View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4545-Insertion-1 (Length: 1050)

Name: NF4545-Insertion-1
Description: NF4545
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4545-Insertion-1
NF4545-Insertion-1
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (397-995)||(36222407-36223014)
chr7 (427-995)||(11279061-11279638)
chr7 (427-995)||(46846410-46846986)
chr7 (427-983)||(33312563-33313129)
chr7 (427-995)||(23759707-23760285)
chr7 (419-985)||(294425-294996)
chr7 (432-900)||(17863298-17863766)
chr7 (432-900)||(17866557-17867025)
chr7 (432-900)||(6966721-6967189)
chr7 (397-945)||(23107529-23108080)
chr7 (437-900)||(36843141-36843604)
chr7 (437-900)||(24782984-24783450)
chr7 (92-262)||(36223265-36223435)
chr7 (437-900)||(9765376-9765843)
chr7 (458-945)||(3862059-3862540)
chr7 (258-361)||(36223046-36223153)
chr7 (455-616)||(23313690-23313849)
chr7 (731-900)||(23313464-23313633)
chr7 (299-361)||(23107438-23107500)
chr7 (458-577)||(35773058-35773176)
chr7 (258-310)||(5796095-5796147)
chr7 (279-361)||(17601229-17601312)
chr7 (646-750)||(2719331-2719435)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (427-995)||(33574657-33575235)
chr5 (427-897)||(26712549-26713021)
chr5 (427-897)||(26982287-26982759)
chr5 (427-995)||(15532299-15532877)
chr5 (427-995)||(15542481-15543059)
chr5 (432-900)||(14616632-14617100)
chr5 (432-900)||(34405422-34405890)
chr5 (432-898)||(22159317-22159784)
chr5 (455-755)||(11989166-11989465)
chr5 (490-900)||(7650145-7650562)
chr5 (490-689)||(23993447-23993649)
chr5 (838-973)||(11988986-11989133)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (510-983)||(16294550-16295032)
chr2 (427-995)||(31527958-31528536)
chr2 (427-983)||(31626116-31626684)
chr2 (432-995)||(40017551-40018125)
chr2 (455-943)||(23673499-23673992)
chr2 (432-943)||(36326498-36327017)
chr2 (437-900)||(32575890-32576352)
chr2 (431-995)||(13709644-13710217)
chr2 (627-691)||(8426766-8426830)
chr2 (832-894)||(8427199-8427260)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (427-995)||(22626411-22626989)
chr3 (459-897)||(39563717-39564153)
chr3 (427-995)||(11138669-11139245)
chr3 (455-900)||(13979088-13979528)
chr3 (510-860)||(35366028-35366377)
chr3 (510-703)||(47411841-47412035)
chr3 (760-895)||(46731396-46731531)
chr3 (758-860)||(47412082-47412184)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (431-995)||(12171555-12172118)
chr4 (432-900)||(647407-647875)
chr4 (432-900)||(650679-651148)
chr4 (431-899)||(26062898-26063366)
chr4 (462-897)||(26060192-26060626)
chr4 (455-899)||(2541483-2541925)
chr4 (847-897)||(11649440-11649490)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (427-995)||(13017288-13017866)
chr6 (427-995)||(22247128-22247703)
chr6 (427-995)||(22221293-22221868)
chr6 (432-900)||(14790192-14790660)
chr6 (432-900)||(14795220-14795688)
chr6 (455-900)||(20527367-20527810)
chr6 (458-945)||(16883277-16883768)
chr6 (432-900)||(32704458-32704925)
chr6 (431-900)||(1838046-1838515)
chr6 (431-899)||(19664870-19665337)
chr6 (497-885)||(12983598-12983989)
chr6 (458-763)||(32426969-32427271)
chr6 (432-681)||(15534662-15534912)
chr6 (510-885)||(12980711-12981089)
chr6 (759-984)||(30978321-30978557)
chr6 (92-252)||(12986843-12986990)
chr6 (725-899)||(15534923-15535097)
chr6 (145-217)||(20544626-20544698)
chr6 (627-898)||(7769594-7769872)
chr6 (673-792)||(15538036-15538155)
chr6 (833-900)||(27649077-27649144)
chr6 (431-543)||(15537856-15537966)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (427-897)||(7199-7669)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (427-897)||(2260-2732)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (455-900)||(13492860-13493304)
chr1 (443-900)||(13495572-13496029)
chr1 (397-972)||(34065883-34066468)
chr1 (416-900)||(27282311-27282795)
chr1 (432-896)||(32506062-32506525)
chr1 (620-900)||(39546004-39546284)
chr1 (455-900)||(1936225-1936668)
chr1 (518-795)||(22104680-22104956)
chr1 (437-900)||(16190381-16190843)
chr1 (455-818)||(23990374-23990735)
chr1 (510-898)||(21152906-21153295)
chr1 (497-885)||(22456711-22457100)
chr1 (599-818)||(22453421-22453641)
chr1 (510-898)||(15296980-15297371)
chr1 (258-361)||(34065743-34065848)
chr1 (768-900)||(10764829-10764961)
chr1 (432-549)||(10759695-10759811)
chr1 (283-334)||(47643957-47644009)
chr1 (497-549)||(49147745-49147797)
chr1 (789-885)||(49147829-49147924)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (418-900)||(2807-3293)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (566-995)||(24284-24722)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (603-995)||(9606-10009)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (437-900)||(6014-6476)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (437-973)||(12575420-12575966)
chr8 (525-900)||(13096686-13097062)
chr8 (464-898)||(44007909-44008335)
chr8 (625-900)||(41778945-41779213)
chr8 (461-561)||(41779220-41779318)
chr8 (838-900)||(14418445-14418507)
chr8 (847-897)||(41836429-41836479)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (432-747)||(1-316)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (838-900)||(211-273)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 397 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 36223014 - 36222407
Alignment:
Q  397 gaacatgagtagctaaatttctttgtggctattcctgaggtgaatctgatgtaacctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa----atattca 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    |||||||    
T  36223014 gaacatgagtagctaaatttctttgtggttattcctgaggtgaatctgatgtaacctatgggaatcctaatttgttgaactc-tttgaatatcatattca 36222916  T
Q  493 ataaaagtttagtcttta-ttcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatc 591  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36222915 atgaaagtttagtctttaattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactagccctagctttatgaacatgcatattgatc 36222816  T
Q  592 atggaaattgaatgaccactaa-cctcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatg 690  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36222815 atggaaattgaatgaccactaaccctcgcttttaactctgaactagctaatagatttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatg 36222716  T
Q  691 acatagagattaatgttcttaaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggtt 790  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     |||||||||||||||||||| ||    
T  36222715 acatagagattaacgttcttaaatacttccaac-ggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcact-----ggagaattctaggtcaagagatt 36222622  T
Q  791 ggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgact 890  Q
     | || ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  36222621 aggtaaaattactaagttaatttgtagtgaaactaaataatcattgattgaactaggagtgaaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggact 36222522  T
Q  891 taaccata-----ctcaatcttct-aaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatgt--acaaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaa- 980  Q
    ||||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36222521 taaccatacttctctcaatcttctaaaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatgttagaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaat 36222422  T
Q  981 tttatacatcttttt 995  Q
    |||||||||| ||||    
T  36222421 tttatacatcctttt 36222407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Original strand, 11279061 - 11279638
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaacc-tgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279061 attcgtgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtttagtctttattcatattaccttgt 11279158  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttta 624  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  11279159 gcttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaacatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttta 11279258  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttcttaaatacttccaacg 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  11279259 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaacgttcattaatacctccaacg 11279358  T
Q  725 ggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaatt 824  Q
    | ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11279359 g-tttcagattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaatcctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaact 11279457  T
Q  825 aaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttct-aaaaccaat 918  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||     ||||||||||| |||||||||    
T  11279458 aaataatcatttattgaactaggagtgcaaattaccagaggagaacttcgaaagattcgaaggacttaaccatacttctctcaatcttctaaaaaccaat 11279557  T
Q  919 ctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcttttt 995  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11279558 ctttattcgtttttaatcagtttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattttatacatcctttt 11279638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 46846986 - 46846410
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaacc-tgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46846986 attcctgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtttagtctttattcatattaccttgt 46846889  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttta 624  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  46846888 gtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactattaaccctagctt---gaacatgcatattgatcatggaaattgaatgatcactaaccctgactttta 46846792  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc-ttaaatacttccaac 723  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || || || || ||||||    
T  46846791 actctgaactaagtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagattattattaggttatgacatagggattaacgatcttttaaaacctccaac 46846692  T
Q  724 gggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaat 823  Q
     | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  46846691 -gttttcgaattcagttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattattaggttaatctgtcgtgaaac 46846593  T
Q  824 taaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttct-aaaaccaa 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||     |||||| |||| ||||||||    
T  46846592 taaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatagaagaacttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaa 46846493  T
Q  918 tctttctttg-tttttaatcagtttat--gtacaaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcttttt 995  Q
    |||||  ||| |||||| |||||||||    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  46846492 tcttttattgttttttagtcagtttataataagaattcaactcaactgcctagggcaccaatataaattttatacatcctttt 46846410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 427 - 983
Target Start/End: Original strand, 33312563 - 33313129
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33312563 attcctgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactccattgaac-att-aatgaaaatttagtctttattcatattaccttgt 33312660  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttta 624  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  33312661 gtttaatgccttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctgactttta 33312760  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaac 723  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||||| |||  |    
T  33312761 actctgaactaggtaatatgtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttcttttaatacctccgcc 33312860  T
Q  724 gggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaat 823  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||     
T  33312861 gg-tttcgaattcatttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaaagattgggtagaattactaagttaattcgtcgtgaaac 33312959  T
Q  824 taaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat-----actca-atcttctaaaaccaa 917  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||      |||| || ||||||||||||    
T  33312960 taaataatcattgattgaattaggaaagcaaattaccataggagagcttcagaggattcgaaggacttaaccatttttctctcagattttctaaaaccaa 33313059  T
Q  918 tctttctttgtttttaa-tcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaattt 983  Q
    || ||  || ||||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33313060 tcctttattatttttaattccgtttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattt 33313129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 23760285 - 23759707
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23760285 attcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaac-att-aatgaaagtttagtttttattcatattactttgt 23760188  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttta 624  Q
    | ||| | | || |||| |||||| || ||| | ||  |||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  23760187 gcttagtaccttatgtacgtttatgatagactattaatcctagcgtcgtgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttta 23760088  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttcttaaatacttccaacg 724  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||| ||||| |    
T  23760087 actccgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgttaatacctccaatg 23759988  T
Q  725 ggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaatt 824  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23759987 gtttt-gaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctagggcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaact 23759889  T
Q  825 aaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttct--aaaacca 916  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||     ||| || ||||  |||||||    
T  23759888 aaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcgattttcttaaaaacca 23759789  T
Q  917 atctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23759788 attctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttt 23759707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 419 - 985
Target Start/End: Original strand, 294425 - 294996
Alignment:
Q  419 ttgtggctattcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatat 517  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || | || ||||||||    
T  294425 ttgtggttaatcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtataattttaattcatat 294522  T
Q  518 taccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-t 616  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||  || | || | |||| |||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| |    
T  294523 tactttatgtttaatgcttattgtatgtttatcatgaactattaactctagttttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccct 294622  T
Q  617 cccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaata 715  Q
      ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | || |    
T  294623 ggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttttgttaaaa 294722  T
Q  716 cttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgt 815  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||  ||||||||||    
T  294723 catccaac-agtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttatggggagaattctagttcaagagattgggtataattactttgttaatctgt 294821  T
Q  816 cgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttcta 910  Q
    |||  ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||     |||||| |||||    
T  294822 cgttgaattagataatcattgattgcattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaagacttaaccatacttctctcaattttcta 294921  T
Q  911 aaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatg-tacaaatcaactcactgcctagggcaccaatataaatttat 985  Q
    ||||||||| || |||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  294922 aaaccaatccttatttgcttttaaccagcttatgttacaaaacaact-actgcctcgggcatcaatataaatttat 294996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 432 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 17863766 - 17863298
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||| || ||||||||||| || |||||     
T  17863766 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-cattgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttt 17863669  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactct 629  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | || ||| |||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  17863668 atgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactct 17863569  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtt 728  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || || |||||||| ||    
T  17863568 gatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgg-tt 17863470  T
Q  729 tcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaat 828  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||    
T  17863469 tcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagat 17863370  T
Q  829 aatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  17863369 aatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatact 17863298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 432 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 17867025 - 17866557
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||| || ||||||||||| || |||||     
T  17867025 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-cattgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttt 17866928  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactct 629  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | || ||| |||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  17866927 atgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactct 17866828  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtt 728  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || || |||||||| ||    
T  17866827 gatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgg-tt 17866729  T
Q  729 tcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaat 828  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||    
T  17866728 tcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagat 17866629  T
Q  829 aatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | || |||||||||    
T  17866628 aatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtctaaaccatact 17866557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 432 - 900
Target Start/End: Original strand, 6966721 - 6967189
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||| || ||||||||||| || |||||     
T  6966721 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-cattgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttt 6966818  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactct 629  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| || || | ||||| | || ||| |||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  6966819 atgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatattcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactct 6966918  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtt 728  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || || |||||||| ||    
T  6966919 gatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgg-tt 6967017  T
Q  729 tcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaat 828  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||| ||| || ||    
T  6967018 tcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactttgttaatctatcgttaaactagat 6967117  T
Q  829 aatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  6967118 aatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatact 6967189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 397 - 945
Target Start/End: Original strand, 23107529 - 23108080
Alignment:
Q  397 gaacatgagtagctaaatttctttgtggctattcctgaggtgaatctgatgtaacctg-tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaata 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    || || ||||| |||||||| ||  | | ||||||   |||||||||||||||||| |  |||||     
T  23107529 gaacatgagtagctaaatttctttgtggttgagacttagatgaatttgatgtaatcttatagaaaccct---ttgttgaactcctttgaatt--tcaatg 23107623  T
Q  496 aaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatgg 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| | ||||||| ||||| ||||||  | |    
T  23107624 aaagtttagtctttattcatattactttttgtttaatgctttttgcatgtttatcatcgactattaaccctaacgttatgaatatgcaaattgatagtag 23107723  T
Q  596 aaattgaatgaccactaacctcc-cttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacat 694  Q
    | |||||||||||||| |||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23107724 agattgaatgaccactgacccagacttttgactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacat 23107823  T
Q  695 agagattaatgttctta-aatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttgga 793  Q
    || |||||| ||||||  ||||| || |||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||   ||||     
T  23107824 agggattaacgttcttttaatacctcaaacaa-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattatagctcaaggaattggg 23107922  T
Q  794 tagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaa 893  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||    
T  23107923 tagagttactaagttaatctgttgtgaaactaaataatcattgtttgaactaggagtgcaaattaccataggagagcttcggatgattcgaaggtcttaa 23108022  T
Q  894 cca---tactc---aatcttctaaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatgt 945  Q
    |||   | |||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  23108023 ccacatttctctctaattttctaaaaccaatcttttattgtttttaattcgtttatgt 23108080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 437 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 36843604 - 36843141
Alignment:
Q  437 tgaatctgatgtaacct-gtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgct 535  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36843604 tgaatttgatgtaatcttgtgggaactctaatttgttgaactc-tttgaatg--tcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgtttaatgct 36843508  T
Q  536 ttttgtat-gtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaa-cctcccttttaactctgaac 633  Q
    |||| ||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| |    
T  36843507 ttttatattgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaatcctggcttttgactctgatc 36843408  T
Q  634 taggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcga 732  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || || |||||  ||||||||    
T  36843407 taggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaa-tggtttcga 36843309  T
Q  733 attcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatc 832  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| |  |||||||||||||  || || ||||||    
T  36843308 attcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttaatttgttaatctgtcgttgaactagataatc 36843209  T
Q  833 attgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  36843208 attgattgaagtaggagtgcgaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatact 36843141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 437 - 900
Target Start/End: Original strand, 24782984 - 24783450
Alignment:
Q  437 tgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgct 535  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| || || |||||||| || ||||| |||||    
T  24782984 tgaatctgatgtaatcctatgggaaccgtagtttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtctagttttaatccatattactttatgtttgatgct 24783081  T
Q  536 ttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaa-cctcccttttaactctgaact 634  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||    
T  24783082 ttttgtatgtttatcatcgactactaaccatagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatct 24783181  T
Q  635 aggtaataggtttaacctaag---taatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttc 730  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || |  |||||| ||||||    
T  24783182 aggtaataagtttaacctaagtaataatcaagctagagatatatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaatctccaac-ggtttc 24783280  T
Q  731 gaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataa 830  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||||| |||| ||| || ||||    
T  24783281 gaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtataattactttgttaatctctcgttaaactagataa 24783380  T
Q  831 tcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  24783381 tcattgattgaattaggaatgaaaattaccatatgagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatact 24783450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 92 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36223435 - 36223265
Alignment:
Q  92 agtcaatttgaataaattcttatctttgatttactgagtgaagtgatacattatagtgacattatttgaaagaaatcaaagaatgcttggccataggaaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36223435 agtcaatttgaataaattcttatctttgatttactgagtgaagtgatacattatagtgacatgatttgaaagaaatcaaagaatgcttggccataggaaa 36223336  T
Q  192 taaggtgatggccacgtgagcaactttttaagttggtgggagtataaataatgagacacaagatgatttgg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36223335 taaggtgatggccacgtgagcaactatttaagttggtgggagtaaaaataatgagacacaagatgatttgg 36223265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 437 - 900
Target Start/End: Original strand, 9765376 - 9765843
Alignment:
Q  437 tgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgct 535  Q
    ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||     
T  9765376 tgaatatgatgtaatcctatgagaaccctaatttgttgaacttctttgaa-tatg-aataaaagtctagtttttattcatattactttatgtttaatgcg 9765473  T
Q  536 ttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaact 634  Q
    ||||| |||||||  |||||| | || ||||||||||||| | ||||| |||||||      |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||  ||    
T  9765474 ttttgcatgtttaccatcgactattaaccctagctttatggatatgcaaattgatcg-----attgaatgaccactaaccctgacttttgactctggtct 9765568  T
Q  635 aggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaa 733  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| | | || || || ||  |||||||||    
T  9765569 aggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatgattattaggttatgacataaggactaatgttttgttaaaacctctaa-tggtttcgaa 9765667  T
Q  734 ttcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctg---------tcgtgaaatt 824  Q
    ||||||||||||||||| ||  | | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||  |||||||||         |||||||| |    
T  9765668 ttcacttaagagattaagggtattttacttgcagggagaattataggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgccgtgaaactcgtgaaact 9765767  T
Q  825 aaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  9765768 agataatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatact 9765843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 458 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 3862540 - 3862059
Alignment:
Q  458 gaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgacc 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||     
T  3862540 gaaccctaatttgttgaactccttt-aaatat-caatgaaagtctagtttttatttatatcatcttgtttttaatgctttgtgtatgtttattattgact 3862443  T
Q  558 actagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagt 656  Q
    ||||||||       || ||  |||| | || || | ||| || | |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  3862442 actagccc-------ataaatttgcagactggtcttagaacttaattgaccactaaccctggctttaaactctgaactaggtggtgtgtttaacctaagt 3862350  T
Q  657 aatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc--ttaaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaac--- 751  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| |  |  ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||        
T  3862349 aattaagctagagatagaaaattattaggttatgatatagggattaaaggacggttaaa-acttccaacagtttt-gaattcacttaagacattaattaa 3862252  T
Q  752 -gggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagt 850  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||  || || |||||||||  ||||| |||||||    
T  3862251 ggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttgaactagataatcatttcttgaattaggagt 3862152  T
Q  851 gcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact------caatcttctaaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatg 944  Q
    |        |||| |||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||       ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3862151 g--------cataggagaacttcgaaggattcgaaggtcttaatcatacttctctctaattttataaaaccaatcttttattgtttttaatcagtttatg 3862060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36223153 - 36223046
Alignment:
Q  258 tttgggaacagaggagc----gagagagagaagagctacggcatgcaaacaacaacaatgatttgaaacaaaattcaggagcaacgtcggcaacaatgaa 353  Q
    |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36223153 tttgggaacagaggagcacgagagagacagaagagctacggcatgcaaacaacaacaatgatttgaaacaaaattcaggagcaacgtcggcaacaatgaa 36223054  T
Q  354 attcttgg 361  Q
    ||||||||    
T  36223053 attcttgg 36223046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 455 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 23313849 - 23313690
Alignment:
Q  455 tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcg 554  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23313849 tgggaactctaatttgttaaactcctttgaa-tat-caatgaaagtctagtctttattcatgttactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcg 23313752  T
Q  555 accactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacct 616  Q
    || || | ||||||||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  23313751 actacaaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaacct 23313690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 731 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 23313633 - 23313464
Alignment:
Q  731 gaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataa 830  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||   |||||| ||| |||||  || ||||    
T  23313633 gaattcacttaagagattaaggggtttccacttgcggggagaattctaggccaagagattgggtagagttacagtgttaatatgttgtgaacctagataa 23313534  T
Q  831 tcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  23313533 tcattgtttgaattagtagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatact 23313464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 299 - 361
Target Start/End: Original strand, 23107438 - 23107500
Alignment:
Q  299 caaacaacaacaatgatttgaaacaaaattcaggagcaacgtcggcaacaatgaaattcttgg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23107438 caaacaacaacaatgatttgaaagaaaattcaggagcaacgtcggcaacaatgaaattcttgg 23107500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 458 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 35773176 - 35773058
Alignment:
Q  458 gaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgta-tgtttataatcgac 556  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  35773176 gaactctaatttgttgaactcatttgaatg--tcaatgaaagtttagtttttattcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcaac 35773079  T
Q  557 cactagccctagctttatgaa 577  Q
     |||| ||||| |||||||||    
T  35773078 tactaaccctaactttatgaa 35773058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Original strand, 5796095 - 5796147
Alignment:
Q  258 tttgggaacagaggagcgagagagagaagagctacggcatgcaaacaacaaca 310  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5796095 tttgggaacagaggagcacgagagagaagagctacggcatgcaaacaacaaca 5796147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 361
Target Start/End: Original strand, 17601229 - 17601312
Alignment:
Q  279 gagagaagagctacggcatgc-aaacaacaacaatgatttgaaacaaaattcaggagcaacgtcggcaacaatgaaattcttgg 361  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  17601229 gagagaagagctacagcatgccaaacaacaaggatgattagaaagaaatttcaggagcaacatcggcaacaaggaaactcttgg 17601312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 646 - 750
Target Start/End: Original strand, 2719331 - 2719435
Alignment:
Q  646 ttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaaga 744  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||||  || ||||||| | ||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2719331 ttaacttaattaattaagctagagatagacaattgttaagttatgatttatagattaacgatctataaaaacctccaacggtttt-gaattcacttaaga 2719429  T
Q  745 gattaa 750  Q
    ||||||    
T  2719430 gattaa 2719435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Original strand, 33574657 - 33575235
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaacc-tgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33574657 attcctgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaca--tcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgt 33574754  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttta 624  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  33574755 gtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctaactttta 33574854  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc-ttaaatacttccaac 723  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| || ||||| |||||     
T  33574855 actctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacattcgtttaatacctccaat 33574954  T
Q  724 gggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaat 823  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  33574955 gg-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctagatcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaac 33575053  T
Q  824 taaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttct-aaaacca 916  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||     |||||| |||| |||||||    
T  33575054 taaataatcattgattgtaattaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaacca 33575153  T
Q  917 atctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33575154 attctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttt 33575235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 427 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 26713021 - 26712549
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaacctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtg 526  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26713021 attcctgagataaatctgatgtaatcctacggaaccctaatttgttgaactcctttgaaca--tcaatgaaagtttagtctttattcatattaccttgtg 26712924  T
Q  527 tttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaa 625  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  26712923 tttaatgctttatgtatgtttatcattgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 26712824  T
Q  626 ctctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcat---tattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttcca 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||    
T  26712823 ctctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctcca 26712724  T
Q  722 acgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaa 821  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26712723 acgg-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaa 26712625  T
Q  822 attaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat 897  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26712624 actaaataatcattgattgaattaggagtgcaaattatcataggagagcgtcggaggattcgaaagacttaaccat 26712549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 427 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 26982759 - 26982287
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaacctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtg 526  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982759 attcctgagataaatctgatgtaatcctacggaaccctaatttgttgaactcctttgaaca--tcaatgaaagtttagtctttattcatattaccttgtg 26982662  T
Q  527 tttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaa 625  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  26982661 tttaatgctttatgtatgtttatcattgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 26982562  T
Q  626 ctctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcat---tattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttcca 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||    
T  26982561 ctctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctcca 26982462  T
Q  722 acgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaa 821  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982461 acgg-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaa 26982363  T
Q  822 attaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat 897  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26982362 actaaataatcattgattgaattaggagtgcaaattatcataggagagcgtcggaggattcgaaagacttaaccat 26982287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 15532877 - 15532299
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaacc-tgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  15532877 attcatgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaca--tcaatgaaagtttagtttttattcttattactttgt 15532780  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttta 624  Q
    | ||||||| || |||| |||||| || ||| | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  15532779 gcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttta 15532680  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttcttaaatacttccaacg 724  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||| ||||  |    
T  15532679 actctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgttaatacctccattg 15532580  T
Q  725 ggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaatt 824  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15532579 g-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaact 15532481  T
Q  825 aaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttct--aaaacca 916  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||| |||  || |||||||| ||||||||||||     |||||| ||||  |||||||    
T  15532480 aaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttcttaaaaacca 15532381  T
Q  917 atctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15532380 attctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttt 15532299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 15543059 - 15542481
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaacc-tgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  15543059 attcatgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaca--tcaatgaaagtttagtttttattcttattactttgt 15542962  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttta 624  Q
    | ||||||| || |||| |||||| || ||| | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  15542961 gcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttta 15542862  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttcttaaatacttccaacg 724  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||| ||||  |    
T  15542861 actctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgttaatacctccattg 15542762  T
Q  725 ggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaatt 824  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15542761 g-tttcgaattcacttaagagatcaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaact 15542663  T
Q  825 aaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttct--aaaacca 916  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||| |||  || |||||||| ||||||||||||     |||||| ||||  |||||||    
T  15542662 aaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttcttaaaaacca 15542563  T
Q  917 atctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15542562 attctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttt 15542481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 432 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 14617100 - 14616632
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||| || ||||||    
T  14617100 tgagatgaatatgatgtaatcctatgagaaccctagtttgttgaactccttt-aaatat-caatgaaagtctagttttaattcatattactttatgttta 14617003  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactct 629  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  14617002 atgctttttgtatgtttatcatcgaatactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccatggcttttgactct 14616903  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtt 728  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | | || || |||||||| ||    
T  14616902 gatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttttgttaaaacctccaacgg-tt 14616804  T
Q  729 tcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaat 828  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||    
T  14616803 tcgaattcactcaagagattaagggcttgtcacttgcggggagaattataggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagat 14616704  T
Q  829 aatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  14616703 aatcattgattgaattaggagtgaaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatact 14616632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 432 - 900
Target Start/End: Original strand, 34405422 - 34405890
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||| || ||||||||||| || |||||     
T  34405422 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-cattgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttt 34405519  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactct 629  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | || ||| |||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  34405520 atgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactct 34405619  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtt 728  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  || || |||||||| ||    
T  34405620 gatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgagatagggattaacgttcttttaaaacctccaacggttt 34405719  T
Q  729 tcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaat 828  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||    
T  34405720 t-gaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcgaggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagat 34405818  T
Q  829 aatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| | ||||||||||||    
T  34405819 aatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggatttgaaggtcttaaccatact 34405890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 432 - 898
Target Start/End: Original strand, 22159317 - 22159784
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22159317 tgagatgaatccgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatg--tcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgttta 22159414  T
Q  531 atgctttttgtat-gtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactc 628  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||| || || ||||||  | || |||||||||||| ||||| |  ||||| ||||    
T  22159415 atgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccatagctttatgaatatacaaattgatgttagagattgaatgaccattaaccctggcttttgactc 22159514  T
Q  629 tgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggt 727  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || || |||||  |||    
T  22159515 tgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaaactagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaa-tggt 22159613  T
Q  728 ttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaa 827  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||||| ||||  || || |    
T  22159614 ttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgtggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctatcgttgaactaga 22159713  T
Q  828 taatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata 898  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||    
T  22159714 tagtcattgattgaactaggagtgcgatttaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccata 22159784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 455 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 11989465 - 11989166
Alignment:
Q  455 tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcg 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11989465 tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtctagtttttattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcg 11989368  T
Q  555 accactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaaccta 653  Q
    || |||| ||||||||||||||| || || ||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11989367 actactaaccctagctttatgaatatacaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccttcgcttttgactctgatctaggtattaggtttaaccta 11989268  T
Q  654 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacg 752  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11989267 tgtaatcaagttagagatagatcattattaggttttaacatagagattaacgttctattaaaacctccaac-ggtttcgaattcacttaagagattaagg 11989169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 490 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 7650562 - 7650145
Alignment:
Q  490 tcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattga 589  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  7650562 tcaatgaaagtctagtctttattcatgttactttatgtttaatgttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctaactttatgaatatgcaaattga 7650463  T
Q  590 tcatggaaattgaatgaccactaacctcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcatta--------- 680  Q
    || | || ||||||| |||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||             
T  7650462 tcttagagattgaataaccactaac--cgcttttgactcagaactaggtaataagtttaacctaaaaaatcaagctagagatagatcattattaggttat 7650365  T
Q  681 ttaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctag 779  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||| | || || |||| | | ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7650364 ttaggttatgacatagggattaaccttctattaaaacctccagc-gatttcgaattcactcaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctag 7650266  T
Q  780 gtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaaga 879  Q
    || ||||| |||  |||||||||   |||||||| || | ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  7650265 gtaaagagattgagtagaattaccttgttaatctatctttaaactagataatcattgattgaattaggagtgcaaattaccatagaagaacttcgtagga 7650166  T
Q  880 ttcgaatgacttaaccatact 900  Q
    ||| |||| ||||||||||||    
T  7650165 ttcaaatgtcttaaccatact 7650145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 490 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 23993649 - 23993447
Alignment:
Q  490 tcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccacta---gccctagctttatgaaaatgcatat 586  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| || ||| ||||   || ||||| |  ||||  |  | ||    
T  23993649 tcaataaaaatatagt-tttattcatatttccttatgtttaatgttgtttgtatgtttatgattgactactactagcactagcatcttgaatgtatagat 23993551  T
Q  587 tgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattagg 685  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||| || |  ||||| | ||||| ||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  23993550 tgatcttagaacttgaatgaccactagccatgacttttgaatctgatctaggaaatatggttaacctaagaaattaagctagagatagacaattattagg 23993451  T
Q  686 ttat 689  Q
    ||||    
T  23993450 ttat 23993447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 838 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 11989133 - 11988986
Alignment:
Q  838 ttgaactaggagtgcaaattaccatat--gagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact------caatcttctaaaaccaatctttctttgtt 929  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||||       ||| |||||||| ||||||||  | |||    
T  11989133 ttgaactaggagtgcaaattaccatataggagaactttggaggattcgaaggtcttaaccttacttctctctaattttctaaaatcaatcttttatcgtt 11989034  T
Q  930 tttaatcagtttatgt---acaaatcaactc-actgcctagggcacca 973  Q
    ||||||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11989033 tttaatctgtttatgttacaaaaatcaactcaactgcctaggggacca 11988986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 304; Significance: 1e-170; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 510 - 983
Target Start/End: Original strand, 16294550 - 16295032
Alignment:
Q  510 attcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgacca 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16294550 attcatattaccttgtgtttaatgctttgtgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 16294649  T
Q  610 ctaac-ctcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc 708  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16294650 ctaactctggcttttaactctgaactatgtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttc 16294749  T
Q  709 ttaaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagtt 808  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16294750 tttaatacctccaacgg-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 16294848  T
Q  809 aatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact-----caa 903  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     |||    
T  16294849 aatctgtcgtgaaactaaataatcattgattaaactaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaa 16294948  T
Q  904 tcttct-aaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaattt 983  Q
    | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16294949 ttttctgaaaactaatctttatttgtttttaatcggtttatgatacaaaatcaactcaactgcctagggcatcaatataaattt 16295032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Original strand, 31527958 - 31528536
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  31527958 attcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaca--tcaatgaaagtttagtttttattcttattactttgt 31528055  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttta 624  Q
    | ||||||| || |||| |||||| || ||| | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  31528056 gcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttta 31528155  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttcttaaatacttccaacg 724  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||| ||||  |    
T  31528156 actctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgttaatacctccattg 31528255  T
Q  725 ggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaatt 824  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31528256 g-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaact 31528354  T
Q  825 aaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttct--aaaacca 916  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||| |||  || |||||||| ||||||||||||     |||||| ||||  |||||||    
T  31528355 aaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttcttaaaaacca 31528454  T
Q  917 atctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31528455 attctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttt 31528536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 427 - 983
Target Start/End: Original strand, 31626116 - 31626684
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctt--tattcatattacctt 523  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    | || || |  ||||||||||||| |    
T  31626116 attcttgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tataca-tattgatgtaatcctactattcatattaccct 31626213  T
Q  524 gtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttt 622  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  31626214 gtgtttaatgttttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatacatattgattatagaaattgaatgaccactaaccctggcttt 31626313  T
Q  623 taactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttcca 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||  ||||| ||||    
T  31626314 taactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttataacataaggattaacgttcttttaatacctcca 31626413  T
Q  722 acgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaa 821  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31626414 acga-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaa 31626512  T
Q  822 attaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat-----actca-atcttctaaaacc 915  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||      |||| || ||||||||||    
T  31626513 actaaataataattgattgaattaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaatgacttaaccattcttctctcagattttctaaaacc 31626612  T
Q  916 aatctttctttgtttttaa-tcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaattt 983  Q
    |||| ||  || ||||||| ||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31626613 aatcctttattatttttaattccttttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattt 31626684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 432 - 995
Target Start/End: Original strand, 40017551 - 40018125
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40017551 tgagatgaatatgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatt--tcaatgaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 40017648  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccact-aacctcccttttaactct 629  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||| | |||  ||||| ||| |    
T  40017649 atgctttttgtatgtttatcatcgactactgaccctatctttatgaatatgcaaattgatcgtagagattgaatgaccactgaccctggcttttgacttt 40017748  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc-ttaaatacttccaacgggtt 728  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||| || ||||| ||||||  |||    
T  40017749 gaactaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggtcatgacatatgaattaacgttcttttaatacctccaac-agtt 40017847  T
Q  729 tcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaa---tta 825  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| |||| |||||||||||||| |||    ||    
T  40017848 tcgaattcacttaagagaataa-gggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaaggattggggagaagtactgagttaatctgtcgtaaaacttata 40017946  T
Q  826 aataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaa-tcttctaaaaccaatc 919  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| | ||||||||||     ||||| | |||| |||||| ||    
T  40017947 aataatcattggttgaattaggagtgcaaattaccataggagagtttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctcaatttttcttaaaccagtc 40018046  T
Q  920 tttctttgtttttaatcagtttatg-tacaaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcttttt 995  Q
    | |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  40018047 tcttattgtttttaatccgtttatgttacaaatcaactcaactgcctagggcatcaatataaattttatacatcctttt 40018125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 455 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 23673992 - 23673499
Alignment:
Q  455 tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcg 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23673992 tgggaaccttaatttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcg 23673895  T
Q  555 accactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaaccta 653  Q
    || |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23673894 actactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactatccctgacttttgactctgatctaggtaataagtttaaccta 23673795  T
Q  654 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacg 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || || |||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  23673794 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaactg-tttcgaattcacttaagagattaagg 23673696  T
Q  753 ggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgc 852  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  23673695 ggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatttgtcgttaaactagataatcattgattgaattaggagtgc 23673596  T
Q  853 aaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatac-tc-----aatcttctaaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttat 943  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||     ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||    
T  23673595 aaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacatctctctaattttctaaaaccaaacttttattgtttttaatccgtttat 23673499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 432 - 943
Target Start/End: Original strand, 36326498 - 36327017
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||| || ||||||||||| || ||||||    
T  36326498 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcatttgaa-tat-caatgaaagtctagttttaattcatattactttatgttta 36326595  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactct 629  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||| | || |||||||||||||||||| |  ||||| ||| |    
T  36326596 atgctttttgt--gtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaatcgatcttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgacttt 36326693  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtt 728  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||| ||||||  |||    
T  36326694 gatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggctatgacacagggattaacgttctgttaatacctccaac-agtt 36326792  T
Q  729 tc----gaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaatt 824  Q
    ||     ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  36326793 tcaaattaattcacttaagagattaaggagttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctatcgttaaatt 36326892  T
Q  825 aaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatac-tc-----aatcttctaaaaccaat 918  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||     ||| ||||||||||||     
T  36326893 agataatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatacatctctctaattttctaaaaccaaa 36326992  T
Q  919 ctttctttgtttttaatcagtttat 943  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||    
T  36326993 cttttattgtttttaatccgtttat 36327017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 437 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 32576352 - 32575890
Alignment:
Q  437 tgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgct 535  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  32576352 tgaatatgatgtaatcctataggaaccctaatttgttgaactcctttgaatt--tcaatgaaagtttagtctttatccatattactttttgtt-aatgct 32576256  T
Q  536 ttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaact 634  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||   |||| ||||||||| ||||| ||||||| |  | ||||||||| |||| ||| |  ||||| ||| ||||||    
T  32576255 ttttgcatgtttatcattgactactgatcctaactttatgaatatgcaaattgatcgtatagattgaatgatcactgaccctgtcttttgactatgaact 32576156  T
Q  635 aggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtttcgaa 733  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||   |||||||    
T  32576155 aggtaatatgtttaacctaaataatcaagctaaagatagatctttattaggttacgacatagggattaacgttcttttaatacctccaacaa-tttcgaa 32576057  T
Q  734 ttcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatca 833  Q
    |||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32576056 ttcagtcaagagattaaggggttgtcacttgtggggagaattctaggtcaagggatttggtagagttactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatca 32575957  T
Q  834 ttgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  32575956 ttttttgaactaggagtgcaaattatcataggagagcttcggaggattcgaaggtcttaaccatact 32575890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 431 - 995
Target Start/End: Original strand, 13709644 - 13710217
Alignment:
Q  431 ctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttt 529  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |     ||||| |||| ||||| || | || ||||||||||| || |||||    
T  13709644 ctgagatgaatctgatgtaatcctatgtgaaccctaatttgttgaacttcaag--aatat-caatgaaagtctaattttaattcatattactttatgttt 13709740  T
Q  530 aatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaa-cctcccttttaactc 628  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| | || |||||||||||||||| |||   |||| ||||    
T  13709741 aatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgtaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggattttgactc 13709840  T
Q  629 tgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggt 727  Q
    ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | || || |||||| | |    
T  13709841 tgacctaggtgataagtttaacccaagtaatcaagctagatatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttttgttaaaacctccaac-gat 13709939  T
Q  728 ttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaa 827  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||  |||||||||| ||  || || |    
T  13709940 ttcgaattcactaaagagattatggggttgtcacttgaggggagaattatgggtcaagagatcgggtagaattactttgttaatctgttgttgaactaga 13710039  T
Q  828 taatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaac-ttcggaagattcgaatgacttaaccatact------caatcttctaaaaccaatct 920  Q
    |||||||||  | || ||||||||||||||| |||| |||| | ||| || |||| ||| | ||||||||||||       ||| |||||||||||||||    
T  13710040 taatcattgcctaaattaggagtgcaaattatcataggagagctttcagatgatttgaaggtcttaaccatacttctctcaaattttctaaaaccaatct 13710139  T
Q  921 ttctttgtttttaatcagtttatg-tacaaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcttttt 995  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  13710140 tttattgtttttaatccgtttatgttacaactcaactcaacttcctcaggcatcaatataaattttatacatcctttt 13710217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 627 - 691
Target Start/End: Original strand, 8426766 - 8426830
Alignment:
Q  627 tctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatga 691  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8426766 tctgatctaggaaacatgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatga 8426830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 832 - 894
Target Start/End: Original strand, 8427199 - 8427260
Alignment:
Q  832 cattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaac 894  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8427199 cattgattgaac-aggggtgcaaattaccaaataagaacatcggatgattcgaatgtcttaac 8427260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 22626989 - 22626411
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22626989 attcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaca--tcaatgaaagtttagtttttattcatattactttgt 22626892  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttta 624  Q
    | ||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  22626891 gcttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttta 22626792  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagata-gatcattattaggttatgacatagagattaatgttc-ttaaatacttccaa 722  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||| |||||    
T  22626791 actctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagataagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaa 22626692  T
Q  723 cgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaa 822  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22626691 tgg-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattggatagaattactaagttaatccgtcgtgaaa 22626593  T
Q  823 ttaaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttctaaaacca 916  Q
     ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||     |||||| ||||||| |||    
T  22626592 ctaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttctaaatcca 22626493  T
Q  917 atctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22626492 attctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttt 22626411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 459 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 39564153 - 39563717
Alignment:
Q  459 aaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgacca 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |    
T  39564153 aaccctaatttgttgaactcctttgaac-att-aatgaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcattgacta 39564056  T
Q  559 ctagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagta 657  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39564055 ttaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctgacttttaa-tctgaactaggtaataggtttaacctaagta 39563957  T
Q  658 atcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggtt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39563956 atcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctccaacgg-tttcgaattcacttaagagattaaggggtt 39563858  T
Q  757 atcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaat 856  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  39563857 gtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataaccattgattgaattaggagtgcaaat 39563758  T
Q  857 taccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat 897  Q
    || |||| |||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  39563757 tatcataggagagcgtcggaggattcgaaggacttaaccat 39563717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 11139245 - 11138669
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11139245 attcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaca--tcaatgaaagtttagtttttattcatattactttgt 11139148  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttta 624  Q
    | ||||||| || ||||||||||| ||  || | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||    
T  11139147 gcttaatgccttatgtatgtttatgataaactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatggccactaaccctggctttta 11139048  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc-ttaaatacttccaac 723  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||| ||| |     
T  11139047 actctgaaatag-taataggtttaacctcagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctcctat 11138949  T
Q  724 gggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaat 823  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  11138948 gg-tttcgaattcacttaagagattaaggagttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattggatagaattactaagttaatccgtcgtgaaac 11138850  T
Q  824 taaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttctaaaaccaa 917  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||     |||||| |||| || ||||    
T  11138849 taaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttctgaatccaa 11138750  T
Q  918 tctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    |  |   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11138749 ttctatattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttt 11138669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 455 - 900
Target Start/End: Original strand, 13979088 - 13979528
Alignment:
Q  455 tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcg 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||   ||| ||||    
T  13979088 tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatt--taaatgaaagtttagtcttttttcatattactttttgtttaatgtttttcgtat---tatcatcg 13979182  T
Q  555 accactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaaccta 653  Q
    || |||  |||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||| ||| |  ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13979183 actactgaccctagctttatgaaa-tgcaaattgatcgtagagattgaatgaccactgaccctgactttcgactctgaactaggtaatagttttaactta 13979281  T
Q  654 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacg 752  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  13979282 agtaatcaagttggagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctcgaacga-tttcgaattcacttaagagattaaga 13979380  T
Q  753 ggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgc 852  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13979381 ggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagggattggatagagttactaagttaatctgtcatgaaactaaataatcattgtttgaacttggagtgc 13979480  T
Q  853 aaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  13979481 aaattaccataggagagcttcggaggattcaaaggtcttaaccatact 13979528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 510 - 860
Target Start/End: Original strand, 35366028 - 35366377
Alignment:
Q  510 attcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgacca 609  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||| |||||| ||||| |  ||||  |||| ||||||| |  || |||||||||||    
T  35366028 attcatattaccttgtgtttaatgttgttt-tatgtttattattgactactagcactagcatcgtgaatgtgcaaattgatcttaaaacttgaatgacca 35366126  T
Q  610 ctaacctcc-cttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc 708  Q
    ||| |||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||  |  |||||| |  |    
T  35366127 ctagccttggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaattaagttagagatagaaaattattaggctatgactcatggattaacggac 35366226  T
Q  709 t-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagt 807  Q
    | | || || ||||| | || | |||||||||||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||    ||    
T  35366227 tgttaaaacctccaa-gagtcttgaattcacttaagagattaagggattgtcactcgcggagagagttctaggtcaagagattgagtagaattatcttgt 35366325  T
Q  808 taatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattacc 860  Q
    |||| |||||| |||||| || | ||||||||||| | || ||||||||||||    
T  35366326 taatttgtcgttaaattatatgaacattgattgaa-ttggggtgcaaattacc 35366377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 510 - 703
Target Start/End: Original strand, 47411841 - 47412035
Alignment:
Q  510 attcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgacca 609  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||  |||| ||| | ||||||| | ||| |||||||| ||    
T  47411841 attcatattaccttgtgtttaatgttgtttgtatgtttattattgactactagcactaacttcttgaatatgaaaattgatcttagaacttgaatgatca 47411940  T
Q  610 ctaa-cctcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaa 703  Q
    |||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| || ||||  |||||||||    
T  47411941 ctagtcctgccttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaattaagttagagatagaaaattattagattgtgactcagagattaa 47412035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 760 - 895
Target Start/End: Original strand, 46731396 - 46731531
Alignment:
Q  760 acttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattac 859  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||  |||||| ||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46731396 acttgcggggagaactccaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatatgtcgttgaactagataatcattgattgaattaggagtgcaaattac 46731495  T
Q  860 catatgagaacttcggaagattcgaatgacttaacc 895  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  46731496 catatgagaacttcggaggattcgaaggtcttaacc 46731531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 758 - 860
Target Start/End: Original strand, 47412082 - 47412184
Alignment:
Q  758 tcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaatt 857  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||    |||||||||| || |||||| || | ||||||||||| |  | |||||||||    
T  47412082 tcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgagtagaattatcgtgttaatctgttgttaaattagatgaacattgattgaattgtgggtgcaaatt 47412181  T
Q  858 acc 860  Q
    |||    
T  47412182 acc 47412184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 431 - 995
Target Start/End: Original strand, 12171555 - 12172118
Alignment:
Q  431 ctgaggtgaatctgatgtaacc-tgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttt 529  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12171555 ctgagatgaatctgatgtaaccctattggaacccaaatttgttgaactcctttgaaca--tcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgttt 12171652  T
Q  530 aatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactc 628  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||    
T  12171653 aatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaattc 12171752  T
Q  629 tgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc-ttaaatacttccaacgggt 727  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||| ||||| || |    
T  12171753 ttaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatgg-t 12171851  T
Q  728 ttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaa 827  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12171852 ttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattgtaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaa 12171951  T
Q  828 taatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatactcaatcttcta-aaacc-aatctttct 924  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||||||      |||||| ||||| |||||||      
T  12171952 taatcattgattgtatttaggagtgcaaattaccataggcgagcttcggaagattccaaggacttaaccata------cttctagaaaccaaatcttt-a 12172044  T
Q  925 ttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12172045 ttgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttt 12172118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 432 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 647875 - 647407
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||| || ||||||||||| || |||||     
T  647875 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-cattgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttt 647778  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactct 629  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | || ||| |||| ||||||||| |  ||||| |||||    
T  647777 atgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatggccactaaccctggcttttgactct 647678  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtt 728  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || || |||||||| ||    
T  647677 gatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgg-tt 647579  T
Q  729 tcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaat 828  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||    
T  647578 tcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagat 647479  T
Q  829 aatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||   ||||||||||||    
T  647478 aatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaagatcttaaccatact 647407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 432 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 651148 - 650679
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccc-taatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttt 529  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||| || ||||||||||| || |||||    
T  651148 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaacccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-cattgaaagtctagttttaattcatattactttatgttt 651051  T
Q  530 aatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactc 628  Q
     ||||||||||||||||||| || |    ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| | || ||| |||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  651050 tatgctttttgtatgtttatcattgtttcctaaccctaactttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatggccactaaccctggcttttgactc 650951  T
Q  629 tgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggt 727  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || || |||||||| |    
T  650950 tgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgg-t 650852  T
Q  728 ttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaa 827  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |    
T  650851 ttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactaga 650752  T
Q  828 taatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  650751 taatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatact 650679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 431 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 26063366 - 26062898
Alignment:
Q  431 ctgaggtgaatctgatgtaacc-tgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttt 529  Q
    ||||| ||||||| |||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26063366 ctgagatgaatctaatgtaatcatatgggaaccctgatttgttgaactcctttgaatg--tcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgttt 26063269  T
Q  530 aatgctttttgtat-gtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaact 627  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||||||||| |  ||||| |||    
T  26063268 aatgctttttgtattgtttatcatcgactaataaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgact 26063169  T
Q  628 ctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacggg 726  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| | || || |||||  ||    
T  26063168 ctgatctaggtaataggtt-aacctaagtaatcaagctagagattgatcattattaggttatgacatatggataaacgttctgttaaaacctccaa-tgg 26063071  T
Q  727 tttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaa 826  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||||||||||  || ||     
T  26063070 tttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactag 26062971  T
Q  827 ataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatac 899  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  26062970 ataatcattgattgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatac 26062898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 462 - 897
Target Start/End: Original strand, 26060192 - 26060626
Alignment:
Q  462 cctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccacta 561  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26060192 cctagtttgttgaactcttttgaa-tat-caataaaagtctagattttattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactacta 26060289  T
Q  562 gccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatc 660  Q
     ||||||||| ||||| || || ||||||| | || |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26060290 accctagcttcatgaatatacaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccatgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaacttaagtaatc 26060389  T
Q  661 aagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatc 759  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  26060390 aagctagagatagaccattattaggttatgacatagggattaacgttctattaaaacctccaacgg-tttcgaattcacttaagacattaaggggttgtt 26060488  T
Q  760 acttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattac 859  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||||| ||| |||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26060489 atttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctatcgggaagctagataatcattgcttgaattaggagtgcaaattac 26060588  T
Q  860 catatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat 897  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  26060589 cataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccat 26060626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 455 - 899
Target Start/End: Original strand, 2541483 - 2541925
Alignment:
Q  455 tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcg 554  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||   |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| || |    
T  2541483 tgggaactctaatttgttgaattcctttcatat---caataaaagtctagtttttattcatattatcttgtgtttaatgattttcgtatgtttattattg 2541579  T
Q  555 accactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacctcc-cttttaactctgaactaggtaataggtttaaccta 653  Q
    || || || |||||||| || |   ||||   ||||| | ||| |||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||   | ||||||||||    
T  2541580 actacaagtcctagcttgataagtttgcaggctgatcttagaacttgattgaccactaacaccggcttttaactctgaactaggtggaatgtttaaccta 2541679  T
Q  654 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacg 752  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| |  || | || || | ||| || ||| ||||||| |||||||||||| |    
T  2541680 agtaattaagctagagatagacaattattaggttatgatatagggattaacggactgttaaaaccttcaatggtttt-gaattcatttaagagattaatg 2541778  T
Q  753 ggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgc 852  Q
    | || | | || || | |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||  || || |||||||||| ||||| ||||||| |    
T  2541779 gattgttatttccgagaagaattttaggtcaagagattggataaaattactttgttaatctgtcgtttaactagataatcattgcttgaaataggagtac 2541878  T
Q  853 aaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatac 899  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||    
T  2541879 aaattaccataagagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatac 2541925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 847 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 11649490 - 11649440
Alignment:
Q  847 gagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat 897  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  11649490 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccat 11649440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 13017866 - 13017288
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-atattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttg 524  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13017866 attcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacata---aatgaaagtttagtttttattcatattactttg 13017770  T
Q  525 tgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttt 623  Q
    || ||||||| || |||| |||||| || ||| | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  || ||    
T  13017769 tgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctctt 13017670  T
Q  624 aactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttcttaaatacttccaac 723  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||| |||||     
T  13017669 aactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgttaatacctccaat 13017570  T
Q  724 gggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaat 823  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  13017569 gg-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaac 13017471  T
Q  824 taaataatcattgat-tgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttct--aaaacc 915  Q
    |||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||     |||||| ||||  ||||||    
T  13017470 taaataatcattgatcatatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttctgaaaaacc 13017371  T
Q  916 aatctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    |||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13017370 aattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttt 13017288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Original strand, 22247128 - 22247703
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22247128 attcctgagatgaatctgatgtaatcctatgg-aaccctaatttgttgaactcttttgaaca--tcaatgaaagtttggtttttattcatattaccttgt 22247224  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaa-cctccctttta 624  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||| | || || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  22247225 gtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccatagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttta 22247324  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatg-ttcttaaatacttccaac 723  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | || || ||| | || ||     
T  22247325 actctgaaccaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatatggattaacgtttgtttaattcctctaa- 22247423  T
Q  724 gggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaat 823  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  22247424 tggtttcgaattcacttgagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatac 22247523  T
Q  824 taaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat-----actcaatcttct-aaaacca 916  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||      |||||| |||| |||||||    
T  22247524 taaataatcattgattgtatttaagagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatgcttctctcaattttctaaaaacca 22247623  T
Q  917 atctttctttgtttttaatcagtttatgtac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    ||  ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  22247624 attctttattgtttttaattagtttat-tactaaatcaactcaactgcctagggcaccaataataatttatacatcctttt 22247703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 427 - 995
Target Start/End: Original strand, 22221293 - 22221868
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22221293 attcctgagatgaatctgatgtaatcctatgg-aaccctaatttgttgaactcttttgaaca--tcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgt 22221389  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaa-cctccctttta 624  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  22221390 gtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttta 22221489  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatg-ttcttaaatacttccaac 723  Q
    | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | || || ||| | || ||     
T  22221490 aatctaaaaaaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatatggattaacgtttgtttaattcctctaa- 22221588  T
Q  724 gggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaat 823  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  22221589 tggtttcgaattcacttgagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatac 22221688  T
Q  824 taaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat-----actcaatcttct-aaaacca 916  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||      |||||| |||| |||||||    
T  22221689 taaataatcattgattgtatttaagagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatgcttctctcaattttctaaaaacca 22221788  T
Q  917 atctttctttgtttttaatcagtttatgtac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    ||  ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  22221789 attctttattgtttttaattagtttat-tactaaatcaactcaactgcctagggcaccaataataatttatacatcctttt 22221868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 432 - 900
Target Start/End: Original strand, 14790192 - 14790660
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||| || ||||||||||| || |||||     
T  14790192 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-cattgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttt 14790289  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactct 629  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | || ||| |||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  14790290 atgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactct 14790389  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtt 728  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || || |||||||| ||    
T  14790390 gatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgg-tt 14790488  T
Q  729 tcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaat 828  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||    
T  14790489 tcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagat 14790588  T
Q  829 aatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  14790589 aatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatact 14790660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 432 - 900
Target Start/End: Original strand, 14795220 - 14795688
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||| || ||||||||||| || |||||     
T  14795220 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-cattgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttt 14795317  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactct 629  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | || ||| |||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  14795318 atgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactct 14795417  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtt 728  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || || |||||||| ||    
T  14795418 gatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgg-tt 14795516  T
Q  729 tcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaat 828  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||    
T  14795517 tcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagat 14795616  T
Q  829 aatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  14795617 aatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatact 14795688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 455 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 20527810 - 20527367
Alignment:
Q  455 tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcg 554  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20527810 tgggaaccttaatgtgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtctaatctttattcatattactttatatttaatgctttttgtatgtttatcatcg 20527713  T
Q  555 accactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaaccta 653  Q
    ||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20527712 actcctaaccctagctttatgaatatgcaaattgattttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgaactaggtaataagtttaaccta 20527613  T
Q  654 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacg 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| | || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  20527612 agtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacgg-tttcaaattcacttaagagattaa-g 20527515  T
Q  753 ggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgc 852  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20527514 ggttgttacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtaaagttaatttgttaatctgtcgtgaagttagataatcattgattgaattaggagtgc 20527415  T
Q  853 aaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  20527414 aaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatact 20527367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 458 - 945
Target Start/End: Original strand, 16883277 - 16883768
Alignment:
Q  458 gaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgacc 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16883277 gaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtctagtctttattcatgttactttatctttaatgctttttgtatgtttatcatcgact 16883374  T
Q  558 actagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagt 656  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16883375 actaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctcacttttgactctgaactaggtaataagtttaacctaagt 16883474  T
Q  657 aatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggt 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  16883475 aatcaagctagagatagatcattattaggtgatg-catagggattaatgttctgttaaaacctccaacggtttt-gaattcacataagagattaaggggt 16883572  T
Q  756 tatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaa 855  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |  |||||||| |||||||  || |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  16883573 tgccacttgtggggagaattctaggtcaagagattgggtagggttattgtgttaatctttcgtgaacatagataatcattgtttgaattagtagtgcaaa 16883672  T
Q  856 ttaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact------caatcttctaaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatgt 945  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||       ||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  16883673 ttaccataggagaacttcgaaggattcgaatgtcttaaccatacttctctctaattttctaaaaccaatcttttattgtttttaattcgtttatgt 16883768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 432 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 32704925 - 32704458
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| || | ||| ||||| || ||||||    
T  32704925 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtctagttttaagtca-attactttatgttta 32704829  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactct 629  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | || ||| |||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  32704828 atgttttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactct 32704729  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtt 728  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || || |||||||| ||    
T  32704728 gatctaagtaataagtttaacctaagtaatcaagatagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgg-tt 32704630  T
Q  729 tcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaat 828  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||    
T  32704629 tcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctatttcaagagattgggtagaattactctgttaatctgtcgttaaactagat 32704530  T
Q  829 aatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  32704529 aatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatact 32704458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 431 - 900
Target Start/End: Original strand, 1838046 - 1838515
Alignment:
Q  431 ctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttt 529  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||     
T  1838046 ctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatg--tcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgtta 1838143  T
Q  530 aatgctttttgtat-gtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaact 627  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||||||||| |  ||||| |||    
T  1838144 aatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctgacttttgact 1838243  T
Q  628 ctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacggg 726  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | || |  |||||  ||    
T  1838244 ctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttatgttaaaatctccaa-tgg 1838342  T
Q  727 tttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaa 826  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||||||||||  || |||    
T  1838343 tttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactaa 1838442  T
Q  827 ataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  1838443 ataatcgttgattgaactaggagtgcgaatta-cataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatact 1838515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 431 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 19665337 - 19664870
Alignment:
Q  431 ctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttt 529  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||     
T  19665337 ctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcatttgaatg--tcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgtta 19665240  T
Q  530 aatgctttttgtat-gtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaact 627  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  | || ||||||||| |||||||| |  ||||||| |    
T  19665239 aatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgatcactaaccctgacttttaatt 19665140  T
Q  628 ctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacggg 726  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| | || |  |||||  |     
T  19665139 ctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagatagagatagatca-tattaggttatgacatagggattaacgttctattaaaatctccaa-tga 19665042  T
Q  727 tttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaa 826  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||  |||||||||||||| || ||     
T  19665041 tttcgaattcacttaagagattaaggggatgttacttgcggggagaactctaggtcaagatattgggtagagttactttgttaatctgtcgtg-aactag 19664943  T
Q  827 ataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatac 899  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  19664942 ataatcattgattgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatac 19664870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 497 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 12983989 - 12983598
Alignment:
Q  497 aagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatc--gaccactagccctagc-tttatgaaaatgcatattgatcat 593  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   ||  |||||| ||||| ||| |||| ||||| | ||||| |    
T  12983989 aagtctagttttaattcatattaccttgtgtttaatgctgtctgtatgtttattatattgagtactagcactagcgtttttgaatatgcaaactgatctt 12983890  T
Q  594 ggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgac 692  Q
     ||| |||||||||||||| || |  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12983889 agaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgac 12983790  T
Q  693 atagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttg 791  Q
    | |  |||||| |  || | || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  12983789 acatggattaacggactgttaaaacctccaacgg-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattcaaggtcaagagattg 12983691  T
Q  792 gatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaa 885  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |  | ||||||||||| |||| || || |||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  12983690 ggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagacgaacattgattgaa-taggggtacagattttcataggagaacttcggaggattcgaa 12983598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 458 - 763
Target Start/End: Original strand, 32426969 - 32427271
Alignment:
Q  458 gaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgacc 557  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| || ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32426969 gaaccctagtttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtctagttttaatttatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgacc 32427066  T
Q  558 actagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaac-ctcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagt 656  Q
    |||| |||| |||||| ||  ||||| || |||| | || ||||||||||||||||| ||   |||| |||  || |||||||||| |||||||||||||    
T  32427067 actaaccctggctttaggagtatgcaaatcgatcttagagattgaatgaccactaactctggattttgact--gatctaggtaataagtttaacctaagt 32427164  T
Q  657 aatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggt 755  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32427165 aatcaatctagagatagatcattattatgttatgacatagggattaacattctgttaatacctccaac-ggttttgaattcacttaagagattaaggggt 32427263  T
Q  756 tatcactt 763  Q
    | ||||||    
T  32427264 tgtcactt 32427271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 432 - 681
Target Start/End: Original strand, 15534662 - 15534912
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  15534662 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatg--tcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgttaa 15534759  T
Q  531 atgctttttgtat-gtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacctcc-cttttaactc 628  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||  | || ||||| |||||||||| ||   ||||||||||    
T  15534760 atgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgaaaattgatgttagagattgagtgaccactaaacttgacttttaactc 15534859  T
Q  629 tgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattat 681  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15534860 tgatcttggtaataggtttaacataagtaatcaagctagtgatagatcattat 15534912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 510 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 12981089 - 12980711
Alignment:
Q  510 attcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatc--gaccactagccctagc-tttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatga 606  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||   ||| |||||| ||||| ||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||||||    
T  12981089 attcatattaccttgtgtttaatgttgtctgtatgtttattatattgactactagcactagcgtttttgaatatgcaaactgatcttagaacttgaatga 12980990  T
Q  607 ccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatg 705  Q
    |||||| || |  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||  |  |||||| |    
T  12980989 ccactagccctgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaagtattaggttatgactcatggattaacg 12980890  T
Q  706 ttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattacta 804  Q
      || | || || ||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  12980889 gactgttaaaacctccaacaa-tttcgaattcacttaagagattaagcggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtagaattactt 12980791  T
Q  805 agttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaa 885  Q
     ||||||||||||| ||| || |  | ||||||||||| |||| || ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  12980790 tgttaatctgtcgttaaactagacgaacattgattgaa-taggggtacaaattttcataggagaacttcggaggattcgaa 12980711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 30978557 - 30978321
Alignment:
Q  759 cacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattg-aactaggagtgcaaatt 857  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  30978557 cacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaatt 30978458  T
Q  858 accatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata-----ctcaatcttct--aaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-a 948  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||     |||||| ||||  |||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  30978457 accataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttacta 30978358  T
Q  949 aatcaactc-actgcctagggcaccaatataaattta 984  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30978357 aatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattta 30978321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12986990 - 12986843
Alignment:
Q  92 agtcaatttgaataaattcttatctttgatttactgagtgaagtgatacattatagtgacattatttgaaagaaatcaaagaatgcttggccataggaaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||              ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12986990 agtcaatttgaataaattcttatctttgatttattgagt--------------tagtgacatgagttgaaagaaatcaaagaatgcttggctataggaaa 12986905  T
Q  192 taaggtgatggccacgtgagcaacttttta-agttggtgggagtataaataatgagacacaa 252  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12986904 tatggtgatggccacgtgagcaactttttatagttggtgggagtataaataatgagacacaa 12986843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 725 - 899
Target Start/End: Original strand, 15534923 - 15535097
Alignment:
Q  725 ggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaatt 824  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||||||||||  || |    
T  15534923 ggtttcgaattcacttaagagattaagaggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattggttagagttactttgttaatctgtcgttgaact 15535022  T
Q  825 aaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatac 899  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  15535023 agataatcattgattgaattaggaatgcaaattaccataggaaaacttcggaggatttgaaggtcttaaccatac 15535097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20544698 - 20544626
Alignment:
Q  145 tagtgacattatttgaaagaaatcaaagaatgcttggccataggaaataaggtgatggccacgtgagcaactt 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20544698 tagtgacatgatttgaaagaaatcaaagaatgcttggctataggaaataaggcgatggccacgtgagcaactt 20544626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 627 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 7769872 - 7769594
Alignment:
Q  627 tctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgg 725  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||| |  || | || || ||||| |     
T  7769872 tctgatctaggaaatatgtttaacctaagtaattaagttagagatagacaattattaggttatgatttagggattaacggactgttaaaacctccaaaga 7769773  T
Q  726 gtttcgaattca---cttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaatt----ctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgt 818  Q
     |||||||||||   || |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||    ||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  7769772 -tttcgaattcatcactgaagagattaaggggttagcacttgcagagagaattatagctaggtcaaaagattgagtagaattactttgttaatatgtcgt 7769674  T
Q  819 gaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata 898  Q
     ||| ||||| | ||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  7769673 taaactaaatgaacattgattgaattgagggtgcaaattaccatataagagcatcggaggattcgaaggtcttaaccata 7769594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 673 - 792
Target Start/End: Original strand, 15538036 - 15538155
Alignment:
Q  673 gatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggag 771  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | || || |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  15538036 gatcattattaagttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaa-tggtttcgaattcacttaagagattaaggtgttgttacttgcggggag 15538134  T
Q  772 aattctaggtcaagaggttgg 792  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  15538135 aactctaggtcaagagattgg 15538155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 833 - 900
Target Start/End: Original strand, 27649077 - 27649144
Alignment:
Q  833 attgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  27649077 attgcttgaattagaagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatact 27649144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 543
Target Start/End: Original strand, 15537856 - 15537966
Alignment:
Q  431 ctgaggtgaatctgatgtaacc-tgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttt 529  Q
    ||||| ||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||| || | |||||||||| ||| || || ||    
T  15537856 ctgagatgaatttgatgtaatcatatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa--tgtcaatgaaagtctaatttttattcatagtactttatg-tt 15537952  T
Q  530 aatgctttttgtat 543  Q
    ||||||||||||||    
T  15537953 aatgctttttgtat 15537966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 427 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 7669 - 7199
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-atattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttg 524  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  7669 attcctgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacata---aatgaaagtttagtttttattcatattactttg 7573  T
Q  525 tgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tccctttt 623  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |  |||||    
T  7572 agtttaatgctttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaatttgattgaccactaaccctggctttt 7473  T
Q  624 aactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaa 722  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||    
T  7472 tactcagaactaggtaataggtttaacctaagtaataaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctccaa 7373  T
Q  723 cgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaa 822  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372 cgg-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaagtcaagagattgaatagaattactaagttaatctgtcgtgaaa 7274  T
Q  823 ttaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat 897  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||   || || |||||||| |||||||||||    
T  7273 ctaaataatcattgattgaattaggagtacaaattaccataggagagtatcagaggattcgaaggacttaaccat 7199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 427 - 897
Target Start/End: Original strand, 2260 - 2732
Alignment:
Q  427 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgt 525  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2260 attcctaagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaact--tcaatgaaagtttagtctttattcatattactttgt 2357  T
Q  526 gtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaa-cctccctttta 624  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||  |||||     
T  2358 gtttaatgctttatgtatgtttatcatcaactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaaataaatgaccactaaccctggcttttt 2457  T
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc-ttaaatacttccaac 723  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| || ||||| ||||||    
T  2458 actctgaactaggtaataggtttgacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggatcaacgttcttttaatacctccaac 2557  T
Q  724 gggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggataga--attactaagttaatctgtcgtgaa 821  Q
     |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2558 -ggtttcgaattcacttaagagatttaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgagtagaatattactaagttaatctgtcgtgaa 2656  T
Q  822 attaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat 897  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||   || || |||||||| |||||||||||    
T  2657 actaaataatcattgattgaattaggagtgcaagttaccataggagagtatcagaggattcgaaggacttaaccat 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 455 - 900
Target Start/End: Original strand, 13492860 - 13493304
Alignment:
Q  455 tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcg 554  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13492860 tgggaaccctagtttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcg 13492957  T
Q  555 accactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaaccta 653  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13492958 actactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaaccta 13493057  T
Q  654 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacg 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13493058 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacgg-tttcgaattcacttaagagattaagg 13493156  T
Q  753 ggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgc 852  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  13493157 ggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaattaggagtgc 13493256  T
Q  853 aaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  13493257 aaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatact 13493304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 443 - 900
Target Start/End: Original strand, 13495572 - 13496029
Alignment:
Q  443 tgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgt 541  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13495572 tgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgt 13495669  T
Q  542 atgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaa 640  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||    
T  13495670 atgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctagcttttgactctgatctaggtaa 13495769  T
Q  641 taggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct--taaatacttccaacgggtttcgaattcac 738  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| || |||||||| ||||||||||||    
T  13495770 taagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgctaaa-acctccaacgg-tttcgaattcac 13495867  T
Q  739 ttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgat 838  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  13495868 ttaagagattaaggggttgtcacttgcgggtagaattctaggtcaagagattggatataattactttcttaatctgtcgttaaagtagataatcattgat 13495967  T
Q  839 tgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  13495968 tgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatact 13496029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 397 - 972
Target Start/End: Original strand, 34065883 - 34066468
Alignment:
Q  397 gaacatgagtagctaaatttctttgtggctattcctgaggtgaatctgatgtaacctg-tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaata 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||  | ||||  |||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||     
T  34065883 gaacatgagtagctaaatttctttgtggttaagactttgatgaacttgatgtaatcttatgggaatcctaatttgttgaacttttttgaa-tat-caatg 34065980  T
Q  496 aaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatgg 595  Q
    ||| | |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |    
T  34065981 aaaatctagttttaattcatattacgttatgtttaatgctttttgtacgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttag 34066080  T
Q  596 aaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacat 694  Q
    | ||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34066081 agattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgacctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacat 34066180  T
Q  695 agagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttgga 793  Q
    ||||||||| ||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||     
T  34066181 agagattaacgttctgttaaaacctccaacgg-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattcaaggtcaagagattggg 34066279  T
Q  794 tagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaa 893  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||    
T  34066280 tagaattactttgttaatctatcgttaaactagataatcattgattgaattaggagtgcaaattatcataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaa 34066379  T
Q  894 ccatact------caatcttctaaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatgt---acaaatcaactc-actgcctagggcacc 972  Q
    |||||||       ||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||   | ||||||| || |||||||||||||||    
T  34066380 ccatacttctctctaattttctaaaaccaatcttttattgtttttaattcgtttatgttacaaaaatcaattcaactgcctagggcacc 34066468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 416 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 27282795 - 27282311
Alignment:
Q  416 tctttgtggctattcctgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattca 514  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| || |||||    
T  27282795 tctttgtggttaatcctgagatgaatctgatataatcctatgggaaccctaatttgttgaacacctttgaa-tat-caatgaaagtctagttttaattca 27282698  T
Q  515 tattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaac 614  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| | || |||||||||||||||||    
T  27282697 tattactttatgtttaatcctttttgtatctttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgaaaattgatcttagagattgaatgaccactaac 27282598  T
Q  615 c-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-a 712  Q
    | |   |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |    
T  27282597 cctggattttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctttta 27282498  T
Q  713 atacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatc 812  Q
    | || |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  27282497 aaacctccaacgatttt-gaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatc 27282399  T
Q  813 tgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
     |||||  || || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  27282398 ggtcgttgaactagataatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggagaattcgaaagtcttaaccatact 27282311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 432 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 32506525 - 32506062
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttga-aatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttt 529  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| ||||| |||| || |   ||||||| || |||||    
T  32506525 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttttgaatat-caatgaaagtctagttttaa---atattactttatgttt 32506430  T
Q  530 aatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactc 628  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||| | || |||||||||||||||||| |  ||||| ||||    
T  32506429 aatgttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaatcgatcttagagattgaatgaccactaaccctgacttttgactc 32506330  T
Q  629 tgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggt 727  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||| |    
T  32506329 tgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagataggtcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaatacctccaacgg-t 32506231  T
Q  728 ttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaa 827  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |    
T  32506230 ttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactaga 32506131  T
Q  828 taatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaacca 896  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  32506130 taatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaacca 32506062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 620 - 900
Target Start/End: Original strand, 39546004 - 39546284
Alignment:
Q  620 ttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatactt 718  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || || |    
T  39546004 ttttgactctgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctattaaaacct 39546103  T
Q  719 ccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgt 818  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  39546104 ccaacga-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgt 39546202  T
Q  819 gaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  39546203 gaaactagataatcattgcttgaattaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatact 39546284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 455 - 900
Target Start/End: Original strand, 1936225 - 1936668
Alignment:
Q  455 tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcg 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1936225 tgggaaccataatttgttgaactcctttgaa-tat-caatggaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcg 1936322  T
Q  555 accactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaaccta 653  Q
    || |||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||| | || ||| |||||||||||||| |  ||||  | | ||| | |||||||| ||||||||||    
T  1936323 actactaaccctaactttatgaatatgaaaattgatcttagagattaaatgaccactaaccatggctttcgaatttgatccaggtaataagtttaaccta 1936422  T
Q  654 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta-aatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacg 752  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||  || || || ||||  |||| ||||||||||||||||||| |    
T  1936423 agtaatcatgctagagatagatcattattaggttatgacatagggaataacattcttttaaaacctcaaacg--tttcaaattcacttaagagattaagg 1936520  T
Q  753 ggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgc 852  Q
    | || | |||||||||||||| | ||  ||||||| || | |||| |||||  |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1936521 gattgttacttgcggggagaactataaatcaagagatttggtagagttactttgttaatctttcgtgaagctagataatcattgattgaactaggagtgc 1936620  T
Q  853 aaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  1936621 aaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatact 1936668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 518 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 22104956 - 22104680
Alignment:
Q  518 taccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaac-ct 616  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  22104956 taccttgtgtttaatgttttgtgtaggtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaattct 22104857  T
Q  617 cccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttcttaaatac 716  Q
       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  22104856 ggtttttaactctgaactatgtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctttaatac 22104757  T
Q  717 ttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggata 795  Q
     |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22104756 ctccaac-gattttgaattcacttaagagattaa-ggtctgtcacttacggggagaattctaggtcaagagattggata 22104680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 437 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 16190843 - 16190381
Alignment:
Q  437 tgaatctgatgtaacctg-tgggaaccctaatttgttgaactcctttga----aatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaa 531  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |    ||||| |||| ||||| |||| || ||| ||||||| || |||||||    
T  16190843 tgaatctgatgtaatcttataggaaccctaatttgttgaactcctttaatttgaatat-caatgaaagtctagttttaatttatattactttatgtttaa 16190745  T
Q  532 tgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacctcc-cttttaactctg 630  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  16190744 tgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccttagctttatgaatatgcaaattgatcctagagattggatgaccactaaccttggcttttaactctg 16190645  T
Q  631 aactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttcttaaatacttccaacgggtttc 730  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||          || || |||||| ||||||    
T  16190644 atctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcaatattaggttatgacatagggatt----------aaaacctccaac-ggtttc 16190556  T
Q  731 gaattcacttaagag----attaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggataga-attactaagttaatctgtcgtgaaatta 825  Q
    |||||||||||||||    ||||| ||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||| |||| || | |||| |  |||||| |||||| ||| ||    
T  16190555 gaattcacttaagagattaattaaggggttgtcactcgtggggagaattatgggtcaagagattgggtatatattattttgttaatttgtcgttaaacta 16190456  T
Q  826 aataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
     |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  16190455 gataatcattgcttgaattaagagtgcaaattatcataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatact 16190381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 455 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 23990735 - 23990374
Alignment:
Q  455 tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcg 554  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || ||| || |||| || ||||| ||||  || | || |||| ||||||||||||||| || |    
T  23990735 tgggaacactaatttgttgaactcctctgaa-tatttaagaaa-gtctagttttaattcacattatattatcttcaatgttttttgtatgtttatcattg 23990638  T
Q  555 accactagccctagctttatgaaaatgcatattgatc--atg--gaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaa 649  Q
    || ||||     ||||||||||| ||||| |||||||  ||   || |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  23990637 actacta-----agctttatgaatatgcaaattgatctaattaagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaa 23990543  T
Q  650 cctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagatt 748  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || || |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23990542 cctaagtaatcaagctagagattgatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaac-ggtttcgaattcacttaagagttt 23990444  T
Q  749 aacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgt 818  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  23990443 aaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagtgattgggtagaattactttgttaatctgtcgt 23990374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 510 - 898
Target Start/End: Original strand, 21152906 - 21153295
Alignment:
Q  510 attcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgacca 609  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||| || ||| |||||| ||||| |  ||||  || | ||||| | | ||| |||||||||||    
T  21152906 attcatatttccttctgtttaatgttgtttatatgtttatgattgactactagcactagcatcttgaatgtgtaaattgaacttagaacttgaatgacca 21153005  T
Q  610 ctaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc 708  Q
    ||| || |  ||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||  ||| |||||| |  |    
T  21153006 ctagccctgacttttgactctgatctagggaatatatttaacctaagtaattaagctagagatagacagttattaggttatgatttagggattaacggac 21153105  T
Q  709 t-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagt 807  Q
    | | || || ||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||    
T  21153106 tattaaaacctccaaagg-tttcaaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgagtagaattactgtgt 21153204  T
Q  808 taatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata 898  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| | || |||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  21153205 taatctgtcgttaaactaaatgaacattgattgaattgggggtgcaaattaccatttaagagcatcggaggattcgaaggtcttaaccata 21153295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 497 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 22457100 - 22456711
Alignment:
Q  497 aagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatc--gaccactagccctagc-tttatgaaaatgcatattgatcat 593  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||   ||| |||||| ||||| ||| |||| ||||| | ||||| |    
T  22457100 aagtctagttttaattcatattacctt-tgttcaatgttgtttgtatgtttattatattgactactagcactagcgtttttgaatatgcaaactgatctt 22457002  T
Q  594 ggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgac 692  Q
     ||| |||||||||||||| || |  ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  22457001 agaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgttttaggtaataggtttaacctaagtaattaagcaagagatagaaaattattaggttatgac 22456902  T
Q  693 atagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttg 791  Q
      |  |||||| |  || | || || |||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22456901 tcatggattaacggactgttaaaacctccaacag-tttcgaattcacttaagagattaa-gagttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattg 22456804  T
Q  792 gatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaa 885  Q
    | ||||||||||  |||| |||||||| ||| || |  | ||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22456803 ggtagaattactttgttagtctgtcgttaaactagacgaacattgattgaa-taggggtacaaatttccataggagaacttcggaggattcgaa 22456711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 599 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 22453641 - 22453421
Alignment:
Q  599 ttgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacataga 697  Q
    |||||||||||||| || |  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |      
T  22453641 ttgaatgaccactagccctggcttttgactctgatttaggtaataggtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgactcatg 22453542  T
Q  698 gattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatag 796  Q
    |||||| |  || | || || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22453541 gattaacggactgttaaaacctccaacag-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtag 22453443  T
Q  797 aattactaagttaatctgtcgt 818  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  22453442 aattactttgttaatctgtcgt 22453421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 510 - 898
Target Start/End: Original strand, 15296980 - 15297371
Alignment:
Q  510 attcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatc--gaccactagccctagc-tttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatga 606  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||   | | |||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||    
T  15296980 attcatattaccttgtgtttaatgttgtttcaatgtttattatattgtctactagcactagcatttttgaatatgcaaattgatcttagaacttgaatga 15297079  T
Q  607 ccactaac-ctcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatg 705  Q
    |||||| | ||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |  |||||| |    
T  15297080 ccactagctctggcttttgaatctgatctaggtaatagttttaacctaagtaattaagttagagatagaaaattattaggttatgactcatggattaacg 15297179  T
Q  706 ttct-taaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattacta 804  Q
      || | || || |||||| | |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  15297180 gactgttaaaacctccaacag-tttcaaattcacttaagagatttaagggttgtcacttgcagagagaattctaggtcaagagattgggtagaattactt 15297278  T
Q  805 agttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata 898  Q
     ||||||||||||| ||| || || |  |||||||||| | || |||||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  15297279 tgttaatctgtcgttaaactagatgaatattgattgaa-ttggggtgcaaattaccgtggaagaacatcggaggattcgaaggtcttaatcata 15297371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 361
Target Start/End: Original strand, 34065743 - 34065848
Alignment:
Q  258 tttgggaacagaggagc--gagagagagaagagctacggcatgcaaacaacaacaatgatttgaaacaaaattcaggagcaacgtcggcaacaatgaaat 355  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34065743 tttgagaacagaggagcacgagagagggaagagctacggcatgcaaacaacaacaatgatttgaaagaaaattcaggagcaacgtcggcaacaatgaaat 34065842  T
Q  356 tcttgg 361  Q
    ||||||    
T  34065843 tcttgg 34065848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 768 - 900
Target Start/End: Original strand, 10764829 - 10764961
Alignment:
Q  768 ggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgag 867  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  10764829 ggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaattaggagtgcaagttaccataggag 10764928  T
Q  868 aacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    |||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  10764929 aacttcagaggattcgaaggtcttaaccatact 10764961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 432 - 549
Target Start/End: Original strand, 10759695 - 10759811
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||| || ||||||||||| || |||||     
T  10759695 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttg-aata-tcattgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttt 10759792  T
Q  531 atgctttttgtatgtttat 549  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10759793 atgctttttgtatgtttat 10759811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47644009 - 47643957
Alignment:
Q  283 gaagagctacggcatg-caaacaacaacaatgatttgaaacaaaattcaggag 334  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47644009 gaagagctacgacatgtcaaacaacaacaatgatttgaatgaaaattcaggag 47643957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 549
Target Start/End: Original strand, 49147745 - 49147797
Alignment:
Q  497 aagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttat 549  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  49147745 aagtctagttttaattcatattaccttgtgtttaatgttgtttgtatgtttat 49147797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 789 - 885
Target Start/End: Original strand, 49147829 - 49147924
Alignment:
Q  789 ttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaa 885  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |  | ||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  49147829 ttgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagacgaacattgattgaa-taggggtacaaatttccataggagaacttcggaggattcgaa 49147924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 418 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 3293 - 2807
Alignment:
Q  418 tttgtggctattcctgaggtgaatctgatgtaacctg-tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcata 516  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||  ||| || ||||||||||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  3293 tttgtggttattcctgagatgaatcttatgtaatcttatggaaatcctaatttgttgaactcatttgaatt--taaatgaaagtttagtctttactcata 3196  T
Q  517 ttacct---tgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagcttt-atgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccacta 612  Q
    |||| |   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  3195 ttacttctttgtgtttaatgttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagcttttatgaatatgcaaattgatcacagaatttgaatgaacacta 3096  T
Q  613 acc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttctta 711  Q
    ||| |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||     
T  3095 accatggctttcaactctgaactaggtaatacgtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacacaaggattaacgttcttt 2996  T
Q  712 -aatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaa 810  Q
     ||||| |||||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  ||||    
T  2995 taatacctccaatagtttt-gaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagatttggtagaattactaccttaa 2897  T
Q  811 tctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || | |||||| |||||    
T  2896 tctttcgtgaaactatataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcaaaggtcttaacgatact 2807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 566 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 24722 - 24284
Alignment:
Q  566 tagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagc 664  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24722 tagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaaccaggtaataggtttaacctaagtaatcaagc 24623  T
Q  665 tagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc-ttaaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcactt 763  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||  || ||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  24622 tagagatatatcattattaggttatgatatagggattaacgtttatttaattcctccaatgg-tttcgaattcacataagagattaaggggttgtcactt 24524  T
Q  764 gcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccat 862  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||    
T  24523 gcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatactaaataatcatttattgtatttaggagtgcaaattaccat 24424  T
Q  863 atgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat-----actcaatcttct-aaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatgtac-aaatcaac 955  Q
    | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||      |||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24423 aggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatgcttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttat-tactaaatcaac 24325  T
Q  956 tc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatcttttt 995  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  24324 tcaactgcctagggcaccaataataatttatacatcctttt 24284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 603 - 995
Target Start/End: Original strand, 9606 - 10009
Alignment:
Q  603 atgaccactaacc-tcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagatt 701  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9606 atgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctaaagatagatcattattaggttatgatatagggatt 9705  T
Q  702 aatgttc-ttaaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaatt 800  Q
    || |||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9706 aacgttcgtttaatacctccaatgg-tttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaatt 9804  T
Q  801 actaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata- 898  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  9805 actaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatac 9904  T
Q  899 ----ctcaatcttct-aaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatg-tac-aaatcaactc-actgcctagggcaccaatataaatttatacatc 990  Q
        |||||| |||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9905 ttctctcaattttctaaaaaccaattatttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctaggggaccaatataaatttatacatc 10004  T
Q  991 ttttt 995  Q
     ||||    
T  10005 ctttt 10009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 437 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 6476 - 6014
Alignment:
Q  437 tgaatctgatgtaacctg-tgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgct 535  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||  ||| ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  6476 tgaatctgatgtaatcttatgggaaccttaatttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtc-agtgtttattcatgttactttatgtttaatgct 6380  T
Q  536 ttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaa-cctcccttttaactctgaact 634  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  6379 ttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctgacttttgactctgaact 6280  T
Q  635 aggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttccaacgggtttcgaa 733  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | || || |||||  | ||| |||    
T  6279 aggtaataagtttaatctaagtaatcaacctagagatagatcattattaggttatgacatagggtttaacgttctgttaaaacctccaa-tgattttgaa 6181  T
Q  734 ttcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatca 833  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |  ||||||||||||||||  || |||||||    
T  6180 ttcacttaagagattaaggggttgccacttgcggggagaattctagatcaagagattgggtagagttattgtgttaatctgtcgtgaacctagataatca 6081  T
Q  834 ttgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  6080 ttgtttgaattagtagtgcaaattaccataggagaacctcggaggattcgaaggtcttaaccatact 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 5e-99; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 437 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 12575966 - 12575420
Alignment:
Q  437 tgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgct 535  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |||    
T  12575966 tgaatctgatgtaatcctataggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-caatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgttcaacgct 12575869  T
Q  536 ttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactctgaact 634  Q
    |||||||| ||||| ||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||| |  ||||| ||| ||| |     
T  12575868 ttttgtatctttatcatcaacaactagccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgactactaaccttggcttttgactttgatca 12575769  T
Q  635 aggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaa--tgttcttaaatacttccaacgggtttcga 732  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  | || ||||| || |||||  |||||| |    
T  12575768 aggtaataggtttaacataagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgatataaggattaacgtattgttaaa-acctccaa-tggtttcta 12575671  T
Q  733 attcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctagg-tcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataat 831  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||  ||||||||||||| ||| || || ||    
T  12575670 attcacttaagagattaa-gggttgttacttgcggggagaattctaggtttaagagattaggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagattat 12575572  T
Q  832 cattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact------caatcttctaaaaccaatctttctt 925  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |  | ||||||||||||       ||| |||||||||||||||||  |    
T  12575571 cattgcttgaattaggagtgcaaattaccataagaaaacttcggaggattcaatggtcttaaccatacttctctctaattttctaaaaccaatcttttat 12575472  T
Q  926 tgtttttaatcagtttatgt---acaaatcaactc-actgcctagggcacca 973  Q
    |||||||||||| |||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12575471 tgtttttaatcaatttatgttacaaaaatcaactcaactgcctagggcacca 12575420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 525 - 900
Target Start/End: Original strand, 13096686 - 13097062
Alignment:
Q  525 tgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacctc---cctt 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||| |||||||  |   ||||    
T  13096686 tgtttaatgctttt-gtatgtttatcatcgactactatccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgatcactaactcctggcctt 13096784  T
Q  622 ttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttct-taaatacttcc 720  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| | || || |||    
T  13096785 ttaactctgacctaggtaataagtttaagctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacatagggatttacgttctgttaaaacctcc 13096884  T
Q  721 aacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtga 820  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||| || |      
T  13096885 cac-ggtttcaaattcacttaagacattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggccaagagattgggtagaattactttgttaatctttcattg 13096983  T
Q  821 aattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    || || |||||||||| || || ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  13096984 aactagataatcattgcttaaattaggagtgcaaatta-cataggataacttcggaggattcgaaggtcttaaccatact 13097062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 464 - 898
Target Start/End: Original strand, 44007909 - 44008335
Alignment:
Q  464 taatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccactagc 563  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  |    
T  44007909 taatttgttgaactcctttgaatt--tcaattaaagtttagtctttattcttattactctttgtttaatgcttttt-tatgtttatcatcgactattgac 44008005  T
Q  564 cctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaac-ctcccttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaa 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | || ||||||||| |||| || ||  ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  44008006 cctagctttatgaaaatgcaaattgaccgtagagattgaatgaacactgactctggcttttgattctgaactaggtaataagtttaacctaactaatcaa 44008105  T
Q  663 gctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc-ttaaatacttccaacgggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcac 761  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||| || ||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||    
T  44008106 gctagaaatagatcattgttaggttacgacacagggattaacgttcttttaatacctccaac-gatttcaaattcacttatgagattaaggagttgtcac 44008204  T
Q  762 ttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaattaaataatcattgattgaactaggagtgcaaattacca 861  Q
    |||| |||||||||||||||| || | || | |||| ||||     |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44008205 ttgc-gggagaattctaggtcgagggatttggtagagttac-----taatctatcgtgaaactaaataatcattgtttgaactaggagtgcagattacca 44008298  T
Q  862 tatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccata 898  Q
     | | || ||||||| |||||||| | | ||||||||    
T  44008299 aaggcgagcttcggaggattcgaaggtcataaccata 44008335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 625 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 41779213 - 41778945
Alignment:
Q  625 actctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttcttaaatacttccaacg 724  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |  | | ||  |           
T  41779213 actctgaactaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattgacataataacatttt------- 41779121  T
Q  725 ggtttcgaattcacttaagagattaacgggttatcacttgcggggagaattctaggtcaagaggttggatagaattactaagttaatctgtcgtgaaatt 824  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |  ||||||||||||||||  |    
T  41779120 ggttttgaattcacttaagatattaaggggttgccacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagagttattgtgttaatctgtcgtgaacct 41779021  T
Q  825 aaataatcattgattgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    | |||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  41779020 agataatcattgtttgaattactagtgcaaattagcataggagaacttcggaagatttgaaggtcttaaccatact 41778945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 461 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 41779318 - 41779220
Alignment:
Q  461 ccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttataatcgaccact 560  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41779318 ccctaatttgttgaactccttt-aaatat-caatgaaagtttagtctttatccatgttactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgaccact 41779221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 838 - 900
Target Start/End: Original strand, 14418445 - 14418507
Alignment:
Q  838 ttgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14418445 ttgaattaggagtgcaaattatcataggagaaattcggaggattcgaatgtcttaaccatact 14418507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 847 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 41836479 - 41836429
Alignment:
Q  847 gagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccat 897  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  41836479 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccat 41836429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 432 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 316 - 1
Alignment:
Q  432 tgaggtgaatctgatgtaa-cctgtgggaaccctaatttgttgaactcctttgaaatattcaataaaagtttagtctttattcatattaccttgtgttta 530  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||| || ||||||||||| || |||||     
T  316 tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaa-tat-cattgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttt 219  T
Q  531 atgctttttgtatgtttataatcgaccactagccctagctttatgaaaatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaacc-tcccttttaactct 629  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | || ||| |||||| ||||||| |   |||| |||||    
T  218 atgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgactactaaccctggtttttgactct 119  T
Q  630 gaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaatgttc-ttaaatacttccaacgggtt 728  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || || |||||| ||||    
T  118 gatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaac-ggtt 20  T
Q  729 tcgaattcacttaagagat 747  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19 tcgaattcacttaagagat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 838 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 211
Alignment:
Q  838 ttgaactaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaagattcgaatgacttaaccatact 900  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  273 ttgaattaggagtgcaaattatcataggagaaattcggaggattcgaatgtcttaaccatact 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3984 times since January 2019
Visitors: 8743