaaataaacaacgcactaagac 11937812  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  11937813 gggaaatcaaaaacacacc 11937831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 4426314 - 4426631
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  4426314 aaaataaacgacattcattcattcaaattcatagagtacatcgatacagtacaaatccaaattcgctaaaaactaaaaggatgaatttatgaacaaactc 4426413  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    | | |||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    ||||| |||||| ||| |||    
T  4426414 atagcatccatgttaatagcataaaatggaaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccgaatattcatgtatccggat 4426513  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4426514 ctgcaacgttgacgatgataaagttattgtcatttatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 4426613  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  4426614 ggaaatcaaaaacacacc 4426631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 32314891 - 32314590
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc-aaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32314891 aaaataatagatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaaatccaaattcgtttaaaacaaaaaggatgaat-tgtgaacaaact 32314793  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||| ||    
T  32314792 caaaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattt----------------atgtctccgga 32314709  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32314708 tctgcaacgttgacgacgccaaagttattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 32314609  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  32314608 gggaaataaaaaacacacc 32314590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 385 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 22597575 - 22597283
Alignment:
Q  385 ttgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  22597575 ttgatagagtacatctatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcataacatccatgttaatagcataaaa 22597476  T
Q  484 cggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtc 582  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||   |||||||    
T  22597475 cggcaaagtaccaatgcctacaaatatgactaatatgactatatccaagtctccggaatactcatgtctctggatctgcaacattgacgatgtcaaagtc 22597376  T
Q  583 atggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  22597375 attatcattgatcggacctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaataaaaaacacacc 22597283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 362 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 11942830 - 11942584
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11942830 taaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacgtcgatataatacaaattcaaattcgcaaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaataaactcacaa 11942731  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    || | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11942730 cacccatgttaatagcataaaatggaaaagtacttatgcctacaaatatgtctaatatgactatattcatgtctctggaatactcatgtctccagatctg 11942631  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcactt 607  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11942630 caacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcactt 11942584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 28261560 - 28261861
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  28261560 aaaataaacaatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgataaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaactc 28261659  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||| |||    
T  28261660 acaacatccatggtaataacataaaatgacaaagtaccgatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccggat 28261743  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28261744 ctgcaacgttgacgacgcgaaagttattgtcattgatcggatctgctcttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 28261843  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  28261844 ggaaataaaaaacacacc 28261861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 34471422 - 34471114
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    ||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  34471422 aaaataaacgatatacattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatcc----tcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactc 34471327  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||    
T  34471326 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaaatacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctctaga 34471227  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||| || |||||      ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||    
T  34471226 tctgcaacgttgacaacgccaaa------gtcattgattggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacatgaatcaaataaataccgcactaaaac 34471133  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  34471132 gggaaattaaaaacacacc 34471114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 360 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 4732526 - 4732218
Alignment:
Q  360 aataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaa-ttcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4732526 aataaacgatattcattaattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaatccaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactca 4732427  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||||||||||||         |||| | || || ||||||||||||||||| |||    
T  4732426 caacatccatgttaatagcataaaacaacaaaaaatttatgcctacaaatatgacta---------tattcaagtctccggaatactcatgtctccggat 4732336  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4732335 ctgcaacgttgacgacgctaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagataatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagacg 4732236  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  4732235 ggaaatcaaaaacacacc 4732218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 27096155 - 27095861
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27096155 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatggagtacatagatacaatacaaattcaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 27096056  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||                ||| |||||| |||    
T  27096055 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgaccatat----------------tcaagtctccggat 27095972  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27095971 ctgcaacgttgatgacgctaaagtcattgtcattgatcggatcagtacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacatcgcactacgacg 27095872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 359 - 675
Target Start/End: Original strand, 10286670 - 10286980
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  10286670 aaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatagaaatccaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaacaaactca 10286769  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagta-ct-tatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccag 555  Q
     || ||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||         ||||| ||| || ||||||||||||||||| |    
T  10286770 aaatatccatgttaatagcataaaccggcaaagtatctctatgcctacaaatatgacta---------tatttttgtctccggaatactcatgtctccgg 10286860  T
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10286861 atctgcaacgttgacaacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 10286960  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  10286961 cgggaaataaaaaacacacc 10286980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 358 - 658
Target Start/End: Original strand, 18089067 - 18089353
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18089067 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 18089166  T
Q  458 acaacatc--tatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccag 555  Q
    ||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||                |||||||||| |    
T  18089167 acaacatccacatattaatagcataaaacggcaaaatacctatgcctgcaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccgg 18089250  T
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18089251 atctgcaacgctgacgaagccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaaga 18089350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 25068307 - 25068000
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25068307 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 25068208  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||         |||||||| | || |  ||||| ||| ||||||| ||    
T  25068207 acatcatcagtgttaatagcataaaacggcaaggtacctatgcctacaaatatg---------actatattcaagtcttcggaatcctcttgtctccgga 25068117  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25068116 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcgaatctgc-tttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaaca-cgcactaagac 25068019  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  25068018 gggaaataaaaaacacacc 25068000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 38384121 - 38384430
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  38384121 aaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagcacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacgtgtgaacaaactc 38384220  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | | |||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||         |||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  38384221 agagcatccatgttaatagcctaaaacggcaaggtacctatgcctataaatatgacta---------tatttaagtctccggaatcctcatgtctccgga 38384311  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  38384312 tctgcaatgttgatgacgccaaagttattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaataaaataaacaccgcactaagac 38384411  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || |||| |||| ||||||    
T  38384412 ggaaaataaaaaacacacc 38384430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 13740309 - 13740633
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  13740309 aaaacaaacgatattctttcattcaaattgataaagtacatcaatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgagtttgtgaacaaactc 13740408  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact------aatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtc 550  Q
    ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||      |||||||||||||| |||| || | ||||  ||||||    
T  13740409 acagcatccatgttaatactataaaacggcaaagtacctatgcctataaatatgactatattcaatatgactatattcatgtctccgaaatatgcatgtc 13740508  T
Q  551 tccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 650  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13740509 tccggatctgcaacgttgacgacgtcaaagtaattgtcattgattggatctgtacttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcac 13740608  T
Q  651 taggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||||  ||| ||||| ||||||    
T  13740609 taagacgaaaaagcaaaaacacacc 13740633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 362 - 674
Target Start/End: Original strand, 4603975 - 4604279
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || |  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  4603975 taaacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaatccgctagaaacaaaaaagatgaatctctgaacaaactcacaa 4604074  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||         |||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  4604075 tatccatgttaatagcataaaacggcaaaatatctatgcctaca---------aatatgactatattcaagtctctagaatact-atgtctctagatctg 4604164  T
Q  561 caacgttgacg-acaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggg 659  Q
    ||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4604165 caacgttgacgaagtcaaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctagtctttcaacctgaatcaaataaacaccacactaagacggg 4604264  T
Q  660 aaatcaaaagcacac 674  Q
    |||| |||| |||||    
T  4604265 aaataaaaaacacac 4604279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 358 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 16136544 - 16136322
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16136544 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 16136445  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||  |    
T  16136444 acattatccatgttaatagcataaaacggcaaagttcctatgcctacaaatatgattaatatgactatattcatatctccggaatactcatgtctccgaa 16136345  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaa 579  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16136344 tctgcaacgttgacgacgccaaa 16136322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 360 - 668
Target Start/End: Original strand, 11798195 - 11798489
Alignment:
Q  360 aataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcac 459  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||| |||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  11798195 aataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaattcaaattcaaagtcgctaaaaataaaaag-atgaatctgcgaacaaactcac 11798293  T
Q  460 aacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctcc-agat 557  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||         |||||||||||||| | || ||   ||||||||||||||| | ||    
T  11798294 aacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctaca---------aatatgactatattcaagtctccataatactcatgtctccgaaat 11798384  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||| | |||      |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11798385 ctgcaacgttgacgacgcaaaa------gtcattgatcggatctacacctgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacg 11798478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15920319 - 15920030
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15920319 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcac------taaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactc 15920226  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||| | || |  | ||||||||||| ||| ||    
T  15920225 gcaacatcaatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatg---------actatattcaagtcttcgaaatactcatgtttccgga 15920135  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  15920134 tctgcaacgttgacgacgccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgcacaaagctaatatttcaacctgaatcaaataaaca-cgcattaagac 15920042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 675
Target Start/End: Original strand, 34962818 - 34963049
Alignment:
Q  452 aaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtactt-------atgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatac 543  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||  |||| |    
T  34962818 aaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacccggtacccatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaaatctccagaatcc 34962917  T
Q  544 tcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaac 643  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34962918 tcatgtcttcggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgataggatctgcacttgctcaaatctaatctttcaacctgaatcaaataaac 34963017  T
Q  644 accgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34963018 accgcactaagacgggaaatcaaaaacacacc 34963049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 37884096 - 37883886
Alignment:
Q  360 aataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcac 459  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||      | | |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37884096 aataaacgatattcattcattcaaattgatatagtacatcaatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcac 37884003  T
Q  460 aacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatc 558  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||          ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  |||    
T  37884002 atcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtatctagaatactcatgtctccgtatc 37883912  T
Q  559 tgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37883911 tgcaacgttgacgactccaaagtcat 37883886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 675
Target Start/End: Original strand, 17767227 - 17767533
Alignment:
Q  360 aataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaaca------- 452  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||| ||| | ||||||||| ||| |||| || |||||           
T  17767227 aataaacgatattcattcatttaaattgatagagtactttgatacattttaaatccaaaatcgctaaaaacaaaaaggaagaatttgcgaacatgcgaac 17767326  T
Q  453 -aactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtc 550  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||         |||| | || ||   ||||||||||||    
T  17767327 aaactcacaacatccatgttaatagcataa---ggcaaagtatctatgcctacaaatatgacta---------tattcaagtctcaataatactcatgtc 17767414  T
Q  551 tccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 650  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||      |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||    
T  17767415 tccggatctgcaacgttgacgacgcagaagtca------ttgatcggatctgcacttgctcaaagttaatcttttaacctaaatcaaataagcaccgtac 17767508  T
Q  651 taggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || || |||||||||||||||||||    
T  17767509 taagatgggaaatcaaaagcacacc 17767533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 397 - 675
Target Start/End: Original strand, 6431112 - 6431375
Alignment:
Q  397 atcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtactt 496  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||| | |||  |||| ||||||| ||| ||||||| ||| || |||||| |||||  |||||||||||||||||| |    
T  6431112 atcgatacaatttaaatctaaaatcgctaaaataaaaaaggatgaacctgcgaacaaaatcaaaa-atctatattaatcgcataaaacggcaaagtacat 6431210  T
Q  497 atgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatc 595  Q
    |||| ||||||||||||||         |||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||      |||||    
T  6431211 atgcatacaaatatgacta---------tatttaagtctccggaatactcatgtcttcagatctgcaacattgacgacgcaaaagtcat------tgatc 6431295  T
Q  596 ggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  6431296 agatctgcgcttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaatcaacaccgcactaagatcggaaatcaaaaacacacc 6431375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 544 - 675
Target Start/End: Original strand, 7072790 - 7072921
Alignment:
Q  544 tcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaac 643  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7072790 tcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgattggatttgcacttcctcaaaactaatatttcgacctgaatcaaataaac 7072889  T
Q  644 accgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||    
T  7072890 accgcactaagacaggaaataaaaaacacacc 7072921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 5071052 - 5071190
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5071052 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaata------caaattcgctaataacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgt 5071145  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||    
T  5071146 taatagcataaaacggcataatacataagcctacaaatatgacta 5071190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 4878403 - 4878556
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||    |||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4878403 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatacaatgaa----aattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 4878498  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  4878499 acagcatccatgttaataacataaaacggtcaagtactaaagcctacacatatgacta 4878556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 34962650 - 34962786
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||     
T  34962650 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacataaatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaacaggatgaatgtgtgaacaaactt 34962749  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34962750 acagcatccatgttaatagcataaaacggcaaggtac 34962786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 41177303 - 41177155
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  41177303 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtaaatcgatataatg------caaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 41177210  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  41177209 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatga 41177155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 3397661 - 3397799
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||      ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  3397661 ttcattcattcaaattgatagagtacattgatgcaata------caaattctttaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacaaccatgt 3397754  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  3397755 taatagcataaaacgacaaagtacataagcatacaaatatgacta 3397799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4703597 - 4703440
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||| |||||||| |   |||||||||    
T  4703597 aaaataaacgatattcattcatccaaattgacagagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcgccaaaaacaaaaaggatgaattttcaaacaaactc 4703498  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
     ||||| | |||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4703497 gcaacaaccatgttaataatataaaacagtatagtacatatgcttacaaatatgacta 4703440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 372 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35354071 - 35353934
Alignment:
Q  372 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35354071 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactcacaacatccatgtt 35353978  T
Q  472 aataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| ||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  35353977 aatagcataaaacaacaaagtacataagcctataaatatgacta 35353934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 374 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 44589322 - 44589206
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44589322 attcattcaaattgatagaataaatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaactcacatcatccatgttaa 44589223  T
Q  474 taacataaaacggcaaa 490  Q
    || ||||||||| ||||    
T  44589222 tagcataaaacgacaaa 44589206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 30933692 - 30933542
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||       || |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  30933692 aaaataaacgatattcatttattcaaattgata-------tcaatacaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgattatgtgaacaaactc 30933600  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  30933599 acaacatccatgttaatagcataaaacggaaaaatatttatgcctataaatatgacta 30933542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 106707 - 106557
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatct-gtgaacaaact 456  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  106707 aaaataaataatattcattcattcaaattgatagactatatcgaaacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaaactagtgaacaaact 106608  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaa 507  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  106607 cacatcatccatgttaatagcatgaaacgacaaagtatatatgcctacaaa 106557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Original strand, 2251033 - 2251167
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      | | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2251033 attcattcaaattgatagagtacatcgaagcaatataaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaat-tgtgaacaaactcacgacatccatgttaa 2251125  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2251126 tagcataaaactgcaaagtacataagcctacaaatatgacta 2251167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11931317 - 11931166
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||       |||||||| | |||| |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  11931317 aaaataaatgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaataaaaagaatgaatctgcgaacaaactc 11931224  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  11931223 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagcctacacatatgacta 11931166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17792920 - 17792767
Alignment:
Q  361 ataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaca 460  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||  ||||||| || |||||||  ||||    
T  17792920 ataaacgatattcattaattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcgtt-aaagcataaaagatgaatttgcgaacaaaaacaca 17792822  T
Q  461 acatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  17792821 acatctatgttaatagcataaaatagtagagtatatatgcctacaaatatgacta 17792767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 25622713 - 25622864
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||      | | ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  25622713 aaaataaatgacattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgtaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactc 25622806  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  25622807 acaacatccatgttaatagcataaaacgtcaaagtacaaaagcctacacatatgacta 25622864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 483
Target Start/End: Original strand, 40038978 - 40039103
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  40038978 aaaataaacgatatccattcattcatattgataaagtacatcgatacaataaaaattcaaagtcattaaaaacaaaaatgatgaatctacgaacaaactc 40039077  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||    
T  40039078 acaacgtccatgttaatagcataaaa 40039103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43567317 - 43567167
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||   | |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  43567317 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcaata---tat---tgcaaattcgctaaaaacaaaa-ggatgaatctgtgaacaggctc 43567225  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  43567224 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 43567167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 26491746 - 26491534
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26491746 aaaacaaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactc 26491653  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||  ||| |||||||||  |||| ||| ||||||||| | |||||||          ||||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| ||    
T  26491652 acattatccatgttaatagtataacacgacaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtctccggaatgcccatgtctccgga 26491562  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26491561 tctgcaacgttgacgactccaaagtcat 26491534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 360 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20570422 - 20570267
Alignment:
Q  360 aataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcac 459  Q
    |||||||||| ||||| |||| || |||||| | ||||| ||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  20570422 aataaacgatattcatccatttaagttgataaaatacattgatacaattcaaattcaaaatcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacaaactcac 20570323  T
Q  460 aacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  20570322 agcatctatgttaatagcataaaacgacaaagtagctatgcttacaactatgacta 20570267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3603430 - 3603279
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  3603430 aaaataaaaaatattcattcattcaaatttatatagtacttcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 3603337  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  3603336 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 3603279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25771890 - 25771739
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  25771890 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctc 25771797  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||    
T  25771796 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgacta 25771739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27666002 - 27665844
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatct-gtgaacaaact 456  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||| | | | |||||||||  ||||||| | | |||||||||    
T  27666002 aaaataaacaatattcattcattctaattgatagaatacatttatacaatacaaatttaaaattgctaaaaacaaaaatgatgaatattgcgaacaaact 27665903  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27665902 cacaacatctatgttaatagtataaaacatcatagtacatatgcctacaaatatgacta 27665844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 15673633 - 15673849
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaatt-----gatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaaca 452  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| |||||||||||  ||||    
T  15673633 aaaataaaagatattcattcattcaaattaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatctga-aaca 15673725  T
Q  453 aactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtct 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||          ||||||||||||||| || || ||||||  |||||||    
T  15673726 aactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaaatactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtctccggaatatccatgtct 15673816  T
Q  552 ccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15673817 ccagatctgcaacattgacgactccaaagtcat 15673849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 362 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12366309 - 12366164
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||    
T  12366309 taaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac------aatgaaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaacctctcaa 12366216  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgac 513  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||    
T  12366215 catccatgttaatagcataaaacgaaaaagtactaaagcctacacatatgac 12366164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 359 - 490
Target Start/End: Original strand, 25237001 - 25237126
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||| |||   |||||||| |||||| |||||||||||    
T  25237001 aaataaatgatattctttcattcaaattgatagagtatatcgatacaatg------caaattcgttaaaacgtaaatggataaatctgggaacaaactca 25237094  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25237095 caacatccatgttaataacataaaacggcaaa 25237126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40125830 - 40125681
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |      ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  40125830 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatagatacaatgaaaatcc------gttaaaaacaaaaagaatgaatatgtgaacaaactc 40125737  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  40125736 acatcatccatgttaatagc--aaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgacta 40125681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Original strand, 43928985 - 43929120
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||      | | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43928985 attcattcaaattgatcaagtacatcgatataatgtaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagactcacaacatccatgttaa 43929078  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  43929079 tagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgacta 43929120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 44167381 - 44167531
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  44167381 aaaataaaagatattcattcattcaa-ttgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggataaatctgtgaacaggctc 44167473  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  44167474 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 44167531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 510
Target Start/End: Original strand, 13548574 - 13548727
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaac-aaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| | | | ||||| |||| ||||||||||  |||||||||    
T  13548574 aaaataaacgatattcattcatttaaattgatatagtacatcgatacaatacgaatttaaaattgctaaaaacaaaaaaggatgaatctacgaacaaact 13548673  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatat 510  Q
    || |  ||| ||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  13548674 cagagtatccatgttaatagcataaaacggtagagtatatatgcctacaaatat 13548727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31812034 - 31811871
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaat--------tgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtga 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    ||| |||||  ||||||||||| |    
T  31812034 aaaataaacgatgttcattcattcaaatgatcagcttgatatagtacattgatacaatataaattcacattcacaaaaagcaaaa--gatgaatctgtaa 31811937  T
Q  450 acaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  31811936 acaaactcacaacatctatttaaatagcataaaacgacaaagaacgcatacctacaaatatgacta 31811871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6090334 - 6090204
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  6090334 aaaataaaagatactcattcattcaaattgaaagagtacatc-----aatataa-tgcaaattcgctcaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacagattc 6090241  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6090240 acaacatccatgctaatagcataaaacggcaaagtac 6090204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 443 - 515
Target Start/End: Original strand, 7072714 - 7072786
Alignment:
Q  443 tctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7072714 tctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcctacaaatatgacta 7072786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 9715226 - 9715343
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  9715226 ttcatttattcaaattgatagagtacaccgatacaatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatctttgt 9715319  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||||| |||| ||||||||    
T  9715320 taataacatataacgacaaagtac 9715343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 359 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13269016 - 13268887
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||| | |||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  13269016 aaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctacgaacaaactca 13268923  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
     |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13268922 taacatccatgttaatatcataaaacagcaaagtac 13268887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 373 - 515
Target Start/End: Original strand, 31125063 - 31125199
Alignment:
Q  373 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||      |||||||| | ||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  31125063 catttattcaaattgataaagtacattgatgcaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgttaaaaaacttacaacatccatgtta 31125156  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  31125157 atatcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatataacta 31125199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3465374 - 3465223
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||| | | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||    
T  3465374 aaaataaaagatatccattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaatttgctaaaaataaaaaggataaatctgtgaacaagctc 3465281  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  3465280 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacacatatgacta 3465223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 3527452 - 3527354
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |   |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3527452 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaatctgccaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaact 3527354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 452
Target Start/End: Original strand, 7071430 - 7071523
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaaca 452  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7071430 aaaaaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaa-ggatgaatctatgaaca 7071523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 378 - 512
Target Start/End: Original strand, 11561362 - 11561496
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||| | | | |||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  11561362 attcaaattgataaagtatatcgattcgatacaaattcaaagttgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaacttacaacatccatgttaatagc 11561461  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    | |||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  11561462 agaaaacgacaaaatatgtatgcctacaaatatga 11561496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 27023808 - 27023959
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||      |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  27023808 aaaataaaagatatttattcattcaaatcgatagagtacatcgatataata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctc 27023901  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||   |||| ||| |||||||||    
T  27023902 acatcatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacaattgcccacacatatgacta 27023959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 27191002 - 27191153
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  27191002 aaaattaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 27191095  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |   |||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  27191096 atggcatccatgttaatagcataaaacggtaaagtacaaatgcctacacatatgacta 27191153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 27840816 - 27840967
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  27840816 aaaattaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 27840909  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |   |||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  27840910 atggcatccatgttaatagcataaaacggtaaagtacaaatgcctacacatatgacta 27840967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 3390868 - 3390738
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||| | | |||||||||  ||||||| ||||||||  |||    
T  3390868 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata------taatgcaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacagtctc 3390775  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3390774 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtac 3390738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 410 - 515
Target Start/End: Original strand, 7640071 - 7640176
Alignment:
Q  410 aaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaata 509  Q
    |||| |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  7640071 aaatgcaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacata 7640170  T
Q  510 tgacta 515  Q
    ||||||    
T  7640171 tgacta 7640176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 438 - 581
Target Start/End: Original strand, 8027747 - 8027882
Alignment:
Q  438 atgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tct 536  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||         ||||||| |||||||| || |||    
T  8027747 atgaatctgttaacaaactcacaacttttatgttaatagcataaaacggcatagtatctatgcctaca---------aatatgattatatttaagtatct 8027837  T
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagt 581  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8027838 cgaatactcatgtcttcagatctgtaacattgacgacaccaaagt 8027882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 382 - 652
Target Start/End: Original strand, 11580824 - 11581080
Alignment:
Q  382 aaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataa 481  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||| | |||||||||  ||||||| |  | |||||||||||||||| |||||||||  | ||    
T  11580824 aaattgattgagtacatcgatacaatacaaatttacagtcgctaaaaacaaaaacgatgaatttacggacaaactcacaacatccatgttaatagtacaa 11580923  T
Q  482 aacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatg-ttctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaag 580  Q
    |||| |||||||| |||| |||||         |||||||| ||||| | |   ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  11580924 aacgacaaagtacatatgtctaca---------aatatgaccatattcaagccacttaaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacgacacaaaa- 11581013  T
Q  581 tcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
          |||||||| | || |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11581014 -----atcattgattgaatttgcacttgatgaaacctaatctttcaacctgaatcaaataaataccgcacta 11581080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13113477 - 13113361
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||   | |||||||| |||||||||  ||    
T  13113477 aaaataaacgatatttattcatttaaattgatagaatacatcgatataatataaattcaaagtcgttataaacgtgaaggatgaatatgtgaacaagttc 13113378  T
Q  458 acaacatctatgttaat 474  Q
    |||||||| ||||||||    
T  13113377 acaacatccatgttaat 13113361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 19580671 - 19580883
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||       | | ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  19580671 aaaataaatgagattcatccattcaaattgatagagtgcatcgatacaatgaaaattt------gctaaaaacaaaaagtttgaatctgtgaacaaactc 19580764  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| | | |||||          |||||| |||||||| || || ||||||  ||||||||| ||    
T  19580765 acaacatccatgttaatagcataaaactgcaaagtactaaagtctaca---------gatatgattatatttaagtctccggaatatccatgtctccgga 19580855  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||    
T  19580856 tctgcaacgttgacaactccaaagtcat 19580883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36508323 - 36508223
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  36508323 caaattcgctaaaagcaaaaaggatgaatctgtgaacaggttcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgact 36508224  T
Q  515 a 515  Q
    |    
T  36508223 a 36508223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38822466 - 38822366
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  38822466 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacatgctcacaacattcatgttaataacatgaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgact 38822367  T
Q  515 a 515  Q
    |    
T  38822366 a 38822366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16570799 - 16570646
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| | || || ||| ||||||||| ||||| ||| ||| |   || ||||| ||||||| || ||||||||||    
T  16570799 aaaataaatgatattcattcattcaaattaaaagtgttcattgatacaatacaaatttaaagtcggt---aaaaaaat-gatgaatttgcgaacaaactc 16570704  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  16570703 acaacatctatgttaataatataagacgacatagtacatatacatacaaatatgacta 16570646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 18141150 - 18141301
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||       |||||| | | |||||||||  ||| ||||||| ||||| | |    
T  18141150 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatgtaatg------caaatttgctaaaaacaaaaatgattaatctgtaaacaagccc 18141243  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  18141244 acagtatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 18141301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 480
Target Start/End: Original strand, 32711882 - 32712004
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |   || ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||| ||    
T  32711882 aaaataaacgatattcattcattttaattaatagagtatactaatgcaatataaattcaaagtcgttaaaaacaaagtggatgaatttgcaaacaaattc 32711981  T
Q  458 acaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||  |||||||||||||    
T  32711982 acaacatcagtgttaataacata 32712004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34480410 - 34480259
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||       | | ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  34480410 aaaataaatgatattcattcgttcaaattgatagagtacaccggtacaatgtaaattcac------taagaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactc 34480317  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||  |  |||||| |||||||||    
T  34480316 acaacatccatgttaatagaataaaacgacaaagtacaaaaacctacacatatgacta 34480259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 19953983 - 19953853
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||       |||||||| | |||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  19953983 aaaataaatgatattcattctttcaaattgatagagtatatctatacaatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctccgaacaaactc 19953890  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    | |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19953889 ataacatccatgttaatagcctaaaacggcaaagtac 19953853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 493
Target Start/End: Original strand, 45693792 - 45693900
Alignment:
Q  385 ttgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaac 484  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  45693792 ttgatagagtatatggatacaatagaaattcaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgattctgcaaacaaactcacatcatctatgttaatagcataaaat 45693891  T
Q  485 ggcaaagta 493  Q
    | |||||||    
T  45693892 gacaaagta 45693900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 9207025 - 9207176
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||       |||||| | | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  9207025 aaaataaatgacattcattcatttgaattgatagagtacatcgatataatg------caaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacatgctc 9207118  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||| |||||||||    
T  9207119 acaacattcatgttaataacataaaacggcaaaacacaaattcctacacatatgacta 9207176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10589467 - 10589389
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||||    
T  10589467 gatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtattaaagcctatacatatgacta 10589389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 652
Target Start/End: Original strand, 20124653 - 20124719
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20124653 gtcattgatcgaatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatgaaataaacaccacacta 20124719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 371 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 27666620 - 27666510
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |   | ||||||||| |||||| |||   ||||||||| |||||||||||     
T  27666620 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgttacaatacaaatttaaaattactaaaaacaaaaaggatgattctacaaacaaactcgcaacatctatgc 27666521  T
Q  471 taataacataa 481  Q
    ||||| |||||    
T  27666520 taatagcataa 27666510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 484
Target Start/End: Original strand, 33839068 - 33839178
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||   |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  33839068 attcattcaagttgatataaaacatcgatacaatataaatttgaagtcgttgaaaacaaaaataatgaatttgcgaaaaaactcacaacatccatgttaa 33839167  T
Q  474 taacataaaac 484  Q
    || ||||||||    
T  33839168 tagcataaaac 33839178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 44441824 - 44441694
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |       |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44441824 aaaataaatgatatttattgattcaaattgatagaatacattgatacattg------caaattcgctaaaaacaaaagggatgaatctgcgaacaaactc 44441731  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    | | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44441730 atagcatccatgttaatagcttaaaacggcaaagtac 44441694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5930868 - 5930719
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||      | | ||||||||| ||||||||  |||||||  |||    
T  5930868 aaaatatatgatattcatttattcaaattgatagagtacattgatataatgtaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaattcgtgaacatgctc 5930775  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgac 513  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||    
T  5930774 acaacatccatattaatagcataaaacgacaaaatacaaatgcctacacatatgac 5930719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 515
Target Start/End: Original strand, 23256302 - 23256450
Alignment:
Q  360 aataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcac 459  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||     ||||||| || ||| | |||| | ||  || |||| ||| |||||||||||    
T  23256302 aataaatgatattcattcattcaaattgataaggtatatcgata-----taaattcgaaatcgctaaaaaaagaa--gaagaatatgtaaacaaactcac 23256394  T
Q  460 aacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23256395 aacatccatgttaatatcataaaacggtagagtacatatacctacaaatatgacta 23256450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25516862 - 25516786
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  25516862 tgaatttgtgaacaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 25516786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31271826 - 31271670
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||| || |||||| ||| | |  | ||||  |||||||||   |||||||| |    
T  31271826 aaataaacgatattcgttcattcaaaatgataaagtacattgacacaatacaagttcaaagtcgctaatgataaaaaagatgaatcttcaaacaaactaa 31271727  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || |||| ||||||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  31271726 catcatccatgttaatagcataaaatggcataatatatatgcctacaaatatgacta 31271670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Original strand, 823845 - 823924
Alignment:
Q  589 attgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  823845 attgattgaatctgaacttgctcaaagctaatttttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaataaaaa 823924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5172232 - 5172091
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||| ||||||| || || ||| |||| |||||| ||||    
T  5172232 ttcatttattcaagttgataaagtatatcgatacaatacaaattcaaagtcactaaaaacaaaat-gatgaatttgcgagcaatctcataacatccatgt 5172134  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgac 513  Q
    |||| ||||||||   |||||||| || ||||| || ||||||    
T  5172133 taatgacataaaaaaacaaagtacataagcctataattatgac 5172091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 464
Target Start/End: Original strand, 12183006 - 12183105
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    |||||||| || || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||      |||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12183006 aaataaacaatattaattcattcaatttgatagagtatatcaatacaata------caaatttgttaaaaacaaaatagatgaatctgcgaacaaactca 12183099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 428
Target Start/End: Original strand, 16379763 - 16379833
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaa 428  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16379763 aaaataaccgatattcatacaatcaaattgatagagtacatcaatacaatattaattcaaagtcgttcaaa 16379833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 416 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 29734587 - 29734423
Alignment:
Q  416 aaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact--cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgac 513  Q
    ||||||| | |||| |||| |||| ||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| | | |||   |||||||    
T  29734587 aaattcgctaaaaataaaaaggattaatctgtaaacaaactatcacagcatccatgttaatagtataaaacggcaaagtactaaagtctagccatatgac 29734488  T
Q  514 taatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||       |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29734487 ta-------tatatttaagtctccggaatactcatgtctccggatcttcaacgttgacgactccaaagtcat 29734423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 27666416 - 27666359
Alignment:
Q  617 taatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacac 674  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  27666416 taatcttttaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaataaaaaacacac 27666359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 521 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 11426940 - 11426791
Alignment:
Q  521 actatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaa 619  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  |||||| || |      ||  |||||||| |||||||| |||||    
T  11426940 actatatttaagtctctagaatactcatgtcttcggatctgcaacattgacgacgtcaaagtgatcg------attagatctgcaattgctcaaagctaa 11426847  T
Q  620 tctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||| |||| |||| ||||||    
T  11426846 tctttcaacttgaatgaaataaatatcgcactagaacggaaaataaaaaacacacc 11426791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19904942 - 19904802
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | | | |||| |||    |||||| ||  |||||||||| || ||  ||||    
T  19904942 ttcattcatttaaattgatatagtacatcgatataatacaaattcaaaattgctaaaaaaaaa----atgaatatgcaaacaaactcataatattcatgt 19904847  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | || ||||||| |||||||    
T  19904846 taatagcataaaacggcagagtacatgtgtctacaaacatgacta 19904802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 652
Target Start/End: Original strand, 26254835 - 26254886
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26254835 tgcacttgctcaaagttaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcacta 26254886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 652
Target Start/End: Original strand, 45694284 - 45694396
Alignment:
Q  534 tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaa 633  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||      ||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||     
T  45694284 tctggaatattcatgtcttcggatctgcaacgttgacgacgttaaagtcat------tgattagatctgcatttgctcaaagataatctttcaacatgag 45694377  T
Q  634 tcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  45694378 tcaaataaacaccgtacta 45694396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 8064457 - 8064607
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| | ||||      ||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  8064457 aaaataaacgatattcattcattcacattgatagagtatat-gatataataaagattc------gttaaaaacaaaaagggtgaatctgcgaataaactc 8064549  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||   | |||||| ||||||||| |||||||| ||  | | ||||||||||||    
T  8064550 acaacataagttttaatagcataaaacgacaaagtacataaacttgcaaatatgacta 8064607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 668
Target Start/End: Original strand, 40039204 - 40039274
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  40039204 atctgcacttgatcaatactaatttttcaacctgaataaaataaacaccgcactaagacggaaaataaaaa 40039274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 4615366 - 4615265
Alignment:
Q  382 aaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataa 481  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |  |||||||||   ||||||||  ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  4615366 aaattgatagagtatatctatacaatacaaattcaaagtcatcaaaaacaaaaaaaatgaatctacgaacaaattcacaatatttatattaataacataa 4615267  T
Q  482 aa 483  Q
    ||    
T  4615266 aa 4615265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 407
Target Start/End: Original strand, 11550335 - 11550384
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaat 407  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11550335 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaat 11550384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 515
Target Start/End: Original strand, 17056212 - 17056289
Alignment:
Q  438 atgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||    
T  17056212 atgaatctacgaacaaactcacaacattcatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagtctacacatatgacta 17056289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 515
Target Start/End: Original strand, 17068659 - 17068736
Alignment:
Q  438 atgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||    
T  17068659 atgaatctacgaacaaactcacaacattcatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagtctacacatatgacta 17068736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 515
Target Start/End: Original strand, 17095229 - 17095306
Alignment:
Q  438 atgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||    
T  17095229 atgaatctacgaacaaactcacaacattcatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagtctacacatatgacta 17095306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 515
Target Start/End: Original strand, 17118557 - 17118634
Alignment:
Q  438 atgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  17118557 atgaatctacgaacaaactcacaacattcatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaacgcctacacatatgacta 17118634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 45035428 - 45035278
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||      |||||| ||  |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  45035428 aaataaacgataatcattcatgtaaattaataaagtacatcgatataata------caaattagtgaaaaacataaaagatgaatctatgaacaaactca 45035335  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    | ||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||  | |||||||||||| ||||    
T  45035334 cgacatccatgttaatagcataaaccagcaaaatacacaagcctacaaatataacta 45035278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 673
Target Start/End: Original strand, 7581762 - 7582058
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||| ||  || |||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7581762 aaaataaatgatatttattcattcaaattgataaagtatatcgatacaaaacaaattaaaagtc--tctaaa--aaatg-atgaatctgcgaacaaactc 7581856  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |   ||||  |||||||| ||||||| |  | |||| |||||||||||||||||| ||         |||| | || ||  ||||| |||||||| | ||    
T  7581857 atttcatccgtgttaatagcataaaatgatagagtatttatgcctacaaatatgatta---------tattgaagtctccagaatattcatgtcttcgga 7581947  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||| |      |||| | || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  ||| || ||     
T  7581948 tctacaacgttgacgacgtcaaagtcgt------tgattgaatttgcacttgctcaaagataatatttcaacctgaatcaaataaacatggcattaagat 7582041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 598 - 649
Target Start/End: Original strand, 13548797 - 13548848
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgca 649  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13548797 atctgcatttgatcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaaaaccgca 13548848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 414
Target Start/End: Original strand, 17304188 - 17304243
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  17304188 aaataaacgatattcatttattcaaattgatataatatatcgatacaatataaatt 17304243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 36692105 - 36692054
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||    
T  36692105 tgaatctgtgaacaaactcacaacaaccaagttaatagcataaaacggcaaa 36692054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20036755 - 20036697
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20036755 ggatgaatccgagaataaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggtaaagtac 20036697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 519 - 572
Target Start/End: Original strand, 29812430 - 29812484
Alignment:
Q  519 tgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacga 572  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29812430 tgactatatttatgtctctggaatacccatgtcttcggatctgcaacgttgacga 29812484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 38233977 - 38233903
Alignment:
Q  401 atacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaata 475  Q
    |||||||||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  38233977 atacaatataaattcaaaattgcttaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacgaaatcacatcatttatgttaata 38233903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 6510900 - 6510787
Alignment:
Q  383 aattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaa 482  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| || || |||| ||||  ||||||| || ||||||||||| |  ||  ||||||||| ||||||    
T  6510900 aattgatagagtacattgatataatacaaatttaaaatcattaaaaataaaaatgatgaatatgcgaacaaactcaaagtatgcatgttaatagcataaa 6510801  T
Q  483 acggcaaagtactt 496  Q
    || ||| |||||||    
T  6510800 acagcagagtactt 6510787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 675
Target Start/End: Original strand, 11561568 - 11561644
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| ||||||    
T  11561568 atctgcacttgatcaaagttaatctt-caacctgaatcaaataatcaccgcactaagacataaaatcaaaaccacacc 11561644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 415
Target Start/End: Original strand, 15786254 - 15786295
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15786254 attcattcaaattgatagagtacattgatacaatagaaattc 15786295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 616 - 653
Target Start/End: Original strand, 20598581 - 20598618
Alignment:
Q  616 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactag 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20598581 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgaactag 20598618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25516969 - 25516924
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgata 403  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25516969 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgata 25516924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 494
Target Start/End: Original strand, 31262695 - 31262752
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31262695 gatgaatctgtaaacaaatttacaacatccatgttaataacattaaacgacaaagtac 31262752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 490
Target Start/End: Original strand, 32448483 - 32448536
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  32448483 gatgaatctatgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaa 32448536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 36234234 - 36234189
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataa 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  36234234 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataa 36234189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13547236 - 13547196
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13547236 attcattcaaattgatagagtacaccgatacaatatgaatt 13547196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 14955763 - 14955719
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14955763 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacacctaagttaataacata 14955719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 450
Target Start/End: Original strand, 20607133 - 20607201
Alignment:
Q  382 aaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaa 450  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||    
T  20607133 aaattgatagagaacatcgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaataaaaatgatgaatatgtgaa 20607201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 616 - 652
Target Start/End: Original strand, 20607228 - 20607264
Alignment:
Q  616 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20607228 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgaacta 20607264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 27248996 - 27249048
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  27248996 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 27249048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 30420905 - 30420853
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  30420905 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 30420853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 37876408 - 37876444
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876408 aaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 37876444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 40659777 - 40659829
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  40659777 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 40659829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6174052 - 6174009
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacat 479  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6174052 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacat 6174009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 6510724 - 6510637
Alignment:
Q  581 tcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||    
T  6510724 tcatagtcattgattgaatatgcacttattcaaagctaatttttcaacttgaatcaaataaacattgcactaagacggaaaataaaaa 6510637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 490
Target Start/End: Original strand, 9169127 - 9169178
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  9169127 tgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaa 9169178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 417
Target Start/End: Original strand, 14826310 - 14826368
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaa 417  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  14826310 aaaataaac-atattcattcattcaaatttatagaatacatcgatataataaaaattcaa 14826368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18763699 - 18763648
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||    
T  18763699 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaa 18763648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 601 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 19904730 - 19904679
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19904730 tgcacttgatcaaagttaatctttctacctgaatcaaataaacatcgcacta 19904679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 20570253 - 20570173
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctt 623  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| | |||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20570253 ggaatattcatgtctccggatctgtaacgttaacgacgcaaaagtcaa------tgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctt 20570173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34480245 - 34480198
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  34480245 ggaatactcatgtctccggatctgcaacgtggatgacgccaaagtcat 34480198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 610 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 8781765 - 8781723
Alignment:
Q  610 tcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8781765 tcaaagctaatcttttaacttgaatcaaataaacaccgcacta 8781723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 8806102 - 8806048
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  8806102 ggatgaatctgcgaacaatctcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaa 8806048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 534 - 584
Target Start/End: Original strand, 11550426 - 11550476
Alignment:
Q  534 tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11550426 tctgtaatacccatgtcttcggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcat 11550476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 665
Target Start/End: Original strand, 12994098 - 12994175
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatca 665  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||    
T  12994098 tcattgatggaatttgcactt-ctcaaagctaatctttcaactagaatcaaataaacattgcactaagacgagaaatca 12994175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 616 - 650
Target Start/End: Original strand, 15261327 - 15261361
Alignment:
Q  616 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 650  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15261327 ctaacctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 15261361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28228667 - 28228609
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattca 416  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||    
T  28228667 aaaataaataatattcattcattcaaattgatagagaacatcgatataatgcaaattca 28228609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 29938707 - 29938613
Alignment:
Q  388 atagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaa 482  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||   |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  29938707 atagagtaaatcaatacaatataaatttaaaattgttaaaaacagaaaaaatgattatgtcaacaaactcacaacattcatgttaatagcataaa 29938613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 536 - 570
Target Start/End: Original strand, 37614061 - 37614095
Alignment:
Q  536 tggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgac 570  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37614061 tggaatactcatgtctcccgatctgcaacgttgac 37614095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 617 - 675
Target Start/End: Original strand, 44149956 - 44150014
Alignment:
Q  617 taatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  44149956 taatatttccacctgaatcaaataaatatcgcactaagacaggaaatcaaaaacacacc 44150014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 440 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 45134296 - 45134254
Alignment:
Q  440 gaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaa 482  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45134296 gaatctatgaacaaactcacaatatctaagttaataacataaa 45134254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 2550394 - 2550325
Alignment:
Q  599 tctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||| ||| ||||  |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2550394 tctgcatttgatcaaaactaaacttttaacctaaatcaaatgaacaccgcactaagacggaaaatcaaaa 2550325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 539 - 584
Target Start/End: Original strand, 2763364 - 2763409
Alignment:
Q  539 aatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2763364 aatactcatgtcttcggatctgcaacgttgacaacaacaaagtcat 2763409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4228359 - 4228310
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  4228359 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg 4228310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 668
Target Start/End: Original strand, 8531447 - 8531528
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||| | || |||||||| | || | || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  8531447 tcattgattgaatttgcacttgattaaagttattctttaaacatgaatcaaataaacaccgcactaagaaaggaaatcaaaa 8531528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 485
Target Start/End: Original strand, 9986187 - 9986236
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  9986187 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg 9986236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 399
Target Start/End: Original strand, 11985030 - 11985071
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11985030 aaaaaaaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 11985071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 408
Target Start/End: Original strand, 15261123 - 15261160
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15261123 ttcattcattcaaattgatagagtatatcgagacaata 15261160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 17054720 - 17054875
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||  ||||||| || ||| ||||||    
T  17054720 aaaataaa-gatattcatttatttaaattgatatattacaccgatacaataaaaatttaaagtcgct-aaaacaaaaatgatgaatttgcgaagaaactc 17054817  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
      | |||| ||||||| | ||||||| || | ||||  || | |||||||||||||||    
T  17054818 ttatcatccatgttaaaagcataaaagggtagagtatataagtctacaaatatgacta 17054875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17319556 - 17319507
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  17319556 ggatgaatctgcgaacaaactcacgacatccaagttaataacatataacg 17319507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 490
Target Start/End: Original strand, 25508935 - 25508988
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||| |||||||||    
T  25508935 gatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaataacatacaacggcaaa 25508988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38450580 - 38450535
Alignment:
Q  470 ttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  38450580 ttaataacataaaatggcatagtacatatgcctacgaatatgacta 38450535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43711707 - 43711654
Alignment:
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  43711707 catccatgttgataacataaaacggcaaaatggatatgcctacaaatatgacta 43711654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 84026 - 84078
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  84026 ggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggca 84078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 488
Target Start/End: Original strand, 2278793 - 2278825
Alignment:
Q  456 tcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2278793 tcacaacatccatgttaataacataaaacggca 2278825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 4903947 - 4903983
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4903947 aaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatc 4903983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 5369139 - 5369039
Alignment:
Q  375 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaat 474  Q
    |||||| |||||  |||| ||| || || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||| |  ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  5369139 ttcatttaaatttttagattacgtcaatgcaatataaatttaaagtcgttaaaaacaaaaaggataaatttacgaataaactcacaacatgcatgttaat 5369040  T
Q  475 a 475  Q
    |    
T  5369039 a 5369039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 5427671 - 5427707
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5427671 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 5427707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8809584 - 8809544
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacat 398  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8809584 aaaaaaaatgatattcattcattcaaattgatagagtacat 8809544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 534 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 13268855 - 13268807
Alignment:
Q  534 tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtc 582  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  13268855 tctggaatactcatgtccccggatcttcaacgttgaagacgccaaagtc 13268807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15988951 - 15988899
Alignment:
Q  106 cacttgttaaggaaatataaaagaaaatattctc-tgaaaattgtgtattcta 157  Q
    ||||| |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15988951 cacttcttaagggaatataaaacgaaatattctcatgaaaattgtgtattcta 15988899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 494
Target Start/End: Original strand, 17074642 - 17074698
Alignment:
Q  438 atgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17074642 atgaatctacgaacaaacttacaacattcatggtaatagcataaaacggcaaagtac 17074698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 25508870 - 25508906
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25508870 aaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatc 25508906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 27249147 - 27249195
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  27249147 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 27249195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 29173583 - 29173627
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  29173583 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacaccaaagttaataacata 29173627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 399
Target Start/End: Original strand, 30923267 - 30923295
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30923267 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 30923295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 31193138 - 31193174
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31193138 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 31193174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31788754 - 31788718
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31788754 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 31788718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 32913476 - 32913424
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  32913476 ggatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 32913424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 34600450 - 34600398
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  34600450 ggatgaatctgtgaacaaactcgcatcatccaagttaatagcatataacggca 34600398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35220618 - 35220590
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35220618 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 35220590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 36234093 - 36234045
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  36234093 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 36234045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37994581 - 37994545
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37994581 aaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 37994545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38445464 - 38445428
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38445464 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 38445428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41328037 - 41328005
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagta 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41328037 aaacgatattcattcattcaaattgatagagta 41328005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 101)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 31705631 - 31705313
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  31705631 aaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattggctaaaaataaaaaggataaatctgtgaacaaactc 31705532  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||    
T  31705531 acaacatctatgttaatagcataaaacaacaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatatccatgtctccggaatactcatgtctccgga 31705432  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31705431 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 31705332  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  31705331 gagaaatcaaaaacacacc 31705313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 358 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 23654715 - 23654397
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23654715 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaa-ggatgaatctgtgaacaaactc 23654617  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||||||||| ||    
T  23654616 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaagttacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctcctgaatcctcatgtctccgga 23654517  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23654516 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 23654417  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacca 676  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  23654416 gggaaatcaaaaacacacca 23654397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 23101063 - 23101374
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaa-caaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23101063 aaaataaacgatattcattcat-caaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatccgctaaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 23101161  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccag 555  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |    
T  23101162 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacacatgcctacaaatatgactaatatgactatattcacgtctccggaatactcatgtctccgg 23101261  T
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  23101262 atctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaataccgcacaaaga 23101361  T
Q  656 cgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||||||||    
T  23101362 cgggaaatcaaaa 23101374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 362 - 668
Target Start/End: Original strand, 2304497 - 2304804
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||    
T  2304497 taaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaagataaattagtgaacaaactcacaa 2304596  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2304597 tatccatgttaataacataaaacggcaaagtttttgtgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtatctagaatactcatgtctccggatctg 2304696  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2304697 caacgttgacaatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacggga 2304796  T
Q  661 aatcaaaa 668  Q
    ||| ||||    
T  2304797 aataaaaa 2304804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 35219568 - 35219879
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35219568 aaaataaacgatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 35219667  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | | |||| ||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | || || | ||||||||||| ||| ||    
T  35219668 agagcatcaatgttaatagcataaaacggcattgtacctatgcctacaaatatgatcaatatgactatattcaagtctccgaaatactcatgtttccgga 35219767  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35219768 tctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 35219867  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||| ||||    
T  35219868 gggaaataaaaa 35219879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 366 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 4394228 - 4393919
Alignment:
Q  366 cgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatc 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4394228 cgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaacggatgaatctgtgaacaaactctcaacatc 4394129  T
Q  466 tatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaac 564  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4394128 catgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctcatgaatactcatgtctccggatctgcaac 4394029  T
Q  565 gttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatc 664  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||     
T  4394028 gttgacgacgccaaagtcattgtcagtgatcagatctgcacttgatcaaagttaatctttcaacctgagtcaaataaacaccgcactaagatgggaaata 4393929  T
Q  665 aaaagcacac 674  Q
    |||| |||||    
T  4393928 aaaaacacac 4393919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 8693326 - 8693620
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8693326 aaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 8693425  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||| |||    
T  8693426 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccggat 8693509  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8693510 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtccttgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacg 8693609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 1106518 - 1106833
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttc----aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaa 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |     ||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  1106518 aaaataaacgatattcattcattcagattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctagctaaaaacgaaaaggatgaatttctgaacaa 1106617  T
Q  454 actcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctc 552  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || ||||||||||||||||    
T  1106618 actcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaacatgattatattcaagtctccggaatactcatgtctc 1106717  T
Q  553 cagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1106718 cggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgtacta 1106817  T
Q  653 ggacgggaaatcaaaa 668  Q
     |||||||| ||||||    
T  1106818 agacgggaagtcaaaa 1106833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 15589780 - 15590074
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15589780 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaaccaactc 15589879  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||| |||    
T  15589880 acagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacgtatacctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccggat 15589963  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15589964 ctgcaacattgacgacgccaaagccattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagacg 15590063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 6295904 - 6296222
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||  || ||||| ||||||||||||    
T  6295904 aaaataaataatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaatgacgaatccgtgaacaaactc 6296003  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || | | ||||||||||||  ||    
T  6296004 acaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgtctacaaatatgattaatatgactacattcatgtctccgaagtactcatgtctctgga 6296103  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6296104 tctgcaatgtttaccacgccaaaatcattgtcattgatcggatctgcatttgctcaaagttaatcttttaacctgaatcaaataaacactgcactaagac 6296203  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || |||| |||| ||||||    
T  6296204 ggaaaataaaaaacacacc 6296222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 6302714 - 6303032
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||  || ||||| ||||||||||||    
T  6302714 aaaataaataatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaatgacgaatccgtgaacaaactc 6302813  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || | | ||||||||||||  ||    
T  6302814 acaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgtctacaaatatgattaatatgactacattcatgtctccgaagtactcatgtctctgga 6302913  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6302914 tctgcaatgtttaccacgccaaaatcattgtcattgatcggatctgcatttgctcaaagttaatcttttaacctgaatcaaataaacactgcactaagac 6303013  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || |||| |||| ||||||    
T  6303014 ggaaaataaaaaacacacc 6303032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Original strand, 23637777 - 23638085
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  23637777 aaaataaacgacattcattcattcaaattaataaagtacatcgatacaatacaaattcaattttgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactc 23637876  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||  ||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||    
T  23637877 acagtatccatgttaag--cataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgattaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccgga 23637974  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| || ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23637975 tctgcaacattgacgacgtcaaagtcattgtcatttattggatcagcatttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 23638074  T
Q  657 gggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||||    
T  23638075 gggaaatcaaa 23638085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 12481034 - 12481343
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12481034 aaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactc 12481133  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||         |||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||    
T  12481134 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacctatgcctaca---------aatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctccgga 12481224  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  12481225 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattttcattgatcggatctgctcttgttcaaagttaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagac 12481324  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  12481325 gggaaatcaaaaacacacc 12481343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 21507509 - 21507803
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21507509 aaaataaacgatattcattcattcaaactgatagagtacatcaatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 21507608  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                | |||||||| |||    
T  21507609 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------taatgtctccggat 21507692  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  21507693 ctgtaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatcgacacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaaaacacaccgcactaagacg 21507792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 371 - 675
Target Start/End: Original strand, 13871294 - 13871593
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13871294 ttcattcattcaaattgatagtgtacataaatataaaataaatccaaattcgctaaaaacaaaa-ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgt 13871392  T
Q  471 taataacataaaac-ggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttg 568  Q
    ||||| |||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13871393 taatagcataaaactggaaaaatacatatgcctacaaatttgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttg 13871492  T
Q  569 acgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||| |||||      |||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  13871493 acgacgccaaa------gtcattgatcagatttgcacttgctcaaagcaaatcttccaacctgaatcaaataaacactgcactaagacggaaaataaaaa 13871586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 362 - 647
Target Start/End: Original strand, 29920576 - 29920862
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29920576 taaacgatattcgttcattcaaattgataaagtacatcgatacattacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaa 29920675  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  29920676 catccatgttaatagcataaaacgacaaagtatccatgactacaaatatgactaatataactatattcaagtcttcggaatactcatgtctccagatctg 29920775  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccg 647  Q
     ||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29920776 taacgttgacgacgataaagtcattgtcattgatcgaatcaacacttactcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaccg 29920862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 14782810 - 14783115
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14782810 aaaataatagatattcagtcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 14782909  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||  ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||         |||||||||||||| |||| || |||||||||    |||| ||    
T  14782910 acattatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacctatgcctaca---------aatatgactatattcatgtctccggaatactc----ctccgga 14782996  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||    
T  14782997 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcacatctgcacttgctcaaaactaatctttcaatctaaatcaaatatacaccacactaagac 14783096  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  14783097 gggaaatcaaaaacacacc 14783115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 463 - 675
Target Start/End: Original strand, 31937180 - 31937393
Alignment:
Q  463 atctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgc 561  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  31937180 atctatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatataattaatatgactatatccatgtctccggaatacttatgtctccggatctgc 31937279  T
Q  562 aacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaa 661  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31937280 aacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaa 31937379  T
Q  662 atcaaaagcacacc 675  Q
    |||| || ||||||    
T  31937380 atcataaacacacc 31937393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 358 - 562
Target Start/End: Original strand, 19402507 - 19402712
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19402507 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 19402606  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||    
T  19402607 acagtatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccgga 19402706  T
Q  557 tctgca 562  Q
    ||||||    
T  19402707 tctgca 19402712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 358 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 30813523 - 30813267
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30813523 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 30813424  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||         |||||||| | || |||| ||| ||||||||||| ||    
T  30813423 acatcatccatgttaatagcataaaacgccaaggtacctatgcctacaaatatg---------actatattcaagtctctgaaatcctcatgtctccgga 30813333  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatct 622  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  30813332 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattttcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatct 30813267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 358 - 658
Target Start/End: Original strand, 12653973 - 12654259
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12653973 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaattccaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgcgaacaaactc 12654072  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||         |||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  |    
T  12654073 acatcatccatgttaatagcataaaacgacaaaatacatatgcctaca---------aatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccgaa 12654163  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||| ||| |||||      |||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  12654164 tctgcaacgttgatgacgccaaa------gtcattgatcagatctacacttgctcaaaactagtctttcaacctaaatcaaataaacaccacactaagac 12654257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 449 - 675
Target Start/End: Original strand, 6419604 - 6419831
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcat 547  Q
    |||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || | |||||||||    
T  6419604 aacaaattcacagtatccatgttaatagcataaaacgacaaactatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccgaaatactcat 6419703  T
Q  548 gtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccg 647  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  6419704 gtctccggatctgcaactttgacgacgccaaagtcattgtcatcgattgggtctgcacttactcaaagctaatctttcaacctgaaccaaataaacattg 6419803  T
Q  648 cactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  6419804 cactaagacgggaaataaaaaacacacc 6419831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4660894 - 4660740
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4660894 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaattccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactc 4660795  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4660794 acatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatga 4660740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 358 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 2488588 - 2488308
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||| |||| ||| || |||||||||     
T  2488588 aaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaagtcattaaaaacaaaaaggataaatatgcgaacaaactt 2488489  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||         ||| ||||||| |||| || ||  ||||||||| |||||| ||    
T  2488488 acaacatctatgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcttaca---------aatgtgactatgtttaagtctccagaatactcaagtctccgga 2488398  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||  ||||      | ||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2488397 tctgcctcgtt------aacaacgtcaaaatcattgatcggatctacacttgctcaaagttaatctttcaacctgaataagataaacaccgcacta 2488308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 359 - 673
Target Start/End: Original strand, 4921564 - 4921852
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      |||| ||| | |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4921564 aaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgataccata------caaactcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaacaaactca 4921657  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtt-ctggaatactcatgtctccagat 557  Q
     |||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| |||               |||||||||| | ||  | |||||||||||  |||  |||    
T  4921658 taacattcatgttaatagcataaaacgacaaaatacatatgtcta---------------tgactatattcaagtcaccggaatactcatacctctggat 4921742  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  4921743 ctgcaacgttgacgacaacaaagtca------ttgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctggatcaaataaacaccgcagtaagacg 4921836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 10745027 - 10744815
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10745027 aaaataaattatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaat------tgaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactc 10744934  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||          ||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||| ||    
T  10744933 acatcatccatgctaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtctccggaatacccttgtctccgga 10744843  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10744842 tttgcaacgttgacgactccaaagtcat 10744815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31748386 - 31748251
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31748386 attcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaagctcacaacatccatgttaa 31748293  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  31748292 tagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 31748251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34021035 - 34020897
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||      |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  34021035 ttcattcattcatattgatagagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatacatgt 34020942  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  34020941 taatagcataaaacgacaaagtacataagcctacaaatatgacta 34020897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 20496638 - 20496426
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||       |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20496638 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagcgtacattgatacaatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactc 20496545  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||          ||||||||||||| | || || ||||||| ||| |||| |||    
T  20496544 acaacatccatattaatagcataaaacggcaaagtacaaaagcctaca---------catatgactatattcaagtctccggaatacccatctctcaaga 20496454  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20496453 tatgcaacgttgacgacaccaaagtcat 20496426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 8978411 - 8978568
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||   |||||||||  ||||||  || ||||||||||    
T  8978411 aaaataaacaacattcattcattcaaactgatagagtatattaatacaatacaaattcaaagtcgccaaaaacaaaaaagatgaaattgcgaacaaactc 8978510  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8978511 acaacatccatgttcataacataaaacgacatagtacatatgcctacaaatatgacta 8978568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 471
Target Start/End: Original strand, 31936288 - 31936401
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  31936288 aaaataaacgatattcgttcattcaaattgatagagtacatagatacaatacatatctaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 31936387  T
Q  458 acaacatctatgtt 471  Q
    ||||||||||||||    
T  31936388 acaacatctatgtt 31936401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 358 - 513
Target Start/End: Original strand, 4663489 - 4663638
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||      | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4663489 aaaataaacaatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 4663582  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgac 513  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| | || |||| |||||||    
T  4663583 acaacatccatgttaatagcataaaatggcatagtactaaagcttacacatatgac 4663638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 595 - 667
Target Start/End: Original strand, 19402703 - 19402775
Alignment:
Q  595 cggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19402703 cggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaatcaaa 19402775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8644673 - 8644522
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||       | ||||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  8644673 aaaataaatgatattaattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattcac------taaaaacaagaaagatgaatctgcgaacaaactc 8644580  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  8644579 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgacta 8644522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5146392 - 5146300
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaa 450  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||    
T  5146392 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaa 5146300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 359 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14731070 - 14730917
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaa-tctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| ||| | |||| |||| | ||||| | || ||||||||||    
T  14731070 aaataaatgatattcattcattcaaattgataacatacatcgatacaatacatattcaaagtcgct-aaaataaaaagaatgaaatttgcgaacaaactc 14730972  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  14730971 acatcatccatgttaataacataaaacatcatagtacatatgcctacaaatatga 14730917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 23843093 - 23843244
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||       |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  23843093 aaaataaataatattcattcattcaaattgatagagtacatccatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacatgctc 23843186  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  23843187 acaacatccatgctaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacatatatgacta 23843244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 485
Target Start/End: Original strand, 5527303 - 5527422
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   || |||||| ||     |||||||||||||    
T  5527303 aaaataaatgatattcattcattcgaattgatagagtacatcaatacaatataaattcaaagtcgtt---aaaaaaatgaat-----tgtgaacaaactc 5527394  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||    
T  5527395 acaacatctatgttagtagcataaaacg 5527422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 548541 - 548671
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||     ||||||| | ||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  548541 aaaataaatgatattcattgattcaaattgatagagtacatc-----aatataa-tgcaaattcgcaaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacagactc 548634  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  548635 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtac 548671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 6127983 - 6127855
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | | | ||| ||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  6127983 aaaataagcgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgttaaattataaattcaaagtagctaaaagcaaaaaggatgaatttgcaaacaaactc 6127884  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacgg 486  Q
    ||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  6127883 acatcatccatgttaaaagcataaaacgg 6127855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 15469929 - 15470068
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||     ||||||| || ||| | |||||||||  || |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  15469929 ttcattcattcaaattgatagggtatatcgata-----taaattcgaaatcgctaaaaacaaaaaagaagaatatgtgaacaaacttacaacatccatgt 15470023  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15470024 taatatcataaaacggtagagtacatattcctacaaatatgacta 15470068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20845458 - 20845302
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaa--- 454  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||      |||||||| | ||||||||| | |||||| | |||||| |       
T  20845458 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatataata------caaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatatatgaacagaaca 20845365  T
Q  455 --ctcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
      ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  20845364 gactcacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaatgtctacaaatatgacta 20845302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 5416894 - 5417044
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |      ||| || | | |||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  5416894 aaaataaatgatattcattcattcaaattaatagagtacat-gatacaaca------caattttgctaaaaacaaaaatgatgaatctacgaacaaactc 5416986  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | || |||| |||||||||    
T  5416987 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagcatacacatatgacta 5417044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 13233777 - 13233928
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||      |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  13233777 aaaataaaatatattcattaattcaaattgatagagtatatcaatataata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctc 13233870  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||   |||||||| |||||||||    
T  13233871 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaaatacagttgcctacacatatgacta 13233928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 382 - 512
Target Start/End: Original strand, 16328769 - 16328899
Alignment:
Q  382 aaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataa 481  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||  ||||||| ||  |||||||| |||||||| || |||||| |||||    
T  16328769 aaattgatagagtacatccatacaatacaaattcaaagtcgctataaacaaaaaagatgaatatgcaaacaaacttacaacatccatattaatagcataa 16328868  T
Q  482 aacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||  || |||||||||| |||| |||||||    
T  16328869 aacaacagagtacttatgtctactaatatga 16328899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16913760 - 16913619
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtg---aacaaactcacaacatcta 467  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| | |||||||||||   ||||  ||||||||||| |    
T  16913760 ttcattcattcaaattgaaatagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtggtgaacaggctcacaacatcca 16913667  T
Q  468 tgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  16913666 tgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 16913619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 362 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 28943710 - 28943579
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| | | ||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  28943710 taaatgatattcattcatccaaattgatagagtatattgatataatacaaattcataat-gttaaaaacgaaaaggatgaatctgcaaacaaactcacaa 28943612  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
     ||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28943611 aatacatgttaataacataaaaccacaaagtac 28943579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4085142 - 4085059
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatga 441  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||| ||||||    
T  4085142 aaaataaacgatattcattcagtcaaatcgatagagtacatcgatacaatacaaatcaaaattcattaaaaacaaaaaggatga 4085059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 362 - 433
Target Start/End: Original strand, 6419538 - 6419609
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaa 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  6419538 taaacgatattcattcattcaaattgatagactacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaa 6419609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 472
Target Start/End: Original strand, 21942096 - 21942210
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||| | ||| |||| ||||  ||||||||||  |||||||||    
T  21942096 aaaataaatgatattaattcattcaaattgatgtagcacatcgatataataaaaattcaaaattgttaaaaataaaaatgatgaatctgcaaacaaactc 21942195  T
Q  458 acaacatctatgtta 472  Q
    |||||||| ||||||    
T  21942196 acaacatccatgtta 21942210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Original strand, 33541216 - 33541351
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||      | | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  33541216 attcattcaaattgttagagtacattaatgcaatataaattc------gctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcatgacatccatgttaa 33541309  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || ||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  33541310 tagcatgaaacgacaaagtacataagcctacaaacatgacta 33541351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 8632878 - 8633016
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||       |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||    
T  8632878 ttcattcattcaaattgaaatagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaggctcacaacattcatgt 8632971  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  8632972 taatagcatgaaatgacaaagtacaaatgcctacacatatgacta 8633016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 486
Target Start/End: Original strand, 9043785 - 9043913
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||| ||||| |||| ||||  |||| || |||||||||||||    
T  9043785 aaaattaacgatatttattcaattaaattgatagagtatatcgatacgatacaaaaccaaagtcgttaaaaataaaaatgatggatatgtgaacaaactc 9043884  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacgg 486  Q
    | | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  9043885 aaagcatccatgttaatatcataaaacgg 9043913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 668
Target Start/End: Original strand, 1915085 - 1915152
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  1915085 tgcacttgttcatagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaagacgggaaagcaaaa 1915152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3359176 - 3359053
Alignment:
Q  392 agtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaag 491  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||| | | | ||||||||| | |||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||  |    
T  3359176 agtacatcgatataatataattttaaagttgctaaaaacaaaaggaatgaatttgcgaacaaactcacgacattcatgttaatagcataaagcggcattg 3359077  T
Q  492 tacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||    
T  3359076 tacatatgcctacaaatataacta 3359053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 29285132 - 29284908
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactat 525  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||         |||||    
T  29285132 aaaacaaaaaggatggatatgcgaacaaactcacgacattcatgttaataacataaaacggaagagtacatatagctacaaatatg---------actat 29285042  T
Q  526 atttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatcttt 624  Q
    ||| | || ||| ||||||  |||||| || |||||||||||||| |||| ||||      ||||||||| | |||  |||||    || ||||||||||    
T  29285041 attcaagtctctagaatacatatgtcttcatatctgcaacgttgatgacatcaaa------gtcattgattgaatcaacactt----aaagctaatcttt 29284952  T
Q  625 caacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  29284951 caacttgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaataaaaa 29284908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 31680871 - 31680756
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaa-caaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||  ||| ||||| |||| ||||| | |||||| | |||||||||||||||| || || |||    
T  31680871 attcattcaagttgatagagtatattgatacaatacaaatctaaagtcgttaaaaaacaaaaagaatgaatatatgaacaaactcacaacttccatatta 31680772  T
Q  473 ataacataaaacggca 488  Q
    ||| ||||||||||||    
T  31680771 atagcataaaacggca 31680756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19760233 - 19760082
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||  |||    
T  19760233 aaaataattgatattcattcactcaaattgatagagtacatcgata------taatgcaaattcgataaaaacaaaaaggataaatatgtgaacaggctc 19760140  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||| || || |||||||||    
T  19760139 acaacattcatgttaatagcataaaatggcaaggtacaaatgtctgcacatatgacta 19760082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 35039090 - 35039016
Alignment:
Q  410 aaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaac 484  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35039090 aaattcaaagtcgttaaaaacaaaaatgataaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaac 35039016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 5545125 - 5545068
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc 415  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5545125 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgtaaattc 5545068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7870563 - 7870451
Alignment:
Q  400 gatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatg 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||| |   ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| ||| ||||  ||||    
T  7870563 gatacaatataaattcaaagtcacaaaaaacaaaaaggatgaacccacgaacaaactcacatcatccaggttaatagcataaaactgcagagtatgtatg 7870464  T
Q  500 cctacaaatatga 512  Q
    |||||||||||||    
T  7870463 cctacaaatatga 7870451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 31804659 - 31804530
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||       ||||||| |  ||| || ||  || ||| |||||| ||||||    
T  31804659 aaaataaacgatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatataata------aaaattcgctagaaaaaagat--ataaatatgtgaagaaactc 31804568  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtact 495  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31804567 acagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtact 31804530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 484
Target Start/End: Original strand, 3610044 - 3610146
Alignment:
Q  382 aaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataa 481  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||||| || | ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3610044 aaattaataaagtatatcgataaaatacaaatttaaaatcgtttaaaacataaagaatggatatgcgaacaaactcacaacatctatgttaatagcgtaa 3610143  T
Q  482 aac 484  Q
    |||    
T  3610144 aac 3610146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7076961 - 7076824
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagta--catcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtt 471  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||  ||  ||||||| |||||  |||||    
T  7076961 attcattcaaattgatagagtatacattaatataatataaattcaaagtcgataaaaataaaatggatggatctccgagtaaactcaaaacattcatgtt 7076862  T
Q  472 aataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaata 509  Q
    |||| ||||||| | ||  ||||  |||||||||||||    
T  7076861 aatagcataaaatgacagtgtacacatgcctacaaata 7076824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 484
Target Start/End: Original strand, 15985633 - 15985758
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||| || || |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||  |||||||||| ||| ||||      
T  15985633 aaaatagaccatattcattaatttaaattgatatagtaaatcgatacaatatagattcaaagtcgctaaaaacaaaa-agatgaatctgcgaataaacat 15985731  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaac 484  Q
    || |||||||| ||||||  |||||||    
T  15985732 accacatctatattaatagtataaaac 15985758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 515
Target Start/End: Original strand, 20028391 - 20028527
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||||| |||| |   |||||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||||| |  ||||||  | |||||||| |||||||||      
T  20028391 attcaaattgatatagtatagtaatacaatacaaattcaaagttgttgataacaaaaaggatgaatttc-gaacaattttacaacatcaatgttaatagt 20028489  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  20028490 ataaaacggcagaatatatatgcctacaaatatgacta 20028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 892729 - 892608
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||||||| |  || |||||||||      |||||| ||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  892729 aaaataaataatattcattaattcaaattgatagaatgaattgatacaata------caaatttgttaaaaacaaaaatgatggatctgcgaacaaactc 892636  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  892635 acgacatccatgttaataatataaaacg 892608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 461
Target Start/End: Original strand, 1418807 - 1418875
Alignment:
Q  394 tacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaa-aatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1418807 tacatcgataaaatataaattcaaagtcgctaaaaacaataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaa 1418875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15176239 - 15176100
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||     ||||||  || |||   |||||||||  || |||| | | |||||||||| |||||  ||||    
T  15176239 ttcattcattcaaattgatagggtatatcgata-----taaatttgaaatcgccaaaaacaaaaaagacgaatatataaacaaactcataacattcatgt 15176145  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15176144 taatatcataaaacggtagagtacatattcctacaaatatgacta 15176100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 15127811 - 15127950
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatg 469  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||        |||||||| | |||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||| |||    
T  15127811 ttcattcattcaaatcgatagagtacattaatacaacg------caaattcgctaaaaacaaaaaaggatcaatctacgaacaaattcacaacatccatg 15127904  T
Q  470 ttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||||||  || |||||  | ||||||| |||||||||    
T  15127905 ttaataacataaaacaacagagtacagaagcctacacatatgacta 15127950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 647
Target Start/End: Original strand, 1418981 - 1419042
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccg 647  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1418981 gtcattgatcgaatctacacttgcttaaatctaatctttcaatctaaatcaaataaacaccg 1419042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 652
Target Start/End: Original strand, 3610230 - 3610295
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3610230 tcattgattgaatctgcacttgtccaaagctaacttttcaacctgaatcagataaacaccgcacta 3610295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 652
Target Start/End: Original strand, 5527510 - 5527575
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  5527510 tcattgattggatctacacttgttcaaagctaatatttcaacctgaattaaataatcatcgcacta 5527575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 15176015 - 15175958
Alignment:
Q  618 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||    
T  15176015 aatcttttaacctgaatcaaataaacaccgcactaacacgagaaataaaaaacacacc 15175958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 31395674 - 31395574
Alignment:
Q  385 ttgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaac-aaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||| ||  || || |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  31395674 ttgatagagtacatcgatacaatccaaattcaaagttgttaaaaacaaaaaaggatgaatttg-aaaaaatctcacatcatccatgttaaaaacataaaa 31395576  T
Q  484 cg 485  Q
    ||    
T  31395575 cg 31395574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32804677 - 32804589
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||  | ||||||| |||| ||||    
T  32804677 aaaacaaaaaggataaatctg-gaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacaacaaagtacaaaagcctacacatataacta 32804589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 490
Target Start/End: Original strand, 7976042 - 7976106
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  7976042 aaaacataaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaa 7976106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12653176 - 12653124
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  12653176 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 12653124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 485
Target Start/End: Original strand, 18248756 - 18248864
Alignment:
Q  377 cattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataa 476  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||| | ||||||| ||  | |||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||     
T  18248756 cattcaaaatgatatagtacattaatacaatacatattcaaaatctctaaaaacaaaaatgatgaatatgcgaacaaactcacaatattcatattaatag 18248855  T
Q  477 cataaaacg 485  Q
    |||||||||    
T  18248856 cataaaacg 18248864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 28634958 - 28635010
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||||    
T  28634958 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatcgcatataacggca 28635010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 33052969 - 33053005
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33052969 aaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 33053005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 12156419 - 12156302
Alignment:
Q  534 tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaa 633  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||   |||||||| ||  |||||    || |||||||| ||||   || ||||||||||||||    
T  12156419 tctggaatacgcatgtctccggatctgcaatattgacgaagtcaaagtcaagg--attga----atatgcacttgttcaaacttagtctttcaacctgaa 12156326  T
Q  634 tcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  12156325 tcaaataaataccgcactaagacg 12156302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 12343613 - 12343499
Alignment:
Q  393 gtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagt 492  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | | |||| ||  ||||||| | | |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||| |||    
T  12343613 gtacatcgatacaatacaaatttaaagtcgataacaacataa-agatgaatttataaacaaactcaaaatatccatgttaatagcataaaatggcagagt 12343515  T
Q  493 acttatgcctacaaat 508  Q
    || ||||| |||||||    
T  12343514 acctatgcttacaaat 12343499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17334984 - 17334933
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  17334984 gatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 17334933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1944505 - 1944455
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata 408  Q
    |||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1944505 aaaataaatgatattcatttatccaaattgatagagtacattgatacaata 1944455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 598 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 8508353 - 8508299
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  8508353 atctgcacttgatcaaaactaatcttttaatctgaatcaaataaacaccacacta 8508299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 618 - 652
Target Start/End: Original strand, 15470153 - 15470187
Alignment:
Q  618 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15470153 aatcttttaacctgaatcaaataaacaccgcacta 15470187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 485
Target Start/End: Original strand, 12059618 - 12059667
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  12059618 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg 12059667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 475
Target Start/End: Original strand, 16352228 - 16352321
Alignment:
Q  382 aaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaata 475  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |  ||||||||  ||||||| ||  |||||||| |||||||| || ||||||    
T  16352228 aaattgatagagtacattcatacaatacaaattaaaagtcgctataaacaaaaaagatgaatatgcaaacaaacttacaacatccatcttaata 16352321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25064468 - 25064419
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  25064468 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg 25064419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 904651 - 904583
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  904651 aaaacaaaaatgatgaatcggcgaacaaactcacaatattcatgttaatagtataaaacgacaaagtac 904583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 3359005 - 3358949
Alignment:
Q  589 attgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacac 645  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3359005 attgattggatatgcatttgatcaaaactactctttcaacctgaatcaaataaacac 3358949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 3913375 - 3913411
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3913375 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 3913411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 8497200 - 8497148
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  8497200 ggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggca 8497148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 11321345 - 11321381
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11321345 aaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatc 11321381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12170757 - 12170721
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12170757 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 12170721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 645
Target Start/End: Original strand, 16328967 - 16329011
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacac 645  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16328967 tgcacttactcaaaactaatctttcaacctaaatcaaataaacac 16329011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 23947162 - 23947214
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  23947162 ggatgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 23947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31297108 - 31297072
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31297108 aaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 31297072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 32327021 - 32327057
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32327021 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 32327057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 35001822 - 35001770
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  35001822 ggattaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 35001770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 181)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 15390907 - 15391225
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15390907 aaaataaacgatatttattcattcaacttgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgatcaaactc 15391006  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  15391007 acagcatccatattaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccaga 15391106  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15391107 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctcaaagataatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 15391206  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  15391207 gggaaatcaaaaacacacc 15391225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 44517614 - 44517295
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44517614 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcactaaaaacaaaaaggatgactctgtgaacaaactc 44517515  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||    
T  44517514 acaacatccatgttaatagcataaaacggtgaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgga 44517415  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacacc-aaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44517414 tctgcaacgttgacgacgccaaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 44517315  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  44517314 cgggaaatcaaaaacacacc 44517295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Original strand, 28677794 - 28678102
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28677794 aaaataaacgatattcatttattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactc 28677893  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  28677894 acaacatccatgttaatagcataaaacggaaaagtacctatgcctacaaatatgacta---------tatttatgtctctcgaatactcatgtctccata 28677984  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28677985 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 28678084  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacac 674  Q
    |||||||||||| |||||    
T  28678085 gggaaatcaaaaacacac 28678102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 362 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 14265745 - 14265432
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14265745 taaaagatgttcattctttcaaattgatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatga-tctgtgaacaaactcacaa 14265647  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  14265646 catccatgttaatagcataaaacagcaaagtgtctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctccggatctg 14265547  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14265546 caacgttgacaacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacggga 14265447  T
Q  661 aatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||| ||||||    
T  14265446 aatcaaaaacacacc 14265432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 42276821 - 42276503
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42276821 aaaataaacaatatgcattctttcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 42276722  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |    
T  42276721 acagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatataattaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgaa 42276622  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  42276621 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgcttaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagat 42276522  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  42276521 gggaaatcaaaaacacacc 42276503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 358 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 32784545 - 32784233
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| | | |||||||||    
T  32784545 aaaataaactatattcattaattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaattttttaacaaactc 32784446  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  32784445 acaacattcatgttaataacatataacggcaaactacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccgga 32784346  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32784345 tctgcaacgttgacgacgctaaagtcattgttattgatcgaatttgcacttgctcaaagctaatctttcagcctgaatcaaataaacaccgcactaagac 32784246  T
Q  657 gggaaatcaaaag 669  Q
    || ||||||||||    
T  32784245 ggaaaatcaaaag 32784233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 13488191 - 13488502
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||  ||| ||| |||||| ||||||    
T  13488191 aaaataattgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaagataaatttgtgaataaactc 13488290  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||    
T  13488291 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctctggaatcctcatgtctccaga 13488390  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13488391 cctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaattaaataaacaccgcactaagac 13488490  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||| ||||    
T  13488491 gggaaataaaaa 13488502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 378 - 667
Target Start/End: Original strand, 45193303 - 45193593
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  45193303 attcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtaaacaaactcacatcatccatgttaatagc 45193402  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacacc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  45193403 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctccaaaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgcc 45193502  T
Q  577 aaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45193503 aaaatcattgtcattgatcggatcagcacttgctcaaagctaatctttcaacctgattcaaataaacaccgtactaagacgggaaatcaaa 45193593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 45750944 - 45750633
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | | ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  45750944 aaaataaaagatattcgttcgttcaaattgatagagtacatcaatacaataaaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatttatgaacaaactc 45750845  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttct-ggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||    
T  45750844 acagcatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatataactatatttttgtcttcggaatactcatgtctccgga 45750745  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45750744 tctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctaaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 45750645  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||| ||||    
T  45750644 gggaaataaaaa 45750633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 374 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 27535147 - 27534845
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27535147 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaa 27535048  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacga 572  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27535047 tagcataaaacggcaaggtacctatgcctacaaatataactaatatgactatattcaagtctccggaatcctcatgtctccggatctgcaacgttgacga 27534948  T
Q  573 caccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcac 672  Q
    | | |||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  27534947 cgctaaagtcattgttattgatcagatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcacactaagacgggaaatcaaaaacac 27534848  T
Q  673 acc 675  Q
    |||    
T  27534847 acc 27534845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 358 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 3233237 - 3232938
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  3233237 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaacggattaatatgtgaacaaactc 3233138  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||| |||    
T  3233137 acaacactcatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccggat 3233054  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3233053 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcactttctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacg 3232954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 29205734 - 29205433
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29205734 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaataaaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaataaactc 29205635  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||                 || |||||||||| |||    
T  29205634 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacacatgcctacaaatatgactaatatgact----------------gtaatcatgtctccggat 29205551  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29205550 ctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctgatcattcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 29205451  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  29205450 ggaaatcaaaaacacacc 29205433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 405 - 675
Target Start/End: Original strand, 29726299 - 29726570
Alignment:
Q  405 aatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctac 504  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29726299 aatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctac 29726398  T
Q  505 aaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgc 603  Q
    ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29726399 aaatatgactaatatgactatcttaaagtctctggaatactcatgtcttcggttctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgc 29726498  T
Q  604 acttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  29726499 acttgctcagagctaatctttcaacctgaatcaattaaacaccgcattaagacgggaaatcaaaaacacacc 29726570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Original strand, 33486691 - 33487002
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33486691 aaaaaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactc 33486790  T
Q  458 acaacatctatg----ttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctc 552  Q
    ||| |||| |||    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||||||| |||| || |||||||||||||||     
T  33486791 acagcatccatgttaattaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatat----------actatattcatgtatccggaatactcatgtctt 33486880  T
Q  553 cagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33486881 cggatctgcaacattgacgacaccaaagccattgtcattgatcggatttgcatttgctcaaagttaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 33486980  T
Q  653 ggacgggaaatcaaaagcacac 674  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  33486981 agacgggaaatcaaaaacacac 33487002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 4882032 - 4882332
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||||    
T  4882032 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaaaaaaa-gaatgaatttgtgaacaaactc 4882130  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||                |||||||||| |||    
T  4882131 acagcatccatgttaatagcataaaacagcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgattatat----------------tcatgtctccggat 4882214  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  4882215 ctgcaacgttgacgatgccaaagtcattatcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagaca 4882314  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  4882315 gaaaatcaaaaacacacc 4882332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 362 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 51418446 - 51418139
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  51418446 taaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaagtttgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacag 51418347  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || ||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | || ||  |||||||  ||||||| |||||     
T  51418346 catccatgttaacaacataaaatggaaaagtatctatgccagcaaatatgactaatatgcctatattcaagtctccagaatacttctgtctccggatcta 51418247  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  51418246 caacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttccacctgaatcaaataaacaccgcacaaagacggaa 51418147  T
Q  661 aatcaaaa 668  Q
    ||||||||    
T  51418146 aatcaaaa 51418139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 10627471 - 10627148
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgata------caatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaac 451  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||      ||||| |||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  10627471 aaaataaacgatattcattcattcaaattgaaagagtacattcatataaatacaataaaaattcaatttcgctacaaacaaaaaggatgaatctgtgaac 10627372  T
Q  452 aaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtc 550  Q
    |||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||   || |||||||||    
T  10627371 aaactcacaacatccatattaatagtctaaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatcactaatatgactatattaaagtctccaaaaaactcatgtc 10627272  T
Q  551 tccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 650  Q
    |||  |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10627271 tccgaatctgcaacgttgaagacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatc-ttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 10627173  T
Q  651 taggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||||| |||| |||| ||||||    
T  10627172 tatgacggaaaataaaaaacacacc 10627148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 371 - 675
Target Start/End: Original strand, 7995247 - 7995533
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7995247 ttcattcatttaaattgatag--tacatcggtacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgt 7995344  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgac 570  Q
    ||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||   |||||||||||||||    
T  7995345 taatagcataaaatgataaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctcagaatctgcaacgttgac 7995428  T
Q  571 gacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagc 670  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  7995429 gacgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccacactaagacgggaaatcaaaaac 7995528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 37822018 - 37822311
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  37822018 aaaataaacgatattcattcactcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaaaaaactc 37822117  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| |                |||||||||| |||    
T  37822118 acagcatccatgttaatagtataaaacggcaaagtatctatacctacaaatatgactaatataactatgt----------------tcatgtctccggat 37822201  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  37822202 ctgcaacgttgacgacaccaaagacattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaag-taatctttcaacctgaatcaaataaatactgcactaagacg 37822300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 364 - 673
Target Start/End: Original strand, 423953 - 424262
Alignment:
Q  364 aacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaaca 463  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  423953 aacgatattcattcattcaaatcgataaagtatatcgatataatacaaattcaaattcactaaaaacgaaaaggacgaatctgtgagcaaactcacaaca 424052  T
Q  464 tctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttct--ggaatactcatgtctccagatctgc 561  Q
    || ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  424053 tccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattca-attctaaggaatactcatgtctcca-atctgc 424150  T
Q  562 aacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaa 661  Q
    |||||||||||| || ||  ||| ||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  424151 aacgttgacgacgcctaacccattgtcattgatcgaatctgcacttgtgcaaagttaatctttcaacctagatcaaataaacaccgtactaagacggaaa 424250  T
Q  662 atcaaaagcaca 673  Q
    || |||| ||||    
T  424251 ataaaaaacaca 424262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 358 - 652
Target Start/End: Original strand, 15790931 - 15791225
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||||| |||||| ||| ||    
T  15790931 aaaataaaagatattcatttattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaagtatgaatatgtgaa-aaaatc 15791029  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatt-tatgttctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |   ||  ||||| |||||| || |||    
T  15791030 acaacatccatgttattaacataaaacggcaaaatacctatgcctacaaatatgactaatatgactgtattaaacactccagaatattcatgtttctaga 15791129  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15791130 tctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgataagatttgcatttcttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 15791225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 32879159 - 32878856
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||| |||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  32879159 aaaataaacgataatcattcattcaaattgatttagtacatcgatacaatacaaatccaaagtcgctaaaaataaaaaggataaatctgcgaacatactc 32879060  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttct-ggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||    
T  32879059 acatcacccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatg---------actatattcaagttttcggaatactcatgtctccgga 32878969  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32878968 tctacaacgttgacgacaccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaagac 32878875  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  32878874 ggaaaatcaaaaacacacc 32878856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 18344063 - 18343768
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18344063 aaaataaacgatatttatttattcaaattgatagagtatatcgatacaata------caaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 18343970  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||         |||| | || || ||||| ||||||||||| ||    
T  18343969 acatcatccctgttaatagcataaaacggcaaggtacccatgcctacaaatatgacta---------tattcaagtctccggaatcctcatgtctccgga 18343879  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18343878 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaatc-aataaacaccgcactaagac 18343780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 42491335 - 42491048
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42491335 aaaataaacaatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgat--aaaaaaaat-gatgaatctgtgaacaaactc 42491239  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||      ||||||         |||||||||||  | | || || ||||||||||||||| | ||    
T  42491238 acaacatccatgttaataacataaaacgacaaagta------cctaca---------aatatgactatcgtcaagtctccggaatactcatgtcttcgga 42491154  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||| ||||||||      ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42491153 tctgcaacattgacgac------gtcaacgtcattgatctgatctgcacttgctcaaagctaatctttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaagac 42491060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 12872072 - 12871769
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  12872072 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccatattcgctaaaaacaaaaaggatggatttatgaacaaactc 12871973  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||         | |||||||||||| | || || ||||||||||||||||  ||    
T  12871972 acagcatccatgttattagcataaaacgacaaagtacatatgcctaca---------agtatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctctgga 12871882  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||  |||||      ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||     
T  12871881 tctgcaacgttgacgatgccaaa------gtcattgatcgaatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaacgcactaagat 12871788  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    | ||||| |||| ||||||    
T  12871787 gagaaataaaaaacacacc 12871769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 393 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 47551511 - 47551243
Alignment:
Q  393 gtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagt 492  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47551511 gtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatctatgttaatagcataaaatggcaaagt 47551412  T
Q  493 acttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcatt 591  Q
    |  ||||||||||||||||         |||||||| | || ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      ||||  ||||||    
T  47551411 atctatgcctacaaatatg---------actatattcaagtctccagaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacgac------gtcaaagtcatt 47551327  T
Q  592 gatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  47551326 gattggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaattaaacacagcactgagacgggaaataaaaaacacacc 47551243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 9298086 - 9298382
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  9298086 aaaataaatgatgtttattcatttaagttgatagagtacatcgatactatataaatttaaaatcactgaaaacaaaaaggatgaatctgcgaataaactc 9298185  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| | |||||||| |||||||| |         ||||||| |||||| | || || | ||||||||| ||||| ||    
T  9298186 acaacatccatgttaatagtataaaatgacaaagtacctatgcctata---------aatatgattatattcaagtctccgaaatactcatatctccgga 9298276  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||| |||||||||  |||||      |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9298277 tctgcatcgttgacgatgccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagat 9298370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 358 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 17348041 - 17347873
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17348041 aaaataaacgatattcactcatttaaattgatagagtacatcgatataatataaatttaaattctctaaaaacaaaacggatgaatttgtgaacaaactc 17347942  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatt 528  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17347941 acaacatc--cgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctataaatatgactaatatgactatatt 17347873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 412 - 674
Target Start/End: Original strand, 4870751 - 4871005
Alignment:
Q  412 attcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatg 511  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | || ||||| |||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||    
T  4870751 attcaaattcgctaaaaacaaaaggaataaatctatgaacaaactcactgaatccatgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctgtaaatatg 4870850  T
Q  512 actaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgct 610  Q
    ||||         |||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4870851 acta---------tattcatgtctccagaatactcatgtctccggatctacaacgttgacgacgccgaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgct 4870941  T
Q  611 caaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacac 674  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||    
T  4870942 caaagctaatttttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaagatgagaaataaaaaacacac 4871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 25032758 - 25032915
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  25032758 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaattc 25032857  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||  || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  25032858 acaacatcaatgttaacaacatagaacatcagagtatctatgcctacaaatatgacta 25032915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 358 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 13152893 - 13152636
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacat--cgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| || | |||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  13152893 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatatcaatacaatataaatccaaatccgctaaaataaaaaaggatgaatttgtgaacaaac 13152794  T
Q  456 tcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctcca 554  Q
    ||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||         |||| ||||||| | |||| || |||||||| |||||||      
T  13152793 tcacatcatccatgtcaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctaca---------aatacgactataatcatgtctccggaatacttatgtctctt 13152703  T
Q  555 gatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaa 627  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13152702 gatctgtaacgttgatgacgccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaa 13152636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34567113 - 34566975
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34567113 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgt 34567020  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34567019 taatagcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgacta 34566975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 15276115 - 15276327
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15276115 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactc 15276208  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||          |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||    
T  15276209 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctaca---------catatgactatatttaaatctctggaataatcatgtctccaga 15276299  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  15276300 tctgcaacgtggatgacgccaaagtcat 15276327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 44513671 - 44513883
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44513671 aaaataaaagatattcattcatttaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatctttgaacaaactc 44513764  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||          ||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||    
T  44513765 acaacatccatgttaataacataaaacagcaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctccgga 44513855  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44513856 tctgcaacgttgacgactccaaagtcat 44513883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 10305029 - 10304734
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  10305029 aaaataaaggatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatataaattcaaaattgataaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaactc 10304930  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| || |||||| |||||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||         |||||||| | || |  ||||||  |||||||||  |    
T  10304929 acaacatccattttaatagcataaaattgcagagtatctatgcatacaaatatg---------actatattcaagtcttcggaatatccatgtctccgaa 10304839  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||  | |||      ||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10304838 tctgcaacgttgacgatgctaaa------gtcattgattgaatctccactttctcaaagctaatatttcaacttgaatcaaataaacaccacactaagac 10304745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 475
Target Start/End: Original strand, 33938712 - 33938816
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33938712 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgt 33938811  T
Q  471 taata 475  Q
    |||||    
T  33938812 taata 33938816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 46589593 - 46589381
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  46589593 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaagggatgaatatgtgaacaaactc 46589500  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||          |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||    
T  46589499 acatcatccatgttaataacataaaacgacaaagtactaaagtctaca---------catatgagtatatttaagtctctgaaatactcatgtgtccgga 46589409  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  46589408 tctgcaacgttgaggactccaaagtcat 46589381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 2351066 - 2350916
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2351066 aaaacaaacaatattcgttcattcaaattgatagagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaacaaaatg-atgaatatgtgaacaaactc 2350974  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  2350973 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaaagcctacaaatatgacta 2350916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Original strand, 13691448 - 13691583
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| | | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13691448 attcattcaaattgatagagtacatcgatgcaata------caaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactcacaacatccatgttaa 13691541  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  13691542 tagcataaaacggcaaaatacataagcctacaaatatgacta 13691583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 515 - 668
Target Start/End: Original strand, 33938825 - 33938979
Alignment:
Q  515 aatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaa 613  Q
    ||||||| |||||| |||| || | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33938825 aatatgattatattcatgtctccgaaatactcatgtctccggatctggaacgttgacgacgacaaagtcattgtcattgattggatctgtacttgctcaa 33938924  T
Q  614 ggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
     |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  33938925 agctaatctttcaacctaaaccaaataagcaccgcactaagacggaaaataaaaa 33938979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 13969309 - 13969439
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13969309 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatacaatg------caaattcgcaaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactc 13969402  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13969403 acaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtac 13969439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 33703179 - 33703330
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33703179 aaaataaacgatattcattcgtttaaattgatagagtacatcgatacaataaaaaat----ttc--taaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 33703272  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  33703273 acagtatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgacta 33703330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 12147717 - 12147929
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||      | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12147717 aaaatagacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaataaaagggatgaatctgtgaacaaactc 12147810  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||          ||||||||||| ||| || || ||||||| ||||||||| ||    
T  12147811 acatcatccatgttagtagcataaaacgacaaagtactaaagcctaca---------catatgactatacttaagtctccggaatacccatgtctccgga 12147901  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12147902 tttgcaacgttgacgactccaaagtcat 12147929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Original strand, 15312325 - 15312439
Alignment:
Q  401 atacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgc 500  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||     
T  15312325 atacaatacaaatccaaagtcgttaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgttaataacataaaacggcataatacatatgg 15312424  T
Q  501 ctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||||||    
T  15312425 ctacaaatatgacta 15312439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 575 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 17347845 - 17347747
Alignment:
Q  575 ccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcaca 673  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17347845 ccaaagtcattgtcattgatcgaatctgcacttactcaaagctaatctttcaaccttaatcaaataaacactgcactaagacgggaaatcaaaaacaca 17347747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 33177267 - 33177418
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||| | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33177267 aaaataaataatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatg------caaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactc 33177360  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  33177361 acaacatccatgttaattgcataaaacggcaaagtacaaaagcctacacatatgacta 33177418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 44562418 - 44562569
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  44562418 aaaataaatgatattcattcagtcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgataaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 44562511  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||    
T  44562512 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaagatacaaatgcctacacatatgacta 44562569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38647029 - 38646878
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| | |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||  |||    
T  38647029 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatc-----aatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaaactgtgaacaggctc 38646936  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  38646935 acaacatccatgttaatagcataaaaaggcaaagtacaaatgtctacacatatgacta 38646878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 358 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16141077 - 16140993
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaa 442  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16141077 aaaataaacgatattcattcatccaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaatggatgaa 16140993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 12967402 - 12967613
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |       |||||| | | |||||||||  ||| ||||||||||||  |||    
T  12967402 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatagtg------caaatttgctaaaaacaaaaatgataaatctgtgaacaggctc 12967495  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||          |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  12967496 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctaca---------catatgactatatttaatctccggaataatcatgtctccagat 12967586  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  12967587 ctacaacgtggatgacaccaaagtcat 12967613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8893737 - 8893586
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  8893737 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac------aatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctaggaacaaactc 8893644  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||  || |||||  | ||||||| |||||||||    
T  8893643 ataacatccatgttaatagcataaaacaacagagtacaaaagcctacacatatgacta 8893586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10599314 - 10599173
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatgg-atgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||| || |||    
T  10599314 attcattcaaatttattgagtacatcgatacaata-aaattcaaagtcgttaaaaacaaaatgttatgaatctccgaacaaactcacagcatccatatta 10599216  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| |||| |||||||| |||  |||||||||||||||    
T  10599215 atagcatagaacgacaaagtacatatatctacaaatatgacta 10599173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 49652280 - 49652129
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||| | | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  49652280 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaatttgctaaaaacaaaaaggatggatctgtgaacaagctc 49652187  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  49652186 acaacaaccatgttaatagcataaaacagcaaggtacaaatgcctacacatatgacta 49652129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 11121421 - 11121271
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||      | | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11121421 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatacaatgaaagttc------gctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactc 11121328  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  11121327 acaatatccatgttaatagtataaaacgacaaagtactcaggcctacacatatgact 11121271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 11877117 - 11877274
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||| ||||||||| | | ||||||| | ||| ||||||||| | |||||  || ||||||||||    
T  11877117 aaaataaacgatattaattcattcatgttgatagaatacgtcgatacaacacatattcaaagttgttaaaaacaaaaagaatgaacttgcgaacaaactc 11877216  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  11877217 acagcatccatgttaataacataaaacggcaatgtaactacgccaacaaatatgacta 11877274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20413191 - 20413094
Alignment:
Q  416 aaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgac 513  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20413191 aaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatctatgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgac 20413094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 38644466 - 38644617
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||| | |||||| | | ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||    
T  38644466 aaaataaattatattcattcatttaaattgatagagtacatc-----aatataa-tgcaaatttgctaaaaactaaaaggatgaatatgtgaacaagctc 38644559  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  38644560 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 38644617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 445 - 675
Target Start/End: Original strand, 28399086 - 28399302
Alignment:
Q  445 tgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatac 543  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||         |||||||||||||| | || || | |||||    
T  28399086 tgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcttaca---------aatatgactatattcaagtctccgaaatac 28399176  T
Q  544 tcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaac 643  Q
    | | |||| ||||||||||| |||||| |  | |||      ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  28399177 ttaggtcttcagatctgcaatgttgacaatgcaaaa------gtcattgattggatctgcacttgctcaaagctaatatttcaacatgaatcaaataaat 28399270  T
Q  644 accgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||| || ||| |||||| |||| ||||||    
T  28399271 accgcattaagacaggaaataaaaaacacacc 28399302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 50107584 - 50107881
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  50107584 aaaataaacgatatttattaattcaaattgattgagaacatcgatactagacaaattcaatgtcgctaaaaacaaaatg-atgaatctacgaacaaactc 50107682  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatg-ttctggaatactcatgtctccaga 556  Q
     ||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||  ||||||||||         |||| ||||||||| | |   | | ||||||||||| ||  ||    
T  50107683 tcaacatccatgttaaaaggataaaacgacaaagtatgtatgcctaca---------aatacgactatattcaagccaccgaaatactcatgtttctgga 50107773  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggc--taatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagg 654  Q
    ||||||| ||||||||||| |||      ||||||||| | || |||||||| |||| ||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  50107774 tctgcaatgttgacgacacaaaa------gtcattgattgaatttgcacttgatcaaagctataatttttcaacataaatcaaataaacaccgcactaag 50107867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 52839962 - 52839763
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||       | |||  |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  52839962 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatgaaaattcac------taaaagtaaaaaggatgaatccgtaaacaaactcacaacatccatgt 52839869  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatg-ttctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttga 569  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||          ||| ||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  52839868 taatagcataaaacggcaaagtactaaagcctaca---------catacgactatagttaagtttccgaaatacccatgtctccagatttgcaacgttga 52839778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 6212583 - 6212734
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||      ||| |||||||||  ||||||| ||||||||  |||    
T  6212583 aaaataaaagatatttattcattcaaattgatagagtatatcgatataatgtaaattc------gttaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctc 6212676  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  6212677 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgcctacccatatgacta 6212734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26771551 - 26771400
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||  | |||||||||  |||||||    ||||||||||    
T  26771551 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata------caaattcactaaaaacaaaaaagatgaattaacgaacaaactc 26771458  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  26771457 acaacaaccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgacta 26771400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 538 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 29938516 - 29938388
Alignment:
Q  538 gaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaa 637  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||      |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  29938516 gaatactcatgtctccggatttgcaacgttgataacgccaaagtcat------tgattggatctgcacttgatcaag-ctattctttcaacataaatcaa 29938424  T
Q  638 ataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcaca 673  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29938423 ataaacaccgcactaggacgagaaatcaaaaacaca 29938388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 493
Target Start/End: Original strand, 34659310 - 34659439
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||| | | |||||| || |||||||| || || |||||||    
T  34659310 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatac------aatgcaaatttgctaaaaacataaaggatgaatttgcgagcaaactc 34659403  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagta 493  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34659404 acaacatccatgttaatagcataaaatggcaaagta 34659439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 362 - 515
Target Start/End: Original strand, 630457 - 630604
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||    
T  630457 taaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacagactcgcaa 630550  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||  ||| ||||| |||||||||    
T  630551 catccatgttaatagcataaagtggcaaggtacaaatgtctacacatatgacta 630604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 22344581 - 22344732
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||  |||    
T  22344581 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata------taatgcaaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctc 22344674  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||| |||||||||    
T  22344675 acatcatccatgttaatagcataaaacagtaaagtacaattacctacacatatgacta 22344732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23257533 - 23257382
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||  |||    
T  23257533 aaaataaatgatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgttaacaggctc 23257440  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23257439 acaacatccatgttaatagcacaaaacagcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 23257382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 371 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 36621783 - 36621648
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||||| | |||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36621783 ttcattcattcaaattgacagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaataaaaagaatgaatatgtgaacaagctcacaacatccatgt 36621690  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36621689 taatagcataaaatggcaaagtacaaatgcctacacatatga 36621648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 437 - 644
Target Start/End: Original strand, 40862568 - 40862761
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttct 536  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||       ||| ||  | |||     
T  40862568 gatgaatctgcgaacaaactcaaaacatccatgttaatagcataaaacgacagagtacttatgcctacaaatatgacta-------tattttagtcttca 40862660  T
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatca 636  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||       |||||||| | || | ||| || ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  40862661 g-aatactcatgtctctggatctgcaacgttgacgacgccaaa------atcattgattgcatttacacctgatcaaaactaatctttcaatctgaatca 40862753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 463
Target Start/End: Original strand, 25689508 - 25689613
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  25689508 aaaatgaacgatatttattcattcaaattgatagagtatattgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaataaaacggatgaatctgggaacaaaatc 25689607  T
Q  458 acaaca 463  Q
    ||||||    
T  25689608 acaaca 25689613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37662797 - 37662650
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||| | |||| ||| ||    |||||||||||||||||    
T  37662797 aaaacaaacgacattcatccattcaaattgatagagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaaaaaactg----aatctgtgaacaaactc 37662708  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  37662707 acaacattcatgttaatagcataaaatgacaaagtacgtaagcctacaaatatgacta 37662650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 48003662 - 48003522
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||| || | ||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||    
T  48003662 aaaataaacgatattcatttattaaaattgatatagta-atcaatacagtacacattcaaagtcgttaaaaacaaaaaagatgaatttgtaaacaaaatc 48003564  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatg 499  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  48003563 acaacattcatgttaatagcataaaacggcaaaatacatatg 48003522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 374 - 513
Target Start/End: Original strand, 29551436 - 29551576
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcac-aacatctatgtta 472  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||  ||| ||    
T  29551436 attcatttaaattgatagattacatcgatacaatacaatttcaaagtcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcaaacaaactcactaacattcatgcta 29551535  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgac 513  Q
    ||| |||| ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  29551536 atagcatagaacagcagagtatatatgcctacaaatatgac 29551576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 609 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 20411786 - 20411727
Alignment:
Q  609 ctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20411786 ctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaatcaaaa 20411727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 428 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21326854 - 21326767
Alignment:
Q  428 aacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  21326854 aacaaaaaggatgaatatgtgaacaagctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgacta 21326767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 40992727 - 40992595
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||      | | ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  40992727 attcattcaaattgatagagtacattgatataatgtaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaatatccatgttaa 40992634  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||  |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  40992633 tagtataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatga 40992595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1768309 - 1768221
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1768309 aaaacaaaaaggatgaatatgtggacag-ctcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacaaatatgacta 1768221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 362 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 5844572 - 5844458
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  5844572 taaaagatattcattaattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcgcaa 5844479  T
Q  462 catctatgttaataacataaa 482  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  5844478 catccatgttaatagcataaa 5844458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 10782876 - 10782751
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||| | || ||  |||||||||||||    
T  10782876 aaaataatcgatattcattcattcgaattgatggagtacatcaatataatattaattcaaaatcgctaaaaacaaaaagaataaaattgtgaacaaactc 10782777  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    |||| |||||| |||| | |||||||    
T  10782776 acaatatctatattaaaagcataaaa 10782751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 45659446 - 45659308
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||       |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  45659446 ttcattcatttaaatcgatagagtacatcgatataatg------caaatttgctaaaaacaaaagggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgt 45659353  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||  |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  45659352 taatagtataaaacaccaaagtacaaatgcctacacatatgacta 45659308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 537 - 668
Target Start/End: Original strand, 26097846 - 26097971
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatca 636  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||      | || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26097846 ggaaaactcatgtctccggatctgcaatgttgacgacgcaaaagtcat------taatggaatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatca 26097939  T
Q  637 aataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||| |||| |||| ||||  |||||||||    
T  26097940 aataaataccgtactaagacgaaaaatcaaaa 26097971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 362 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 29938662 - 29938550
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    ||||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| | || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29938662 taaacaatattcattcatttaagtttatagagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaatagaaaggatgaatctgcgaacacactcacaa 29938563  T
Q  462 catctatgttaat 474  Q
    |||| ||| ||||    
T  29938562 catccatgataat 29938550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 399 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 6788266 - 6788175
Alignment:
Q  399 cgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||    
T  6788266 cgatacaatacaaatctaaattcgttaaaaacaaaagggatgaatctataaacaaactcacaacatccatattaatagcataaaacagcaaa 6788175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 589 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 8737584 - 8737521
Alignment:
Q  589 attgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8737584 attgattggatctgcacttactcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcacta 8737521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13999407 - 13999281
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||| ||  |  ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  13999407 aaaataaa-gatattcatttatttaaattggtaaagtatatcgatagaatacaaattcaaagtcactataaacaaaaatgatgaatctgcgaacaaactc 13999309  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||    
T  13999308 acaacgtccatgttaataacataaaacg 13999281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15698643 - 15698492
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||| |||||||| | ||||||| | |||||||| ||||| |   |||    
T  15698643 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgata------taatgcaaattcgctaaaaacaagaaggatgaatatgtgagcctgctc 15698550  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||   |||||||| |||||||||    
T  15698549 acaacatcaatgttaatagcataaaacggcaacatacaattgcctacacatatgacta 15698492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26200025 - 26199874
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||       | ||||||||| | || ||  |||||| ||||||    
T  26200025 aaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgccacaatgaaaattcac------taaaaacaaaaagaattaacatgtgaataaactc 26199932  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  26199931 acaacatccatgttaatagcataaaacaacaaagtattaaagcctacacatatgacta 26199874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 371 - 488
Target Start/End: Original strand, 2597249 - 2597366
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||| ||||| |||| ||||   |||||| | ||| |||| |||||||||| ||||    
T  2597249 ttcattcattcgaattgatagagtaaatcgatgtgatacaaattcaaagtcgttaaaaataaaaattatgaatatatgatcaaagtcacaacatccatgt 2597348  T
Q  471 taataacataaaacggca 488  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  2597349 taatagcataaaacggca 2597366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 32301788 - 32301664
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  32301788 aaaataaacgacattcattcgttcaaattcatatagtatatcaatacaatacaaatttaaagtcactcaaaacaaaa-agatgaatttgcgaacaaactc 32301690  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||    
T  32301689 acatcatccatgttaatagcataaaa 32301664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 900496 - 900376
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      ||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||| |||||    
T  900496 aaaataaattatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgt------aaattcgctaaaaacaaaa-ggatgaatctgcaaacgaactc 900404  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||    
T  900403 acaacatccatattaattgcataaaacg 900376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 586 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 13869874 - 13869802
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgg 658  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13869874 gtcattgattggatctacacttgttcaaaactaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagacgg 13869802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 359 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28213497 - 28213372
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| | |||    
T  28213497 aaataaatgatattcatttattcaaattgataaagtacattgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagattca 28213404  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28213403 catcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 28213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 603 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 32301558 - 32301486
Alignment:
Q  603 cacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| ||||||    
T  32301558 cacttgatcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagacgagaaataaaaaacacacc 32301486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 580
Target Start/End: Original strand, 27469380 - 27469585
Alignment:
Q  361 ataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaca 460  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||| |  ||||||| | |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  27469380 ataaatgatattcattcattcaaattaatagagtacatc-----aatataa-tgaaaattcgataaaaataaaaaggatgaatccgtaaacaaactcaca 27469473  T
Q  461 acatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatct 559  Q
     |||| ||||||||| ||||||| | ||||||| | | ||||||       |||  ||||||||||||||  | ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  27469474 tcatccatgttaatagcataaaatgacaaagtattaaagcctac-------act--tatgactatatttaactctctagaatatccatgtctccggatct 27469564  T
Q  560 gcaacgttgacgacaccaaag 580  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  27469565 gcaacgttgacgactccaaag 27469585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 492
Target Start/End: Original strand, 16574753 - 16574887
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||| ||| ||||| | |   |||||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  16574753 aaaataaatgatattcatttattcaaattgataaaatacataaatacaatacaaactcaaaattgagaaaaacaaaatgggtgaatttgcaaacaaactc 16574852  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagt 492  Q
    |  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  16574853 aagacatccatgttaatagcataaaacggtaaagt 16574887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23791424 - 23791288
Alignment:
Q  373 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |     ||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  23791424 cattcattcaaattaacagagtacatcgatgcaataca-----aaattcgtt-aaaacaaaaatgatgaatatgagaacaaactcacaacatttatgtta 23791331  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||  |||||||  ||||| || ||  | ||||||||||||||    
T  23791330 atagtataaaacaacaaagcacataaacttacaaatatgacta 23791288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10877792 - 10877641
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||     ||||||| | |||||||| | ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  10877792 aaaataaatgatattcgtttattcaaattgatagagtatatc-----aatataa-tgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatacatctgcgaacaaactc 10877699  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  10877698 acttcatcgatgctaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgacta 10877641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 12537985 - 12537881
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | | |||||||||  ||| |||||| ||| ||||||    
T  12537985 aaaataaatgatattaatttattcaaattgatagagtacatcaatacaatataaatgcaaagttgctaaaaacaaaa-agataaatctgcgaagaaactc 12537887  T
Q  458 acaaca 463  Q
    ||||||    
T  12537886 acaaca 12537881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 30678705 - 30678581
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| || |||||| |  || ||||||    
T  30678705 aaaataaacgatattcattccatcaaattgatagaatatatcgatacaatacaaattcaaagttgttaaaaacaaaa-ggttgaatcagcaaataaactc 30678607  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    |  ||||  ||||||||| |||||||    
T  30678606 aagacattcatgttaatagcataaaa 30678581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 43504263 - 43504112
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||   ||| | || ||||   |||||| || ||||||||||    
T  43504263 aaaataaatgatattcatttatttacattgatagagtatatcaatataatataaatttaaa---gttgataaaaaaa---atgaatatgcgaacaaactc 43504170  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43504169 acataatctatgttcatagcataaaacaacaaagtacatattcctacaaatatgacta 43504112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 486
Target Start/End: Original strand, 26097689 - 26097815
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||     | |||| ||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  26097689 aaataaaagatattaattcattcaaatcgatagagtagatcgatacaatacaaatttaaagaaactaaaaataaaaaagatg-atctgcgaacaaactca 26097787  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacgg 486  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  26097788 catcatccatgttaatagcataaaacgg 26097815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28666523 - 28666476
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 406  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28666523 aaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 28666476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2486366 - 2486212
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||  |||||| | || ||||||||| ||  | |||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  2486366 aaaataaacgatatttattcatttaaattgataaattatttcgatatagtacaaattcaaagtcactaaaaataaaaaagatgaatctgcgaacaaactc 2486267  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    | |  ||| | ||||||| ||||||| |  | | |||||||||||||||||||||    
T  2486266 atagtatccacgttaatagcataaaatgatagaatacttatgcctacaaatatga 2486212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 416
Target Start/End: Original strand, 22031771 - 22031829
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattca 416  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22031771 aaaataattgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattca 22031829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 582
Target Start/End: Original strand, 25278508 - 25278715
Alignment:
Q  360 aataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcac 459  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||       ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25278508 aataaacgatattaactcattcaaattgatagattataacgataaaatacaaatt-------gttaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcac 25278600  T
Q  460 aacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatc 558  Q
    |||||  || || ||| |||||||  || || |||  |  ||||||||||||||||          ||| | || |||||||||||||||||| ||||||    
T  25278601 aacatacatattgatagcataaaatagctaaatacaaaatcctacaaatatgactac---------attcaagtctctggaatactcatgtcttcagatc 25278691  T
Q  559 tgcaacgttgacgacaccaaagtc 582  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  25278692 tgcaacgttaacgacatcaaagtc 25278715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 30853616 - 30853745
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||       |||||||| | | ||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  30853616 aaaataaatgatattcatttattcaaattgatataatacatcgatacaatg------caaattcgct-agaacaaaaaggatgaatctgcaaacaaactc 30853708  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| || |||||  ||||||||  ||||||||    
T  30853709 acaacatccatattaattgcataaaacaacaaagtac 30853745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Original strand, 33125543 - 33125632
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  33125543 aaaataaaaaggataaatatgcgaacaaactcacaacgtccatgttaatagcataaaacgacaaaataattatgtctataaatatgacta 33125632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 29802890 - 29802797
Alignment:
Q  553 cagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||      |||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  29802890 cagatctgcaacgttgacgacattaaagtcat------tgattggatctgcacttgatcaaaactactctttcaacaagaatcaaataaacaccacacta 29802797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 32538888 - 32538932
Alignment:
Q  372 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattca 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32538888 tcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgtaaattca 32538932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38783473 - 38783361
Alignment:
Q  403 acaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcct 502  Q
    |||||| ||||||||| ||  | |||||||||  ||| ||| || || |||||||| |||||| |||||||||| |||||| | || ||||| |||||||    
T  38783473 acaatacaaattcaaagtctctaaaaacaaaaatgataaatttgcgagcaaactcaaaacatccatgttaataatataaaatgacatagtacatatgcct 38783374  T
Q  503 acaaatatgacta 515  Q
    | |||||||||||    
T  38783373 ataaatatgacta 38783361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47392530 - 47392430
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||| | ||| |||||  ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  | || |||| ||||||||    
T  47392530 caaattcgctaaaagcaaaaaagataaatcagcgaacaaactcacaacatccatgttaataacgtaaaacgacaaagtacaaaagcatacacatatgact 47392431  T
Q  515 a 515  Q
    |    
T  47392430 a 47392430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 50165944 - 50165996
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  50165944 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 50165996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 50271985 - 50272037
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  50271985 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggca 50272037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 433
Target Start/End: Original strand, 10188545 - 10188620
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaa 433  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  10188545 aaaataaataatattcattcattcaaattaatagagtacattggtacaatacaaattcaaagtcgctaaaaacaaa 10188620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 13999203 - 13999132
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  13999203 gtcattgattgaatctgcatttgctcaaagttaatcttacaacctgaatcaaataaacatcgtactaagacg 13999132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 14716945 - 14717071
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  14716945 aaaataaaatatattcattcattcaaattgataaagtacatagatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 14717038  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
       ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14717039 ---acatccatgttaatagcataaaac-gcaaagtac 14717071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 24114563 - 24114626
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgca 649  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24114563 gtcattgattgaatctgcacttgctaaacactaatctttcaacttgaatcaaataaacatcgca 24114626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 490
Target Start/End: Original strand, 34878146 - 34878197
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||    
T  34878146 tgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaa 34878197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 38783303 - 38783216
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacac 674  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  38783303 tcattgattgcatctgcacttgatcaaagttaatctttcaaactggatcaaataaacatcacactaagacgagaaataaaaaacacac 38783216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 46930537 - 46930423
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| | |||||| ||  |||||||||    
T  46930537 aaaataaaagatattcattcttttaaattgataaagtacat-gatacaatacaaattaaaactcactaaaaacaaaaagaatgaatatgcaaacaaactc 46930439  T
Q  458 acaacatctatgttaa 473  Q
    || ||| |||||||||    
T  46930438 acgacaactatgttaa 46930423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 538 - 584
Target Start/End: Original strand, 13969475 - 13969521
Alignment:
Q  538 gaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13969475 gaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgtcaaagtcat 13969521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 20413097 - 20413051
Alignment:
Q  567 tgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaa 613  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20413097 tgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaa 20413051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 652
Target Start/End: Original strand, 45425359 - 45425425
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||||||  ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45425359 gtcattgattcgatatgcaattgatcaagactaatctttcaacatgaataaaataaacaccgcacta 45425425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 8224544 - 8224490
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagta 493  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8224544 gatgagtctgtgaacaaactca--acatctaagttaataacataaaacgacaaagta 8224490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8737983 - 8737827
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| |||| || ||||||| |||||||||||  |||| ||  |||||||| ||||||||| ||| | |||| | || |||||||||||  |||| ||||    
T  8737983 aaaacaaaccatattcattccttcaaattgattaagtatattaatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaaaataa-ggatgaatctgcaaacacactc 8737885  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    | |||||| ||||||| | | ||| ||| |||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  8737884 aaaacatccatgttaaaagcgtaagacgacaaagtatctattcctacaaaaatgacta 8737827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8758107 - 8758062
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgata 403  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8758107 aaaatatacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgata 8758062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 674
Target Start/End: Original strand, 25032987 - 25033060
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacac 674  Q
    ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || || || |||||| ||||| |||||    
T  25032987 tgcacttgctcaaagttaatctcacaacctgaatcaaataaacaccacattaagatgggaaaacaaaaccacac 25033060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 650
Target Start/End: Original strand, 31427049 - 31427098
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 650  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31427049 tgcacttgatcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcac 31427098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 539 - 584
Target Start/End: Original strand, 33177434 - 33177479
Alignment:
Q  539 aatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33177434 aatactcatgtctccggatttgcaatgttgacgacaccaaagtcat 33177479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1141144 - 1141084
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaa 418  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  1141144 aaaataaacgatattcattcttttaaatcgatagaatacatcaatataatataaattcaaa 1141084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 5701495 - 5701443
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  5701495 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 5701443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 490
Target Start/End: Original strand, 7836651 - 7836715
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||    
T  7836651 aaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaa 7836715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 539 - 646
Target Start/End: Original strand, 25689684 - 25689785
Alignment:
Q  539 aatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaa 638  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||      ||||||||| | || ||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  25689684 aatactcatgtcttcagatctgcaatgttgacgacgccgaa------gtcattgattgaatatgcgctttcccaaagctaatctatcaacctgaataaaa 25689777  T
Q  639 taaacacc 646  Q
    ||||||||    
T  25689778 taaacacc 25689785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26535627 - 26535591
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26535627 aaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 26535591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27456780 - 27456744
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27456780 aaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 27456744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 517 - 584
Target Start/End: Original strand, 37684903 - 37684971
Alignment:
Q  517 tatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||||||||||| || |||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37684903 tatgactatatttaagtctctaaaatgctcgtgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaagtcat 37684971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 517 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 37700614 - 37700546
Alignment:
Q  517 tatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||||||||||| || |||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37700614 tatgactatatttaagtctctaaaatgctcgtgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaagtcat 37700546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 598 - 666
Target Start/End: Original strand, 39080811 - 39080879
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaa 666  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  39080811 atctacacttgctcaaaactaatcttttaacatgaatcaaataaacactgcactaagacgaaaaatcaa 39080879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 40646755 - 40646707
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40646755 atctttcaatatgaatcaaataaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 40646707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12370359 - 12370292
Alignment:
Q  404 caatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtt 471  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||    
T  12370359 caatataaattcaaagtcgctaaaaacaaaaaggatgaatccgctaacaaattcacaacatctctgtt 12370292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 490
Target Start/End: Original strand, 13144680 - 13144731
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  13144680 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaatggcaaa 13144731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 27872972 - 27872921
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||    
T  27872972 gatgaatctgcgaacaaactcacaacattcaagttaataacatataacggca 27872921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 490
Target Start/End: Original strand, 36775578 - 36775629
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  36775578 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaa 36775629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 398
Target Start/End: Original strand, 51373659 - 51373694
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacat 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51373659 aaacgatgttcattcattcaaattgataaagtacat 51373694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 652
Target Start/End: Original strand, 2513484 - 2513550
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||| |||| |||||  |||||| | ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  2513484 gtcattgattggatatgcacccgctcaaagttaatctttcagtctgaatcaaacaaacaccgcacta 2513550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 534 - 584
Target Start/End: Original strand, 13691594 - 13691644
Alignment:
Q  534 tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  13691594 tctggaatagtcatgcctccagatctgcaacgttgatgacgtcaaagtcat 13691644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24583177 - 24583123
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| |||||||||    
T  24583177 ggatgaatctgtgaacaaactcacatcacccaagttaatatcatacaacggcaaa 24583123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 418
Target Start/End: Original strand, 28399013 - 28399071
Alignment:
Q  360 aataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaa 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  28399013 aataaacaatgttcatttatttaaattgatggagtatatcgatacaattcaaattcaaa 28399071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 601 - 663
Target Start/End: Original strand, 29551648 - 29551710
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaat 663  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  29551648 tgcacttgatcaaaactaatatttcaaccttaatcaaataaacaccacactaagaagggaaat 29551710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Original strand, 32679006 - 32679060
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||||||    
T  32679006 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatggcatataacggcaaa 32679060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 464
Target Start/End: Original strand, 33144827 - 33144917
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacat 464  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||   ||| | ||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||    
T  33144827 attcatttaaattgataaaatacatcgatataatacaaattcatgatcgctaaaaacaaaaaggataaacatgcgaacaaactcacaacat 33144917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 449 - 515
Target Start/End: Original strand, 34039329 - 34039395
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  34039329 aacaaactcacatcatccatattaatatcataaagcggcaaagcacataagccttcaaatatgacta 34039395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 486
Target Start/End: Original strand, 38520380 - 38520430
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacgg 486  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  38520380 ggatgaatttgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgg 38520430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 438 - 480
Target Start/End: Original strand, 41081551 - 41081593
Alignment:
Q  438 atgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  41081551 atgaatctgtgaacaaactcacaacatccgagttaataacata 41081593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 44543499 - 44543445
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||    
T  44543499 ggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaa 44543445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 47133130 - 47133076
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  47133130 ggataaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaa 47133076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 5832536 - 5832467
Alignment:
Q  516 atatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||||||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  5832536 atatgactatatttaaatctccggaataatcatgtctccagatctgcaacgtggatgacgtcaaagtcat 5832467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5856189 - 5856160
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5856189 ttcattcattcaaattgatagagtacatcg 5856160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 7421114 - 7421077
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaat 474  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7421114 gatgaatctgcaaacaaactcacaacatctatgttaat 7421077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 657
Target Start/End: Original strand, 10188789 - 10188830
Alignment:
Q  616 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  10188789 ctaatttttcaacctggatcaaataaacactgcactaggacg 10188830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15575866 - 15575805
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatat 510  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||||||    
T  15575866 aacaaactcacaacattcgtgttaataacataaaacaacaaaatacatatgtctacaaatat 15575805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 19061135 - 19061082
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  19061135 gatgaatgtgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaa 19061082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 31919277 - 31919162
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| |   || |||| | |||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||    
T  31919277 ttcattcattcaaattgatagagtacatc-acatcatataca---aacttcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcgcaacatccaagt 31919182  T
Q  471 taataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||| |||| |||| ||||    
T  31919181 taatagcatacaacgacaaa 31919162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 7998025 - 7997973
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||    
T  7998025 ggatgaatctgcaaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggca 7997973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 536 - 584
Target Start/End: Original strand, 8743968 - 8744016
Alignment:
Q  536 tggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8743968 tggaatatgcatgtcttcatatctgcaacgttgacaacaccaaagtcat 8744016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 616 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8937837 - 8937785
Alignment:
Q  616 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  8937837 ctaatctttcaatttgaatcaaataaacaccgcattaagacaagaaatcaaaa 8937785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 11454173 - 11454129
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  11454173 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 11454129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 11462283 - 11462319
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11462283 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 11462319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 11709552 - 11709596
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  11709552 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaaattaatagcata 11709596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 19715891 - 19715939
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  19715891 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 19715939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 21947419 - 21947455
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21947419 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 21947455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 499
Target Start/End: Original strand, 27579996 - 27580056
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatg 499  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  27579996 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcttatg 27580056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 646
Target Start/End: Original strand, 29069725 - 29069785
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacacc 646  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29069725 gtcattgattgaatatgcacttgatcaaaattaatctttcaatctgaatcaaataaacacc 29069785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 35484192 - 35484228
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35484192 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 35484228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 36894209 - 36894245
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36894209 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 36894245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 41740596 - 41740552
Alignment:
Q  442 atctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacgg 486  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41740596 atctgcgaacaaactaacaacatctaagttaataacatacaacgg 41740552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 44915922 - 44915894
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44915922 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 44915894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 512
Target Start/End: Original strand, 45425223 - 45425299
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||||||||  ||| || ||| | |||| ||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||    
T  45425223 ggatgaatctgcaaacgaattcatatcatccatgttaatagcataaaacgactaagtgcatatgcctacaaatatga 45425299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 47133193 - 47133157
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47133193 aaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 47133157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 50148455 - 50148407
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  50148455 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 50148407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 51868490 - 51868542
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||    
T  51868490 ggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaataacatataacggca 51868542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 212)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 358 - 673
Target Start/End: Original strand, 393929 - 394245
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  393929 aaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaagggtgaatctgtgaacaaactc 394028  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |     
T  394029 acaacatccatgttaatagcataaaacgggaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccggt 394128  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  394129 tctgcaacgttgacgacgctaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 394228  T
Q  657 gggaaatcaaaagcaca 673  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  394229 gggaaataaaaaacaca 394245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 43244036 - 43244354
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  43244036 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacaccgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacaaactc 43244135  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||    
T  43244136 acaacatccatgttaatagcataaaccggcaaagtgcttatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccgaaatactcatgtctccgga 43244235  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43244236 tctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatgaaataaacaccgcactaagac 43244335  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  43244336 gggaaatcaaaaacacacc 43244354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 45350725 - 45351043
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  45350725 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaagggtgaatctgtgaacaaactc 45350824  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  45350825 acaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccgga 45350924  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||     
T  45350925 tctgtaacattgacgacgccaaagtcattgtcattaatcagatctgcacttgatcaaagctaatctttcaacttgagtcaaataaacaccacactaagat 45351024  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  45351025 gggaaatcaaaaacacacc 45351043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 45360204 - 45360522
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  45360204 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaagggtgaatctgtgaacaaactc 45360303  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  45360304 acaacatccatgttaataacataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctccgga 45360403  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||     
T  45360404 tctgtaacattgacgacgccaaagtcattgtcattaatcagatctgcacttgatcaaagctaatctttcaacttgagtcaaataaacaccacactaagat 45360503  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  45360504 gggaaatcaaaaacacacc 45360522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 7083476 - 7083789
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7083476 aaaataaacgatattcattcactcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 7083575  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||         ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7083576 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctataaatatgacta---------tatttatgtctccggaatactcatgtctccaga 7083666  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaa----ataaacaccgcacta 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  7083667 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaatatataaacaccgcacta 7083766  T
Q  653 ggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  7083767 ggacgggaaatcaaaaacacacc 7083789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 358 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 42198019 - 42197714
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42198019 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatggatctgtgaacaaactc 42197920  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||    
T  42197919 acaacatccatgtcaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgactaatacgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccgga 42197820  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42197819 tttgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcatcgatcggatctgcacttgctcaaagataatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 42197720  T
Q  657 gggaaa 662  Q
    ||||||    
T  42197719 gggaaa 42197714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 371 - 675
Target Start/End: Original strand, 20399570 - 20399876
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatg 469  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20399570 ttcattcattcaaattgatagactacatcgatacaatacaaattcaaattcgccaaaagcaaaaaaggatgaatccgtgaacaaactcacaacatccatg 20399669  T
Q  470 ttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttg 568  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20399670 gtaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctctggaatactcgtgtctccagatctgcaacgttg 20399769  T
Q  569 acgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20399770 acgacgacaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaaactgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaatcaaaa 20399869  T
Q  669 gcacacc 675  Q
     ||||||    
T  20399870 acacacc 20399876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 359 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31522411 - 31522101
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31522411 aaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaagtccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactca 31522312  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  31522311 caacatccttgttaatagcataaaacggaaaagtacttatgcctgcaaatatgactaatatgactatattcatgtcttcggaatactcatgtctccggat 31522212  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31522211 ctgcaacgttgatgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacg 31522112  T
Q  658 ggaaatcaaaa 668  Q
     ||||| ||||    
T  31522111 agaaataaaaa 31522101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Original strand, 20887412 - 20887728
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20887412 aaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactc 20887511  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  20887512 acaacatccatgttaatatcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactagtatgactatattcatgtctctggaatactcatgtttccgga 20887611  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  20887612 tctgcaacgttgacgatgtcaaagtcattgtcattgatcggatttgcatttgctcaaagctaatctttcaatctgaatc-aataaacatcgcactaagac 20887710  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacac 674  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  20887711 gggaaataaaaaacacac 20887728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 358 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 39838060 - 39837755
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39838060 aaaataaacgatattcattcattcaaattgttagagtatatcaatacaatagaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 39837961  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||    
T  39837960 acaacatccatggtaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattttttctccagaatactcatgtctccagat 39837861  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39837860 ctgcaacgttgacgttgccaaaatcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagcaaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 39837761  T
Q  658 ggaaat 663  Q
    ||||||    
T  39837760 ggaaat 39837755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 6912146 - 6911828
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6912146 aaaataaacgttattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 6912047  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||    
T  6912046 acatcatccatgttaatagcataaaacagcaaggtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctctggaatcctcatgtctccgga 6911947  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6911946 tctacaacattgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgctcttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagac 6911847  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     |||||| |||| ||||||    
T  6911846 aggaaataaaaaacacacc 6911828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Original strand, 11209968 - 11210285
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11209968 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatgcaaatccaaattcactaaaaacataaaggatgaatctgtgaacaaactc 11210067  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  11210068 acaacatccatgataatagcataaaacgacaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgaccatatttatgtctccggaatactcatgtctccgga 11210167  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11210168 tctgcaacgttgatgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctccactcaatcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 11210267  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacac 674  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  11210268 gggaactcaaaaacacac 11210285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 626214 - 626516
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  626214 aaaataaatgaaattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaagctc 626313  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||         ||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  626314 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacccatgcctacaaatatgacta---------tatttatgtctccggaatactcatgtcttcaga 626404  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  626405 tctgcaatgtcgacgacaccaaagtcattgtcattggtcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagtac 626504  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||| ||||    
T  626505 gggaaataaaaa 626516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 371 - 667
Target Start/End: Original strand, 32616527 - 32616824
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||| |||     
T  32616527 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaactcttaacatccatgc 32616626  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttga 569  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  32616627 taatagcataaaacggcaaagtgcatatgcctacaaatatgattaatatgactatattcatgtcttcggaataatcatgactccggatctgcaacgttga 32616726  T
Q  570 cgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32616727 cgatgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaatcaaa 32616824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 44756694 - 44757015
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  44756694 aaaataaacgatattcattcatccaaattgatagagtacatcggtacaatagaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaattc 44756793  T
Q  458 acaacatctatgttaataaca---taaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctcc 553  Q
    ||| |||| |||||||||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||    
T  44756794 acagcatccatgttaataataatataaaacggcaaagtatatatgcctacaaatatgacaaatatgactatattcaagtctccggaatactcaagtctcc 44756893  T
Q  554 agatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactag 653  Q
      |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44756894 gaatctgcaacgttgaagacgccaaagtcactgtcattaatcggatctgcacttgctcaatgctgatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 44756993  T
Q  654 gacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || || ||||||||| ||||||    
T  44756994 gatggaaaatcaaaaacacacc 44757015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 359 - 675
Target Start/End: Original strand, 38943813 - 38944121
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38943813 aaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatccgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactca 38943912  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagat 557  Q
     | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||         |||| |||| || ||||||||| ||||||| |||    
T  38943913 tatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtatttatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcgtgtctccggat 38944003  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38944004 ctgcaacgttgacaacgccaaagtcattgtccttgatcggatctgcacttgctcaaagctattctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacg 38944103  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  38944104 ggaaatcaaaaacacacc 38944121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 358 - 663
Target Start/End: Original strand, 8517114 - 8517417
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  8517114 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaacta 8517213  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| |||||||||||    
T  8517214 acaatatccatgttaatagcataaaacagcaaagtacctatgcttataaatatgactaatatgactatattcatgtctccgaaatacttatgtctccaga 8517313  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  8517314 tctgcaatgttgacgacacaaaagtcattgtcat---tcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctaaatcaaataaacaccacactaagac 8517410  T
Q  657 gggaaat 663  Q
    |||||||    
T  8517411 gggaaat 8517417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 7060780 - 7060471
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  7060780 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaaaatgtgaacaaactc 7060681  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||         |||| |||| || ||||||||||||||||  ||    
T  7060680 acaacatccatgttaatagcataaaacgataaagtacctatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctctgga 7060590  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  7060589 tctgcaacgttgatgacgccaaagtaattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagac 7060490  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  7060489 gggaaataaaaaacacacc 7060471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 358 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 13966009 - 13965710
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13966009 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattccctaaaaacaaaaaggatgaatctgttaacaaactc 13965910  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||| |||    
T  13965909 acagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtccctatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccggat 13965826  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    || ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13965825 ctacaacgttgacgacgccaaagttattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagacg 13965726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 36124012 - 36124314
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36124012 aaaataaacgatattcattctttcaaattgatagagtccatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 36124111  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||         |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||| ||    
T  36124112 acaacatccatgttaatagcataaatcggcaaagcacatatgcctaca---------aatatgactatattcatgtctcccgaatactcatgtttccgga 36124202  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36124203 tctgcaacgttgacaacgccaaagtcattgtcattgatcgaatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 36124302  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||| ||||    
T  36124303 gggaaataaaaa 36124314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 362 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 30202500 - 30202186
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30202500 taaacgatattcattcaatcaaattgatagagtacatctatacaatacaaatctaaattcgctagaaacaaaaaggatgaaactgtgaacaaactcacaa 30202401  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||||| |||||||||| ||||||    
T  30202400 catccatgttaatagcataaaacggcaaagcatctatgcctacaaatatgagtaatatgactatattcaagtctccagaataatcatgtctccggatctg 30202301  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||    
T  30202300 caacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttcctcaaagctaatttttcaacttgaatcaaataaccactgcactaaaacggga 30202201  T
Q  661 aatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||| ||||||    
T  30202200 aatcaaaaacacacc 30202186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 19745856 - 19745537
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatg--gatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    ||||||| |||||  ||||    
T  19745856 aaaataaacgatattcaatcatttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaaatgatgaatttgtgat-aaac 19745758  T
Q  456 tcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctcca 554  Q
    ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||     
T  19745757 tcacatcatccatgttagtagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaactatgactaagatgactatatttatttctccggaatactcatgtctccc 19745658  T
Q  555 gatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagg 654  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  19745657 gatctgcaacattgacgacgctaaagtcattgtcattaatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaacaaacacctcactaag 19745558  T
Q  655 acgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  19745557 acgggaaataaaaaacacacc 19745537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 19793950 - 19794269
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatg--gatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    ||||||| |||||  ||||    
T  19793950 aaaataaacgatattcaatcatttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatccaaattcgttaaaaacaaaaaaatgatgaatttgtgat-aaac 19794048  T
Q  456 tcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctcca 554  Q
    ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||     
T  19794049 tcacatcatccatgttagtagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaactatgactaagatgactatatttatttctccggaatactcatgtctccc 19794148  T
Q  555 gatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagg 654  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  19794149 gatctgcaacattgacgacgctaaagtcattgtcattaatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaacaaacacctcactaag 19794248  T
Q  655 acgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  19794249 acgggaaataaaaaacacacc 19794269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 371 - 675
Target Start/End: Original strand, 24568383 - 24568686
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  24568383 ttcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacattcatgt 24568482  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttga 569  Q
    ||||| ||||||| ||||||  || |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24568483 taatagcataaaatggcaaaacacctatgcc-acaaatataactaatatgattatattcatgtctccgaaatactcatgtct-cggatctgcaacgttga 24568580  T
Q  570 cgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaag 669  Q
    |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||     
T  24568581 cgaggccaatgtcattgtcattgatcggatctgcactttctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccccactaagacggaaaataaaaaa 24568680  T
Q  670 cacacc 675  Q
    ||||||    
T  24568681 cacacc 24568686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 384 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 22757524 - 22757242
Alignment:
Q  384 attgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22757524 attgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaaaaaaa-ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaa 22757426  T
Q  484 cggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtc 582  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||         |||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22757425 cggctaagtacctatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatgtctccggatttgcaacgttgacgacgccaaagtc 22757335  T
Q  583 atggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  22757334 attgtcattgatcggatctgcatttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacaggaaatcaaaaacacacc 22757242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 25658627 - 25658315
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||      |||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  25658627 aaaataaacaatattcattcattcaaattgacaaaatacattgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaataatgaatttgtgaacaaactc 25658534  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  25658533 acaacatccatgttgatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgattaatatgactatatttatgtatctggaatactcatgtatccgga 25658434  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||    
T  25658433 tgtgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcgttgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacataaatcaaataaacatcgcactaagac 25658334  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || |||| |||| ||||||    
T  25658333 ggcaaataaaaaacacacc 25658315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 358 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 24100599 - 24100306
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||  ||||||||| |||            
T  24100599 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaatttcgctaaaaacaaaaatgatgaatctatgat------- 24100507  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||    
T  24100506 acaacatccacgttaatagcataaaacggcgaagtacttatgcctacagatatgagtaatatgactatatttatgtctcgggattacccatgtctccgga 24100407  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24100406 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccacactaagac 24100307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 477676 - 477985
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  477676 aaaataaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacattgatacagtacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaacgatgaatctgtgaacaaactc 477775  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttct--ggaatactcatgtctccag 555  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||         |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |    
T  477776 acaacatccatgttaatagcataaaacgtcaaagtacctacgcctaca---------aatatgactatattcat-ttcttcggaatactcatgtctccgg 477865  T
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  477866 atctgcaatgttgtagacgccaaagtcattgtcattgattggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 477965  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  477966 cgggaaataaaaaacacacc 477985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 39523873 - 39523557
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| | |||| ||   |||| ||||||||| |||||||    
T  39523873 aaaataaacgatattcattcaatcatattgatagagtatatcgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaataa---ggataaatctgtgagcaaactc 39523777  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||| | | ||    
T  39523776 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaattacatatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtcttcgaaatgctcatgttttcgga 39523677  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctc-aaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39523676 tctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 39523577  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||||| |||| ||||||    
T  39523576 cgagaaataaaaaacacacc 39523557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 362 - 673
Target Start/End: Original strand, 24611457 - 24611770
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  24611457 taaatgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacag 24611556  T
Q  462 catctatgttaataac--ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatc 558  Q
    |||| |||||||||    ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||| |||||| |||||     
T  24611557 catccatgttaatatagtataaaacggaaaagtatatatgcttacaaatatgactaatatgattatattcaagtctccggaatacttatgtcttcagatt 24611656  T
Q  559 tgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgg 658  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  24611657 tgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaat-aacaccgcactaagacga 24611755  T
Q  659 gaaatcaaaagcaca 673  Q
    ||||| |||| ||||    
T  24611756 gaaatgaaaaacaca 24611770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 26742127 - 26742436
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26742127 aaaatatacgatattcattcattcaaattgatatagtgcatcgatgcaatacaaatccaaattcgctataaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactc 26742226  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||         |||| |||| ||   ||||| ||||| ||||||    
T  26742227 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaaatatatatgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccaaaatacccatgtgtccaga 26742317  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26742318 tctgcaacgttgacgactccaaagtcattgtcattgatcggatctacacttgctcaaagctaatctttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaagac 26742417  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  26742418 gggaaatcaaaatcacacc 26742436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 51152580 - 51152272
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||  || ||| || | |||||||||||||    
T  51152580 aaaataaacgatattcat-cattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacttaaaggaagactttgtgaacaaactc 51152482  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||         |||| |||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  51152481 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatttgcctacaaatatgacta---------tattcatgtctccggaatactcatatctccgga 51152391  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  51152390 tctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaaaac 51152291  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  51152290 gggaaatcaaaaacacacc 51152272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 362 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 6882406 - 6882106
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6882406 taaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctctgaacaaactcacaa 6882307  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| |   ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||         |||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  6882306 catcca---taatagcataaaacggcaaagtatttatgtctaca---------aatatgactatattcaagtctctgttatactcatgtctccggatctg 6882219  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    |||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  6882218 caacgttgacgacgacaaagttattgtcattgatcggatctgcacttgctcatagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagacggaa 6882119  T
Q  661 aatcaaaagcaca 673  Q
    ||| |||| ||||    
T  6882118 aataaaaaacaca 6882106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 378 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 26674809 - 26674519
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||| | |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26674809 attcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatctcaattcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 26674710  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacacc 576  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||          ||||||||| || | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  26674709 ataaaacagaaaagtacctatgcctacaaatatgactg---------tatttatgtctccgaaatactcatgtcttcggatctgcaacgttgacgacgcc 26674619  T
Q  577 aaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacca 676  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26674618 aaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataagcacgacactaagacgggaaatcaaaaacacacca 26674519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 8712974 - 8712678
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  | |||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  8712974 aaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatctaaattcactaaaaacaaaaaaggatgaatttgtgaacaaact 8712875  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||  ||    
T  8712874 cacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctctgga 8712791  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8712790 tctgcaacgttgacgacgccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagac 8712697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 372 - 673
Target Start/End: Original strand, 7860878 - 7861177
Alignment:
Q  372 tcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtt 471  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7860878 tcattctttcaaattgatagaatacatcgatacagtacaaattcaaattcgttaaaaacaaaaagaatgaatctgtaaataaactcacaacatctatgtt 7860977  T
Q  472 aataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgac 570  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||           |||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7860978 aatagcataaaacggcaaaatatctatgcctacaaatatgac-----------tattcaagtctctggaacactcatgtctccagatctgcaacgttgac 7861066  T
Q  571 gacacca--------aagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaa 662  Q
    ||||| |        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7861067 gacactaaagtcattaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgcttaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaa 7861166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24826105 - 24825805
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaa-caaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24826105 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatagaatacaaatccaaattcgttaaaaaacaaaaaggatgaatctgtaaacaaact 24826006  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatg---tctc 552  Q
     |||        ||       ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||    ||||    
T  24826005 aacag-------gt-------ataaaacagcaaagtacctatgcatataaatatgacaaatatgactatattcaagtctctggaatactcataatttctc 24825920  T
Q  553 cagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24825919 cggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaagaccgcacta 24825820  T
Q  653 ggacgggaaatcaaa 667  Q
     ||||| ||||||||    
T  24825819 agacggaaaatcaaa 24825805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 362 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 50801664 - 50801372
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||| | |||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  50801664 taaacgatattcatttattcaaattgatagagtgcatcaataaaatacaaatccaaattcgctaaaaataaaaaggctgaatctgtgaacaaactcacaa 50801565  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta--atatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagatct 559  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||                |||||||||| |||||    
T  50801564 catccatgttagtagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatatgactatat----------------tcatgtctccggatct 50801481  T
Q  560 gcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggg 659  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  50801480 gcaacgttgacgatgtcaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgctcaaaattaatctttcaacctgaatcaaataaacacagcactaagacggg 50801381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 27395282 - 27394978
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||  | ||||| | |||||||||||    
T  27395282 aaaataaataatattcattcattcaaattgatagagttcatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaatggtgaatatttgaacaaactc 27395183  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||| | ||||||||| |||||              |||| ||| |   ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||      
T  27395182 acaacagccatgttaatagcataa--------------tatgactatattcatgtctaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgtctccatg 27395097  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27395096 tctgctacattgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgcttaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 27394997  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||| |||||||| ||||||    
T  27394996 ggggaatcaaaaacacacc 27394978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 358 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 28837521 - 28837212
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  28837521 aaaataactgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaataaactc 28837422  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| || |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||         |||| | || || |  ||| |||| ||||| ||    
T  28837421 acatcatccatattaatg-cataaaacgacaaagtaactatgcctacaaatatgacta---------tattcaagtctccgagatattcatttctccgga 28837332  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28837331 tctgcaacgttgacgacacgaaagtcattgtcattgttcggatcttcacttgctcaaagctaatctttcaacgtgaattaaataaacaccgcactaagac 28837232  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacca 676  Q
     | ||||||||| |||||||    
T  28837231 agaaaatcaaaaacacacca 28837212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Original strand, 13586012 - 13586205
Alignment:
Q  475 aacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgac 573  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  13586012 aacataaaacggtaaaatatctatgcctacaaatatgactaatatgattatattcttgtctctggaatactcatgtcttctgatctgcaacgttgactac 13586111  T
Q  574 accaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13586112 gccaaaatcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaatcaaa 13586205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 358 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 5814797 - 5814493
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5814797 aaaataaaagacattcattcattcagactgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaattagctaaaagaaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 5814698  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||         |||||||| | || ||  |||||||||||||||  ||    
T  5814697 acaacatccatgttaatagcataaaatggaaaagtatttatgcctacaaatatg---------actatattcaagtctccagaatactcatgtctctgga 5814607  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||| ||| |||||      ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5814606 tctgcaacgttgatgacgccaaa------gtcattgatcgaatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagac 5814513  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacca 676  Q
    |  |||| |||| |||||||    
T  5814512 gaaaaataaaaaacacacca 5814493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 480 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 29923179 - 29922991
Alignment:
Q  480 aaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaa 578  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29923179 aaaacggcaaagtacttaagcctaaaaatatgactaatatgactatatataaatctctgaagtactcatgtttccggatctgcaacattgacgacaccaa 29923080  T
Q  579 agtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  29923079 agtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcatagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaagacggaaaatcaaa 29922991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 371 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 53648060 - 53647780
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaat-ataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  53648060 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaattacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcataacatccatg 53647961  T
Q  470 ttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttga 569  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||                 ||||||||| ||||||||| ||||     
T  53647960 ttaatagcattaaacggcaaagtacctatgcctaca---------aatatgactatatc----------------catgtctccggatctgcaatgttgg 53647886  T
Q  570 cgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaag 669  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||     
T  53647885 cgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaataaaaaa 53647786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 358 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 46268131 - 46267897
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| | |||||||| ||| |||||||||    
T  46268131 aaaataaacgatatttattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatacaaattcgtcaaaaacaacaaggatgaatatgt-aacaaactc 46268033  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||| ||  |||||||||||| ||| ||    
T  46268032 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttgtgcctacaaatatgactaatgtgaatatagtcatgtctccagaatactcatgtttccgga 46267933  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattg 592  Q
    ||| ||| ||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  46267932 tctacaatgttaacgacgccaaagtcattgtcattg 46267897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 378 - 644
Target Start/End: Original strand, 6082121 - 6082366
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6082121 attcaaattgatagagtacatcgataca-------tccaaattcgttaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 6082213  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacacc 576  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||| | || ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||    
T  6082214 ataaaacggcaaagtacatatgcctaca---------aatatgactatattcaagtctccagaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacgatgcc 6082304  T
Q  577 aaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaaca 644  Q
    |||       ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6082305 aaa------atcattgaccgaatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctaaatcaaataaaca 6082366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 56236486 - 56236795
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| |     
T  56236486 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacatatccaaaatcgctaaaaacaaaaaggataaatctgtgaacaaattt 56236585  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctgga------atactcatgtc 550  Q
    |||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||         ||||||| |||||| | ||  | |||      |||||||||||    
T  56236586 acattatccatgttaatagcataaaacggcaatgtatctatgcctaca---------aatatgattatattcaagtcaccggaatactcatactcatgtc 56236676  T
Q  551 tccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 650  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||| |     
T  56236677 tccggatctgcaacgttgacgacgccaaa------gtcattgatcggatctgcgcttgctcaaagttaatctttcaacttgaatcaaataaataccgtat 56236770  T
Q  651 taggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||||||||||||||| ||||||    
T  56236771 taagacgggaaatcaaaaacacacc 56236795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 358 - 507
Target Start/End: Original strand, 18502497 - 18502646
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18502497 aaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 18502596  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaa 507  Q
    |||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  18502597 acagaatccatgttaatagcataaaacggcaaaataactatgcctacaaa 18502646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Original strand, 55600201 - 55600509
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||  | ||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||    
T  55600201 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtgcatcgatacaatacaaatctaaaatcactaaaaacaaaaaggataaatttgtgatcaaattc 55600300  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgtt-ctgga------atactcatgtc 550  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||         ||||||| |||||| | ||| | |||      |||||||||||    
T  55600301 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtatttatgcctaca---------aatatgattatattcaagttaccggaatactcatactcatgtc 55600391  T
Q  551 tccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcac 650  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||       |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  55600392 tccggatctgcaacgttgacgacgctaaa------atcattgattggatctgcgcttgctcaaagctaatctttcaagcggaatcaaataaacaccgtac 55600485  T
Q  651 taggacgggaaatcaaaagcacac 674  Q
    || || | ||||| |||| |||||    
T  55600486 taagatgagaaataaaaaacacac 55600509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 358 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 27091174 - 27090894
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||| |||| ||| || |||||||||     
T  27091174 aaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaagtcattaaaaacaaaaaggataaatatgcgaacaaactt 27091075  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||         ||| ||||||| |||| || ||  ||||||||| |||||| ||    
T  27091074 acaacatctatgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcttaca---------aatgtgactatgtttaagtctccagaatactcaagtctccgga 27090984  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||  ||||      | ||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27090983 tctgcctcgtt------aacaacgtcaaaatcattgatcggatctacacttgctcaaagttaatctttcaacctgaataagataaacaccgcacta 27090894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 362 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3159424 - 3159271
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||    
T  3159424 taaactatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaatacaaattcaaagtcactaaaaacaaaaaggatgaatctgcaaacaatctcacaa 3159325  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
     ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3159324 tatccatgttaatagcatgaaacagcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 3159271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 14346876 - 14346664
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  14346876 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaagaggatgaatccgtgaacaaactc 14346783  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||          ||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||| ||    
T  14346782 acagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtctctagaatacacatggctccgga 14346692  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14346691 tctgcaacgttgacgactccaaagtcat 14346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 358 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 7084408 - 7084278
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgataca--atataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7084408 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaac 7084309  T
Q  456 tcacaacatctatgttaataacataaaacgg 486  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  7084308 tcacatcatccatgttaatagcataaaacgg 7084278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 373 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23926471 - 23926335
Alignment:
Q  373 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23926471 cattcgttcaaattgatagagtacattgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 23926378  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23926377 atagcatcaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgacta 23926335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 362 - 491
Target Start/End: Original strand, 29266563 - 29266691
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  29266563 taaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctagaaacaaaa-ggatgaaactgtgaacaaactcacag 29266661  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaag 491  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29266662 catccatgttaatagcataaaacggcaaag 29266691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 29473997 - 29474209
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||      | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29473997 aaaataaaagatattcattcattcaaattggtagagtacatcaatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 29474090  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatg-ttctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||          ||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||| ||    
T  29474091 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaaagactaca---------catatgactatatttaagcctccggaatacccatgtctccgga 29474181  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29474182 tctgcaacgttgacgactccaaagtcat 29474209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 43157222 - 43157010
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43157222 aaaaaaaatgatattcatttattcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 43157129  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||          ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||    
T  43157128 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtctatggaatactcatgtgtccgga 43157038  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43157037 tctgcaacgttgaggactccaaagtcat 43157010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 537 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 2448086 - 2447948
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatca 636  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||    
T  2448086 ggaatactcatgtctctagatctgcaatgttgacgacgccaaagtcattctcattgattgaatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacataaatca 2447987  T
Q  637 aataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||    
T  2447986 aataaacaccgcactaagacgggatataaaaaacacacc 2447948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 31932713 - 31932559
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  31932713 aaaaaaaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgacacaatacaaattcaaaatcgttaaaaacaaaaagtatgaatatgcgaacaaactc 31932614  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||||||||    
T  31932613 ataacatccatgttaatagcataaaacaatagagtacatatgcctacaaatatga 31932559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 46728589 - 46728801
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46728589 aaaataaatgatattaattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 46728682  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||          ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||  |    
T  46728683 acagcatccatgttaataatataaaacggcaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtctctggaatacccatgtctccgaa 46728773  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||    
T  46728774 tttgcaacgttgacgacttcaaagtcat 46728801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 12716787 - 12717090
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||  |  | |||| || |  |||||||||| ||| ||||||    
T  12716787 aaaataaacgatattcatttattcaaattgataaattacatcgatacaatacatattcaaaggcactaaaaataagaatgatgaatctgcgaagaaactc 12716886  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| || ||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||         |||| | || ||| ||||| ||||||||   ||    
T  12716887 acaacatccatattaatagtataaaacaacaaagtatttatgcctacacatatgacta---------tattaaagtctctagaatattcatgtctttgga 12716977  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||   ||||| ||||||||||      | ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12716978 tctgcaacggctacgacgccaaagtcat------taatcagatctgcacttaatcaaagctaatccttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 12717071  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  12717072 ggaaaatcaaaaacacacc 12717090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3673920 - 3673782
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||       ||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3673920 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatgtaatataaattt------gttaaaaataaaaaggacgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgt 3673827  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  3673826 taatagcataaaacggcaaagtacacaagcctacaaatatgacta 3673782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5388945 - 5388807
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5388945 ttcattcatttaaattgatagagtacatcgctacaata------caaattcgttaaaaatataaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgc 5388852  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  5388851 taatagcataaaacggaaaagtacataagcctacaaatatgacta 5388807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 539 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 43278218 - 43278089
Alignment:
Q  539 aatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaa 638  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  43278218 aatactcgtgtctctggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcgttgtcatggatcggatatacacttgctcaaagttaatcttccaacctgaatcaaa 43278119  T
Q  639 taaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43278118 taaacaccgcactaagacggaaaatcaaaa 43278089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 43493141 - 43493253
Alignment:
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43493141 atctgcaaagttgacgactccaaagtcattgtcattgaccagatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacacagcactaaga 43493240  T
Q  656 cgggaaatcaaaa 668  Q
     ||||||||||||    
T  43493241 tgggaaatcaaaa 43493253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 415 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47466311 - 47466211
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  47466311 caaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacataaacctacaaatatgact 47466212  T
Q  515 a 515  Q
    |    
T  47466211 a 47466211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 358 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 56172279 - 56172128
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||| || |  ||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  56172279 aaaataaatgatattcatgtattcaaattgatagactacattgatacaatacaaatataaagtcatagaaaacaaaaaggttgaatctgcgaacaaactc 56172180  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaata 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  56172179 acaacatccatgttaataacataaaacgacaatgtacatatgcctacaaata 56172128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 23002602 - 23002752
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  23002602 aaaataaaatatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgct-aaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 23002694  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23002695 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 23002752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37431622 - 37431465
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | | |||| ||||  ||||||||||||||| || ||    
T  37431622 aaaataaacgatattctttcttttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaattcaaaattgctaaaaataaaactgatgaatctgtgaacgaattc 37431523  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  37431522 acaacatccatgttaataacgtaaaacaacaaaatacacatgcctacaaatatgacta 37431465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 50981396 - 50981534
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      |||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  50981396 ttcattcattcaaattgatatagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaacaaaaagtatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgt 50981489  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  50981490 taatatcataaaacaacaaagtacataagcctacaaatatgacta 50981534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15182901 - 15182775
Alignment:
Q  381 caaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15182901 caaattgatagagtacatcaatataatataa-ttcaaagtcgctaaaaataaaatggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctatattaatagcata 15182803  T
Q  481 aaacggcaaagtacttatgcctacaaat 508  Q
     |||| || ||||| |||||||||||||    
T  15182802 caacgacatagtacatatgcctacaaat 15182775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9662298 - 9662147
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9662298 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacagactc 9662205  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||    
T  9662204 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgtctacacatatgacta 9662147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 501
Target Start/End: Original strand, 30416296 - 30416434
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaac-aaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  30416296 aaaataaatgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacgaaaaaggatgaatctgtgaacaaact 30416389  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcc 501  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30416390 cacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtactaatgcc 30416434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 41487019 - 41486869
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||   || |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  41487019 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcga---aata---atgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 41486926  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  41486925 acaacatccatgttaatagcat-aaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgacta 41486869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 29589030 - 29589242
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||      ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29589030 aaaataaataatattcattcattcaaattgatggagtacattgatgcaatgaaaattc------gttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaattc 29589123  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | || ||||          ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||    
T  29589124 acatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtactaaagcataca---------catatgactatatttaagtctccagaatactcatgtctccgga 29589214  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29589215 tctgcaacgttgaagactccaaagtcat 29589242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 426 - 584
Target Start/End: Original strand, 1657297 - 1657447
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactat 525  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||          ||||||||||    
T  1657297 aaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcaactatgttaatagcataaaacggcaaaatactgaatcctaca---------catatgactat 1657387  T
Q  526 atttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1657388 atttaagtctctggaatacccatgtctccggatctgcaacgttgacgactccaaagtcat 1657447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 675
Target Start/End: Original strand, 29268647 - 29268750
Alignment:
Q  572 acaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagca 671  Q
    |||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  29268647 acaccaaattcattgtcattggttggatctgcacttcctcaaagtcaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaatcaaaaaca 29268746  T
Q  672 cacc 675  Q
    ||||    
T  29268747 cacc 29268750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4634728 - 4634577
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  4634728 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata------taatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacatgctc 4634635  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||    
T  4634634 acatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaattgcctacacatatgacta 4634577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 46716563 - 46716714
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||      | | |||| |||| |||| ||||||||||||  |||    
T  46716563 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatatagtacatcgatataatgtaaattc------gctaaaaataaaaaggataaatctgtgaacaggctc 46716656  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  46716657 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgacta 46716714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 53904024 - 53903873
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  53904024 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 53903931  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  53903930 acagcatccatgttaatagaataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgacta 53903873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 449 - 675
Target Start/End: Original strand, 22049165 - 22049377
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatg 548  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||  ||| ||||       |  ||  |||||||||||||||    
T  22049165 aacaaactcacaacatccatgttaataacataaaacagaaaagtatttatgcctacaaatacaact-atat-------tcaattatctggaatactcatg 22049256  T
Q  549 tctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgc 648  Q
    ||| | |||||| ||||||| |||| |||||      ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  22049257 tcttctgatctgtaacgttggcgactccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgcttaaagttaatcttcaatcctaaataaaataaacaccgc 22049350  T
Q  649 actaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||| |||| ||||| |||| ||||||    
T  22049351 actaagacgtgaaataaaaaacacacc 22049377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 41837780 - 41837663
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||||||    
T  41837780 aaaataaacgataattattcattcaaattgatagagtacatcaatacactacaaattcaaagtcgttaaaaacaaagagaatgaatctccgaacaaactc 41837681  T
Q  458 acaacatctatgttaata 475  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  41837680 acagcatctatgttaata 41837663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 38435043 - 38434832
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||       |   |||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  38435043 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgaaaattt------gccaaaaataaaaaggatgaatctgtaaacaaactc 38434950  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||          ||||||||||||||| || || ||||||| |||||| || ||    
T  38434949 acatcatccatgttaatagcataaaatgacaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtctccggaatacccatgtc-ccgga 38434860  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38434859 tctgcaacgttgacgactccaaagtcat 38434832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42972484 - 42972332
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttca-ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |  ||    
T  42972484 aaaataaatgatattcaattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaagaggct 42972391  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  42972390 cacaatatccatgttaatagcacaaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgacta 42972332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 14542181 - 14542332
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||      | | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  14542181 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatataatgtaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctc 14542274  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    | | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  14542275 atatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaattgcctacatatatgacta 14542332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 23067517 - 23067668
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  23067517 aaaataaattatattcattcattcaaattgacagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaggctc 23067610  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||    
T  23067611 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaaggcctacacatatgacta 23067668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 31994484 - 31994325
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagt---acatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatga--atctgtgaaca 452  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||   |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||  || ||  || |    
T  31994484 aaaataaacgatattcactcattcaaattgataaagttatacatcgactcaatacaaattcaaaatcgttcaaaacagaaaggatgatcatatgctaata 31994385  T
Q  453 aactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    || |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31994384 aaatcacaatatcaatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcgtacaaatatga 31994325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 37869087 - 37869237
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||      || ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  37869087 aaaataaaatatattcatttattcaaattgatagagtacatctatataatgcaaattca------ttaaaaacaaaa-ggatgaatatgtgaacaggctc 37869179  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  37869180 acaacatccatgttaataacataaaacgacaaagtacaaatgcctacacatatgacta 37869237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 360 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39797418 - 39797270
Alignment:
Q  360 aataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcac 459  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||   ||||  | ||| || ||||||||||||    
T  39797418 aataaacgatattcattcatttaaattgatagagtatatgtatacaatataaattcaaactcattaaaaa---aatgt-taaatttgagaacaaactcac 39797323  T
Q  460 aacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  39797322 aacattcatgttaatatcataaaacggcaaaatatctatgcctacaaatatga 39797270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 33020609 - 33020747
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||        | ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  33020609 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgaagtaatataaattccc------taaaaacaaaaaggatgaatctgttaacaaattcacgacatccatgt 33020702  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  33020703 taatagcataaaatgacaaagtacataagcctacaaatatgacta 33020747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 51646480 - 51646391
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  51646480 aaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtattaaagcctacacatatgacta 51646391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24789625 - 24789486
Alignment:
Q  375 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaat--ataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| || || |||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||    
T  24789625 ttcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaaaattcaaaatcattaaaaacaaaaatgatgaatctatgaacaaactgccaacattcatgtta 24789526  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||  |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  24789525 atagaataaaacgacaaaatacatatgcctacgaatatga 24789486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 512
Target Start/End: Original strand, 24818634 - 24818773
Alignment:
Q  375 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaat--ataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| || || |||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||    
T  24818634 ttcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaaaattcaaaatcattaaaaacaaaaatgatgaatctatgaacaaactgccaacattcatgtta 24818733  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||  |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  24818734 atagaataaaacgacaaaatacatatgcctacgaatatga 24818773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Original strand, 40198212 - 40198511
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||     ||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||  ||||||||||    
T  40198212 aaaataaatgatattctttcattcaaaatgatagagtacatcaatacaa-----attcaaagtcgttaaaaacaaaaatgatgagtctacgaacaaactc 40198306  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatg---actaatatgactatatttatgttct-ggaatactcatgtctcc 553  Q
    |||||||   |||||||||||||||||     ||| | ||||||    | ||||   || |||||||||||||| | ||| |   ||||||||| |||||    
T  40198307 acaacattcctgttaataacataaaacataggagtgcatatgcc----attatgcctacaaatatgactatattcaagttttcataatactcatatctcc 40198402  T
Q  554 agatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactag 653  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||      || ||||||||||  | || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  40198403 agatttgcaacgttgacgacctcaaa------gtgattgatcggacatacatttgttcaaagataatctttcaacctgaatcaaataaacaccacactaa 40198496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 3159230 - 3159152
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatca 665  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3159230 tcattgatcggatatgcacttgctcaaagctaacctttcaacctgattcaaataaacatcgcactaagacgggaaatca 3159152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 15729650 - 15729801
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||       | | | ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15729650 aaaaaaaatgatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattt------gctaacaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaactc 15729743  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  15729744 acagcatccatgttaatagcgtgaaacggcaaagtactaaagcctacacatatgacta 15729801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 44374944 - 44375095
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||  |||    
T  44374944 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgata------taatgcaaattcgttaaaaacaaaaatgatagatctgtgaacaggctc 44375037  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||    
T  44375038 acaacatccattttaatagcataaaatggcaaggtagaaatgcctacacatatgacta 44375095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 54420409 - 54420560
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  |||||||       | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  54420409 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaatagtacatcgatataatgcaaattcac------taaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 54420502  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  54420503 acaacatccatgttaatagcataaaacatcaaagtacaaatgcttacacatatgacta 54420560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 2945583 - 2945461
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  2945583 aaaataaatgatattaattcattcaaattgatagagtacatcgatacgatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactc 2945490  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacgg 486  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  2945489 acagcatccatgttaataacaaaaaacgg 2945461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 416 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 32189372 - 32189276
Alignment:
Q  416 aaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  32189372 aaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaggctcacaacatccatgttaatatcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatga 32189276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 426 - 584
Target Start/End: Original strand, 26576234 - 26576384
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactat 525  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||          ||||||||||    
T  26576234 aaaacaaaaaggatgaatttgtgaacaaattcacaacatccatgataataacataatacggtaaagtactaaagcctaca---------catatgactat 26576324  T
Q  526 atttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||  || || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26576325 atttgagtctccggaatactcatgtcttcggatctgcatcgttgacgactccaaagtcat 26576384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 7242455 - 7242606
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||| | |||||||||  |||||||||||||| |||||     
T  7242455 aaaataaatgatattcatttatttaaattgatagagtacatcgatacaatg------caaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaataaactt 7242548  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  | ||||||| || ||||||    
T  7242549 acaacatccatgttaatagtataaaacgacaaaatacaaaagcctacacatctgacta 7242606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 379 - 515
Target Start/End: Original strand, 34115338 - 34115476
Alignment:
Q  379 ttcaaattgatagagtacatcgatacaat-ata-aattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataa 476  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||  ||||||| | |||||||||  |||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||     
T  34115338 ttcaaatttatagagcacatcgatataatcatataatgtaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaataggctcagaacatccatgttaatag 34115437  T
Q  477 cataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  34115438 cataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 34115476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 40861363 - 40861252
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |    
T  40861363 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattc------gttaaaaacgaaaaggatgaatctatgaacaaactcgcatcatccatgttaatagc 40861270  T
Q  478 ataaaacggcaaagtact 495  Q
    |||||||| |||||||||    
T  40861269 ataaaacgacaaagtact 40861252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 4959243 - 4959373
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||       |||||| ||| ||||||||| | |||||  || ||||||||||    
T  4959243 aaaataaatgatattcattcattcatattgataaagtacatcgttacaatg------caaatttgttaaaaacaaaaagaatgaacatgcgaacaaactc 4959336  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4959337 acaacatcaatgttaatagcataaaactgcaaagtac 4959373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22121898 - 22121743
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaat-tcgttca---aaacaaaatggatgaatctgtgaacaa 453  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |   |||   |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  22121898 aaaataaacgatattcaatcatttaatttgatagagtacatcaatacaatacaaattcaaagctaagtcacaaaaacaaaaaggatgaatttgtgaataa 22121799  T
Q  454 actcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaata 509  Q
    | |||||||||  ||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||    
T  22121798 agtcacaacattcatgttaatagcataaaatcgtatagtacttatgcctacaaata 22121743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 46829822 - 46829705
Alignment:
Q  394 tacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagta 493  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || ||||    
T  46829822 tacatccatacaatgcaaattcaaaatcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgcaaacaaactcacaacattcatgttaataacataaaatgacatagta 46829723  T
Q  494 cttatgcctacaaatatg 511  Q
      ||||||||||||||||    
T  46829722 tatatgcctacaaatatg 46829705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16992293 - 16992168
Alignment:
Q  382 aaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataa 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||      | | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16992293 aaattgatagagtacatcgatacaatgaaaactc------gctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaacctcacaacatccatgttaatagcataa 16992200  T
Q  482 aacggcaaagtacttatgcctacaaatatgac 513  Q
    ||| |||||||| | | ||||||| |||||||    
T  16992199 aacagcaaagtattaaagcctacacatatgac 16992168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 515
Target Start/End: Original strand, 30469843 - 30469943
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  30469843 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctcagatcatccatgttaatagcataaaacggaaaagtacaaatgcctacacatatgact 30469942  T
Q  515 a 515  Q
    |    
T  30469943 a 30469943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 515
Target Start/End: Original strand, 52555460 - 52555560
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||   ||| ||||  ||||||||| ||||||||    
T  52555460 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactcacaacatccatgttaatagcataaaagtacaaggtacaaatgcctacacatatgact 52555559  T
Q  515 a 515  Q
    |    
T  52555560 a 52555560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 9474207 - 9474359
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | |||||||||  |||||| | ||||||||  ||    
T  9474207 aaaataaaagatattttttcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaaggatgagtatgtgaacaggct 9474300  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  9474301 cacaacatccacgttaatagcataaaatggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 9474359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20961893 - 20961745
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||||| |  || ||||| |||||||||| ||||||  |||    
T  20961893 aaaataaaatatattcatttattcaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgctataagcaaaaaggatgaatctatgaacaggctc 20961800  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  20961799 acaacatccatgttattagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatga 20961745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 512
Target Start/End: Original strand, 46775527 - 46775675
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||  | | |||||||      |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||    
T  46775527 aaaataaatcatattcattcattcaaattgataaggaatatcgata------aaatgcaaattcgctcaaaacaaaaaggctgaatatgcaaacaaactc 46775620  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  | ||||||| ||||||    
T  46775621 acaacatctatgttaatagcataaaacgacaaagcacaaaagcctacacatatga 46775675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 371 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 56062427 - 56062144
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||| ||| |  ||||||||| |||||||| || |    
T  56062427 ttcattcattaaaattgatatagtacattcatacaatacaaattcaaagtcgctaaaaacaaaaaggattaatatacgaacaaacttacaacatccatat 56062328  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttga 569  Q
    ||||| ||| ||||  ||  |||| |||| ||||||||         |||| |||||||| || | ||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  56062327 taatagcatgaaacaacatggtacctatgactacaaat---------atgattatatttaagtctatggaatactcatggctccaagtctgcaacgttga 56062237  T
Q  570 cgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||      ||||    ||||||| | ||||| |||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||    
T  56062236 cgac------gtcaaatacattgattgaatctgtacttgctcaaagataatatgtcaacttgaatcaaataaacattgcactaagacgagaaataaaaa 56062144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11817420 - 11817350
Alignment:
Q  445 tgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  11817420 tgtgaacaaactcacaacatctattttaatagaataaaacggcaaagtacataagcctacatatatgacta 11817350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 598 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 24789414 - 24789344
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  24789414 atctgcatttgatcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacgagaaatcaaaa 24789344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 598 - 668
Target Start/End: Original strand, 24818845 - 24818915
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  24818845 atctgcatttgatcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagacgagaaatcaaaa 24818915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 28990747 - 28990613
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||||||  || |||||| | |||||||||||| |||||| | ||| || | ||||| |||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  28990747 aaaataaacgatactcgttcatttagattgatagagtatatcgat-cgatacaa-tgcaaatccgttaaaaacaaaaacgataaatctgcgaacaaactc 28990650  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  28990649 acaacatccatgttaatagcataaaacaacaaagtac 28990613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 515
Target Start/End: Original strand, 4518603 - 4518734
Alignment:
Q  384 attgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    ||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||| | |||| |||   |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  4518603 attgataaaatacatcgataaaatgcaaattcaaattcgctaaaaagaaatatgatgtatctgcgaacaaactcacaacatatatgttaattacataaag 4518702  T
Q  484 cggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |  ||| |||| ||||| |||| |||||||||    
T  4518703 caacaatgtacatatgcatacatatatgacta 4518734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6408890 - 6408739
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||| |||||  |      | |||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  6408890 aaaataaatgatattcattcatttaaattgacaaagtacattgatataataaaaatttga------taaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 6408797  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| || |||||| |||||||| |||||||||  | ||||||| | |||||||    
T  6408796 acaacatccattttaatagcataaaacagcaaagtaccaaagcctacacagatgacta 6408739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47923706 - 47923555
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| ||||||||      | |||| |||| |||||||||| |||||||| ||    
T  47923706 aaaataaacagtgtttattcattcaaattgacgaagtatatcaatacaatacaaattcaa------taaaaataaaaaggatgaatctctgaacaaattc 47923613  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| |||  |||||||| ||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||    
T  47923612 acaaaatccttgttaatagcataaaatggtaaagtagataagcctacaaatatgacta 47923555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12755230 - 12755105
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||    |||| |||| |||| ||| || ||||||| ||    
T  12755230 aaaataaatgatattcaatcattcaaattgacatagtacatagatacaataaaaattcaaagtc-aaaaaaataaaaaggatcaatatgcgaacaaagtc 12755132  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaac 484  Q
    |||||||  || |||||||||||||||    
T  12755131 acaacattcatcttaataacataaaac 12755105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 472
Target Start/End: Original strand, 13169115 - 13169229
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |   | ||||||||| ||| ||| ||  |||||||| |    
T  13169115 aaaataaacgatattcaataattcaaattgataaagtacatcaatacaatataaatttaaagtttgtaaaaacaaaaaggaagaaactacgaacaaaccc 13169214  T
Q  458 acaacatctatgtta 472  Q
    |||| | ||||||||    
T  13169215 acaataactatgtta 13169229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 515
Target Start/End: Original strand, 35658249 - 35658351
Alignment:
Q  413 ttcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||||||| | |||| ||||  ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||| || |  |||||||||||    
T  35658249 ttcaaattcgctaaaaataaaaatgatgaatttatgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacaacaaagtacataagtttacaaatatga 35658348  T
Q  513 cta 515  Q
    |||    
T  35658349 cta 35658351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 56250616 - 56250458
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaa-ttgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| || | | | | |||||||   || |||  |||||||||||    
T  56250616 aaaataaacaatattcatttatttaaaattgataaagtacatcgatataatacaaattcgaaattgctaacaacaaaaataataaattagtgaacaaact 56250517  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
     |||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  56250516 tacataatccatgttaataacataaaacgacaaaatatctatgcatacaaatatgacta 56250458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 515
Target Start/End: Original strand, 10715981 - 10716114
Alignment:
Q  375 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaat 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||      |||||||||| |||||||||  ||||||| |  ||||||||||| |||||  ||||| ||    
T  10715981 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaata------caaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatttccgaacaaactcataacattcatgttcat 10716074  T
Q  475 aacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| ||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  10716075 aacctaaaatggtaaa-tacataagcctacaaatatgacta 10716114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 515
Target Start/End: Original strand, 10929751 - 10929884
Alignment:
Q  375 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaat 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||      |||||||||| |||||||||  ||||||| |  ||||||||||| |||||  ||||| ||    
T  10929751 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaata------caaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatttccgaacaaactcataacattcatgttcat 10929844  T
Q  475 aacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| ||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  10929845 aacctaaaatggtaaa-tacataagcctacaaatatgacta 10929884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 601 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 22121668 - 22121596
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcaca 673  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||| | |||||||| ||||    
T  22121668 tgcacttgctcaaagctaatatttcaacttgaatcaaataaacaccacattaagacgtgtaatcaaaaacaca 22121596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23964115 - 23964059
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||    
T  23964115 aaaataaacgatattcattcattcaaattgagataatacattgatacaatataaatt 23964059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 44947656 - 44947604
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  44947656 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacatataacggca 44947604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 485
Target Start/End: Original strand, 3171295 - 3171405
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |  || |||| ||||  ||||||  |  |||||||||||||||||  |||||||    
T  3171295 attcattcaaattgatatagtacgttgatacaatacaaattcaaagtacttaaaaataaaaatgatgaa-ataagaacaaactcacaacatacatgttaa 3171393  T
Q  474 taacataaaacg 485  Q
    || |||||||||    
T  3171394 tagcataaaacg 3171405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 437 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12265705 - 12265654
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  12265705 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatcaaagttaatagcatataacggca 12265654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12520064 - 12519972
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||      ||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  12520064 aaaataaatgatattcatttattcaaatttatagagtacatcgatac------aatgcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaact 12519972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 537 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 29257505 - 29257458
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29257505 ggaatacacatgtctccgtatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 29257458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 42914833 - 42914726
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaac-aaact 456  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||||   ||||||||  |||| |||||    
T  42914833 aaaataaacgatatttattctttcaaattgatagaatacatcggtataatataaactcaaagtcattaaaaataaaaataatgaatctacgaacaaaact 42914734  T
Q  457 cacaacat 464  Q
    ||||||||    
T  42914733 cacaacat 42914726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 515
Target Start/End: Original strand, 4622445 - 4622523
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| | |||||||    
T  4622445 gatgaatttgcgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacgaacgcctacacacatgacta 4622523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 484
Target Start/End: Original strand, 6789596 - 6789666
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaaca-aaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaac 484  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6789596 caaattcgctaaaaacataaaaggatgaatctgcgaataaactcacaacatccatgttaatagcataaaac 6789666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Original strand, 11299875 - 11299929
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||    
T  11299875 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacataaaacgccaaa 11299929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 515
Target Start/End: Original strand, 22066745 - 22066876
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||       | |||||||||  ||| ||| || ||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  22066745 attcaaattgttagagtacgtcgatacaatacaaattcac------taaaaacaaaaatgataaatttgcgaacaaactcataacattcatgttcataac 22066838  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
     ||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  22066839 ctaaaatggtaaaatacataagcctacaaatatgacta 22066876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 515
Target Start/End: Original strand, 10680692 - 10680826
Alignment:
Q  375 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaat 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||      |||||||| | |||||||||  ||||||| |  ||||||||||| |||||  || || ||    
T  10680692 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttccgaacaaactcataacattcatattcat 10680785  T
Q  475 aacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| ||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  10680786 aacctaaaatggtaaaatacataagcctacaaatatgacta 10680826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 515
Target Start/End: Original strand, 10894332 - 10894466
Alignment:
Q  375 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaat 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||      |||||||| | |||||||||  ||||||| |  ||||||||||| |||||  || || ||    
T  10894332 ttcattcaaattgttagagtacgccgatacaata------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttccgaacaaactcataacattcatattcat 10894425  T
Q  475 aacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| ||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  10894426 aacctaaaatggtaaaatacataagcctacaaatatgacta 10894466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17220213 - 17220079
Alignment:
Q  375 ttcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaat 474  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||      |||||||||| ||||  |||  ||||||| |  ||| ||||||| |||||  ||||| ||    
T  17220213 ttcattcaaattgttagagtacgtcgataccata------caaattcgttaaaaattaaaatgatgaatttccgaataaactcataacattcatgttcat 17220120  T
Q  475 aacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  17220119 aacataaaatggtaaaatacataagcctacaaatatgacta 17220079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 538 - 579
Target Start/End: Original strand, 29266721 - 29266762
Alignment:
Q  538 gaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaa 579  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29266721 gaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaa 29266762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Original strand, 38545822 - 38545879
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc 415  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  38545822 aaaataagtgatattcattcattcaaattgatatagtacattgatacagtataaattc 38545879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 399
Target Start/End: Original strand, 48257428 - 48257469
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48257428 aaaataaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 48257469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 56335890 - 56335768
Alignment:
Q  361 ataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaca 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||  |  | |||| ||||  || | |||||  |||||| |||||    
T  56335890 ataaacgatattcattcattcaaattgatagggt--atcaatacaatacaaattcaaagccactaaaaataaaaatgacggatctgcaaacaaaatcaca 56335793  T
Q  461 acatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||    
T  56335792 acatccatgttaattgcataaaacg 56335768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 1532001 - 1531953
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  1532001 atctttcaacatgaatcaaataaacaccgcacgaagacaggaaatcaaa 1531953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25274127 - 25274083
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25274127 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcata 25274083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 490
Target Start/End: Original strand, 36204234 - 36204298
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||    
T  36204234 aaaacataaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacatccaaattaataacatataatggcaaa 36204298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 41837611 - 41837510
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatca 636  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||       |||||||| | || | |||||||| || |||||  ||| |||||||||||    
T  41837611 ggaatactcatgtctctagatctacaacgttgacgacgccaaa------atcattgattgaatatccacttgctaaaagctaacattttaacctgaatca 41837518  T
Q  637 aataaaca 644  Q
    ||||||||    
T  41837517 aataaaca 41837510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 47417906 - 47417854
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||    
T  47417906 ggatgaatctgtgaacaaactcacagcattcaagttaataacatataacggca 47417854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 467 - 515
Target Start/End: Original strand, 50002948 - 50002996
Alignment:
Q  467 atgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  50002948 atgttaataacataaaacggcaaagtgcaaatgcctacaactatgacta 50002996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 50274379 - 50274435
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50274379 aaaataaacgatatttattcatttaaattaataaagtacattgatacaatataaatt 50274435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 53375062 - 53375010
Alignment:
Q  106 cacttgttaaggaaatataaaagaaaatattctc-tgaaaattgtgtattcta 157  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  53375062 cacttgttaagggaatataaaaggaaatattctcttggaaattgtgtattcta 53375010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 584
Target Start/End: Original strand, 4959408 - 4959455
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4959408 ggaatacccatgtctccggatctgcaacgctgacgacgccaaagtcat 4959455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 22301094 - 22301031
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatg 499  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||| ||||    
T  22301094 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatatagcggcaaaatacctatg 22301031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 512
Target Start/End: Original strand, 24398575 - 24398645
Alignment:
Q  441 aatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||    
T  24398575 aatctgcgaacaaactcacaatattcatgtta-taacataaaacgacaaaatacataagcctacaaatatga 24398645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 488
Target Start/End: Original strand, 27593675 - 27593726
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  27593675 gatgaatctatgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 27593726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 36194949 - 36194898
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  36194949 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaa 36194898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 584
Target Start/End: Original strand, 47704180 - 47704227
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47704180 ggaatactcatatctctggatctgcaacgttgacaacaccaaagtcat 47704227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 56172050 - 56171999
Alignment:
Q  617 taatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  56172050 taatctttcaaccttaattaaataaacaccgcactaagatggaaaatcaaaa 56171999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 1532162 - 1532100
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  1532162 aaaacataaaggatgaatctgcgaacaagctcacaacatccaagttaatagcatataacggca 1532100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 416
Target Start/End: Original strand, 1645293 - 1645331
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1645293 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgcaaattca 1645331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 402 - 512
Target Start/End: Original strand, 9255011 - 9255120
Alignment:
Q  402 tacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcc 501  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||  ||||||||    ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||    
T  9255011 tacaatacaaatttaaagttgttaaaaacaaaaatgatgaatcctcaaaccaactcacaatatc-atgttaatagcataaaacaacatagtacatatgcc 9255109  T
Q  502 tacaaatatga 512  Q
    |||||||||||    
T  9255110 tacaaatatga 9255120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 598 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12754388 - 12754318
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||    
T  12754388 atctgcacttggtcaaagttaatgtttcaacttgaatcaaataaacaccacattaagacgggtaataaaaa 12754318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 19885635 - 19885786
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||       | | ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  19885635 aaaataaattatattcatttattcaaattgatacagtatatcaatacaatttaaattt------gctaaaaacaaaaagaatgaatctgcgaacaaactc 19885728  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| || | ||||||||| ||| || || ||||||||  | ||||||  |||||||||    
T  19885729 acagcagccatgttaatatcatgaagcgacaaagtacaaaagcctactcatatgacta 19885786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 29576790 - 29576941
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||      ||| |||||| | | | |||||||  |||||||||   |||||||||    
T  29576790 aaaataaatgatattcattcattcaaattgataaagtatatcaatac------aatgcaaatttgctaataacaaaaatgatgaatctacaaacaaactc 29576883  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||  | || |||  |||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||    
T  29576884 acaacatccctctttatagtataaaacggcaaggtacaaaagcctacacatatgacta 29576941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 36161952 - 36161906
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  36161952 tgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaataacatataacg 36161906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 43853762 - 43853716
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaata 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43853762 aaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatcagatacaata 43853716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 371 - 416
Target Start/End: Original strand, 45032732 - 45032778
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaa-ttgatagagtacatcgatacaatataaattca 416  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45032732 ttcattcgttcaaagtttatagagtacatcgatacaatataaattca 45032778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 51958793 - 51958678
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||  || |||| |  ||||||| ||    
T  51958793 aaaataaattatattcatttatttaaattgataaaataaatcgatacaata--aattcaaactcgttaaaaacaaaaatgaagaatttacgaacaaattc 51958696  T
Q  458 acaacatctatgttaata 475  Q
    |||||||| | |||||||    
T  51958695 acaacatccacgttaata 51958678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2624590 - 2624541
Alignment:
Q  618 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  2624590 aatctttcaatatgaatcaaataaacaccgcaacaagacgggaaatcaaa 2624541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3169802 - 3169773
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaat 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3169802 attcaaattgatagagtacatcgatacaat 3169773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9549806 - 9549733
Alignment:
Q  442 atctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||  ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||    
T  9549806 atctgtgaactgactcaaagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgtctatacatatgacta 9549733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9549877 - 9549832
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgata 403  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9549877 aaaataaatgatattcattcattcaaattaatatagtacatcgata 9549832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18936106 - 18936065
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18936106 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagaatacatc 18936065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 584
Target Start/End: Original strand, 29576933 - 29577002
Alignment:
Q  516 atatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||| | || || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29576933 atatgactatattcaagtctccggaatattcatgtcttcggatctgcaacgttgacgacgccaaaatcat 29577002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 29965729 - 29965680
Alignment:
Q  618 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  29965729 aatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaa 29965680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 51318229 - 51318180
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||    
T  51318229 ggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacg 51318180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 644
Target Start/End: Original strand, 54549023 - 54549080
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaaca 644  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  54549023 tcattgatgggatctacacttgctcaaagtttatcttccaacccgaatcaaataaaca 54549080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 4142565 - 4142601
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4142565 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 4142601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 4643951 - 4643903
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  4643951 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaa 4643903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 4644102 - 4644050
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  4644102 ggatgaatctgcgaacaagctcacaacatccaagttaatagcatataacggca 4644050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 6973054 - 6973002
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  6973054 ggatgaatctgtgaacaaactcatagcatccaagttaatagcatataacggca 6973002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Original strand, 7273606 - 7273638
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagta 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7273606 aaacgatattcattcattcaaattgatagagta 7273638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9284004 - 9283956
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  9284004 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 9283956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 9645369 - 9645421
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  9645369 ggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggca 9645421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 399
Target Start/End: Original strand, 10258710 - 10258738
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10258710 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 10258738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10496644 - 10496612
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagta 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10496644 aaacgatattcattcattcaaattgatagagta 10496612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 645
Target Start/End: Original strand, 13169340 - 13169384
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacac 645  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13169340 tgcacttgatcaaaactaatctttcaatctgaatcaaataaacac 13169384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 19853313 - 19853349
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19853313 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 19853349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 21686043 - 21686079
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21686043 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 21686079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 616 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 22621638 - 22621610
Alignment:
Q  616 ctaatctttcaacctgaatcaaataaaca 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22621638 ctaatctttcaacctgaatcaaataaaca 22621610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 25273976 - 25273928
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  25273976 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 25273928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 26633472 - 26633508
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26633472 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 26633508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 29966570 - 29966526
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  29966570 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 29966526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 418
Target Start/End: Original strand, 31444758 - 31444802
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaa 418  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  31444758 attcattcaaattgatatagtgcatcaatacaatacaaattcaaa 31444802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32872597 - 32872538
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaa 418  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  32872597 aaaatgaacgatattctttcat-caaattgatagactaaatcgatataatataaattcaaa 32872538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 34024283 - 34024327
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  34024283 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 34024327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 35338741 - 35338685
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    ||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35338741 aaaataaattatattcatttatttaaattgatagagtacattgatacaatgtaaatt 35338685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 42032319 - 42032355
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42032319 aaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 42032355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 43095941 - 43095909
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagta 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43095941 aaacgatattcattcattcaaattgatagagta 43095909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 43154010 - 43154058
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  43154010 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 43154058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 45227886 - 45227930
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45227886 ggatgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaataacata 45227930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 47417755 - 47417707
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  47417755 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 47417707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 49067068 - 49067003
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagta 493  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  49067068 aaaataaaaaggatgaatctg--aacaagctcacaccatctatattaataacataaaacaacaaagta 49067003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 49410316 - 49410268
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  49410316 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 49410268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 49410467 - 49410415
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||    
T  49410467 ggatgaatcagcgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggca 49410415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 50766508 - 50766556
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  50766508 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 50766556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 53616495 - 53616547
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  53616495 ggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggca 53616547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 53616646 - 53616694
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  53616646 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 53616694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 56040447 - 56040483
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56040447 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 56040483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 362 - 668
Target Start/End: Original strand, 3726 - 4033
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3726 taaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcggtaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaa 3825  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatg-ttctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3826 catccatgttaatagcataaaacggcaaagtatatatgcctacaaatatgactaatatgattatattcaagtttctaaaatactcatgtctccagatctg 3925  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3926 caacgttgacgatgccaaagtcattttcattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatatttcaacctgaattaaataaacaccgcactaagacggga 4025  T
Q  661 aatcaaaa 668  Q
    ||||||||    
T  4026 aatcaaaa 4033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 382 - 467
Target Start/End: Original strand, 5877 - 5962
Alignment:
Q  382 aaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcta 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5877 aaattgatagaatacatcgatacaatataaattcaaattcgctaaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatcta 5962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0536 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0536
Description:

Target: scaffold0536; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3361 - 3056
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3361 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactc 3262  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| ||    
T  3261 acatcatccatgttaatagcataaaacggcaaagt-----tgcctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctctgaagtactcatgtctccgga 3167  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  3166 tttgcaacgttgacgacaccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaaaac 3067  T
Q  657 gggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||||    
T  3066 gggaaatcaaa 3056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 158)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 358 - 657
Target Start/End: Original strand, 14600361 - 14600661
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14600361 aaaataaacgatatttattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactc 14600460  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| |||||||  ||    
T  14600461 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatacttatgtctctgga 14600560  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14600561 tctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 14600660  T
Q  657 g 657  Q
    |    
T  14600661 g 14600661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 24790833 - 24791149
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  24790833 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaaaaaa--ggatgaatctgtgaacaaactc 24790930  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||    
T  24790931 acaacatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatatatccggaatactcatgtctctgga 24791030  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||    
T  24791031 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgattcaaataaacaccaaactaagac 24791130  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  24791131 gggaaattaaaaacacacc 24791149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 2234133 - 2234451
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  2234133 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgattatgtgaataaactc 2234232  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||    
T  2234233 acatcatccatattaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctaaaaatatgactaatatgactatattcatgtctttggaatactcatgcctccgga 2234332  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2234333 tctgcaacgttgacgacatcaaattcattgttattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatatttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 2234432  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  2234433 ggaaaatcaaaaacacacc 2234451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 362 - 673
Target Start/End: Original strand, 7579522 - 7579834
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7579522 taaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatccaaatttgctagaaacaaaaaggatgaaactgtgaacaaactcacaa 7579621  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||  ||||||    
T  7579622 catccatgttaatagcataaaacgtcaaagcatttatgtctacaaatatgagtaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctctggatctg 7579721  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7579722 caacgttggcgacgccaaagtcattgtcattaatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggga 7579821  T
Q  661 aatcaaaagcaca 673  Q
    ||| |||| ||||    
T  7579822 aataaaaaacaca 7579834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 373 - 673
Target Start/End: Original strand, 31407429 - 31407727
Alignment:
Q  373 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  31407429 cattcattcaaattgatatagtacattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaag-atgaatctgtgaacaaactcacatcat--atgtta 31407525  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacg 571  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  31407526 atagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctccggaatactcatgactccggatctgcaatgttgacg 31407625  T
Q  572 acaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagca 671  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  31407626 aagccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacaggaaatcaaaaaca 31407725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 362 - 658
Target Start/End: Original strand, 2024891 - 2025188
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2024891 taaacaatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaa 2024990  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||    
T  2024991 catccatgttaatagcataaaacggcaaagtatctatgtctacaaatatgactaatatgactatatttaagtctccggaataatcatgtctccggatctg 2025090  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgg 658  Q
    ||||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2025091 caacgttgacgatgccagaatcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaatctgaatcaaataaacaccgcactaagacgg 2025188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 358 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 37613102 - 37612800
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37613102 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatacaaattcaaattcgttaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 37613003  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||| ||| |||    
T  37613002 acatcatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtatccggat 37612919  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37612918 ctgcaacgttgaagacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcaattgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagacg 37612819  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacca 676  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  37612818 ggaaatcaaaaacacacca 37612800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 362 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 4757610 - 4757313
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4757610 taaacgatattcattcattcaaattgatagagtacattgatacaatacaaatctaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaa 4757511  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagatctgc 561  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||                ||| |||||| |||||||    
T  4757510 catccatgttaataacataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcaagtctccggatctgc 4757427  T
Q  562 aacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaa 661  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4757426 aacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcactaagacgggaa 4757327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Original strand, 30026545 - 30026855
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30026545 aaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtatattgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 30026644  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||  ||| ||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||| ||    
T  30026645 acagtatccatgttaatagcataaaacaacaaagtatatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatattcatgtctccgga 30026744  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30026745 tctgcaacgttgaagatgccaaagtcattgtcattgatcagacctgcacttgctcaaagctaatctttcaacatgaatcaaataaacaccgcactaagac 30026844  T
Q  657 gggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||||    
T  30026845 gggaaatcaaa 30026855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 41362199 - 41361880
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | || | |||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  41362199 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatacaatacaaattcatttacgctaaaaaaaaaagaggatgaatctatgaacaaact 41362100  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccag 555  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||  |||| ||||||||||  |    
T  41362099 cacaacatccatgttaatagcataaaacggcagggtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaactctccagaatcctcatgtctctgg 41362000  T
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  41361999 atctgcgacgttgacgacaccaaagtcattgacattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaaa 41361900  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  41361899 cgggaaataaaaaacacacc 41361880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 43936843 - 43937158
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43936843 aaaataaacgatatttattcattcgaattgatagagtagatcgatacaatacaaattcaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 43936942  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || || ||||| ||||||||| | ||    
T  43936943 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacctatgcctataaatatgactagtatgattgtatttaagtctccggaatcctcatgtcttcgga 43937042  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    | ||||   |||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43937043 tatgca---ttgacgacgctaaaatcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 43937139  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  43937140 gggaaatcaaaaacacacc 43937158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 358 - 673
Target Start/End: Original strand, 39067353 - 39067668
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39067353 aaaataaacgatattcattcttttaaattgatagagtatatcgatactatacaaatttaaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaaactc 39067452  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||| |||||||||  ||    
T  39067453 agagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacatatgcctacaaatatgactaatacaactatattcatgtctccggaata-tcatgtctctgga 39067551  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  39067552 tctgcaacgttggcgacgccaaagtcattgtcatcgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacatgaatctaataaacaccgcactaagac 39067651  T
Q  657 gggaaatcaaaagcaca 673  Q
    || |||| |||| ||||    
T  39067652 ggaaaataaaaaacaca 39067668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 28296778 - 28297088
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28296778 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggttgaatctgtgaacaaactc 28296877  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagta-cttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccag 555  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||||||| ||| |    
T  28296878 acagcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtaccttatgcttacaaatatgaataatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtgtccgg 28296977  T
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||||||||||         |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28296978 atctgcaacgt---------caaagtcattttcattgatcggatctgcagttgctcaaatctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaaga 28297068  T
Q  656 cgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  28297069 tgggaaatcaaaaacacacc 28297088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 374 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 24210690 - 24210389
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24210690 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaataaaaattcaaatttgctaaaaacaaaaag-atgaatttgtgaacaaactcacagcatgtatgttaa 24210592  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacga 572  Q
    |||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24210591 taacttaaaacggaaaaatatttatacctacaaatatgactaatatgactatatttatgtctccggaatactcatgtctctggatctgcaacgttgacga 24210492  T
Q  573 caccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcac 672  Q
    | |||||||| | || | ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| |||| |||    
T  24210491 cgccaaagtctttgtgaatgatcggatctacacttgttcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaataccgcactaagaccagaaattaaaaacac 24210392  T
Q  673 acc 675  Q
    |||    
T  24210391 acc 24210389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 362 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 9502030 - 9501741
Alignment:
Q  362 taaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||    
T  9502030 taaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaagttcgctaaaaacaaaaagc-tgaatctgtaaacaaactcacaa 9501932  T
Q  462 catctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagatctgc 561  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||| ||| |||    
T  9501931 catccatgttaataacataaaacggcaaagtacttattcctacaaatatgactaatatgactatat----------------tcatgtctccggatttgc 9501848  T
Q  562 aacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaa 661  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9501847 aacgttgacgaaaccaaagtcgttgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacaaagacgggaa 9501748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 365 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 11162345 - 11162038
Alignment:
Q  365 acgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacat 464  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  11162345 acgatattcattcattcaaattgatggagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacgaaaaggatgaatatgggaacaaactcacaacat 11162246  T
Q  465 ctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatat---gactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctg 560  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| |||||| | || || ||||||||||| | ||| ||||||    
T  11162245 ccatgttaatagcataaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgacgactaatatgattatattcaagtctccggaatactcatatttccggatctg 11162146  T
Q  561 caacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacggga 660  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11162145 caacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcagatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactgcgacggga 11162046  T
Q  661 aatcaaaa 668  Q
    ||| ||||    
T  11162045 aataaaaa 11162038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 19720479 - 19720157
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgat----agagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaa 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||  |||||||||||| ||||    
T  19720479 aaaataaacgatattcattcattcaaattgattgatagagtacatcgatacaatacaaatcgaaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtggacaa 19720380  T
Q  454 actcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctc 552  Q
    ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||     
T  19720379 actcactgcatccatgttaatagcataaaacggcaaagtgcctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctt 19720280  T
Q  553 cagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  19720279 cggatctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgttattgatcggacctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataattaccgcatta 19720180  T
Q  653 ggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     |||| ||||| |||| ||||||    
T  19720179 agacgagaaataaaaaacacacc 19720157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 374 - 673
Target Start/End: Original strand, 10338510 - 10338801
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10338510 attcattcaaattaatagagtacatcaatgcaatagaaattcaaatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaa 10338609  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacga 572  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10338610 tagcataaaacggcaaagtacctatgcctacaaatatgacta---------tatttttgtctccggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacga 10338700  T
Q  573 caccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcac 672  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  10338701 cgccaaagtcattgttattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacttgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaataaaaaacac 10338800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 358 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 10148402 - 10148101
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10148402 aaaataaacaatattcattcattcaaattgatagattacatcgatacaatacaaatcctaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactc 10148303  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||| || || | ||||||||||||||| ||    
T  10148302 acatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacttatgcctacaaatatg---------actatatttaagtctccgaaatactcatgtctccgga 10148212  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  10148211 tctgcaacgttgacgacgctaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatttttcaacctgaatcaaataaacaccgtactaagat 10148112  T
Q  657 gggaaatcaaa 667  Q
    | |||||||||    
T  10148111 gagaaatcaaa 10148101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 31202914 - 31202606
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31202914 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaa-ggatgaatctgtgaacaaactc 31202816  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||         |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||    
T  31202815 acaacatccatgttaatagtataaaatggcaaagtacctatgcctaca---------aataggactatatttatgtctctggaatactcgtgtctctgga 31202725  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31202724 tctgcgacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcagatctgcacttgatcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacactgcactaagac 31202625  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  31202624 tggaaatcaaaaacacacc 31202606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 24700300 - 24699980
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24700300 aaaataaacgatat-cattcattcaaattcatagagtacatcgatacaattcaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctatgaacaaactc 24700202  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacgg---caaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctcc 553  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |   ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||| |||| || |||||||    
T  24700201 acaacatccatgttaatagcataaaacagtgccaacgtacatatgcctacaaatatgactaatataaatatattaaagtctctgaaatattcgtgtctcc 24700102  T
Q  554 agatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactag 653  Q
     |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24700101 ggatctgcaacgttgacgacgacaatgtcaatgtcattgatcggatctgcatttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaa 24700002  T
Q  654 gacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
     ||||||||| |||| ||||||    
T  24700001 cacgggaaataaaaaacacacc 24699980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 380 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 31308592 - 31308296
Alignment:
Q  380 tcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacat 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || |||    
T  31308592 tcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaagttcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcatagcatccatgttattagcat 31308493  T
Q  480 aaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaa 578  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||   |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31308492 aaaactgcaaagtatttatgcctacaaatatgactaacatgactatatttaagtctccaaaatattcatatctccggatctgcaacgttgacgacaccaa 31308393  T
Q  579 agtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  31308392 agtcgttgtcattgatcggatctgcacttgttcaaaactattctttcaacctgaattaaataaacatcgtactaaaacgggaaatcaaaaacacacc 31308296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 1809901 - 1810203
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1809901 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaata----------------caaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 1809984  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttct-ggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  1809985 acaacatccaagttaatagcataaagtggcaaagtacatatgcctacaaatatgactagtatgactatattcatgtccccggaatactcatgtctccgga 1810084  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  1810085 tctgcaacgttggcgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatttacacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacatcgcgctaagac 1810184  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  1810185 gggacatcaaaaacacacc 1810203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 22787949 - 22787640
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||       |||||| |||| |||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22787949 aaaataaacgatatttattcattcaaattgata-------tcgatataatacaaatccaagttcgctgaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 22787857  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||    
T  22787856 acagcatccatgttaatagcataaaacagcaaagtagatatgcctacaaatacgattaatatgattatatttatgtctccggaatacccatgtctccgga 22787757  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22787756 tctgcaatgttgacgacgccaaagtcattctcattgatcg--tctgcatttactcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 22787659  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  22787658 ggaaaatcaaaaacacacc 22787640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 381 - 668
Target Start/End: Original strand, 3204472 - 3204759
Alignment:
Q  381 caaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3204472 caaattgatatagtatatcgatacaatataaattcaaattcactaaaaacaaaaatgatgaatctttgaacaaactcacatcatccatgttaataacata 3204571  T
Q  481 aaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttct-ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaa 579  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||    
T  3204572 aaacggcaaagtaactatgcc-acaaatataactaacatgactatattcatgtcttcggaatactcatgtcttcggatctgcaacgttgaccacgccaaa 3204670  T
Q  580 gtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  3204671 gtcattgtgatttatcggatatgcacttgctcaaagttaatctttcaacttgaatcaaataaacactgcactaagacgagaaatcaaaa 3204759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 358 - 626
Target Start/End: Original strand, 23970851 - 23971115
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23970851 aaaataaacgatatacattcgttcaaattgatagagtacatcgatacaatac-----caaatccgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 23970945  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||   ||    
T  23970946 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaaaatgactaatatgactatattcaagtctccggaatactcatgtctttgga 23971045  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttca 626  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23971046 tttgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttca 23971115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 392 - 668
Target Start/End: Original strand, 37128193 - 37128461
Alignment:
Q  392 agtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaag 491  Q
    ||||||| |||||| || |||| ||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||    
T  37128193 agtacattgataca-tacaaatccaaattcattaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaaactcaca-------tgttaatagcataaaacggcaaag 37128284  T
Q  492 tacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcat 590  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||    
T  37128285 tacatatgcctacaaatatgactaatatgattatattcatgtctctgaaatactcatgtctccggatctgcaa-gttgacgacgccaaagtcattgttat 37128383  T
Q  591 tgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37128384 tgatcggatctgcacttgctcaaaactaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacggaaaatcaaaa 37128461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 412 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 12330039 - 12329775
Alignment:
Q  412 attcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatg 511  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  12330039 attcaaattcgctaaaaacaaaaaggaagaatctgggaacaaattcacagcatccgtgttaatagcataaaacgacaaagtatctacgcctacaaatatg 12329940  T
Q  512 actaatatgactatatttatgttctggaa-tactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgct 610  Q
    || |||||||||||||  ||||| | ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12329939 accaatatgactatatccatgttttcgaaatacccatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgct 12329840  T
Q  611 caaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||    
T  12329839 caaagctaatttttcaacctaaatcaaataaacaccgcattaagacgggaaataaaaaacacacc 12329775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 358 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 5526268 - 5526033
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  5526268 aaaataaacgatatttattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataagttcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 5526169  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  |||| ||||||||||| ||    
T  5526168 gcagcatctatgttaatagcataaaacgacaaggtacatatgtctacaaatatgactaatatgaatatattcaagtctccagaattctcatgtctccgga 5526069  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattg 592  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  5526068 tctgcaacgttgatgatgccaaagtcattgtcattg 5526033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 2968981 - 2968680
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| | | | |||||||||||||||||| |    
T  2968981 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacatattcaaagtcgttaaaaacgataagaatgaatctgtgaacaaacac 2968882  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagat 557  Q
    | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |  |||||| | | || ||||||| |||||||||||||    
T  2968881 atatcatccatcttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctaca---------aatacggttatattaaag-tccggaatacgcatgtctccagat 2968792  T
Q  558 ctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacg 657  Q
     ||||| | ||| |||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2968791 atgcaatgctgatgacaccaaa------gtcattgatcggatttgcacttgctcaaagcggatctttcaacctgaatcaaataaataccgcactaagacg 2968698  T
Q  658 ggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    | |||| |||| ||||||    
T  2968697 gaaaataaaaaacacacc 2968680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 360 - 662
Target Start/End: Original strand, 32778637 - 32778925
Alignment:
Q  360 aataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcac 459  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  32778637 aataaacaatattcatttattcaaattgatagagtacatcgatacaattcaaatccaaagtcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgcgaacaaactcac 32778736  T
Q  460 aacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatc 558  Q
    |||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||         |||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||||    
T  32778737 aacaaccatattaatagcataaaacggcaaagtacctatggctaca---------aatatgactatattcaagtctccagaatactcatgtctccagatc 32778827  T
Q  559 tgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgg 658  Q
    ||||| ||||||||| | |||      |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  32778828 tgcaaagttgacgacgcaaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcattaagatgg 32778921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 358 - 674
Target Start/End: Original strand, 13575872 - 13576174
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  13575872 aaaatagacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatacatatccaaagtcgctaaaaacaaaaaggatgaatttgcgaacaaactc 13575971  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||  ||||| || |         |||| ||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||    
T  13575972 acaacatccatgttaatagcataaaacaacaaagtatatatgcttaaa---------aatacgactatattcaagtctcaggaatactcatttctccgga 13576062  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||| |||| ||  |||||      ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  13576063 tctgcaacattgaagatgccaaa------gtcgttgatcggatctgcacttgctcaaagttaatctttcaatctgaatctaataaacaccgcactaagac 13576156  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacac 674  Q
    || |||| |||| |||||    
T  13576157 ggaaaataaaaaacacac 13576174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 13570430 - 13570585
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13570430 aaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtatatcgatacaatacaaatttaaatttgttaaaaacaaaaaagatgaatatgtgaacaaactc 13570529  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  13570530 acaacatccatgttaatagcataaaacggc--agtacctatgcctacaaacatgacta 13570585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 358 - 519
Target Start/End: Original strand, 15286695 - 15286857
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc-aaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||| | |||||||||  ||| ||||| ||||||||||    
T  15286695 aaaataaatgatattcattcatttaaattgatagagtacatttatacaatacaaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgataaatctatgaacaaact 15286794  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatat 519  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15286795 cacaacatctatgttaatcgcataaaacggcaaaatacctatgcctacaattatgactaatat 15286857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 358 - 519
Target Start/End: Original strand, 15467064 - 15467226
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattc-aaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||| | |||||||||  ||| ||||| ||||||||||    
T  15467064 aaaataaatgatattcattcatttaaattgatagagtacatttatacaatacaaaatccaaattcgctaaaaacaaaaatgataaatctatgaacaaact 15467163  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatat 519  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15467164 cacaacatctatgttaatcgcataaaacggcaaaatacctatgcctacaattatgactaatat 15467226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 400 - 639
Target Start/End: Original strand, 40490238 - 40490467
Alignment:
Q  400 gatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatg 499  Q
    |||||||||||||| |||||| | | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  40490238 gatacaatataaatccaaatttgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagtataaaacggcaaaatacctatg 40490337  T
Q  500 cctacaaatatgactaatatgactatatttatgttctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggat 599  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||                |||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  40490338 cctataaatatgactaatttgtctatat----------------tcatgtctccggatctgcaacattgacgacgctaaagtcattgtcattgatcggat 40490421  T
Q  600 ctgcacttgctcaaggc------taatctttcaacctgaatcaaat 639  Q
    ||  |||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||    
T  40490422 ctatacttgctcaaagctaataataatctttcaacctgaatcaaat 40490467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 3925360 - 3925571
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |       ||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3925360 aaaataaatgatattcattcattcaaatgggtagagtacatcgatacatga-------aaatttgctaaaaacaaaactgatgaatctgtgaacaaactc 3925452  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||          |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |    
T  3925453 acatcatccatgttaataacataaaacggcaaagtactaaagcctaca---------catatgattatatttaagtctccggaatactcatgtctccaaa 3925543  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3925544 tctgcaacgttgacgactccaaagtcat 3925571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 16937008 - 16937220
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||      | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16937008 aaaataaaagatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattc------gcttaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 16937101  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||          ||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| |||    
T  16937102 acatcatccatgttaatagcataaaacaacaaagtactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctctaga 16937192  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16937193 tctgcaacgttgacgactccaaagtcat 16937220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 358 - 505
Target Start/End: Original strand, 1215010 - 1215151
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      |||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  1215010 aaaacaaacgacgttcattcatttaaattgatagagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatttgtgaacaaactc 1215103  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctaca 505  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  1215104 acaacatcaatgttaataacataaaacgacaaagtacataagcctaca 1215151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Original strand, 12248380 - 12248592
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12248380 aaaataaatgatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 12248473  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||          ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||   |    
T  12248474 gcatcatccatgttaataacataaaacggcaaaatactaaagcctaca---------catatgactatatttaagtctctggaatacccatgtctctgaa 12248564  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12248565 tctgcaaagttgacgactccaaagtcat 12248592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 31712743 - 31712896
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||    |||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31712743 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatatacaatgaa----aattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactc 31712838  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  31712839 acagcatccatgttaataacataaaacggtcaagtactaaagcctacacatatgacta 31712896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 544 - 668
Target Start/End: Original strand, 13570589 - 13570715
Alignment:
Q  544 tcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaac 643  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13570589 tcatatctccggatctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtaattgatcagatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacttgaatcaaataaac 13570688  T
Q  644 accgcactagg--acgggaaatcaaaa 668  Q
    ||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  13570689 accacactaagacacgggaaatcaaaa 13570715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9993111 - 9992960
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  9993111 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaggctc 9993018  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  9993017 acaacatccgtgttaatagcataaaacagcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 9992960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 371 - 584
Target Start/End: Original strand, 16937954 - 16938158
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  16937954 ttcattcatttaaattgatagagtacatcgatacaatg------caaattcgctaaaaacaaaaagcatgaatctgcgaacaaactcacagaatccatgt 16938047  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttga 569  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||  | ||||||| ||||||||    |||||||||||| || |  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  16938048 taataccataaaacaacaaagtacaaaagcctacacatatgact----tgactatatttaagtcttcggaatacccatatctccggatctgcaacgttga 16938143  T
Q  570 cgacaccaaagtcat 584  Q
    |||||| ||||||||    
T  16938144 cgacacaaaagtcat 16938158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 14530598 - 14530736
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||      || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14530598 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacagattca------ttaaaaacaaaaatgatgaatctgtgagcaaactcacaacatccatgt 14530691  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  14530692 taatagcataaaacggcaaagtacacaagcctataaatatgacta 14530736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 18190533 - 18190671
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18190533 ttcattcattcaaattaatagagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaacaaaaagaatgaatctgtgaacaaactcacaacatccatat 18190626  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  18190627 taatagcataaaacgacaaagtacacaagcctacaaatatgacta 18190671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 537 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 10334456 - 10334331
Alignment:
Q  537 ggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatca 636  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||      |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  10334456 ggaatactcatgtctccggatctgcaacgttgacgatgccaaagtcat------tgatcggatctgcatttgctcaaagctaatatttcaatctgaatca 10334363  T
Q  637 aataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  10334362 aataaacaccgcactaagacgagagatcaaaa 10334331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 32104506 - 32104657
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  32104506 aaaataaattatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgttaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacaggctc 32104599  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||    
T  32104600 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcatacacatatgacta 32104657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 41996988 - 41996837
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||       |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41996988 aaaataaatgatattcattcatttaaattgatcgagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacagactc 41996895  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  41996894 acaacatccatgttaatagcataaaacgacaaggtacaaatgcctacacatatgacta 41996837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 27534094 - 27534232
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||       | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27534094 ttcatttatttaaattgaaagagtacatcgatgcaatacaaattcac------taaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacattcatgt 27534187  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27534188 taatagcataaaacggcaaagtacataagcctacaaatatgacta 27534232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 8054477 - 8054628
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||      |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||   |||    
T  8054477 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagaatacatcgatataata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacccgctc 8054570  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  8054571 acaacatccattttaatagcataaaacggcaaggtacaaatgcctacacatatgacta 8054628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 15665986 - 15665772
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||   ||||||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  15665986 aaaataaatgacattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatg------caaattcgccaaaaacaaaaaggacgaatctgcaaacaaactc 15665893  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |  | |||||| |||||||       ||||||||| | || || | ||||| ||||||||| ||    
T  15665892 acaacatccatgttaatagcataaaacggcatagtgcaaaagcctaccaatatga-------gactatattcaagtctccgaaatacccatgtctccgga 15665800  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15665799 tctgcaacgctgatgacaccaaagtcat 15665772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 16996558 - 16996709
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||  |||    
T  16996558 aaaataaaagatattcattcattcaaattgaaagagtacatcgatatgatg------caaattcgctaaaaacaaataggttgaatctgtgaacaggctc 16996651  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  16996652 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacatatatgacta 16996709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 458
Target Start/End: Original strand, 38545479 - 38545580
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaac-aaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  38545479 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtatatcgatacaatataaattcaacttcactaaaaacgaaaaaagatgaatctgtgaacaaact 38545578  T
Q  457 ca 458  Q
    ||    
T  38545579 ca 38545580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 378 - 584
Target Start/End: Original strand, 32256410 - 32256602
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  32256410 attcaaattgacagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatattaataac 32256503  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacacc 576  Q
    |||||||||||||||||| | |||         |||  ||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  32256504 ataaaacggcaaagtactaaagcc---------gacacatatgactatatttaagtctccggaatacccttgtctccggatctgcaacgttgatgactcc 32256594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5457516 - 5457365
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  5457516 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatataa------attcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgtgaacatgctc 5457423  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||| ||| ||||  ||| ||||| |||||||||    
T  5457422 acaacacccatgctaatagcataaaacgacaaggtacaaatggctacacatatgacta 5457365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44295761 - 44295610
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||  |||    
T  44295761 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatg------caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatatgtgaacaggctc 44295668  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  44295667 acatcatccatgttaataggataaaacggcaaagtacaattgcctacatatatgacta 44295610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 359 - 488
Target Start/End: Original strand, 26673446 - 26673575
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| | | | |||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  26673446 aaataaatgatatccattcatttaaattgatagagtatatcgatacgatacaaatttaaaatagctaaaaacaaaaaagatgaatctacgaacaaactca 26673545  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  26673546 catcatccatgttaataacataaaacggca 26673575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 512 - 675
Target Start/End: Original strand, 38545971 - 38546134
Alignment:
Q  512 actaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgct 610  Q
    ||||| ||||||||||| | || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||| |||| ||| |    
T  38545971 actaacatgactatattcaagtctccggaatacttatgtctccggatctgcaacgttgacgacgccaaatctatg-tcattgatcggatatgcatttggt 38546069  T
Q  611 caaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||   ||||||||| ||||||    
T  38546070 caaagttaatctttcaatctgaatcaaataaacatcgtactaagacaaaaaatcaaaaacacacc 38546134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Original strand, 18196831 - 18196966
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||||||| ||||||||| | || |||||| |||||||||| |||| |  |||||||    
T  18196831 attcattcaaattgatagagtatatcgatacaata------caaattcgttaaaaacaaaaggaatcaatctgcgaacaaactcccaacgttcatgttaa 18196924  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |  ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||    
T  18196925 tcgcataaaacggcaaagtacagaagactacaaatatgacta 18196966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 373 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18204408 - 18204266
Alignment:
Q  373 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||||| ||||||    
T  18204408 catttattcaaatttataaagtatatcgatacaatataaattcatggtcgctaaaaacaaaatagatgaatgtactaacaaacttacaacatcaatgtta 18204309  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||||  | ||||| | | ||||||||||||||||    
T  18204308 ataacataaaacgatatagtacatgtacctacaaatatgacta 18204266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 378 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4928359 - 4928222
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||| | |||||||      
T  4928359 attcaagttgatagagtacatcaatataatacaaattcaaagtcgttaaaaacaaaaaagatgaatctccgaacaaactcacgacatccaagttaatagt 4928260  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||  | || || |||||||| ||||||||||||    
T  4928259 ataaaacaacgaaatagttatgcctgcaaatatgacta 4928222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 10951960 - 10952116
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  10951960 aaaataaattatattcatttattcaaattgataaagtacatcaatataaaataaatt-aaagtcgttaaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaactc 10952058  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||| | || ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  10952059 acaacatccatgataatagcataaaatgacagagtatctatgcctataaatttgacta 10952116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 10959965 - 10960121
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  10959965 aaaataaattatattcatttattcaaattgataaagtacatcaatataaaataaatt-aaagtcgttaaaaacaaaaatgatgaatctgcaaacaaactc 10960063  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||| | || ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  10960064 acaacatccatgataatagcataaaatgacagagtatctatgcctataaatttgacta 10960121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 11298444 - 11298582
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |      |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  11298444 ttcatttattcaaattgatagagtacatcgatgcaatacaaattcactt------aaaataaaaaggatgaatatatgaacaaactcacaacatccatgt 11298537  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||||    
T  11298538 taatagcataaaacaacaaagtacataatactacaaatatgacta 11298582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 12243898 - 12244036
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||       | |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12243898 ttcattcgttcaaactgatagagtacatcgatataatgcaaattcac------taaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccatgt 12243991  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||    
T  12243992 taataacataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatataacta 12244036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4429514 - 4429355
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacat--cgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  4429514 aaaataaatgatattcattcattcaaattggcagagtatatatcgatacattacaaattcaaagtcgctaaatacaaaaaggatgaatctgcgaagaaac 4429415  T
Q  456 tcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| | |||| ||||||| |||||||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4429414 tcatatcatccatgttaaaaacataaaattgcagagtatatatgcatacaaatatgacta 4429355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10334942 - 10334866
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaa 434  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  10334942 aaaataaacgatatccattcattcaaattgatagagtacattgatacaatgtaaattcaaattcgctaaaaacaaaa 10334866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 373 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32921074 - 32920938
Alignment:
Q  373 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| || ||||| |||||||       | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32921074 cattcatgcacattgatagagtacatcaatgcaatacaaattcac------taaaaacaaaaaggatgaatctctgaacaaactcacaacatccatgtta 32920981  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| || |||||| || ||||| || ||||||||| |||||||    
T  32920980 atagcacaaaacgacatagtacataagcctacaaacatgacta 32920938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 26538829 - 26538702
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26538829 aaaataaatgataatcattcattcaaattgattgagtacatcgatacaatg------caaatttgctaaaaacaaaatggatgaatttgtgaacaaactc 26538736  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaag 491  Q
    |||||||| |||| || | | ||||||| |||||    
T  26538735 acaacatccatgtcaacagcgtaaaacgacaaag 26538702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32062223 - 32062088
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||      |||||||| | |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32062223 attcatttaaaatgatatagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaataaaaaggatcaatgtgtgaacaaactcacaacatccatgttaa 32062130  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || ||||||||| |||||| | || || ||||||||||||||    
T  32062129 tagcataaaacgacaaagtgcataagcatacaaatatgacta 32062088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9270452 - 9270315
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |      ||||||| | ||||||  | |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||    
T  9270452 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgt------aaattcgctaaaaacatcaaggatgaatatgtgaa-agactcacaacatccatgt 9270360  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  9270359 taacagcataaaatggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 9270315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 378 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 10043195 - 10043008
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      | | ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10043195 attcaaattgatagagtacatcgatacaatgaaaattc------gctaaaaacaaaaag-ataaatctctgaacaaactcacaacatccatgttaatagc 10043103  T
Q  478 ataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacacc 576  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||          |||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  10043102 ataaaacgacaaagtactaaag-ctaca---------catataactatatttaagtctccggaatacacatgtctccggatctgcaacgttgacgactcc 10043013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 358 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 13977855 - 13977738
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||  | |||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  13977855 aaaataaatgatattcattcgttcaaattgatagagtacatcgatac------aatgcaaattcactaaaaacaaaagaaatgaatctgcgaacaaactc 13977762  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataa 481  Q
    ||| |||||||||||||| |||||    
T  13977761 acagcatctatgttaatagcataa 13977738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 416 - 515
Target Start/End: Original strand, 7014188 - 7014287
Alignment:
Q  416 aaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| | |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  7014188 aaattcgctaaaaataaaaatgatgaatctgtgaataaactcacaacaactatgttaataacataaaacaacaaagtactaaaacctacacatatgacta 7014287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 361 - 480
Target Start/End: Original strand, 7256476 - 7256594
Alignment:
Q  361 ataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcaca 460  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||| ||| | ||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  7256476 ataaacgatatttattcattcaaattgatcgtgtacattgatgcaaaacaaattcaaagtcgct-aaaacaaaaagaatgaatctgcgaacaaattcaca 7256574  T
Q  461 acatctatgttaataacata 480  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  7256575 acatctatattaacaacata 7256594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 587 - 666
Target Start/End: Original strand, 10633074 - 10633153
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaa 666  Q
    |||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10633074 tcattgattgaatctacacttgatcaaagctaatctttcaacctgaataaaataaacaccgcactaagacggaaaatcaa 10633153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 494
Target Start/End: Original strand, 15237231 - 15237339
Alignment:
Q  380 tcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacat 479  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||      ||| |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15237231 tcaaattgatagagtacatcaatagaataaaaattc------gttaaaaacaaaaatgatgaatctgagaacaagctcacaacatctatgttaatagcat 15237324  T
Q  480 aaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||  ||||||||    
T  15237325 aaaaccacaaagtac 15237339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7291613 - 7291551
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaatt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  7291613 aaaataaacgatgttcattcattaaaattgatagagtacatcgatgcattacaaattcaaatt 7291551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23767184 - 23767033
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||      | |  ||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23767184 aaaataaacaatattcattcattcaaattaatagagtacatcaatacaatgaaaattc------gctagaataaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 23767091  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
     || |||| |||||| || |||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||    
T  23767090 ccagcatccatgttagtagcataaaacggcagagtattaaagcctacacatatgacta 23767033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Original strand, 7280798 - 7280928
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||      | |||||| | |||| |||| | |||||| || ||||||||||    
T  7280798 aaaataaatgatatgcattcattcaaattgatagagttcatcgatacaata------ctaattcgataaaaagaaaaagaatgaatttgcgaacaaactc 7280891  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  7280892 ataacatccatgttaatatcataaaacaacaaagtac 7280928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 36545451 - 36545601
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaat-ggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||        || |||||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||  ||    
T  36545451 aaaacaaatgatattcatttattcaaattgatagagtacatcgata--------atgcaaattcgctaaaaacaaaaaaggatgaatttgtgaacaggct 36545542  T
Q  457 cacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||| |||| |||||||||    
T  36545543 cacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaattgcttacacatatgacta 36545601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5990007 - 5989907
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  5990007 caaattcgctaaaaacaaaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaatattcatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgact 5989908  T
Q  515 a 515  Q
    |    
T  5989907 a 5989907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16809257 - 16809157
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    |||||||||  |||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  16809257 caaattcgtaaaaaacaaaaatgatgaatctgcgtacaaactcacatcatctttgttaataacataaaacaacaaagtacagaagcctacacatatgact 16809158  T
Q  515 a 515  Q
    |    
T  16809157 a 16809157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 539 - 649
Target Start/End: Original strand, 6219947 - 6220051
Alignment:
Q  539 aatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaa 638  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||| ||||      |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6219947 aatactcatgttttcggatctgcaacgttgaagacgccaaaatcat------tgattgaatctgcacttgctcaagactaatctttcaacctgaatgaaa 6220040  T
Q  639 taaacaccgca 649  Q
    |||||| ||||    
T  6220041 taaacatcgca 6220051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 484
Target Start/End: Original strand, 9799680 - 9799800
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||| ||||| |  | |||||||||  || |||| || ||||||||||    
T  9799680 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacatcaatac------aatgcaaatgctctaaaaacaaaaaagaggaatatgcgaacaaactc 9799773  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaac 484  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9799774 acaacatccatgttaatagcataaaac 9799800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 481
Target Start/End: Original strand, 35778768 - 35778891
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| | | | ||||| ||| ||||| || || ||||||| ||    
T  35778768 aaaatagatgatattcattcattcaaaatgataaagtacatcgatataatacaaactcaaagtagctaaaaaccaaaaggatgcatatgcgaacaaattc 35778867  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataa 481  Q
    ||||||||||||||| || |||||    
T  35778868 acaacatctatgttattagcataa 35778891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 2629358 - 2629204
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||       | | ||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  2629358 aaaataaatgatattaattcattcaagttgatagagtacatccgatacaatgaaaatta------gctgaaaacaaaaaggatgaatttatgaacaaact 2629265  T
Q  457 cacaacatctatgttaata--acataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| |||||||||  | |||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  2629264 cacaacatccatgttaatagcatataaaacgacaaagtactaaatcctacacatatgacta 2629204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 494
Target Start/End: Original strand, 7269150 - 7269265
Alignment:
Q  373 cattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||      |||||||| | |||| |||| |||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||    
T  7269150 catttattcaaattgatagagttcatcgatacaata------caaattcgataaaaataaaaaggatgaatttgcgaacaaactcatagcatccatgtta 7269243  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    ||| ||||||||  ||||||||    
T  7269244 atatcataaaacaacaaagtac 7269265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 10632790 - 10632952
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaa-----attgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaaca 452  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |     ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||   |  ||||||  ||||||||||  ||||    
T  10632790 aaaataaacgatattcattcattccattacaattgatagagtacattgatataatacaaattcaaattcgcaaattacaaaaacgatgaatctggaaaca 10632889  T
Q  453 aactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||| | | ||| |||| ||| |||| ||||||    
T  10632890 aacttacaacattcatgttaatagcataaaacggtagattacatatgtctaaaaatctgacta 10632952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 18994326 - 18994197
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||       || | |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  18994326 aaaataaatgataatcattcattcaaattaatagagtacatcgatacattgcaaat-------cgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaaatc 18994234  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||    
T  18994233 acaacatccatgttaatagcataaaacgacatagtac 18994197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32413235 - 32413084
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| | |||| |  |||    
T  32413235 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacattgata------taatgcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatatctgaaaaggctc 32413142  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||  ||| |||||  ||||||||    
T  32413141 acaacatacatgttaatagcttaaaacgacaaagtacaaatgtctacacgtatgacta 32413084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37720268 - 37720134
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaa 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |      ||||||| | |||| |||| ||||||||||  |||||||||| || |||| || ||||    
T  37720268 attcattcaaattgatagagtacatcgat-caatgt------aaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctccgaacaaactcgcagcatccatattaa 37720176  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    || ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  37720175 tagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgacta 37720134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 668
Target Start/End: Original strand, 1039815 - 1039868
Alignment:
Q  615 gctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1039815 gctaatctttcaacctggatcaaataaacaccgcactaagacgggaaataaaaa 1039868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 503
Target Start/End: Original strand, 12111003 - 12111148
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||| ||||||||||||| | |||||||||  |||   | ||   | |||||     
T  12111003 aaaataaacaatattcattcattcaaattgatcgagtacattggcacgatacaaattcaaattcggtaaaaacaaaaatgattgttgtgcacaaaaactt 12111102  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgccta 503  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  12111103 acaacatcaatgttaatagtataaaacgacaaagtacatatgccta 12111148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12357178 - 12357089
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12357178 aaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagaataaattggcagagtacataaacctacaaatatgacta 12357089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17019544 - 17019394
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||      |||| ||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  17019544 aaataaatgatattcattcattcaaattagtagagtaactcaatacaata------caaagtcgctaaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactca 17019451  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||  |  |||||| |||||||||    
T  17019450 caacatccatgttaatagcataaaatagcaaagtacaaaatcctacacatatgacta 17019394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17549981 - 17549831
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||      |||| ||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  17549981 aaataaatgatattcattcattcaaattagtagagtaactcaatacaata------caaagtcgctaaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactca 17549888  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||  |  |||||| |||||||||    
T  17549887 caacatccatgttaatagcataaaatagcaaagtacaaaatcctacacatatgacta 17549831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 484
Target Start/End: Original strand, 26046287 - 26046397
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacat-cgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||  ||||||    
T  26046287 attcattcaaattgatagaatacattcgatacaatgcaaattcaaagtcacttaaaacaaaacggatgaaccac-gaacaaactcacaacattcatgtta 26046385  T
Q  473 ataacataaaac 484  Q
    |||||| |||||    
T  26046386 ataacacaaaac 26046397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 4928192 - 4928118
Alignment:
Q  601 tgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||    
T  4928192 tgcacttgctcaaagctaatatctcaacctgaatcaaacaaacaccacactagaacgagaaataaaaaacacacc 4928118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 19489066 - 19488984
Alignment:
Q  586 gtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||    
T  19489066 gtcattgattgaatttgcacttgatcaaagttaatctttcaacctgaatcaaataaacaccagactatgacggaaaataaaaa 19488984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31874509 - 31874455
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaa 412  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31874509 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatataatgtaaa 31874455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21472012 - 21471895
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||| || || ||||||||| ||||||||| |   | |||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  21472012 aaaataaaagatattctttcattcaagtttatagactatattgatacaatacaaattcaaagtttctaaaaacagaaaggatgaatctgcgaacaaactc 21471913  T
Q  458 acaacatctatgttaata 475  Q
    | || ||| |||||||||    
T  21471912 agaatatccatgttaata 21471895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37659305 - 37659256
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaat 407  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37659305 aaaataaatgatattcattcattcaaattggtagagtacatcgatacaat 37659256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 4809203 - 4809151
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  4809203 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggca 4809151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 406
Target Start/End: Original strand, 11967996 - 11968044
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaa 406  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11967996 aaaataaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatcgacacaa 11968044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 20993258 - 20993202
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  20993258 aaaataaactatattcattcattcaaattgatagattgcatcgatataatataaatt 20993202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27989135 - 27989079
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    ||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989135 aaaataaacaatatttatttatttaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 27989079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 28046437 - 28046381
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    ||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28046437 aaaataaacaatatttatttatttaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 28046381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5328392 - 5328243
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||  | ||| |||| |||||||||||| || |  |||    
T  5328392 aaaataaatgatattcattcttttaaattgatagagtacatcgata------taatgcaaattcg--ctaaaaaaaaaggatgaatctgtaaataggctc 5328301  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||    
T  5328300 acaacattcatgttaatagtataaaacggcaaagtacaaatgcatacacatataacta 5328243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31874453 - 31874374
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||    
T  31874453 ggatgaatatgtgaagaggctcacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacaattgcctacacatatgacta 31874374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 437 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 33299092 - 33299041
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  33299092 gatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggca 33299041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 437 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 34365938 - 34365863
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||    
T  34365938 gatgaatctgcaaacaaactcacaatatttatgttaatagcataaaacgacgaagtacatatacctataaatatga 34365863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7282018 - 7281932
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatc 444  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| ||||    
T  7282018 aaaataaacgatattcattcattttaatttatagagtatatcgatataatataaatttaaagtctctaaaaacaaaaaggataaatc 7281932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10334867 - 10334813
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgccta 503  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  10334867 aacaaactcacaatatccatgttaataacataaaacaacaaagtactcatgccta 10334813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 33526833 - 33526708
Alignment:
Q  361 ataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc--gatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||   |||| |||| ||||| ||| ||||| |||||||||  || |||||||  |||||||||     
T  33526833 ataaatgatattcattcatttaaattgatagaatatattttgatataatacaaatttaaagtcgttaaaaacaaaaaagacgaatctgcaaacaaactcg 33526734  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaac 484  Q
     |  ||||||||||||||||||||||    
T  33526733 tagaatctatgttaataacataaaac 33526708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 428 - 514
Target Start/End: Original strand, 39092820 - 39092906
Alignment:
Q  428 aacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||| |||| |||| || |||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  39092820 aacaatatggatgaatctgcaaataaacgcacatcatccatattaaaaacatagaacggcaaagtgcatatgcctacaaatacgact 39092906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 23422258 - 23422118
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatgga-tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgtta 472  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| |||||| | || |||||| ||||| |||||||||  || ||||| || || |||||||| || ||| ||||||    
T  23422258 attcattcaagttgataaaatacatccatacaacacaatttcaaaatcgttaaaaacaaaaaagaatgaatttgcgagcaaactcataa-atccatgtta 23422160  T
Q  473 ataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgact 514  Q
    ||| |||||||  ||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  23422159 atatcataaaattgcaaagtaaataagcctacaaatacgact 23422118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 4021216 - 4021160
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaatt 414  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  4021216 aaaataaattatattcattcattcaaattgattatgtacatcgatacaatataaatt 4021160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6833783 - 6833743
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacat 398  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6833783 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagagtacat 6833743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9627895 - 9627835
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaa 418  Q
    ||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9627895 aaaataatcaatattcattctttcgaattgatagagtacattgatacaatacaaattcaaa 9627835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 11725919 - 11725867
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||    
T  11725919 ggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggca 11725867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18087310 - 18087259
Alignment:
Q  106 cacttgttaaggaaatataaaagaaaatattctct-gaaaattgtgtattcta 157  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18087310 cacttgttaaggaa-tataaaaggaaatattctcttgaaaattgtgtattcta 18087259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 19443852 - 19443888
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19443852 aaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 19443888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28240080 - 28240028
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||    
T  28240080 ggatgaatctgtgaacaaactcacagcatctaagttaatagaatataacggca 28240028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 483
Target Start/End: Original strand, 36006163 - 36006285
Alignment:
Q  359 aaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactca 458  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||| |  | ||||| ||| ||||||||   |||||| |||    
T  36006163 aaataaacaatgtttattcactcaaattgatagagtacatcgat-caat-gcaatacaaattcataaagaacaagatgaatgaatctacaaacaaattca 36006260  T
Q  459 caacatctatgttaataacataaaa 483  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||    
T  36006261 caatatctgtgttaatagcataaaa 36006285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 3240671 - 3240636
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacat 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3240671 aaacgatgttcattcattcaaattgatagaatacat 3240636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26912093 - 26912038
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaat 413  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  26912093 aaaataaacgatattcattcttttaaattgataaagtacaacaatacaatataaat 26912038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 490
Target Start/End: Original strand, 30568187 - 30568238
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||    
T  30568187 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaa 30568238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3240606 - 3240552
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  3240606 ggatgaatctgcgaataaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaa 3240552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6314959 - 6314917
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcg 400  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6314959 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatagattacatcg 6314917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 598 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 20993032 - 20992962
Alignment:
Q  598 atctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaa 668  Q
    ||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||    
T  20993032 atctgcatttgctcaaagttaatttttcaaccagaatcaaataaacatcacactaaaacgggaaataaaaa 20992962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 154
Target Start/End: Original strand, 33986853 - 33986903
Alignment:
Q  105 acacttgttaaggaaatataaaagaaaatattctc-tgaaaattgtgtatt 154  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  33986853 acactcgttaagggaatataaaagaaaatattctctttaaaattgtgtatt 33986903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 438 - 488
Target Start/End: Original strand, 42447874 - 42447924
Alignment:
Q  438 atgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  42447874 atgaatatgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 42447924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 488
Target Start/End: Original strand, 43192182 - 43192244
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  43192182 aaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcagaacatccaagttaatagcatataacggca 43192244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 497
Target Start/End: Original strand, 9619202 - 9619263
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtactta 497  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  9619202 ggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatactta 9619263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 494
Target Start/End: Original strand, 14918411 - 14918468
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14918411 gatgaaactgtaaataaactcacaacatccgtgttaatagcataaaacgacaaagtac 14918468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 16794530 - 16794481
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  16794530 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataccatataacg 16794481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 623 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 32726636 - 32726607
Alignment:
Q  623 ttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32726636 ttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 32726607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 154
Target Start/End: Original strand, 34612221 - 34612270
Alignment:
Q  106 cacttgttaaggaaatataaaagaaaatattctc-tgaaaattgtgtatt 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  34612221 cacttgttaaggagatataaaaggaaatattctcttgaaaattatgtatt 34612270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2655958 - 2655910
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  2655958 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 2655910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 9498444 - 9498488
Alignment:
Q  436 ggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacata 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  9498444 ggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcata 9498488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 9619353 - 9619401
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  9619353 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 9619401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 9637208 - 9637244
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9637208 aaacgatattcattcatttaaattgatagagtacatc 9637244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9802106 - 9802062
Alignment:
Q  374 attcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaa 418  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9802106 attcgttcaaattggtagggtacatcgatacaatacaaattcaaa 9802062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 616 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14186946 - 14186910
Alignment:
Q  616 ctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14186946 ctaatttttcaacctgaatcaaataaagaccgcacta 14186910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 544 - 592
Target Start/End: Original strand, 15288677 - 15288725
Alignment:
Q  544 tcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattg 592  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15288677 tcatgtctctggatttgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattg 15288725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 544 - 592
Target Start/End: Original strand, 15469046 - 15469094
Alignment:
Q  544 tcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattg 592  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15469046 tcatgtctctggatttgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcattg 15469094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 395
Target Start/End: Original strand, 15596952 - 15596984
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagta 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15596952 aaacgatattcattcattcaaattgatagagta 15596984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 17693412 - 17693448
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17693412 aaacgatattcattcactcaaattgatagagtacatc 17693448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21238011 - 21237975
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaata 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21238011 tgaatctgtgaacaaactcacaacacccatgttaata 21237975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23230933 - 23230897
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23230933 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 23230897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 540 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 23767017 - 23766973
Alignment:
Q  540 atactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcat 584  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23767017 atacccatgtttccggatctgcaacgttgacgactccaaagtcat 23766973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 485
Target Start/End: Original strand, 23851344 - 23851388
Alignment:
Q  441 aatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacg 485  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  23851344 aatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacg 23851388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 667
Target Start/End: Original strand, 23851490 - 23851538
Alignment:
Q  619 atctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  23851490 atctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaa 23851538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 399
Target Start/End: Original strand, 27498173 - 27498201
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27498173 ttcattcattcaaattgatagagtacatc 27498201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 40211099 - 40211135
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40211099 aaacgatattcattcattcaaatcgatagagtacatc 40211135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 40618872 - 40618908
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40618872 aaacgatattcattcattcaaattgatagaatacatc 40618908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 74630 - 74312
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  74630 aaaataaacgatattcatttatttaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaagtc 74531  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  74530 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacctgtgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtcttcggaatactcatgtctccgga 74431  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  74430 tctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaactccgtactaagat 74331  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    | ||||| |||| ||||||    
T  74330 gtgaaattaaaaacacacc 74312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 361 - 675
Target Start/End: Original strand, 6787 - 7097
Alignment:
Q  361 ataaacgatgttcattcatt-caaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcac 459  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6787 ataaacgatattcattcatttcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcac 6886  T
Q  460 aacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatc 558  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  6887 aacatccatgttaatagcataaaatggtaaagtacatatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatgtctcaagaatactcatgtctccggatc 6986  T
Q  559 tgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgg 658  Q
    ||||||||| ||||| |||||      |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||  |||||    
T  6987 tgcaacgttaacgacgccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctccaagctaatcttttaacccgaattaaataaacactgcacttagacgg 7080  T
Q  659 gaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||||||| ||||||    
T  7081 gaaatcaaaaacacacc 7097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 358 - 675
Target Start/End: Original strand, 12905 - 13218
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||     ||  ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12905 aaaataaatgatattcattaattcaaattaatagagtacaacgatacaa-----atctaaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatctgtgaacaaactc 12999  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| | ||    
T  13000 acaacatccatgataatagcataaaacggcaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcatatctccggaatactcatgtctacgga 13099  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  13100 tctgcaacgttgacgacgtcaaagtcattgtcattgatcggatttgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacacctcactaagac 13199  T
Q  657 gggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  13200 gggaaataaaaaacacacc 13218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 31075 - 31111
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31075 aaacgatattcattcattcaaattgatatagtacatc 31111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 358 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 35541 - 35239
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  35541 aaaataaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatacaaatccaaatttgctaaaaacaaaaaggataaatttgtgaacaaactc 35442  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| |         |||||||| ||||| | || || ||||||||||||| ||| ||    
T  35441 acaacatccatgttaatagcataaaacagtaaagtacatatgcctata---------aatatgacaatattcaagtctccggaatactcatgtatccgga 35351  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35350 tctgcaacgttgacgacgccaaagtcattgtcaatggtcggatttgcacttgctcaaagctaatatttcaacctaaatcaaataaacaccgcactaagac 35251  T
Q  657 gggaaatcaaaa 668  Q
    | ||||| ||||    
T  35250 gagaaataaaaa 35239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 364 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 6596 - 6287
Alignment:
Q  364 aacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaaca 463  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6596 aacgatattcattcattcaaatcgataaagtatatcgatataatacaaattcaaattcactaaaaacgaaaaggacgaatctgtgagcaaactcacaaca 6497  T
Q  464 tctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgttct--ggaatactcatgtctccagatctgc 561  Q
    || ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  6496 tccatgttaatagcataaaacgacaaagtacctatgcctacaaatatgactaatatgactatattca-attctaaggaatactcatgtctcca-atctgc 6399  T
Q  562 aacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaa 661  Q
    |||||||||||| || ||  ||| ||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  6398 aacgttgacgacgcctaacccattgtcattgatcgaatctgcacttgtgcaaagttaatctttcaacctagatcaaataaacaccgtactaagacggaaa 6299  T
Q  662 atcaaaagcaca 673  Q
    || |||| ||||    
T  6298 ataaaaaacaca 6287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1350 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1350
Description:

Target: scaffold1350; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 415 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 1984 - 1722
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaa-cggcaaagtacttatgcctacaaatatgac 513  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||     
T  1984 caaattcgctaaaaacaaaaaagatgaatttgtgaacaaactcacaacatctatgttaatagcataaaaacgacaaggtacctatgcctacaaatatgat 1885  T
Q  514 taatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctca 612  Q
    ||||| || |||||| | || || ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1884 taataagagtatattcaagtctccggaatcctcatgtatctggatctgcaacgttgacgatgccaaagtcattgtcattgatcggatctgtacttgctca 1785  T
Q  613 aggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  1784 aagctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagacgggaaataaaaaacacacc 1722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 358 - 652
Target Start/End: Original strand, 403903 - 404204
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  403903 aaaataaacgatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatacaatacaaattcaaattcgctgaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 404002  T
Q  458 acaacatctatgttaataa-------------cataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatac 543  Q
    ||| |||| ||||||||||             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||    
T  404003 acagcatccatgttaataatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacttatgcctacaaatatgattaatatgactatatttatgtctccgaaatac 404102  T
Q  544 tcatgtctccagatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaac 643  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||      ||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  404103 tcatgtcttcggatctgcaatgttga------caacgtcaaagtcattgatcgaatctgcacatgctcaaagct-atctttcaacctgaatcaaataaac 404195  T
Q  644 accgcacta 652  Q
    ||| |||||    
T  404196 accacacta 404204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0432 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0432
Description:

Target: scaffold0432; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 358 - 666
Target Start/End: Original strand, 2103 - 2384
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2103 aaaataaacgatattcattcattcaaattgataaagtacatcgatacaata------caaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgtgaacaaactc 2196  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    | |  ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||| ||    
T  2197 atagtatccatgttaatagcattaaacgacaaagtatctatgcctacaaatatgactaatatgactatattcaagtctccagaatactcatgtctccgga 2296  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggac 656  Q
    |||||||| |||||||| |||||      |||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2297 tctgcaacattgacgacgccaaa------gtcattgatcggatctgca----------------ctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaagac 2374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0999 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0999
Description:

Target: scaffold0999; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 358 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 2157 - 1900
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacat--cgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaac 455  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||| | |||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  2157 aaaataaacgatattcattcactcaaattgatagagtacataccaatacaatacaaatccaaattcgctaaaataaaaaaggatgaatttgtgaacaaac 2058  T
Q  456 tcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctcca 554  Q
    ||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||         |||| ||||||| | |||| || |||||||| |||||||      
T  2057 tcacatcatccatgtcaatagcataaaacgacaaagtacatatgcctaca---------aatacgactataatcatgtctccggaatacttatgtctctc 1967  T
Q  555 gatctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaa 627  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1966 gatctgcaacgttgatgacgccaaa------gtcattgatcggatctgcacttgctcaaagctaatctttcaa 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1379 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold1379
Description:

Target: scaffold1379; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 378 - 652
Target Start/End: Original strand, 752 - 1033
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaa----catctatgttaa 473  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||    
T  752 attcaaattgatagaacacatcgatataatacaaattcaaattcgctaaaaacaagaatgatgaaactgtgaacaaactcacaacatgcatctgtgttaa 851  T
Q  474 taacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta-at--atgact-----atatttatgttct-ggaatactcatgtctccagatctgcaac 564  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  | | ||     ||| | ||  |||    |||||||||||||| ||||||||||    
T  852 taacataaaacggcaaaatacttatgtctacaaatatgactatattcaagtctctggaatactcatactctactcatactcatgtctccggatctgcaac 951  T
Q  565 gttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    ||||| |||||||||      ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  952 gttgatgacaccaaa------gtcattgatcgaatctgcagtttctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaatatacaccgcacta 1033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1379; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 242 - 130
Alignment:
Q  556 atctgcaacgttgacgacaccaaagtcatggtcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactagga 655  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  242 atctgcaaagttgacgactccaaagtcattgtcattgaccagatatgcacttgctcaaagctaatctttcaacctgaatcaaataaacacagcactaaga 143  T
Q  656 cgggaaatcaaaa 668  Q
     ||||||||||||    
T  142 tgggaaatcaaaa 130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 358 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 21059 - 20907
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||  | ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  21059 aaaataaacgattttcattcattcaaattgatagagtacatcgatccaatacaattccaaattcactaaaaacaaaaaggatgaatctttaaacaaactc 20960  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatat 510  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  20959 acatcatccatgttaatagcataaaacgacaaagtacatatccctacaaatat 20907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36969 - 36818
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||       ||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  36969 aaaataaaagatattcattcattcaaattgatagagtacattgatataatgtaaattt------gttaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaggctc 36876  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  36875 acaacatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacaattgcctacacatatgacta 36818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 25181 - 25332
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||      || ||| | | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  25181 aaaacaaacgacattcatttattcaaattgatagaatacatcgctgcaata------cagatttgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaataaactc 25274  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25275 acaacatccatgttaatagcataaaatggcaaagtacataggcctacaaatatgacta 25332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0722 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0722
Description:

Target: scaffold0722; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 5195 - 5346
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      |||||| | | ||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  5195 aaaataaatgatattcattcattcaaatttatagagtacatcgatataata------caaatttgctaaaaacaaaaagg-tgaatctgtgaacaggctc 5287  T
Q  458 acaacatcta-tgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||    
T  5288 acaacatccattgttaatagcataaaacggcaaggtacaagtgcctacacatatgacta 5346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 11445 - 11596
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||      ||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  11445 aaaataaataatattcattcattcaaattaatagagtacatcgatataatgaaaattc------gttaaaataaaaaaggatgaatctgttaacaaactc 11538  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| || |||||| | | ||||||| |||||||||    
T  11539 acaacatccatgttagtgacataaaatggtaaagtattaaagcctacacatatgacta 11596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0580 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0580
Description:

Target: scaffold0580; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 406 - 515
Target Start/End: Original strand, 503 - 612
Alignment:
Q  406 atataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctaca 505  Q
    |||||||||| || ||| | | |||||||  || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||    
T  503 atataaattcgaaatcgctaagaacaaaaaagaagaatatgtgaacaaacttacaacatccatgttaatatcataaaatggtagagtacatatgcctaca 602  T
Q  506 aatatgacta 515  Q
    ||||||||||    
T  603 aatatgacta 612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0580; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 406 - 515
Target Start/End: Original strand, 8242 - 8351
Alignment:
Q  406 atataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctaca 505  Q
    |||||||||| || ||| | | |||||||  || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||    
T  8242 atataaattcgaaatcgctaagaacaaaaaagaagaatatgtgaacaaacttacaacatccatgttaatatcataaaatggtagagtacatatgcctaca 8341  T
Q  506 aatatgacta 515  Q
    ||||||||||    
T  8342 aatatgacta 8351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0580; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 662
Target Start/End: Original strand, 698 - 742
Alignment:
Q  618 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaa 662  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  698 aatcttttaacatgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaa 742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0580; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 662
Target Start/End: Original strand, 8437 - 8481
Alignment:
Q  618 aatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaa 662  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8437 aatcttttaacatgaatcaaataaacaccgcactaagacgagaaa 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 105491 - 105334
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      |||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  105491 aaaacaaacgacattcattcattcaaattgatatagtacatcgatgcaata------caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaacatgtgaacaaactc 105398  T
Q  458 acaacatc------tatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||      | | |||||| ||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||    
T  105397 acaacatccaggttttttttaatagcataaaacaacaaagtatataagcctacaaatatgacta 105334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 378 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4239 - 4137
Alignment:
Q  378 attcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataac 477  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| || || |||  ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  4239 attcaaattgacagagtatatcgatgcaatataaatttaaagtctttaaaataaaaaatgatgaatctgcgaataaactcacaacatccatattaataac 4140  T
Q  478 ata 480  Q
    |||    
T  4139 ata 4137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 589 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 4016 - 3938
Alignment:
Q  589 attgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaa 667  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||    
T  4016 attgattggatctgcacttgatcaaagataatcttttaatttgaatcaaataaacaccacaataagacgagaaatcaaa 3938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 582
Target Start/End: Original strand, 136744 - 136953
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||      ||| ||||||||| | || ||| |||||||| ||||    
T  136744 aaaataaattatattcattcattcaaattgatagtgtacattgatataatgaaaattc------gttaaaaacaaaaag-ataaatttgtgaacacactc 136836  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgactaatatgactatatttatgt-tctggaatactcatgtctccaga 556  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| | ||         | ||  ||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||  ||    
T  136837 acaacatccatgttaatagcataaaacagcaaggtactgaagc---------ttacgcatatgactatatttaagtctccggaatacccatgtctctgga 136927  T
Q  557 tctgcaacgttgacgacaccaaagtc 582  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  136928 tctgcaacgttgacgactccaaagtc 136953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 504
Target Start/End: Original strand, 11923 - 12012
Alignment:
Q  415 caaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctac 504  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  11923 caaattcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacatgctcacatcatccatgttaatagcataaaatgacaaagtacaaatgcctac 12012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 457
Target Start/End: Original strand, 22301 - 22400
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || || ||| | | | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  22301 aaaatgaacgatattcattcattcaaattaataaagtacatcgatataatacaattttaaagtaggtaaaaacaaaaaggataaatctgcgaacaaactc 22400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 512
Target Start/End: Original strand, 404489 - 404564
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatga 512  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||| |||||||||||    
T  404489 gatgaatatgtgaacaaactgacaacatccatgttaataacataaaatcgtagagtacatatgcttacaaatatga 404564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 515
Target Start/End: Original strand, 9998 - 10149
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||  || ||||||||      |||| ||| | ||||| ||| |||||||| || ||||||||||    
T  9998 aaaataaatgatattctttcattcaaattagtagagtaactcaatacaata------caaaatcgataaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactc 10091  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||  |  |||||| |||||||||    
T  10092 acaacatccatgttaatagcataaaatagcaaagtacaaaatcctacacatatgacta 10149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 245074 - 244949
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||      || ||||||||  |||     |||||||||  |||    
T  245074 aaaataaatgatattcattcattcaaattgatatagtacaacgatataatgcaaattca------ttaaaaacaaatagga-----ctgtgaacaggctc 244986  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  244985 acaacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtac 244949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 443
Target Start/End: Original strand, 201732 - 201817
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaat 443  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||    
T  201732 aaaataaatgatatacattcatttaaattgatagagtaaatcaatacaatacaaattcaaagtcgtttaaagtaaaaaggatgaat 201817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 675
Target Start/End: Original strand, 201952 - 202024
Alignment:
Q  603 cacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacacc 675  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  201952 cacttgttcaaagctaatatttcaacctgaatcaaataaacatcatactaagacgggaaattaaaaacacacc 202024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 185571 - 185513
Alignment:
Q  100 ccgaaacacttgttaaggaaatataaaagaaaatattct-ctgaaaattgtgtattcta 157  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  185571 ccgagacactggttaaggaattataaaagaaaatattgtattgaaaattgtgtattcta 185513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 434
Target Start/End: Original strand, 11223 - 11299
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaa 434  Q
    |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||    
T  11223 aaaataaatgatattaattcatttaaattgatagagtatatcgatacaataaaaatttaaaatcgctaaaaacaaaa 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 511
Target Start/End: Original strand, 93989 - 94129
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactc 457  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||||||||| |||       |||| ||| |||||||| ||||    
T  93989 aaaataaaagatattaattcattcaaattgaaagagtacatcgatataatg------caaattcgttaaaa-------ggataaatttgtgaacagactc 94075  T
Q  458 acaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatg 511  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| || |||||    
T  94076 acaacatccatgttaataacataaaatgacaaagtacaaatgcctgcacatatg 94129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 456
Target Start/End: Original strand, 847 - 939
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaact 456  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||      ||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  847 aaaataaatgatattcatttattcaaatttatagagtacatcgatac------aatgcaaattcgctaaaaataaaaaggatgaatctgcgaacaaact 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 460 - 515
Target Start/End: Original strand, 9423 - 9478
Alignment:
Q  460 aacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  9423 aacatccatgttaatagcataaaacggcaaagtacaaatgcctacacatatgacta 9478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0603 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0603
Description:

Target: scaffold0603; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8020 - 7979
Alignment:
Q  358 aaaataaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8020 aaaaaaaacgatattcattcattcaaattgatagagtacatc 7979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36054 - 35965
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||||||||| | |||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| || ||||| |||||    
T  36054 aaaacaaaaagaatgaatatgcaaacaaattcacaacatccatgttaataacataaaacaacaaaatacatatgcttataaatacgacta 35965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 35907 - 35842
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcacta 652  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35907 tcattgattgaatctgtacttgatcaaaactaatatttcaacctgaatcaaatagacaccacacta 35842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0886 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:

Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 674
Target Start/End: Original strand, 3626 - 3713
Alignment:
Q  587 tcattgatcggatctgcacttgctcaaggctaatctttcaacctgaatcaaataaacaccgcactaggacgggaaatcaaaagcacac 674  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||  ||||||||| |||||    
T  3626 tcattgattgaatctgtacttgatcaaaactaatatttcaacctgaatcaaatagacaccacactaaaacgttaaatcaaaaacacac 3713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1565 - 1514
Alignment:
Q  439 tgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaa 490  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  1565 tgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacggcaaa 1514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 443
Target Start/End: Original strand, 41343 - 41422
Alignment:
Q  364 aacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaat 443  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| | ||| |||| | || ||||||||    
T  41343 aacgatgttcatttattaaaattgatagagtacatcaataaaatacacattcaaagttgttaaaaaaagaaaggatgaat 41422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 488
Target Start/End: Original strand, 83282 - 83333
Alignment:
Q  437 gatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggca 488  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  83282 gatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 83333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1294 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1294
Description:

Target: scaffold1294; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 449 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1069
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  1135 aacaaactcacggtatctatgttaatagcataaaacgacaaagtacaaaagcctacacatatgacta 1069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0274
Description:

Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 449 - 510
Target Start/End: Original strand, 19294 - 19353
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatat 510  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  19294 aacaaactcacaatat--atgttaataacataaaacggtagagtacatgtgcctacaaatat 19353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 449 - 510
Target Start/End: Original strand, 5595 - 5654
Alignment:
Q  449 aacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatat 510  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  5595 aacaaactcacaatat--atgttaataacataaaacggtagagtacatgtgcctacaaatat 5654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 15363 - 15507
Alignment:
Q  371 ttcattcattcaaattgatagagtacatcgatacaatataaattcaaattcgttcaaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgt 470  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||  ||  | ||||||||| | || ||| ||  |||||| |  ||||||| || |    
T  15363 ttcatttattcaaattgatagagtacattgacacattatagattcaatgtcactaaaaacaaaaagaataaatatgcaaacaaatttccaacatccatat 15462  T
Q  471 taataacataaaacggcaaagtacttatgcctacaaatatgacta 515  Q
    ||| | ||||||||  |||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  15463 taacagcataaaacaacaaaatacatatgcttataaatatgacta 15507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 399
Target Start/End: Original strand, 53202 - 53238
Alignment:
Q  363 aaacgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53202 aaacgatattcattcattcaaattgatatagtacatc 53238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 408
Target Start/End: Original strand, 3837 - 3881
Alignment:
Q  365 acgatgttcattcattcaaattgatagagtacatc-gatacaata 408  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3837 acgatattcattcattcaaattgatagagttcatctgatacaata 3881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11327
Alignment:
Q  426 aaaacaaaatggatgaatctgtgaacaaactcacaacatctatgttaataacataaaacggcaaagtac 494  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  11394 aaaataaaaaggatgaat-tgtgaatagactcacagcatccatattaatagcataaaacggcaaagtac 11327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3855 times since January 2019
Visitors: 8728