View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF4356-Insertion-4 (Length: 915)
Name: NF4356-Insertion-4
Description: NF4356
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4356-Insertion-4 |
 | |
|
| [»] chr4 (11 HSPs) |
| |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 795; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 795; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 14179056 - 14178145
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnntt-aaca |
106 |
Q |
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| T |
14179056 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcaataaaaaaaatgaaca |
14178957 |
T |
|
| Q |
107 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
206 |
Q |
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| T |
14178956 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
14178857 |
T |
|
| Q |
207 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
306 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14178856 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
14178757 |
T |
|
| Q |
307 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacaca--gaaactttgtattttca |
404 |
Q |
| |
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|
| T |
14178756 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttca |
14178657 |
T |
|
| Q |
405 |
cttctgcttcattgatttcattccttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagt |
504 |
Q |
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| T |
14178656 |
cttctgcttcattgatttcattccttcaagtacccctttatttataggggaaatcggctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagt |
14178557 |
T |
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| Q |
505 |
catgtccttaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctgtgtgtgttctctgtacaatctatacatagccaaact |
604 |
Q |
| |
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| T |
14178556 |
catgtccttaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctatacatagccaaact |
14178457 |
T |
|
| Q |
605 |
atttgaaaggaaaaactaagccatgcatttaatgtgtagaagaatttgacaattgcttgttgcaattttccttttggctggaacataccccacgtggtgg |
704 |
Q |
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|
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| T |
14178456 |
atttgaaaggaaaaactaagccatgcatttaatgtgtagaagaatttgacaattgcttgttgcaattttccttttggctggaacataccccacgtggtgg |
14178357 |
T |
|
| Q |
705 |
gaccaacaattctccccctccagccaaagggagatatcctcgcaattcattcaccggcgatccatgccgatcaactcggcacaaagttgaagcttttcac |
804 |
Q |
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| T |
14178356 |
gaccaacaattctccccctccagccaaagggagatatcctcgcaattcattcaccggcgatccatgccgatcaactcggcacaaagttgaagcttttcac |
14178257 |
T |
|
| Q |
805 |
gtgctacaactttcgtcaacatatccgc-ggatttttatcggtgtgaatcttttcccacataaatttgttgttcttccgctgcttgacgc-accaatgat |
902 |
Q |
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| T |
14178256 |
gtgctacaactttcgtcaacatatctgcgggatttttatcggtgtgaatcttttccaacataaa-ttgttgttcttccgctgcttgacgcaaccaatgat |
14178158 |
T |
|
| Q |
903 |
atctgacatcaat |
915 |
Q |
| |
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||||||||||||| |
|
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| T |
14178157 |
atctgacatcaat |
14178145 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 626; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 14174302 - 14173595
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnntt-aaca |
106 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14174302 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagtgataaaaaaaatgaaca |
14174203 |
T |
|
| Q |
107 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
206 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14174202 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
14174103 |
T |
|
| Q |
207 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174102 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
14174003 |
T |
|
| Q |
307 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacaca--gaaactttgtattttca |
404 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174002 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaaactttgtattttca |
14173903 |
T |
|
| Q |
405 |
cttctgcttcattgatttcattccttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagt |
504 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14173902 |
cttctgcttcattgatttcattccttcaagtacccctctatttataggggaaatcggctgatgaagagttaaatgctatgccctcctttcacaccaaagt |
14173803 |
T |
|
| Q |
505 |
catgtccttaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctgtgtgtgttctctgtacaatctatacatagccaaact |
604 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14173802 |
catgtccttaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctatacatagccaaact |
14173703 |
T |
|
| Q |
605 |
atttgaaaggaaaaactaagccatgcatttaatgtgtagaagaatttgacaattgcttgttgcaattttccttttggctggaacataccccacgtggtgg |
704 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14173702 |
atttgaaaggaaaaactaagccatgcatttaatgtgtagaagaatttgacaattgcttgttgcaattttccttttggctggaacataccccacgtggtgg |
14173603 |
T |
|
| Q |
705 |
gaccaaca |
712 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
14173602 |
gaccaaca |
14173595 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 44161950 - 44161245
Alignment:
| Q |
7 |
atgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnntt-aac |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
44161950 |
atgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaac |
44161851 |
T |
|
| Q |
106 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
205 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
44161850 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaat--tctc |
44161753 |
T |
|
| Q |
206 |
tccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161752 |
tccactctcttacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtaagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
44161653 |
T |
|
| Q |
306 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacagaaactttgtatttt-ca |
404 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
44161652 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattattcctctcacacacctctacacacagaagctttgtgtttttca |
44161553 |
T |
|
| Q |
405 |
cttctgcttcattgatttcattccttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagt |
504 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161552 |
cttctgcttcgatgccttcattccttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagt |
44161453 |
T |
|
| Q |
505 |
catgtccttaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctgtgtgtgttctctgtacaatctatacatagccaaact |
604 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161452 |
catgtccttaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctatacatagccaaact |
44161353 |
T |
|
| Q |
605 |
atttgaaaggaaaaactaagccatgcatttaatgtgtagaagaatttgacaattgcttgttgcaattttccttttggctggaacataccccacgtggtgg |
704 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161352 |
atttgaaaggaaaaactaagccatgcatttaatgtgtagaagaatttgacaattgcttgttgcaattttccttttggctggaacataccccacgtggtgg |
44161253 |
T |
|
| Q |
705 |
gaccaaca |
712 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
44161252 |
gaccaaca |
44161245 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 414
Target Start/End: Original strand, 28606806 - 28607215
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnn-ttaaca |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28606806 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaattaaca |
28606905 |
T |
|
| Q |
107 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28606906 |
ccaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
28607005 |
T |
|
| Q |
207 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607006 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
28607105 |
T |
|
| Q |
307 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttct--acacacagaaactttgtattttca |
404 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28607106 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttca |
28607205 |
T |
|
| Q |
405 |
cttctgcttc |
414 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
28607206 |
cttctgcttc |
28607215 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 414
Target Start/End: Original strand, 28611568 - 28611977
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnntt-aaca |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
28611568 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaaca |
28611667 |
T |
|
| Q |
107 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
206 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611668 |
ccaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
28611767 |
T |
|
| Q |
207 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611768 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
28611867 |
T |
|
| Q |
307 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttct--acacacagaaactttgtattttca |
404 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28611868 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttca |
28611967 |
T |
|
| Q |
405 |
cttctgcttc |
414 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
28611968 |
cttctgcttc |
28611977 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11104832 - 11104427
Alignment:
| Q |
5 |
acatgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnnttaa |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || |
|
|
| T |
11104832 |
acatgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagctgtagcgataaaaa--tgaa |
11104735 |
T |
|
| Q |
105 |
caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104734 |
caccaatatttaacatagaaaatcctctaatatcgagggtaaa-ccacgggacaaactccgaaaaatattccaccatatctaagaatattacaatattct |
11104636 |
T |
|
| Q |
205 |
ctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagag |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104635 |
ctccactctcttacacaca-aagagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcaaatgctattattttataacacctagaagttatagag |
11104537 |
T |
|
| Q |
305 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacagaaactttgtattttca |
404 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |
|
|
| T |
11104536 |
atgatatccacccggtgtatttttcctacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttctacacatagaagctttgta-tttga |
11104438 |
T |
|
| Q |
405 |
cttctgcttca |
415 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
11104437 |
cttctgcttca |
11104427 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 695 - 915
Target Start/End: Original strand, 28607507 - 28607728
Alignment:
| Q |
695 |
cacgtggtgggaccaacaattctccccctccagccaaagggagatatcctcgcaattcattcaccggcgatccatgccgatcaactcggcacaaagttga |
794 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607507 |
cacgtggtggggccaacaattctccccctccagccaaagggagatatcatcgcaattcattcacctgcgatccatgccgaacaactcggcacaaagttga |
28607606 |
T |
|
| Q |
795 |
agcttttcacgtgctacaactttcgtcaacatatccgc-ggatttttatcggtgtgaatcttttcccacataaatttgttgttcttccgctgcttgacgc |
893 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607607 |
agcttttcacgtgctacaactttcgtcaacatattcgcgggatttttatcggtgtgaatcttttccaacataaa-ttgttgttcttccgctgcttgacgc |
28607705 |
T |
|
| Q |
894 |
a-ccaatgatatctgacatcaat |
915 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607706 |
agccaatgatatctgacatcaat |
28607728 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 310
Target Start/End: Original strand, 48826702 - 48827000
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnnttaacac |
107 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48826702 |
tgttgggatcgacgagcttaacgcaattgtaaattaaaatttcaaaattcaa--gagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatagaaaaag-aacac |
48826798 |
T |
|
| Q |
108 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48826799 |
caatatttaacgtggaaaatcctctaataccgagggaaaaatcacgggacaa-ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctt |
48826897 |
T |
|
| Q |
208 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
307 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48826898 |
cgctctcttacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagattcactcctatttgaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
48826997 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 283
Target Start/End: Original strand, 24726288 - 24726446
Alignment:
| Q |
122 |
gaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacaca |
221 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
24726288 |
gaaaaccatctaatatcaagggaaaagccacgagacaaactctgaaaaatattccattatattaaagaacataataatattctctccattctcttaccga |
24726387 |
T |
|
| Q |
222 |
cacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatttta |
283 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
24726388 |
cac--gagatacactatattgttttccgtgagacc-actcctattcaaatgttattatttta |
24726446 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Original strand, 48708155 - 48708256
Alignment:
| Q |
106 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||| || |||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48708155 |
accaatatttaacatgaaaaactctataatactaagagaaaaaccacgtgacaaactccaaaaaatatttcattatattaaaaaatattacaatattctc |
48708254 |
T |
|
| Q |
206 |
tc |
207 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
48708255 |
tc |
48708256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 451
Target Start/End: Original strand, 24726535 - 24726634
Alignment:
| Q |
352 |
acactctatttttcctctcacacacttctacacacagaaactttgtattttcacttctgcttcattgatttcattccttcaagtacccctctatttatag |
451 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24726535 |
acactctatcttttcattcatacacttctacagacagaagctttgtatttcaacttcttcttagatgctttccttccttcaaatacccctcaatttatag |
24726634 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 451; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 15290594 - 15289895
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaa-gagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnntt-aac |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| |
|
|
| T |
15290594 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaattgtaaattaaaatttcaaaatccaaaaagagattggatcttgcagcgcagccttagcgataaaaaaaatgaac |
15290495 |
T |
|
| Q |
106 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290494 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggtataaaccacgggacaaactccaaaagattttccactatatttaagaatattacaatattctc |
15290395 |
T |
|
| Q |
206 |
tccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290394 |
tccactctcttacacacacaagagatacaatatagtgtttcc-gtgagacccactcctattcgaatgctattatttca--gcacctagaagttatagaga |
15290298 |
T |
|
| Q |
306 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacagaaacttt---gtatttt |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
15290297 |
tgatacccacccggtgtatttttcc-acactttctggatttagtcaacactctatt------ctcacacacttctacacacagaagcttttttgtatttt |
15290205 |
T |
|
| Q |
403 |
cacttctgcttcattgatttcattccttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaa |
502 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
15290204 |
cacttctgctacgatgctttcattccttcaagtacccctctatttatagaggaaatcagttgatgaagagttaaatgctatgcatttctttcacaccaaa |
15290105 |
T |
|
| Q |
503 |
gtcatgtccttaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctgtgtgtgttctctgtacaatctatacatagccaaa |
602 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290104 |
gtcatgtcttcaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctatacatagccaaa |
15290005 |
T |
|
| Q |
603 |
ctatttgaaaggaaaaactaagccatgcatttaatgtgtagaagaatttgacaattgcttgttgcaattttccttttggctggaacataccccacgtggt |
702 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
15290004 |
ctatttgaaaggaaaaactaagccatgcatttaatgtgtagaagactttgacaattgcttgttgcaattttccttttggctggaacatgtcccacatggt |
15289905 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 415
Target Start/End: Original strand, 37040426 - 37040836
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnntt-aaca |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
37040426 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaaca |
37040525 |
T |
|
| Q |
107 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37040526 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattttct |
37040625 |
T |
|
| Q |
207 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37040626 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgttttccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
37040725 |
T |
|
| Q |
307 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttct--acacacagaaactttgtattttca |
404 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37040726 |
gatacccacccgatgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttca |
37040825 |
T |
|
| Q |
405 |
cttctgcttca |
415 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
37040826 |
cttctgcttca |
37040836 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 356 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 15302960 - 15302602
Alignment:
| Q |
356 |
tctatttttcctctcacacacttctacacaca--gaaactttgtattttcacttctgcttcattgatttcattccttcaagtacccctctatttataggg |
453 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15302960 |
tctatttttgctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcaattctgcttcgatgctttcattccttcaagtacccctctatttatagag |
15302861 |
T |
|
| Q |
454 |
gaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactg |
553 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15302860 |
gaaatcagttgatgaagagttaaatgctatggactcctttcacacgaaagtcatgtcttcaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactg |
15302761 |
T |
|
| Q |
554 |
ctccaccgcaagctgtgtgtgttctctgtacaatctatacatagccaaactatttgaaaggaaaaactaagccatgcatttaatgtgtagaagaatttga |
653 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15302760 |
ctccactgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctatacatagccaaactatttgaaaggaaaatctaagccatgcatttaatgtgtagaagactttga |
15302661 |
T |
|
| Q |
654 |
caattgcttgttgcaattttccttttggctggaacataccccacgtggtgggaccaaca |
712 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15302660 |
caattgcttgttgcgattttccttttggctggaacatgccccacatggtgggaccaaca |
15302602 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12099362 - 12098960
Alignment:
| Q |
7 |
atgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnnttaaca |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | || | |
|
|
| T |
12099362 |
atgttgggctcgacgagtttaacgcgagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagatatgatcttgcagctcaccgatagcgataaaaa--tgaaaa |
12099265 |
T |
|
| Q |
107 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
206 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12099264 |
gcaatattttacgtgaaaaaccctctaatgacgaaggaaaaaccaagggacaaactccgaaaaaatttcaactatattaaagaatattacaatattctct |
12099165 |
T |
|
| Q |
207 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
306 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12099164 |
ccactctcttacacgcacaagagacacaatattgtgtttctagtgagactcactcctattcaaatgatattattttataacacctaaaagttatagagat |
12099065 |
T |
|
| Q |
307 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacagaaactttgtattttcact |
406 |
Q |
| |
|
||||| ||| | | |||||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12099064 |
gatactcactcaatctatttt--cgaga--ctctgaatttactcaacactctatttttcctttcacatacttctacacacaaaaactttgtagtttcact |
12098969 |
T |
|
| Q |
407 |
tctgcttca |
415 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
12098968 |
tctacttca |
12098960 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12082227 - 12081973
Alignment:
| Q |
158 |
aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacct |
257 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12082227 |
aaactccaaaaaatattccactatattaa-gaatattacaatattttctccactctcttacacggaaaagagatacaatatagtgtttctaatgagactc |
12082129 |
T |
|
| Q |
258 |
acttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactc |
357 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12082128 |
gctcctattcaaatgttattattttatagcgcctagaagttatagagataatacctacccgatatatttttccc-ctttttctggatttacccaacactc |
12082030 |
T |
|
| Q |
358 |
tatttttcctctcacacacttctacacacagaaactttgtattttcacttctgcttca |
415 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12082029 |
taattttctgatcacacacttctacaca-aaaaactttgtatcttcacttatgcttca |
12081973 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Original strand, 2757370 - 2757448
Alignment:
| Q |
167 |
aaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgttt |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2757370 |
aaaatattccactatatttaaaaatattgcactattctctccactctctttcacactcaagagatacaatatagtgttt |
2757448 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 12084752 - 12084668
Alignment:
| Q |
7 |
atgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcg |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
12084752 |
atgttgggctcaacgagcttaacacgagggtaaattaaaatttcaaaatccaatagacattggatcttgtagcgcaacggtagcg |
12084668 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 869 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 15300708 - 15300661
Alignment:
| Q |
869 |
ttgttgttcttccgctgcttgacgc-accaatgatatctgacatcaat |
915 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15300708 |
ttgttgttcttccgctgcttgaagcaaccaatgatatatgacatcaat |
15300661 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 655 - 705
Target Start/End: Original strand, 37041079 - 37041128
Alignment:
| Q |
655 |
aattgcttgttgcaattttccttttggctggaacataccccacgtggtggg |
705 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37041079 |
aattgcttcatgcatttttccttt-ggctggaacataccccacgtggtggg |
37041128 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 636
Target Start/End: Original strand, 29106877 - 29107505
Alignment:
| Q |
7 |
atgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnnttaaca |
106 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
29106877 |
atgttgggatcgaggagcttaatgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagattggatcttgcagcgcagcggtagcgttaaaaa--tgaaca |
29106974 |
T |
|
| Q |
107 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29106975 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
29107074 |
T |
|
| Q |
207 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
306 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
29107075 |
ccactctcttacacacacaagagatacaa-atagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttttagcacctagaagttataaagat |
29107173 |
T |
|
| Q |
307 |
gata-cccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctac--acacagaaactttgtattttc |
403 |
Q |
| |
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|||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |
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| T |
29107174 |
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29107271 |
T |
|
| Q |
404 |
acttctgcttcattgatttcattccttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaag |
503 |
Q |
| |
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||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
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| T |
29107272 |
acttctgcttcgatgctttcattccttcaagtacccctttatttatagaggaaatcagttgatgatgagttaaatgctatgcactccttttacgccaaag |
29107371 |
T |
|
| Q |
504 |
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602 |
Q |
| |
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| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
29107372 |
ttatgtcctcaatgtgtgaaaaactatattttatgtcatgttttcaaactgcttcaccacaagctatgtgtgttctctgaacaacctatacatagccaaa |
29107471 |
T |
|
| Q |
603 |
ctatttgaaaggaaaaactaagccatgcatttaa |
636 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29107472 |
ctatttgaaaggaaaaactaagccatgcatttaa |
29107505 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 528
Target Start/End: Original strand, 42910993 - 42911513
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnnttaacac |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | || | ||||| |
|
|
| T |
42910993 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtggaaattaaaattttaaaatccaaaagagattagatcttgcagcgcagcggcaacgataaaaa--tgaacac |
42911090 |
T |
|
| Q |
108 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911091 |
caatatttaacatggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaa-tattccactatatttaagaatattacaatattctctc |
42911189 |
T |
|
| Q |
208 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
307 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
42911190 |
cactctctcacacacacaaaagatacaatatagtgtttcccttgagacctacttctattctaatgctattattttatagcaccaagaagttatagagatg |
42911289 |
T |
|
| Q |
308 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttct--acacacagaaactttgt-attttca |
404 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |
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|
| T |
42911290 |
atacccacccagtgtattttttccacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttctacacacacagaagctttgtgtttttca |
42911389 |
T |
|
| Q |
405 |
cttctgcttcattgatttcattccttcaagtaccc-ctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaag |
503 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911390 |
cttctgcttcgatgctttcattccttcaagtaccctctctatttatagaggaaatcagcttat-aagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaag |
42911488 |
T |
|
| Q |
504 |
tcatgtccttaatgtgtgaaaacta |
528 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911489 |
tcatgtccttaatgtgtgaaaacta |
42911513 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 527 - 712
Target Start/End: Original strand, 42911787 - 42911978
Alignment:
| Q |
527 |
tatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctgtgtgtgttctctgtacaatctatacatagccaaactatttgaaaggaaaaactaagcc |
626 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42911787 |
tatattttatgtcatgctttcaaactgctccatcgcaagctatgtgtgttctctgcacatcctatacatagccaaactatttgaaaagaaaaactaagcc |
42911886 |
T |
|
| Q |
627 |
atgcat------ttaatgtgtagaagaatttgacaattgcttgttgcaattttccttttggctggaacataccccacgtggtgggaccaaca |
712 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911887 |
atgcatttacggttaatgtgtagaagactttgacaattgtttgttgcaattttccttttagctggaacataccccacgtggtgggaccaaca |
42911978 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Original strand, 38997231 - 38997320
Alignment:
| Q |
103 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
192 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38997231 |
aacagcaatattttacgtcgaaaaccctctaatatcgaacgaaaaactacgggacaaactccaaaaaataatccattatattaaagaata |
38997320 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 88
Target Start/End: Original strand, 38994699 - 38994779
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggta |
88 |
Q |
| |
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||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38994699 |
tgttgggcttgacgatcttaatgctagtgtaaattaaaattccaaaacccaaacaaaattggatcttgcagtgcagcggta |
38994779 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 38997138 - 38997193
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaga |
63 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38997138 |
tgttgggttcgaagggcttaatgcgggtgtaaattaaaattccagaatccaaaaga |
38997193 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 706 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 33811298 - 33811268
Alignment:
| Q |
706 |
accaacaattctccccctccagccaaaggga |
736 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33811298 |
accaacaattctccccctccagccaaaggga |
33811268 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 706 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 33816216 - 33816186
Alignment:
| Q |
706 |
accaacaattctccccctccagccaaaggga |
736 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33816216 |
accaacaattctccccctccagccaaaggga |
33816186 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12931040 - 12930631
Alignment:
| Q |
8 |
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107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
12931040 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacac |
12930941 |
T |
|
| Q |
108 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12930940 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
12930841 |
T |
|
| Q |
208 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
307 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12930840 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
12930741 |
T |
|
| Q |
308 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctaca--cacagaaactttgtattttcac |
405 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12930740 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcac |
12930641 |
T |
|
| Q |
406 |
ttctgcttca |
415 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12930640 |
ttctgcttca |
12930631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12935786 - 12935377
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnnttaacac |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
12935786 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaattcaaaagaaactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacac |
12935687 |
T |
|
| Q |
108 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12935686 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
12935587 |
T |
|
| Q |
208 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12935586 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttactctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
12935487 |
T |
|
| Q |
308 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctaca--cacagaaactttgtattttcac |
405 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12935486 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcac |
12935387 |
T |
|
| Q |
406 |
ttctgcttca |
415 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12935386 |
ttctgcttca |
12935377 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 649 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 12935141 - 12934875
Alignment:
| Q |
649 |
tttgacaattgcttgttgcaattttccttttggctggaacataccccac--gtggtgggaccaacaattctccccctccagccaaagggagatatcctcg |
746 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12935141 |
tttggcaattgcttgtagcaattgtc--tttggctgga-cataacccacacgtggtggggccaacaattctccccctccagccaaagggagatattctcg |
12935045 |
T |
|
| Q |
747 |
caattcattcaccggcgatccatgccgatcaactcggcacaaagttgaagcttttcacgtgctacaactttcgtcaacatatccgc-ggatttttatcgg |
845 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12935044 |
caattcattcacttgcgatccatgccgatcaactcggcacaaagttgaagcttttcacgtgctacaactttcgtcaacatatccgcgggatttttatcgg |
12934945 |
T |
|
| Q |
846 |
tgtgaatcttttcccacataaatttgttgttcttccgctgcttgacgc-accaatgatatctgacatcaat |
915 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12934944 |
tgtgaatcttttccaacataaa-ttgttgttctcccgctgcttgacgcaaccaatgatatctgacatcaat |
12934875 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 714 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 17123843 - 17123642
Alignment:
| Q |
714 |
ttctccccctccagccaaagggagatatcctcgcaattcattcaccggcgatccatgccgatcaactcggcacaaagttgaagcttttcacgtgctacaa |
813 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| | |||| |
|
|
| T |
17123843 |
ttctctccctcttgccaaaaggagatatcctcgga--tcattcaccttcgatccatgccgatcatctcggaataaatttgaagtttttcacaaacgacaa |
17123746 |
T |
|
| Q |
814 |
c-tttcgtcaacatatccgc-ggatttttatcggtgtgaatcttttcccacataaatttgttgttcttccgctgcttgacgc-accaatgatatctgaca |
910 |
Q |
| |
|
||| | |||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17123745 |
aattttgccaacatattcacaggatttttatcagtgtgaatctttttcaacataaa-ttgttgttcttccactgcttgacgcaaccaatgatatctgaca |
17123647 |
T |
|
| Q |
911 |
tcaat |
915 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
17123646 |
tcaat |
17123642 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 215
Target Start/End: Original strand, 26504945 - 26505055
Alignment:
| Q |
103 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatt |
202 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |
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|
| T |
26504945 |
aacatcaatatttaacgtg-aataccgtctaataacaaggcaaaa-ccacagtacaaactccaaaaaatattcaactataataaaaaatattacaatatt |
26505042 |
T |
|
| Q |
203 |
ctctccactctct |
215 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| |
|
|
| T |
26505043 |
ctttcaactctct |
26505055 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 34907503 - 34907094
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnnttaacac |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
34907503 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacac |
34907404 |
T |
|
| Q |
108 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907403 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
34907304 |
T |
|
| Q |
208 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907303 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
34907204 |
T |
|
| Q |
308 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctaca--cacagaaactttgtattttcac |
405 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34907203 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcac |
34907104 |
T |
|
| Q |
406 |
ttctgcttca |
415 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
34907103 |
ttctgcttca |
34907094 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 8539548 - 8539139
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnnttaacac |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||| |
|
|
| T |
8539548 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaattctaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtaac-aataaaaaatgaacat |
8539450 |
T |
|
| Q |
108 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8539449 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaagatattccactatatttaagaatattacaatattatctc |
8539350 |
T |
|
| Q |
208 |
cactctctcacacacacaagagatacaa---tatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagag |
304 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8539349 |
cactctcttacacacacaagagatacaatattatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgattgctattattttacagcacctaaaagttatagag |
8539251 |
T |
|
| Q |
305 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttct--acacacagaaactttgtatttt |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8539250 |
atgatacccatccgatgtatttttcccacactctctgaatttactgaacactatatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtatttt |
8539151 |
T |
|
| Q |
403 |
cacttctgcttc |
414 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
8539150 |
cacttctgcttc |
8539139 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 227 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 51302306 - 51302118
Alignment:
| Q |
227 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt |
326 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
51302306 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcgaatgcaattgttttatagcacctagaagttatagagatgattcccacccggtgtattt |
51302207 |
T |
|
| Q |
327 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctaca--cacagaaactttgtattttcacttctgctt |
413 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51302206 |
tatccacactctctggatttactcaatactctatttttcctcacacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttatgctt |
51302118 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 51303019 - 51302937
Alignment:
| Q |
8 |
tgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagc |
90 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51303019 |
tgttgggatcgacgagcttaatgcaagtgtaaattaaaatttcaaaatccaaaacagattggatcttgcagcgcagcggtagc |
51302937 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 51302342 - 51302304
Alignment:
| Q |
103 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgag |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51302342 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgag |
51302304 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 2100198 - 2100379
Alignment:
| Q |
7 |
atgttgggctcgacgggcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactgga-tcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnnttaac |
105 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || | ||||||| || || || | | ||| |
|
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| T |
2100198 |
atgttgggctcgacgagcttaacacaagtgtaaattaaaattccaaaattcataagagatttgaattttgcagcacaacgataatgataaaat--tgaac |
2100295 |
T |
|
| Q |
106 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
192 |
Q |
| |
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| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2100296 |
atcaatatttaaggtggaaaaccctttaataatgagcgaaaa---acggggcaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
2100379 |
T |
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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 2100723 - 2100771
Alignment:
| Q |
185 |
aaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaagagatac |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
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| T |
2100723 |
aaagaatattacaatattctctccactctcttacatacacaagagatac |
2100771 |
T |
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