View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: R108-tnk507-E59 (Length: 618)

Name: R108-tnk507-E59
Description: Pascalseqs
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] R108-tnk507-E59
R108-tnk507-E59
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (237-505)||(39934875-39935142)
chr3 (28-165)||(39935213-39935347)
chr3 (255-416)||(22304560-22304719)
chr3 (264-416)||(32589704-32589853)
chr3 (275-416)||(43346799-43346940)
chr3 (276-415)||(12114571-12114710)
chr3 (275-416)||(37990647-37990788)
chr3 (275-416)||(37990985-37991126)
chr3 (275-416)||(42342396-42342537)
chr3 (256-415)||(39389062-39389219)
chr3 (275-415)||(54017825-54017965)
chr3 (276-416)||(29644910-29645050)
chr3 (275-416)||(15772863-15773004)
chr3 (275-416)||(33803260-33803401)
chr3 (275-416)||(35946531-35946672)
chr3 (275-415)||(54018207-54018347)
chr3 (275-418)||(29644587-29644730)
chr3 (256-401)||(50612470-50612618)
chr3 (289-415)||(41359774-41359900)
chr3 (275-418)||(25755403-25755546)
chr3 (275-413)||(52634685-52634822)
chr3 (275-416)||(25739433-25739574)
chr3 (275-417)||(22303962-22304097)
chr3 (296-416)||(45395661-45395781)
chr3 (275-418)||(53577373-53577516)
chr3 (275-416)||(15773201-15773344)
chr3 (275-414)||(32462910-32463050)
chr3 (289-416)||(42342098-42342225)
chr3 (255-380)||(4823646-4823769)
chr3 (275-416)||(21832353-21832492)
chr3 (275-413)||(39914261-39914399)
chr3 (275-415)||(33175668-33175813)
chr3 (275-398)||(3135099-3135222)
chr3 (256-414)||(51886553-51886703)
chr3 (275-417)||(49336693-49336836)
chr3 (324-413)||(22303670-22303759)
chr3 (276-416)||(42584832-42584970)
chr3 (275-416)||(31190026-31190159)
chr3 (256-416)||(37726496-37726646)
chr3 (306-416)||(1634323-1634432)
chr3 (295-416)||(44160555-44160673)
chr3 (306-416)||(45901754-45901864)
chr3 (275-416)||(3135462-3135610)
chr3 (275-384)||(8327913-8328022)
chr3 (295-414)||(11661980-11662099)
chr3 (275-414)||(53117985-53118123)
chr3 (308-398)||(47964544-47964634)
chr3 (295-368)||(33362349-33362422)
chr3 (306-413)||(32462569-32462676)
chr3 (275-416)||(9240158-9240299)
chr3 (308-413)||(12749211-12749316)
chr3 (255-373)||(3384317-3384433)
chr3 (275-358)||(7767380-7767463)
chr3 (255-321)||(22304237-22304301)
chr3 (336-415)||(54017557-54017636)
chr3 (308-378)||(46546371-46546441)
chr3 (316-374)||(52634990-52635048)
chr3 (308-394)||(39336000-39336086)
chr3 (351-416)||(41359499-41359564)
chr3 (275-333)||(11661544-11661602)
chr3 (308-398)||(25317200-25317290)
chr3 (308-373)||(39336280-39336345)
chr3 (275-416)||(47964923-47965064)
chr3 (275-322)||(43346659-43346706)
chr3 (333-384)||(53596027-53596078)
chr3 (333-384)||(53596342-53596393)
chr3 (333-384)||(53596542-53596593)
chr3 (334-372)||(17735043-17735081)
chr3 (334-372)||(19036312-19036350)
chr3 (351-384)||(11661605-11661638)
chr3 (321-374)||(17731954-17732007)
chr3 (321-374)||(19033185-19033238)
chr3 (346-416)||(43978873-43978947)
chr3 (351-418)||(7766789-7766854)
chr3 (376-416)||(22304303-22304343)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (255-418)||(3669678-3669839)
chr8 (256-418)||(1014251-1014411)
chr8 (275-414)||(45122067-45122206)
chr8 (256-416)||(3670052-3670210)
chr8 (275-420)||(34834885-34835030)
chr8 (275-413)||(34835218-34835356)
chr8 (290-416)||(45122648-45122774)
chr8 (275-416)||(3038298-3038439)
chr8 (255-416)||(30441072-30441235)
chr8 (256-403)||(20870594-20870741)
chr8 (275-416)||(25561823-25561965)
chr8 (295-416)||(9483195-9483316)
chr8 (275-404)||(33113387-33113516)
chr8 (275-416)||(40518591-40518732)
chr8 (255-418)||(1013877-1014038)
chr8 (295-413)||(34835504-34835622)
chr8 (295-413)||(34835770-34835888)
chr8 (275-416)||(37544498-37544639)
chr8 (289-416)||(6876870-6876997)
chr8 (275-418)||(30359280-30359423)
chr8 (278-416)||(5420663-5420801)
chr8 (275-416)||(30359618-30359759)
chr8 (275-403)||(70295-70423)
chr8 (298-416)||(40518103-40518221)
chr8 (275-404)||(147460-147589)
chr8 (275-416)||(1513923-1514064)
chr8 (275-416)||(8918772-8918913)
chr8 (275-416)||(9309364-9309504)
chr8 (275-416)||(9482612-9482753)
chr8 (295-416)||(40579514-40579635)
chr8 (275-416)||(45123015-45123156)
chr8 (289-416)||(45121664-45121791)
chr8 (296-414)||(18372004-18372122)
chr8 (275-416)||(9608754-9608895)
chr8 (275-416)||(45121918-45122059)
chr8 (327-416)||(5915928-5916017)
chr8 (255-420)||(6731895-6732049)
chr8 (289-403)||(9609108-9609222)
chr8 (275-416)||(9308986-9309131)
chr8 (275-416)||(18371669-18371805)
chr8 (275-379)||(43274824-43274928)
chr8 (303-416)||(9507819-9507932)
chr8 (275-415)||(4154290-4154429)
chr8 (275-418)||(6651512-6651646)
chr8 (276-415)||(12283883-12284021)
chr8 (275-338)||(18372785-18372848)
chr8 (275-414)||(32640542-32640676)
chr8 (275-401)||(41972167-41972296)
chr8 (256-343)||(41416252-41416335)
chr8 (295-416)||(32305506-32305627)
chr8 (345-416)||(41129067-41129138)
chr8 (275-384)||(8794120-8794229)
chr8 (334-414)||(147888-147968)
chr8 (275-398)||(9620704-9620825)
chr8 (289-356)||(3037776-3037843)
chr8 (275-338)||(18372342-18372405)
chr8 (275-374)||(18380067-18380166)
chr8 (278-370)||(18372988-18373077)
chr8 (251-383)||(4154707-4154836)
chr8 (295-374)||(18372656-18372731)
chr8 (276-339)||(25561729-25561792)
chr8 (345-416)||(40579277-40579348)
chr8 (351-416)||(8919152-8919217)
chr8 (352-404)||(16524451-16524503)
chr8 (302-358)||(18373236-18373292)
chr8 (337-378)||(12156704-12156745)
chr8 (345-398)||(20995442-20995495)
chr8 (303-415)||(43398077-43398192)
chr8 (275-382)||(5274784-5274891)
chr8 (310-363)||(33832022-33832075)
chr8 (279-371)||(20130462-20130553)
chr8 (360-416)||(43274643-43274699)
chr8 (308-365)||(40991795-40991852)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (256-414)||(3409251-3409407)
chr6 (255-416)||(29518911-29519070)
chr6 (256-416)||(29518495-29518653)
chr6 (256-416)||(32741171-32741329)
chr6 (255-416)||(2378117-2378276)
chr6 (256-416)||(35210196-35210354)
chr6 (255-416)||(3409651-3409810)
chr6 (254-416)||(3415448-3415610)
chr6 (289-417)||(10074370-10074498)
chr6 (256-414)||(26544041-26544197)
chr6 (275-416)||(2377763-2377904)
chr6 (256-416)||(3058218-3058376)
chr6 (275-416)||(16454916-16455057)
chr6 (256-416)||(14748350-14748504)
chr6 (275-416)||(2579880-2580021)
chr6 (256-415)||(1127352-1127509)
chr6 (257-416)||(1846741-1846898)
chr6 (275-415)||(16107687-16107827)
chr6 (275-416)||(2843563-2843705)
chr6 (275-416)||(10911574-10911716)
chr6 (295-416)||(2578451-2578572)
chr6 (275-416)||(6999804-6999945)
chr6 (275-416)||(16454584-16454725)
chr6 (303-416)||(10073624-10073737)
chr6 (275-418)||(2579498-2579641)
chr6 (275-409)||(1950200-1950334)
chr6 (276-413)||(5832038-5832174)
chr6 (275-416)||(10073999-10074140)
chr6 (275-391)||(9062383-9062498)
chr6 (275-375)||(32460629-32460729)
chr6 (275-413)||(593718-593858)
chr6 (275-416)||(5958615-5958752)
chr6 (290-416)||(2578843-2578968)
chr6 (275-357)||(16108072-16108154)
chr6 (276-414)||(2579119-2579253)
chr6 (275-412)||(12085046-12085182)
chr6 (275-386)||(8481936-8482046)
chr6 (351-414)||(12071701-12071764)
chr6 (308-415)||(12092491-12092598)
chr6 (289-382)||(2975575-2975668)
chr6 (308-398)||(6071174-6071264)
chr6 (312-398)||(30618643-30618727)
chr6 (289-339)||(35210501-35210551)
chr6 (334-386)||(11637759-11637811)
chr6 (303-343)||(14789285-14789325)
chr6 (358-402)||(10902452-10902496)
chr6 (329-416)||(31714732-31714818)
chr6 (275-401)||(17135092-17135218)
chr6 (308-398)||(34661635-34661725)
chr6 (334-374)||(22605305-22605345)
[»] chr1 (70 HSPs)
chr1 (258-392)||(32594748-32594880)
chr1 (255-416)||(44290832-44290992)
chr1 (251-416)||(41759470-41759633)
chr1 (255-416)||(44290466-44290625)
chr1 (255-416)||(48588496-48588655)
chr1 (276-416)||(3537607-3537747)
chr1 (275-415)||(41157384-41157524)
chr1 (295-415)||(41157020-41157140)
chr1 (256-416)||(3550712-3550867)
chr1 (275-418)||(34364516-34364659)
chr1 (275-417)||(40082416-40082557)
chr1 (275-416)||(41142381-41142523)
chr1 (275-416)||(26661530-26661671)
chr1 (276-416)||(3875339-3875479)
chr1 (289-416)||(31767169-31767296)
chr1 (275-418)||(34364934-34365077)
chr1 (275-414)||(9955916-9956057)
chr1 (275-416)||(14318876-14319017)
chr1 (275-415)||(37556120-37556260)
chr1 (275-403)||(29798208-29798336)
chr1 (275-416)||(17294586-17294728)
chr1 (291-401)||(26661921-26662031)
chr1 (289-414)||(39066210-39066335)
chr1 (275-416)||(50052032-50052172)
chr1 (255-416)||(45493982-45494146)
chr1 (275-416)||(11977289-11977430)
chr1 (275-413)||(5319976-5320114)
chr1 (275-401)||(22077518-22077644)
chr1 (275-416)||(24600322-24600463)
chr1 (275-416)||(34649447-34649588)
chr1 (275-416)||(37850608-37850749)
chr1 (276-419)||(5528759-5528902)
chr1 (295-416)||(32168706-32168821)
chr1 (275-409)||(38804370-38804504)
chr1 (275-412)||(45084391-45084522)
chr1 (255-343)||(3537228-3537314)
chr1 (303-416)||(22077118-22077231)
chr1 (300-385)||(44043811-44043896)
chr1 (275-415)||(37555739-37555878)
chr1 (275-416)||(66480-66621)
chr1 (275-360)||(41184489-41184574)
chr1 (275-425)||(22793287-22793438)
chr1 (275-413)||(24131999-24132134)
chr1 (278-414)||(30630648-30630784)
chr1 (289-413)||(66100-66223)
chr1 (278-416)||(5575116-5575252)
chr1 (275-416)||(22077837-22077977)
chr1 (313-414)||(45839678-45839779)
chr1 (339-389)||(9956208-9956258)
chr1 (289-391)||(10351183-10351285)
chr1 (303-398)||(30576609-30576704)
chr1 (275-415)||(19283464-19283604)
chr1 (281-413)||(44091909-44092041)
chr1 (275-380)||(44685465-44685570)
chr1 (303-380)||(4956228-4956305)
chr1 (351-416)||(11977029-11977094)
chr1 (321-381)||(35154046-35154106)
chr1 (336-416)||(50051697-50051776)
chr1 (365-415)||(4266807-4266855)
chr1 (276-343)||(21378122-21378189)
chr1 (320-398)||(1188614-1188692)
chr1 (337-415)||(47380176-47380254)
chr1 (275-325)||(50469180-50469230)
chr1 (275-331)||(4266875-4266931)
chr1 (275-334)||(30630912-30630972)
chr1 (310-401)||(24448321-24448412)
chr1 (320-389)||(1187399-1187468)
chr1 (311-404)||(5996892-5996984)
chr1 (351-384)||(31973375-31973408)
chr1 (315-360)||(41184152-41184197)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (255-416)||(36178613-36178772)
chr2 (275-416)||(15511503-15511644)
chr2 (255-416)||(37106179-37106338)
chr2 (256-416)||(14745675-14745833)
chr2 (255-416)||(5542633-5542792)
chr2 (275-416)||(962607-962748)
chr2 (275-416)||(6421394-6421535)
chr2 (256-416)||(41283483-41283641)
chr2 (275-416)||(42514658-42514799)
chr2 (255-416)||(5543006-5543165)
chr2 (251-416)||(37105911-37106074)
chr2 (275-416)||(15880272-15880413)
chr2 (289-416)||(6422133-6422260)
chr2 (275-416)||(40679637-40679778)
chr2 (289-413)||(36178182-36178306)
chr2 (266-413)||(33731648-33731795)
chr2 (275-418)||(40733526-40733669)
chr2 (275-416)||(6712985-6713127)
chr2 (303-416)||(36005888-36006001)
chr2 (278-404)||(28254259-28254383)
chr2 (256-373)||(36178320-36178435)
chr2 (255-416)||(7598600-7598751)
chr2 (275-416)||(37632605-37632746)
chr2 (256-414)||(1769884-1770040)
chr2 (255-416)||(14745301-14745461)
chr2 (277-418)||(40163378-40163520)
chr2 (275-416)||(35580732-35580872)
chr2 (275-413)||(38796629-38796769)
chr2 (275-418)||(28531320-28531463)
chr2 (303-416)||(23346274-23346386)
chr2 (320-416)||(3673122-3673218)
chr2 (278-414)||(7598240-7598376)
chr2 (275-389)||(33561486-33561600)
chr2 (328-416)||(6421793-6421881)
chr2 (295-410)||(5367484-5367599)
chr2 (275-416)||(16590897-16591033)
chr2 (338-416)||(3672773-3672851)
chr2 (275-377)||(31468797-31468895)
chr2 (275-403)||(12529049-12529177)
chr2 (275-418)||(29676912-29677060)
chr2 (289-413)||(29873548-29873672)
chr2 (275-416)||(40733892-40734032)
chr2 (275-373)||(16542458-16542556)
chr2 (277-398)||(30313189-30313309)
chr2 (328-416)||(6421688-6421776)
chr2 (275-354)||(31899496-31899575)
chr2 (290-374)||(31259666-31259750)
chr2 (319-411)||(36784273-36784365)
chr2 (289-371)||(28254165-28254247)
chr2 (275-416)||(29676544-29676679)
chr2 (277-374)||(29874073-29874170)
chr2 (308-397)||(31385779-31385868)
chr2 (275-343)||(38796299-38796367)
chr2 (264-396)||(41678396-41678527)
chr2 (308-383)||(30323506-30323581)
chr2 (275-398)||(33953797-33953920)
chr2 (275-374)||(37895111-37895210)
chr2 (308-414)||(3594188-3594294)
chr2 (333-384)||(28226404-28226455)
chr2 (275-416)||(9231258-9231399)
chr2 (275-323)||(36785664-36785712)
chr2 (275-373)||(12910237-12910335)
chr2 (308-384)||(30312831-30312907)
chr2 (330-370)||(35580494-35580534)
chr2 (320-379)||(25390313-25390372)
chr2 (308-365)||(2336666-2336723)
chr2 (345-382)||(13792536-13792573)
chr2 (339-396)||(15689427-15689484)
chr2 (303-384)||(37894732-37894813)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (275-416)||(1085624-1085765)
chr7 (276-416)||(6054570-6054710)
chr7 (275-415)||(7517589-7517729)
chr7 (255-416)||(14681501-14681658)
chr7 (275-414)||(19122741-19122879)
chr7 (275-418)||(30244279-30244422)
chr7 (255-416)||(37533019-37533177)
chr7 (276-414)||(45434646-45434784)
chr7 (258-416)||(29157559-29157715)
chr7 (275-416)||(37533372-37533513)
chr7 (275-415)||(40094783-40094923)
chr7 (275-413)||(11845200-11845338)
chr7 (275-416)||(23385-23526)
chr7 (289-418)||(22567045-22567174)
chr7 (275-416)||(34218042-34218183)
chr7 (275-418)||(30245086-30245225)
chr7 (275-413)||(45754725-45754862)
chr7 (275-395)||(7554034-7554154)
chr7 (275-418)||(36939739-36939882)
chr7 (276-401)||(24838724-24838850)
chr7 (289-415)||(45433264-45433390)
chr7 (275-413)||(47129104-47129242)
chr7 (275-416)||(9901654-9901793)
chr7 (275-374)||(22566712-22566811)
chr7 (275-413)||(41854644-41854781)
chr7 (275-416)||(24177444-24177585)
chr7 (276-404)||(118319-118449)
chr7 (275-385)||(16569205-16569315)
chr7 (275-385)||(16596347-16596457)
chr7 (270-416)||(30032571-30032717)
chr7 (308-418)||(30253534-30253640)
chr7 (275-402)||(36622969-36623096)
chr7 (278-415)||(36534795-36534930)
chr7 (295-392)||(1085280-1085377)
chr7 (276-385)||(40230330-40230439)
chr7 (289-416)||(37167810-37167931)
chr7 (275-414)||(8128451-8128590)
chr7 (275-385)||(43241504-43241614)
chr7 (312-416)||(28300261-28300366)
chr7 (275-400)||(20599323-20599450)
chr7 (275-339)||(30245503-30245567)
chr7 (275-416)||(41910594-41910743)
chr7 (264-391)||(37345916-37346043)
chr7 (351-416)||(47129454-47129519)
chr7 (275-354)||(28301613-28301692)
chr7 (351-416)||(28300576-28300642)
chr7 (277-339)||(30255350-30255412)
chr7 (335-383)||(23569043-23569091)
chr7 (275-334)||(36109007-36109066)
chr7 (334-413)||(40094424-40094503)
chr7 (354-416)||(37532759-37532821)
chr7 (333-398)||(21619071-21619136)
chr7 (275-336)||(30244710-30244771)
chr7 (315-398)||(4124114-4124197)
chr7 (333-384)||(21416181-21416232)
chr7 (308-402)||(15902342-15902436)
chr7 (367-416)||(30244453-30244502)
chr7 (367-416)||(30253671-30253720)
chr7 (358-411)||(45755019-45755072)
chr7 (279-371)||(44361517-44361608)
chr7 (338-397)||(2512575-2512634)
chr7 (337-391)||(37345652-37345706)
chr7 (374-411)||(7517765-7517802)
chr7 (374-411)||(7518031-7518068)
chr7 (367-416)||(30245256-30245305)
chr7 (275-316)||(40094502-40094543)
chr7 (337-378)||(48071457-48071498)
chr7 (338-398)||(7109754-7109814)
chr7 (333-373)||(27598052-27598092)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (255-415)||(50630762-50630920)
chr4 (256-416)||(55933130-55933288)
chr4 (275-416)||(25483345-25483486)
chr4 (275-416)||(54017601-54017742)
chr4 (261-415)||(50002423-50002575)
chr4 (275-416)||(36629246-36629387)
chr4 (256-416)||(41370349-41370507)
chr4 (289-416)||(54936219-54936345)
chr4 (275-416)||(1731653-1731794)
chr4 (275-416)||(36608667-36608808)
chr4 (275-416)||(39792866-39793007)
chr4 (275-414)||(39404407-39404546)
chr4 (288-414)||(18932757-18932883)
chr4 (278-416)||(22027967-22028105)
chr4 (275-416)||(3340816-3340957)
chr4 (275-416)||(32941129-32941270)
chr4 (289-414)||(54108936-54109060)
chr4 (276-418)||(54343012-54343147)
chr4 (273-416)||(44620360-44620503)
chr4 (289-416)||(44621025-44621152)
chr4 (289-395)||(45496828-45496934)
chr4 (275-404)||(4955335-4955464)
chr4 (278-416)||(22028375-22028515)
chr4 (275-416)||(39404027-39404168)
chr4 (275-415)||(3244458-3244598)
chr4 (275-414)||(52884704-52884844)
chr4 (275-414)||(50459730-50459869)
chr4 (275-414)||(52884896-52885038)
chr4 (275-413)||(16888825-16888963)
chr4 (256-385)||(49880152-49880279)
chr4 (275-416)||(10245929-10246069)
chr4 (275-416)||(49302913-49303056)
chr4 (289-412)||(4390111-4390234)
chr4 (275-416)||(20826226-20826367)
chr4 (275-404)||(34646667-34646796)
chr4 (295-415)||(54108565-54108686)
chr4 (275-416)||(22183270-22183411)
chr4 (275-416)||(44620669-44620809)
chr4 (275-416)||(51768066-51768207)
chr4 (275-374)||(2741080-2741179)
chr4 (275-414)||(36572028-36572167)
chr4 (297-416)||(49076837-49076955)
chr4 (275-397)||(41707490-41707611)
chr4 (275-416)||(20825845-20825986)
chr4 (275-418)||(2740709-2740850)
chr4 (308-404)||(15841386-15841482)
chr4 (320-416)||(23817687-23817783)
chr4 (275-414)||(34004593-34004730)
chr4 (278-373)||(54741227-54741322)
chr4 (275-397)||(3341137-3341259)
chr4 (275-385)||(6975493-6975603)
chr4 (275-416)||(16889542-16889683)
chr4 (289-374)||(54017750-54017835)
chr4 (278-418)||(45489336-45489475)
chr4 (306-416)||(43827480-43827589)
chr4 (275-416)||(3700374-3700507)
chr4 (312-416)||(18879852-18879956)
chr4 (317-416)||(31691203-31691304)
chr4 (275-416)||(43174515-43174657)
chr4 (289-416)||(3271807-3271939)
chr4 (275-403)||(40067052-40067181)
chr4 (275-360)||(49076510-49076595)
chr4 (275-398)||(23556890-23557013)
chr4 (308-418)||(28034271-28034381)
chr4 (275-412)||(19504714-19504842)
chr4 (268-398)||(760191-760320)
chr4 (275-332)||(44620305-44620362)
chr4 (295-384)||(48111736-48111825)
chr4 (308-391)||(34544148-34544232)
chr4 (352-415)||(45489721-45489784)
chr4 (277-343)||(10246358-10246424)
chr4 (346-416)||(41370738-41370808)
chr4 (358-416)||(43174233-43174291)
chr4 (275-340)||(11348410-11348475)
chr4 (320-380)||(2891864-2891924)
chr4 (303-416)||(39698950-39699065)
chr4 (333-384)||(11197293-11197344)
chr4 (355-414)||(11348272-11348330)
chr4 (308-367)||(41603246-41603305)
chr4 (256-318)||(50788087-50788147)
chr4 (275-332)||(44621435-44621492)
chr4 (333-385)||(922485-922537)
chr4 (289-332)||(44620968-44621011)
chr4 (333-384)||(53468038-53468089)
chr4 (308-400)||(6876123-6876212)
chr4 (278-391)||(15841016-15841128)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (256-418)||(32487386-32487545)
chr5 (256-416)||(6500443-6500600)
chr5 (275-416)||(18603128-18603269)
chr5 (255-416)||(6500814-6500972)
chr5 (275-416)||(40296323-40296464)
chr5 (261-416)||(36492225-36492378)
chr5 (289-416)||(3295353-3295479)
chr5 (255-416)||(624187-624346)
chr5 (275-409)||(41170643-41170777)
chr5 (256-416)||(27502044-27502202)
chr5 (254-385)||(9498693-9498822)
chr5 (275-418)||(11416983-11417126)
chr5 (264-416)||(3295023-3295172)
chr5 (275-416)||(25327944-25328085)
chr5 (275-420)||(26074150-26074295)
chr5 (275-420)||(26074621-26074766)
chr5 (276-416)||(41632792-41632932)
chr5 (275-410)||(13415774-13415909)
chr5 (275-416)||(15370108-15370249)
chr5 (278-416)||(26075169-26075308)
chr5 (275-416)||(35150016-35150156)
chr5 (276-416)||(34753033-34753173)
chr5 (270-420)||(38427552-38427701)
chr5 (275-416)||(42405606-42405745)
chr5 (275-416)||(299498-299639)
chr5 (261-401)||(29549278-29549416)
chr5 (275-415)||(12662661-12662801)
chr5 (256-413)||(623810-623965)
chr5 (278-416)||(33747783-33747921)
chr5 (275-416)||(1028525-1028666)
chr5 (303-416)||(15370439-15370552)
chr5 (275-415)||(24489215-24489353)
chr5 (303-418)||(26590916-26591031)
chr5 (289-416)||(35167846-35167973)
chr5 (256-405)||(5723810-5723957)
chr5 (275-416)||(36568577-36568716)
chr5 (275-404)||(6224205-6224334)
chr5 (275-398)||(26074807-26074931)
chr5 (290-403)||(41635212-41635325)
chr5 (277-410)||(300970-301095)
chr5 (251-341)||(7768837-7768925)
chr5 (310-392)||(36522269-36522351)
chr5 (275-398)||(36521922-36522045)
chr5 (275-416)||(2411016-2411157)
chr5 (275-343)||(26074327-26074395)
chr5 (309-384)||(13786041-13786116)
chr5 (280-374)||(19275543-19275636)
chr5 (352-416)||(26900025-26900089)
chr5 (275-342)||(35914858-35914925)
chr5 (289-361)||(42508635-42508707)
chr5 (351-402)||(795254-795305)
chr5 (333-384)||(13042606-13042657)
chr5 (333-380)||(13112604-13112651)
chr5 (353-413)||(38427306-38427366)
chr5 (275-326)||(6225053-6225104)
chr5 (324-391)||(32445943-32446010)
chr5 (275-361)||(31509632-31509718)
chr5 (275-336)||(39309693-39309754)
chr5 (351-416)||(42435512-42435577)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (275-415)||(5405-5546)
scaffold0734 (275-401)||(5786-5917)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (275-416)||(522-663)
scaffold0702 (255-416)||(155-309)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (275-416)||(1114-1255)
scaffold0391 (313-384)||(1731-1802)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (275-382)||(17496-17605)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (289-416)||(47383-47510)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (275-385)||(5366-5476)
scaffold0078 (278-416)||(4994-5132)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (275-344)||(10191-10260)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (308-398)||(39498-39588)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 237 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39935142 - 39934875
Alignment:
Q  237 ggacgtggttatggatttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39935142 ggacgtggttatggatttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatc 39935043  T
Q  337 cataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatgatgacccctgaaccagac 436  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935042 cataaacccattgccttaaagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggatgatgacccctgaaccagac 39934943  T
Q  437 gtataanaacggatgaccaaccggttttgatttaacaggttaanttttaggtgcaaatatccaatnaaa 505  Q
     ||||  || |||||||| ||| ||||| | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  39934942 ttatagaaatggatgaccgacc-gttttaaattaatcggttaaattttaggtgcaaatatccaataaaa 39934875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39935347 - 39935213
Alignment:
Q  28 gaatcttgttttctagaatgatgaatagaaactatgattttctagaatatttgattaatcacatagttttttcacacaggtacataagaagattattctc 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935347 gaatcttgttttctagaatcatgaatagaaactatgattttctagaatatttgattaatcacatagttttttcacacaggtacataagaagattattctc 39935248  T
Q  128 gcaactttattaatgagagaggggaagatatgattcag 165  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935247 gcaact---ttaatgagagaggggaagatatgattcag 39935213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Original strand, 22304560 - 22304719
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22304560 gtgttggtttgcaagtgtgagc--tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgcctta 22304657  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22304658 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtgga 22304719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 264 - 416
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589853
Alignment:
Q  264 tgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgg 363  Q
    ||||||||||||   ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgag---tatatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 32589800  T
Q  364 gtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32589801 gtaagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtgga 32589853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 43346940 - 43346799
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43346940 gagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 43346841  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  43346840 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtgga 43346799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 276 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12114710 - 12114571
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||| ||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12114710 agttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgg 12114611  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  12114610 tgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtgg 12114571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37990788 - 37990647
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37990788 gagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 37990689  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37990688 gtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtgga 37990647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37991126 - 37990985
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37991126 gagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaagagtgtg 37991027  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37991026 gtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtgga 37990985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42342537 - 42342396
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342537 gagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 42342438  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  42342437 acgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtgga 42342396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 256 - 415
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaa 39389159  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||   ||||||||| || |||||||    
T  39389160 ggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 54017965 - 54017825
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  54017965 gagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtg 54017866  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  54017865 gtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgg 54017825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29645050 - 29644910
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29645050 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgg 29644951  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||    
T  29644950 cgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtgga 29644910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 15772863 - 15773004
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  15772863 gagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggataagagtgtg 15772962  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15772963 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtgga 15773004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 33803401 - 33803260
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  33803401 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggtaagagtgtg 33803302  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33803301 gcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 33803260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 35946531 - 35946672
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35946531 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaaaagtgtg 35946630  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  35946631 gtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtgga 35946672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 54018347 - 54018207
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  54018347 gagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtg 54018248  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54018247 gtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 54018207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 29644730 - 29644587
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29644730 gagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 29644631  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
      ||||||||| ||| || ||||||| |||  ||||||||||||    
T  29644630 gcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgtggatg 29644587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612470
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaa-----cacattgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     || ||| |    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattat 50612521  T
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  50612520 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttc 50612470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 289 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 41359900 - 41359774
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||    
T  41359900 acatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggcgtctctctcgct 41359801  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41359800 tgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 41359774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 25755403 - 25755546
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  25755403 gagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaaaagtgtg 25755502  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
      ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25755503 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatg 25755546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Original strand, 52634685 - 52634822
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52634685 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 52634783  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||    
T  52634784 acgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgt 52634822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25739574 - 25739433
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  25739574 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggtaagagtgtg 25739475  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    | ||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  25739474 acgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtgga 25739433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22304097 - 22303962
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22304097 gagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtg 22304005  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggat 417  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22304004 gtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggat 22303962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 296 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 45395781 - 45395661
Alignment:
Q  296 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtgg 395  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  45395781 ataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgggg 45395682  T
Q  396 ttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  45395681 ttgctctagcctcgatgtgga 45395661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 53577373 - 53577516
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  53577373 gagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggtaagagtgtg 53577472  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  53577473 gtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatg 53577516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 15773201 - 15773344
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15773201 gagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 15773300  T
Q  375 atgtctct--cttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15773301 atgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtgga 15773344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 32463050 - 32462910
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32463050 gagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgt 32462951  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32462950 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 32462910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42342225 - 42342098
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  42342225 acatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgct 42342126  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42342125 tgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 42342098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 255 - 380
Target Start/End: Original strand, 4823646 - 4823769
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4823646 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgcctta 4823743  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtct 380  Q
    || ||||||||||||||||| |||||    
T  4823744 agattttgggtaagagtgtggtgtct 4823769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21832492 - 21832353
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||    
T  21832492 gagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggttttgggtaaga--gtg 21832395  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21832394 gcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtgga 21832353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Original strand, 39914261 - 39914399
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||  |||||| ||||||||||    
T  39914261 gagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggataagagtgtg 39914360  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
     ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  39914361 gtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgt 39914399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 33175813 - 33175668
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacacattgtcttaaggttttgggtaaga-- 369  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| | |||||||||||||||||||      
T  33175813 gagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttgggtaagagt 33175714  T
Q  370 gtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  33175713 gtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgg 33175668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 3135222 - 3135099
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| || || | |||||||||| |||||||||||    
T  3135222 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtgtg 3135123  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
     |||||||||| |||||| |||||    
T  3135122 gtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 414
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886703
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||          
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattg------ 51886644  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  51886645 cgttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtg 51886703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49336836 - 49336693
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||| |||||  ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  49336836 gagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaagagtgtg 49336737  T
Q  375 atgtctctc-ttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggat 417  Q
     |||||||| ||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  49336736 gtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtggat 49336693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303670
Alignment:
Q  324 aagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgt 22303670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584832
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  ||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtg- 42584872  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     || |||||||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  42584871 -gtgtctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtgga 42584832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 31190026 - 31190159
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||    
T  31190026 gagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggtaagagtgtg 31190117  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  31190118 gtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttgga 31190159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726646
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |        ||||| ||| |    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagaggatc--------cattgccttta 37726585  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  37726586 ggttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtgga 37726646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 306 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1634432 - 1634323
Alignment:
Q  306 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagt 405  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| || | | ||||||||||||     
T  1634432 aaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttgggtaagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagc 1634334  T
Q  406 ctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||    
T  1634333 ctcgatgtgga 1634323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 295 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 44160673 - 44160555
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtg 394  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||  || |    
T  44160673 gataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggtaagaatgtggcgtctctcttact--tgcg 44160577  T
Q  395 gttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||| |||||||||||    
T  44160576 attgttctagcctcgatgtgga 44160555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 306 - 416
Target Start/End: Original strand, 45901754 - 45901864
Alignment:
Q  306 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||      
T  45901754 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggtaagagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaac 45901853  T
Q  406 ctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||||    
T  45901854 ttcgatgtgga 45901864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3135610 - 3135462
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacacattgtcttaaggttttgggtaa 367  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| | |||    
T  3135610 gagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttttagataa 3135511  T
Q  368 gagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3135510 gagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 3135462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 384
Target Start/End: Original strand, 8327913 - 8328022
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  8327913 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggtaagagtgtg 8328012  T
Q  375 atgtctctct 384  Q
     |||||||||    
T  8328013 gtgtctctct 8328022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 11661980 - 11662099
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaagg-ttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgt 393  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||    
T  11661980 gataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaagagtgaggtgtctctctca-ttgtgt 11662078  T
Q  394 ggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  11662079 ggttgttctagcctcgatgtg 11662099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 53118123 - 53117985
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  53118123 gagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggtaagagtgta 53118025  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
     ||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  53118024 gtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtg 53117985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 308 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 47964634 - 47964544
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  47964634 aggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33362422 - 33362349
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaag 368  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  33362422 gataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaag 33362349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 306 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32462676 - 32462569
Alignment:
Q  306 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||  ||||| | ||||| |||     
T  32462676 aaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagc 32462577  T
Q  406 ctcgatgt 413  Q
    ||||||||    
T  32462576 ctcgatgt 32462569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 9240158 - 9240299
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| |||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||| || ||||| ||||    
T  9240158 gagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcggataagaatgtg 9240257  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||| | | ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  9240258 gtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtgga 9240299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 413
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtct 407  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||  |||||||||| | ||||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  408 cgatgt 413  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3384433 - 3384317
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||| |||||| |||||  |||||||||  ||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | || ||||    
T  3384433 gtgttggtgtgcaagcgtgag--ttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgcctta 3384336  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgt 373  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3384335 aagttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7767463 - 7767380
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggt 358  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7767463 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 321
Target Start/End: Original strand, 22304237 - 22304301
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacacctt 321  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22304237 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017557
Alignment:
Q  336 ccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| | | ||||||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtgg 54017557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 46546441 - 46546371
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgt 378  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  46546441 aggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtgatgt 46546371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 374
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635048
Alignment:
Q  316 caccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtg 52635048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtg 394  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 41359564 - 41359499
Alignment:
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  41359564 cttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtgga 41359499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 333
Target Start/End: Original strand, 11661544 - 11661602
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 333  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  11661544 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg 11661602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 398
Target Start/End: Original strand, 25317200 - 25317290
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  25317200 aggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaaagtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39336345 - 39336280
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  39336345 aggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggataatagtgt 39336280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 47965064 - 47964923
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||  |||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  47965064 gagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggtaagagtgtg 47964965  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      |||||||| |||| | || ||||||| | || ||||||||    
T  47964964 gcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtgga 47964923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 322
Target Start/End: Original strand, 43346659 - 43346706
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacacctta 322  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346659 gagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 384
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 384
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 384
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735043
Alignment:
Q  334 acccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtg 372  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtg 17735043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036312
Alignment:
Q  334 acccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtg 372  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtg 19036312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Original strand, 11661605 - 11661638
Alignment:
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11661605 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731954
Alignment:
Q  321 tataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtg 17731954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033185
Alignment:
Q  321 tataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtg 19033185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978873
Alignment:
Q  346 attgtcttaaggttttgggtaag----agtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||    ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtgga 43978873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7766854 - 7766789
Alignment:
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  7766854 cttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctc--acttgtatggttgttctagcctcgatgtagatg 7766789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 376 - 416
Target Start/End: Original strand, 22304303 - 22304343
Alignment:
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22304303 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 22304343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 255 - 418
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3669839
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgcctta 3669775  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3669776 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatg 3669839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 256 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014251
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaa 1014314  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1014313 agttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatg 1014251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 45122206 - 45122067
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45122206 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggtaagagtgtg 45122107  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45122106 gtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Original strand, 3670052 - 3670210
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||    
T  3670052 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaa 3670149  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3670150 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 3670210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 420
Target Start/End: Original strand, 34834885 - 34835030
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34834885 gagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 34834984  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatgat 420  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34834985 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggatgat 34835030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Original strand, 34835218 - 34835356
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34835218 gagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 34835317  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
     |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34835318 gtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgt 34835356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 290 - 416
Target Start/End: Original strand, 45122648 - 45122774
Alignment:
Q  290 catcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttactt 389  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||    
T  45122648 catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgctt 45122747  T
Q  390 gtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  45122748 gtgtggttgttcaagcctcgatgtgga 45122774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3038439 - 3038298
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3038439 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 3038340  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
       |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3038339 gcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 3038298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Original strand, 30441072 - 30441235
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacacattgt 350  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| |||||     
T  30441072 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgc 30441169  T
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30441170 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 30441235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870594
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttcta 403  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 20870594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25561965 - 25561823
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggtttt-gggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25561965 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggtaagagtgt 25561866  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25561865 gacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtgga 25561823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9483316 - 9483195
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtg 394  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||| |    
T  9483316 gataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcgtgcg 9483217  T
Q  395 gttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  9483216 gttgttctagcctcgatgtgga 9483195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33113516 - 33113387
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33113516 gagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtg 33113417  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctag 404  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||    
T  33113416 gtgtctctcttgctagtgtggttgttctag 33113387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 40518591 - 40518732
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  40518591 gagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaagagtgtg 40518690  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40518691 acgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgga 40518732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 255 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1014038 - 1013877
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  1014038 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgcctta 1013941  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
      |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1013940 gagttttgagtaagagtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatg 1013877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 413
Target Start/End: Original strand, 34835504 - 34835622
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtg 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  34835504 gataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtg 34835603  T
Q  395 gttgttctagtctcgatgt 413  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  34835604 gttattctagcctcgatgt 34835622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 413
Target Start/End: Original strand, 34835770 - 34835888
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtg 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  34835770 gataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtg 34835869  T
Q  395 gttgttctagtctcgatgt 413  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  34835870 gttattctagcctcgatgt 34835888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37544639 - 37544498
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  37544639 gagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaagagtgtg 37544540  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37544539 gtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 37544498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6876997 - 6876870
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |    
T  6876997 acatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgtt 6876898  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6876897 tgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 6876870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 30359280 - 30359423
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30359280 gagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtg 30359379  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
     |||||||||| ||||||  |||||| ||| ||| |||||||||    
T  30359380 gtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatg 30359423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 278 - 416
Target Start/End: Original strand, 5420663 - 5420801
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatg 377  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| |    
T  5420663 ttatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgtaagagtgtgacg 5420762  T
Q  378 tctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||| || |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5420763 tctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgga 5420801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 30359618 - 30359759
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||| |||||||||||||||||    
T  30359618 gagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtg 30359717  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||    
T  30359718 gtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtgga 30359759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 70423 - 70295
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  70423 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtgtg 70324  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttcta 403  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  70323 acgtctatcttgcttgtgtggttgttcta 70295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 298 - 416
Target Start/End: Original strand, 40518103 - 40518221
Alignment:
Q  298 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggtt 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  40518103 aaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggtt 40518202  T
Q  398 gttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  40518203 gttctagccttgatgtgga 40518221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 404
Target Start/End: Original strand, 147460 - 147589
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  147460 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 147559  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctag 404  Q
      ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  147560 gcgtctctcttgcttgtgcggtagttctag 147589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1514064 - 1513923
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  1514064 gagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaaaagtgtg 1513965  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     | |||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  1513964 gtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtgga 1513923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8918913 - 8918772
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||| |||||  ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8918913 gagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaaggttttgggtaagagtgtg 8918814  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    | |||| |||| | |||||||||||| ||  |||||||||||    
T  8918813 acgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtgga 8918772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 9309364 - 9309504
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  9309364 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggtaagagtgtg 9309463  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||    
T  9309464 gtgtctctctca-gtatgtggttgttctagcctcgatgtgga 9309504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9482753 - 9482612
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  ||||||||||    
T  9482753 gagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtgtg 9482654  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     | |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9482653 gtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 9482612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 40579635 - 40579514
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||  |    
T  40579635 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacg 40579536  T
Q  395 gttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  40579535 gttgttctatcctcgatgtgga 40579514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 45123015 - 45123156
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagag--tg 372  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  45123015 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacctta--agtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggtaagagagtg 45123112  T
Q  373 tgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45123113 tggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtgga 45123156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 45121791 - 45121664
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  45121791 acatcggataaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttact 45121692  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||    
T  45121691 tatggggttgttctagcctcgatgtgga 45121664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18372122 - 18372004
Alignment:
Q  296 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtgg 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||    
T  18372122 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctctcgcttgtgcgg 18372023  T
Q  396 ttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    ||| ||||| ||| |||||    
T  18372022 ttgctctagcctcaatgtg 18372004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 9608754 - 9608895
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||    
T  9608754 gagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggtatgagtgtg 9608853  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9608854 gcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtgga 9608895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 45122059 - 45121918
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  45122059 gagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggtaacagtgtg 45121960  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      |||||| || || |||||||| ||| || |||||||||||    
T  45121959 gcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtgga 45121918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 327 - 416
Target Start/End: Original strand, 5915928 - 5916017
Alignment:
Q  327 taagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5915928 taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 5916017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 255 - 420
Target Start/End: Original strand, 6731895 - 6732049
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||  ||||| ||||    
T  6731895 gtgttgttttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa---------agtaagagaacccataaattcattgcctta 6731983  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatgat 420  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  6731984 aggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtggatgat 6732049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 289 - 403
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  389 tgtgtggttgttcta 403  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 9308986 - 9309131
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcataca--tcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaag---a 369  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||   |    
T  9308986 gagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgggcaagagta 9309085  T
Q  370 gtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||    
T  9309086 gtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtgga 9309131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18371805 - 18371669
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  18371805 gagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtgtg 18371711  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||| ||||| | ||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  18371710 gtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtgga 18371669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43274928 - 43274824
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43274928 gagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaagagtgtg 43274829  T
Q  375 atgtc 379  Q
     ||||    
T  43274828 gtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 303 - 416
Target Start/End: Original strand, 9507819 - 9507932
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttct 402  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||| | |||||||||     
T  9507819 agtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttca 9507918  T
Q  403 agtctcgatgtgga 416  Q
    || |||||||||||    
T  9507919 agcctcgatgtgga 9507932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 4154429 - 4154290
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  4154429 gagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagag-acccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtg 4154331  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    |||||||||| | |||| |||||| ||| | || |||||||    
T  4154330 atgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgtgg 4154290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 6651512 - 6651646
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |         |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6651512 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacccataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 6651602  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
     |||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  6651603 gtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatg 6651646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 415
Target Start/End: Original strand, 12283883 - 12284021
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||      
T  12283883 agttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggataagagtgtag 12283981  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12283982 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18372848 - 18372785
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 338  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372848 gagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 32640676 - 32640542
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  32640676 gagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtt 32640582  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
      ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  32640581 gcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtg 32640542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 401
Target Start/End: Original strand, 41972167 - 41972296
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggtt---ttgggtaagagt 371  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||| |||   ||||||||||||    
T  41972167 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttgggtaagagt 41972266  T
Q  372 gtgatgtctctcttacttgtgtggttgttc 401  Q
    |||  ||| ||||| |||||||||||||||    
T  41972267 gtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttc 41972296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416252
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 343  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg----agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaac 41416252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 416
Target Start/End: Original strand, 32305506 - 32305627
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtg 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||  |||| | |||||| ||      
T  32305506 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagattttggataagagtgtggcgtctttattacttatgca 32305605  T
Q  395 gttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||  || ||||||||    
T  32305606 gttgttctaaccttgatgtgga 32305627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 41129067 - 41129138
Alignment:
Q  345 cattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  41129067 cattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtgga 41129138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 384
Target Start/End: Original strand, 8794120 - 8794229
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||| |||||| |    
T  8794120 gagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtgagagtgcg 8794219  T
Q  375 atgtctctct 384  Q
     |||||||||    
T  8794220 gtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 334 - 414
Target Start/End: Original strand, 147888 - 147968
Alignment:
Q  334 acccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  147888 acccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9620825 - 9620704
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||   ||||||| ||    
T  9620825 gagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--ataagagtttg 9620728  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  9620727 atgtctctctcacttgtgtggttg 9620704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 289 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3037843 - 3037776
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaag 356  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3037843 acatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18372405 - 18372342
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 338  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372405 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18380166 - 18380067
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| || |  |||||||||||| |||||||||||    
T  18380166 gagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaagagtgtg 18380067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18373077 - 18372988
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagag 370  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||||    
T  18373077 ttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 4154836 - 4154707
Alignment:
Q  251 atttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgt 350  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||     
T  4154836 atttgtgttg-tgtgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgc 4154740  T
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 383  Q
    |  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4154739 cccaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 4154707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18372731 - 18372656
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  18372731 gataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaagagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 339  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 40579348 - 40579277
Alignment:
Q  345 cattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40579348 cattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 40579277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8919217 - 8919152
Alignment:
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8919217 cttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtgga 8919152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 404
Target Start/End: Original strand, 16524451 - 16524503
Alignment:
Q  352 ttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctag 404  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16524451 ttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  302 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156704
Alignment:
Q  337 cataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgt 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgt 12156704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20995495 - 20995442
Alignment:
Q  345 cattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20995495 cattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttg 20995442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 43398192 - 43398077
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||| ||||| ||| |||||     
T  43398192 agtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggataagaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgc 43398093  T
Q  400 tctagtctcgatgtgg 415  Q
    ||||  ||||||||||    
T  43398092 tctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 382
Target Start/End: Original strand, 5274784 - 5274891
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||  |||||   |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  5274784 gagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagtaagagtgtg 5274883  T
Q  375 atgtctct 382  Q
    ||||||||    
T  5274884 atgtctct 5274891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 363
Target Start/End: Original strand, 33832022 - 33832075
Alignment:
Q  310 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgg 363  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  33832022 gttgaacactttataagtaagaggacctataaacacttttttttaaggttttgg 33832075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 371
Target Start/End: Original strand, 20130462 - 20130553
Alignment:
Q  279 tatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagt 371  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||   |||| |||||| |||||||||    
T  20130462 tatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagagt 20130553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274643
Alignment:
Q  360 ttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtgga 43274643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 365
Target Start/End: Original strand, 40991795 - 40991852
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggt 365  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  40991795 aggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggt 40991852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 256 - 414
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 3409348  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3409349 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Original strand, 29518911 - 29519070
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  29518911 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctta 29519008  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29519009 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 29519070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518653
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 29518592  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29518593 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 29518653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741329
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 32741268  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32741269 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 32741329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Original strand, 2378117 - 2378276
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  2378117 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctta 2378214  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2378215 aggttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 2378276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210354
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaa 35210293  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  35210294 ggttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgga 35210354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Original strand, 3409651 - 3409810
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  3409651 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttt 3409748  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3409749 attttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 3409810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 254 - 416
Target Start/End: Original strand, 3415448 - 3415610
Alignment:
Q  254 tgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctt 353  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3415448 tgtgttggtttgcgagtgtgag--ttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcctt 3415545  T
Q  354 aaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgt--tctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  3415546 aaggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtgga 3415610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 289 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10074498 - 10074370
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10074498 acatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcact 10074399  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtggat 417  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10074398 agtgtggttgttctagcctcgatgtggat 10074370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 414
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaa 26544138  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  26544139 ggttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 2377763 - 2377904
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2377763 gagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 2377862  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||| |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  2377863 gtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtgga 2377904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058376
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaa 3058315  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||||  |||||||||||    
T  3058316 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtgga 3058376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 16454916 - 16455057
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16454916 gagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 16455015  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16455016 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 16455057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748350
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaa 14748407  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14748406 ggttttgggtaagagtgtg----gtctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 14748350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2580021 - 2579880
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  2580021 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggtaagaatgtg 2579922  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2579921 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 2579880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 256 - 415
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127509
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgag--ttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaa 1127449  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  1127450 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgg 1127509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 257 - 416
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846898
Alignment:
Q  257 gttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaag 356  Q
    ||||| ||||||||||||   || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaa--ttctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaag 1846838  T
Q  357 gttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1846839 gttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1846898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Original strand, 16107687 - 16107827
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16107687 gagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 16107786  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
     |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  16107787 gtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 2843563 - 2843705
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2843563 gagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgt 2843662  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    | | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2843663 ggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 2843705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 10911574 - 10911716
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  10911574 gagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaataagagtgt 10911673  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||    
T  10911674 gatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtgga 10911716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2578572 - 2578451
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtg 394  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |    
T  2578572 gataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcg 2578473  T
Q  395 gttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  2578472 gttgttctagcctcgatgtgga 2578451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6999945 - 6999804
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||    
T  6999945 gagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataagagtgtg 6999846  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6999845 gcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtgga 6999804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 16454584 - 16454725
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  16454584 gagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtg 16454683  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16454684 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 16454725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 303 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10073737 - 10073624
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttct 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10073737 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttct 10073638  T
Q  403 agtctcgatgtgga 416  Q
    ||  ||||||||||    
T  10073637 agcatcgatgtgga 10073624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2579641 - 2579498
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  2579641 gagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagtatg 2579542  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2579541 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatg 2579498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 275 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1950334 - 1950200
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | || |||||||||||| |||||||||||    
T  1950334 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaagagtgtg 1950235  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcg 409  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1950234 acgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 276 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 5832174 - 5832038
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||||||     
T  5832174 agttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagccaccc-cttaagattttgggtaaaagtgtgg 5832076  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5832075 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 5832038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10074140 - 10073999
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10074140 gagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtg 10074041  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||  ||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  10074040 gtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtgga 10073999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9062498 - 9062383
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9062498 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagtgtg 9062400  T
Q  375 atgtctctcttacttgt 391  Q
     | ||||||||||||||    
T  9062399 gtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32460729 - 32460629
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32460729 gagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 32460630  T
Q  375 a 375  Q
    |    
T  32460629 a 32460629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 593858 - 593718
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  593858 gagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggtaatagtgtg 593759  T
Q  375 --atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
      || ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  593758 gtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgt 593718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 5958752 - 5958615
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  5958752 gagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttttgggatagagtgtg 5958653  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||    |||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  5958652 atgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtgga 5958615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 290 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2578968 - 2578843
Alignment:
Q  290 catcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttactt 389  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  2578968 catcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccataaactcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctt 2578870  T
Q  390 gtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||   |||||||||||    
T  2578869 gtgtggttgttctgacctcgatgtgga 2578843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 16108072 - 16108154
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaagg 357  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16108072 gagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 16108154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2579253 - 2579119
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||| |||||||| |||    |||||| ||||| ||||||||||     
T  2579253 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----aggaaccataaacccataactttaaggctttggctaagagtgtgg 2579158  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  2579157 tgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtg 2579119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12085182 - 12085046
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12085182 gagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggtaagagtgtg 12085084  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatg 412  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12085083 gcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatg 12085046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 386
Target Start/End: Original strand, 8481936 - 8482046
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8481936 gagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtg 8482034  T
Q  375 atgtctctctta 386  Q
     |||||||||||    
T  8482035 gtgtctctctta 8482046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 12071764 - 12071701
Alignment:
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12071764 cttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 12071701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 308 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12092598 - 12092491
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtct 407  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||    
T  12092598 aggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagtaagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcct 12092499  T
Q  408 cgatgtgg 415  Q
     |||||||    
T  12092498 ggatgtgg 12092491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 382
Target Start/End: Original strand, 2975575 - 2975668
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 382  Q
    |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  2975575 acatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 398
Target Start/End: Original strand, 6071174 - 6071264
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||    
T  6071174 aggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30618727 - 30618643
Alignment:
Q  312 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30618727 tgaacactttataagtaagatgacc-ataaac-cgttgtcttaaggttatgggtaaaaatgtggtgtctctcttacttatgtggttg 30618643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 289 - 339
Target Start/End: Original strand, 35210501 - 35210551
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35210501 acatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637759
Alignment:
Q  334 acccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctta 386  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctta 11637759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789285
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaac 14789285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902452
Alignment:
Q  358 ttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttct 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttct 10902452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 416
Target Start/End: Original strand, 31714732 - 31714818
Alignment:
Q  329 agaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  || | | |  |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31714732 agaggacccattaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggcgt-tttttcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtgga 31714818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17135218 - 17135092
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||   || ||||||| ||||||||||    
T  17135218 gagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataagagtgtg 17135119  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttc 401  Q
    | | |||| |  |||||| ||||||||    
T  17135118 acggctctttcgcttgtgcggttgttc 17135092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 34661725 - 34661635
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||  || | |||||| || || ||| |||||| ||||||    
T  34661725 aggttgatcactttataagtaagagaacccatacatatattgtcttaaggttttacgttaaagtgtggtggctgtctcacttgtatggttg 34661635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605305
Alignment:
Q  334 acccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtg 22605305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 70)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 258 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594748
Alignment:
Q  258 ttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaagg 357  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaagg 32594783  T
Q  358 ttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtg 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32594782 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 44290992 - 44290832
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44290992 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 44290895  T
Q  355 aggttttgggt-aagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44290894 aggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 44290832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 416
Target Start/End: Original strand, 41759470 - 41759633
Alignment:
Q  251 atttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgt 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||     
T  41759470 atttttgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgc 41759567  T
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  41759568 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtgga 41759633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 44290625 - 44290466
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44290625 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 44290528  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  44290527 aggttttgggtaagagtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtgga 44290466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 48588655 - 48588496
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  48588655 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgcctta 48588558  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  48588557 aggttttgggtaagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 48588496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3537747 - 3537607
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3537747 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaaggttttgggtaagagtgtgg 3537648  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3537647 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 3537607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Original strand, 41157384 - 41157524
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  41157384 gagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagtaagagtgtg 41157483  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41157484 gtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 41157524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 415
Target Start/End: Original strand, 41157020 - 41157140
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtg 394  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  41157020 gataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgtg 41157119  T
Q  395 gttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  41157120 gttgttctagcctcgatgtgg 41157140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550867
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaa 3550809  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||||||| |||||||||||    
T  3550810 agttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtgga 3550867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 34364516 - 34364659
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34364516 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtg 34364615  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
    ||||||||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34364616 atgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatg 34364659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 417
Target Start/End: Original strand, 40082416 - 40082557
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40082416 gagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 40082514  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggat 417  Q
     | |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  40082515 gtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtggat 40082557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 41142381 - 41142523
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggt-aagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  41142381 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaaagagtgt 41142480  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41142481 ggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 41142523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26661671 - 26661530
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26661671 gagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 26661572  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  26661571 gtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatgga 26661530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3875479 - 3875339
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  3875479 agttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggtaagaatgtgg 3875380  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3875379 agtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 3875339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 31767296 - 31767169
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  31767296 acatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctatcttgct 31767197  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31767196 tgtgtggttgttctagactcgatgtgga 31767169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 34364934 - 34365077
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34364934 gagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtg 34365033  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
     |||||||||  ||| ||  |||| ||||  |||||||||||||    
T  34365034 gtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtggatg 34365077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Original strand, 9955916 - 9956057
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtg 372  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955916 gagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtg 9956015  T
Q  373 tgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  9956016 tgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtg 9956057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 14318876 - 14319017
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14318876 gagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 14318975  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  14318976 gtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtgga 14319017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Original strand, 37556120 - 37556260
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaa-tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  37556120 gagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgt 37556218  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37556219 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Original strand, 29798208 - 29798336
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  29798208 gagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggataagagtgtg 29798307  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttcta 403  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  29798308 gtgtctctcttgcaagtgtggttgttcta 29798336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 17294586 - 17294728
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17294586 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 17294685  T
Q  375 atgtctctcttacttgtg-tggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||  ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  17294686 gtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtgga 17294728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26662031 - 26661921
Alignment:
Q  291 atcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttg 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26662031 atcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 26661932  T
Q  391 tgtggttgttc 401  Q
    |||||||||||    
T  26661931 tgtggttgttc 26661921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 289 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 39066335 - 39066210
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39066335 acatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttact 39066236  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    | |||||||||||||| || ||||||    
T  39066235 tatgtggttgttctagccttgatgtg 39066210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 50052172 - 50052032
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  50052172 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaagttttgggtaagagtgtg 50052073  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||||  || ||| |||||||||  |||||||||||    
T  50052072 gtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtgga 50052032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493982
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacacattgt 350  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || |||||||| |||||     
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagt-ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgc 45494048  T
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  45494047 cttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtgga 45493982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 11977289 - 11977430
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  11977289 gagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtg 11977388  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11977389 atgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtgga 11977430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 5320114 - 5319976
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||     
T  5320114 gagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggtaagagtgta 5320015  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  5320014 gtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgt 5319976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22077644 - 22077518
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||    
T  22077644 gagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtg 22077545  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttc 401  Q
      |||||||| |||| || ||||||||    
T  22077544 gcgtctctctcacttatgcggttgttc 22077518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24600463 - 24600322
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24600463 gagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtg 24600364  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||  || || |||||||||||| |||||||||||    
T  24600363 gtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtgga 24600322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 34649447 - 34649588
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |    
T  34649447 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgag 34649546  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  34649547 gcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34649588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37850749 - 37850608
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  37850749 gagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggataagagtgtg 37850650  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  37850649 gtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtgga 37850608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 276 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528759
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||     
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatga 419  Q
     |||||||||  || || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtggatga 5528759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 295 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 32168821 - 32168706
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtg 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  32168821 gataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcg 32168728  T
Q  395 gttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  32168727 gttgttctagcctcgatgtgga 32168706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 38804504 - 38804370
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||| |||  |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||     
T  38804504 gagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgta 38804405  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcg 409  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  38804404 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 412
Target Start/End: Original strand, 45084391 - 45084522
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||    
T  45084391 gagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggtaagagagtg 45084484  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatg 412  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||    
T  45084485 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatg 45084522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3537314 - 3537228
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 343  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537314 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 3537228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 303 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22077231 - 22077118
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttct 402  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| || ||||||||     
T  22077231 agtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcacttatgcggttgttca 22077132  T
Q  403 agtctcgatgtgga 416  Q
    || |||||||||||    
T  22077131 agcctcgatgtgga 22077118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 300 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 44043896 - 44043811
Alignment:
Q  300 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 385  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44043896 aatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctt 44043811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Original strand, 37555739 - 37555878
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||  | | | ||||||||||||||||||||||||    
T  37555739 gagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaagagtgtg 37555837  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37555838 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 66621 - 66480
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |     
T  66621 gagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggtaagagtata 66522  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||||||  |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  66521 gcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtgga 66480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41184574 - 41184489
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttt 360  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41184574 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 41184489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 425
Target Start/End: Original strand, 22793287 - 22793438
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacatt-gtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  |||||  ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||    
T  22793287 gagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagtaagagtgt 22793386  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatgatgaccc 425  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||    
T  22793387 gacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacgatgaccc 22793438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24132134 - 24131999
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||   |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||    
T  24132134 gagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggta--agtgtg 24132038  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24132037 gtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgt 24131999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 30630784 - 30630648
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatg 377  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |    
T  30630784 ttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcg 30630685  T
Q  378 tctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    || || | |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  30630684 tccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 289 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 66223 - 66100
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttac 387  Q
    ||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||    
T  66223 acatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcgcctctc--ac 66126  T
Q  388 ttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||    
T  66125 ttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 416
Target Start/End: Original strand, 5575116 - 5575252
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatg 377  Q
    |||||||||  || || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |  |||||||||||| ||||||||||  |    
T  5575116 ttatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagtgtggcg 5575215  T
Q  378 tctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||  ||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  5575216 tctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtgga 5575252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22077977 - 22077837
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||  || ||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||    
T  22077977 gagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatag-cctaaggtttggggtaagagtgtg 22077879  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      |||||| | |||| || |||||||| ||  ||||||||||    
T  22077878 gcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtgga 22077837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 414
Target Start/End: Original strand, 45839678 - 45839779
Alignment:
Q  313 gaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatg 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||| | |||||||    
T  45839678 gaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttgggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatg 45839777  T
Q  413 tg 414  Q
    ||    
T  45839778 tg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956208
Alignment:
Q  339 taaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttactt 389  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctcttactt 9956208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 391
Target Start/End: Original strand, 10351183 - 10351285
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  10351183 acatcagatagaaaaatagaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcact 10351282  T
Q  389 tgt 391  Q
    |||    
T  10351283 tgt 10351285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30576704 - 30576609
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  30576704 agtagaggttgaacactttatgagtgagaggacccatagacataatgtcttaatgttttgggtaaaaatgtaatgtctctctcacttgtgttgttg 30576609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19283604 - 19283464
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||| | |||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  19283604 gagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggataagagtgtg 19283505  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
      |||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  19283504 gcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgg 19283464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 413
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092041
Alignment:
Q  281 tatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtct 380  Q
    ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||   | | | ||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  381 ctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
     ||| |||||| | |||||||| | ||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgt 44092041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 380
Target Start/End: Original strand, 44685465 - 44685570
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  44685465 gagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttgggtaacagtgt 44685563  T
Q  374 gatgtct 380  Q
    || ||||    
T  44685564 gacgtct 44685570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 380
Target Start/End: Original strand, 4956228 - 4956305
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtct 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||   ||| ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  4956228 agtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtct 4956305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 416
Target Start/End: Original strand, 11977029 - 11977094
Alignment:
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  11977029 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtgga 11977094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  321 tataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctc 381  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051697
Alignment:
Q  336 ccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtgga 50051697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266807
Alignment:
Q  365 taagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttact--tgtggttgttctagcctcgatgtgg 4266807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21378189 - 21378122
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 343  Q
    |||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21378189 agttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaac 21378122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 1188692 - 1188614
Alignment:
Q  320 ttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  1188692 ttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggtaaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttg 1188614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380176
Alignment:
Q  337 cataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| || || || |||||||    
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgg 47380176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 50469230 - 50469180
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469230 gagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4266931 - 4266875
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 331  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266931 gagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 334  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 401
Target Start/End: Original strand, 24448321 - 24448412
Alignment:
Q  310 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttc 401  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||  || ||||| |||| || ||||||||    
T  24448321 gttgaacattttataagtgagagggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttgttc 24448412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1187468 - 1187399
Alignment:
Q  320 ttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttactt 389  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  1187468 ttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagtaaaagtgtgacgtctctctcactt 1187399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 5996984 - 5996892
Alignment:
Q  311 ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctag 404  Q
    |||||||  |||||| | |||||| ||||| |  |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  5996984 ttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagtgagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctag 5996892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31973408 - 31973375
Alignment:
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31973408 cttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  315 acaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttt 360  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178613
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 36178675  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36178674 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtgga 36178613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15511644 - 15511503
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15511644 gagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtgtg 15511545  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15511544 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 15511503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Original strand, 37106179 - 37106338
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  37106179 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatttcctta 37106276  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  37106277 aggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtgga 37106338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745675
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 14745736  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14745735 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 14745675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 5542792 - 5542633
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  5542792 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgcctta 5542695  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5542694 aggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtgga 5542633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 962607 - 962748
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962607 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 962706  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  962707 ttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 962748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 6421394 - 6421535
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6421394 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaagagtgtg 6421493  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6421494 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtgga 6421535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283483
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 41283544  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41283543 ggttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtgga 41283483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 42514658 - 42514799
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  42514658 gagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtg 42514757  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42514758 gcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtgga 42514799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 5543165 - 5543006
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||    
T  5543165 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgcctta 5543068  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  5543067 agattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgga 5543006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 416
Target Start/End: Original strand, 37105911 - 37106074
Alignment:
Q  251 atttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgt 350  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  37105911 atttttgtgggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgc 37106008  T
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  37106009 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtgga 37106074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 15880272 - 15880413
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15880272 gagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 15880371  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  15880372 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgga 15880413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Original strand, 6422133 - 6422260
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  6422133 acatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgct 6422232  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6422233 tgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 6422260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 40679778 - 40679637
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  40679778 gagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtg 40679679  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40679678 gcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtgga 40679637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 289 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 36178306 - 36178182
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  36178306 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctcttgct 36178207  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  36178206 tgtgtggttgttatagcctcgatgt 36178182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 266 - 413
Target Start/End: Original strand, 33731648 - 33731795
Alignment:
Q  266 caagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggt 365  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  33731648 caagtgtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggt 33731747  T
Q  366 aagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    |||||| || |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  33731748 aagagtatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgt 33731795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 40733526 - 40733669
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    ||||| ||||||||||||||||||    
T  40733526 gagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtg 40733625  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
     |||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40733626 gtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatg 40733669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 6712985 - 6713127
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaagg-ttttgggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  6712985 gagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggtaagagtgt 6713084  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  6713085 gatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtgga 6713127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 303 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 36006001 - 36005888
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttct 402  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  36006001 agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttct 36005902  T
Q  403 agtctcgatgtgga 416  Q
    || |||||||||||    
T  36005901 agcctcgatgtgga 36005888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 28254383 - 28254259
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatg 377  Q
    |||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28254383 ttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 28254284  T
Q  378 tctctcttacttgtgtggttgttctag 404  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||    
T  28254283 tctctct--cttgtggggttgttctag 28254259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 256 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36178435 - 36178320
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  36178435 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaa 36178338  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36178337 ggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Original strand, 7598600 - 7598751
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  7598600 gtgttggtgtgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------cctta 7598689  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  7598690 acgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtgga 7598751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37632746 - 37632605
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  37632746 gagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggtaagagtgtg 37632647  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37632646 gtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtgga 37632605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 414
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770040
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  || |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgag--ttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttga 1769981  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
     | ||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1769982 agctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtg 1770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14745461 - 14745301
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14745461 gtgttggtttgcaactgtgag--ttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgcctta 14745364  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgt-gtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  14745363 aggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtgga 14745301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 277 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163378
Alignment:
Q  277 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctt-aaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    ||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||||| |||||||||||||| ||||||     
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatg 40163378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 35580872 - 35580732
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  35580872 gagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgcg 35580774  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35580773 gcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtgga 35580732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 38796769 - 38796629
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagag--tg 372  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||  ||    
T  38796769 gagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtatg 38796670  T
Q  373 tgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    ||  |||||| || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  38796669 tggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 38796629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28531463 - 28531320
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28531463 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtg 28531364  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
     || |||||| | || ||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  28531363 gtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatg 28531320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 303 - 416
Target Start/End: Original strand, 23346274 - 23346386
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttct 402  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23346274 agtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgttct 23346372  T
Q  403 agtctcgatgtgga 416  Q
    || || ||||||||    
T  23346373 agcctagatgtgga 23346386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 416
Target Start/End: Original strand, 3673122 - 3673218
Alignment:
Q  320 ttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3673122 ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 3673218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 414
Target Start/End: Original strand, 7598240 - 7598376
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatg 377  Q
    ||||||||  ||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | || ||    
T  7598240 ttatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggtaagaatatggtg 7598339  T
Q  378 tctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||    
T  7598340 tctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtg 7598376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33561600 - 33561486
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33561600 gagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 33561501  T
Q  375 atgtctctcttactt 389  Q
    || ||||||| ||||    
T  33561500 atatctctctcactt 33561486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 328 - 416
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421881
Alignment:
Q  328 aagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtgga 6421881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 5367484 - 5367599
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtg 394  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||      
T  5367484 gataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgca 5367583  T
Q  395 gttgttctagtctcga 410  Q
    |||||||||| |||||    
T  5367584 gttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 16590897 - 16591033
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| | |    
T  16590897 gagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaagtaagaatct 16590990  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  16590991 aatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtgga 16591033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 416
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672851
Alignment:
Q  338 ataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 3672851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31468895 - 31468797
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31468895 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatcttataag----aggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12529177 - 12529049
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||  ||     
T  12529177 gagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagataagaacgta 12529078  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttcta 403  Q
     ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  12529077 gtgtctctcttgtttgtgcggttgttcta 12529049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 29676912 - 29677060
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacacattgtcttaaggttttgggtaaga 369  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     ||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||    
T  29676912 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctttaagtaaga 29677011  T
Q  370 gtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  29677012 gtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatg 29677060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 289 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 29873672 - 29873548
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    |||||||||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  29873672 acatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtgggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcact 29873573  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||    
T  29873572 tgtgtggttgctctggtctggatgt 29873548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 40733892 - 40734032
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac-acattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| | |||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  40733892 gagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcataacctaca--gccttaaagttttgggtaagagtgt 40733989  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40733990 ggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtgga 40734032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 373
Target Start/End: Original strand, 16542458 - 16542556
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  16542458 gagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagtaagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 398
Target Start/End: Original strand, 30313189 - 30313309
Alignment:
Q  277 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgat 376  Q
    ||||||||||  ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||      
T  30313189 gttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggc 30313287  T
Q  377 gtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  30313288 gtctctctcacttgtgtggttg 30313309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 328 - 416
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421776
Alignment:
Q  328 aagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtgga 6421776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31899575 - 31899496
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31899575 gagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 290 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31259750 - 31259666
Alignment:
Q  290 catcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  31259750 catcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggtaagagtgtg 31259666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 319 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  319 cttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgat 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28254247 - 28254165
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagt 371  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  28254247 acatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 29676544 - 29676679
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| |      |||||||||||||||||    
T  29676544 gagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcc------ttttgggtaagagtgtg 29676637  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  29676638 gtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtgga 29676679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29874170 - 29874073
Alignment:
Q  277 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||  |||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29874170 gttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtg 29874073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 397
Target Start/End: Original strand, 31385779 - 31385868
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggtt 397  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  31385779 aggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaataagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38796367 - 38796299
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 343  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38796367 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaac 38796299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41678527 - 41678396
Alignment:
Q  264 tgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgg 363  Q
    ||||||||||||   ||||||||  |||||||||| || ||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||     
T  41678527 tgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaac-ctttgccttaaggttttga 41678429  T
Q  364 gtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggt 396  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  41678428 gtaagagtgtaacgtctctctcacttgtatggt 41678396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 383
Target Start/End: Original strand, 30323506 - 30323581
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 383  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30323506 aggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 33953920 - 33953797
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||| |||  |||||||||| || |||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||   ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33953920 gagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    | ||| ||||||||| | ||||||    
T  33953820 acgtccctcttacttttatggttg 33953797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37895210 - 37895111
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37895210 gagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 37895111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3594294 - 3594188
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtct 407  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||  ||    
T  3594294 aggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaagagtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacct 3594195  T
Q  408 cgatgtg 414  Q
    |||||||    
T  3594194 cgatgtg 3594188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 384
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 9231258 - 9231399
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||| ||  | ||||| ||||||| |||||||||     
T  9231258 gagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaagagtgta 9231357  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     | ||||||| |||| || |||| |||||  || ||||||||    
T  9231358 gtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtgga 9231399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 36785712 - 36785664
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttat 323  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785712 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 373
Target Start/End: Original strand, 12910237 - 12910335
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    |||||||||||   ||||| |||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12910237 gagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 384
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312907
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctct 30312907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580494
Alignment:
Q  330 gaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagag 370  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 35580494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  320 ttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtc 379  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 365
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || || |||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13792573 - 13792536
Alignment:
Q  345 cattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 382  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13792573 cattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15689484 - 15689427
Alignment:
Q  339 taaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggt 396  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||| |||||||    
T  15689484 taaactcattgtcttaaggttttgggtaaaaatgtggtgtctctatcactagtgtggt 15689427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37894813 - 37894732
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||    
T  37894813 agtaaaggctaaaaaccttataagtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1085765 - 1085624
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1085765 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 1085666  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1085665 gcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 1085624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Original strand, 6054570 - 6054710
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  6054570 agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 6054669  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  6054670 tgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtgga 6054710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Original strand, 7517589 - 7517729
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7517589 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 7517688  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7517689 gtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 7517729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Original strand, 14681501 - 14681658
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14681501 gtgttggtttgcaagtgtaag--ttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtctta 14681598  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  14681599 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctc--acaagtgtggttgttctagccttgatgtgga 14681658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Original strand, 19122741 - 19122879
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19122741 gagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 19122839  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122840 gtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 30244279 - 30244422
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30244279 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 30244378  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30244379 gtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatg 30244422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37533177 - 37533019
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37533177 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 37533080  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  37533079 aggttttgggtaa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtgga 37533019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 276 - 414
Target Start/End: Original strand, 45434646 - 45434784
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  45434646 agttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaagagtgtga 45434745  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  45434746 tgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtg 45434784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 258 - 416
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157715
Alignment:
Q  258 ttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaagg 357  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaagg 29157656  T
Q  358 ttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  29157657 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtgga 29157715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37533513 - 37533372
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37533513 gagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 37533414  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37533413 gtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 37533372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 40094923 - 40094783
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40094923 gagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 40094824  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
      ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40094823 gcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtgg 40094783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Original strand, 11845200 - 11845338
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11845200 gagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtg 11845299  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
     |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  11845300 gtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgt 11845338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23526 - 23385
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23526 gagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 23427  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  23426 gtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttgga 23385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 289 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 22567174 - 22567045
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  22567174 acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgct 22567075  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  22567074 tgtggggttgttcgggcctcgatgtggatg 22567045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 34218183 - 34218042
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34218183 gagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 34218084  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||  ||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  34218083 gtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtgga 34218042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 30245086 - 30245225
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30245086 gagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 30245185  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
     |||||||    ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30245186 gtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatg 30245225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Original strand, 45754725 - 45754862
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45754725 gagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtg 45754823  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  45754824 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 395
Target Start/End: Original strand, 7554034 - 7554154
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7554034 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtg 7554133  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtgg 395  Q
     |||||||||  |||||||||    
T  7554134 gtgtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 36939882 - 36939739
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  | |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36939882 gagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtg 36939783  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
     ||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  36939782 gtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggatg 36939739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 276 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24838850 - 24838724
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24838850 agttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 24838751  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttc 401  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24838750 acgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 289 - 415
Target Start/End: Original strand, 45433264 - 45433390
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  45433264 acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 45433363  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433364 tgtggggttgttctagcctcgatgtgg 45433390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Original strand, 47129104 - 47129242
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  47129104 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtaggagtgtg 47129203  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
     ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  47129204 gtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgt 47129242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 9901654 - 9901793
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9901654 gagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 9901751  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  9901752 gtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtgga 9901793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22566811 - 22566712
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22566811 gagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 22566712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Original strand, 41854644 - 41854781
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41854644 gagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggtaagagtgtg 41854742  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  41854743 acgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgt 41854781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 24177444 - 24177585
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  24177444 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggtaagagtgtg 24177543  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||||    
T  24177544 gcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtgga 24177585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 276 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 118449 - 118319
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||     
T  118449 agttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggtaagagtgtgg 118350  T
Q  376 tgtc--tctcttacttgtgtggttgttctag 404  Q
     |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  118349 cgtctatctcttgcttgtgtggttgttctag 118319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 385
Target Start/End: Original strand, 16569205 - 16569315
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  16569205 gagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgcg 16569304  T
Q  375 atgtctctctt 385  Q
     ||||||||||    
T  16569305 gtgtctctctt 16569315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16596457 - 16596347
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  16596457 gagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgcg 16596358  T
Q  375 atgtctctctt 385  Q
     ||||||||||    
T  16596357 gtgtctctctt 16596347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 270 - 416
Target Start/End: Original strand, 30032571 - 30032717
Alignment:
Q  270 tgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaaga 369  Q
    |||| ||||||||||||  |||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  30032571 tgtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaaga 30032670  T
Q  370 gtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  30032671 gtgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtgga 30032717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 308 - 418
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253640
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtct 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||| || ||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  408 cgatgtggatg 418  Q
    |||||||||||    
T  30253630 cgatgtggatg 30253640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 402
Target Start/End: Original strand, 36622969 - 36623096
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  36622969 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggtaggagtatg 36623068  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttct 402  Q
     || |||||||||||||||| |||||||    
T  36623069 gtgcctctcttacttgtgtgattgttct 36623096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 278 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 36534930 - 36534795
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatg 377  Q
    |||||||||  || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36534930 ttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggtaagagtgtggcg 36534831  T
Q  378 tctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    ||||||  ||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  36534830 tctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1085377 - 1085280
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtg 392  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  1085377 gataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 276 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 40230439 - 40230330
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  |||||  |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||     
T  40230439 agttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggtaaaagtctgg 40230340  T
Q  376 tgtctctctt 385  Q
    ||||||||||    
T  40230339 tgtctctctt 40230330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Original strand, 37167810 - 37167931
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  37167810 acatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 37167903  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37167904 tgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 37167931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 8128590 - 8128451
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  8128590 gagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggttaagagtgtg 8128491  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
     |||| ||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  8128490 gtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtg 8128451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 385
Target Start/End: Original strand, 43241504 - 43241614
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  43241504 gagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggtaaaagtatg 43241603  T
Q  375 atgtctctctt 385  Q
    |||||||||||    
T  43241604 atgtctctctt 43241614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300261
Alignment:
Q  312 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcga 410  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||  | |||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  411 tgtgga 416  Q
    ||||||    
T  28300266 tgtgga 28300261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 400
Target Start/End: Original strand, 20599323 - 20599450
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggta--agagtg 372  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  20599323 gagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaagagagtg 20599422  T
Q  373 tgatgtctctcttacttgtgtggttgtt 400  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20599423 tggtgtctctcttgcttgtatggttgtt 20599450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 30245503 - 30245567
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 339  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30245503 gagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 41910743 - 41910594
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa--------ggttttgggta 366  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||        | |||| ||||    
T  41910743 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggatttttggta 41910644  T
Q  367 agagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  41910643 agagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtgga 41910594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 391
Target Start/End: Original strand, 37345916 - 37346043
Alignment:
Q  264 tgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgg 363  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||| |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||     
T  37345916 tgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttga 37346015  T
Q  364 gtaagagtgtgatgtctctcttacttgt 391  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37346016 gtaagagtgtgacgtctctctcacttgt 37346043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 416
Target Start/End: Original strand, 47129454 - 47129519
Alignment:
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  47129454 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtgga 47129519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28301692 - 28301613
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28301692 gagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28300642 - 28300576
Alignment:
Q  351 cttaaggttttggg-taagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28300642 cttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtgga 28300576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 339
Target Start/End: Original strand, 30255350 - 30255412
Alignment:
Q  277 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 339  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30255350 gttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  335 cccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 383  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36109066 - 36109007
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 334  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109066 gagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  334 acccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    |||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 354 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532759
Alignment:
Q  354 aaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtgga 37532759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619071
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||||| ||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgtatctttcacttgtatggttg 21619071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 336
Target Start/End: Original strand, 30244710 - 30244771
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 336  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30244710 gagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4124197 - 4124114
Alignment:
Q  315 acaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  4124197 acactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggataaaagtgtggtgtctctctcacttttttggttg 4124114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 402
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902436
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttct 402  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct 15902436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 367 - 416
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244502
Alignment:
Q  367 agagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgga 30244502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 367 - 416
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253720
Alignment:
Q  367 agagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgga 30253720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 358 - 411
Target Start/End: Original strand, 45755019 - 45755072
Alignment:
Q  358 ttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgat 411  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  45755019 ttttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44361608 - 44361517
Alignment:
Q  279 tatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagt 371  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||   |||| |||||| |||||||||    
T  44361608 tatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagagt 44361517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 397
Target Start/End: Original strand, 2512575 - 2512634
Alignment:
Q  338 ataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggtt 397  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  2512575 ataaactcattgtcttaatattttgtgtaagagtgtgatatatctctcacttgtgtggtt 2512634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 391
Target Start/End: Original strand, 37345652 - 37345706
Alignment:
Q  337 cataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgt 391  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  37345652 cataaacatattgccttaaggtttttggtaagagtctgacgtctctctcacttgt 37345706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 411
Target Start/End: Original strand, 7517765 - 7517802
Alignment:
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgat 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7517765 gatgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgat 7517802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 411
Target Start/End: Original strand, 7518031 - 7518068
Alignment:
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgat 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7518031 gatgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgat 7518068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 416
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245305
Alignment:
Q  367 agagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtgga 30245305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40094543 - 40094502
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaac 316  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40094543 gagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Original strand, 48071457 - 48071498
Alignment:
Q  337 cataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgt 378  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48071457 cataaacctattgtcttaaggttttggataagagtgtgatgt 48071498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 338 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7109814 - 7109754
Alignment:
Q  338 ataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    |||||||||||   ||||||||||| || | | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7109814 ataaacacattacattaaggttttgagttaaattgtgatgtctctcttacatgtgtggttg 7109754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 333 - 373
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 255 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 50630920 - 50630762
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  50630920 gtgttggtttgcaagcgtgag--ttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgcctta 50630823  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  50630822 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgg 50630762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933130
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 55933191  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  55933190 agttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtgga 55933130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 25483345 - 25483486
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25483345 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 25483444  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25483445 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 25483486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 54017742 - 54017601
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017742 gagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtg 54017643  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54017642 atgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtgga 54017601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002575
Alignment:
Q  261 gtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttt 360  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgag--ttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttt 50002520  T
Q  361 tgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50002521 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 50002575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 36629246 - 36629387
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36629246 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 36629345  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36629346 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 36629387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370507
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 41370446  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41370447 agttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 41370507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Original strand, 54936219 - 54936345
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  54936219 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcac- 54936317  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  54936318 tatgtggttgttctagcctcgatgtgga 54936345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1731794 - 1731653
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1731794 gagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 1731695  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1731694 gtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgga 1731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 36608808 - 36608667
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36608808 gagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 36608709  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36608708 gtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 36608667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 39793007 - 39792866
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39793007 gagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 39792908  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39792907 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39792866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Original strand, 39404407 - 39404546
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||| |||| ||||    
T  39404407 gagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtg 39404506  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39404507 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 39404546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18932883 - 18932757
Alignment:
Q  288 tacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttac 387  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18932883 tacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttac 18932784  T
Q  388 ttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  18932783 ttgagtggttgttatagcctcgatgtg 18932757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 278 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22028105 - 22027967
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatg 377  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22028105 ttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtg 22028006  T
Q  378 tctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22028005 tctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtgga 22027967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 3340816 - 3340957
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  3340816 gagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggtaagagtgtg 3340915  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3340916 gtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtgga 3340957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 32941270 - 32941129
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| |||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32941270 gagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 32941171  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32941170 acgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 32941129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 289 - 414
Target Start/End: Original strand, 54108936 - 54109060
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  54108936 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 54109034  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||    
T  54109035 tgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 276 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343012
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatg 54343012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 273 - 416
Target Start/End: Original strand, 44620360 - 44620503
Alignment:
Q  273 gagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtg 372  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44620360 gagagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 44620459  T
Q  373 tgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  44620460 tgatgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtgga 44620503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Original strand, 44621025 - 44621152
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  44621025 acatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgct 44621124  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  44621125 tgtgcggttattctagcctcgatgtgga 44621152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 289 - 395
Target Start/End: Original strand, 45496828 - 45496934
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  45496828 acatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 45496927  T
Q  389 tgtgtgg 395  Q
    |||||||    
T  45496928 tgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 4955464 - 4955335
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4955464 gagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 4955365  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctag 404  Q
      |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4955364 gcgtctctcttacttgtgcggttgctctag 4955335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 278 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22028515 - 22028375
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  22028515 ttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgg 22028416  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  22028415 tgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtgga 22028375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 39404027 - 39404168
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  39404027 gagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaagagtgtg 39404126  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39404127 gcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39404168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3244598 - 3244458
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3244598 gagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtg 3244499  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
      |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  3244498 tcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgg 3244458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Original strand, 52884704 - 52884844
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggtttt-gggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  52884704 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttggggtaagagtgt 52884803  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  52884804 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Original strand, 50459730 - 50459869
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  50459730 gagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaagagcgtg 50459829  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50459830 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 50459869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Original strand, 52884896 - 52885038
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggtttt-gggtaagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  52884896 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgt 52884995  T
Q  374 gatg--tctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    | ||  ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  52884996 ggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16888963 - 16888825
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16888963 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggtaagagtgtg 16888864  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    |||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||    
T  16888863 atgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgt 16888825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 256 - 385
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880279
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 49880249  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 385  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  49880250 ggttttgggtaagagcgtggtgtctctctt 49880279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 10245929 - 10246069
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  10245929 gagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggtaagagtgtg 10246027  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10246028 gtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtgga 10246069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 49302913 - 49303056
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtg 372  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49302913 gagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 49303012  T
Q  373 tgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    || ||| |||||||||| || | ||||||||  |||||||||||    
T  49303013 tggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtgga 49303056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 289 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4390234 - 4390111
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4390234 acatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgct 4390135  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatg 412  Q
    ||||  |||||||||| |||||||    
T  4390134 tgtgcagttgttctagcctcgatg 4390111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 20826226 - 20826367
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||  |||| ||||||||||||    
T  20826226 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtg 20826325  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  20826326 atgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtgga 20826367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34646796 - 34646667
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34646796 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 34646697  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctag 404  Q
     |||||||||    ||||||||||||||||    
T  34646696 gtgtctctctggtctgtgtggttgttctag 34646667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 415
Target Start/End: Original strand, 54108565 - 54108686
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgt 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  54108565 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttggctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgt 54108664  T
Q  394 ggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  54108665 ggttgttctagcctcaatgtgg 54108686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22183411 - 22183270
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22183411 gagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtg 22183312  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  22183311 gcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtgga 22183270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 44620669 - 44620809
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  44620669 gagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaac-cataaccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620767  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     | |||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  44620768 gtttctctcttgcttgtgcggttgttatatcctcgatgtgga 44620809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 51768207 - 51768066
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| || |||  ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  51768207 gagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggtaaaagtacg 51768108  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||    
T  51768107 atgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtgga 51768066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 374
Target Start/End: Original strand, 2741080 - 2741179
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2741080 gagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 2741179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Original strand, 36572028 - 36572167
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  36572028 gagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggttagagtatg 36572127  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
     |||||||||  |||||| |||||||| || |||||||||    
T  36572128 gtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtg 36572167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 297 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 49076955 - 49076837
Alignment:
Q  297 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  49076955 taaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggttagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggt 49076857  T
Q  397 tgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  49076856 tgttctagcctcgatgtgga 49076837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 41707611 - 41707490
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41707611 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaagagtgtg 41707513  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggtt 397  Q
     ||||||||| ||| | ||||||    
T  41707512 gtgtctctctcactagcgtggtt 41707490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 20825845 - 20825986
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||    
T  20825845 gagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagtgtg 20825944  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||| |||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  20825945 gtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtgga 20825986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Original strand, 2740709 - 2740850
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||  |||||||||||    
T  2740709 gagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgtaagagtgtg 2740808  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
      |||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2740809 gcgtctctctcact--tgtggttgttctagcctcgatatggatg 2740850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 308 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841386
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctag 404  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctag 15841386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817687
Alignment:
Q  320 ttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 23817687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 34004730 - 34004593
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  34004730 gagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgataagagtgtg 34004633  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
      ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34004632 ccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 34004593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 278 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54741322 - 54741227
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    |||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  54741322 ttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggataagagtgt 54741227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 397
Target Start/End: Original strand, 3341137 - 3341259
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3341137 gagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtg 3341236  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggtt 397  Q
    |||||| ||||| || |||||||    
T  3341237 atgtctttcttaattatgtggtt 3341259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6975603 - 6975493
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6975603 gagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 6975504  T
Q  375 atgtctctctt 385  Q
      |||||||||    
T  6975503 gcgtctctctt 6975493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16889683 - 16889542
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  | || ||||| ||||||||||||||| ||    
T  16889683 gagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggtaagagtatg 16889584  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  16889583 gtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtgga 16889542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 289 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54017835 - 54017750
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54017835 acatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 45489475 - 45489336
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatg 377  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||  | ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  45489475 ttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaactcttaaacctactgt-ttaagatttttggtaagagtgtgatg 45489377  T
Q  378 tctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  45489376 tctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatg 45489336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 306 - 416
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827589
Alignment:
Q  306 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagt 405  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  406 ctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtgga 43827589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 3700374 - 3700507
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  3700374 gagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggataagagtatg 3700465  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  3700466 atgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtgga 3700507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 416
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879956
Alignment:
Q  312 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgat 411  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||  |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  412 gtgga 416  Q
    |||||    
T  18879952 gtgga 18879956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 416
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691304
Alignment:
Q  317 accttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtc--tctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||  | ||||||||| |||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  415 ga 416  Q
    ||    
T  31691303 ga 31691304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 43174515 - 43174657
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||   ||||| || ||||||||||||||    
T  43174515 gagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacacataaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgt 43174614  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |  |||||||||  || | |||||||| ||| || ||||||||    
T  43174615 ggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtgga 43174657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Original strand, 3271807 - 3271939
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc-- 383  Q
    |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  3271807 acatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-tgtctctctc 3271905  T
Q  384 -ttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtgga 3271939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Original strand, 40067052 - 40067181
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| |  || |  |||||| |||||||||| |||||    
T  40067052 gagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggtaaaagtgt 40067151  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttcta 403  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  40067152 gatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49076595 - 49076510
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttt 360  Q
    |||||||||||   | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  49076595 gagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaaagttt 49076510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23557013 - 23556890
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||| ||||  |||||| |||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  23557013 gagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggataagagtgtg 23556914  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  23556913 acgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 418
Target Start/End: Original strand, 28034271 - 28034381
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtct 407  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| || ||||| ||| ||||    
T  28034271 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtct 28034370  T
Q  408 cgatgtggatg 418  Q
     ||||||||||    
T  28034371 ggatgtggatg 28034381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 412
Target Start/End: Original strand, 19504714 - 19504842
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||         |||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19504714 gagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 19504804  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatg 412  Q
      |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19504805 gcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 398
Target Start/End: Original strand, 760191 - 760320
Alignment:
Q  268 agtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaa 367  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||  ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  760191 agtgtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaa 760289  T
Q  368 gagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
     |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  760290 aagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttg 760320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 332
Target Start/End: Original strand, 44620305 - 44620362
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 332  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620305 gagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48111825 - 48111736
Alignment:
Q  295 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||  ||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  48111825 gataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctct 48111736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 391
Target Start/End: Original strand, 34544148 - 34544232
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaagg-ttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgt 391  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  34544148 aggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggtaagagtgtggtatctctctcacttgt 34544232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 45489784 - 45489721
Alignment:
Q  352 ttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45489784 ttaaggttttgggtaatagtgtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtgg 45489721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 277 - 343
Target Start/End: Original strand, 10246358 - 10246424
Alignment:
Q  277 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 343  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10246358 gttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaac 10246424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 346 - 416
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370808
Alignment:
Q  346 attgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtgga 41370808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 358 - 416
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174291
Alignment:
Q  358 ttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtgga 43174291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11348475 - 11348410
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata 340  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  11348475 gagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccata 11348410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  320 ttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtct 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 39699065 - 39698950
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacatt--gtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgtt 400  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||  | |   || ||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||| |||| ||    
T  39699065 agtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgcttgtgcggttatt 39698966  T
Q  401 ctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||    
T  39698965 ctagtctcgatgtgga 39698950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 384
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 11348330 - 11348272
Alignment:
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 414  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11348330 aggtttttggtaagagtgtg-tgtctctctcacttatgtggttgttcaagtctcgatgtg 11348272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41603305 - 41603246
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaa 367  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41603305 aggttgagcactttataagtgagaagacccataaacatagtgtcttaaggttttgggtaa 41603246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacac 318  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 332
Target Start/End: Original strand, 44621435 - 44621492
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 332  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621435 gagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 385
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 385  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Original strand, 44620968 - 44621011
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 332  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620968 acatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 53468089 - 53468038
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  53468089 gacccataaactcattgttttaagcttttggataagtgtgtgatgtctctct 53468038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6876212 - 6876123
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgtt 400  Q
    |||| |||||| |||||||  |||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  6876212 aggtcgaacactttataag--agagaaccaataaacgcatcgacttaaggttttggataaaagtgtgacgtctctctcacttgt-tggttgtt 6876123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15841128 - 15841016
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatg 377  Q
    |||||||||  | |||||||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||  ||    
T  15841128 ttatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaag-ttttgggtaagagtgtattg 15841030  T
Q  378 tctctcttacttgt 391  Q
    ||||||| ||||||    
T  15841029 tctctctcacttgt 15841016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 256 - 418
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487545
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 32487482  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  32487483 ggttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatg 32487545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500600
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaa 6500539  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6500540 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 6500600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18603269 - 18603128
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18603269 gagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 18603170  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
       |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18603169 gcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtgga 18603128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Original strand, 6500814 - 6500972
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  6500814 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgcctta 6500910  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  6500911 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtgga 6500972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 40296464 - 40296323
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40296464 gagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggtaagagtgtg 40296365  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40296364 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 40296323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492225
Alignment:
Q  261 gtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttt 360  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttt 36492281  T
Q  361 tgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36492280 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 36492225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3295479 - 3295353
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  3295479 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaagagtgtgttgtctctcttgct 3295381  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3295380 tgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 3295353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Original strand, 624187 - 624346
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||     
T  624187 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttg 624284  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  624285 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtgga 624346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 275 - 409
Target Start/End: Original strand, 41170643 - 41170777
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41170643 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 41170742  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcg 409  Q
     ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41170743 gtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 41170777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 256 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502044
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaa 27502105  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    | |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27502104 gatttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtgga 27502044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9498822 - 9498693
Alignment:
Q  254 tgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctt 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  9498822 tgtgttggtttgcaaatgtgag--ttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 9498725  T
Q  354 aaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 385  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9498724 aagattttgggtaagagtgtggtgtctctctt 9498693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 275 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11417126 - 11416983
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11417126 gagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtg 11417027  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatg 418  Q
    || |||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  11417026 atctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatg 11416983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 264 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3295172 - 3295023
Alignment:
Q  264 tgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgg 363  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  3295172 tgcaagtgtgag---tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgg 3295076  T
Q  364 gtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3295075 gtatgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtgga 3295023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 25327944 - 25328085
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  25327944 gagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtg 25328043  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25328044 gtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtgga 25328085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 26074295 - 26074150
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26074295 gagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccatgaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 26074196  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatgat 420  Q
     ||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  26074195 gtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgat 26074150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 420
Target Start/End: Original strand, 26074621 - 26074766
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26074621 gagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 26074720  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatgat 420  Q
     ||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  26074721 gtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgat 26074766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Original strand, 41632792 - 41632932
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||||||||||||||     
T  41632792 agttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggtaagagtgtgg 41632891  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41632892 tgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtgga 41632932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13415909 - 13415774
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13415909 gagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtg 13415810  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcga 410  Q
      ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  13415809 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 13415774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 15370108 - 15370249
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  15370108 gagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggtaagagtgtg 15370207  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  15370208 gtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtgga 15370249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26075308 - 26075169
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggt-aagagtgtgat 376  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||      
T  26075308 ttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaagagtgtgtc 26075209  T
Q  377 gtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26075208 gtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtgga 26075169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 35150016 - 35150156
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35150016 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaagag-acccataaatccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtg 35150114  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  35150115 gtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtgga 35150156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753033
Alignment:
Q  276 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtga 375  Q
    |||||||||||  ||||  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  376 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 34753033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 270 - 420
Target Start/End: Original strand, 38427552 - 38427701
Alignment:
Q  270 tgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaaga 369  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  38427552 tgtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaaga 38427650  T
Q  370 gtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtggatgat 420  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  38427651 gtgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtggatgat 38427701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42405745 - 42405606
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  42405745 gagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtg 42405646  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      || |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42405645 --gtgtctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 42405606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 299498 - 299639
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  299498 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgtaagagtgtg 299597  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      |||||| || |||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  299598 gcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtgga 299639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 261 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  261 gtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttt 360  Q
    |||||||||||||||  ||||||||   | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgag--ttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttt 29549319  T
Q  361 tgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttc 401  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  29549318 tggataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12662801 - 12662661
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12662801 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggtaagagtgtg 12662702  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
     || || |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  12662701 gtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtgg 12662661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 413
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623965
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || | |||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaa 623907  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  623908 ggttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgt 623965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 416
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747921
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatg 377  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||| ||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  378 tctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtgga 33747921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1028666 - 1028525
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  1028666 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaagagtgtg 1028567  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1028566 gcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1028525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 303 - 416
Target Start/End: Original strand, 15370439 - 15370552
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttct 402  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
T  15370439 agtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtggggttgttct 15370538  T
Q  403 agtctcgatgtgga 416  Q
    || |||||||||||    
T  15370539 agcctcgatgtgga 15370552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 24489353 - 24489215
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  24489353 gagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtg 24489256  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
      |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24489255 gcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgg 24489215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 303 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26591031 - 26590916
Alignment:
Q  303 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttct 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  26591031 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagtaagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttct 26590932  T
Q  403 agtctcgatgtggatg 418  Q
    |  |||||||||||||    
T  26590931 aacctcgatgtggatg 26590916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 35167973 - 35167846
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   |||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  35167973 acatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaagagtgtgatgtctctcacact 35167874  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||    
T  35167873 agtgtggttgttctagcatcgatgtgga 35167846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723810
Alignment:
Q  256 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaa 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   ||||||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaa 5723860  T
Q  356 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagt 405  Q
    ||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5723859 ggttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagt 5723810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 36568716 - 36568577
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36568716 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtg 36568617  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36568616 gcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtgga 36568577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 404
Target Start/End: Original strand, 6224205 - 6224334
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  6224205 gagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaagagtgtg 6224304  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctag 404  Q
     || |||  || |||||| ||||| |||||    
T  6224305 gtgcctcagttgcttgtgcggttggtctag 6224334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26074931 - 26074807
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggt-aagagtgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26074931 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgt 26074832  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    |  ||||||||| |  |||||||||    
T  26074831 ggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 290 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41635325 - 41635212
Alignment:
Q  290 catcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttactt 389  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  41635325 catcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaagagtgtagtatctcttttactt 41635226  T
Q  390 gtgtggttgttcta 403  Q
    || |||||| ||||    
T  41635225 gtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 410
Target Start/End: Original strand, 300970 - 301095
Alignment:
Q  277 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgat 376  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        ||  ||||| |||||| |||| |||||||||||| |    
T  300970 gttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaagagtgtggt 301061  T
Q  377 gtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcga 410  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  301062 gtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcga 301095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 341
Target Start/End: Original strand, 7768837 - 7768925
Alignment:
Q  251 atttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 341  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768837 atttttgttggttttcaagtgtgag--ttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36522351 - 36522269
Alignment:
Q  310 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtg 392  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  36522351 gttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtg 36522269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 36522045 - 36521922
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||  |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36522045 gagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 36521946  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
       ||||||| | |||||||||||    
T  36521945 tcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 2411016 - 2411157
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||| |||||  |||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||     
T  2411016 gagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaagagtgta 2411115  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     | ||||| |||||||  || ||||||||  |||||| ||||    
T  2411116 gtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatgga 2411157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 343
Target Start/End: Original strand, 26074327 - 26074395
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 343  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074327 gagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaac 26074395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13786116 - 13786041
Alignment:
Q  309 ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13786116 ggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggataagagtgtgatgtctctct 13786041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 374
Target Start/End: Original strand, 19275543 - 19275636
Alignment:
Q  280 atatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19275543 atatgtcttaaatcagatagaaaagtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtg 19275636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900025
Alignment:
Q  352 ttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtgga 26900025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 342
Target Start/End: Original strand, 35914858 - 35914925
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaa 342  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  35914858 gagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaa 35914925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 361
Target Start/End: Original strand, 42508635 - 42508707
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggtttt 361  Q
    ||||| |||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  42508635 acatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 795305 - 795254
Alignment:
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttct 402  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  795305 cttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 384
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 380
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  333 gacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtct 380  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 413
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427366
Alignment:
Q  353 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgt 413  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgt 38427366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 326
Target Start/End: Original strand, 6225053 - 6225104
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 326  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225053 gagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 391
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446010
Alignment:
Q  324 aagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgt 391  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctctcacttgt 32446010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 361
Target Start/End: Original strand, 31509632 - 31509718
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggtttt 361  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  31509632 gagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggtttt 31509718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 336
Target Start/End: Original strand, 39309693 - 39309754
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 336  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39309693 gagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagaggacc 39309754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 416
Target Start/End: Original strand, 42435512 - 42435577
Alignment:
Q  351 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||    
T  42435512 cttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtgga 42435577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Original strand, 5405 - 5546
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctt-aaggttttgggtaagagtgt 373  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5405 gagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttgggtaagagtgt 5504  T
Q  374 gatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgg 415  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  5505 ggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 401
Target Start/End: Original strand, 5786 - 5917
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaag-----gttttgggtaaga 369  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      ||||| ||||||    
T  5786 gagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattttgagtaaga 5885  T
Q  370 gtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttc 401  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5886 gtgtggtgtctcttttacttgtggggttgttc 5917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 663 - 522
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  663 gagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 564  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||| |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  563 gtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtgga 522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 309 - 155
Alignment:
Q  255 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtctta 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||     
T  309 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaac-cat--acttt 216  T
Q  355 aggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    ||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  215 agg-tttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1255 - 1114
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1255 gagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatg 1156  T
Q  375 atgtctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
     ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  1155 gtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtgga 1114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  313 gaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctct 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17605 - 17496
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaagg--ttttgggtaagagtg 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||     
T  17605 gagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagta 17506  T
Q  373 tgatgtctct 382  Q
    || |||||||    
T  17505 tggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Original strand, 47383 - 47510
Alignment:
Q  289 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttact 388  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| ||    
T  47383 acatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggtaaaaatgtggtgtctctcttgct 47482  T
Q  389 tgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    || | ||||||||||  |||||||||||    
T  47483 tgcgcggttgttctaacctcgatgtgga 47510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 385
Target Start/End: Original strand, 5366 - 5476
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 374  Q
    |||||||||||   ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  5366 gagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtg 5465  T
Q  375 atgtctctctt 385  Q
     ||||||||||    
T  5466 gtgtctctctt 5476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 416
Target Start/End: Original strand, 4994 - 5132
Alignment:
Q  278 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatg 377  Q
    |||||||||  ||||| || | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4994 ttatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggtaagagtgtggtg 5093  T
Q  378 tctctcttacttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 416  Q
    |||||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5094 tctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtgga 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10260 - 10191
Alignment:
Q  275 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaca 344  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10260 gagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaaca 10191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 398
Target Start/End: Original strand, 39498 - 39588
Alignment:
Q  308 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgtcttaaggttttgggtaagagtgt-gatgtctctcttacttgtgtggttg 398  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  39498 aggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaag-ttttgggtaaaagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 8278 times since January 2019
Visitors: 7802